合成生物学相关文章
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当前共找到 4965 篇文献，本页显示第 261 - 280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2026-04-28 |
Nanoparticle-Based Membranes on Coacervates: From Interfacial Assembly to Biomimetic Applications
2026-Apr, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202514620
PMID:41848017
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综述 | 介绍基于纳米颗粒膜包覆凝聚液滴的形成机制、理化性质及仿生应用 | 系统分类纳米颗粒膜形成的主要驱动力（界面能驱动自组装、静电相互作用主导组装、协同多机制组装），并强调膜包覆显著提升凝聚液滴的结构完整性和选择性分子渗透性 | 当前在纳米颗粒包覆凝聚液滴的设计和调控方面存在局限性 | 通过概述纳米颗粒基膜包覆凝聚液滴的研究进展，推动其在合成生物学和仿生材料领域的进一步研究和应用 | 凝聚液滴和基于纳米颗粒的膜包覆系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 仿生材料 |
| 262 | 2026-04-28 |
Exploring the chemical diversity of Dictyostelium secondary metabolites and their biological implications
2026-Mar-10, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-026-04742-8
PMID:41805866
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综述 | 详细介绍盘基网柄菌次级代谢产物的化学多样性及其生物学意义 | 首次全面总结了盘基网柄菌中独特的次级代谢产物化学多样性，包括其他微生物来源中未发现的稀有骨架化合物，并揭示了多酮合酶和萜烯合酶基因家族在代谢多样性中的作用 | 未提及具体的研究局限性，可能受限于现有基因组数据的不完整性和代谢产物产出量的优化问题 | 探索盘基网柄菌次级代谢产物的化学多样性及其在药物发现中的潜在应用 | 盘基网柄菌的次级代谢产物，包括多酮类、萜类、生物碱、酚类和肽类等 | 天然产物化学 | NA | 色谱法, 光谱法, 化学合成, 基因组挖掘 | NA | 文本, 化学结构数据 | NA | NA | 盘基网柄菌 | NA | 医学, 药学 |
| 263 | 2026-04-28 |
From machine learning to multimodal models: The AI revolution in enzyme engineering
2026-Mar, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2025.100044
PMID:42038007
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综述 | 本文系统回顾了人工智能在酶工程中的发展，从传统机器学习到多模态模型，并提供了当前酶工程任务的指导图景 | 提出了AI在酶工程中演进的四个阶段（经典机器学习、深度神经网络、蛋白质语言模型和多模态架构），并总结了重塑该领域的四大趋势，包括从手工特征到统一嵌入、从单模态到多模态系统的转变等 | 作为综述，未提出新的实验方法或数据，可能未涵盖所有最新研究进展 | 提供AI在酶工程中应用的整合视角，包括模型类型、关键任务和数据资源 | 酶工程任务，包括功能注释、结构建模和性质预测 | 机器学习 | NA | NA | 经典机器学习算法、深度神经网络、蛋白质语言模型、多模态架构 | 蛋白质序列与结构数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、生物催化、药物发现 |
| 264 | 2026-04-28 |
Bacterial secondary metabolites as resistance-modifying adjuvants: microbial origins, molecular mechanisms, and translational relevance
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1779022
PMID:42039799
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综述 | 综述2020至2025年间细菌次级代谢产物作为抗性修饰佐剂的研究进展 | 将细菌次级代谢产物重新定位为下一代抗菌药物耐药性干预策略的核心组成部分，并整合其化学多样性、生态功能及多项分子机制 | 未明确提及具体局限性，但综述性质决定了缺乏原始实验数据验证 | 阐述细菌次级代谢产物作为抗性修饰佐剂在对抗抗菌药物耐药性中的作用 | 细菌次级代谢产物及其抗性修饰机制 | 微生物学 | 抗菌药物耐药性相关疾病 | 基因组挖掘、多组学方法、合成生物学、人工智能辅助结构活性建模 | NA | 综述性数据 | NA | 合成生物学 | 细菌 | 抗性修饰回路（如外排泵抑制、β-内酰胺酶抑制、核糖体保护干扰、生物膜与群体感应网络破坏） | 医学、生物技术 |
| 265 | 2026-04-28 |
Synthetic microbiomes in bioengineered rhizospheres: new frontiers for climate-resilient agriculture
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1780132
PMID:42039802
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综述 | 探讨通过设计合成微生物组和工程化根际来增强植物在环境胁迫下的恢复力，以应对气候变化对农业的威胁 | 整合多界微生物（细菌、真菌、原生生物和古菌）互作，并结合合成生物学工具（如CRISPR）和系统生物学方法，提出针对特定胁迫的定制化根际工程策略 | 对多界微生物动态的理解不足、合成群落在特定环境下的优化困难、实验室成果向田间应用转化时面临规模化和生态安全性挑战 | 开发气候韧性可持续农业系统 | 多界微生物群落（细菌、真菌、原生生物、古菌）及植物根际系统 | 微生物生态学 | NA | CRISPR基因编辑、代谢通路工程、高通量筛选、机器学习、宏基因组分析 | NA | 宏基因组数据 | NA | CRISPR-Cas9, 代谢通路工程 | 植物（根际宿主） | 合成微生物组（SynComs）、根际工程（调控根系分泌物和土壤理化性质） | 农业 |
| 266 | 2026-04-28 |
Advances in the microbial biosynthesis of ʟ-tryptophan and its derivatives
2025-Dec, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2025.100046
PMID:42038707
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综述 | 综述L-色氨酸及其衍生物的微生物合成进展 | 系统总结了提高微生物L-色氨酸产量的优化策略及工程菌株在合成高价值衍生物方面的应用，并探讨了合成生物学快速进化为衍生物生产带来的变革性机遇 | 仍存在若干关键瓶颈，但未具体阐述 | 优化微生物合成途径以高效生产L-色氨酸及其衍生物 | L-色氨酸及其衍生物的微生物合成 | 合成生物学 | NA | 微生物合成 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 微生物 | 生物合成途径 | 医药, 食品 |
| 267 | 2026-04-28 |
Four enzymes from button bush enable de novo biosynthesis of spirooxindole alkaloids in yeast
2025-Dec, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2025.100049
PMID:42038706
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研究论文 | 本文从风箱树中发现了四种酶，并在酵母中实现了螺环氧化吲哚生物碱的从头生物合成 | 首次发现并表征了四条酶的级联反应途径，能够在酵母中完全从头合成异育亨宾型氧化吲哚生物碱，阐明了氧化吲哚形成的酶学逻辑 | 未明确提及局限性 | 揭示异育亨宾型氧化吲哚生物碱的生物合成途径并实现其在酵母中的异源重建 | 风箱树中的四种酶（CoAJS、CoHYC3O、CoHYC3R、CoOIS）及相应生物碱产物 | 合成生物学 | NA | 转录组挖掘、生化验证、酶动力学分析、酵母工程改造 | NA | NA | NA | 酵母菌株工程 | 酿酒酵母 | 四酶级联途径，将鹰爪豆碱苷元转化为异育亨宾型氧化吲哚生物碱（米曲菲林、异米曲菲林、uncarine F） | 医药、工业生物技术 |
| 268 | 2026-04-28 |
DeepCodon: A deep learning codon-optimization model to enhance protein expression
2025-Dec, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2025.100042
PMID:42038710
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研究论文 | 提出一种名为DeepCodon的深度学习密码子优化模型，用于增强蛋白质表达 | 首次在密码子优化中保留功能上重要的稀有密码子簇，采用条件概率策略保护保守稀有密码子 | 未详细说明模型的泛化能力或在不同宿主物种中的表现 | 开发一种多目标密码子优化工具，平衡宿主密码子偏好、GC含量和mRNA二级结构等因素以提高异源基因表达 | Enterobacteriaceae序列、P450和G3PDH基因 | 机器学习 | NA | 深度学习 | CNN | 序列数据 | 150万个天然肠杆菌科序列，7种低产量P450和13种AI设计的G3PDH | NA | E. coli | NA | 合成生物学、基因工程 |
| 269 | 2026-04-28 |
Protein design drives synthetic biology research of plant natural products
2025-Dec, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2025.100048
PMID:42038708
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综述 | 本文综述了蛋白质设计技术在植物天然产物合成生物学研究中的前沿进展，探讨如何通过人工智能与合成生物学深度融合解决植物天然产物微生物生产中的关键瓶颈 | 系统阐述了蛋白质设计技术在解决植物天然产物生物合成中未知酶步骤和植物源酶功能表现不佳等难题方面的突破性进展，并强调了人工智能与合成生物学深度融合的潜力 | 未深入讨论蛋白质设计技术的具体实验验证细节及其在工业规模化生产中的实际应用挑战 | 总结蛋白质设计技术在植物天然产物生物合成中的应用，探索解决微生物生产瓶颈的方法 | 植物天然产物及其相关的植物源酶 | 合成生物学 | NA | 蛋白质设计技术 | NA | NA | NA | NA | 微生物系统 | 植物天然产物的生物合成途径 | 医药, 化妆品, 食品 |
| 270 | 2026-04-28 |
The convergence of AI and synthetic biology: the looming deluge
2025-Jul-01, npj biomedical innovations
DOI:10.1038/s44385-025-00021-1
PMID:42032179
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评论 | 探讨人工智能与合成生物学融合带来的机遇与风险，并提出监管策略 | 首次综合性地分析AI驱动合成生物学在医学、农业和可持续发展领域的创新潜力，同时系统性地评估双重用途风险、治理缺口和伦理困境 | 未提供具体实验数据或案例研究，分析较为宏观，缺乏实证支持 | 探讨AI与合成生物学融合如何加速生物工程流程，并识别相关风险与治理需求 | AI驱动合成生物学的应用场景及治理框架 | 机器学习, 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学, 农业, 可持续性 |
| 271 | 2026-04-28 |
Bioremediation of complex organic pollutants by engineered Vibrio natriegens
2025-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-08947-7
PMID:40335686
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研究论文 | 利用合成生物学将Vibrio natriegens改造成能修复含复杂有机污染物的盐废水及土壤的菌株 | 通过插入tfoX基因增强DNA摄取和整合能力，并利用酵母组装五个降解基因簇（总长43 kb）转移至Vmax菌株，实现从单环到多环有机污染物（联苯、苯酚、萘、二苯并呋喃和甲苯）的广谱修复 | NA | 解决有机污染物复杂性及盐胁迫耐受受限的问题，开发海洋微生物在生物修复中的应用 | 复杂有机污染物（联苯、苯酚、萘、二苯并呋喃和甲苯）及盐废水/土壤样本 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 来自氯碱厂和炼油厂的工业废水样本 | 酵母组装 | Vibrio natriegens | 代谢途径（五个降解基因簇） | 环境 |
| 272 | 2026-04-28 |
Construction of P450 scaffold biocatalysts for the biodegradation of five chloroanilines
2025-05-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.137305
PMID:39854990
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研究论文 | 通过工程化P450BM3活性位点，构建具有过氧酶活性的人工生物催化剂，用于五种氯苯胺的生物降解 | 首次通过将高度保守的苏氨酸268替换为天冬氨酸，诱导P450BM3产生过氧酶活性，实现无需NAD(P)H或双功能小分子的高效催化 | 未提及长期稳定性、大规模应用可行性或实际环境条件下的性能评估 | 开发绿色可持续的氯苯胺降解技术 | 五种氯苯胺（4-氯苯胺、2-氯苯胺、2,4-二氯苯胺、3,4-二氯苯胺和3,5-二氯苯胺） | NA | NA | UPLC-MS | NA | 质谱数据 | 五种氯苯胺化合物 | NA | NA | NA | 环境修复 |
| 273 | 2026-04-28 |
Functional characterization and regioselectivity manipulation of two Benzylisoquinoline alkaloids O-methyltransferases from Stephania yunnanensis
2025-04, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2025.108238
PMID:39922041
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研究论文 | 本文从云南金不换中鉴定并表征了两个功能相同但系统发育不同的苄基异喹啉生物碱7-O-甲基转移酶SyOMT4和SyOMT5，并通过对底物结合微环境的操作改变其催化区域选择性 | 首次发现通过操纵底物结合微环境中的三个残基（R143/L156/H163和F154/F167/G174），可将SyOMT4转化为高度特异的BIA 6OMT（SyOMT4-WFE），并将SyOMT5工程化为BIA N-甲基转移酶（SyOMT5-WFE和SyOMT5-WFD），拓展了BIA OMT的功能谱 | 未评估工程化酶在合成生物学和代谢工程中的实际应用效果 | 研究云南金不换中苄基异喹啉生物碱O-甲基转移酶的功能并通过蛋白工程改变其区域选择性 | 来自云南金不换（Stephania yunnanensis）转录组数据的两种O-甲基转移酶SyOMT4和SyOMT5 | NA | NA | 转录组测序、定点突变、结构建模 | NA | 转录组数据 | 从云南金不换转录组数据中鉴定两种酶 | 定点突变 | NA | NA | 医学、合成生物学、代谢工程 |
| 274 | 2026-04-28 |
Rapid, Low-Cost Detection of Zika Virus Using Programmable Biomolecular Components
2016-May-19, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2016.04.059
PMID:27160350
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研究论文 | 利用可编程生物分子组件快速、低成本检测寨卡病毒 | 结合等温RNA扩增与趾钩开关RNA传感器，并引入新型CRISPR/Cas9模块实现单碱基分辨率区分病毒株 | 未提及 | 开发可用于大流行地区的低成本现场快速诊断工具 | 寨卡病毒RNA基因组 | 合成生物学 | 寨卡病毒感染 | 等温RNA扩增、CRISPR/Cas9 | NA | RNA序列 | 实验使用来源于病毒血症猕猴的血浆样本 | CRISPR-Cas9 | 无细胞系统（纸基传感器） | 趾钩开关RNA传感器与CRISPR/Cas9模块联用 | 医学 |
| 275 | 2026-04-27 |
Multilayer microbial framework of aerobic granule microecosystems: Integrating community ecology, genetic networks, and enhancement strategies
2026-Jul, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134569
PMID:41950970
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综述 | 提出好氧颗粒污泥微生态系统的多层微生物框架，整合群落生态学、遗传网络和强化策略 | 提出功能性状驱动的自组织过程而非简单细胞聚集的概念框架，揭示群体感应系统与代谢协同和功能分区强化的关联机制 | 缺乏定量跨尺度耦合模型，当前强化策略存在局限性，工程普遍性和可设计性尚需验证 | 统一解释好氧颗粒污泥形成与稳定性的微生物学机制 | 好氧颗粒污泥微生态系统 | 环境微生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | 好氧颗粒污泥中的微生物群落 | 群体感应调控回路（luxI/luxR通路） | 废水处理, 环境工程 |
| 276 | 2026-04-27 |
Ion- and Temperature-Programmable Reconfiguration of Subcompartments in Synthetic Cells
2026-Apr-28, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500928
PMID:42029428
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研究论文 | 提出一种纯镁离子介导的可逆子区室组装机制，实现合成细胞内的动态重构 | 首次利用镁离子作为可逆调控因子，通过离子浓度和温度变化实现合成细胞子区室的空间重构，克服了合成细胞设计中动态重组的挑战 | 未研究镁离子在生理浓度下的长期稳定性及多离子协同效应，也未验证该系统在复杂生物环境中的适用性 | 开发一种基于物理刺激的合成细胞动态组织机制，模拟活细胞子区室的空间重组 | 带负电的巨型单层囊泡和中性大单层囊泡，分别作为合成细胞底盘和子区室模型 | 数字病理学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、工业生物技术 |
| 277 | 2026-04-27 |
From transport to regulation: systems engineering for high-efficiency dicarboxylic acid biosynthesis
2026-Apr-24, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103499
PMID:42034010
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综述 | 总结了通过酶工程、系统代谢工程和合成生物学方法提高中长链二羧酸生物合成效率的策略 | 重点探讨了疏水底物跨膜转运增强机制、新型转运蛋白挖掘、关键酶（如细胞色素P450）的蛋白工程改进以及反向β-氧化循环构建等系统级代谢调控创新 | 仍存在疏水底物质传效率低、关键氧化酶系统不稳定和细胞代谢失衡等瓶颈 | 克服中长链二羧酸生物合成中的应用瓶颈，推动高效可持续的生物制造 | 中长链二羧酸 | NA | NA | 酶工程、系统代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 反向β-氧化循环 | 工业生物技术、材料 |
| 278 | 2026-04-27 |
Genetic encoding of multiple distinct noncanonical amino acids
2026-Apr-24, Trends in biochemical sciences
IF:11.6Q1
DOI:10.1016/j.tibs.2026.03.006
PMID:42034479
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综述 | 本文综述了在活细胞中同时编码多种不同非经典氨基酸（ncAAs）的遗传改造技术的进展 | 提出了利用相互正交的翻译系统和扩展密码子储备库实现多种ncAAs的位点特异性整合，特别强调了在哺乳动物系统中结合稀有密码子重编码和终止密码子抑制技术首次实现最多五种不同ncAAs的编码 | 文中未具体说明同时串联多种ncAAs编码时的效率、误差率及潜在的蛋白毒性等限制因素，且主要关注技术路线而较少讨论通用性和可扩展性的挑战 | 总结同时遗传编码多种非经典氨基酸的方法以实现合成多功能生物聚合物的目的 | 多种非经典氨基酸（ncAAs）及对应的翻译系统 | 合成生物学 | NA | 遗传密码子扩展, 正交翻译系统, 终止密码子抑制, 稀有密码子重编码 | NA | NA | NA | NA | 哺乳动物细胞, 细菌 | 多功能生物传感器, 下一代治疗性蛋白, 合成生物学回路 | 医学, 合成生物学 |
| 279 | 2026-04-27 |
Membrane-Based Assembly and Interactions in Immune Receptors
2026-Apr-22, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.5c00993
PMID:41865294
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综述 | 本文综述了免疫受体的膜基组装和相互作用，探讨了其在脂质双层中的分子原理和结构基序 | 系统总结了跨膜结构域（TMD）在免疫受体组装和信号传导中的关键作用，并揭示了膜内与膜间的分子相互作用对受体结构和功能的重复性解决方案 | NA | 理解免疫受体在脂质双层中的组装和调控机制，以及它们在合成生物学应用中的潜力 | 免疫受体，特别是单跨膜蛋白组成的受体复合物 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 280 | 2026-04-27 |
Engineering oncolytic bacteria as precision cancer therapeutics: design principles, therapeutic strategies, and translational perspectives
2026-Apr-01, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwaf085
PMID:41128615
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综述 | 综述了工程化溶瘤细菌作为精准癌症治疗平台的设计原则、治疗策略和转化前景 | 系统整合了合成生物学调控回路设计（感知外源信号、细菌自身信号、肿瘤微环境特征）与多种治疗模态的联合策略 | 未提及临床试验中宿主免疫反应对细菌活性的具体影响及长期安全性数据 | 为开发安全有效的个性化细菌癌症疗法提供设计框架和转化路线 | 工程化溶瘤细菌及其基因调控回路 | 合成生物学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 群体感应系统, 合成基因回路 | 细菌（如溶瘤细菌） | 诱导型/自主调控回路（包括群体感应开关、细菌入侵开关、一氧化氮响应启动子、缺氧/低pH/乳酸响应启动子），产物释放模块（前药转化酶、细胞因子、抗体/纳米抗体片段） | 医学 |