合成生物学相关文章
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当前共找到 3043 篇文献，本页显示第 2841 - 2860 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2841 | 2024-08-07 |
Rapid and Efficient One-Step Metabolic Pathway Integration in E. coli
2016-Jul-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5b00187
PMID:27072506
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研究论文 | 本文介绍了一种基于CRISPR的策略，用于在Escherichia coli中高效、单步整合大型代谢途径 | 该策略允许在广泛的同源臂大小和基因组位置上进行高效率整合，效率范围从70%到100%，并在7个不同位点进行验证 | NA | 加速合成生物学和代谢工程应用 | 在Escherichia coli中快速测试基因和途径的稳定整合方法 | 合成生物学 | NA | CRISPR | NA | 基因组 | 7个不同基因组位点 |
| 2842 | 2024-08-07 |
Multiplexed Targeted Genome Engineering Using a Universal Nuclease-Assisted Vector Integration System
2016-Jul-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6b00056
PMID:27159246
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研究论文 | 本研究开发了一种多重化和通用的核酸酶辅助载体整合系统，用于快速生成基因敲除 | 该系统无需定制靶向载体，降低了基因编辑的成本和时间，并能整合高达50kb的DNA，实现多基因敲除的快速生成和筛选 | NA | 开发一种高效的基因编辑工具，用于哺乳动物基因组工程 | 哺乳动物基因组的基因编辑 | 基因工程 | NA | 核酸酶辅助载体整合 | NA | DNA | NA |
| 2843 | 2024-08-07 |
Conditional Control of CRISPR/Cas9 Function
2016-Apr-25, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.201511441
PMID:26996256
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研究论文 | 本文探讨了通过小分子和光控制CRISPR/Cas9系统的条件激活方法，以实现更精确的基因组编辑和时空控制基因调控系统 | 开发了几种使用小分子和光条件激活Cas9功能的方法，提高了CRISPR/Cas9系统的基因编辑特异性，并实现了时间和空间上的精确激活 | NA | 实现更精确的基因组修改和扩展CRISPR/Cas9系统作为时空控制基因调控系统 | CRISPR/Cas9系统的条件激活方法 | 基因编辑 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | NA | NA |
| 2844 | 2024-08-07 |
Potential pitfalls of CRISPR/Cas9-mediated genome editing
2016-Apr, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.13586
PMID:26535798
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综述 | 本文综述了CRISPR/Cas9基因编辑技术的发展历程及其在疾病研究、基因校正和表型修正中的应用，同时探讨了该技术在效率和特异性方面存在的问题和可能的解决方案。 | CRISPR/Cas9系统从最初发现到成为一种有前景的基因编辑工具的快速演进。 | CRISPR/Cas9技术在Cas9活性、目标位点选择、短引导RNA设计、递送方法、脱靶效应和同源定向修复等方面的效率和特异性问题。 | 探讨CRISPR/Cas9基因编辑技术的应用及其存在的问题和解决方案。 | CRISPR/Cas9基因编辑技术的效率和特异性。 | 基因编辑 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | NA | NA |
| 2845 | 2024-08-07 |
Programmable control of bacterial gene expression with the combined CRISPR and antisense RNA system
2016-Mar-18, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkw056
PMID:26837577
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研究论文 | 本文结合CRISPR系统和合成反义RNA（asRNA）在Escherichia coli菌株中以可编程方式抑制或解除抑制目标基因 | 首次展示了CRISPR系统抑制的基因可以通过表达asRNA来解除抑制，并且通过设计靶向不同区域sgRNA的asRNA以及改变sgRNA-asRNA复合物的杂交自由能，可以实现可调节的解除抑制水平（高达95%） | NA | 实现通过可预测地控制基因表达来实施多样化的细胞功能 | CRISPR系统和合成反义RNA在Escherichia coli中的应用 | 合成生物学 | NA | CRISPR系统，反义RNA | NA | RNA | NA |
| 2846 | 2024-08-07 |
Accelerating genome editing in CHO cells using CRISPR Cas9 and CRISPy, a web-based target finding tool
2014-Aug, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.25233
PMID:24827782
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研究论文 | 本文首次展示了CRISPR Cas9技术在CHO细胞中产生位点特异性基因破坏的有效性，并开发了一个名为CRISPy的生物信息学工具，用于快速识别CHO-K1基因组中的sgRNA靶序列。 | 首次在CHO细胞中验证了CRISPR Cas9技术的有效性，并开发了CRISPy工具，有助于加速CHO细胞的基因编辑和合成生物学研究。 | NA | 提高CHO细胞中复杂药物蛋白的生产质量和产量。 | CHO细胞中的COSMC和FUT8基因。 | 生物技术 | NA | CRISPR Cas9 | NA | 基因组数据 | 8个sgRNAs在CHO细胞中进行了测试。 |
| 2847 | 2024-08-07 |
Multiplex engineering of industrial yeast genomes using CRISPRm
2014, Methods in enzymology
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research paper | 本文介绍了一种高效、无标记、高通量、多重化的基因编辑平台，用于工业酵母菌株的基因组编辑 | 开发了一种基于质粒表达CRISPR/Cas9核酸酶和多个核酶保护的单引导RNA的多重CRISPR（CRISPRm）系统 | NA | 开发适用于工业酵母菌株的高效基因编辑工具 | 工业酵母菌株Saccharomyces cerevisiae | synthetic biology | NA | CRISPR/Cas9 | NA | DNA | NA |
| 2848 | 2024-08-07 |
Selective induction of programmed cell death using synthetic biology tools
2024-03-15, Seminars in cell & developmental biology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.semcdb.2023.07.012
PMID:37598045
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研究论文 | 本文讨论了利用合成生物学工具选择性诱导程序性细胞死亡的最新进展 | 开发了基于合成生物学的工具，允许使用化学遗传学或光遗传学方法靶向诱导程序性细胞死亡 | 由于程序性细胞死亡途径的互连性和多效性效应，单独研究这些途径具有挑战性 | 探讨合成生物学工具在细胞和动物中研究程序性细胞死亡的应用 | 程序性细胞死亡的不同形式及其诱导和执行的细胞信号传导途径 | 合成生物学 | NA | 化学遗传学，光遗传学 | NA | NA | NA |
| 2849 | 2024-08-07 |
The Calvin Benson cycle in bacteria: New insights from systems biology
2024-03-01, Seminars in cell & developmental biology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.semcdb.2023.03.007
PMID:37002131
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综述 | 本文综述了光养和化能自养细菌中Calvin Benson循环的调控机制及其在生物技术中的应用 | 强调了光养和化能自养模型之间的差异，并探讨了通过蛋白质工程和合成生物学手段对Calvin Benson循环酶进行调控以增强CO2固定的可能性 | NA | 旨在深入理解细菌中Calvin Benson循环的调控机制，并探索其在生物技术中的应用潜力 | 光养和化能自养细菌中的Calvin Benson循环 | 系统生物学 | NA | 系统生物学研究方法 | NA | NA | NA |
| 2850 | 2024-08-07 |
The resurrection of life
2010-Apr, Origins of life and evolution of the biosphere : the journal of the International Society for the Study of the Origin of Life
DOI:10.1007/s11084-010-9197-y
PMID:20195774
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研究论文 | 本文重新探讨了生命本质的问题，并反驳了生命问题在生物学中无立足之地的观点 | 提出生命问题不应被排除在生物学之外，并指出生命问题的本质已从寻找生命原则转变为描述历史过程 | NA | 探讨生命本质问题在生物学中的地位和意义 | 生命本质及其在生物学中的地位 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2851 | 2024-08-07 |
Question 7: construction of a semi-synthetic minimal cell: a model for early living cells
2007-Oct, Origins of life and evolution of the biosphere : the journal of the International Society for the Study of the Origin of Life
DOI:10.1007/s11084-007-9090-5
PMID:17668286
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法构建了一个半合成最小细胞模型，旨在模拟早期生命细胞的简单性 | 引入了名为“Puresystem”（PS）的最小酶集合，用于合成EGFP蛋白，并通过克隆脂肪酸合成酶（FAS）I型酶的基因，实现了脂质体的生长和复制 | NA | 构建一个半合成最小细胞模型，模拟早期生命细胞的进化过程 | 半合成最小细胞模型及其复制机制 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | 最小细胞模型 | 基因数据 | NA |
| 2852 | 2024-08-07 |
From Never Born Proteins to Minimal Living Cells: two projects in synthetic biology
2006-Dec, Origins of life and evolution of the biosphere : the journal of the International Society for the Study of the Origin of Life
DOI:10.1007/s11084-006-9033-6
PMID:17131092
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研究论文 | 本文探讨了合成生物学领域的两个研究项目：从未诞生蛋白质（NBPs）和最小细胞项目 | 研究涉及从头蛋白质的结构和功能特性，以及构建具有生命特性的最简单细胞结构 | NA | 主要关注这两个研究项目对生命起源研究的相关性 | 从未诞生蛋白质和最小细胞 | 合成生物学 | NA | 噬菌体展示方法 | NA | NA | NA |
| 2853 | 2024-08-07 |
Biosensor-assisted titratable CRISPRi high-throughput (BATCH) screening for over-production phenotypes
2023-01, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2022.11.004
PMID:36375746
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研究论文 | 本文开发了一种生物传感器辅助的可调式CRISPRi高通量（BATCH）筛选方法，用于在Escherichia coli中筛选高产量表型 | 首次开发了一种可编程的错配CRISPRi，能够通过一个sgRNA池实现多级干扰效果，并结合生物传感器进行高产量表型的筛选 | NA | 优化代谢通量并加速微生物生物生产中的高通量表型筛选 | Escherichia coli中的代谢通量和表型筛选 | 合成生物学 | NA | CRISPR干扰技术 | NA | 生物传感器数据 | 20个相关基因的sgRNA池，以及pfkA和ptsI的组合敲降 |
| 2854 | 2024-08-07 |
Improving cooperativity of transcription activators by oligomerization domains in mammalian cells
2023-Mar, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2022.12.003
PMID:36605704
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研究论文 | 本研究通过在哺乳动物细胞中融合寡聚化域，开发了具有协同激活功能的转录因子 | 本研究采用了一种新型寡聚化域CarH，其寡聚化能力不依赖于C端域，与转录因子和激活域融合，显著提高了协同激活能力 | NA | 提高哺乳动物细胞中合成生物学应用的协同激活 | 哺乳动物细胞中的转录因子协同激活 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2855 | 2024-08-07 |
A quantitative autonomous bioluminescence reporter system with a wide dynamic range for Plant Synthetic Biology
2024-Jan, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.14146
PMID:37882352
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研究论文 | 本文介绍了一种基于自主生物发光的新型低成本、高通量的植物基因表达定量报告系统 | 该系统利用Neonothopanus nambi真菌的完整生物发光循环途径构建了一个自维持的报告系统，无需外源性提供荧光素酶底物，并通过HispS基因作为报告系统的转录入口点，显著提高了输出的动态范围 | NA | 旨在为植物合成生物学中的合成基因电路优化提供快速、丰富的数据集 | 植物基因表达的定量测量 | 合成生物学 | NA | 生物发光 | NA | 基因表达数据 | 涉及N. benthamiana等植物样本 |
| 2856 | 2024-08-07 |
A comparative analysis of stably expressed genes across diverse angiosperms exposes flexibility in underlying promoter architecture
2023-11-01, G3 (Bethesda, Md.)
DOI:10.1093/g3journal/jkad206
PMID:37697043
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研究论文 | 本文通过比较多种被子植物中稳定表达基因的启动子结构，探讨了启动子架构的灵活性 | 研究发现核心启动子类型与表达模式之间存在相关性而非因果关系，强调了在多样植物物种中寻找或构建组成型启动子的挑战 | 研究依赖于公开的RNA-seq数据，可能存在数据质量和覆盖范围的局限性 | 验证核心启动子设计规则在不同被子植物中的保守性 | 多种被子植物中的稳定表达基因及其启动子结构 | NA | NA | RNA-seq | NA | RNA序列数据 | 多个被子植物物种 |
| 2857 | 2024-08-07 |
IDESS: a toolbox for identification and automated design of stochastic gene circuits
2023-11-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad682
PMID:37988145
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research paper | 本文介绍了IDESS工具箱，用于优化基于设计的基因调控电路的模型识别和自动设计，特别是在随机机制中。 | IDESS工具箱结合了化学主方程的有效近似和随机模拟算法，以及能够解决混合整数非线性规划问题的全局优化算法。 | NA | 提高合成生物学中基因电路模型识别和自动设计的可预测性。 | 基因调控电路的自动设计和参数估计。 | synthetic biology | NA | 化学主方程近似，随机模拟算法 | NA | NA | NA |
| 2858 | 2024-08-07 |
Building a pipeline to identify and engineer constitutive and repressible promoters
2023, Quantitative plant biology
DOI:10.1017/qpb.2023.10
PMID:37901686
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研究论文 | 本文开发了一个流程，用于识别和工程化构建在植物合成生物学应用中所需的稳定表达的组成型和可抑制启动子。 | 本文引入了两个基因组正交的gRNA靶点，将筛选出的部分启动子转化为NOR逻辑门，增加了启动子的功能性。 | NA | 支持植物合成生物学应用中日益复杂的电路需求，寻找新的组成型启动子。 | 植物合成生物学中的组成型启动子。 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2859 | 2024-08-07 |
CSI: Contrastive data Stratification for Interaction prediction and its application to compound-protein interaction prediction
2023-08-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad456
PMID:37490457
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研究论文 | 本文介绍了一种名为对比分层交互预测（CSI）的新方法，通过对比多视角编码技术来学习最大化互信息的数据嵌入，并应用于化合物-蛋白质序列交互预测问题 | 提出了一种新的数据分层方法CSI，通过对比学习技术增强对象表示，并展示了在化合物-蛋白质序列交互预测中的有效性 | NA | 开发一种新的方法来准确预测两个对象之间的交互可能性，并应用于化合物-蛋白质序列交互预测 | 化合物-蛋白质序列交互预测问题 | 计算机科学 | NA | 对比学习 | 对比多视角编码 | 序列数据 | 多个药物-目标和酶数据集 |
| 2860 | 2024-08-07 |
Structural features of sensory two component systems: a synthetic biology perspective
2023-01-31, The Biochemical journal
DOI:10.1042/BCJ20210798
PMID:36688908
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综述 | 本文从结构生物学的角度探讨了如何利用双组分系统中的传感器和效应蛋白模块构建新的合成电路 | 综述了过去二十年中对信号检测、别构机制和特异性决定因素的分子理解进展，并讨论了这些信息如何被用于开发新的合成网络 | NA | 探讨如何利用双组分系统中的传感器和效应蛋白模块构建新的合成电路 | 双组分系统中的传感器和效应蛋白模块 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |