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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2026-03-09 |
Cytochrome P450-mediated structural diversification of diketopiperazine alkaloids
2026-Mar-06, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103476
PMID:41793977
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综述 | 本文综述了细胞色素P450酶在2,5-二酮哌嗪(DKP)结构多样化中的关键作用及其在药物发现中的应用 | 重点阐述了P450酶除羟基化外,在DKP二聚化、核碱基偶联和分子内环化等催化多样性方面的最新进展,并探讨了利用工程化P450变体进行可持续生物合成的新兴策略 | NA | 探讨P450酶如何扩展DKP的结构多样性并推动基于DKP的药物发现创新 | 2,5-二酮哌嗪(DKPs)及其P450介导的氧化修饰产物 | NA | NA | 细胞色素P450酶催化、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物发现、天然产物生物合成 |
| 282 | 2026-03-09 |
Green Biosynthesis of Terpenoid-Derived Flavor and Fragrance Compounds: Advances and Strategic Perspectives
2026-Mar-04, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c08719
PMID:41718042
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综述 | 本文系统综述了利用合成生物学策略绿色生物合成萜类香料化合物的最新进展、关键工程策略及未来展望 | 从低成本底物利用、宿主菌株适配性、酶修饰、动态途径调控、细胞区室化和毒性耐受性增强等综合视角,系统总结了萜类生物合成的关键工程策略,并探讨了多策略与先进技术整合的未来方向 | NA | 为萜类化合物的可持续生产提供关键见解和指导 | 萜类及其衍生物(香料化合物) | 合成生物学 | NA | 生物合成、酶工程、途径调控 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 微生物细胞工厂(如大肠杆菌、酿酒酵母等) | 代谢途径工程、动态调控回路、生物传感器 | 食品, 工业生物技术 |
| 283 | 2026-03-09 |
Synthetic Biology Approaches to Study Maize Signaling Pathways
2026-Mar-02, Cold Spring Harbor protocols
DOI:10.1101/pdb.top108450
PMID:40074299
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综述 | 本文综述了合成生物学方法在玉米信号通路研究中的应用,特别是通过异源表达系统(如酵母中的AuxInYeast系统)来解析玉米生长素信号通路 | 利用酵母作为异源底盘来重构玉米核生长素响应系统(AuxInYeast),提供了一种快速、高通量的假设生成平台,用于研究信号通路的进化、遗传和生化特性 | NA | 应用合成生物学原理和方法研究玉米信号通路,以推动基础生物学理解和育种工具开发 | 玉米信号通路,特别是生长素信号通路 | 合成生物学 | NA | 异源表达、荧光流式细胞术 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | 玉米核生长素响应系统在酵母中的重构(AuxInYeast系统) | 农业 |
| 284 | 2026-03-09 |
BOTany methods: accessible automation for plant synthetic biology
2026-Mar-02, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiag066
PMID:41715940
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研究论文 | 本文开发了一套基于Opentrons OT-2机器人的模块化BOTany方法,旨在为植物合成生物学提供可访问的自动化实验方案 | 为缺乏液体处理机器人的研究人员提供了低成本、易修改的自动化解决方案,支持从简单重复任务到复杂分子克隆操作的全流程自动化 | 依赖特定机器人平台(Opentrons OT-2),且未在多种植物宿主系统中广泛验证 | 降低植物合成生物学实验自动化门槛,提高实验通量和可重复性 | 植物合成生物学实验流程 | 合成生物学 | NA | 植物模块化克隆(Plant MoClo)、细菌转化、质粒提取、PCR | NA | 实验操作流程 | NA | Opentrons OT-2 | 植物, 细菌 | 模块化克隆系统 | 农业, 工业生物技术 |
| 285 | 2026-03-09 |
Protein-glycan engineering in vaccine design: merging immune mechanisms with biotechnological innovation
2026-Mar, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.06.022
PMID:40713219
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综述 | 本文综述了蛋白质-糖基工程在疫苗设计中的应用,结合免疫机制与生物技术创新以提升疫苗效力 | 整合CRISPR糖基编辑、合成生物学和糖基修饰纳米颗粒等前沿技术,实现对糖基结构的精确控制,以增强抗原呈递和免疫激活 | NA | 探讨蛋白质-糖基工程如何通过控制糖基结构来优化疫苗设计,针对新兴病原体、肿瘤和自身免疫性疾病 | 糖基在免疫识别中的作用,包括感染、癌症和自身免疫中的糖基介导机制 | 生物技术 | 感染性疾病、癌症、自身免疫性疾病 | CRISPR糖基编辑、合成生物学、糖基修饰纳米颗粒 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学 |
| 286 | 2026-03-09 |
The dual role of teichoic acids in gram-positive bacteria: Structural diversity dictates pathogenic and probiotic functions
2026-Mar, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.150925
PMID:41692204
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综述 | 本文综述了革兰氏阳性细菌中磷壁酸的结构多样性如何决定其致病性和益生功能的双重作用 | 系统比较了病原体和益生菌中壁磷壁酸和脂磷壁酸,并探讨了合成生物学方法重新设计磷壁酸合成的潜力 | NA | 阐明磷壁酸的结构多样性如何调控其与宿主的双重相互作用,并探索其在功能食品和精准营养策略中的应用 | 革兰氏阳性细菌中的磷壁酸 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药, 食品 |
| 287 | 2026-03-09 |
Strategies for Metabolic Engineering of Escherichia coli for β-Carotene Biosynthesis
2026-Feb-10, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules31040611
PMID:41752388
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综述 | 本文总结了在大肠杆菌中通过代谢工程策略生产β-胡萝卜素的方法 | 系统综述了在大肠杆菌中生产β-胡萝卜素的多种代谢工程策略,包括内源MEP途径操作、杂合MVA途径引入、中心碳代谢调控、细胞膜修饰及发酵过程优化 | NA | 为设计高效的β-胡萝卜素生产菌株提供理论见解,并为有价值的类胡萝卜素和类胡萝卜素衍生物的可持续生产奠定基础 | 大肠杆菌(Escherichia coli) | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | β-胡萝卜素生物合成途径,包括内源MEP途径和引入的杂合MVA途径 | 食品, 制药, 化妆品 |
| 288 | 2026-03-09 |
Beyond CRISPR: next-gen precision engineering of CAR-NK cells for enhanced persistence, trafficking, and tumor eradication
2026-Feb-05, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-026-04219-0
PMID:41645252
|
综述 | 本文综述了超越传统CRISPR技术的下一代精准工程工具,用于增强CAR-NK细胞的持久性、迁移能力和肿瘤清除效果 | 探讨了超越DSB依赖型CRISPR-Cas9的下一代工具(如碱基编辑器、表观遗传重编程、靶向转座子系统、合成生物学回路)的协同整合,以解决CAR-NK细胞临床转化中的关键挑战 | NA | 开发能够持久、强效且安全地对抗血液肿瘤和实体瘤的下一代CAR-NK细胞疗法 | CAR-NK(嵌合抗原受体自然杀伤)细胞 | 合成生物学 | 肿瘤 | 碱基编辑、表观遗传重编程、靶向转座子系统、合成生物学回路 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 碱基编辑器, 表观遗传编辑器, CRISPR相关转座酶 | NK细胞 | 逻辑门控靶向、免疫调节载荷、双特异性衔接器、合成/表观遗传回路 | 医学 |
| 289 | 2026-03-09 |
Strategies for Improving Aptamer Screening Efficiency: Library Design, Awareness Innovation, and Instrument Assistance
2026, Critical reviews in analytical chemistry
IF:4.2Q1
DOI:10.1080/10408347.2024.2411244
PMID:39378058
|
综述 | 本文综述了提高适配体筛选效率的策略,包括库设计、筛选意识创新和仪器辅助,旨在优化SELEX方法 | 通过整合理性库设计、新颖筛选意识和先进筛选设备,显著减少筛选轮数至<8轮,部分方法实现单轮筛选,整体时间缩短至<3周,同时提升适配体性能 | NA | 优化适配体筛选方法,提高SELEX效率,以应对初始库盲目、过程耗时和适配体性能不足等挑战 | 适配体(短单链核酸)及其筛选方法SELEX | 合成生物学 | NA | SELEX(配体指数富集系统进化) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物传感器、疾病治疗、合成生物学 |
| 290 | 2026-03-08 |
Natural products as modulators of ferroptosis: Therapeutic implications and molecular mechanisms in disease treatment
2026-May, The Journal of nutritional biochemistry
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jnutbio.2026.110259
PMID:41490559
|
综述 | 本文综述了天然产物作为铁死亡调节剂在疾病治疗中的分子机制与治疗潜力 | 系统性地基于结构类别和作用机制对天然产物进行分类,并强调纳米递送系统和合成生物学作为克服其应用限制的前沿策略 | 天然产物的应用受到来源受限、成分复杂和药代动力学不稳定的限制 | 探讨天然产物作为铁死亡调节剂在疾病治疗中的治疗意义和分子机制 | 天然产物(如萜类、黄酮类、生物碱、皂苷和多酚)及其对铁死亡的调节作用 | NA | 癌症、神经退行性疾病、糖尿病、心血管疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 291 | 2026-03-08 |
Modulation of Clostridioides difficile virulence by metabolites derived from probiotic consortia and genetically edited strains
2026 May-Jun, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108818
PMID:41638450
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综述 | 本文综述了通过代谢物调节艰难梭菌毒力的策略,重点探讨了恢复次级胆汁酸代谢、增加短链脂肪酸产量和破坏群体感应系统如何协同抑制毒素表达、生物膜形成和孢子萌发 | 提出了一种协同多靶点(胆汁酸代谢、短链脂肪酸、群体感应)抑制艰难梭菌毒力的策略,并展望了合成生物学和代谢工程在开发下一代工程益生菌和活体生物治疗产品中的应用 | NA | 探讨通过调节肠道代谢网络来抑制艰难梭菌毒力、控制感染复发的策略 | 艰难梭菌及其毒力因子(毒素、生物膜、孢子) | 合成生物学 | 艰难梭菌感染 | 多组学(基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学)、计算建模 | NA | 多组学数据 | NA | 代谢工程 | 益生菌、工程微生物群落 | 具有可编程群体淬灭能力和优化代谢输出的活体生物治疗产品 | 医学 |
| 292 | 2026-03-08 |
Genetic toolbox development for engineering Bacteroides and other bacterial species
2026-Apr, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102709
PMID:41643388
|
综述 | 本文综述了为非模型细菌菌株开发合成生物学工具箱的策略,以 Bacteroides 属为例,探讨如何建立分子生物学框架 | 强调为非模型共生和益生菌菌株开发定制化遗传工具,以支持原位工程化活体治疗或诊断机器的构建 | NA | 开发合成生物学工具箱,以促进非模型细菌菌株的遗传和代谢操作 | Bacteroides 属及其他非模型细菌物种 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | Bacteroides, E. coli | 逻辑门、生物传感器、代谢途径 | 医学 |
| 293 | 2026-03-08 |
Seizing the key nodes in glabridin biosynthesis network: identification of enzymes for producing licorice hairy roots with high levels of glabridin
2026-Mar-05, Molecular horticulture
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s43897-025-00202-x
PMID:41782076
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研究论文 | 本研究通过多组学分析和体外酶活验证,阐明了光甘草定生物合成的两条关键途径,并利用转基因毛状根体系实现了光甘草定的高效生产 | 首次系统解析了光甘草定生物合成网络中的关键酶与两条互作途径,并建立了44倍产量提升的转基因毛状根生产平台 | 未在田间或大规模发酵体系中验证生产平台的稳定性与经济效益 | 解析光甘草定生物合成途径并建立高效生物生产体系 | 甘草(Glycyrrhiza glabra)及其光甘草定生物合成相关酶 | 合成生物学 | NA | 多组学分析、体外酶活测定、农杆菌介导的遗传转化 | NA | 组学数据、酶活数据、代谢物含量数据 | 转基因毛状根系及4年生野生根对照 | 农杆菌介导转化 | 甘草毛状根 | 光甘草定生物合成途径(OMT/ODMT依赖与非依赖双途径) | 医药、化妆品 |
| 294 | 2026-03-08 |
An Easy-To-Use and Field-Deployable Cell-Free Bioreporter for Environmental Detection of Tetracyclines and Macrolides
2026-Mar-03, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c04800
PMID:41693084
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研究论文 | 本文开发了一种基于合成生物学的无细胞生物报告系统,用于环境中四环素和大环内酯类抗生素的检测 | 该系统整合了抗生素响应转录因子、RNA聚合酶和工程化DNA转录模板,通过体外转录反应产生可见荧光信号,无需生物安全防护,可冻干保存并适用于现场部署 | NA | 开发一种便携、快速且无需复杂仪器的环境抗生素检测方法 | 四环素和大环内酯类抗生素在环境水样中的检测 | 合成生物学 | NA | 体外转录反应 | NA | 荧光信号 | 真实水样 | 合成生物学 | 无细胞系统 | 抗生素响应生物传感器 | 环境 |
| 295 | 2026-03-08 |
Genomic perplexity and the evolution of context-dependent function
2026-Mar-02, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msag041
PMID:41739546
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研究论文 | 本文提出基因组像大型语言模型一样不编码固定功能,而是编码功能和表型结果的概率分布,并引入“基因组困惑度”概念来量化基因流动的适应度成本 | 将基因组功能与大型语言模型进行概念类比,提出基因组编码概率分布而非固定功能的新框架,并首次引入“基因组困惑度”作为量化基因流动适应度成本的信息论度量 | 提出的框架目前主要是概念性的,需要更多实证研究来验证其预测能力,且对基因组复杂性的简化可能忽略某些生物学细节 | 探讨基因组功能的上下文依赖性及其进化意义,为理解基因流动和合成生物学提供新框架 | 基因组功能、基因流动(水平基因转移和基因渗入)、表型结果 | 计算生物学 | NA | 泛基因组学、合成生物学、全基因组关联研究(GWAS) | Transformer、大型语言模型(LLM) | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、进化建模 |
| 296 | 2026-03-08 |
Self-assembled cell-scale containers made from DNA origami membranes
2026-Mar, Nature materials
IF:37.2Q1
DOI:10.1038/s41563-025-02418-0
PMID:41315785
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研究论文 | 本文报道了一种受脂质结构启发的DNA折纸单层膜自组装方法,可形成囊泡或中空管状结构 | 首次利用DNA折纸技术构建细胞尺度的动态膜结构,突破了传统蛋白质/脂质膜的限制 | 未明确说明结构的长期稳定性及在复杂生物环境中的功能表现 | 开发新型仿生隔室化技术用于合成生物学和细胞尺度软机器人 | DNA折纸膜自组装结构(囊泡/中空管) | 合成生物学 | NA | DNA折纸技术 | NA | 结构成像数据 | NA | DNA折纸 | NA | 仿脂质结构的径向对称DNA折纸亚基自组装膜 | 生物技术, 软体机器人 |
| 297 | 2026-03-08 |
Glassy Dynamics as a Predictive Framework for Lipid Exchange Across Membranes
2026-Mar, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202512844
PMID:41562888
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研究论文 | 本文提出了一种受玻璃态动力学启发的热力学-动力学框架,用于预测跨膜脂质交换的活化能和转移时间尺度 | 利用脂质囊泡的热膨胀系数这一单一实验可测参数,应用集体小位移模型进行无调整参数的预测,将脂质交换过程与无定形材料中的协同分子事件联系起来 | NA | 建立脂质跨膜交换的定量预测框架 | 脂质囊泡和跨膜脂质交换过程 | 软物质物理 | NA | 无标记石英晶体微天平实验 | 集体小位移模型 | 实验数据 | 多个脂质系统 | NA | NA | NA | 药物递送、生物仿生材料设计、纳米生物技术 |
| 298 | 2026-03-08 |
Mistletoe- and Mussel-Inspired Fabrication of Hierarchically Structured Protein-Cellulose Scaffolds From Biomolecular Condensates
2026-Mar, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202520827
PMID:41603494
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研究论文 | 本研究受槲寄生和贻贝启发,利用生物分子凝聚相开发了一种可调控层次结构的蛋白质-纤维素复合支架的制备方法 | 首次结合贻贝足蛋白-1(rMfp-1)与表面功能化阴离子纤维素纳米棒,通过多组分相分离形成具有核壳形态的凝聚相,并以此制备可调控多孔结构的组织工程支架 | 未明确说明支架在体内组织工程应用中的具体生物相容性、降解性能及长期稳定性数据 | 开发一种受自然启发的生物可再生、水基的层次结构材料制备方法,用于组织工程支架 | 重组贻贝足蛋白-1(rMfp-1)与表面功能化阴离子纤维素纳米棒形成的生物分子凝聚相 | 生物材料 | NA | 冷冻干燥、光谱学与成像技术(多种模态) | NA | 光谱数据、成像数据 | NA | NA | NA | NA | 医学(组织工程) |
| 299 | 2026-03-08 |
Enhanced Heterologous Production of Tylosin Through Pathway Reconstruction and Integrated Optimization in Streptomyces
2026-Mar, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70203
PMID:41761947
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研究论文 | 本研究通过克隆泰乐菌素生物合成基因簇,在链霉菌宿主中实现异源表达,并通过培养基优化、启动子替换和调控基因敲除等策略,显著提高了泰乐菌素的产量 | 采用ExoCET技术克隆大型GC-rich基因簇,通过两步组装策略在三种链霉菌宿主中实现异源表达,并综合运用培养基优化、启动子工程和调控基因敲除进行系统优化 | 未提及泰乐菌素类似物的开发或规模化生产的验证 | 提高泰乐菌素的异源生物合成效率 | 泰乐菌素生物合成基因簇及其在链霉菌中的异源表达 | 合成生物学 | NA | ExoCET技术、基因克隆、启动子替换、基因敲除 | NA | NA | 三种链霉菌宿主(包括S. albus J1074) | ExoCET, 基因敲除 | Streptomyces fradiae QL100, Streptomyces albus J1074, 链霉菌宿主 | 泰乐菌素生物合成途径重构,包括启动子替换(tylGI和tylI)和调控基因(tylQ)敲除 | 医药 |
| 300 | 2026-03-08 |
DNA Framework-Encoded Digital Recorder for Bacterial Discrimination
2026-Feb-25, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.6c01091
PMID:41738382
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研究论文 | 本文开发了一种基于DNA框架的位置编码系统(DFDR),用于同时区分多个核酸序列,并应用于细菌鉴别 | DFDR系统通过三角形DNA框架实现位点特异性功能化,单单元可同时解析18个核酸靶标,比传统DNA自组装系统提高6倍多重检测能力,支持时序控制和可重写记录 | NA | 开发一种高分辨率追踪多重分子信息的系统,用于细菌鉴别和诊断 | 核酸序列(包括16S rRNA混合物)和临床相关呼吸道病原体 | 合成生物学 | 呼吸道感染 | DNA框架自组装 | NA | 核酸序列数据 | 医院环境和自然河水样本 | NA | NA | 位置编码系统(DFDR),基于三角形DNA框架设计 | 医学诊断、环境监测 |