合成生物学相关文章
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当前共找到 3041 篇文献，本页显示第 2761 - 2780 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2761 | 2024-08-07 |
Biosynthetic pathway of prescription bergenin from Bergenia purpurascens and Ardisia japonica
2023, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2023.1259347
PMID:38239219
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析、异源表达和酶学特性研究，功能性地表征了参与bergenin生物合成途径的shikimate脱氢酶（SDH）、两种O-甲基转移酶（OMTs）和一种糖基转移酶（CGT）。 | 首次揭示了bergenin的生物合成途径，为通过合成生物学策略在细胞工厂中合理生产bergenin铺平了道路。 | NA | 揭示bergenin的生物合成途径 | shikimate脱氢酶（SDH）、两种O-甲基转移酶（OMTs）和一种糖基转移酶（CGT） | NA | NA | 生物信息学分析、异源表达、酶学特性研究 | NA | NA | NA |
| 2762 | 2024-08-07 |
Reconstruction of a catalogue of genome-scale metabolic models with enzymatic constraints using GECKO 2.0
2022-06-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-31421-1
PMID:35773252
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研究论文 | 本文升级了GECKO工具箱，以增强任何具有兼容GEM重建的生物体的酶和蛋白质组学约束模型，并生成了几种酵母的酶约束模型，以研究它们对多种应激因子的长期适应 | 引入了自动化框架，用于酶约束GEM的连续和版本控制更新，并扩展了GECKO的功能 | NA | 研究微生物在应激和营养限制条件下的生长，以及代谢鲁棒性与蛋白质利用最优性之间的关系 | 酵母菌属的Saccharomyces cerevisiae、Yarrowia lipolytica和Kluyveromyces marxianus，以及大肠杆菌和人类 | 代谢工程 | NA | GECKO 2.0 | GEM（基因组规模代谢模型） | 蛋白质组学数据 | 涉及多种酵母菌和大肠杆菌及人类 |
| 2763 | 2024-08-07 |
Development of new binary expression systems for plant synthetic biology
2023-Dec-27, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-023-03100-y
PMID:38150091
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研究论文 | 本文开发了一种新的植物二元表达系统，源自Penicillium citrinum ML-236B的compactin生物合成途径，并在转基因烟草中实现了基因表达的五倍激活 | 本文利用Penicillium citrinum ML-236B途径中的调控元件开发了合成植物转录因子，并成功在转基因烟草中实现了基因表达的显著提升 | NA | 开发和优化植物合成生物学的遗传工具集 | 植物二元表达系统和合成转录因子 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 基因表达数据 | 转基因烟草植物和非转基因对照植物 |
| 2764 | 2024-08-07 |
Towards a hybrid model-driven platform based on flux balance analysis and a machine learning pipeline for biosystem design
2024-Mar, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2023.12.004
PMID:38234412
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研究论文 | 本研究提出并严格评估了一种基于通量平衡分析和机器学习管道的混合模型驱动的生物系统设计平台 | 首次全面探索了代谢模型与机器学习框架的集成，并充分利用了通量组数据 | NA | 旨在揭示基因型、表型与环境之间复杂关系的下一代系统与合成生物学工具 | 代谢模型与机器学习技术的集成及其在生物系统设计中的应用 | 合成生物学 | NA | 机器学习 | 混合模型 | 通量组数据 | 涉及六个目标基因的过表达和七个目标基因的敲除实验 |
| 2765 | 2024-08-07 |
IMP: bridging the gap for medicinal plant genomics
2024-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad898
PMID:37870445
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研究论文 | 开发了一个名为IMP的综合平台，用于整合和分析药用植物的基因组和转录组数据 | IMP平台整合了大量药用植物的基因组和转录组数据，并提供了10个分析模块，便于用户一站式查询基因注释、序列、功能、分布和表达 | NA | 旨在解决药用植物基因组和转录组数据利用不足的问题，推动合成生物学和药物发现领域的发展 | 药用植物的基因组和转录组数据 | 基因组学 | NA | 基因组测序，转录组测序 | NA | 基因组数据，转录组数据 | 84个高质量基因组，2156个转录组测序样本 |
| 2766 | 2024-08-07 |
Synthetic Biology Facilitates Semisynthetic Development of Type V Glycopeptide Antibiotics Targeting Vancomycin-Resistant Enterococcus
2023-07-13, Journal of medicinal chemistry
IF:6.8Q1
DOI:10.1021/acs.jmedchem.3c00633
PMID:37315221
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法，对第五类糖肽抗生素rimomycin A进行半合成改造，生成了32种新的类似物，其中一种化合物通过N端酰化和C端酰胺化，显示出增强的抗万古霉素耐药肠球菌（VRE）活性和溶解性 | 本研究创新性地通过合成生物学方法改造第五类糖肽抗生素，生成新的类似物，并展示了其增强的抗VRE活性 | NA | 开发针对万古霉素耐药肠球菌的下一代糖肽抗生素 | 第五类糖肽抗生素rimomycin A及其类似物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 32种新的类似物 |
| 2767 | 2024-08-07 |
Regulation of genes encoding polysaccharide-degrading enzymes in Penicillium
2024-Dec, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-023-12892-8
PMID:38170318
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综述 | 本文综述了Penicillium真菌中植物多糖降解酶（PPDEs）的分布、功能及其生物合成调控机制，并介绍了通过分子育种提高PPDE产量Penicillium菌株的研究进展。 | 本文更新了关于PPDE生物合成调控机制和PPDE高产Penicillium菌株育种的最新研究进展。 | NA | 促进基于PPDE的工业生物炼制应用。 | Penicillium真菌中的植物多糖降解酶（PPDEs）及其调控机制。 | NA | NA | 分子育种 | NA | NA | NA |
| 2768 | 2024-08-07 |
Microbial host engineering for sustainable isobutanol production from renewable resources
2024-Dec, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-023-12821-9
PMID:38175234
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综述 | 本文综述了利用遗传工程技术提高微生物宿主从可再生资源生产异丁醇的策略和合成生物学方法 | 利用遗传工程技术增强微生物宿主生产异丁醇的能力 | 工程化微生物宿主面临的挑战，如有限的底物范围、对溶剂或抑制剂的低耐受性等 | 探讨提高从可再生资源生产异丁醇的效率 | 异丁醇作为生物燃料的生产 | 生物工程 | NA | 遗传工程技术 | NA | NA | NA |
| 2769 | 2024-08-07 |
Heterologous expression of Arabidopsis laccase2, laccase4 and peroxidase52 driven under developing xylem specific promoter DX15 improves saccharification in populus
2024-Jan-13, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-023-02452-7
PMID:38218877
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研究论文 | 本研究通过异源表达拟南芥的Laccase2、Laccase4和Peroxidase52基因，并使用DX15启动子驱动其在杨树中的表达，以提高杨树的糖化效率。 | 首次在杨树中异源表达拟南芥的Laccase和Peroxidase基因，以优化木质纤维素生物质的糖化效率，为生物燃料生产提供可持续解决方案。 | NA | 研究特定Laccase和Peroxidase基因在杨树木材形成中的作用，并探讨其表达变化如何影响生物质抗性和植物生长。 | 拟南芥的Laccase2、Laccase4和Peroxidase52基因在杨树中的表达及其对生物质糖化效率的影响。 | 植物生物技术 | NA | 异源表达 | NA | 基因表达数据 | 转基因杨树株系 |
| 2770 | 2024-08-07 |
A Self-Regenerating Artificial Cell, that is One Step Closer to Living Cells: Challenges and Perspectives
2023-12, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202300182
PMID:37246263
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综述 | 本文综述了可控自再生人工细胞（SRACs）领域的最新进展及其在合成生物学中的应用前景 | 首次探讨了通过重组实验室中的各种生物分子来创造生殖细胞的可能性 | 目前仍难以在人工创造的空间中复制细胞再生过程中的复杂过程，如遗传物质复制和细胞膜分裂 | 旨在实现创造可控自再生人工细胞的目标 | 可控自再生人工细胞及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2771 | 2024-08-07 |
Engineering a Plant Polyketide Synthase for the Biosynthesis of Methylated Flavonoids
2024-Jan-10, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.3c06785
PMID:38109879
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研究论文 | 本研究通过工程化植物聚酮合酶，提高了O-甲基化黄酮类化合物的生物合成效率 | 通过构建突变体变异，成功提高了homoeriodictyol和hesperetin的产量，分别为之前的2倍和10倍 | NA | 提高O-甲基化黄酮类化合物的生物合成效率 | 植物聚酮合酶及其在微生物中的应用 | 生物工程 | NA | 晶体结构分析 | NA | 蛋白质结构 | 涉及多种酶和突变体变异 |
| 2772 | 2024-08-07 |
Biosynthesis, Engineering, and Delivery of Selenoproteins
2023-Dec-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25010223
PMID:38203392
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综述 | 本文综述了硒代半胱氨酸（Sec）的发现、生物合成及其在工程和递送中的应用 | 强调了遗传密码扩展技术在细菌和酵母中定向插入Sec的最新进展 | NA | 探讨Sec在人类健康和疾病治疗中的重要性及其在合成生物学中的新应用 | Sec的生物合成、遗传编码及其在蛋白质工程中的应用 | 生物技术 | NA | 遗传密码扩展 | NA | NA | NA |
| 2773 | 2024-08-07 |
Programmable synthetic biomolecular condensates for cellular control
2023-04, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-022-01252-8
PMID:36747054
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研究论文 | 本文介绍了一种理性工程方法，用于编程合成凝聚物的形成和物理特性，以实现预期的细胞功能 | 提出了一种新的理性工程方法，用于设计和控制合成凝聚物的形成和物理特性，以实现特定的细胞功能 | 目前主要集中在细菌和哺乳动物细胞中的实验验证，未来可能需要扩展到更多类型的细胞和生物系统 | 开发一种新的方法来设计和控制合成凝聚物，以应用于合成生物学 | 合成凝聚物的形成和物理特性，以及其在细胞功能调控中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 细菌和哺乳动物细胞 |
| 2774 | 2024-08-07 |
Recent progress in engineering Clostridium autoethanogenum to synthesize the biochemicals and biocommodities
2024-Mar, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2023.12.001
PMID:38205027
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综述 | 本文综述了利用合成生物学工具改进Clostridium autoethanogenum代谢能力，以通过气体发酵可持续生产生物化学品和生物燃料的最新进展 | 介绍了合成生物学工具在改进Clostridium autoethanogenum代谢能力方面的应用 | NA | 总结Clostridium autoethanogenum的生理机制和菌株工程的最新进展，并展望其基础生物学和工程生物学的未来发展 | Clostridium autoethanogenum的生理机制和菌株工程 | 生物工程 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 2775 | 2024-08-07 |
Construction and characterization of a temperature-sensitive pRC4 replicon for Rhodococcus and Gordonia
2024-Feb-20, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2023.147990
PMID:37977321
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研究论文 | 本文报道了在Rhodococcus和Gordonia中构建并表征了一种温度敏感的pRC4复制子 | 首次在Gordonia中构建了温度敏感的pRC4复制子，并通过分子模拟验证了其温度敏感性 | NA | 开发适用于Rhodococcus和Gordonia的温度敏感质粒，用于基因组工程和合成生物学应用 | Rhodococcus和Gordonia的温度敏感pRC4复制子 | 合成生物学 | NA | 分子模拟 | NA | DNA | Gordonia sp. IITR100和Rhodococcus erythropolis |
| 2776 | 2024-08-07 |
Applications of synthetic yeast consortia for the production of native and non-native chemicals
2024-Feb, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2022.2118569
PMID:36130800
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review | 本文综述了合成酵母共生体系在生产天然和非天然化学品中的应用 | 合成酵母共生体系通过成员间的合作和交叉喂养，实现了稳定的微生物交流，能够消耗多种底物，执行更复杂的功能，并以高滴度、速率和产量生产代谢物 | 由于合成共生体系的新研究背景，用于构建这些共生体系的酵母种类较少 | 探讨合成酵母共生体系在有效和稳健生产有价值代谢物方面的优势和瓶颈 | 合成酵母共生体系及其在生产如纤维素、木糖、甘油等生物资源中有价值代谢物的应用 | synthetic biology | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2777 | 2024-08-07 |
Genomic imprints of unparalleled growth
2024-Feb, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.19444
PMID:38072860
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研究论文 | 本文比较了快速生长的绿藻Chlorella ohadii的基因组与其他绿藻的基因组，揭示了其快速生长和抗逆性的基因组印记 | 发现了Chlorella ohadii中与快速生长相关的多个核糖体编码基因、高内含子丰度、增加的密码子偏倚和独特的代谢灵活性及抗光损伤基因 | NA | 研究Chlorella ohadii的基因组适应性和快速生长的基因组特征 | Chlorella ohadii的基因组与其他绿藻的基因组 | NA | NA | 基因组比较 | NA | 基因组数据 | 包括Chlorella ohadii和其近缘种Chlorella sorokiniana UTEX 1663 |
| 2778 | 2024-08-07 |
Eco-friendly approaches to phytochemical production: elicitation and beyond
2024-Jan-10, Natural products and bioprospecting
IF:4.8Q1
DOI:10.1007/s13659-023-00419-7
PMID:38195902
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综述 | 本文综述了植物次生代谢产物生产的生态友好方法，特别是激发子在提高植物细胞培养物中生物活性化合物合成和储存中的作用及现代代谢工程和合成生物学方法的应用 | 介绍了代谢工程和合成生物学等分子基础方法在植物次生代谢产物合成中的应用前景 | 需要深入了解植物细胞培养中对激发子的代谢响应，以实现生物活性化合物在商业水平上的合成突破 | 探讨可持续和生态友好的体外策略，以提高植物细胞培养物中次生代谢产物的产量 | 植物次生代谢产物及其在提高人类健康中的应用 | NA | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
| 2779 | 2024-08-07 |
DNA origami: a tool to evaluate and harness transcription factors
2023-12, Journal of molecular medicine (Berlin, Germany)
DOI:10.1007/s00109-023-02380-x
PMID:37813986
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研究论文 | 本文探讨了DNA折纸技术在评估和利用转录因子（TFs）中的应用 | 提出DNA折纸作为一种新型合成DNA纳米技术方法，能够利用DNA的多个关键特性，如DNA聚合、DNA互补性、DNA可编程性和DNA可编辑性 | NA | 研究如何通过合成生物学/医学手段辅助转录因子的研究和治疗靶向 | 转录因子及其在基因调控中的作用 | 合成生物学 | NA | DNA折纸 | NA | NA | NA |
| 2780 | 2024-08-07 |
Plasmid Crosstalk in Cell-Free Expression Systems
2023-10-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00412
PMID:37756020
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研究论文 | 本文探讨了无细胞表达系统中质粒间相互作用（质粒串扰）对蛋白质表达水平的影响 | 首次详细研究了质粒浓度和转录机器类型对质粒串扰效应的影响 | 未提及具体限制 | 研究质粒串扰对无细胞合成生物学应用中遗传电路功能的影响 | 无细胞表达系统中的质粒串扰现象 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白质表达 | NA | 蛋白质表达水平 | 未提及具体样本数量 |