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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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3061 | 2024-08-07 |
GoldenBraid: an iterative cloning system for standardized assembly of reusable genetic modules
2011, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0021622
PMID:21750718
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研究论文 | 本文介绍了一种名为GoldenBraid的标准化组装系统,该系统基于IIS型限制酶,允许无限增长的可重复使用基因模块的构建。 | GoldenBraid系统通过IIS型限制酶的相对位置引入双环(“编织”)拓扑结构,实现了复合部件的无限增长和迭代组装步骤。 | NA | 提出GoldenBraid作为植物合成生物学的组装标准。 | GoldenBraid系统的标准化组装方法及其在植物合成生物学中的应用。 | 合成生物学 | NA | IIS型限制酶 | NA | DNA | 涉及多个基因模块和19个基本部件 |
3062 | 2024-08-07 |
The bacterial nanorecorder: engineering E. coli to function as a chemical recording device
2011, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0027559
PMID:22132112
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研究论文 | 本文介绍了一种利用合成生物学技术,通过合成化学敏感的遗传开关激活荧光蛋白指示器和细胞分裂抑制剂,创造出一种新型的大肠杆菌菌株,该菌株可作为高度特异、简单且廉价的化学记录设备 | 开发了一种新型的大肠杆菌菌株,能够作为生物“纳米记录器”,用于确定化学暴露事件的类型和时间 | NA | 展示通过简易修改现有遗传开关,可以生成一种基于生物的“纳米记录器”,用于检测、响应和记录各种随时间和空间变化的化学刺激 | 大肠杆菌菌株及其在化学记录设备中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成遗传构造 | 遗传开关 | 细胞长度 | NA |
3063 | 2024-08-07 |
Epistemology of synthetic biology: a new theoretical framework based on its potential objects and objectives
2023, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2023.1266298
PMID:38053845
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研究论文 | 本文提出了一种基于合成生物学潜在对象和目标的新理论框架,并对合成生物学的研究对象和特定目标进行了认识论分析 | 提出了一个三层次的研究对象分类和三个逐步关联的目标,为合成生物学提供了新的理论框架 | NA | 更好地定义合成生物学这一新学科的研究对象和特定目标 | 合成生物学的研究对象,包括不同种类的实验室构建生物实体 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
3064 | 2024-08-07 |
Engineering the next generation of theranostic biomaterials with synthetic biology
2024-Feb, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2023.10.018
PMID:38026437
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综述 | 本文综述了合成生物学在治疗诊断学中的应用,强调了其在推动先进生物材料发展中的关键作用 | 合成生物学通过基因重编程生物系统,为生物材料的发展提供了新的范式 | 生物材料的进步受到化学和机械方法的限制 | 探索合成生物学与生物材料的交叉应用,推动可编程复杂功能的生物材料工程 | 合成生物学在治疗诊断学中的应用及其对生物材料的影响 | 生物材料 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
3065 | 2024-08-07 |
Advance of tolerance engineering on microbes for industrial production
2023-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2023.10.004
PMID:38025766
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综述 | 本文综述了提高工业微生物耐受性的代谢工程技术,并讨论了生物仪器和合成生物学发展带来的新思路 | 探讨了生物仪器和合成生物学发展带来的新思路 | NA | 提高工业微生物在极端生产条件下的耐受性 | 工业微生物的耐受性 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
3066 | 2024-08-07 |
Recent advances in genome annotation and synthetic biology for the development of microbial chassis
2023-Dec-01, Journal, genetic engineering & biotechnology
DOI:10.1186/s43141-023-00598-3
PMID:38038785
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综述 | 本文综述了微生物宿主选择、合成生物学、基因组注释、代谢建模以及预测基因必需性的计算方法,以开发微生物底盘,特别关注乳酸菌作为微生物底盘及其基因组注释策略。 | 本文提出了基因组注释策略,以优化基因组减少而不损害底盘功能,并探讨了最小基因组底盘开发的潜力。 | NA | 开发高效和可持续的合成生物学系统,使用具有最小基因组的优化微生物底盘。 | 乳酸菌(LAB)作为微生物底盘及其基因组注释策略,以Lactococcus lactis为例。 | 合成生物学 | NA | 基因组注释、代谢建模、计算方法 | NA | 基因组数据 | 以Lactococcus lactis为例 |
3067 | 2024-08-07 |
Harnessing synthetic biology for advancing RNA therapeutics and vaccine design
2023-Nov-30, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-023-00323-3
PMID:38036580
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综述 | 本文综述了合成生物学如何促进RNA疗法和疫苗设计的发展 | 探讨了合成生物学在优化疫苗抗原、治疗结构、治疗活性和递送载体方面的应用,以提高RNA疫苗技术的功能性和有效性 | NA | 探讨合成生物学在RNA疗法和疫苗设计中的应用,以推动下一代疫苗和治疗技术的发展 | RNA疗法和疫苗设计 | 生物技术 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
3068 | 2024-08-07 |
Computational analysis of protein synthesis, diffusion, and binding in compartmental biochips
2023-Nov-30, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-023-02237-5
PMID:38037098
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研究论文 | 研究在硅基二维分隔生物芯片中蛋白质合成、扩散和结合的动力学过程 | 引入陷阱结合效率来表征系统性能,并通过数学和计算模型识别陷阱结合效率的三种不同状态 | NA | 扩展合成、扩散和结合在分隔系统中的理论知识基础,以更好地控制分子自组装 | 蛋白质复合体的合成和组装 | 生物技术 | NA | NA | NA | NA | NA |
3069 | 2024-08-07 |
Installing xylose assimilation and cellodextrin phosphorolysis pathways in obese Yarrowia lipolytica facilitates cost-effective lipid production from lignocellulosic hydrolysates
2023-Nov-29, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-023-02434-9
PMID:38031183
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研究论文 | 本文通过合理和组合策略,首次成功改造Yarrowia lipolytica,使其能够利用木糖和纤维糊精生产脂质,并提高了脂质产量和降低了生产成本 | 首次在Yarrowia lipolytica中构建了木糖同化和纤维糊精磷酸解途径,并通过增强PPP途径和增加细胞质NADPH供应,缓解了葡萄糖对木糖利用的抑制作用 | NA | 研究如何通过合成生物学方法改造Yarrowia lipolytica,使其能够利用木糖和纤维糊精生产脂质,并提高脂质产量和降低生产成本 | Yarrowia lipolytica细胞,木糖和纤维糊精 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
3070 | 2024-08-07 |
Modular Cloning by Golden Gate Assembly and Possible Application in Pathway Design
2023-Jun-28, Chimia
IF:1.1Q3
DOI:10.2533/chimia.2023.437
PMID:38047784
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研究论文 | 本文介绍了模块化克隆技术及其在合成生物学中的应用,特别是通过Golden Gate组装快速生成表达载体库的方法 | 模块化克隆技术通过Golden Gate组装支持一步法和一锅法反应,快速生成表达载体库,为代谢途径或酶级联设计提供了新的解决方案 | 由于缺乏高通量筛选方法,模块化克隆技术在工业应用中仍较少,且某些应用受限 | 探讨模块化克隆技术在合成生物学中的应用及其在工业应用中的潜力 | 模块化克隆技术及其在代谢途径和酶级联设计中的应用 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | NA | 遗传元素(如启动子、核糖体结合位点和标签) | 涉及多达20种酶的复杂途径 |
3071 | 2024-08-07 |
Advancing reproducibility can ease the 'hard truths' of synthetic biology
2023, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysad014
PMID:38022744
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研究论文 | 本文讨论了合成生物学领域中可重复性的现状及其改进方法 | 提出通过教育、激励和投资相关基础设施来提高合成生物学研究的可重复性 | 未具体说明当前可重复性问题的具体限制 | 探讨如何提高合成生物学研究的可重复性以促进其技术应用 | 合成生物学领域的可重复性问题 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
3072 | 2024-08-07 |
Elucidating the impact of in vitro cultivation on Nicotiana tabacum metabolism through combined in silico modeling and multiomics analysis
2023, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2023.1281348
PMID:38023876
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研究论文 | 本文通过结合计算机模拟和多组学分析,系统地阐明了体外培养对烟草代谢网络的影响 | 首次构建了烟草的基因组规模代谢网络(GSMN),并结合多组学分析,揭示了体外培养条件下烟草代谢的系统性变化 | 文章中提到的体外培养对植物整体代谢的系统性影响仍了解不足 | 系统地理解和表征植物代谢行为,为高效的植物代谢工程和合成生物学提供基础 | 烟草的代谢网络及其在体外培养条件下的变化 | 合成生物学 | NA | 多组学分析 | 基因组规模代谢网络(GSMN) | 代谢物 | NA |
3073 | 2024-08-07 |
Pyramiding stacking of multigenes (PSM): a simple, flexible and efficient multigene stacking system based on Gibson assembly and gateway cloning
2023, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2023.1263715
PMID:38026899
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研究论文 | 本研究开发了一种基于Gibson组装和Gateway克隆的Pyramiding Stacking of Multigenes (PSM)系统,用于将多个转基因整合到一个T-DNA中 | PSM系统结合了Gibson组装和Gateway克隆的优点,采用倒金字塔堆叠路线,实现了快速、灵活和高效的多基因堆叠 | NA | 开发一种简单、灵活且高效的多基因堆叠系统,用于遗传工程和合成生物学 | 多基因堆叠系统的设计和其在拟南芥中的应用 | 遗传工程 | NA | Gibson组装, Gateway克隆 | NA | DNA | 四个和九个基因表达盒分别组装到目标载体中,用于生成两个二元表达载体 |
3074 | 2024-08-07 |
Biotechnological production of omega-3 fatty acids: current status and future perspectives
2023, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2023.1280296
PMID:38029217
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综述 | 本文综述了omega-3脂肪酸的生物技术生产现状、关键挑战及未来展望 | 利用合成生物学和工程微生物细胞工厂提供更稳定、可持续和经济的omega-3脂肪酸来源 | 目前生物技术生产omega-3脂肪酸仍面临降低生产成本和提高产品质量与可持续性的挑战 | 探讨生物技术在生产omega-3脂肪酸中的应用及未来发展方向 | omega-3脂肪酸,包括ALA、EPA和DHA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
3075 | 2024-08-07 |
Unleashing the potential of catalytic RNAs to combat mis-spliced transcripts
2023, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2023.1244377
PMID:38047291
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综述 | 本文综述了利用催化RNA和纳米药物递送系统来治疗由于剪接异常导致的遗传疾病的可能性 | 探讨了利用合成生物学、高通量深度测序和计算方法来克服催化RNA递送挑战的新视角 | NA | 探讨利用催化RNA和纳米药物递送系统治疗剪接异常转录本的方法 | 剪接异常导致的遗传疾病,如肌肉萎缩症、阿尔茨海默病、亨廷顿病和骨髓增生异常综合征 | 合成生物学 | 遗传疾病 | 高通量深度测序 | NA | 转录组数据 | NA |
3076 | 2024-08-07 |
[Biomanufacturing of bioactive compounds: current situation, challenges, and future perspectives]
2023-Nov-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.230334
PMID:38013171
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综述 | 本文回顾了生物制造技术的发展历程,探讨了其在生物经济中的应用及未来展望 | 利用合成生物学和自动化技术加速生物制造的发展,推动可持续生产方式 | NA | 全面理解生物制造在生物经济增长和创新中的作用 | 生物制造技术及其在各行业中的应用 | NA | NA | 生物制造 | NA | NA | NA |
3077 | 2024-08-07 |
[Advances in the biosynthesis of cyclodipeptide type natural products derived from actinomycetes]
2023-Nov-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.230068
PMID:38013180
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综述 | 本文综述了由放线菌产生的环二肽类天然产物的生物合成途径及其后修饰机制 | 总结了环二肽骨架的生物合成途径和放线菌中的后修饰机制 | NA | 加速环二肽的基因组挖掘及其分离、纯化和结构鉴定,并揭示新型环二肽的生物合成机制及其合成生物学设计 | 环二肽类天然产物的生物合成 | NA | NA | 非核糖体肽合成酶 (NRPS) 或环二肽合成酶 (CDPS) | NA | NA | NA |
3078 | 2024-08-07 |
Genomic Insights on the Carbon-Negative Workhorse: Systematical Comparative Genomic Analysis on 56 Synechococcus Strains
2023-Nov-18, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering10111329
PMID:38002453
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研究论文 | 对56种Synechococcus菌株的完整基因组进行综合分析,阐明其遗传关系、环境适应性及其在基因组水平上的反映 | 揭示了Synechococcus菌株的开放基因组模式,以及冷适应和热适应菌株在核心基因功能单元中的独特KO功能单元 | NA | 深入理解Synechococcus的代谢潜力,促进蓝细菌生物技术的发展和工业应用 | 56种Synechococcus菌株的基因组 | 合成生物学 | NA | 泛基因组分析 | NA | 基因组数据 | 56种Synechococcus菌株 |
3079 | 2024-08-07 |
Evaluation of Reference Genes for Normalizing RT-qPCR and Analysis of the Expression Patterns of WRKY1 Transcription Factor and Rhynchophylline Biosynthesis-Related Genes in Uncaria rhynchophylla
2023-Nov-15, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms242216330
PMID:38003520
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研究论文 | 评估用于归一化RT-qPCR的参考基因,并分析钩藤中WRKY1转录因子和蛇根碱生物合成相关基因的表达模式 | 首次报道了钩藤中参考基因的稳定性,并为未来的基因表达分析提供了重要基础 | NA | 选择和评估适用于基因表达分析的适当参考基因,特别是涉及钩藤中生物碱生物合成途径的转录因子和关键酶基因 | 钩藤中的参考基因、WRKY1转录因子和蛇根碱生物合成相关基因 | NA | NA | RT-qPCR | NA | 基因表达数据 | 14个关键生物碱酶基因和一个转录因子基因在三种实验压力处理下的表达 |
3080 | 2024-08-07 |
Recent Advances in Cyanotoxin Synthesis and Applications: A Comprehensive Review
2023-Oct-26, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms11112636
PMID:38004647
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综述 | 本文综述了蓝藻毒素的分类、生物合成途径及其潜在应用 | 强调了蓝藻毒素在生物技术领域的潜力,包括作为化感物质、杀虫剂和生物药物的应用 | NA | 促进对蓝藻毒素的全面理解及其在合成生物学和潜在应用中的研究 | 蓝藻毒素及其生物合成途径和应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |