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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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2661 | 2024-08-07 |
Constructing a Smartphone-Controlled Semiautomatic Theranostic System for Glucose Homeostasis in Diabetic Mice
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1441-9_9
PMID:34228289
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研究论文 | 研究者开发了一种智能手机控制的半自动治疗诊断系统,用于调节糖尿病小鼠的血糖稳态 | 该研究结合了多学科设计原则,包括电气工程、软件开发、合成生物学和光遗传学,创造了一种新型的智能手机控制的治疗诊断系统 | NA | 开发一种新型的智能手机控制的治疗诊断系统,用于远程调节糖尿病小鼠的血糖稳态 | 糖尿病小鼠的血糖稳态 | 生物医学工程 | 糖尿病 | 光遗传学 | NA | 生物信号 | 糖尿病小鼠 |
2662 | 2024-08-07 |
Expression and Purification of Cp3GT: Structural Analysis and Modeling of a Key Plant Flavonol-3-O Glucosyltransferase from Citrus paradisi
2024-Feb-07, Biotech (Basel (Switzerland))
DOI:10.3390/biotech13010004
PMID:38390907
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研究论文 | 本研究聚焦于植物黄酮醇特异性3-O葡萄糖基转移酶(Cp3GT)的规模化表达、纯化及其结构分析与建模 | 通过优化培养条件和纯化过程,成功解决了重组蛋白生产中的蛋白酶降解问题,并实现了Cp3GT的高纯度制备 | NA | 研究Cp3GT的结构和功能机制,为合成生物学和酶工程在制药应用中的发展提供支持 | 植物黄酮醇特异性3-O葡萄糖基转移酶(Cp3GT) | 生物技术 | NA | 亲和层析、阴离子交换层析和尺寸排阻层析 | AlphaFold2 | 蛋白质结构 | NA |
2663 | 2024-08-07 |
The dynamic-process characterization and prediction of synthetic gene circuits by dynamic delay model
2024-Mar-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109142
PMID:38384832
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研究论文 | 本文提出了一种动态延迟模型(DDM),用于描述和预测合成基因电路的动态过程 | 首次提供了动态确定函数的详细公式,并提出了一种通过微流控系统测量合成元件参数的方法 | NA | 旨在通过动态延迟模型提高合成基因电路预测的准确性 | 合成基因电路的动态行为及其参数测量 | 合成生物学 | NA | 微流控系统 | 动态延迟模型 | NA | 包括8个激活子和5个抑制子 |
2664 | 2024-08-07 |
A MoClo-Compatible Toolbox of ECF Sigma Factor-Based Regulatory Switches for Proteobacterial Chassis
2024, Biodesign research
DOI:10.34133/bdr.0025
PMID:38384496
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研究论文 | 本文展示了alpha变形菌作为植物相关合成生物学底盘的潜力,并识别了一组可在两种细菌宿主中使用的正交ECF基调控因子,用于创建2步延迟电路。 | 本文首次在alpha变形菌中应用ECF sigma因子作为正交调控元件,并提供了一个与Golden Gate (MoClo)克隆标准兼容的工具箱,以促进ECF基电路在不同物种中的构建。 | NA | 构建一个上下文无关且跨物种的ECF基工具箱,用于合成生物学应用。 | alpha变形菌和gamma变形菌中的ECF sigma因子调控元件。 | 合成生物学 | NA | Golden Gate (MoClo)克隆 | NA | 基因电路 | NA |
2665 | 2024-08-07 |
Advances in Metabolic Engineering of Plant Monoterpene Indole Alkaloids
2023-Jul-27, Biology
DOI:10.3390/biology12081056
PMID:37626942
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综述 | 本文综述了植物单萜吲哚生物碱(MIAs)代谢工程的最新进展和策略 | 探讨了通过合成生物学方法在异源宿主中增加MIAs产量和扩展其化学多样性的策略 | 讨论了当前制造MIAs的问题和未来发展 | 旨在通过代谢工程和合成生物学方法提高MIAs的产量和多样性 | 植物单萜吲哚生物碱(MIAs) | 代谢工程 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
2666 | 2024-08-07 |
Versatile Microfluidic Platform for Automated Live-Cell Hyperspectral Imaging Applied to Cold Climate Cyanobacterial Biofilms
2021-Jun-16, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.0c05446
PMID:34133116
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研究论文 | 本文介绍了一种多功能微流控平台,用于冷气候条件下蓝藻生物膜的自动活细胞高光谱成像和物种检测 | 结合微流控技术、多模态成像和计算机视觉系统,提供了一个多功能平台,用于研究蓝藻生物膜的因果关系 | NA | 开发一种用于冷气候环境中蓝藻生物膜的活细胞成像和自动物种检测的微流控平台 | 冷气候环境中的蓝藻生物膜 | 计算机视觉 | NA | 高光谱成像 | 机器学习算法 | 图像 | 六个平行生长通道的生物膜样本 |
2667 | 2024-08-07 |
A non-equilibrium dissipation system with tunable molecular fuel flux
2024-Feb-22, Nanoscale
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d3nr06136a
PMID:38334944
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研究论文 | 本文报道了一种基于动态DNA纳米技术的仿生耗散系统,该系统具有可调节的分子燃料通量 | 通过调节链置换和酶反应速率,控制燃料通量并进一步调节非平衡瞬态状态的强度,实现了对金纳米粒子动态组装和解组的调控 | NA | 展示一种具有可调节分子燃料通量的耗散系统,并探讨其在生物仿生学、合成生物学、智能材料、生物传感及人工细胞等领域的应用潜力 | 仿生耗散系统及其在金纳米粒子组装和解组中的应用 | 合成生物学 | NA | 动态DNA纳米技术 | NA | NA | NA |
2668 | 2024-08-07 |
Efficient assembly of a synthetic attenuated SARS-CoV-2 genome in Saccharomyces cerevisiae using multi-copy yeast vectors
2024, Journal of genetics
IF:1.4Q4
PMID:38379228
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研究论文 | 本文研究了在多拷贝酵母载体中高效组装合成减毒SARS-CoV-2基因组的方法 | 首次尝试在多拷贝载体中进行大型多片段组装,并开发了一套工具包,使研究人员能够在单拷贝和多拷贝载体之间无缝过渡 | NA | 评估在单拷贝和多拷贝载体系统中组装28 kb减毒SARS-CoV-2基因组的效率 | SARS-CoV-2减毒基因组的组装 | 合成生物学 | NA | 同源重组 | NA | DNA | 10个片段 |
2669 | 2024-08-07 |
RNAs as Sensors of Oxidative Stress in Bacteria
2023-06-08, Annual review of chemical and biomolecular engineering
IF:7.6Q1
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综述 | 本文综述了氧化应激的本质,强调了已知的蛋白质传感器(转录因子)作为氧化应激中分子传感器标准的作用,并描述了探索RNA直接感受氧化应激潜力的分子研究 | RNA传感器有望成为理解和调控细菌氧化应激反应中动态生物途径的关键层,代表了合成生物学的重要前沿 | 关于RNA传感器的知识存在空白,特别是关于RNA核苷酸化学修饰的部分 | 探讨RNA作为细菌中氧化应激传感器的潜力 | RNA传感器在氧化应激反应中的作用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
2670 | 2024-08-07 |
Engineering a dual vaccine against COVID-19 and tuberculosis
2023, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2023.1273019
PMID:37965265
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研究论文 | 研究通过合成生物技术构建了一种重组BCG菌株AspikeRBD,该菌株表达由Ag85A蛋白和SARS-CoV-2刺突蛋白的受体结合域(RBD)组成的融合蛋白,旨在开发一种针对COVID-19和结核病的双重疫苗 | 首次成功构建了一种能够同时表达Ag85A蛋白和SARS-CoV-2 RBD的重组BCG菌株,显示出对两种疾病的免疫反应增强 | 研究仅在老鼠模型中进行,尚未在人类中进行临床试验 | 开发一种新型双重疫苗,同时预防COVID-19和结核病 | 重组BCG菌株AspikeRBD的免疫效果及其作为双重疫苗的潜力 | NA | COVID-19和结核病 | 合成生物技术 | NA | NA | 老鼠模型 |
2671 | 2024-08-07 |
All-in-one IQ toggle switches with high versatilities for fine-tuning of transgene expression in mammalian cells and tissues
2024-Mar-14, Molecular therapy. Methods & clinical development
DOI:10.1016/j.omtm.2024.101202
PMID:38374964
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研究论文 | 本文介绍了一种新型转基因开关SIQ,该开关将所有基因切换元素集成到一个单一载体中,具有高效率和避免转基因泄漏的特点 | SIQ开关具有高效率和避免转基因泄漏的特点,并且可以通过单一构建体进行瞬时转染、建立稳定细胞系以及同时生产用于细胞和哺乳动物组织转导的腺病毒 | NA | 开发一种新型的转基因开关,用于基因和细胞基础的生物学研究和精准医学 | 转基因表达在哺乳动物细胞和组织中的精细调控 | 基因工程 | NA | 转基因技术 | NA | NA | NA |
2672 | 2024-08-07 |
Strategies on biosynthesis and production of bioactive compounds in medicinal plants
2024-Jan, Chinese herbal medicines
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.chmed.2023.01.007
PMID:38375043
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综述 | 本文总结了药用植物中天然产物生物合成和生产的策略与方法 | 介绍了基于多种“OMICS”技术的遗传工程、植物细胞培养工程、代谢工程和合成生物学在药用植物天然产物生物合成中的应用 | NA | 促进药用植物的保护和可持续利用 | 药用植物中的天然产物 | NA | NA | 遗传工程、植物细胞培养工程、代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA |
2673 | 2024-08-07 |
Budding yeast as a factory to engineer partial and complete microbial genomes
2020-Dec, Current opinion in systems biology
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.coisb.2020.09.003
PMID:33015421
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研究论文 | 本文探讨了利用酵母细胞作为宿主来工程化微生物基因组的新进展 | 开发了新的合成生物学途径,使得能够高效地工程化微生物基因组并产生修改后的细菌/病毒 | 克隆大于两百万碱基对的DNA分子复杂,细菌基因组难以恢复,且这些技术的双重用途需要仔细考虑 | 研究利用酵母细胞作为工厂来工程化微生物基因组的方法 | 酵母细胞和微生物基因组 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑 | NA | DNA | NA |
2674 | 2024-08-07 |
Multiplexing cell-cell communication
2020-07, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.20209618
PMID:32672881
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研究论文 | 本文开发了一种基于CRISPRi的遗传编码通道选择器设备,使单个通信系统能够传输两个独立的细胞间对话 | 设计了多路复用器和解多路复用器子电路,由12个基于CRISPRi的转录逻辑门、一个酰基高丝氨酸内酯基通信模块和三个可诱导启动子组成,实现了对细胞间通信的精细控制 | NA | 开发用于合成生物学的高级多细胞行为的细胞间通信系统 | 细胞间通信系统的遗传工程 | 合成生物学 | NA | CRISPRi | 转录逻辑门 | NA | NA |
2675 | 2024-08-07 |
Dynamic Cell Programming with Quorum Sensing-Controlled CRISPRi Circuit
2020-06-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.0c00148
PMID:32485106
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research paper | 本文构建了一系列基于群体感应控制的CRISPRi系统(Q-CRISPRi),用于动态编程细菌,无需引入细胞裂解 | Q-CRISPRi系统能够在不依赖基因编辑或细胞裂解的情况下动态编程细菌,具有广泛的应用潜力 | 现有的动态电路大多依赖基因编辑或细胞裂解,限制了其广泛和便捷的应用 | 开发一种新型的动态电路,用于调控细胞资源和微生物群落行为 | 细菌的基因表达、种群密度、表型、物理性质和群落组成 | synthetic biology | NA | CRISPRi | NA | NA | NA |
2676 | 2024-08-07 |
A transient reporter for editing enrichment (TREE) in human cells
2019-11-04, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkz713
PMID:31428784
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研究论文 | 本研究开发了一种名为TREE的临时报告系统,用于在人类细胞中高效筛选经过碱基编辑的细胞群体 | TREE系统通过使用蓝色荧光蛋白(BFP)在C到T替换后转化为绿色荧光蛋白(GFP),直接报告细胞内的碱基编辑活性,显著提高了编辑效率 | NA | 优化碱基编辑转染参数和递送策略,并开发一种高效的临时报告系统用于筛选碱基编辑细胞 | 人类细胞和人类多能干细胞(hPSCs) | 合成生物学 | NA | 碱基编辑技术 | NA | 荧光信号 | 多个独立位点 |
2677 | 2024-08-07 |
Polarized displacement by transcription activator-like effectors for regulatory circuits
2019-01, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-018-0163-8
PMID:30455466
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研究论文 | 本文展示了转录激活因子样效应物(TALE)能够以高度极化的方式从DNA上置换另一个TALE蛋白,仅置换3'端而非5'端重叠或相邻的TALE。 | 提出了基于TALE多部分DNA结合特性的极化置换机制,为基因表达的特异性调控、构建所有双输入布尔遗传逻辑电路、置换锌指转录因子及抑制Cas9-gRNA介导的基因组切割提供了新策略。 | NA | 探索DNA结合蛋白间相互作用在转录调控中的作用,提高设计调控电路的精确性和复杂性。 | 转录激活因子样效应物(TALE)及其在DNA上的极化置换行为。 | 合成生物学 | NA | 转录激活因子样效应物(TALE) | NA | DNA | NA |
2678 | 2024-08-07 |
Targeted m6A Reader Proteins To Study Epitranscriptomic Regulation of Single RNAs
2018-09-26, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.8b05012
PMID:30183280
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研究论文 | 本文报道了开发可编程的dPspCas13b-mA阅读器蛋白,用于研究活细胞中单个转录本的调控效应 | 开发了基于dPspCas13b的工具,用于研究内源性RNA的调控,并展示了这些工具在合成生物学中的应用潜力 | 目前对于mA的写入者、擦除者和阅读者之间的竞争性相互作用调控甲基化RNA转录本的研究尚不充分 | 研究RNA的转录后基因表达调控,特别是N-甲基腺苷(mA)修饰对RNA的影响 | 研究特定阅读器蛋白对单个转录本的调控效应 | 生物技术 | NA | RNA修饰分析 | dPspCas13b-mA阅读器蛋白 | RNA | 活细胞中的单个转录本 |
2679 | 2024-08-07 |
Transcriptional reprogramming in yeast using dCas9 and combinatorial gRNA strategies
2017-Mar-15, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-017-0664-2
PMID:28298224
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研究论文 | 本研究比较了两种基于dCas9的转录重编程系统,并将其应用于酵母中的两条生物合成途径,以生产异戊二烯和甘油三酯(TAG) | 本研究展示了常驻和诱导型dCas9方法的相似性能,并识别了能够显著扰动酵母中异戊二烯生产和TAG剖面的多重gRNA设计 | 研究指出,在14个酵母目标启动子中有大量gRNA位置不影响表达,表明需要进一步优化gRNA设计工具和dCas9工程 | 旨在开发合成生物学工具,实现对转录的正交控制,以便在不干扰原生基因表达机制的情况下灵活及时地控制基因表达 | 酵母中的异戊二烯和甘油三酯(TAG)生物合成途径 | 合成生物学 | NA | dCas9 | NA | 基因表达数据 | 101个gRNA结构,14个不同的酵母启动子 |
2680 | 2024-08-07 |
Targeted isolation and cloning of 100-kb microbial genomic sequences by Cas9-assisted targeting of chromosome segments
2016-May, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/nprot.2016.055
PMID:27101517
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research paper | 本文介绍了一种基于Cas9核酸酶的体外应用方法,用于从微生物中克隆长达100kb的基因组序列。 | 提出了一种名为Cas9辅助染色体片段靶向(CATCH)的新方法,通过体外切割目标DNA并使用Gibson组装法与克隆载体连接,简化了长基因组序列的克隆过程。 | NA | 开发一种新的技术方法,用于从微生物中高效克隆长基因组序列。 | 微生物的长基因组序列。 | genome engineering | NA | Cas9 nuclease, Gibson assembly | NA | DNA sequence | NA |