合成生物学相关文章
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当前共找到 3054 篇文献，本页显示第 2841 - 2860 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2841 | 2024-08-07 |
A gRNA-tRNA array for CRISPR-Cas9 based rapid multiplexed genome editing in Saccharomyces cerevisiae
2019-Mar-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-09005-3
PMID:30837474
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研究论文 | 报道了一种用于CRISPR-Cas9系统的gRNA-tRNA阵列（GTR-CRISPR），能够在酵母中进行多重基因编辑 | 开发了一种加速的Lightning GTR-CRISPR系统，避免了在E. coli中的克隆步骤，直接将Golden Gate反应混合物转化到酵母中，简化了酵母脂质网络，显著提高了游离脂肪酸的产量 | 使用未优化的gRNAs时效率较低 | 提高合成生物学中菌株工程的效率 | 酵母基因编辑和脂质网络简化 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 基因组数据 | 涉及8个基因的编辑 |
| 2842 | 2024-08-07 |
Engineering CRISPR guide RNA riboswitches for in vivo applications
2019-Feb, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2018.08.007
PMID:30265865
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研究论文 | 本文总结了CRISPR和riboswitch技术的最新进展，并推荐了新型功能化合成gRNA（sgRNA）设计，以实现对CRISPR基因编辑器的可诱导和时空调控 | 提出了新型功能化合成gRNA（sgRNA）设计，以实现对CRISPR基因编辑器的可诱导和时空调控 | NA | 实现对CRISPR基因编辑器的可诱导和时空调控 | CRISPR和riboswitch技术 | 基因编辑 | NA | CRISPR | NA | NA | NA |
| 2843 | 2024-08-07 |
A Synthetic Microbial Operational Amplifier
2018-Sep-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.8b00138
PMID:30152993
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研究论文 | 本文展示了如何构建一个合成微生物操作放大器，该放大器包含三个阶段：快速CRISPR基础的差分输入推挽阶段、慢速转录和翻译放大阶段以及快速酶输出阶段 | 首次在生物分子部件中构建了类似于电子学中的操作放大器，提高了电路的预测性和稳定性 | NA | 改进细胞电路的预测性和稳定性 | 合成微生物操作放大器 | 合成生物学 | NA | CRISPR | NA | NA | 使用了5种蛋白质，包括dCas9 |
| 2844 | 2024-08-07 |
Multiplexed sgRNA Expression Allows Versatile Single Nonrepetitive DNA Labeling and Endogenous Gene Regulation
2018-Jan-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.7b00268
PMID:28849913
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研究论文 | 本文介绍了一种基于合成生物学的方法，通过将多个sgRNA表达盒串联到一个单一质粒中，实现了高效的多个sgRNA表达，并探索了其在单个非重复基因组位点成像和活细胞中协同基因调控的应用 | 本文开发了一种无需载体的多sgRNA表达方法，提高了效率和可控性，并具有良好的扩展性 | NA | 探索CRISPR/Cas9系统在基因组编辑、基因调控和染色质研究中的应用 | 多重生物系统的研究 | 基因组学 | NA | CRISPR/Cas9系统 | NA | 基因组数据 | NA |
| 2845 | 2024-08-07 |
Enhanced guide-RNA design and targeting analysis for precise CRISPR genome editing of single and consortia of industrially relevant and non-model organisms
2018-Jan-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btx564
PMID:28968798
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研究论文 | 本文开发了一种名为CASPER的新方法，用于增强CRISPR/Cas系统在不同生物中的基因组编辑能力，通过识别和分析非唯一（重复）目标，提高了目标和非目标预测的准确性 | CASPER方法在预测目标和非目标活动方面分别比传统方法提高了2.4%和30.2%，并支持多目标分析和多物种群体分析 | NA | 开发一种高效的基因组编辑工具，以实现非模式生物的快速菌株工程，用于合成生物学和代谢工程应用 | 非模式生物的基因组编辑 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas系统 | NA | 基因组数据 | 涉及多种工业相关生物的基因组 |
| 2846 | 2024-08-07 |
Bacterial Genome Editing Strategy for Control of Transcription and Protein Stability
2018, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-7295-1_3
PMID:29170951
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研究论文 | 本文描述了一种在埃希氏菌中标记基因的协议，允许对任何感兴趣的可溶性蛋白质进行诱导性降解和转录控制 | 利用CRISPRi和N端规则蛋白降解这两种跨界的工具，以及CRMAGE技术进行基因组编辑，并通过随机化翻译起始区域最小化标签插入的极性效应 | NA | 开发一种通用的合成生物学工具，用于控制蛋白质生产和稳定性 | 埃希氏菌中的基因和蛋白质 | 分子生物学 | NA | CRISPRi, N-end rule, CRMAGE | NA | 基因组 | NA |
| 2847 | 2024-08-07 |
CRISPR-Cas9-Mediated Genome Editing and Transcriptional Control in Yarrowia lipolytica
2018, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-7795-6_18
PMID:29754237
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研究论文 | 本文介绍了在工业重要的产油酵母Yarrowia lipolytica中使用CRISPR-Cas9系统进行基因编辑和转录调控的方法 | 开发了一套易于使用且有效的CRISPR-Cas9质粒载体，扩展了Yarrowia lipolytica的基因编辑和转录调控能力 | NA | 探索在Yarrowia lipolytica中使用CRISPR-Cas9系统进行基因编辑和转录调控的新方法 | Yarrowia lipolytica的基因编辑和转录调控 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | DNA | NA |
| 2848 | 2024-08-07 |
CRISPR-Cas type II-based Synthetic Biology applications in eukaryotic cells
2017-Oct-03, RNA biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/15476286.2017.1282024
PMID:28136159
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研究论文 | 本文探讨了基于CRISPR-Cas II型系统的合成生物学应用在真核细胞中的发展 | 介绍了利用CRISPR-Cas II型系统构建新型RNA基转录因子的方法，这种方法比合成蛋白质如转录激活类似效应子更简单 | CRISPR-dCas9技术在复杂合成网络中的可行性尚未得到证实，需要进一步研究不同CRISPR类型的设计 | 研究CRISPR-Cas II型系统在真核细胞中精确DNA编辑和基因组重编程的应用 | CRISPR-Cas II型系统及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统 | NA | DNA | 涉及哺乳动物和酵母细胞 |
| 2849 | 2024-08-07 |
An enhanced hTERT promoter-driven CRISPR/Cas9 system selectively inhibits the progression of bladder cancer cells
2017-Aug-22, Molecular bioSystems
DOI:10.1039/c7mb00354d
PMID:28702647
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研究论文 | 本文介绍了一种基于CRISPR/Cas9系统的合成逻辑电路，通过增强型hTERT启动子间接控制Cas9核酸酶的表达，以选择性抑制膀胱癌细胞的进展 | 利用增强型hTERT启动子和GAL4/上游激活序列（UAS）结合系统，构建了一种新型的CRISPR/Cas9系统，能够选择性地抑制膀胱癌细胞的增殖、迁移和侵袭，并增加其凋亡率 | NA | 开发一种新型的治疗癌症的方法，通过合成生物学原理提高治疗的有效性和特异性 | 膀胱癌细胞（T24和5637）和人包皮成纤维细胞（HFF） | 合成生物学 | 膀胱癌 | CRISPR/Cas9技术 | NA | mRNA表达水平 | T24和5637膀胱癌细胞以及人包皮成纤维细胞（HFF） |
| 2850 | 2024-08-07 |
Large scale validation of an efficient CRISPR/Cas-based multi gene editing protocol in Escherichia coli
2017-Apr-24, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-017-0681-1
PMID:28438207
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研究论文 | 本文通过大规模验证，优化并定义了一种基于CRISPR/Cas9系统的多基因编辑协议在E. coli中的高效性和鲁棒性 | 首次定义了基于CRISPR/Cas9系统的基因编辑协议的鲁棒性，并展示了其在大规模基因删除中的高效性 | NA | 验证和优化基于CRISPR/Cas9系统的基因编辑协议在E. coli中的效率和鲁棒性 | E. coli中的78个可有可无基因 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9系统结合λ重组酶介导的同源重组 | NA | DNA | 78个基因 |
| 2851 | 2024-08-07 |
CRISPR-Cas-Assisted Multiplexing (CAM): Simple Same-Day Multi-Locus Engineering in Yeast
2016-Dec, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.25375
PMID:26991244
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CRISPR-Cas辅助多重化（CAM）的方法，用于酵母中多基因位点的快速工程化 | CAM方法无需克隆步骤，可在同一天内完成多基因位点的工程化，显著缩短了酵母菌株工程的时间 | NA | 开发一种快速且高效的多基因位点工程化方法，以满足合成生物学时代对酵母菌株工程的需求 | 酵母菌株 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas | NA | NA | NA |
| 2852 | 2024-08-07 |
Rapid and Efficient One-Step Metabolic Pathway Integration in E. coli
2016-Jul-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5b00187
PMID:27072506
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研究论文 | 本文介绍了一种基于CRISPR的策略，用于在Escherichia coli中高效、单步整合大型代谢途径 | 该策略允许在广泛的同源臂大小和基因组位置上进行高效率整合，效率范围从70%到100%，并在7个不同位点进行验证 | NA | 加速合成生物学和代谢工程应用 | 在Escherichia coli中快速测试基因和途径的稳定整合方法 | 合成生物学 | NA | CRISPR | NA | 基因组 | 7个不同基因组位点 |
| 2853 | 2024-08-07 |
Multiplexed Targeted Genome Engineering Using a Universal Nuclease-Assisted Vector Integration System
2016-Jul-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6b00056
PMID:27159246
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研究论文 | 本研究开发了一种多重化和通用的核酸酶辅助载体整合系统，用于快速生成基因敲除 | 该系统无需定制靶向载体，降低了基因编辑的成本和时间，并能整合高达50kb的DNA，实现多基因敲除的快速生成和筛选 | NA | 开发一种高效的基因编辑工具，用于哺乳动物基因组工程 | 哺乳动物基因组的基因编辑 | 基因工程 | NA | 核酸酶辅助载体整合 | NA | DNA | NA |
| 2854 | 2024-08-07 |
Conditional Control of CRISPR/Cas9 Function
2016-Apr-25, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.201511441
PMID:26996256
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研究论文 | 本文探讨了通过小分子和光控制CRISPR/Cas9系统的条件激活方法，以实现更精确的基因组编辑和时空控制基因调控系统 | 开发了几种使用小分子和光条件激活Cas9功能的方法，提高了CRISPR/Cas9系统的基因编辑特异性，并实现了时间和空间上的精确激活 | NA | 实现更精确的基因组修改和扩展CRISPR/Cas9系统作为时空控制基因调控系统 | CRISPR/Cas9系统的条件激活方法 | 基因编辑 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | NA | NA |
| 2855 | 2024-08-07 |
Potential pitfalls of CRISPR/Cas9-mediated genome editing
2016-Apr, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.13586
PMID:26535798
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综述 | 本文综述了CRISPR/Cas9基因编辑技术的发展历程及其在疾病研究、基因校正和表型修正中的应用，同时探讨了该技术在效率和特异性方面存在的问题和可能的解决方案。 | CRISPR/Cas9系统从最初发现到成为一种有前景的基因编辑工具的快速演进。 | CRISPR/Cas9技术在Cas9活性、目标位点选择、短引导RNA设计、递送方法、脱靶效应和同源定向修复等方面的效率和特异性问题。 | 探讨CRISPR/Cas9基因编辑技术的应用及其存在的问题和解决方案。 | CRISPR/Cas9基因编辑技术的效率和特异性。 | 基因编辑 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | NA | NA |
| 2856 | 2024-08-07 |
Programmable control of bacterial gene expression with the combined CRISPR and antisense RNA system
2016-Mar-18, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkw056
PMID:26837577
|
研究论文 | 本文结合CRISPR系统和合成反义RNA（asRNA）在Escherichia coli菌株中以可编程方式抑制或解除抑制目标基因 | 首次展示了CRISPR系统抑制的基因可以通过表达asRNA来解除抑制，并且通过设计靶向不同区域sgRNA的asRNA以及改变sgRNA-asRNA复合物的杂交自由能，可以实现可调节的解除抑制水平（高达95%） | NA | 实现通过可预测地控制基因表达来实施多样化的细胞功能 | CRISPR系统和合成反义RNA在Escherichia coli中的应用 | 合成生物学 | NA | CRISPR系统，反义RNA | NA | RNA | NA |
| 2857 | 2024-08-07 |
Accelerating genome editing in CHO cells using CRISPR Cas9 and CRISPy, a web-based target finding tool
2014-Aug, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.25233
PMID:24827782
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研究论文 | 本文首次展示了CRISPR Cas9技术在CHO细胞中产生位点特异性基因破坏的有效性，并开发了一个名为CRISPy的生物信息学工具，用于快速识别CHO-K1基因组中的sgRNA靶序列。 | 首次在CHO细胞中验证了CRISPR Cas9技术的有效性，并开发了CRISPy工具，有助于加速CHO细胞的基因编辑和合成生物学研究。 | NA | 提高CHO细胞中复杂药物蛋白的生产质量和产量。 | CHO细胞中的COSMC和FUT8基因。 | 生物技术 | NA | CRISPR Cas9 | NA | 基因组数据 | 8个sgRNAs在CHO细胞中进行了测试。 |
| 2858 | 2024-08-07 |
Multiplex engineering of industrial yeast genomes using CRISPRm
2014, Methods in enzymology
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research paper | 本文介绍了一种高效、无标记、高通量、多重化的基因编辑平台，用于工业酵母菌株的基因组编辑 | 开发了一种基于质粒表达CRISPR/Cas9核酸酶和多个核酶保护的单引导RNA的多重CRISPR（CRISPRm）系统 | NA | 开发适用于工业酵母菌株的高效基因编辑工具 | 工业酵母菌株Saccharomyces cerevisiae | synthetic biology | NA | CRISPR/Cas9 | NA | DNA | NA |
| 2859 | 2024-08-07 |
Selective induction of programmed cell death using synthetic biology tools
2024-03-15, Seminars in cell & developmental biology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.semcdb.2023.07.012
PMID:37598045
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研究论文 | 本文讨论了利用合成生物学工具选择性诱导程序性细胞死亡的最新进展 | 开发了基于合成生物学的工具，允许使用化学遗传学或光遗传学方法靶向诱导程序性细胞死亡 | 由于程序性细胞死亡途径的互连性和多效性效应，单独研究这些途径具有挑战性 | 探讨合成生物学工具在细胞和动物中研究程序性细胞死亡的应用 | 程序性细胞死亡的不同形式及其诱导和执行的细胞信号传导途径 | 合成生物学 | NA | 化学遗传学，光遗传学 | NA | NA | NA |
| 2860 | 2024-08-07 |
The Calvin Benson cycle in bacteria: New insights from systems biology
2024-03-01, Seminars in cell & developmental biology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.semcdb.2023.03.007
PMID:37002131
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综述 | 本文综述了光养和化能自养细菌中Calvin Benson循环的调控机制及其在生物技术中的应用 | 强调了光养和化能自养模型之间的差异，并探讨了通过蛋白质工程和合成生物学手段对Calvin Benson循环酶进行调控以增强CO2固定的可能性 | NA | 旨在深入理解细菌中Calvin Benson循环的调控机制，并探索其在生物技术中的应用潜力 | 光养和化能自养细菌中的Calvin Benson循环 | 系统生物学 | NA | 系统生物学研究方法 | NA | NA | NA |