本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2026-04-02 |
RNP-Based Control Systems for Genetic Circuits in Synthetic Biology Beyond CRISPR
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2421-0_1
PMID:35666436
|
综述 | 本文综述了基于核糖核蛋白(RNP)的遗传电路控制系统在合成生物学中的应用,并提供了系统选择标准 | 系统性地回顾了CRISPR之外的工程化RNP控制系统,并提出了针对不同生物过程的优化选择框架 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据,且未来应用部分基于推测 | 评估和总结工程化RNP控制系统在合成生物学中的发展现状与应用潜力 | 核糖核蛋白(RNP)复合物及其工程化控制系统 | 合成生物学 | NA | 工程化RNP系统设计 | NA | NA | NA | CRISPR, 其他RNP工程工具 | 原核生物, 真核生物 | 遗传电路控制, 生物传感器, 逻辑门 | 工业生物技术, 医学, 环境, 农业 |
| 282 | 2026-04-01 |
A general strategy to enhance aptamer affinity by suppressing dissociation through symmetric assembly
2026-Mar-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag268
PMID:41873762
|
研究论文 | 本文提出了一种通过对称组装抑制解离来增强适体亲和力的通用策略 | 采用对称引导的组装方法,通过快速再结合实现动力学协同性,显著降低解离速率常数 | NA | 增强适体亲和力以克服快速靶标解离的限制 | 针对SARS-CoV-2刺突蛋白、VEGF165和心脏肌钙蛋白I的适体 | 合成生物学 | NA | 对称组装方法 | NA | NA | NA | NA | NA | 三价柔性组装体 | 诊断、治疗、合成生物学 |
| 283 | 2026-04-01 |
Aptamer- and Ribozyme-Engineered sgRNAs for Conditional Control of CRISPR/Cas9 Function
2026-Mar-09, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/FBL47300
PMID:41914300
|
综述 | 本文综述了通过将功能性核酸元件(如适配体、核酶和适配酶)整合到sgRNA特定结构区域中,开发条件响应性CRISPR/Cas9系统的设计策略与应用 | 通过工程化sgRNA实现CRISPR/Cas9系统的条件响应性控制,使其能响应小分子、蛋白质和内源性代谢物等多种分子信号 | 当前系统在特异性、效率和适用性方面仍面临挑战,需要进一步改进 | 开发条件响应性CRISPR/Cas9系统,用于合成生物学、疾病建模和治疗开发 | 工程化的单导RNA(sgRNA)和CRISPR/Cas9系统 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9系统,功能性核酸元件整合 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 原核细胞,真核细胞 | 条件响应性基因编辑、激活、抑制和成像系统 | 医学 |
| 284 | 2026-03-31 |
Plant oil body engineering: A roadmap from multiscale structures to next-generation food systems
2026-Mar-25, Food chemistry
IF:8.5Q1
DOI:10.1016/j.foodchem.2026.149010
PMID:41905230
|
综述 | 本文构建了一个全面的植物油体多尺度工程框架,旨在通过跨学科策略将其转化为可编程功能单元,以推动下一代智能食品系统的发展 | 提出了一个整合物理场、界面工程和合成生物学的多尺度工程框架,建立了清晰的“分子结构-界面性质-宏观功能”关系,用于理性设计植物油体 | 成功转化依赖于克服规模化挑战以及解决技术经济和监管障碍 | 通过系统工程方法将植物油体转化为可编程功能单元,以应用于下一代智能食品系统 | 植物油体 | NA | NA | 物理场、界面工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 食品 |
| 285 | 2026-03-31 |
Single Molecule Force Measurements Reveal Energy Stabilization of Theophylline Aptamer RNA Switch Required for Gene Control
2026-Mar-25, ACS physical chemistry Au
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsphyschemau.5c00109
PMID:41909145
|
研究论文 | 本研究利用光镊单分子力谱技术,测量了茶碱适配体RNA开关在有无配体存在时的折叠动力学,揭示了其通过能量稳定而非结构重塑实现基因调控的机制 | 首次通过单分子力测量揭示了茶碱适配体RNA开关的能量稳定机制(约2.1 kcal/mol),并支持构象选择模型,否定了配体结合引发大结构重排的假设 | 研究仅聚焦于茶碱适配体这一特定RNA开关,未验证其他RNA适配体是否遵循相同机制;单分子实验条件可能与体内生理环境存在差异 | 探究茶碱适配体RNA开关在合成基因网络中实现配体响应调控的热力学与动力学基础 | 茶碱适配体RNA分子及其与茶碱小分子配体的相互作用 | 合成生物学 | NA | 光镊单分子力谱 | NA | 单分子力学数据 | NA | NA | NA | 配体响应型RNA开关(用于合成基因网络调控) | 合成生物学、基因治疗 |
| 286 | 2026-03-31 |
Evolution and Impact of Imine Reductases (IREDs) Research: A Knowledge Mapping Approach
2026-Mar, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-025-01421-9
PMID:40172741
|
研究论文 | 本研究使用文献计量和知识图谱方法,探索了亚胺还原酶(IREDs)的研究格局和演变历程 | 首次通过文献计量分析提供了IRED研究的可视化表示,揭示了研究趋势和新兴主题 | 研究基于已发表的文献数据,可能未涵盖所有未发表或正在进行的研究,且分析范围限于2010年至2024年 | 探索IREDs的研究景观和演变,以提供对该领域的全面评估 | 亚胺还原酶(IREDs)及其在合成手性胺中的应用 | 合成生物学 | NA | 文献计量分析、知识图谱方法(如CiteSpace、VOSviewer、Pajek、Scimago Graphica) | NA | 文本数据(研究文章和综述) | 239篇研究文章和综述 | NA | NA | NA | 医药 |
| 287 | 2026-03-31 |
Minor groove tetrads: a potent and versatile capping interaction for i-motif structures
2026-Feb, Biophysical reviews
IF:4.9Q1
DOI:10.1007/s12551-026-01406-1
PMID:41909615
|
研究论文 | 本文探讨了DNA小沟四联体作为增强i-motif结构稳定性和多功能性的新型结构元件 | 揭示了小沟四联体能够作为封端平台,强化半质子化C:C⁺堆叠,使i-motif在中性pH下折叠,并展示了其可调拓扑结构和结构可塑性 | NA | 研究小沟四联体对i-motif DNA结构的稳定性和功能调控作用 | 含有小沟四联体的i-motif结构 | 结构生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物传感, 纳米技术, 合成生物学 |
| 288 | 2026-03-31 |
Recent Advances in Multiple Strategies for the Biosynthesis of Sesquiterpenols
2025-05-03, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15050664
PMID:40427558
|
综述 | 本文综述了利用微生物系统异源合成倍半萜醇的最新合成生物学策略与进展 | 系统总结了包括适应性倍半萜醇合酶筛选与表达、合成途径调控、细胞内区室化表达策略以及应对萜类化合物毒性的耐受性策略在内的多种创新方法 | NA | 推进倍半萜醇生物合成研究,以克服其工业化应用面临的产量低、成本高等挑战 | 倍半萜醇化合物及其微生物合成系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 微生物系统 | 倍半萜醇生物合成途径 | 制药, 食品, 化妆品 |
| 289 | 2026-03-31 |
Assembly of functional microbial ecosystems: from molecular circuits to communities
2024-11-23, FEMS microbiology reviews
IF:10.1Q1
DOI:10.1093/femsre/fuae026
PMID:39496507
|
综述 | 本文综述了从分子电路到群落的功能性微生物生态系统组装,包括交叉通讯和正交调控模块,并提出了一个全面的设计-构建-测试-学习框架 | 系统总结了基于不同调控电路协调微生物生态系统的策略,提出了一个更全面的微生物群落组装框架,整合了遗传电路、通讯工具和工程应用 | NA | 解密、模拟或重建微生物群落,以促进基于联盟的应用 | 微生物生态系统,包括微生物群落及其相互作用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 交叉通讯和正交调控模块,涉及代谢物、转录、翻译和翻译后水平 | 工业生物技术, 环境, 农业, 医学 |
| 290 | 2026-03-31 |
Engineered Platforms for Maturing Pluripotent Stem Cell-Derived Liver Cells for Disease Modeling
2023, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2023.01.013
PMID:36738860
|
综述 | 本文综述了用于促进多能干细胞来源肝细胞成熟以进行疾病建模的工程化平台的设计、特征及应用 | 系统总结了多种先进技术(如蛋白质微图案化、3D生物打印、微流控装置和合成生物学)在提升肝细胞样细胞成熟度方面的创新应用 | 未提供具体实验数据验证各平台效果,主要基于现有文献进行归纳分析 | 开发更成熟的人类肝细胞体外模型,用于疾病机制研究、药物开发和细胞治疗 | 人多能干细胞(包括诱导多能干细胞和胚胎干细胞)分化产生的肝细胞样细胞 | 合成生物学与组织工程 | 肝脏疾病(包括病毒性肝炎、脂肪肝、疟疾、单基因疾病和药物性肝损伤等) | 蛋白质微图案化、3D生物打印、微流控技术、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学工具(未具体说明) | 人类多能干细胞 | 通过遗传修饰加速和增强肝细胞样细胞成熟的合成生物学回路 | 医学(疾病建模、药物开发、细胞治疗) |
| 291 | 2026-03-30 |
Dual-promoter control of gene expression: from transcriptional fine-tuning to antibiotic resistance
2026-Mar-27, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102747
PMID:41903510
|
综述 | 本文综述了双启动子如何调控基因表达,从转录微调延伸到抗生素耐药性机制 | 系统总结了双启动子在微生物中的组合调控策略,并将其与合成生物学应用及抗生素耐药性预测联系起来 | NA | 探讨双启动子对基因表达的调控机制及其在抗生素耐药性和合成生物学中的应用 | 微生物中的启动子调控机制 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 双启动子调控电路 | 医学, 工业生物技术 |
| 292 | 2026-03-30 |
Molecular mechanisms of plant thermal response: from signal transduction and epigenetic regulation to signaling integration
2026-Mar-26, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2026.03.018
PMID:41903742
|
综述 | 本文综述了植物对热应激响应的分子机制,重点关注表观遗传调控与信号网络的整合 | 整合了表观遗传调控(如H2A.Z动态和组蛋白修饰重编程)与信号网络(光、昼夜节律和激素信号通路)在植物热适应中的作用,并强调了HSFA2介导的染色质重塑和siRNA依赖的跨代热记忆机制 | 关于温度感知、HSFA1s激活动力学和应激信号整合的基本问题仍待解决 | 解析植物热响应的分子机制,为气候智能型作物提供理论基础和分子育种策略 | 植物(特别是作物)的热应激响应机制 | 植物生物学 | NA | 多组学和合成生物学方法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 293 | 2026-03-30 |
A Rapid, High-Throughput Method for the Construction of Mutagenesis Libraries
2025-10-25, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15111511
PMID:41301429
|
研究论文 | 本文开发了一种基于芯片寡核苷酸合成的高通量、精确控制突变库构建方法,用于大规模功能筛选 | 利用芯片寡核苷酸合成技术实现高通量、精确控制的突变库构建,突变覆盖率达93.75%,并评估了多种聚合酶以优化文库质量 | 未映射读数的分析揭示了寡核苷酸合成错误和嵌合序列形成等技术因素,需改进PCR条件和加强寡核苷酸合成质量控制 | 开发一种高效、可扩展、精确控制的突变库构建策略,以支持高通量功能研究 | 以模型系统构建全长度琥珀密码子扫描突变库 | 合成生物学 | NA | 芯片寡核苷酸合成、PCR、突变库构建 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 294 | 2026-03-30 |
Protein Translocation Control in E. coli via Temperature-Dependent Aggregation: Application to a Conditionally Lethal Enzyme, Levansucrase
2025-08-20, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15081199
PMID:40867643
|
研究论文 | 本文提出了一种基于温度响应性弹性蛋白样多肽(ELP)的系统,用于调控大肠杆菌中条件致死酶(levansucrase)的转运,实现蛋白质定位和分泌的可逆控制 | 利用ELP标签的温度依赖性聚集特性,设计了一种可逆调控蛋白质分泌的策略,应用于条件致死酶系统,为合成生物学和生物安全提供新方法 | NA | 开发一种温度响应性蛋白质转运控制系统,用于合成生物学和蛋白质工程 | 大肠杆菌中的条件致死酶levansucrase及其ELP融合蛋白 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、ELP标签技术 | NA | NA | NA | ELP标签 | 大肠杆菌 | 温度响应性蛋白质分泌控制系统,基于ELP聚集机制 | 合成生物学、代谢工程、生物安全 |
| 295 | 2026-03-29 |
Biomimetic Construction of Abiotic Membranes Through Acylation of Cationic Diamino Acids
2026-Mar-27, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500978
PMID:41869751
|
研究论文 | 本文提出了一种通过阳离子二氨基氨基酸的酰化反应仿生构建非生物膜的简单模块化策略 | 开发了一种单步合成胆碱模拟非生物磷脂类似物的方法,利用Girard试剂T引入三甲基铵头部基团,并通过预生物相关的硫酯进行N-酰化,实现了头部基团电荷和组成的系统调控 | NA | 开发功能更广泛的人工膜构建方法,扩展合成生物学和原始细胞研究的工具包 | 非生物磷脂类似物及其自组装形成的囊泡结构 | 合成生物学 | NA | 羧酸盐共轭反应、N-酰化反应、自组装技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 分子递送 |
| 296 | 2026-03-29 |
Engineering smart bacteria for the next generation
2026-Mar-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2026.102681
PMID:41850245
|
综述 | 本文综述了智能细菌的理性设计及其在合成生物学中的进展,重点介绍了其在疾病诊断与治疗中的临床应用 | 通过整合复杂的基因回路,实现了微生物传感与信号处理的时空精确控制,并将其应用于原位治疗递送和远程激活 | NA | 总结智能细菌在基因回路工程和临床应用方面的最新进展,并讨论其转化为下一代精准医学的关键挑战与未来方向 | 智能细菌(工程化微生物系统) | 合成生物学 | NA | 基因回路工程 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 传感与信号处理基因回路,可响应化学、物理或病理信号 | 医学 |
| 297 | 2026-03-29 |
Quorum sensing in bacteria: insights into communication and inhibition strategies-a review
2026-Feb-02, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04610-x
PMID:41627464
|
综述 | 本文全面综述了细菌群体感应机制及其抑制策略,涵盖不同细菌类型的信号系统、合成生物学进展和多种抑制剂的应用 | 系统整合了群体感应抑制剂的多样类别,包括天然、合成、抗体、酶、CRISPR介导及临床试验中的抑制剂,并强调其在抗微生物耐药性背景下的无耐药性潜力 | 作为综述文章,未提供原始实验数据,且可能未涵盖所有最新研究进展 | 探讨细菌群体感应机制及其抑制策略,以开发可持续的抗微生物控制工具 | 革兰氏阴性菌、革兰氏阳性菌及其群体感应信号分子(如AHLs、寡肽、AI-2) | NA | NA | 合成生物学、CRISPR技术 | NA | NA | NA | CRISPR | NA | 工程化群体感应电路 | 医疗保健, 农业, 水产养殖, 食品工业, 医疗器械生物膜管理 |
| 298 | 2026-03-29 |
Genomic assembly, rescue, and characterization of a functional pseudorabies virus
2026-Feb, Virologica Sinica
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.virs.2025.11.010
PMID:41319833
|
研究论文 | 本研究利用基于酵母的转化相关重组技术,开发了一个伪狂犬病毒基因组组装平台,成功拯救并表征了功能性病毒 | 首次应用TAR技术组装伪狂犬病毒基因组,并结合CRISPR/Cas9编辑插入外源基因,实现了快速、灵活的基因组修饰 | 拯救的病毒PRV-GX-Syn1在病毒滴度和斑块大小上低于亲本株,且在小鼠中仍能引起致死性感染,表明毒力未完全减弱 | 开发伪狂犬病毒基因组编辑平台,以促进基础研究和疫苗载体开发 | 伪狂犬病毒PRV-GX-2011株 | 合成生物学 | 伪狂犬病 | 酵母转化相关重组技术、CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | 基因组序列 | 使用Vero细胞进行病毒拯救,并在BALB/c小鼠中进行感染实验 | CRISPR-Cas9, TAR | 酵母, Vero细胞 | 在UL23和UL22基因间的非编码区插入egfp基因的合成生物电路 | 医学 |
| 299 | 2026-03-29 |
De novo chemoenzymatic construction of lipid membranes
2026, Methods in enzymology
DOI:10.1016/bs.mie.2026.01.013
PMID:41895902
|
研究论文 | 本文提出了一种化学酶促策略,在水溶液中从头构建磷脂和膜 | 开发了一种模块化方法,通过天然化学连接将脂肪酸合成与磷脂组装结合,实现无预存双层的膜构建 | NA | 为自下而上的合成生物学和生命起源研究提供从头构建膜的平台 | 磷脂和膜 | 合成生物学 | NA | 化学酶促合成,天然化学连接 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学,生命起源研究 |
| 300 | 2026-03-29 |
Reconstitution of the Bacterial Glutamate Receptor Channel by Encapsulation of a Cell-Free Expression System
2024-03-08, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66595
PMID:38526087
|
研究论文 | 本文展示了一种基于细胞自由表达系统封装的方法,在巨型单层囊泡中重构细菌谷氨酸受体通道 | 提出了一种新方法,通过封装和孵育细胞自由表达反应,成功在合成细胞模型中重构膜蛋白,并探索了信号肽替换对蛋白共翻译易位的影响 | NA | 开发一种在合成细胞中重构膜蛋白的稳健方法 | 细菌谷氨酸受体(GluR0)和巨型单层囊泡(GUVs) | 合成生物学 | NA | 细胞自由表达系统、共翻译易位 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |