本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2026-04-04 |
RNA triplet repeats: improved algorithms for structure prediction and interactions
2025-Dec-10, Algorithms for molecular biology : AMB
IF:1.5Q3
DOI:10.1186/s13015-025-00292-8
PMID:41372930
|
研究论文 | 本文研究了由三核苷酸重复序列组成的RNA的最小自由能二级结构,并改进了计算最小自由能和配分函数的算法,同时设计了用于RNA-RNA相互作用的新算法 | 改进了计算RNA三核苷酸重复序列最小自由能和配分函数的算法,并将RNA-RNA相互作用的计算复杂度从阶乘时间优化至指数时间,提出了基于碱基集的相互作用多项式时间算法 | 在TR情况下存在计算复杂性,但通过参数化算法部分解决,未提及实验验证或实际应用限制 | 提高RNA三核苷酸重复序列结构预测和相互作用的计算效率与准确性 | 由三核苷酸重复序列组成的RNA及其相互作用 | 计算生物学 | NA | 最小自由能计算、配分函数计算、RNA-RNA相互作用算法 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 262 | 2026-04-03 |
Biological reduction of Fenton sludge: Electron transfer mechanisms, regulatory strategies, and prospects
2026-Jun, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134424
PMID:41833913
|
综述 | 本文综述了Fenton污泥生物还原中的电子转移机制、调控策略及未来前景,强调其在资源回收中的应用潜力 | 聚焦于多机制动态耦合的电子转移网络框架,并详细探讨了环境条件对各机制的动态响应及增强协同作用的调控策略 | NA | 探讨Fenton污泥生物还原的资源回收策略,以促进高效利用和生物铁还原的多样化发展 | Fenton污泥及其生物还原过程,特别是铁还原细菌和电子转移机制 | 环境生物技术 | NA | 系统生物学、合成生物学、微生物电化学技术 | NA | NA | NA | 基因工程 | NA | NA | 环境 |
| 263 | 2026-04-03 |
Engineered Bacteria as living detectors of tumor DNA: A new diagnostic frontier
2026-Apr-15, Clinica chimica acta; international journal of clinical chemistry
DOI:10.1016/j.cca.2026.120914
PMID:41724454
|
综述 | 本文综述了利用合成生物学技术设计基因工程细菌作为生物传感器,用于检测肿瘤DNA的最新进展 | 将基因工程细菌作为活体检测器,结合CRISPR-Cas工具和天然基因转移能力,实现肿瘤DNA的原位检测 | 存在生物安全性、定植效率和检测灵敏度方面的限制 | 开发用于癌症诊断的工程细菌生物传感器 | 肿瘤DNA,特别是KRAS突变 | 合成生物学 | 结直肠癌和胃肠道癌 | CRISPR-Cas工具,基因工程,水平基因转移 | NA | DNA序列 | NA | CRISPR-Cas | 细菌 | 生物传感器,基因回路,同源重组,多重CRISPR系统,安全回路 | 医学 |
| 264 | 2026-04-03 |
Advances in the construction and biological applications of DNA condensates
2026-Apr-02, Nanoscale
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d5nr05322f
PMID:41758048
|
综述 | 本文综述了通过液-液相分离构建DNA凝聚物的策略及其在仿生细胞器、生物传感、细胞调控和药物递送等领域的生物应用 | 利用DNA的可编程性、多样相互作用模式和易化学修饰特性,构建具有多刺激响应性和可编程生化微环境的人工凝聚物,并展望了与光遗传学、单分子技术和机器学习结合的智能多组分系统 | 时空控制有限、易受核酸酶降解和免疫原性等问题,限制了其在活体系统中的转化应用 | 探讨DNA凝聚物的构建方法及其在合成生物学和精准医学中的生物应用 | DNA凝聚物及其在细胞环境中的功能模拟与应用 | 合成生物学 | NA | 液-液相分离(LLPS)、序列驱动自组装、聚合物或蛋白质介导的凝聚 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 265 | 2026-04-03 |
Peimine: A comprehensive review of its botanical distribution, biosynthesis, pharmacological effects and pharmacokinetics
2026-Apr, Fitoterapia
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.fitote.2026.107140
PMID:41692275
|
综述 | 本文全面综述了贝母素(PM)的植物分布、生物合成途径、药理作用及药代动力学研究进展 | 系统整合了PM的物种特异性分布规律与多靶点药理机制,并指出合成生物学在PM生产中的应用前景 | PM的口服生物利用度较低且药代动力学特征尚未完全明确,限制了其临床转化潜力 | 总结PM的最新研究进展,为其合理开发与利用提供科学依据 | 贝母属植物(如浙贝母、平贝母、湖北贝母)中提取的甾体生物碱贝母素(PM) | NA | 呼吸系统疾病、癌症 | 基因组学、酶学表征、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 266 | 2026-04-03 |
Constructing cellulosomes to enhance lignocellulose degradation and biotechnological applications: A review
2026-Apr, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.151467
PMID:41856184
|
综述 | 本文综述了天然和工程化纤维素小体的最新进展,强调其结构多样性、协同机制及工业应用,以增强木质纤维素降解和生物技术应用 | 介绍了'设计者纤维素小体'作为模块化平台,通过合成支架设计、宿主优化和操作子工程,提升催化协同性、热稳定性及整合生物加工,并探索了双对接模块、三方对接相互作用和糖基化增强稳定性等新概念 | NA | 开发高效木质纤维素生物加工策略,以促进可持续和可再生能源来源 | 纤维素小体,包括天然来源(如梭菌属、瘤胃球菌属和拟杆菌属)和工程化系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成支架设计, 操作子工程 | 酿酒酵母, 枯草芽孢杆菌, 马克斯克鲁维酵母 | 设计者纤维素小体作为模块化平台,整合酶复合物以增强降解效率 | 能源, 工业生物技术 |
| 267 | 2026-04-03 |
The rise and future of peptide-based antimicrobials
2026-Mar, Journal of microbiology (Seoul, Korea)
DOI:10.71150/jm.2510002
PMID:41736369
|
综述 | 本文综述了基于肽的抗菌药物作为应对抗菌素耐药性的适应性有效替代方案的兴起与未来发展 | 系统整合了肽类抗生素从发现、优化到应用的最新进展,并强调了人工智能、合成生物学和现代递送技术等新兴策略在重塑其设计与生产中的作用 | NA | 概述肽类抗生素的研究进展,探讨其作为应对抗菌素耐药性新疗法的潜力 | 肽类抗生素 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 268 | 2026-04-03 |
Emerging synthetic biology-assisted technologies for overcoming antibiotic resistance: CRISPR-Cas, bacteriophage, microbiome, and metabolic engineering-based solutions
2026-Mar, Journal of microbiology (Seoul, Korea)
DOI:10.71150/jm.2512002
PMID:41923586
|
综述 | 本文全面综述了合成生物学辅助技术(包括CRISPR-Cas系统、噬菌体工程、微生物组工程和代谢工程驱动的抗生素发现)在克服抗生素耐药性方面的最新进展 | 提出了一个精准抗菌新范式,能够选择性靶向耐药菌同时维持微生物组稳态,并为限制耐药性传播和开发下一代疗法提供了新方向 | NA | 探讨合成生物学辅助技术如何克服抗生素耐药性这一全球健康挑战 | 抗生素耐药性、耐药病原体、耐药基因的水平转移机制 | 合成生物学 | 感染性疾病 | CRISPR-Cas系统、噬菌体工程、微生物组工程、代谢工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 细菌、噬菌体、微生物组 | NA | 医学 |
| 269 | 2026-04-03 |
Achieving bottom-up ethical, legal, and societal implications and responsible research and innovation in the synthetic biology research community from the Japanese context
2026, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2026.1716198
PMID:41923881
|
研究论文 | 本文探讨了在合成生物学研究中,从日本背景出发如何实现自下而上的伦理、法律和社会影响以及负责任的研究与创新 | 聚焦于ELSI中的规则制定,强调学术界在自下而上倡议方面的不足,并提出三个关键行动领域 | NA | 促进合成生物学研究社区在伦理、法律和社会影响方面的负责任创新 | 合成生物学研究社区及其规则制定过程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 270 | 2026-04-03 |
Expanding the genetic code: phage-driven evolution of pyrrolysyl-synthetase for site-specific incorporation of synthetic phenylalanine and tyrosine derivatives
2026, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2026.1737987
PMID:41924351
|
研究论文 | 本研究利用噬菌体辅助非连续进化技术,优化了来自Methanosarcina mazei的吡咯赖氨酰-tRNA合成酶,以增强其对酪氨酸和苯丙氨酸衍生物的识别与掺入能力 | 采用PANCE技术高效进化PylRS,显著提高了对目标非经典氨基酸的掺入效率,并识别出结合口袋中的关键突变簇 | NA | 扩展遗传密码,通过工程化PylRS实现合成苯丙氨酸和酪氨酸衍生物的位点特异性掺入 | 吡咯赖氨酰-tRNA合成酶及其变体 | 合成生物学 | NA | 噬菌体辅助非连续进化,荧光掺入测定,质谱分析 | NA | 序列数据,荧光数据,质谱数据 | NA | PANCE | NA | NA | 合成生物学 |
| 271 | 2026-04-03 |
Understanding, inhibiting, and engineering membrane transporters with high-throughput mutational screens
2025-Apr-17, Cell chemical biology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.chembiol.2025.03.003
PMID:40168989
|
综述 | 本文介绍了利用高通量突变筛选方法来理解、抑制和改造膜转运蛋白的原理、方法及其应用潜力 | 系统阐述了高通量筛选方法在解析多特异性膜转运蛋白分子机制中的独特优势,并提出了其在药物研发和合成生物学中的创新应用方向 | NA | 探讨高通量遗传筛选方法在膜转运蛋白研究中的应用潜力 | 多特异性膜转运蛋白 | 合成生物学 | NA | 高通量突变筛选 | NA | 遗传变异数据 | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 272 | 2026-04-03 |
Emulating nonribosomal peptides with ribosomal biosynthetic strategies
2023-Jan-04, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d2cb00169a
PMID:36685251
|
综述 | 本文综述了通过核糖体生物合成策略模拟非核糖体肽的研究进展,比较了两者的结构特征,并强调了合成生物学在核糖体途径工程中的应用 | 揭示了非核糖体肽中曾被认为独特的结构特征也存在于核糖体合成肽中,并利用核糖体途径的简化性和修饰酶的多功能性进行工程化设计 | NA | 探讨如何通过核糖体生物合成策略模拟非核糖体肽,以生产具有增强生物活性的类似物 | 非核糖体肽和核糖体合成并翻译后修饰的肽 | 合成生物学 | NA | 核糖体生物合成、翻译后修饰 | NA | NA | NA | 核糖体途径工程 | NA | NA | 医药 |
| 273 | 2026-04-03 |
Multifunctional SEVA shuttle vectors for actinomycetes and Gram-negative bacteria
2020-06, MicrobiologyOpen
IF:3.9Q2
DOI:10.1002/mbo3.1024
PMID:32170856
|
研究论文 | 本研究开发了23种遵循SEVA标准架构的多功能穿梭载体,用于放线菌和革兰氏阴性菌的基因工程 | 开发了结合革兰氏阴性菌和放线菌(特别是链霉菌)复制起点的多功能SEVA穿梭载体,并引入了新的安普霉素抗性选择标记 | 未明确说明载体在所有放线菌物种中的通用性测试范围,也未讨论长期遗传稳定性 | 扩大链霉菌及其他放线菌的遗传工具库,促进其作为合成生物学通用底盘的应用 | 链霉菌属(特别是Streptomyces albus J1074)及其他放线菌 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | SEVA (Standard European Vector Architecture), Gibson Assembly | Streptomyces albus J1074, Escherichia coli, 放线菌, 革兰氏阴性菌 | 穿梭载体(含整合型、低拷贝数、中高拷贝数复制起点),异源表达系统(用于GFP和芹菜素生产) | 工业生物技术 |
| 274 | 2026-04-02 |
Advances in Ene-Reductase Engineering: Dynamic Structure, Catalytic System Innovation, and Green Application Prospects
2026-Apr-01, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c14585
PMID:41873156
|
综述 | 本文综述了烯还原酶(ERs)的动态结构调控、定向进化、固定化技术及其在药物合成和环境修复中的应用 | 重点阐述了构象变化对催化选择性的影响、光酶协同系统以及AI辅助设计,并展望了低成本固定化、连续流工艺和多场耦合催化系统等新兴方向 | NA | 总结烯还原酶的研究进展,并为未来研究提供理论参考 | 烯还原酶(ERs) | 合成生物学 | NA | 定向进化、固定化技术、AI辅助设计 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物合成, 环境修复 |
| 275 | 2026-04-02 |
Oncolytic Virotherapy for Solid Tumors: Clinical Advances and Future Directions
2026-04, Surgical oncology clinics of North America
IF:2.4Q2
DOI:10.1016/j.soc.2025.10.011
PMID:41903995
|
综述 | 本文综述了溶瘤病毒疗法治疗实体瘤的生物学基础、临床应用、组合疗法、新一代病毒平台的发展以及临床转化面临的主要障碍和应对策略 | 系统性地概述了溶瘤病毒疗法的最新临床进展、新兴组合策略以及基于合成生物学和免疫肿瘤学发展的下一代病毒平台,并指出了克服临床转化障碍的新兴策略 | NA | 总结溶瘤病毒疗法在实体瘤治疗中的现状、挑战与未来发展方向 | 溶瘤病毒及其在实体瘤治疗中的应用 | NA | 实体瘤 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 276 | 2026-04-02 |
Engineering a Virus-Derived X Family DNA Polymerase FvPolX for de novo DNA Synthesis
2026-Mar-31, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.75017
PMID:41915827
|
研究论文 | 本文报道了从Faustovirus中发现的FvPolX DNA聚合酶,并通过蛋白质工程改造,显著提升了其催化活性,用于从头DNA合成 | 首次发现并工程化微生物来源的X家族DNA聚合酶FvPolX,使其在催化活性和结构最小化方面超越传统动物来源的聚合酶 | 研究主要集中于酶学特性,未涉及大规模工业应用或体内验证 | 开发高效酶工具用于合成生物学中的从头DNA合成 | Faustovirus来源的X家族DNA聚合酶FvPolX及其工程变体 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、酶催化 | NA | 酶活性数据 | NA | 蛋白质工程 | Faustovirus(病毒) | NA | 工业生物技术 |
| 277 | 2026-04-02 |
Decoding nucleic acid contributions to phase separation and ordering in biomolecular condensates
2026-Mar-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag253
PMID:41909948
|
研究论文 | 本文通过实验和分子动力学模拟,探讨了核酸在生物分子凝聚体相分离和有序化中的作用,并提出了一个评估凝聚体稳定性的指标 | 首次系统研究了核酸长度和杂交程度对相分离行为的影响,并揭示了液滴中液晶有序性的形成条件及其对动力学的不同影响 | 研究基于模型系统,可能无法完全反映自然生物系统中的复杂性 | 填补核酸在液-液相分离(LLPS)中作用的研究空白,为合成生物学和生物医学应用提供设计指导 | 由寡核苷酸和适度带电无序肽组成的模型系统 | 合成生物学 | NA | 分子动力学模拟 | NA | 实验数据和模拟数据 | NA | NA | NA | NA | 生物医学, 合成生物学 |
| 278 | 2026-04-02 |
Programmable, target-induced fluorogenic CRISPR-tDeg platform for live-cell RNA visualization
2026-Mar-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag279
PMID:41909946
|
研究论文 | 本研究开发了一种名为CtDeg的模块化RNA成像平台,用于活细胞中RNA的可视化 | 通过将荧光激活直接与靶RNA识别相连接,并利用degron介导的降解来抑制背景信号,实现了比传统方法更低的背景和更高的特异性 | NA | 开发一种用于活细胞中RNA精确可视化的新型成像平台 | RNA分子,包括NEAT1_2 lncRNA和SARS-CoV-2基因组RNA | 合成生物学 | NA | CRISPR-dCas13-tDeg技术 | NA | 图像数据 | NA | CRISPR-Cas13 | 哺乳动物细胞 | 通过工程化crRNA支架嵌入Pepper RNA基序,实现靶向诱导的荧光激活系统 | 医学, 合成生物学 |
| 279 | 2026-04-02 |
Concentration-Dependent CsrA Regulation of the uxuB Transcript Leads to Development of a Post-Transcriptional Bandpass Filter
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00668
PMID:40202123
|
研究论文 | 本研究利用CsrA蛋白与uxuB mRNA转录本之间的新型转录后相互作用,设计了一种生物转录后带通滤波器 | 首次利用CsrA蛋白在uxuB mRNA上的异质性调控特性,通过5' UTR + 100 nt CDS序列作为支架,实现基于蛋白质浓度的ON/OFF状态转换,减少了合成电路组件数量 | NA | 开发基于转录后调控的合成生物电路,以减少细胞负担并简化调控组件 | uxuB mRNA转录本(特别是5' UTR + 100 nt CDS序列)与CsrA蛋白的相互作用 | 合成生物学 | NA | 转录后调控系统设计 | NA | NA | NA | NA | NA | 基于CsrA与uxuB mRNA相互作用的转录后带通滤波器,采用分级结合策略实现剂量依赖性调控 | 合成生物学 |
| 280 | 2026-04-02 |
Engineering Toehold-Mediated Switches for Native RNA Detection and Regulation in Bacteria
2022-09-30, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2022.167689
PMID:35717997
|
综述 | 本文综述了基于RNA toehold介导的开关在细菌中用于天然RNA检测和调控的工程应用 | 重点讨论了将RNA toehold开关应用于体内天然RNA检测的挑战,包括跨生物体的可转移性,并展望了结构预测算法在提升RNA开关体内功能方面的潜力 | NA | 探讨RNA toehold介导的开关在合成生物学中用于传感和调控的应用,特别是在细菌环境中 | RNA toehold介导的开关及其在天然RNA检测和调控中的设计 | 合成生物学 | NA | RNA toehold介导的开关设计 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | RNA toehold介导的开关,通过链置换控制开关状态转换,用于传感和调控 | 工业生物技术 |