合成生物学相关文章
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当前共找到 3054 篇文献，本页显示第 2761 - 2780 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2761 | 2024-08-07 |
Synthetic Biology Tools for Engineering Aspergillus oryzae
2024-Jan-03, Journal of fungi (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/jof10010034
PMID:38248944
|
综述 | 本文综述了用于工程化Aspergillus oryzae的合成生物学工具的最新进展 | 讨论了DNA组装技术、基因表达调控元件和基因组编辑系统等生物工具的进步 | 探讨了异源表达的挑战 | 旨在探讨Aspergillus oryzae合成生物学工具的发展及其在现代生物技术产业中的应用 | Aspergillus oryzae及其在食品发酵、酿造、调味和生物制品生产中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
| 2762 | 2024-08-07 |
A Genetic Circuit Design for Targeted Viral RNA Degradation
2023-Dec-25, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering11010022
PMID:38247899
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综述 | 本文综述了利用合成生物学设计遗传电路以实现靶向病毒RNA降解的过程和方法 | 提出了一个可定制的遗传电路设计模板，利用RNA结合蛋白作为转录激活因子，模拟自然RNA降解途径，实现靶向病毒RNA降解 | NA | 探讨如何通过设计遗传电路来靶向降解病毒RNA，从而干扰病毒复制和感染 | 病毒RNA降解和遗传电路设计 | 合成生物学 | NA | 遗传电路设计 | NA | NA | NA |
| 2763 | 2024-08-07 |
Modeling the effects of strigolactone levels on maize root system architecture
2023, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2023.1329556
PMID:38273953
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研究论文 | 本文介绍了一种基于Mathematica的平台，用于模拟和预测合成生物学干预对玉米根系架构和激素水平的影响 | 开发了一个结合代谢模型和3D根系生长模型的模拟平台，能够模拟激素水平变化对根系架构的影响 | NA | 研究如何通过调节激素合成来增强玉米对干旱和寄生植物的抵抗力 | 玉米根系架构及其与激素水平的关系 | NA | NA | NA | 代谢模型和3D根系生长模型 | 3D根系架构 | NA |
| 2764 | 2024-08-07 |
Structure, folding and flexibility of co-transcriptional RNA origami
2023-07, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/s41565-023-01321-6
PMID:36849548
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研究论文 | 本文通过低温电子显微镜研究RNA折纸结构的结构、折叠和灵活性，揭示了RNA折纸设计中的关键结构参数和折叠机制 | 发现了RNA折纸设计中的动力学折叠陷阱，并通过组合不同结构构建了多域卫星形状，揭示了域的灵活性 | NA | 深入理解RNA折纸结构的结构特性和折叠原理，以改进RNA纳米器件的设计 | RNA折纸片和束的结构、折叠过程及其灵活性 | 合成生物学 | NA | 低温电子显微镜 | NA | 结构参数 | NA |
| 2765 | 2024-08-07 |
Enzyme-Free Dynamic DNA Reaction Networks for On-Demand Bioanalysis and Bioimaging
2024-Jan-25, Accounts of chemical research
IF:16.4Q1
DOI:10.1021/acs.accounts.3c00676
PMID:38271669
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研究论文 | 本文总结了无酶动态DNA反应网络在生物分析和生物成像中的应用 | 开发了一系列无酶动态DNA反应网络，用于增强分子识别功能、提高信号转导能力和实现细胞内特异性激活 | NA | 探索高效率放大的DNA电路，用于操作复杂的动态反应网络，以实现多种生物应用 | DNA电路的功能扩展、放大能力提升和特异性激活系统 | 生物分析 | NA | DNA电路 | DNAzyme电路 | 生物分子 | NA |
| 2766 | 2024-08-07 |
Simple phenylpropanoids: recent advances in biological activities, biosynthetic pathways, and microbial production
2024-Jan-24, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d3np00012e
PMID:37807808
|
综述 | 本文综述了简单苯丙烷类化合物的生物活性、生物合成途径及微生物生产的研究进展 | 利用代谢工程和合成生物学技术，从廉价可再生的资源中进行微生物生产，为可持续供应提供了可行解决方案 | NA | 探讨简单苯丙烷类化合物的生物活性和生产方法，以满足日益增长的需求 | 简单苯丙烷类化合物及其在不同物种中的生物合成途径 | 生物技术 | NA | 代谢工程，合成生物学 | NA | NA | NA |
| 2767 | 2024-08-07 |
Genomics-driven derivatization of the bioactive fungal sesterterpenoid variecolin: Creation of an unnatural analogue with improved anticancer properties
2024-Jan, Acta pharmaceutica Sinica. B
DOI:10.1016/j.apsb.2023.08.025
PMID:38261827
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研究论文 | 本研究通过基因组学驱动的方法，对生物活性真菌倍半萜烯化合物variecolin进行衍生化，创造出一种具有改进抗癌特性的非天然类似物 | 首次在动物中测试variecolin及其类似物，并展示了合成生物学在创造具有改进生物活性分子方面的实用性 | NA | 通过合成生物学方法创造具有改进生物活性的分子 | 真菌倍半萜烯化合物variecolin及其类似物的衍生化和抗癌活性 | NA | 癌症 | 合成生物学 | NA | 化合物 | 涉及癌症携带小鼠 |
| 2768 | 2024-08-07 |
Current advances in the use of bioluminescence assays for drug discovery: an update of the last ten years
2024 Jan-Jun, Expert opinion on drug discovery
IF:6.0Q1
DOI:10.1080/17460441.2023.2266989
PMID:37814480
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综述 | 本文综述了生物发光系统在药物发现计划中作为工具集的最新进展，特别关注过去十年中用于药物筛选的最先进生物发光技术。 | 得益于合成生物学技术和深度学习的发展，现在有了一系列具有调谐发射波长、动力学和高稳定性的荧光素酶。 | 需要进一步结合机器学习和合成生物学研究，以获得新的可持续且高度预测的生物发光药物发现平台工具。 | 总结生物发光系统在药物发现中的应用进展。 | 生物发光技术在药物筛选中的应用，包括无细胞检测、基于遗传修饰细胞的细胞检测、生物发光共振能量转移和蛋白质互补检测。 | 生物技术 | NA | 生物发光检测技术 | 深度学习 | NA | NA |
| 2769 | 2024-08-07 |
Synthetic Biology Continues to Grow
2024-Jan-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00765
PMID:38239130
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2770 | 2024-08-07 |
'Mother(Nature) knows best' - hijacking nature-designed transcriptional programs for enhancing stress resistance and protein production in Yarrowia lipolytica; presentation of YaliFunTome database
2024-Jan-18, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-023-02285-x
PMID:38238843
|
研究论文 | 本文通过筛选大量Yarrowia lipolytica菌株，利用高吞吐量培养协议，探索自然设计的转录程序在增强应激抵抗和蛋白质生产中的应用，并介绍了YaliFunTome数据库。 | 本文创新地利用自然进化的转录程序，通过筛选和数学建模，发现并验证了能够增强蛋白质合成和应激抵抗的转录因子。 | NA | 旨在通过利用自然设计的转录程序，实现对Yarrowia lipolytica菌株的合成生物学改造，以增强其工业应用中的应激抵抗和蛋白质生产能力。 | 研究对象为Yarrowia lipolytica菌株及其转录因子。 | 合成生物学 | NA | 高吞吐量培养协议 | 数学建模 | 数值数据 | 超过120株Yarrowia lipolytica菌株，72种变量组合 |
| 2771 | 2024-08-07 |
Biphasic amplitude oscillator characterized by distinct dynamics of trough and crest
2023-Dec, Physical review. E
DOI:10.1103/PhysRevE.108.064412
PMID:38243441
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研究论文 | 研究了生物系统中双相振幅动态的特定拓扑结构和调控机制 | 识别了实现稳定振荡的核心振荡器，并利用景观理论研究了系统的随机动力学和全局稳定性 | NA | 理解振荡系统中双相振幅动态的发生机制 | 双相振幅动态的振荡器拓扑结构和调控机制 | 生物学 | NA | NA | 振荡器模型 | 理论分析 | NA |
| 2772 | 2024-08-07 |
A spotlight on global collaboration in the Sc2.0 yeast consortium
2023-11-08, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2023.100441
PMID:38020973
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研究论文 | 本文重点介绍了合成酵母基因组项目（Sc2.0）中中国研究团队的工作及其对Sc2.0和合成生物学未来的看法 | NA | NA | 创建和优化合成染色体，最终目标是组装一个具有设计特征的合成酵母生物，以促进合成生物学和工程项目的应用 | 合成酵母基因组 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2773 | 2024-08-07 |
A Mesorhizobium japonicum quorum sensing circuit that involves three linked genes and an unusual acyl-homoserine lactone signal
2023-08-31, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01010-23
PMID:37227303
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研究论文 | 本文研究了Mesorhizobium japonicum中的群体感应系统，该系统涉及三个连锁基因和一个独特的酰基高丝氨酸内酯信号 | 发现了Mesorhizobium japonicum中一种新的群体感应系统，该系统涉及一个独特的酰基高丝氨酸内酯信号和三个组件，而非传统的两个组件 | NA | 研究Mesorhizobium japonicum中的群体感应系统及其在根瘤共生中的作用 | Mesorhizobium japonicum的群体感应系统和其产生的独特酰基高丝氨酸内酯信号 | NA | NA | 群体感应 | NA | 基因组序列 | 涉及多个Mesorhizobium japonicum菌株 |
| 2774 | 2024-08-07 |
Biosynthetic pathway of prescription bergenin from Bergenia purpurascens and Ardisia japonica
2023, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2023.1259347
PMID:38239219
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析、异源表达和酶学特性研究，功能性地表征了参与bergenin生物合成途径的shikimate脱氢酶（SDH）、两种O-甲基转移酶（OMTs）和一种糖基转移酶（CGT）。 | 首次揭示了bergenin的生物合成途径，为通过合成生物学策略在细胞工厂中合理生产bergenin铺平了道路。 | NA | 揭示bergenin的生物合成途径 | shikimate脱氢酶（SDH）、两种O-甲基转移酶（OMTs）和一种糖基转移酶（CGT） | NA | NA | 生物信息学分析、异源表达、酶学特性研究 | NA | NA | NA |
| 2775 | 2024-08-07 |
Reconstruction of a catalogue of genome-scale metabolic models with enzymatic constraints using GECKO 2.0
2022-06-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-31421-1
PMID:35773252
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研究论文 | 本文升级了GECKO工具箱，以增强任何具有兼容GEM重建的生物体的酶和蛋白质组学约束模型，并生成了几种酵母的酶约束模型，以研究它们对多种应激因子的长期适应 | 引入了自动化框架，用于酶约束GEM的连续和版本控制更新，并扩展了GECKO的功能 | NA | 研究微生物在应激和营养限制条件下的生长，以及代谢鲁棒性与蛋白质利用最优性之间的关系 | 酵母菌属的Saccharomyces cerevisiae、Yarrowia lipolytica和Kluyveromyces marxianus，以及大肠杆菌和人类 | 代谢工程 | NA | GECKO 2.0 | GEM（基因组规模代谢模型） | 蛋白质组学数据 | 涉及多种酵母菌和大肠杆菌及人类 |
| 2776 | 2024-08-07 |
Development of new binary expression systems for plant synthetic biology
2023-Dec-27, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-023-03100-y
PMID:38150091
|
研究论文 | 本文开发了一种新的植物二元表达系统，源自Penicillium citrinum ML-236B的compactin生物合成途径，并在转基因烟草中实现了基因表达的五倍激活 | 本文利用Penicillium citrinum ML-236B途径中的调控元件开发了合成植物转录因子，并成功在转基因烟草中实现了基因表达的显著提升 | NA | 开发和优化植物合成生物学的遗传工具集 | 植物二元表达系统和合成转录因子 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 基因表达数据 | 转基因烟草植物和非转基因对照植物 |
| 2777 | 2024-08-07 |
Towards a hybrid model-driven platform based on flux balance analysis and a machine learning pipeline for biosystem design
2024-Mar, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2023.12.004
PMID:38234412
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研究论文 | 本研究提出并严格评估了一种基于通量平衡分析和机器学习管道的混合模型驱动的生物系统设计平台 | 首次全面探索了代谢模型与机器学习框架的集成，并充分利用了通量组数据 | NA | 旨在揭示基因型、表型与环境之间复杂关系的下一代系统与合成生物学工具 | 代谢模型与机器学习技术的集成及其在生物系统设计中的应用 | 合成生物学 | NA | 机器学习 | 混合模型 | 通量组数据 | 涉及六个目标基因的过表达和七个目标基因的敲除实验 |
| 2778 | 2024-08-07 |
IMP: bridging the gap for medicinal plant genomics
2024-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad898
PMID:37870445
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研究论文 | 开发了一个名为IMP的综合平台，用于整合和分析药用植物的基因组和转录组数据 | IMP平台整合了大量药用植物的基因组和转录组数据，并提供了10个分析模块，便于用户一站式查询基因注释、序列、功能、分布和表达 | NA | 旨在解决药用植物基因组和转录组数据利用不足的问题，推动合成生物学和药物发现领域的发展 | 药用植物的基因组和转录组数据 | 基因组学 | NA | 基因组测序，转录组测序 | NA | 基因组数据，转录组数据 | 84个高质量基因组，2156个转录组测序样本 |
| 2779 | 2024-08-07 |
Synthetic Biology Facilitates Semisynthetic Development of Type V Glycopeptide Antibiotics Targeting Vancomycin-Resistant Enterococcus
2023-07-13, Journal of medicinal chemistry
IF:6.8Q1
DOI:10.1021/acs.jmedchem.3c00633
PMID:37315221
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法，对第五类糖肽抗生素rimomycin A进行半合成改造，生成了32种新的类似物，其中一种化合物通过N端酰化和C端酰胺化，显示出增强的抗万古霉素耐药肠球菌（VRE）活性和溶解性 | 本研究创新性地通过合成生物学方法改造第五类糖肽抗生素，生成新的类似物，并展示了其增强的抗VRE活性 | NA | 开发针对万古霉素耐药肠球菌的下一代糖肽抗生素 | 第五类糖肽抗生素rimomycin A及其类似物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 32种新的类似物 |
| 2780 | 2024-08-07 |
Regulation of genes encoding polysaccharide-degrading enzymes in Penicillium
2024-Dec, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-023-12892-8
PMID:38170318
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综述 | 本文综述了Penicillium真菌中植物多糖降解酶（PPDEs）的分布、功能及其生物合成调控机制，并介绍了通过分子育种提高PPDE产量Penicillium菌株的研究进展。 | 本文更新了关于PPDE生物合成调控机制和PPDE高产Penicillium菌株育种的最新研究进展。 | NA | 促进基于PPDE的工业生物炼制应用。 | Penicillium真菌中的植物多糖降解酶（PPDEs）及其调控机制。 | NA | NA | 分子育种 | NA | NA | NA |