合成生物学相关文章
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当前共找到 3041 篇文献，本页显示第 2821 - 2840 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2821 | 2024-08-07 |
Tunable Repression of Key Photosynthetic Processes Using Cas12a CRISPR Interference in the Fast-Growing Cyanobacterium Synechococcus sp. UTEX 2973
2020-Jan-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.9b00417
PMID:31829621
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研究论文 | 本文描述了一种可调节的dCas12a（dCpf1）CRISPRi系统，并将其应用于快速生长的蓝细菌Synechococcus sp. UTEX 2973中抑制关键光合作用过程 | 开发了一种新的合成生物学工具，即可调节的dCas12a CRISPRi系统，用于精确调控蓝细菌中的基因表达 | NA | 研究蓝细菌作为模型生物和生产平台的关键光合作用过程 | 蓝细菌Synechococcus sp. UTEX 2973中的光合作用过程 | 合成生物学 | NA | CRISPR干扰（CRISPRi） | dCas12a（dCpf1） | 基因表达数据 | 蓝细菌Synechococcus sp. UTEX 2973 |
| 2822 | 2024-08-07 |
Engineering Cellular Signal Sensors based on CRISPR-sgRNA Reconstruction Approaches
2020, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.42299
PMID:32210731
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review | 本文总结了基于CRISPR-sgRNA重构方法构建细胞信号传感器的优缺点及重新编程细胞信号网络的可能途径 | 提出了如何进一步改进基于sgRNA-riboswitch的信号传感器设计 | 控制CRISPR系统的基因编辑活性仍是一个挑战 | 促进环境检测、疾病诊断和基因治疗等领域的发展 | CRISPR系统在细胞信号传感器中的应用 | 生物技术 | NA | CRISPR-sgRNA | NA | NA | NA |
| 2823 | 2024-08-07 |
Combined genome editing and transcriptional repression for metabolic pathway engineering in Corynebacterium glutamicum using a catalytically active Cas12a
2019-Nov, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-019-10118-4
PMID:31583448
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研究论文 | 本文设计了一种结合基因组编辑和转录抑制的双功能CRISPR系统（RE-CRISPR），使用具有催化活性的Cas12a在谷氨酸棒杆菌中进行代谢途径工程 | 开发了一种新的RE-CRISPR系统，能够同时实现基因组编辑和转录抑制，提高了代谢产物的生产效率 | NA | 设计一种能够在谷氨酸棒杆菌中同时进行基因组编辑和转录抑制的新工具，以优化代谢途径 | 谷氨酸棒杆菌的代谢和调控基因 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas12a | NA | 基因组数据 | NA |
| 2824 | 2024-08-07 |
Simultaneous repression of multiple bacterial genes using nonrepetitive extra-long sgRNA arrays
2019-Nov, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-019-0286-9
PMID:31591552
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研究论文 | 本文通过使用非重复超长sgRNA阵列（ELSAs）同时抑制多个细菌基因，解决了CRISPR干扰中多sgRNA共表达引起的遗传不稳定性和表型丧失问题。 | 开发了非重复超长sgRNA阵列（ELSAs），通过结合非重复遗传部件和算法规则设计，实现了对多个基因的同时稳定调控。 | NA | 实现对多个细菌基因的同时稳定调控，以应用于代谢工程和合成生物学。 | 细菌基因的调控和细菌表型的工程化。 | 合成生物学 | NA | CRISPR干扰 | NA | DNA序列 | 22个sgRNAs，28个sgRNA handles |
| 2825 | 2024-08-07 |
Establishment and application of a CRISPR-Cas12a assisted genome-editing system in Zymomonas mobilis
2019-Oct-03, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-019-1219-5
PMID:31581942
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research paper | 本研究在Zymomonas mobilis中建立了基于CRISPR-Cas12a的基因编辑系统，并展示了其在质粒清除、基因删除和插入以及核苷酸替换等方面的应用 | 首次在Zymomonas mobilis中应用CRISPR-Cas12a系统，实现了高效的基因编辑和代谢工程 | NA | 开发一种高效便捷的基因编辑工具，加速Zymomonas mobilis的基因组研究和菌株改良 | Zymomonas mobilis菌株及其基因组 | synthetic biology | NA | CRISPR-Cas12a | NA | DNA | 涉及Zymomonas mobilis ZM4菌株及其原生质粒 |
| 2826 | 2024-08-07 |
Engineered CRISPRa enables programmable eukaryote-like gene activation in bacteria
2019-Aug-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-11479-0
PMID:31451697
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研究论文 | 本文报道了一种基于σ依赖型启动子的类真核细菌CRISPR激活（CRISPRa）系统，支持长距离和多输入调控 | 该系统在非模式细菌中激活σ依赖型启动子，支持正交基因调控，并能与dxCas9结合扩展DNA靶向灵活性 | NA | 开发一种新型的CRISPR激活系统，以提高基因表达调控的灵活性和效率 | 细菌中的基因表达调控 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas | NA | NA | NA |
| 2827 | 2024-08-07 |
Construction of a series of episomal plasmids and their application in the development of an efficient CRISPR/Cas9 system in Pichia pastoris
2019-May-27, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-019-2654-5
PMID:31134410
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研究论文 | 本研究构建了一系列质粒，并将其应用于开发高效的CRISPR/Cas9系统在毕赤酵母中 | 首次使用panARS序列开发了高效的CRISPR/Cas9基因编辑系统，相比传统系统提高了十倍以上的编辑效率 | NA | 开发高效的CRISPR/Cas9基因编辑系统在毕赤酵母中 | 毕赤酵母中的异源基因表达和基因组编辑 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | 质粒 | 五种不同来源的ARS序列 |
| 2828 | 2024-08-07 |
A gRNA-tRNA array for CRISPR-Cas9 based rapid multiplexed genome editing in Saccharomyces cerevisiae
2019-Mar-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-09005-3
PMID:30837474
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研究论文 | 报道了一种用于CRISPR-Cas9系统的gRNA-tRNA阵列（GTR-CRISPR），能够在酵母中进行多重基因编辑 | 开发了一种加速的Lightning GTR-CRISPR系统，避免了在E. coli中的克隆步骤，直接将Golden Gate反应混合物转化到酵母中，简化了酵母脂质网络，显著提高了游离脂肪酸的产量 | 使用未优化的gRNAs时效率较低 | 提高合成生物学中菌株工程的效率 | 酵母基因编辑和脂质网络简化 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 基因组数据 | 涉及8个基因的编辑 |
| 2829 | 2024-08-07 |
Engineering CRISPR guide RNA riboswitches for in vivo applications
2019-Feb, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2018.08.007
PMID:30265865
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研究论文 | 本文总结了CRISPR和riboswitch技术的最新进展，并推荐了新型功能化合成gRNA（sgRNA）设计，以实现对CRISPR基因编辑器的可诱导和时空调控 | 提出了新型功能化合成gRNA（sgRNA）设计，以实现对CRISPR基因编辑器的可诱导和时空调控 | NA | 实现对CRISPR基因编辑器的可诱导和时空调控 | CRISPR和riboswitch技术 | 基因编辑 | NA | CRISPR | NA | NA | NA |
| 2830 | 2024-08-07 |
A Synthetic Microbial Operational Amplifier
2018-Sep-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.8b00138
PMID:30152993
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研究论文 | 本文展示了如何构建一个合成微生物操作放大器，该放大器包含三个阶段：快速CRISPR基础的差分输入推挽阶段、慢速转录和翻译放大阶段以及快速酶输出阶段 | 首次在生物分子部件中构建了类似于电子学中的操作放大器，提高了电路的预测性和稳定性 | NA | 改进细胞电路的预测性和稳定性 | 合成微生物操作放大器 | 合成生物学 | NA | CRISPR | NA | NA | 使用了5种蛋白质，包括dCas9 |
| 2831 | 2024-08-07 |
Multiplexed sgRNA Expression Allows Versatile Single Nonrepetitive DNA Labeling and Endogenous Gene Regulation
2018-Jan-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.7b00268
PMID:28849913
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研究论文 | 本文介绍了一种基于合成生物学的方法，通过将多个sgRNA表达盒串联到一个单一质粒中，实现了高效的多个sgRNA表达，并探索了其在单个非重复基因组位点成像和活细胞中协同基因调控的应用 | 本文开发了一种无需载体的多sgRNA表达方法，提高了效率和可控性，并具有良好的扩展性 | NA | 探索CRISPR/Cas9系统在基因组编辑、基因调控和染色质研究中的应用 | 多重生物系统的研究 | 基因组学 | NA | CRISPR/Cas9系统 | NA | 基因组数据 | NA |
| 2832 | 2024-08-07 |
Enhanced guide-RNA design and targeting analysis for precise CRISPR genome editing of single and consortia of industrially relevant and non-model organisms
2018-Jan-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btx564
PMID:28968798
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研究论文 | 本文开发了一种名为CASPER的新方法，用于增强CRISPR/Cas系统在不同生物中的基因组编辑能力，通过识别和分析非唯一（重复）目标，提高了目标和非目标预测的准确性 | CASPER方法在预测目标和非目标活动方面分别比传统方法提高了2.4%和30.2%，并支持多目标分析和多物种群体分析 | NA | 开发一种高效的基因组编辑工具，以实现非模式生物的快速菌株工程，用于合成生物学和代谢工程应用 | 非模式生物的基因组编辑 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas系统 | NA | 基因组数据 | 涉及多种工业相关生物的基因组 |
| 2833 | 2024-08-07 |
Bacterial Genome Editing Strategy for Control of Transcription and Protein Stability
2018, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-7295-1_3
PMID:29170951
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研究论文 | 本文描述了一种在埃希氏菌中标记基因的协议，允许对任何感兴趣的可溶性蛋白质进行诱导性降解和转录控制 | 利用CRISPRi和N端规则蛋白降解这两种跨界的工具，以及CRMAGE技术进行基因组编辑，并通过随机化翻译起始区域最小化标签插入的极性效应 | NA | 开发一种通用的合成生物学工具，用于控制蛋白质生产和稳定性 | 埃希氏菌中的基因和蛋白质 | 分子生物学 | NA | CRISPRi, N-end rule, CRMAGE | NA | 基因组 | NA |
| 2834 | 2024-08-07 |
CRISPR-Cas9-Mediated Genome Editing and Transcriptional Control in Yarrowia lipolytica
2018, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-7795-6_18
PMID:29754237
|
研究论文 | 本文介绍了在工业重要的产油酵母Yarrowia lipolytica中使用CRISPR-Cas9系统进行基因编辑和转录调控的方法 | 开发了一套易于使用且有效的CRISPR-Cas9质粒载体，扩展了Yarrowia lipolytica的基因编辑和转录调控能力 | NA | 探索在Yarrowia lipolytica中使用CRISPR-Cas9系统进行基因编辑和转录调控的新方法 | Yarrowia lipolytica的基因编辑和转录调控 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | DNA | NA |
| 2835 | 2024-08-07 |
CRISPR-Cas type II-based Synthetic Biology applications in eukaryotic cells
2017-Oct-03, RNA biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/15476286.2017.1282024
PMID:28136159
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研究论文 | 本文探讨了基于CRISPR-Cas II型系统的合成生物学应用在真核细胞中的发展 | 介绍了利用CRISPR-Cas II型系统构建新型RNA基转录因子的方法，这种方法比合成蛋白质如转录激活类似效应子更简单 | CRISPR-dCas9技术在复杂合成网络中的可行性尚未得到证实，需要进一步研究不同CRISPR类型的设计 | 研究CRISPR-Cas II型系统在真核细胞中精确DNA编辑和基因组重编程的应用 | CRISPR-Cas II型系统及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统 | NA | DNA | 涉及哺乳动物和酵母细胞 |
| 2836 | 2024-08-07 |
An enhanced hTERT promoter-driven CRISPR/Cas9 system selectively inhibits the progression of bladder cancer cells
2017-Aug-22, Molecular bioSystems
DOI:10.1039/c7mb00354d
PMID:28702647
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研究论文 | 本文介绍了一种基于CRISPR/Cas9系统的合成逻辑电路，通过增强型hTERT启动子间接控制Cas9核酸酶的表达，以选择性抑制膀胱癌细胞的进展 | 利用增强型hTERT启动子和GAL4/上游激活序列（UAS）结合系统，构建了一种新型的CRISPR/Cas9系统，能够选择性地抑制膀胱癌细胞的增殖、迁移和侵袭，并增加其凋亡率 | NA | 开发一种新型的治疗癌症的方法，通过合成生物学原理提高治疗的有效性和特异性 | 膀胱癌细胞（T24和5637）和人包皮成纤维细胞（HFF） | 合成生物学 | 膀胱癌 | CRISPR/Cas9技术 | NA | mRNA表达水平 | T24和5637膀胱癌细胞以及人包皮成纤维细胞（HFF） |
| 2837 | 2024-08-07 |
Large scale validation of an efficient CRISPR/Cas-based multi gene editing protocol in Escherichia coli
2017-Apr-24, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-017-0681-1
PMID:28438207
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研究论文 | 本文通过大规模验证，优化并定义了一种基于CRISPR/Cas9系统的多基因编辑协议在E. coli中的高效性和鲁棒性 | 首次定义了基于CRISPR/Cas9系统的基因编辑协议的鲁棒性，并展示了其在大规模基因删除中的高效性 | NA | 验证和优化基于CRISPR/Cas9系统的基因编辑协议在E. coli中的效率和鲁棒性 | E. coli中的78个可有可无基因 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9系统结合λ重组酶介导的同源重组 | NA | DNA | 78个基因 |
| 2838 | 2024-08-07 |
CRISPR-Cas-Assisted Multiplexing (CAM): Simple Same-Day Multi-Locus Engineering in Yeast
2016-Dec, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.25375
PMID:26991244
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CRISPR-Cas辅助多重化（CAM）的方法，用于酵母中多基因位点的快速工程化 | CAM方法无需克隆步骤，可在同一天内完成多基因位点的工程化，显著缩短了酵母菌株工程的时间 | NA | 开发一种快速且高效的多基因位点工程化方法，以满足合成生物学时代对酵母菌株工程的需求 | 酵母菌株 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas | NA | NA | NA |
| 2839 | 2024-08-07 |
Rapid and Efficient One-Step Metabolic Pathway Integration in E. coli
2016-Jul-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5b00187
PMID:27072506
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研究论文 | 本文介绍了一种基于CRISPR的策略，用于在Escherichia coli中高效、单步整合大型代谢途径 | 该策略允许在广泛的同源臂大小和基因组位置上进行高效率整合，效率范围从70%到100%，并在7个不同位点进行验证 | NA | 加速合成生物学和代谢工程应用 | 在Escherichia coli中快速测试基因和途径的稳定整合方法 | 合成生物学 | NA | CRISPR | NA | 基因组 | 7个不同基因组位点 |
| 2840 | 2024-08-07 |
Multiplexed Targeted Genome Engineering Using a Universal Nuclease-Assisted Vector Integration System
2016-Jul-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6b00056
PMID:27159246
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研究论文 | 本研究开发了一种多重化和通用的核酸酶辅助载体整合系统，用于快速生成基因敲除 | 该系统无需定制靶向载体，降低了基因编辑的成本和时间，并能整合高达50kb的DNA，实现多基因敲除的快速生成和筛选 | NA | 开发一种高效的基因编辑工具，用于哺乳动物基因组工程 | 哺乳动物基因组的基因编辑 | 基因工程 | NA | 核酸酶辅助载体整合 | NA | DNA | NA |