合成生物学相关文章
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当前共找到 3735 篇文献，本页显示第 3121 - 3140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3121 | 2024-08-07 |
Antibacterial Discovery and Development: From Gene to Product and Back
2015, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/2015/591349
PMID:26339625
|
综述 | 本文综述了从基因到产品的抗菌发现与发展过程，并探讨了如何整合新旧方法以改进微生物产品的筛选、发酵和菌株改良 | 本文结合了微生物生态学、分析化学、基因组学、分子生物学和合成生物学等领域的进展，为微生物天然产物筛选和开发提供了新的视角 | NA | 探讨如何整合新旧方法以改进微生物产品的筛选、发酵和菌株改良 | Enterococcus faecium, Staphylococcus aureus, Klebsiella species, Clostridium difficile, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa, Escherichia coli 等细菌 | NA | 感染性疾病 | 基因组学, 分子生物学, 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3122 | 2024-08-07 |
How to make a minimal genome for synthetic minimal cell
2010-May, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1007/s13238-010-0064-4
PMID:21203957
|
综述 | 本文综述了合成最小细胞的关键步骤——构建功能性最小基因组的历史、现状及主要方法，并讨论了最小基因组对人工细胞代谢和调控的影响 | 实验表明，基因组简化带来了意想不到的有益特性，如高电穿孔效率和重组基因及质粒的准确传播 | NA | 构建一个合成最小细胞，提供一个合适的底盘，以整合功能性的合成部件、设备和系统 | 合成最小细胞及其最小基因组 | 合成生物学 | NA | 生物信息学和分子生物学方法 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3123 | 2024-08-07 |
A Digitally Programmable Cytomorphic Chip for Simulation of Arbitrary Biochemical Reaction Networks
2018-04, IEEE transactions on biomedical circuits and systems
IF:3.8Q2
DOI:10.1109/TBCAS.2017.2781253
PMID:29570063
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研究论文 | 本文报道了一种数字可编程的0.35 μm BiCMOS模拟细胞形态芯片系统，能够精确模拟任意生化反应网络 | 提出了一种基于总变量和守恒定律的独特计算方法，解决了芯片制造过程中随机变化导致的偏差问题 | NA | 开发一种用于模拟任意大规模生物网络的设计、分析和仿真工具 | 数字可编程的细胞形态芯片及其在生化反应网络模拟中的应用 | 生物技术 | NA | BiCMOS | 细胞形态电路 | 电路模拟 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3124 | 2024-08-07 |
Emergent Properties of Giant Vesicles Formed by a Polymerization-Induced Self-Assembly (PISA) Reaction
2017-01-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/srep41534
PMID:28128307
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研究论文 | 本研究展示了通过控制自由基聚合反应，在温和条件下形成巨型聚合物囊泡的方法 | 首次通过聚合诱导自组装（PISA）反应，在温和条件下形成直径大于10微米的巨型聚合物囊泡 | NA | 探索巨型囊泡的形成及其在自然科学和工程领域的应用潜力 | 巨型聚合物囊泡及其自组装过程 | NA | NA | 聚合诱导自组装（PISA） | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3125 | 2024-08-07 |
A Cas9-based toolkit to program gene expression in Saccharomyces cerevisiae
2017-Jan-09, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkw1023
PMID:27899650
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research paper | 本文利用CRISPR/Cas9技术构建了一个无需克隆的工具包，用于解决代谢工程中常见的障碍，如染色体整合位点选择、启动子选择以及蛋白质定位和溶解性问题 | 该工具包包括23个Cas9-sgRNA质粒、37个不同强度和时间表达特性的启动子以及10种蛋白质定位、降解和溶解性标签，并通过一个基于网络的工具自动化生成用于整合的DNA片段 | NA | 开发一个高效的基因表达编程工具包，用于酵母菌株工程 | 酵母菌株工程中的基因编辑和代谢工程 | synthetic biology | NA | CRISPR/Cas9 | NA | DNA | 23个Cas9-sgRNA质粒、37个启动子、10种蛋白质标签 | NA | NA | NA | NA |
| 3126 | 2024-08-07 |
Development of SyneBrick Vectors As a Synthetic Biology Platform for Gene Expression in Synechococcus elongatus PCC 7942
2017, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2017.00293
PMID:28303150
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研究论文 | 本文开发了SyneBrick载体作为合成生物学平台，用于Synechococcus elongatus PCC 7942中的基因表达。 | SyneBrick载体提供了三种可诱导的表达系统和三个中性位点用于染色体整合，能够有效控制基因表达并加速代谢工程。 | 基因表达在光照下48小时后因aTc降解而减少。 | 开发合成生物学平台，用于蓝细菌中的基因表达和代谢途径重构。 | Synechococcus elongatus PCC 7942作为模型蓝细菌。 | 合成生物学 | NA | 基因表达调控技术 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3127 | 2024-08-07 |
Model-guided combinatorial optimization of complex synthetic gene networks
2016-Dec-28, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.20167265
PMID:28031353
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研究论文 | 本文展示了一种利用预测模型优化复杂三基因电路的策略，该电路是一种新型的比例miRNA生物传感器 | 通过模型引导生成遗传多样性，随后进行筛选和模型验证，成功优化了复杂基因网络的性能，无需广泛的前期知识 | NA | 构建满足定量性能标准的基因电路 | 复杂的三基因电路及miRNA生物传感器 | 合成生物学 | NA | 预测建模 | NA | 遗传数据 | 小数量的传感器 | NA | NA | NA | NA |
| 3128 | 2024-08-07 |
Production and Characterization of Synthetic Carboxysome Shells with Incorporated Luminal Proteins
2016-Mar, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1104/pp.15.01822
PMID:26792123
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研究论文 | 本文描述了在大肠杆菌中表达合成操纵子以生产含有内腔蛋白的合成羧基体壳，并研究了其结构决定因素和渗透性 | 本研究不仅加深了对控制羧基体组装的蛋白质-蛋白质相互作用的理解，还建立了一个平台来研究壳的渗透性和完整BMC壳的结构基础 | NA | 理解羧基体和其他细菌微区室（BMCs）的货物包装和壳渗透性的结构决定因素，以应用于植物合成生物学和代谢工程 | 合成羧基体壳及其内腔蛋白的表达和特性 | 生物工程 | NA | NA | NA | 蛋白质 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3129 | 2024-08-07 |
Compartmentalization and Transport in Synthetic Vesicles
2016, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2016.00019
PMID:26973834
|
综述 | 本文综述了合成囊泡在合成生物学中的应用，特别是简单和嵌套人工囊泡在多隔室生物反应器中的使用 | 本文探讨了将膜转运蛋白整合到简单和嵌套人工囊泡中，以实现子隔间之间特定物质交换的潜力 | 目前大多数隔室化生物反应器依赖于非特异性底物和产物的交换，这限制了其进一步的应用 | 探讨合成囊泡在合成生物学中的应用，特别是如何通过技术进步实现膜蛋白的重构 | 简单和嵌套人工囊泡，以及多隔室生物反应器 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3130 | 2024-08-07 |
Genome-Editing Technologies for Enhancing Plant Disease Resistance
2016, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2016.01813
PMID:27990151
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研究论文 | 本文探讨了利用基因编辑技术提高植物病害抗性的策略和目标 | 提出了通过重写效应子-目标序列和修改效应子-目标启动子来增强目标基因表达的策略，以及通过基因编辑技术获得合成基因的方法 | NA | 提高植物病害抗性，促进可持续农业发展 | 植物基因编辑技术和植物免疫系统 | 生物技术 | NA | 基因编辑技术 | NA | 基因序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3131 | 2024-08-07 |
Rationally designed, heterologous S. cerevisiae transcripts expose novel expression determinants
2015, RNA biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/15476286.2015.1071762
PMID:26176266
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法，系统地研究了不同转录区域对基因表达的影响，特别是在酵母中对病毒HRSVgp04基因ORF的383个基因变体的理性设计和分析。 | 发现了转录本中先前未探索区域的新因果效应，以及翻译调控与ORF不同部分折叠强度选择之间的关系。 | 研究主要集中在5'UTR和ORF下游120个核苷酸内的区域，对更远区域的探索有限。 | 揭示RNA转录特征与蛋白质表达谱之间的通用因果关系。 | 病毒HRSVgp04基因ORF的383个基因变体在酵母中的表达。 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | 转录本 | 383个基因变体 | NA | NA | NA | NA |
| 3132 | 2024-08-07 |
Salinity tolerance in plants. Quantitative approach to ion transport starting from halophytes and stepping to genetic and protein engineering for manipulating ion fluxes
2015, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2015.00873
PMID:26579140
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综述 | 本文从盐生植物和盐敏感植物之间的离子运输差异出发，重点讨论了通过遗传和蛋白质工程操纵离子通量以提高植物耐盐性的方法 | 本文介绍了通过过表达或敲除离子转运蛋白来改变耐盐性的成功尝试，并探讨了通过单点突变修改离子通道和转运蛋白以及合成生物学方法创建新的调控网络以提高耐盐性的潜在方向 | NA | 提高植物的耐盐性 | 植物的离子运输机制和相关蛋白质 | NA | NA | 遗传和蛋白质工程 | NA | 离子通量数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3133 | 2024-08-07 |
Synthetic Peptides as Protein Mimics
2015, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2015.00211
PMID:26835447
|
综述 | 本文综述了使用合成肽作为蛋白质模拟物以调节蛋白质功能和为合成生物学提供构建块的最新进展 | 合成肽可以精确复制蛋白质片段，并通过多种化学修饰（包括非蛋白质氨基酸的引入和肽骨架的修饰）来扩展其化学和结构多样性，从而提高其蛋白酶稳定性 | NA | 探索和调节蛋白质功能，通过控制分子间相互作用的干扰 | 合成肽作为蛋白质模拟物 | NA | NA | 合成肽技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3134 | 2024-08-07 |
Construction of synthetic nucleoli and what it tells us about propagation of sub-nuclear domains through cell division
2014, Cell cycle (Georgetown, Tex.)
DOI:10.4161/15384101.2014.949124
PMID:25486191
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研究论文 | 本文通过合成生物学原理构建人工核仁，探讨亚核域在细胞分裂中的传播机制 | 利用合成生物学方法成功构建人工核仁，揭示了核仁在细胞周期传播中的关键机制 | NA | 深入理解核体在细胞周期中的继承机制 | 细胞核中的核体及其在细胞分裂中的传播 | 细胞生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3135 | 2024-08-07 |
A universal molecular control for DNA, mRNA and protein expression
2024-Mar-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46456-9
PMID:38509097
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研究论文 | 本文利用合成生物学原理，开发了一种名为pREF的多组学控制标准，可作为下一代测序和质谱方法的通用分子标准 | pREF序列编码21个合成基因，可体外转录为插入mRNA控制，并体外翻译生成匹配的蛋白质控制，提供了DNA、RNA和肽检测的定性和定量准确性控制 | NA | 开发一种跨基因组学、转录组学和蛋白质组学方法的集成基因表达测量标准 | DNA、mRNA和蛋白质表达的控制标准 | 基因组学 | NA | 下一代测序、质谱 | NA | DNA、RNA、蛋白质 | 21个合成基因 | NA | NA | NA | NA |
| 3136 | 2024-08-07 |
HEx: A heterologous expression platform for the discovery of fungal natural products
2018-04, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aar5459
PMID:29651464
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研究论文 | 本文介绍了一种名为HEx的异源表达平台，用于快速发现真菌天然产物 | HEx平台能够快速、可扩展地表达真菌生物合成基因及其编码的代谢物，特别是对于难以培养或基因转录沉默的真菌物种 | NA | 克服天然产物发现中的瓶颈，特别是针对难以培养或基因转录沉默的真菌物种 | 真菌生物合成基因簇及其编码的代谢物 | 合成生物学 | NA | DNA测序 | NA | 基因组数据 | 41个来自世界各地不同真菌物种的生物合成基因簇，其中22个产生了可检测的化合物 | NA | NA | NA | NA |
| 3137 | 2024-08-07 |
Analysis of the leakage of gene repression by an artificial TetR-regulated promoter in cyanobacteria
2015-Sep-19, BMC research notes
IF:1.6Q2
DOI:10.1186/s13104-015-1425-0
PMID:26387086
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研究论文 | 研究分析了在蓝细菌中人工TetR调控启动子L09的基因抑制泄漏原因 | 通过理论模拟DNA呼吸动力学和表面等离子体共振（SPR）生物传感器技术分析DNA-蛋白质相互作用的动态速率常数，揭示了L09启动子泄漏问题的原因 | 研究仅限于L09启动子与其他点突变启动子（L10、L11、L12）的比较，未涉及其他类型的启动子 | 识别和分析蓝细菌中人工TetR调控启动子L09的基因抑制泄漏原因 | 蓝细菌Synechocystis PCC 6803中的TetR调控启动子L09 | 合成生物学 | NA | 表面等离子体共振（SPR）生物传感器技术 | 非线性Peyrard-Bishop-Dauxois介观模型 | DNA | 涉及L09、L10、L11、L12四个启动子 | NA | NA | NA | NA |
| 3138 | 2024-08-07 |
Transcriptome analysis of 20 taxonomically related benzylisoquinoline alkaloid-producing plants
2015-Sep-18, BMC plant biology
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12870-015-0596-0
PMID:26384972
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研究论文 | 本研究对20种分类相关的苯并异喹啉生物碱生产植物进行了转录组分析 | 首次对非模式植物中的苯并异喹啉生物碱生物合成基因进行了全面挖掘和功能分析 | NA | 探索和发现苯并异喹啉生物碱代谢中的功能同源物和全新催化剂 | 20种分类相关的苯并异喹啉生物碱生产植物 | 植物生物化学 | NA | 转录组测序 | NA | RNA | 20种植物样本 | NA | NA | NA | NA |
| 3139 | 2024-08-07 |
Xylonucleic acid: synthesis, structure, and orthogonal pairing properties
2015-Sep-03, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkv719
PMID:26175047
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研究论文 | 本文首次报道了含有木糖（一种可能的原始木糖）的木糖核酸（XyloNA）的合成及其寡核苷酸的组装，并通过热UV熔解、圆二色谱和溶液态NMR光谱研究了其配对和结构特性。 | XyloNA被证明是一种正交自配对系统，采用略微右旋的扩展螺旋几何结构，为合成生物学中的应用提供了潜在的正交遗传系统。 | 尽管XyloNA显示出正交自配对的特性，但其结构-功能（配对）特性相对于DNA/RNA较差，限制了其在原始环境中的信息聚合物选择。 | 研究木糖核酸（XyloNA）的合成、结构及其在合成生物学和生命起源领域的配对特性。 | 木糖核酸（XyloNA）及其寡核苷酸的合成与结构特性。 | 合成生物学 | NA | 热UV熔解、圆二色谱、溶液态NMR光谱 | NA | NA | 四个XyloNA核苷酸构建块及其寡核苷酸 | NA | NA | NA | NA |
| 3140 | 2024-08-07 |
Towards a behavioral-matching based compilation of synthetic biology functions
2015-Sep, Acta biotheoretica
IF:1.4Q4
DOI:10.1007/s10441-015-9265-9
PMID:26141968
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research paper | 本文探讨了合成生物学领域中基于行为匹配的编译合成生物学功能的高级语言设计问题 | 提出了Gubs语言，这是一种用于描述预期行为的规范语言，并通过编译器选择合适的组件以确保合成生物学功能的行为符合编程要求 | NA | 开发一个在计算机辅助设计环境中用于安全设计可靠新生物功能的工程框架 | 合成生物学中的高级语言设计 | synthetic biology | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |