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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2026-05-04 |
The convergence of AI-driven engineering biology and emerging technologies advancing globally networked autonomous biofoundries
2026-May-01, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103503
PMID:42068969
|
综述 | 综述了人工智能驱动的工程生物学与新兴技术的融合,推动全球网络化自主生物铸造厂的发展 | 提出AI驱动自主生物铸造厂概念,整合计算设计、自动化制造与数据驱动学习于自适应框架,并强调数字孪生和全细胞建模等技术的融合 | 未具体说明当前技术融合的实证验证或实际部署面临的挑战细节 | 探讨人工智能与合成生物学融合以构建全自主生物铸造厂的技术趋势 | AI驱动的合成生物学技术、自动化生物铸造厂、全细胞建模与数字孪生系统 | 人工智能, 合成生物学 | NA | 全细胞建模, 数字孪生, 自动化实验 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 262 | 2026-05-04 |
RNA sensors and actuators for dynamic cellular regulation
2026-Apr-30, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2026.04.005
PMID:42067429
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综述 | 本文综述了用于动态细胞调控的RNA传感器和致动器的工程化进展 | 从RNA结构动力学角度强调其与蛋白质系统相比的优势,并整合了合成生物学、RNA治疗学的最新进展 | 未提及具体实验验证或量化比较与蛋白质系统的性能差异 | 推动RNA在合成细胞控制方案中的应用,提升微生物生物合成和靶向基因治疗 | RNA传感器和致动器 | 合成生物学 | NA | RNA工程 | NA | NA | NA | NA | NA | RNA传感器与致动器 | 医学, 工业生物技术 |
| 263 | 2026-05-04 |
Synthetic Biology Approaches to Enzymology in Food and Agriculture Systems
2026-Apr-29, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c16525
PMID:41962132
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综述 | 探讨合成生物学方法在食品与农业系统中酶学应用的研究进展 | 系统综述了合成生物学在酶工程领域的最新进展,重点讨论了如何将其他行业的技术改造应用于食品与农业系统 | 当前存在的局限性及监管问题,需要进一步探索合成生物学在全球食品系统中的整合方向 | 探索合成生物学在食品与农业系统中通过酶介导解决方案应对全球粮食不安全问题的应用 | 食品与农业系统中的酶及其工程化改造方法 | 合成生物学 | NA | 酶工程、生物催化、计算设计 | NA | NA | NA | NA | NA | 酶介导的代谢途径和生物催化通路 | 食品, 农业 |
| 264 | 2026-05-04 |
OptoChaperone─A Biohybrid Tool for Regulating Protein Condensates in Cells and In Vitro
2026-Apr-29, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c04074
PMID:42002974
|
研究论文 | 报道了一种名为OptoChaperone的光控生物杂合系统,用于在体外和活细胞中调控蛋白质凝聚体 | 利用光响应开关控制分子伴侣活性,实现蛋白质凝聚体的可逆、精准、时空可控调节,无需化学添加剂或基因修饰 | 未提及在体内长期应用的稳定性或可能的免疫原性 | 开发一种可逆且高效的光控工具来操纵蛋白质凝聚体,以研究其在细胞生理和病理中的作用 | 蛋白质凝聚体,包括融合肉瘤蛋白、TAR DNA结合蛋白43和热休克因子1 | 合成生物学 | 神经退行性疾病(如肌萎缩侧索硬化、额颞叶痴呆) | 光控分子伴侣系统 | NA | NA | NA | NA | NA | 光控分子伴侣系统(OptoChaperone) | 医学、合成生物学、生物分子工程 |
| 265 | 2026-05-04 |
Regulatory mechanisms of secondary metabolite biosynthesis in medicinal plants under drought: advances and perspectives
2026-Apr-25, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158246
PMID:42068881
|
综述 | 总结干旱条件下药用植物中萜类、苯丙烷类和生物碱等次生代谢物生物合成的转录调控机制及其应用前景 | 首次从转录调控网络、微生物群落变化、表观遗传重塑等多维度系统阐述干旱对药用植物次生代谢的影响机制,并提出了筛选双功能基因和利用合成生物学策略的应用路径 | 基于现有文献的定性归纳,缺乏定量比较或元分析,且对具体信号通路和分子机制的实验验证不足 | 揭示干旱胁迫下药用植物次生代谢物合成的转录调控机制,为培育高含量活性成分的优质品种和智能灌溉管理提供理论依据 | 药用植物中的萜类、苯丙烷类和生物碱等次生代谢物 | 植物生物学 | NA | 文献检索与综合评述 | NA | 文本 | NA | 合成生物学 | 药用植物 | NA | 农业, 医药, 食品, 化妆品 |
| 266 | 2026-05-04 |
Decoding nucleic acid contributions to phase separation and ordering in biomolecular condensates
2026-Mar-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag253
PMID:41909948
|
研究论文 | 研究核酸在生物分子凝聚体中调控相分离和有序化的作用 | 系统揭示了核酸长度和杂交程度对相变行为的影响,并提出生物凝聚体稳定性的评价指标,同时表征液晶有序形成的条件 | 仅关注模型系统(寡核苷酸与中度电荷无序肽的混合),未涉及天然复杂环境中的多组分相互作用 | 填补核酸在液-液相分离中作用的研究空白,指导合成含核酸凝聚体的设计 | 具有不同长度和杂交程度的寡核苷酸与中度电荷无序肽的混合体系 | 计算生物学 | NA | 分子动力学模拟 | NA | 实验数据与模拟轨迹 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 生物医学 |
| 267 | 2026-05-04 |
Programmable, target-induced fluorogenic CRISPR-tDeg platform for live-cell RNA visualization
2026-Mar-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag279
PMID:41909946
|
研究论文 | 开发了一种名为CtDeg的模块化RNA成像平台,通过目标诱导荧光和degron介导的降解机制实现活细胞RNA的高特异性可视化 | 首次将Pepper RNA基序嵌入crRNA支架,利用degron介导的降解有效抑制背景信号,实现目标RNA识别驱动的荧光激活,显著提高信噪比 | 未提及具体的局限性 | 开发一种低背景、高特异性的活细胞RNA成像平台 | 活细胞中的RNA分子,包括paraspeckle装配动态和SARS-CoV-2基因组RNA | 合成生物学 | NA | CRISPR-dCas13, 荧光成像 | NA | 图像 | NA | CRISPR-Cas13, degron | 哺乳动物细胞 | 目标诱导荧光CRISPR-tDeg电路 | 合成生物学, RNA生物学 |
| 268 | 2026-05-04 |
Steps Toward Recapitulating Endothelium: A Perspective on the Next Generation of Hemocompatible Coatings
2024-10, Macromolecular bioscience
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/mabi.202400152
PMID:39072925
|
综述 | 讨论如何通过合成生物学和涂层技术模拟内皮细胞功能,以改善血液接触医疗设备的血液相容性 | 提出将自下而上的合成生物学(特别是合成细胞)与被动和活性生物表面涂层相结合,协同模拟内皮细胞的三种关键功能,以克服血液相容性挑战 | 未具体说明当前技术的局限性,但隐含地指出了实现内皮功能模拟的复杂性及协同集成功能的必要性 | 开发新一代仿生内皮涂层,用于血液接触医疗设备以增强血液相容性 | 血液接触医疗设备及其表面的内皮模拟涂层 | 数字病理学 | 心血管疾病 | NA | NA | NA | NA | 自下而上的合成生物学(合成细胞) | 哺乳动物细胞 | 模拟内皮细胞的三重功能:保护血液成分、调节凝血和促进纤维蛋白溶解 | 医学 |
| 269 | 2026-05-03 |
The gut-tumor connection: the role of microbiota in cancer progression and treatment strategies
2026-May, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.08.038
PMID:40850681
|
综述 | 探讨肠道微生物群在癌症进展和治疗策略中的作用 | 系统总结了肠道微生物群、肿瘤相关微生物群与肿瘤微环境之间的复杂相互作用,并评估其作为癌症治疗靶点的潜力 | 缺乏标准化方案、先进的测序技术和改进的动物模型,限制了微生物群-癌症相互作用研究的发展 | 探索肠道微生物群与肿瘤微环境的关系及其对个性化癌症治疗的启示 | 肠道微生物群、肿瘤相关微生物群及肿瘤微环境 | 自然语言处理 | NA | 二代测序 | NA | 综述数据 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 270 | 2026-05-03 |
Advances and opportunities for computational interrogation of plant proteins
2026-May, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70899
PMID:42055456
|
综述 | 综述了计算分析方法在植物蛋白质研究中的进展与机遇 | 强调了计算工具在加速植物蛋白质功能发现方面的潜力,并整合了新兴方法与传统实验手段的优势 | 植物内研究仍受限于遗传转化方法的可用性和效率 | 推动计算与实验结合,以克服植物蛋白质研究瓶颈,促进农业、生态和气候韧性进展 | 植物蛋白质 | 机器学习 | NA | 蛋白质结构预测、动力学模拟、相互作用分析 | NA | 蛋白质序列、结构数据 | NA | NA | 植物 | NA | 农业, 生态, 气候韧性 |
| 271 | 2026-05-03 |
Harnessing synthetic circuits to illuminate microbial electron transfer: a perspective on engineered metabolism
2026-Apr-30, Journal of microbiology & biology education
IF:1.6Q2
DOI:10.1128/jmbe.00290-25
PMID:41627025
|
研究论文 | 该视角文章聚焦于一项利用合成基因电路促进微生物电子传递的研究,展示了通过工程化代谢生产氧化还原活性代谢物增强胞外电子传递和发电的能力 | 创新点在于通过合成生物电路控制氧化还原介质的产生,为理解微生物电子流和生物电子设计提供新视角,并作为教育案例整合多学科知识 | NA | 探讨合成电路在微生物电子传递中的应用,并强调其在教育中促进跨学科学习的潜力 | 微生物电子传递和工程化代谢 | 合成生物学 | NA | 合成基因电路 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 合成基因电路用于生产并释放吩嗪-1-羧酸(一种氧化还原活性代谢物) | 生物技术, 教育 |
| 272 | 2026-05-03 |
From known knowns to unknown unknowns: synthetic biology paths to antimicrobial discovery
2026-Apr-30, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102759
PMID:42066660
|
评论性文章 | 提出一个合成生物学中心框架,将抗菌天然产物按化学新颖性和工程可及性分为四个象限,以指导抗菌发现策略 | 从已知已知到未知未知的二维映射框架重新定义了合成生物学视角下的天然产物分类,并揭示了不同象限间的动态转化关系 | NA | 提出基于合成生物学的抗菌天然产物发现路径框架,应对当前抗生素耐药挑战 | 抗菌天然产物 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 273 | 2026-05-03 |
From fundamental understanding to engineering carboxysomes for biotechnological applications
2026-Apr-30, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101882
PMID:42068046
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综述 | 综述了从基础理解到工程化改造羧基体用于生物技术应用的最新进展 | 系统总结了羧基体在合成生物学和生物工程中的设计原理,包括可编程结构、货物封装、半渗透性和模块化组装,并提出了将其改造为高效固碳引擎和多功能纳米材料的新策略 | 实现壳渗透性的精确控制和货物封装的高效性,以及将羧基体整合到异源宿主中仍面临挑战 | 探讨羧基体的分子机制及其在生物技术中的应用潜力 | 羧基体(一种自组装蛋白质微区室) | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | 固碳通路、纳米材料 | 工业生物技术、环境 |
| 274 | 2026-05-03 |
From CRISPR functional genomics to synthetic interventions: engineering antiviral strategies
2026-04-21, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.00057-26
PMID:41910274
|
综述 | 本文综述了从CRISPR功能基因组学到合成生物学干预的进展,旨在工程化抗病毒策略 | 将CRISPR功能基因组学筛选与合成生物学设计相结合,提出可编程干预手段(如受体诱饵、基因电路和工程化免疫细胞) | 讨论从筛选机制转化为安全有效抗病毒策略时面临的约束条件 | 连接CRISPR功能基因组学与合成抗病毒设计,总结跨病毒家族通用原则 | 病毒与宿主相互作用中的宿主依赖性因子和限制因子 | 功能基因组学, 合成生物学 | 病毒相关疾病 | CRISPR扰动筛选, 单细胞测序, 成像技术, 空间表型分析, 类器官模型 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 人类细胞 | 受体诱饵及结合分子、条件性蛋白降解系统、感染感应基因电路、可调抗病毒功能免疫细胞 | 医学 |
| 275 | 2026-05-03 |
A standardized workflow for kinetic metabolic model curation and dissemination
2026-Apr, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014227
PMID:42008579
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research paper | 提出一个标准化工作流程,用于动力学代谢模型的构建、注释、可视化和共享 | 整合社区标准和开源工具,确保模型的可重复性、互操作性和用户可访问性 | NA | 提高动力学代谢模型的可重复性和实用性 | 动力学代谢模型 | NA | NA | NA | 动力学代谢模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 代谢工程, 系统生物学 |
| 276 | 2026-05-03 |
Emerging ultrafast technologies in biotechnology
2025-May, 3 Biotech
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s13205-025-04309-2
PMID:40292246
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综述 | 重点介绍超快技术在生物技术中的应用,包括实时可视化和精确操纵生物分子过程 | 整合了飞秒激光、超快光谱、泵浦-探针显微镜、CARS及阿秒光谱等多种超快技术,并探讨了其与人工智能和纳米技术的结合,推动诊断、个性化医疗和合成生物学发展 | 面临光损伤、与复杂生物系统整合困难以及伦理考量等挑战 | 综述超快技术在生物技术中的变革性应用及潜力 | 涉及蛋白质折叠路径、酶活性、能量转移机制、CRISPR基因编辑实时监测、细胞动力学、神经活动等生物分子过程和动态 | 机器学习, 数字病理学 | NA | 飞秒激光, 超快光谱, 泵浦-探针显微镜, 相干反斯托克斯拉曼散射, 阿秒光谱 | NA | 图像, 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学, 农业, 环境, 能源, 材料, 食品, 工业生物技术 |
| 277 | 2026-05-03 |
Prevention of ribozyme catalysis through cDNA synthesis enables accurate RT-qPCR measurements of context-dependent ribozyme activity
2025-04-16, RNA (New York, N.Y.)
DOI:10.1261/rna.080243.124
PMID:40050070
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研究论文 | 开发并验证了一种通过cDNA合成抑制核酶催化活性以实现准确RT-qPCR测量上下文依赖性核酶活性的方法 | 在样本制备工作流程中引入寡核苷酸以抑制核酶活性,恢复RT-qPCR测量的准确性,首次解决了RNA提取和逆转录条件诱发核酶裂解导致测量不准确的问题 | 研究仅在体外已知上下文依赖性核酶裂解的RNA组上验证,未涉及体内复杂环境或多种核酶类型,潜在限制于实际应用场景的泛化能力 | 准确测量不同遗传和环境上下文中的核酶活性,以验证新核酶序列及基于核酶的生物技术 | 自裂解核酶及其上下文依赖性活性 | 分子生物学 | NA | RT-qPCR, RNA提取, cDNA合成 | NA | RNA定量数据 | 一组已知体外上下文依赖性裂解的RNA样本 | NA | NA | 自裂解核酶(自切割RNA) | 合成生物学, 生物制造, 核酸治疗 |
| 278 | 2026-05-03 |
Active learning of enhancers and silencers in the developing neural retina
2025-Jan-15, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.12.004
PMID:39778579
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研究论文 | 开发了一种主动学习方法,用于训练区分增强子和沉默子的模型,并在发育中的神经视网膜中应用 | 将主动学习与合成生物学及不确定性采样相结合,迭代训练模型以区分功能相反的转录因子结合位点 | 未明确说明局限性 | 训练能够区分增强子和沉默子的模型,解释相同转录因子在不同上下文中激活或抑制转录的机制 | 发育中的神经视网膜中的增强子和沉默子 | 机器学习 | NA | 大规模并行报告分析 | 深度学习模型 | 基因组序列 | 几乎全部CRX结合位点及多轮合成生物学数据 | NA | NA | NA | 医学 |
| 279 | 2026-05-02 |
Engineering Plant-Derived P450 Enables the Efficient Production of Berberine through a Concise and Modular Enzymatic Cascade in E. coli
2026-Apr-27, JACS Au
IF:8.5Q1
DOI:10.1021/jacsau.6c00169
PMID:42063854
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研究论文 | 通过工程化植物来源的P450酶,设计模块化酶促级联反应在大肠杆菌中高效生产小檗碱 | 优化设计了绕过多个天然步骤的简明模块化途径,并结合表达优化、结构指导设计、共识突变和机器学习综合工程化CYP719A1,获得活性提高8.9倍且热稳定性改善的变体 | NA | 解决植物膜结合细胞色素P450酶催化瓶颈,实现植物天然产物小檗碱的可持续高效生产 | 植物来源的CYP719A1酶及其工程化变体 | 合成生物学、代谢工程 | NA | 蛋白质工程、机器学习、酶级联反应 | 机器学习模型 | 序列和结构数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 模块化酶促级联途径(包含P450依赖步骤) | 医药、工业生物技术 |
| 280 | 2026-05-02 |
Engineered commensal Bacteroides thetaiotaomicron enables targeted drug delivery to colorectal tumors
2026-Apr-24, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2026.114945
PMID:42036032
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研究论文 | 工程化肠道共生菌多形拟杆菌实现结直肠肿瘤靶向药物递送 | 基于天然肠道共生菌多形拟杆菌构建新型细菌递送系统,通过筛选表面锚定蛋白实现肿瘤靶向蛋白展示,并整合治疗模块实现双重抗肿瘤效果 | 尚需进一步评估临床安全性和长期免疫反应 | 开发基于肠道共生菌的靶向肿瘤治疗新策略 | 多形拟杆菌 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 微生物工程 | NA | NA | AOM/DSS诱导的结直肠癌小鼠模型 | NA | 多形拟杆菌 | 肿瘤靶向蛋白展示系统及溶血素E治疗模块 | 医学 |