合成生物学相关文章
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当前共找到 3054 篇文献，本页显示第 2661 - 2680 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2661 | 2024-08-07 |
A transient reporter for editing enrichment (TREE) in human cells
2019-11-04, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkz713
PMID:31428784
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研究论文 | 本研究开发了一种名为TREE的临时报告系统，用于在人类细胞中高效筛选经过碱基编辑的细胞群体 | TREE系统通过使用蓝色荧光蛋白（BFP）在C到T替换后转化为绿色荧光蛋白（GFP），直接报告细胞内的碱基编辑活性，显著提高了编辑效率 | NA | 优化碱基编辑转染参数和递送策略，并开发一种高效的临时报告系统用于筛选碱基编辑细胞 | 人类细胞和人类多能干细胞（hPSCs） | 合成生物学 | NA | 碱基编辑技术 | NA | 荧光信号 | 多个独立位点 |
| 2662 | 2024-08-07 |
Polarized displacement by transcription activator-like effectors for regulatory circuits
2019-01, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-018-0163-8
PMID:30455466
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研究论文 | 本文展示了转录激活因子样效应物（TALE）能够以高度极化的方式从DNA上置换另一个TALE蛋白，仅置换3'端而非5'端重叠或相邻的TALE。 | 提出了基于TALE多部分DNA结合特性的极化置换机制，为基因表达的特异性调控、构建所有双输入布尔遗传逻辑电路、置换锌指转录因子及抑制Cas9-gRNA介导的基因组切割提供了新策略。 | NA | 探索DNA结合蛋白间相互作用在转录调控中的作用，提高设计调控电路的精确性和复杂性。 | 转录激活因子样效应物（TALE）及其在DNA上的极化置换行为。 | 合成生物学 | NA | 转录激活因子样效应物（TALE） | NA | DNA | NA |
| 2663 | 2024-08-07 |
Targeted m6A Reader Proteins To Study Epitranscriptomic Regulation of Single RNAs
2018-09-26, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.8b05012
PMID:30183280
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研究论文 | 本文报道了开发可编程的dPspCas13b-mA阅读器蛋白，用于研究活细胞中单个转录本的调控效应 | 开发了基于dPspCas13b的工具，用于研究内源性RNA的调控，并展示了这些工具在合成生物学中的应用潜力 | 目前对于mA的写入者、擦除者和阅读者之间的竞争性相互作用调控甲基化RNA转录本的研究尚不充分 | 研究RNA的转录后基因表达调控，特别是N-甲基腺苷(mA)修饰对RNA的影响 | 研究特定阅读器蛋白对单个转录本的调控效应 | 生物技术 | NA | RNA修饰分析 | dPspCas13b-mA阅读器蛋白 | RNA | 活细胞中的单个转录本 |
| 2664 | 2024-08-07 |
Transcriptional reprogramming in yeast using dCas9 and combinatorial gRNA strategies
2017-Mar-15, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-017-0664-2
PMID:28298224
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研究论文 | 本研究比较了两种基于dCas9的转录重编程系统，并将其应用于酵母中的两条生物合成途径，以生产异戊二烯和甘油三酯（TAG） | 本研究展示了常驻和诱导型dCas9方法的相似性能，并识别了能够显著扰动酵母中异戊二烯生产和TAG剖面的多重gRNA设计 | 研究指出，在14个酵母目标启动子中有大量gRNA位置不影响表达，表明需要进一步优化gRNA设计工具和dCas9工程 | 旨在开发合成生物学工具，实现对转录的正交控制，以便在不干扰原生基因表达机制的情况下灵活及时地控制基因表达 | 酵母中的异戊二烯和甘油三酯（TAG）生物合成途径 | 合成生物学 | NA | dCas9 | NA | 基因表达数据 | 101个gRNA结构，14个不同的酵母启动子 |
| 2665 | 2024-08-07 |
Targeted isolation and cloning of 100-kb microbial genomic sequences by Cas9-assisted targeting of chromosome segments
2016-May, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/nprot.2016.055
PMID:27101517
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research paper | 本文介绍了一种基于Cas9核酸酶的体外应用方法，用于从微生物中克隆长达100kb的基因组序列。 | 提出了一种名为Cas9辅助染色体片段靶向（CATCH）的新方法，通过体外切割目标DNA并使用Gibson组装法与克隆载体连接，简化了长基因组序列的克隆过程。 | NA | 开发一种新的技术方法，用于从微生物中高效克隆长基因组序列。 | 微生物的长基因组序列。 | genome engineering | NA | Cas9 nuclease, Gibson assembly | NA | DNA sequence | NA |
| 2666 | 2024-08-07 |
Multicolor optogenetics for regulating flux ratio of three glycolytic pathways using EL222 and CcaSR in Escherichia coli
2024-Mar, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28628
PMID:38116710
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研究论文 | 本文展示了通过使用蓝光响应的EL222和绿/红光响应的CcaSR在Escherichia coli中通过多色光照控制糖酵解途径的通量比 | 利用多色光调控技术，实现了对三种糖酵解途径（EMP、PP和ED）通量比的具体控制 | NA | 探索通过光遗传学技术控制代谢通量分布的方法 | Escherichia coli中的糖酵解途径 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA |
| 2667 | 2024-08-07 |
Precise integration of large DNA sequences in plant genomes using PrimeRoot editors
2024-Feb, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01769-w
PMID:37095350
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研究论文 | 本文介绍了一种名为PrimeRoot的基因编辑方法，用于在植物基因组中精确插入大型DNA片段 | PrimeRoot编辑器采用了优化的引导RNA设计、增强的植物编辑器和先进的重组酶，能够实现高达11.1千碱基的精确DNA插入 | NA | 开发一种技术，用于在植物基因组中精确插入大型DNA片段，以促进农业特性和信号及代谢途径的引入 | 植物基因组和基因调控元件 | 基因编辑 | NA | PrimeRoot编辑器 | NA | DNA序列 | 在Kitaake水稻中进行了基因盒的整合，获得了含有预期插入的编辑植物，效率为6.3% |
| 2668 | 2024-08-07 |
The Future of Virology is Synthetic
2021-Aug-31, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/mSystems.00770-21
PMID:34463577
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评论 | 文章讨论了合成生物学在病毒学中的应用及其对未来人类健康和可持续农业的潜在贡献 | 提出合成病毒作为理解微生物生态系统中生命规则的工具，并可能提供针对多药耐药微生物的未来治疗策略 | NA | 探讨合成生物学在病毒学中的应用及其对生态系统稳定性和人类健康的潜在影响 | 全球病毒组及其在微生物生态系统中的作用 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 2669 | 2024-08-07 |
Words Are Essential, but Underexamined, Research Tools for Microbes and Microbiomes
2021-Aug-31, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/mSystems.00769-21
PMID:34463574
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研究论文 | 本文探讨了语言工具（尤其是隐喻）在微生物和微生物组研究中的重要性和未被充分重视的问题 | 研究揭示了隐喻在微生物学研究中的潜在影响，并强调了对其进行审查的必要性 | 文章未明确指出具体的研究限制 | 旨在探讨和揭示隐喻在微生物学研究中的作用及其对研究方向的影响 | 研究对象包括酵母、细菌以及合成生物学和微生物组研究等领域 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2670 | 2024-08-07 |
Retooling Microbiome Engineering for a Sustainable Future
2021-Aug-31, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/mSystems.00925-21
PMID:34463582
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评论 | 本文讨论了系统生物学方法在微生物组工程中的应用，以及如何通过整合合成生物学、自动化和机器学习来加速微生物组工程以应对未来的可持续性挑战 | 本文提出了通过系统生物学方法和整合合成生物学、自动化及机器学习来精确操纵和控制微生物组，以释放其全部潜力 | NA | 探讨如何利用系统生物学方法和新兴的遗传工程工具来优化微生物组工程，以应对未来的可持续性挑战 | 微生物组及其在生物技术应用中的功能 | NA | NA | 系统生物学、合成生物学、自动化、机器学习 | NA | NA | NA |
| 2671 | 2024-08-07 |
Third Generation Whole-Cell Sensing Systems: Synthetic Biology Inside, Nanomaterial Outside
2020-Oct-23, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2020.10.002
PMID:34756379
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研究论文 | 本文探讨了第三代全细胞传感系统，结合合成生物学和纳米材料以提高其特异性、稳定性和环境适应性 | 利用合成生物学进行智能设计和组装元素、模块及遗传电路，同时纳米材料提供稳定保护和远程控制能力 | NA | 推动全细胞传感系统的工业化应用 | 全细胞传感系统的改进和应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学，纳米材料 | NA | NA | NA |
| 2672 | 2024-08-07 |
A genetic toolbox to empower Paracoccus pantotrophus DSM 2944 as a metabolically versatile SynBio chassis
2024-Feb-15, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02325-0
PMID:38360576
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研究论文 | 本研究旨在将Paracoccus pantotrophus DSM 2944转化为高效的合成生物学底盘，并开发了一套遗传工具箱以实现基因编辑和多种应用的可能性 | 成功开发了一套遗传工具箱，包括抗生素抗性分析、复制起点选择、基因转移方法评估、基因删除和整合技术，以及适应性实验室进化，以增强底盘的代谢多样性和应用潜力 | NA | 将Paracoccus pantotrophus DSM 2944发展为高效的合成生物学底盘 | Paracoccus pantotrophus DSM 2944的遗传改造和应用潜力 | 合成生物学 | NA | 基因编辑 | NA | 基因组数据 | 单个菌株Paracoccus pantotrophus DSM 2944 |
| 2673 | 2024-08-07 |
Cytokine signaling in chimeric antigen receptor T-cell therapy
2024-Feb-14, International immunology
IF:4.8Q2
DOI:10.1093/intimm/dxad033
PMID:37591521
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综述 | 本文综述了通过基因工程调节细胞因子信号以增强嵌合抗原受体T细胞（CAR-T细胞）治疗效果的合成生物学方法 | 提出了通过基因工程调节CAR-T细胞中的细胞因子信号，包括外源表达细胞因子和细胞因子受体，以及通过转录和表观遗传修饰增强自分泌IL-2信号 | 文章未明确提及具体限制 | 旨在探讨如何通过调节细胞因子信号来增强CAR-T细胞的治疗效果并减轻相关毒性 | CAR-T细胞及其在治疗中的应用 | 免疫疗法 | 血液恶性肿瘤 | 基因工程 | NA | NA | NA |
| 2674 | 2024-08-07 |
Choreographing root architecture and rhizosphere interactions through synthetic biology
2024-Feb-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45272-5
PMID:38355570
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研究论文 | 本文探讨了通过合成生物学技术调控植物根系结构及其与根际微生物相互作用，以应对气候变化对全球粮食安全和生物能源的威胁 | 利用合成遗传电路技术控制植物根系结构和功能及其相关微生物群落，为培育适应气候变化的作物提供新策略 | NA | 通过合成生物学技术改善植物根系及其与根际微生物的相互作用，以增强作物对气候变化的适应性 | 植物根系结构、根系分泌物及根表微生物活性 | 合成生物学 | NA | 合成遗传电路 | NA | NA | NA |
| 2675 | 2024-08-07 |
Use of Cas9 Targeting and Red Recombination for Designer Phage Engineering
2024-Jan, Journal of microbiology (Seoul, Korea)
DOI:10.1007/s12275-024-00107-2
PMID:38300409
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研究论文 | 本文报道了一种直接的基因组工程方法，用于在模型细菌病原体铜绿假单胞菌中高效获得工程噬菌体 | 利用Streptococcus pyogenes Cas9和λRed重组系统开发了一种新的设计噬菌体工程方法 | NA | 开发一种高效的基因组工程方法，用于创建设计噬菌体 | 铜绿假单胞菌中的工程噬菌体 | 合成生物学 | NA | Cas9靶向和Red重组 | NA | 基因组数据 | 使用了铜绿假单胞菌PAO1菌株和温和噬菌体MP29 |
| 2676 | 2024-08-07 |
An open-source, 3D printed inkjet DNA synthesizer
2024-02-14, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-53944-x
PMID:38355610
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研究论文 | 本文介绍了一种开源的3D打印喷墨DNA合成器（OpenIDS），该设备利用3D打印、Arduino和Raspberry Pi技术，实现了高密度寡核苷酸的合成，具有易于构建、快速部署和灵活扩展的特点。 | OpenIDS采用开源设计和3D打印技术，降低了生产成本，并允许用户根据研究需求自由修改结构和添加打印头。 | NA | 开发一种成本低廉、易于构建和操作的DNA合成设备，以支持生物学领域的研究。 | 开源喷墨DNA合成器的设计、构建和性能验证。 | 合成生物学 | NA | 3D打印, Arduino, Raspberry Pi | NA | 寡核苷酸 | 在15×25毫米的硅片上合成了144个点的寡核苷酸 |
| 2677 | 2024-08-07 |
Synthetic biology for combating leishmaniasis
2024, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2024.1338749
PMID:38362504
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research paper | 本文综述了合成生物学在开发针对利什曼病的疫苗、诊断工具和新疗法方面的最新进展 | 合成生物学作为一个快速发展的跨学科领域，为对抗利什曼病提供了新的有效策略 | NA | 探讨合成生物学在治疗利什曼病中的应用 | 利什曼病的疫苗、诊断工具和新疗法 | NA | neglected tropical disease | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 2678 | 2024-08-07 |
The geometry of life: when mathematics meets synthetic biology
2022-Aug-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/d41586-022-02176-y
PMID:35953574
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2679 | 2024-08-07 |
Liquid-Liquid phase separation in bacteria
2024-Apr, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2024.127627
PMID:38262205
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综述 | 本文综述了液体-液体相分离（LLPS）在细菌中的分子机制及其在合成生物学中的应用前景 | 发现细菌中的无膜细胞器通过液体-液体相分离（LLPS）机制进行组装，并在合成生物学中具有潜在应用 | NA | 探讨LLPS在细菌中的分子机制及其在合成生物学中的应用 | 细菌中的无膜细胞器及LLPS机制 | NA | NA | 液体-液体相分离（LLPS） | NA | NA | NA |
| 2680 | 2024-08-07 |
A robust yeast chassis: comprehensive characterization of a fast-growing Saccharomyces cerevisiae
2024-Feb-14, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03196-23
PMID:38214535
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研究论文 | 本研究全面描述了一种新型快速生长酵母菌株XP的特性，并通过基因组、转录组和代谢组分析揭示了其快速生长的机制 | 开发了一种遗传可塑性强的快速生长酵母菌株XP，并构建了用于遗传操作的工具箱，用于高效生产l-乳酸 | NA | 探索和优化用于合成生物学的稳健底盘 | 新型快速生长酵母菌株XP及其遗传操作工具箱 | 合成生物学 | NA | 基因组分析、转录组分析、代谢组分析 | NA | 基因组数据、转录组数据、代谢组数据 | 一种新型酵母菌株XP |