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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2026-05-29 |
High-Throughput Stationary 13C-Based Metabolic Flux Analysis of Pichia pastoris Strains
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4779-0_9
PMID:41028460
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研究论文 | 描述了一种利用高通量培养平台对毕赤酵母菌株进行静态碳代谢流分析的方法 | 提出高通量平台用于大规模工程菌株的代谢流特征分析,加速菌株工程循环 | NA | 实现高通量的13C代谢流分析,以表征工程菌株的细胞内代谢反应速率 | 毕赤酵母(Komagataella phaffii)菌株 | 代谢工程 | NA | 13C代谢流分析 | NA | 代谢通量数据 | 一组工程菌株 | NA | 毕赤酵母(Komagataella phaffii) | NA | 工业生物技术 |
| 282 | 2026-05-29 |
From feeding cell to fruiting body: Multidrug transport in the life cycle of Dictyostelium discoideum
2026, Advances in microbial physiology
DOI:10.1016/bs.ampbs.2026.02.002
PMID:42203389
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综述 | 本文综述了盘基网柄菌生命周期中多药转运蛋白的功能与进化保守性 | 首次系统整合盘基网柄菌中多药耐药蛋白的遗传组成,结合RNAseq与转录组共表达数据,揭示其在趋化、合作和细胞分化中的未探索角色 | 多药转运蛋白在该生物中的实验表征研究稀疏,功能验证数据有限 | 探讨多药转运蛋白在盘基网柄菌生命周期中的进化保守角色及在合成生物学、药物研究和微生物生理学中的应用潜力 | 盘基网柄菌的多药转运蛋白家族(ABC、MFS、MATE、SMR/DMT、RND、AbgT、PACE) | 微生物学 | NA | RNA-seq、转录组学共表达分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 盘基网柄菌 | NA | 医学、合成生物学、药学 |
| 283 | 2026-05-29 |
Enhancing circuit stability under growth feedback with supplementary repressive regulation
2024-02-09, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad1233
PMID:38164993
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研究论文 | 提出在生长反馈下通过添加抑制性调控节点增强双稳态电路稳定性的策略 | 首次提出通过引入一个抑制性调控边缘来使双稳态电路对生长反馈去敏感化的简单控制策略 | 仅进行了仿真和体外实验,缺乏在复杂生物系统中的体内验证 | 研究如何通过额外抑制性调控增强基因电路在生长反馈下的鲁棒性 | 受生长反馈影响的双稳态基因电路 | 合成生物学 | NA | NA | 双稳态电路模型 | NA | NA | NA | NA | 双稳态电路(含抑制性调控边缘) | 合成生物学 |
| 284 | 2026-05-29 |
Recent advances in synthetic biology of cyanobacteria for improved chemicals production
2020-12, Bioengineered
IF:4.2Q2
DOI:10.1080/21655979.2020.1837458
PMID:33124500
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综述 | 总结蓝藻合成生物学在提高化学品生产方面最新进展 | 综述了蓝藻合成生物学工具箱的最新应用和进展 | 由于生物产品产量低,大规模应用仍是技术挑战 | 推动蓝藻生物技术中新型工具的应用和未来展望 | 蓝藻 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 蓝藻 | NA | 工业生物技术 |
| 285 | 2026-05-28 |
Developing artificial cytoskeletons using RNA origami-based nanotubes
2026-Jun, Progress in biophysics and molecular biology
DOI:10.1016/j.pbiomolbio.2026.02.006
PMID:41765186
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综述 | 探讨利用基于RNA折纸的纳米管构建人工细胞骨架的新兴概念 | 系统阐述了RNA相比DNA在构建细胞骨架模拟物中的独特优势,包括共转录折叠能力、复杂三级相互作用及与细胞机器对接的功能 | 体内稳定性和高效递送等重大挑战尚未解决 | 为RNA纳米技术与合成细胞工程的交叉领域提供基础性理解 | RNA折纸纳米管 | 合成生物学 | NA | RNA折纸 | NA | NA | NA | RNA折纸 | NA | 人工细胞骨架(微管和肌动蛋白丝模拟结构) | 纳米技术、合成生物学、医学 |
| 286 | 2026-05-28 |
AI and mechanistic modeling for characterizing biosynthetic pathways of natural products
2026-May-27, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00059a
PMID:41200906
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综述 | 探讨人工智能和机械建模在表征天然产物生物合成途径中的应用 | 全面分析2020至2025年间人工智能与机械建模在预测生物合成途径和酶-底物相互作用中的最新进展,并讨论整合这些策略以加速天然产物发现、工程和应用的未来方向 | 该领域仍面临复杂基因型-表型关系带来的挑战,且整合不同计算方法存在技术障碍 | 揭示天然产物生物合成途径以加速药物发现、生物技术和合成生物学应用 | 天然产物及其生物合成途径相关数据库、AI方法及机械模拟 | 机器学 | NA | AI, 机械建模 | NA | 文本(数据库) | NA | NA | NA | NA | 药物发现, 生物技术, 合成生物学 |
| 287 | 2026-05-28 |
Charting the path for L-tyrosine derivatives: from engineering strategies to microbial cell factories
2026-May-27, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00091b
PMID:41873744
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综述 | 系统总结了利用微生物细胞工厂生产L-酪氨酸及其衍生物的工程策略 | 聚焦酪醇、对香豆酸和左旋多巴三大关键节点,综述近五年在酶、代谢和细胞水平上的前沿工程策略 | 未深入探讨工业放大中的工艺瓶颈和成本问题 | 为加速L-酪氨酸衍生物的绿色生物制造提供战略路线图 | L-酪氨酸及其衍生物(酪醇、对香豆酸、左旋多巴) | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌, 酵母 | 代谢通路 | 食品, 医药, 化工 |
| 288 | 2026-05-28 |
Bioethics-in-Science : An Invitation
2026-May-27, Journal of bioethical inquiry
IF:1.8Q3
DOI:10.1007/s11673-025-10533-5
PMID:42201630
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研究论文 | 提出“科学中的生物伦理学”概念,探讨将生物伦理探究直接融入科学实践的方法论途径 | 重新定义伦理与科学关系,将科学实践视为内在地承载价值,并开发具体方法(如伦理笔记本、协作研讨会、概念映射)实现持续伦理反思而非外部评估 | 跨学科边界挑战与操作实践中的困难分析 | 为生物伦理探究提供超越科学边缘位置、积极参与知识生产规范维度的新路径 | 合成生物学、神经多样性研究、蛋白质组学案例 | 生物伦理学 | NA | NA | NA | 案例研究 | 三个案例(合成生物学、神经多样性、蛋白质组学) | NA | NA | NA | NA |
| 289 | 2026-05-28 |
From gene discovery to synthetic biology: recent advances in the biosynthesis of oleanane-type pentacyclic triterpenoids
2026-May-26, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d6np00013d
PMID:42187150
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综述 | 综述了齐墩果烷型五环三萜生物合成的最新进展,涵盖关键酶、转录调控、合成生物学及人工智能应用 | 系统整合组学技术、合成生物学工具与人工智能在OPT生物合成中的应用前景,强调从经验试错向预测优化的范式转变 | 静态综述,未提供实验验证数据或定量比较不同策略的优劣 | 总结OPT生物合成基因发现、调控机制及合成生物学策略的研究进展,实现可持续高效生产 | 齐墩果烷型五环三萜类化合物及其生物合成途径相关基因和调控元件 | 自然语言处理, 机器学习 | NA | 组学技术, 基因组编辑, 异源表达 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 微生物, 植物 | 合成生物电路、代谢途径工程 | 医药, 工业生物技术 |
| 290 | 2026-05-28 |
Extrachromosomally co-encoded toxin-immunity pairs in yeast and their application potential
2026-May-26, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-026-13876-0
PMID:42189293
|
综述 | 本文综述了酵母中由染色体外元件共编码的毒素-免疫因子对的研究进展及其在合成生物学和生物技术中的应用潜力 | 系统总结了酵母毒素-免疫因子对的分子机制、克隆和研究方法,并类比细菌毒素-抗毒素系统,提出其在合成生物学中的开发前景 | 目前对多数免疫因子的保护机制了解尚少,限制了实际应用 | 推动对酵母毒素-免疫因子对的分子理解,并促进其在合成生物学和生物技术中的应用 | 酵母中的染色体外毒素-免疫因子对(包括dsRNA真菌病毒卫星和DNA病毒样元件) | 合成生物学 | NA | 基因克隆、分子生物学研究、工程改造 | NA | 文本 | NA | Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 酵母 | 毒素-免疫因子对(如毒素分泌系统、自我保护回路) | 食品防腐剂, 医药, 生物技术, 合成生物学 |
| 291 | 2026-05-28 |
From design-build-test-learn cycles to AI-driven digital twins for bioprocess scale-up in the Genesis Mission era
2026-May-26, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103516
PMID:42190350
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评论文章 | 探讨在Genesis Mission时代,从设计-构建-测试-学习循环转向AI驱动的数字孪生技术以加速生物制造工艺放大的前景与挑战 | 提出将合成生物学与AI生态系统整合,并开发共享的AI就绪生物系统数据库和混合数字细胞模型来克服工业放大中的不确定性 | 研究仍处于概念阶段,缺乏具体的实验验证和实际应用案例 | 促进生物制造工艺放大的多尺度优化和数字孪生发展 | 微生物菌株在工业生物反应器中的性能 | 机器学习 | NA | 合成生物学, 机器学习, 大语言模型 | 迁移学习, 强化学习, 贝叶斯优化 | 文献数据, 实时数据 | NA | NA | 微生物 | 混合数字细胞模型 | 工业生物技术 |
| 292 | 2026-05-28 |
Advances in the heterologous biosynthesis of QS saponins: a review
2026-May-26, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-026-03034-6
PMID:42192394
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综述 | 系统综述QS皂苷的异源生物合成进展,重点探讨利用微生物细胞工厂生产QS-21等化合物的合成生物学策略 | 全面梳理了最具有前景的QS皂苷QS-21的作用机制和应用,并深入探索了微生物合成QS皂苷的合成生物学策略,同时针对当前研究挑战提出了靶向应对策略 | 未具体说明,但综述性质决定了其受限于已有文献的覆盖范围和数据可用性 | 为促进QS皂苷的医学应用和可持续生产奠定理论基础 | QS皂苷(特别是QS-21)及其生物合成途径和异源生产策略 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术、异源生物合成 | NA | NA | NA | NA | 微生物细胞工厂(具体种类未指明) | QS皂苷的生物合成途径(包括QS-21的代谢通路设计) | 医学、疫苗学、食品、化妆品、洗涤剂 |
| 293 | 2026-05-28 |
Synthetic biology-driven bioinspired delivery systems for RNA therapeutics in neural repair
2026-May-14, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-25-01801
PMID:42199149
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综述 | 综述基于合成生物学的仿生递送系统在RNA神经修复治疗中的应用 | 提出了将RNA递送转化为可编程生物机器的系统工程框架,融入设计-构建-测试-学习循环和人工智能辅助工具 | 未详细说明具体实验验证结果和定量比较分析 | 探讨合成生物学在神经修复中RNA治疗递送系统的前沿应用与挑战 | 基于合成生物学的仿生递送系统、RNA疗法、神经修复 | 机器学习 | 神经系统疾病 | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | 生物电路、递送系统、可编程生物机器 | 医学 |
| 294 | 2026-05-28 |
Streptomyces Autoregulator Biosensors from Natural Product Cluster-Situated Regulators
2026-May-12, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acschembio.6c00061
PMID:42117380
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研究论文 | 开发了基于簇定位调节因子的八种链霉菌自诱导物生物传感器及其合成路径 | 首次系统开发了八种基于CSR的AR生物传感器,并研究了非同源CSR与AR间的串扰以及CSR调节替代启动子的能力,创建了12种正交信号系统 | 仅涉及链霉菌属,未涵盖其他土壤细菌;生物传感器性能评估主要限于实验室培养条件 | 开发用于天然产物调控中群体感应小分子检测的基于自诱导物的生物传感器平台 | 链霉菌中的簇定位调节因子及相关自诱导物配体 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 小分子配体、基因表达数据 | 8种生物传感器及其对应的自诱导物配体 | NA | 链霉菌,大肠杆菌 | 自诱导物生物传感器、基于群体感应的遗传回路 | 工业生物技术,医学 |
| 295 | 2026-05-28 |
Engineering the Liquid-to-Solid Transition of Biomolecular Condensates: Molecular Mechanisms, Control Strategies, and Applications
2026-May, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.73582
PMID:42070290
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综述 | 系统综述了生物分子凝聚体液-固转变的分子机制、工程调控策略及其在合成生物学中的应用 | 首次将液-固转变作为设计原则整合到系统化学和合成生物学中 | 当前对液-固转变的时空控制仍面临挑战,需进一步探索其在实际生物系统中的可靠性 | 阐明液-固转变的分子语法及工程策略,推动其在合成生物学中的应用 | 生物分子凝聚体的液-固转变过程 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 液-固转变调控回路 | 医学,系统化学,合成生物学 |
| 296 | 2026-05-28 |
Viruses that heal: harnessing bacteriophages in the era of antibiotic resistance
2026-Apr-30, Voprosy virusologii
DOI:10.36233/0507-4088-366
PMID:42187217
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综述 | 本文综述了噬菌体在抗生素耐药时代作为抗菌替代疗法的生物学基础、治疗应用及挑战 | 整合了噬菌体生物学、基因工程进展(如CRISPR-Cas系统、重组工程和合成基因组重启)及多领域应用(临床治疗、食品安全、环境消毒和生物膜控制),并系统讨论了监管框架和宿主抗性动态等关键问题 | 未提供具体实验数据或案例研究的量化结果,主要基于现有文献的理论总结 | 评估噬菌体疗法作为抗生素替代方案的潜力和可持续性,应对全球抗菌耐药性危机 | 噬菌体及其在细菌感染治疗、生物控制中的应用 | 机器学习 | NA | CRISPR-Cas系统、噬菌体重组工程、合成基因组重启 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 细菌 | NA | 医学、农业、环境、工业生物技术 |
| 297 | 2026-05-28 |
Assetizing Diversity: Microbial Culture Collections in an Age of Biotechnology, Biodiversity, and Speculative Value Generation (1972-2022)
2026-Mar, Journal of the history of biology
IF:0.7Q2
DOI:10.1007/s10739-026-09853-y
PMID:42118395
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综述 | 追溯1972至2022年微生物资源保藏中心的历史,探讨微生物多样性保护与生物技术价值化的演变 | 将微生物价值资产化进程与全球微生物公地圈占联系起来,分析保藏中心在生物技术产业全球化中的双重角色 | 未解决全球异地保护基础设施分布不均及微生物价值生成的不对称问题,遗漏2010年名古屋议定书后的实质性进展 | 揭示微生物资源从公共物品向资产化转变的过程及其对保护、商业和全球治理的影响 | 欧洲、美洲、亚洲的微生物培养物保藏中心及世界培养物保藏联合会 | 数字病理学 | NA | 测序技术、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 工业生物技术、农业、环境 |
| 298 | 2026-05-28 |
Engineering Spatial Control of Bacterial Organelles
2025-Sep-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.22.677801
PMID:41040230
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研究论文 | 本文展示了一个双蛋白系统McdAB可被重新编程以实现对细菌多种细胞器的空间控制 | 首次证明McdAB系统可以重新编程以控制所有已知类型的细菌细胞器(包括类囊体、包囊体、生物分子凝聚体和膜结合细胞器)的空间组织,为合成生物学建立了新的设计原理 | 未明确说明局限性 | 研究细菌细胞器的空间组织是否可以被工程化控制 | McdAB双蛋白系统和细菌细胞器(羧酶体、包囊体、生物分子凝聚体、膜结合细胞器) | 合成生物学 | NA | 异源表达、蛋白重新编程 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | McdAB系统用于细胞器空间定位调控 | 工业生物技术 |
| 299 | 2026-05-28 |
A quantitative autonomous bioluminescence reporter system with a wide dynamic range for Plant Synthetic Biology
2024-01, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.14146
PMID:37882352
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研究论文 | 提出了一种基于自发光真菌生物发光循环的定量报告系统,用于植物合成生物学中的基因表达测量 | 首次利用Neonothopanus nambi真菌全生物发光循环构建自维持报告系统,无需外源供应荧光素酶底物,并通过设置HispS基因作为转录入口点显著提高动态范围 | 未明确说明,但可能包括植物中自发光系统的长期稳定性和组织特异性表达等潜在问题 | 开发低成本、高通量的植物基因表达定量报告系统,以优化合成基因回路 | 本氏烟草(N. benthamiana)和拟南芥(推测) | 植物合成生物学 | NA | 自主生物发光报告系统 | NA | 发光和荧光数据 | 涉及多种合成基因回路,包括植物激素传感器和光遗传传感器等,具体样本数量未明确 | NA | 本氏烟草(N. benthamiana) | 自发光报告回路(NeoLuc/eGFP系统),包括激素传感器、光遗传传感器和化学/光双开关 | 农业、工业生物技术 |
| 300 | 2026-05-28 |
Precision engineering of biological function with large-scale measurements and machine learning
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0283548
PMID:36989327
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研究论文 | 结合大规模测量和机器学习,提出了两种精确设计遗传传感器的方法:计算机模拟选择和机器学习前向工程 | 首次将计算机模拟选择与机器学习相结合,实现遗传传感器剂量响应的定量精确工程,包括多目标优化和反向剂量响应工程 | NA | 开发定量精确工程生物功能的方法,特别是遗传传感器的编程响应 | 遗传传感器及其DNA序列 | 机器学习 | NA | 大规模基因型-表型数据集分析 | 机器学习模型 | 序列数据 | 大规模基因型-表型数据集 | NA | NA | 遗传传感器(剂量响应电路) | 工业生物技术 |