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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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2781 | 2024-08-07 |
Recent progress and challenges in synthetic biology for improving microbial production of biopolymers
2023-10, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2023.127463
PMID:37479534
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
2782 | 2024-08-07 |
Plasmodium-Resistant Indole Diterpenoid Biosynthesis Gene Cluster Derived from Aspergillus oryzae Was Activated by Exogenous P450 Gene Ast B
2023-06-23, Journal of natural products
IF:3.3Q1
DOI:10.1021/acs.jnatprod.2c01172
PMID:37257055
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法激活了来自Aspergillus oryzae的沉默生物合成基因簇,产生了一系列新的吲哚二萜类化合物,并研究了它们的抗疟活性 | 首次报道了吲哚二萜类化合物具有潜在的抗疟疾活性,并通过结构-活性关系研究揭示了线性吲哚二萜类化合物对抗寄生虫活性的重要贡献 | NA | 研究通过合成生物学方法激活沉默生物合成基因簇,探索新型抗疟疾化合物 | 吲哚二萜类化合物的生物合成及其抗疟活性 | 合成生物学 | 疟疾 | NMR, HR-ESI-MS, 单晶X射线衍射, 分子对接 | NA | 化合物结构数据 | 15种吲哚二萜类化合物 |
2783 | 2024-08-07 |
Organization of an Artificial Multicellular System with a Tunable DNA Patch on a Membrane Surface
2024-Jan-10, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.3c04249
PMID:38112415
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研究论文 | 本文开发了一种基于DNA杂交链反应的膜表面DNA补丁策略,用于指导囊泡的互连,形成可调节的人工多细胞系统(AMS)。 | 通过调节DNA补丁产生异养粘附,实现了AMS的高阶结构直接且有效的生成,并成功构建了包含活细胞和囊泡的混合AMS。 | NA | 开发一种简便的策略,用于制造具有受控排列的人工多细胞系统。 | 人工多细胞系统(AMS)的构建和调控。 | 合成生物学 | NA | DNA杂交链反应 | NA | NA | NA |
2784 | 2024-08-07 |
Programmable synthetic receptors: the next-generation of cell and gene therapies
2024-01-03, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-023-01680-5
PMID:38167329
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综述 | 本文综述了合成受体系统在重编程治疗细胞及其在生物医学研究中的广泛应用 | 合成受体作为一种合成生物学工具,能够精确控制治疗细胞和遗传模块的功能,为细胞和基因治疗提供了强大的解决方案 | 当前合成受体系统在临床转化中仍面临挑战 | 探讨合成受体系统的设计、构建和改进策略,以及其在治疗应用中的扩展前景 | 合成受体系统,包括嵌合抗原受体(CARs)和合成Notch(synNotch)受体 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
2785 | 2024-08-07 |
Soil as a transdisciplinary research catalyst: from bioprospecting to biorespecting
2023-Nov, Royal Society open science
IF:2.9Q1
DOI:10.1098/rsos.230963
PMID:38026022
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研究论文 | 本文通过一个公共参与项目,探讨了土壤微生物组在城市六个地点的应用,使用基于纳米孔的DNA测序技术,并结合合成生物学、环境人文学和微生物生态学等多个学科的研究 | 提出了从'生物勘探'到'生物尊重'的概念转变,强调了基因信息使用应考虑其生态系统来源的责任 | NA | 探讨如何公平合理地使用土壤微生物组的潜在价值信息 | 土壤微生物组及其在城市环境中的应用 | 微生物生态学 | NA | 基于纳米孔的DNA测序 | NA | DNA序列 | 六个城市地点的土壤样本 |
2786 | 2024-08-07 |
Minimal aromatic aldehyde reduction (MARE) yeast platform for engineering vanillin production
2024-Jan-06, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-023-02454-5
PMID:38184607
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研究论文 | 本文报道了一种通过系统性删除氧化还原酶来改进香兰素积累的工业酵母菌株Saccharomyces cerevisiae的工程化方法 | 开发了最小芳香醛还原(MARE)酵母平台,用于从葡萄糖中从头合成香兰素,并通过多维工程优化辅因子供应和酵母中心代谢重构,提高了香兰素的生产效率 | NA | 展示合成生物学在创造适合工业需求的生物催化剂方面的巨大潜力 | 香兰素的微生物合成 | 合成生物学 | NA | 基因编辑 | NA | 生物代谢数据 | 最终的酵母菌株进行了24项遗传修改,在摇瓶中产生了365.55 ± 7.42 mg/L的香兰素 |
2787 | 2024-08-07 |
Optimizing Rhizobium-legume symbioses by simultaneous measurement of rhizobial competitiveness and N2 fixation in nodules
2020-May-05, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1921225117
PMID:32317381
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法开发了报告质粒,实现了在单个根瘤中同时高通量测量根瘤菌竞争力和氮固定效率 | 利用绿色荧光蛋白(GFP)和下一代测序(NGS)技术,实现了对根瘤菌竞争力和氮固定效率的同时高通量测量 | NA | 优化根瘤菌-豆科植物共生关系,提高农业产量 | 根瘤菌的竞争力和氮固定效率 | NA | NA | 下一代测序(NGS) | NA | NA | 在农业土壤中同时监测了84种不同的根瘤菌株 |
2788 | 2024-08-07 |
Harnessing synthetic biology for kelp forest conservation1
2019-Aug, Journal of phycology
IF:2.8Q2
DOI:10.1111/jpy.12888
PMID:31152453
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研究论文 | 本文讨论了合成生物学在海藻林保护中的潜在直接和间接应用 | 合成生物学作为快速发展和变革性的科学领域,提供了前所未有的解决方案来应对当前和新兴的环境问题 | 技术进步已经超过了对其使用的社会、伦理和实际考虑 | 探讨合成生物学在遏制或逆转全球海藻损失中的作用,并讨论挑战和研究路径 | 合成生物学在海藻林保护中的应用 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
2789 | 2024-08-07 |
Algal Photobiology: A Rich Source of Unusual Light Sensitive Proteins for Synthetic Biology and Optogenetics
2016, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-3512-3_3
PMID:26965114
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研究论文 | 本文探讨了真核微藻中的光吸收系统,特别是高度敏感的光感受器,并讨论了其在合成生物学和光遗传学中的应用潜力 | 本文提出通过识别新的光敏感模块和现有模块的小型变体,以扩展光遗传学工具的来源,并促进细胞信号研究中基于光的新策略的发展 | NA | 旨在发现新的光敏感模块,以扩展光遗传学工具的材料来源,并促进细胞信号研究中基于光的新策略的发展 | 真核微藻中的光吸收系统和光感受器 | 合成生物学 | NA | 基因组和转录组测序 | NA | 基因组数据 | NA |
2790 | 2024-08-07 |
Arabidopsis thaliana and Pisum sativum models demonstrate that root colonization is an intrinsic trait of Burkholderia cepacia complex bacteria
2014-Feb, Microbiology (Reading, England)
DOI:10.1099/mic.0.074351-0
PMID:24327425
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研究论文 | 研究了26种不同种类的Burkholderia cepacia复合体(Bcc)细菌在Arabidopsis thaliana和Pisum sativum根部的定殖能力 | 发现Bcc细菌具有固有的根部定殖能力,不受其物种或来源的影响,且其第三染色体复制子不是根部定殖所必需的 | NA | 探究Bcc细菌在不同植物模型中的根部定殖能力及其与物种和来源的关系 | 26种Bcc细菌在Arabidopsis thaliana和Pisum sativum根部的定殖能力 | NA | NA | 扫描电子显微镜和生物发光成像 | NA | 图像 | 26种Bcc细菌 |
2791 | 2024-08-07 |
Exploiting diversity and synthetic biology for the production of algal biofuels
2012-Aug-16, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/nature11479
PMID:22895338
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研究论文 | 本文探讨了利用多样性和合成生物学方法生产藻类生物燃料的可能性 | 提出了一种更可持续的生物燃料替代方案,特别是从不需要使用宝贵耕地的藻类中获取 | NA | 研究如何使藻类生物燃料在实际应用中更加可行和经济上可行 | 藻类生物燃料的生产 | 生物技术 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
2792 | 2024-08-07 |
Tailored bacteria tackling with environmental mercury: Inspired by natural mercuric detoxification operons
2024-Jan-15, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2023.123016
PMID:38008253
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综述 | 本文综述了基于mer操纵子的细菌在检测、吸收、生物积累和解毒环境汞中的作用 | 利用mer操纵子的四个组成部分(MerR调节因子、mer启动子、解毒因子MerA和MerB)构建合成细菌,以处理污染物汞 | NA | 探讨基于mer操纵子的设计细菌在环境汞生物修复中的潜力 | 环境中的汞及其对生态系统和人类健康的影响 | NA | NA | 合成生物学、蛋白质工程和代谢工程 | NA | NA | NA |
2793 | 2024-08-07 |
Genetic Engineering and Rebooting of Bacteriophages in L-Form Bacteria
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3523-0_16
PMID:38066374
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研究论文 | 本文详细介绍了生产无细胞壁的L型细菌及其在激活感染革兰氏阳性宿主物种的合成噬菌体基因组中的应用 | 本文开发了新型无标记基因组编辑方法,用于改进治疗性噬菌体,并详细介绍了合成生物学在体外组装改良噬菌体基因组的应用 | 在难以转化的革兰氏阳性细菌中激活合成噬菌体基因组可能具有挑战性 | 研究替代抗菌剂,特别是噬菌体,以治疗抗生素耐药性病原体感染 | L型细菌和合成噬菌体基因组 | NA | NA | 基因编辑 | NA | NA | NA |
2794 | 2024-08-07 |
Synthetic Biology to Engineer Bacteriophage Genomes
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3523-0_17
PMID:38066375
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研究论文 | 本文探讨了利用合成生物学技术开发新型分子生物学方法,以构建具有新功能的特化噬菌体 | 介绍了两种成功用于遗传工程噬菌体基因组的策略:噬菌体重组电穿孔DNA(BRED)和基于酵母的噬菌体工程平台 | NA | 开发新型分子生物学技术,以构建具有新功能的特化噬菌体 | 噬菌体及其在病原体控制、检测、靶向药物递送和新材料组装中的应用 | 合成生物学 | NA | 噬菌体重组电穿孔DNA(BRED)和基于酵母的噬菌体工程平台 | NA | NA | NA |
2795 | 2024-08-07 |
Characterization and optimization of 5´ untranslated region containing poly-adenine tracts in Kluyveromyces marxianus using machine-learning model
2024-Jan-03, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-023-02271-3
PMID:38172836
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研究论文 | 本文研究了Kluyveromyces marxianus中含多聚腺苷酸(poly(A))的5´非翻译区(5´ UTR)对蛋白质生产的影响,并利用机器学习模型对其进行优化 | 首次构建了包含5´ UTR poly(A)特征的机器学习模型,用于预测蛋白质产量 | 删除或减少poly(A)对mRNA水平的影响不一致,表明其对蛋白质生产的抑制作用可能与mRNA水平无关 | 构建机器学习模型,研究5´ UTR poly(A)对蛋白质生产的影响并进行优化 | Kluyveromyces marxianus中的5´ UTR poly(A)及其对蛋白质生产的影响 | 机器学习 | NA | 机器学习模型 | 多层感知器神经网络(MLP-NN) | 序列数据 | 207个含poly(A)的5´ UTR和34个不含poly(A)的5´ UTR |
2796 | 2024-08-07 |
Heterologous production of 3-hydroxypropionic acid in Methylorubrum extorquens by introducing the mcr gene via a multi-round chromosomal integration system based on cre-lox71/lox66 and transposon
2024-Jan-03, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-023-02275-z
PMID:38172868
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研究论文 | 本研究通过构建基于cre-lox71/lox66和转座子的多轮染色体整合系统,在Methylorubrum extorquens中异源生产3-羟基丙酸(3-HP)。 | 本研究开发了一种新的遗传工具,通过多轮染色体整合系统,实现了在M. extorquens中异源基因的高效表达。 | NA | 本研究旨在通过整合现有技术,如转座子介导的染色体整合和cre-lox介导的重组,实现目标基因在M. extorquens AM1中的多样化表达。 | Methylorubrum extorquens AM1 | 合成生物学 | NA | 转座子介导的染色体整合,cre-lox介导的重组 | NA | 基因表达 | 两个染色体整合拷贝 |
2797 | 2024-08-07 |
CO2-based production of phytase from highly stable expression plasmids in Cupriavidus necator H16
2024-Jan-03, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-023-02280-2
PMID:38172920
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研究论文 | 本研究介绍了一种新型表达质粒,通过电穿孔技术在Cupriavidus necator H16中高效生产源自大肠杆菌的AppA植酸酶。 | 该研究引入了一种新型表达质粒,包含分区系统以提高分离稳定性,无需选择压力,并成功在C. necator H16中生产了植酸酶。 | NA | 建立稳定的、高拷贝数质粒,支持利用C. necator从CO2生产单细胞蛋白,并探索其在饲料工业中利用CO2的潜力。 | Cupriavidus necator H16中的植酸酶生产。 | 合成生物学 | NA | 电穿孔技术 | NA | 蛋白质 | 在1升分批补料气体发酵系统中进行了放大实验。 |
2798 | 2024-08-07 |
Enhancing the production of recombinant adeno-associated virus in synthetic cell lines through systematic characterization
2024-01, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28562
PMID:37749931
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研究论文 | 本文通过系统性表征病毒生产动力学,优化了合成细胞系中重组腺相关病毒(rAAV)的生产 | 采用合成生物学方法生成稳定细胞系,通过条件表达基因和优化诱导条件,提高了rAAV的生产效率 | NA | 提高合成细胞系中rAAV的生产效率 | 重组腺相关病毒(rAAV)的生产 | 合成生物学 | NA | 定量蛋白质组学 | NA | 蛋白质 | NA |
2799 | 2024-08-07 |
EMT transcription factors activated circuits: A novel tool to study EMT dynamics and its therapeutic implications
2024-Mar, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2023.11.010
PMID:38173810
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研究论文 | 本研究介绍了响应性的EMT传感电路,通过特定的启动子感知EMT过程,并构建了NOT门电路来区分和抑制EMT肿瘤细胞的增殖 | 首次引入响应性的EMT传感电路,通过特定的启动子感知EMT过程,并构建了NOT门电路来区分和抑制EMT肿瘤细胞的增殖 | NA | 开发新的工具来研究EMT动态过程及其在治疗上的应用 | EMT过程中的细胞命运和靶向治疗 | 生物技术 | 癌症 | 合成生物学电路 | NA | 细胞 | 涉及乳腺癌细胞和上皮癌细胞 |
2800 | 2024-08-07 |
Dual Engineering of Olivetolic Acid Cyclase and Tetraketide Synthase for the Formation of Longer Alkyl-Chain Olivetolic Acid Analogs and Their Antibacterial Activities
2024, Chemical & pharmaceutical bulletin
IF:1.5Q3
DOI:10.1248/cpb.c23-00692
PMID:38171898
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综述 | 本文综述了通过双工程化橄榄酸环化酶和四酮合成酶来形成更长烷基链的橄榄酸类似物及其抗菌活性的研究 | 通过混合不同生物合成途径的基因或工程化次级代谢酶以扩展底物和产物特异性,理论上可以生成新的非天然化合物 | NA | 探讨通过工程化酶来扩展非天然大麻素中C-3烷基部分的可能性,以开发具有治疗效益的大麻素 | 橄榄酸环化酶和四酮合成酶的结构基础双工程化及其对橄榄酸类似物抗菌活性的影响 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |