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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2026-07-31 |
Fast, Streamlined In Situ Genotyping of Bacterial Strains for Single-Cell and Subcellular Dynamics Profiling
2026-Jul-27, Chemical & biomedical imaging
DOI:10.1021/cbmi.5c00220
PMID:42529381
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研究论文 | 开发了一种快速、精简的原位基因分型方法,用于细菌菌株的单细胞和亚细胞动力学分析 | 通过表面修饰策略抑制微流控芯片中荧光探针的非特异性聚集,并结合条形码化拷贝数可调质粒,解耦活细胞成像与事后基因分型的冲突,实现了高通量、低扰动的细菌动态表型筛选 | 未明确提及,但从上下文推断可能涉及方法对特定细菌菌株的普适性或长期成像的稳定性挑战 | 克服现有技术在时间分辨率、单细胞信息与实验通量之间的权衡,实现大规模单细胞和亚细胞动力学表型筛选 | 细菌菌株(文库)中的单细胞动态表型及其对应基因型 | 机器学习和合成生物学 | NA | 活细胞延时成像、序贯荧光原位杂交、微流控芯片、基因分型 | NA | 显微图像 | NA | NA | 细菌 | 条形码化拷贝数可调质粒(用于基因分型标签) | 基础生物学, 合成生物学 |
| 282 | 2026-07-31 |
[Evaluation of the skin barrier repair function and anti-inflammatory activity of recombinant mussel mucin Mfp151]
2026-Jul-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250750
PMID:42522623
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研究论文 | 利用合成生物学技术高效生产重组贻贝粘蛋白Mfp151,并评估其抗炎和皮肤屏障修复功能 | 首次通过合成生物学方法高效获取重组贻贝粘蛋白Mfp151,并系统验证其在体外和体内的抗炎、抗氧化及皮肤修复活性 | 未提及重组蛋白的长期安全性评估及大规模生产工艺优化 | 评估重组贻贝粘蛋白Mfp151的皮肤屏障修复功能和抗炎活性 | 重组贻贝粘蛋白Mfp151 | 合成生物学 | 皮肤老化、炎症 | 合成生物学、CCK-8检测、qPCR、跨膜电阻测量、划痕实验、ELISA、自由基清除实验 | NA | 实验数据 | 体外模型:人永生化角质形成细胞(HaCaT)、人包皮成纤维细胞(HFF-1)、人单核细胞白血病细胞(THP-1);体内模型:斑马鱼晒伤模型 | NA | NA | NA | 医学、化妆品 |
| 283 | 2026-07-31 |
A risk-based framework to guide oversight of nucleic acid constructs
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1870125
PMID:42528926
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评论文章 | 提出一个基于风险的框架,以指导对核酸构建体的监督,旨在根据生物安全相关性对合成核酸产品进行分类 | 构建了一个三级分类框架,将定制与非定制产品区分,并根据长度和来源划分为高、中、低风险类别,为比例性筛查提供指导 | 未明确覆盖所有材料,如非定制仓库中的长病毒序列,需要进一步调查和政策发展 | 基于风险评估制定合成核酸产品的分类框架,优化生物安全监督 | 合成核酸产品,包括DNA和RNA序列、寡核苷酸及非DNA/RNA核酸 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物安全 |
| 284 | 2026-07-31 |
Microbial remediation of recalcitrant pollutants in soil and geo-environmental engineering systems
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1904267
PMID:42529377
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综述 | 综述微生物修复土壤中难降解污染物的过程及其在地环境工程系统中的应用 | 综合讨论了难降解污染物类型、土壤微生物群落及关键微生物过程,并批判性地评估了地环境工程应用,如生物刺激、生物强化、根际修复、真菌修复、微生物诱导碳酸盐沉淀和渗透反应性生物屏障,同时指出了合成生物学、工程微生物菌群、纳米生物修复和人工智能等新兴创新 | 未明确提及综述的具体局限性 | 总结微生物修复难降解污染物的原理、过程及地环境工程应用,并展望未来研究方向 | 土壤中难降解污染物(如多环芳烃、石油烃、氯化化合物、农药、药物、全氟和多氟烷基物质及重金属)及微生物群落 | 机器学习和数字病理 | NA | 微生物降解、生物吸附、生物累积、生物转化、生物矿化、共代谢、生物膜介导过程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 细菌、真菌、放线菌、微生物菌群 | 生物修复途径(如降解、转化、固定化、解毒) | 环境 |
| 285 | 2026-07-30 |
Learning from nature's plant engineers: Hijacking metabolism and development beyond genetics
2026-Aug, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2026.102905
PMID:42250525
|
综述 | 本文探讨了除基因工程外,利用自然界中细菌、真菌和昆虫等生物劫持植物代谢和发育的机制,为合成生物学提供新思路 | 提出超越传统基因工程视角,从物种间相互作用中学习植物代谢重编程的新策略 | NA | 研究自然界生物劫持植物代谢的机制,扩展合成生物学的概念边界 | 植物代谢网络及其与细菌、真菌、昆虫的相互作用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 植物 | NA | 农业, 工业生物技术, 材料 |
| 286 | 2026-07-30 |
Living sensors: Engineering plants to sense and report on their environments
2026-Aug, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2026.102923
PMID:42391913
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综述 | 综述了利用合成生物学改造植物作为活体传感器,以感知和报告环境胁迫的研究进展 | 总结了三类主要策略:利用天然启动子系统、工程化蛋白基生物传感器以及构建植物-微生物跨界信号网络,并结合光学报告系统实现远程检测 | 未明确讨论现有传感器植物在田间部署中的稳定性、可扩展性及环境安全评估等具体限制 | 设计可部署于田间的工程植物传感器,用于实时环境监测和土地管理 | 工程改造的传感器植物(包括植感器或哨兵植物) | 合成生物学 | NA | 合成生物学, 基因工程 | NA | 光学信号(荧光、生物发光、色素信号等) | NA | NA | 植物 | 感知-响应模块(包括天然启动子系统、蛋白基生物传感器、植物-微生物跨界信号网络) | 环境监测, 农业 |
| 287 | 2026-07-30 |
Next-Generation Food Enzymology: From Metagenomic Discovery to AI-Driven Biocatalyst Design
2026-Jul-29, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.6c04349
PMID:42461222
|
评论 | 讨论宏基因组学和人工智能如何融合以推动下一代食品酶学的创新,实现从经验性酶发现到预测性生物催化剂设计的转变 | 将宏基因组学与AI驱动的蛋白质设计相结合,实现从传统经验性酶发现到预测性精准生物催化剂设计的范式转变 | NA | 探讨宏基因组学、人工智能和合成生物学在食品酶学中的应用,推动下一代食品加工中的定制化生物催化剂开发 | 食品加工中的酶和生物催化剂 | 机器学习 | NA | 宏基因组学, 蛋白质结构预测, 蛋白质设计 | NA | 基因组数据 | NA | 宏基因组学, 合成生物学 | NA | NA | 食品 |
| 288 | 2026-07-30 |
Silkworm synthetic biology: Toolkit development, chassis engineering, and biomanufacturing applications
2026-Jul-29, Insect science
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/1744-7917.70331
PMID:42522963
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综述 | 本文综述了家蚕合成生物学在底盘特征、工程工具包、代表性应用和未来前景方面的最新进展 | 系统总结了家蚕作为昆虫合成生物学底盘的潜力,涵盖了从工具开发到生物制造应用的完整流程,并提出了利用泛基因组学、多组学和人工智能辅助设计的未来方向 | 跨品系适应性有限、调控元件标准化不完整、整合与表达行为不确定性以及生物安全问题 | 介绍家蚕合成生物学的进展并讨论其在基础研究和生物技术中的应用前景 | 家蚕(Bombyx mori)及其丝腺 | 合成生物学 | NA | 稳定转基因、定点整合、可编程基因组编辑、时空基因调控、重组酶系统、基因沉默、启动子和增强子捕获 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, 重组酶系统 | 家蚕(Bombyx mori) | 组织特异性表达系统、诱导表达系统、重组酶系统、基因沉默系统 | 医学、农业、工业生物技术 |
| 289 | 2026-07-30 |
Adaptive Responses of Tropical Crops: A Multi-Scale Omics Integrated Perspective
2026-Jul-27, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.76735
PMID:42505031
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综述 | 本文从多组学整合视角综述了热带作物应对极端和多变环境的适应策略 | 提出通过多组学解析协同胁迫响应机制、利用野生种质和分子设计育种加速抗逆品种开发、基于生态位框架优化热带农林复合系统,以及将热带适应机制通过合成生物学和基因编辑应用于其他作物 | 未具体讨论各作物适应机制的细节数据支持及现有研究的技术局限性 | 探索热带作物适应性策略并为气候适应性可持续农业提供理论和实践方案 | 甘蔗、香蕉、木薯、橡胶、油棕等热带作物 | 数字病理学 | 不适用 | 多组学、分子设计育种、合成生物学、基因编辑 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | CRISPR-Cas9 | 热带作物(如甘蔗、香蕉、木薯等) | 不适用 | 农业 |
| 290 | 2026-07-30 |
Engineering therapeutic super-competitor cells for educative cancer treatment and ecological replacement
2026-Jul-27, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218765
PMID:42508749
|
综述 | 提出治疗性超级竞争细胞(TSCs)作为一种可编程的、进化感知的肿瘤教育治疗框架,通过生态竞争而非直接杀伤来控制肿瘤 | 将主动杀伤转变为可控生态竞争,整合癌症生态学、发育细胞竞争和合成生物学,提供进化感知的肿瘤治疗新范式 | 该框架仍处于假设阶段,尚未建立临床平台,现有研究多为理论性,缺乏实验验证 | 探索基于生态竞争的治疗性超级竞争细胞用于肿瘤教育治疗和生态替代 | 治疗性超级竞争细胞(TSCs)及其在肿瘤微环境中的生态互动 | 合成生物学, 癌症生态学 | 肿瘤 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | NA | 生态竞争回路、代谢限制回路、免疫重塑回路 | 医学 |
| 291 | 2026-07-30 |
Converting Food Waste into Value-Added Products: A Review on Current Technologies, Challenges, and Future Perspectives
2026-Jul-22, Foods (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/foods15142577
PMID:42511323
|
review | 综述了将食物废弃物转化为增值产品的当前技术、挑战与未来展望 | 综合评述了绿色提取技术、生物化学、热化学、酶和微生物方法,并探讨了生物精炼、人工智能、数字生物精炼、合成生物学和碳中和生产系统等新兴进展 | 原料异质性、工艺可扩展性、监管框架、经济可行性和可持续性评估等关键挑战 | 批判性分析食物废弃物转化为增值产品的策略,支持向弹性循环生物经济系统转型 | 主要农业食品副产品,如果渣、蔬菜残渣、油籽粕、乳制品副产品和农业工业废物 | machine learning | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | food, environment, industrial biotechnology |
| 292 | 2026-07-30 |
Microbial Lignin Valorization to Protocatechuic Acid and Catechol: Biofunneling Pathways and Metabolic Engineering Strategies
2026-Jul-03, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom16070979
PMID:42509773
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综述 | 综述微生物木质素转化为原儿茶酸和儿茶酚的途径及代谢工程策略 | 系统总结微生物将木质素衍生物转化为原儿茶酸和儿茶酚的生物漏斗途径,并强调原儿茶酸脱羧酶作为关键酶桥的作用 | 许多微生物生产策略仅使用纯化的木质素衍生模型化合物,而非真实木质素原料,且面临木质素顽固性、解聚产物异质性、中间体毒性和酶效率有限等挑战 | 推动木质素生物转化为原儿茶酸和儿茶酚,以发展可持续的生物精炼和循环生物经济 | 微生物将木质素衍生芳香化合物转化为原儿茶酸和儿茶酚的途径及工程策略 | 合成生物学 | NA | 木质素解聚技术(热化学和生物方法)、代谢工程(基因删除、通路重连、转运蛋白工程、CRISPR调控) | NA | NA | NA | CRISPR | 微生物(未特指) | 生物漏斗途径(如O-去甲基化、羟基化、脱羧酶转化) | 工业生物技术、环境 |
| 293 | 2026-07-30 |
Engineering an Optogenetic pH-Modulator in Bacteria
2026-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202524319
PMID:42095488
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研究论文 | 在细菌中工程化光遗传pH调节系统,实现胞外pH的可逆调控 | 首次将光遗传学与基因工程结合,在微生物中构建可动态调控胞外pH的合成系统,并实现长达14天的持续循环 | 系统对培养基成分、补料速率和光照模式等环境因素高度依赖,离实际应用仍有差距 | 构建无需人工干预即可在高低pH状态间切换的微生物系统 | 改造的细菌细胞 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 光诱导启动子控制重组脲酶表达,结合降解标签和环境优化 | 工业生物技术 |
| 294 | 2026-07-30 |
Synthetic developmental engineering of human liver organogenesis
2026-07-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.205040
PMID:42440359
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综述 | 讨论人类胚胎肝脏发育和当前用于体外生成肝脏类器官的模型,并探讨如何整合合成生物学和计算分析来增强类器官 | 提出将合成生物学和计算分析整合以增强肝脏类器官的新方法,包括促进血管化、建立分区、优化命运规范和响应外部信号 | 面临可重复性和实现成年水平成熟等挑战 | 推动下一代多细胞人类干细胞衍生系统的开发 | 人类肝脏发育过程和体外肝脏类器官模型 | 数字病理学 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学工具(具体未指定) | 人类干细胞 | 合成发育工程策略包括血管化、分区、命运规范和外部信号响应 | 医学 |
| 295 | 2026-07-30 |
Special Milk and Synthetic Biology: A Dual-Perspective Review of Ingredient Substitutions in Breast-Milk-Simulated Infant Formula
2026-Jul, Comprehensive reviews in food science and food safety
IF:12.0Q1
DOI:10.1111/1541-4337.70572
PMID:42504013
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review | 本文综述了两种补充性策略——特殊乳利用和合成生物学驱动的精准制造——在开发模拟母乳的婴儿配方粉成分中的应用 | 首次提出特殊乳基质与精准发酵生物活性物融合的策略,将婴儿配方粉从成分模仿转向结构-功能仿生 | 大多数研究集中于单一成分而非整合配方系统,且缺乏稳健的临床验证 | 探索替代牛奶的婴儿配方粉中成分替代策略,以更接近模拟母乳的复杂功能 | 特殊乳(如羊奶、骆驼奶、驴奶、水牛奶、牦牛奶)及合成生物学平台生产的生物活性成分(如2'-岩藻糖基乳糖和重组乳铁蛋白) | NA | NA | 多组学整合、精准发酵 | NA | 综述型文章 | NA | NA | NA | NA | 食品、医学 |
| 296 | 2026-07-30 |
Artificial Intelligence in Bacteriophage Science: A Comprehensive Narrative Review of Applications, Challenges, and Translational Opportunities
2026-Jun-25, Antibiotics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antibiotics15070635
PMID:42505598
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综述 | 系统回顾人工智能在噬菌体科学中的应用,涵盖发现、工程、制造和治疗应用全流程 | 首次全面整合AI在噬菌体全流程中的潜力,包括个性化选择、鸡尾酒优化和可扩展制造 | 数据碎片化、分类偏倚、外部验证有限、可解释性不足、隐私和生物安全监管挑战 | 评估AI加速噬菌体疗法从个体化干预向可扩展抗菌平台转化的可能性 | 噬菌体发现、基因组注释、宿主互作预测、治疗匹配、制造优化等环节 | 机器学习 | 耐药菌感染、生物膜相关感染 | NA | NA | 元基因组数据、基因组注释数据、生物过程数据 | NA | CRISPR | 噬菌体 | 受体结合蛋白重设计、CRISPR工程、生成式基因组设计、生物安全筛查 | 医学、工业生物技术 |
| 297 | 2026-07-30 |
Bioconjugation Strategies for Revealing the Roles of Glycerophospholipids in Cells
2026-Jun-15, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.70428
PMID:42287618
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综述 | 总结用于揭示甘油磷脂在细胞中作用的生物共轭策略 | 融合合成生物学、活细胞成像和生物正交反应等多学科方法,设计精确脂质类似物和探针 | NA | 探索甘油磷脂的代谢、运输和相互作用,推动功能研究和治疗创新 | 甘油磷脂及其在细胞中的生物学功能 | 合成生物学 | NA | 化学全合成、生物正交化学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 298 | 2026-07-30 |
Adaptive evolution of oxidosqualene cyclases has driven diversification of triterpene scaffolds for limonoid biosynthesis in Melia toosendan
2026-Jun-15, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101965
PMID:42289993
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研究论文 | 通过染色体级基因组组装和功能分析,揭示了楝树中氧化鲨烯环化酶的适应性进化驱动柠檬苦素生物合成中三萜骨架多样化的分子机制 | 发现了四个关键氨基酸替换(W258L、T413S、M730Y和L735H)就能将底物特异性从tirucalla-7,24-dien-3β-ol转变为eupha-7,24-dien-3β-ol,揭示了一条潜在替代柠檬苦素生物合成途径 | 对OSC基因进化与正选择信号的相关性分析主要基于序列和系统发育,功能验证主要在烟草中瞬时表达,缺乏在天然植物中的完整体内验证 | 理解植物中三萜骨架多样化的分子机制,并为通过合成生物学工程植物源杀虫剂奠定基础 | 楝树(Melia toosendan)中的氧化鲨烯环化酶(OSCs)及其催化产生的三萜骨架 | 植物生物学 | NA | 染色体级基因组组装、瞬时表达、系统发育分析、祖先序列重建 | NA | 基因组序列、表达数据 | 1个楝树基因组,14个OSC基因在烟草中瞬时表达 | NA | 本氏烟草(Nicotiana benthamiana) | NA | 农业, 合成生物学 |
| 299 | 2026-07-30 |
Recognition of non-standard base pairs by triplex-forming oligonucleotides containing an expanded genetic alphabet
2026-Jun-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-74375-4
PMID:42286010
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研究论文 | 利用扩展遗传字母表的三链形成寡核苷酸识别非标准碱基对,实现中性pH下对双链DNA的高亲和力靶向 | 首次使用人工扩展遗传信息系统(AEGIS)的核碱基扩展三链体识别空间,鉴定12种可互换组合的三元组,在中性pH下以纳摩尔亲和力靶向含有标准、损伤或合成碱基对的双链DNA | 未提及具体局限性 | 扩展三链形成寡核苷酸(TFO)的识别空间,实现对非标准碱基对的序列特异性识别 | 双链DNA中的标准、损伤和合成碱基对 | 分子医学 | NA | 三链形成寡核苷酸(TFO)、Hoogsteen碱基配对、酶促合成 | NA | NA | 120种碱基三元组组合 | NA | NA | NA | 医学、合成生物学、核酸纳米技术 |
| 300 | 2026-07-30 |
Bacterial 3D genome architecture: organization, regulation, and synthetic biology applications
2026-May-23, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04117-8
PMID:42177580
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综述 | 本文综述了细菌三维基因组的组织结构、调控机制及其在合成生物学中的应用前景 | 整合了染色体构象捕获和成像研究的见解,强调基因组结构对环境信号的动态响应,并探讨了细菌三维基因组学在合成生物学中的潜在应用 | 细菌基因组架构及其调控的详细原理仍不完全清楚 | 理解细菌基因组稳态和适应性的框架,为工程微生物系统和新型疗法提供机会 | 细菌三维基因组结构及其调控因子 | 基因组学 | NA | 染色体构象捕获,成像 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 合成生物学,医学 |