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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2025-10-30 |
Screening and machine learning-based prediction of translation-enhancing peptides that reduce ribosomal stalling in Escherichia coli
2025-Oct-22, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d5cb00199d
PMID:41142649
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研究论文 | 本研究通过筛选和机器学习预测能够减少大肠杆菌核糖体停滞的翻译增强肽 | 首次系统筛选翻译增强肽并开发机器学习模型预测其活性 | 研究主要针对SecM停滞肽,对其他类型停滞肽的适用性需要进一步验证 | 开发能够缓解核糖体停滞的翻译增强肽工具 | 人工四肽库和SecM停滞肽诱导的翻译停滞系统 | 机器学习 | NA | 随机森林算法,翻译分析 | 随机森林 | 肽序列数据和翻译活性数据 | 随机人工四肽库 | NA | 大肠杆菌 | 翻译增强肽工具包 | 合成生物学 |
| 302 | 2025-10-30 |
Evaluating the Potential of Co-supplementation of Zinc and Ferrous Iron Ion for Itaconic Acid Fermentation of Aspergillus terreus
2025-Sep, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-025-05317-x
PMID:40591109
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研究论文 | 评估锌和亚铁离子共同补充对土曲霉衣康酸发酵的影响 | 首次系统评估锌和亚铁离子共同补充对土曲霉衣康酸发酵的协同促进作用,并通过转录组测序揭示其分子机制 | 仅使用纯葡萄糖和木糖作为碳源,未验证其他碳源或实际工业原料的效果 | 探究锌和亚铁离子共同补充对土曲霉衣康酸发酵的促进效果及机制 | 土曲霉(Aspergillus terreus)及其衣康酸发酵过程 | 工业生物技术 | NA | 转录组测序 | NA | 基因表达数据、发酵性能数据 | NA | 合成生物学工具 | 土曲霉(Aspergillus terreus) | 衣康酸生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 303 | 2025-10-30 |
From single cells to communities: Mathematical perspectives on bacterial quorum sensing
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.09.030
PMID:41142755
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综述 | 本文从数学角度综述细菌群体感应的建模方法及其应用前景 | 系统整合了从单细胞到群体水平的多种数学建模框架,并展望了在合成生物学和抗菌治疗等领域的应用潜力 | 未涉及具体的实验验证数据,主要聚焦于理论模型框架的讨论 | 探讨数学建模在理解细菌群体感应动力学中的作用 | 细菌群体感应机制及其数学建模方法 | 计算生物学 | NA | 数学建模 | 确定性模型、随机模型、空间模型 | 理论模型 | NA | NA | 细菌 | 群体感应系统 | 医学, 环境, 工业生物技术 |
| 304 | 2025-10-30 |
Advances in yeast synthetic biology for human G protein-coupled receptor biology and pharmacology
2024-Aug, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103176
PMID:39079313
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综述 | 回顾酵母合成生物学在推动G蛋白偶联受体(GPCR)研究和药物开发方面的最新进展 | 利用酵母合成生物学技术为GPCR研究提供新的概念突破和技术创新 | NA | 解决GPCR信号传导、药理学和结构生物学研究中的挑战 | 人类G蛋白偶联受体(GPCRs) | 合成生物学 | NA | 酵母合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | NA | 医学, 生物技术 |
| 305 | 2025-10-29 |
Actin Polymerizing Motors to Assist Cytoskeleton-like Networks Formation in Artificial Cells
2025-Oct-28, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5c12624
PMID:41100205
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研究论文 | 本研究利用肌动蛋白聚合纳米马达辅助人工细胞内细胞骨架网络的形成 | 首次将肌动蛋白聚合纳米马达与人工细胞结合,模仿细菌运动机制实现主动推进 | NA | 开发能够模拟生物细胞机械响应功能的人工细胞系统 | 人工细胞和肌动蛋白聚合纳米马达 | 合成生物学 | NA | 肌动蛋白聚合反应、哺乳动物细胞裂解液环境 | NA | NA | NA | NA | NA | 肌动蛋白丝聚合形成细胞骨架样网络 | 医学, 生物技术 |
| 306 | 2025-10-29 |
Bacillus velezensis LoaP promotes antitermination by antagonizing NusA
2025-Oct-28, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01429-25
PMID:41147751
|
研究论文 | 本研究揭示了Bacillus velezensis中LoaP蛋白通过特异性拮抗NusA实现抗终止的分子机制 | 首次发现LoaP类NusG旁系同源物通过特异性拮抗NusA实现抗终止,机制与已知的RfaH范式显著不同 | 研究仅针对革兰氏阳性细菌,未涉及其他NusG旁系同源物的作用机制 | 阐明LoaP蛋白在转录抗终止中的分子机制 | Bacillellus velezensis LoaP蛋白及其与转录复合物的相互作用 | 分子生物学 | NA | RNA聚合酶纯化、转录因子重构、体外转录分析 | NA | 生化实验数据 | NA | NA | Bacillus velezensis | NA | 合成生物学、天然产物发现 |
| 307 | 2025-10-29 |
Specialized Pro-Resolving Mediator Loaded Extracellular Vesicles Mitigate Pulmonary Inflammation
2025-Oct-22, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2025-0398OC
PMID:41124277
|
研究论文 | 开发了一种基于合成生物学的策略,将促消退脂质介质加载到细胞外囊泡中,用于减轻肺部炎症 | 首次利用合成生物学方法在HEK293T细胞中共同表达多种酶,生产并包装促消退介质到细胞外囊泡中 | 未评估长期安全性和在其他炎症模型中的效果 | 开发装载促消退介质的细胞外囊泡用于炎症治疗 | 细胞外囊泡、促消退脂质介质、炎症反应 | 合成生物学 | 急性肺损伤 | 多基因表达载体构建、细胞转染、脂质介质分析 | NA | 细胞实验数据、动物模型数据 | HEK293T细胞、THP-1巨噬细胞、LPS处理的小鼠 | 多基因表达载体 | HEK293T细胞 | 共同表达COX-2、5-LOX和15-LOX酶的代谢通路,用于合成Resolvin D和E系列介质 | 医学 |
| 308 | 2025-10-28 |
The biosynthesis and diversity of taxanes: From pathway elucidation to engineering and synthetic biology
2025-Oct-13, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2025.101460
PMID:40696759
|
综述 | 本文综述紫杉烷生物合成途径解析及通过合成生物学策略开发可持续生产方法的研究进展 | 提出整合酶工程、代谢工程和人工智能引导的定向进化等策略,构建新型紫杉烷衍生物库 | 仅I型紫杉烷骨架生物合成途径接近完全解析,其他类型骨架途径仍不明确 | 阐明多种紫杉烷骨架生物合成途径并开发可持续生产方法 | 紫杉烷类二萜天然产物及其生物合成酶 | 合成生物学 | 癌症 | CRISPRi-dCas9基因回路、人工智能引导定向进化、代谢工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 本氏烟草、大肠杆菌、酿酒酵母 | 代谢途径工程、基因回路 | 医药 |
| 309 | 2025-10-26 |
Survival by Design: The BWC's Autopoietic Response at Fifty to a Disaggregated Biosecurity Ecosystem
2025 Sep-Oct, Health security
IF:2.1Q3
DOI:10.1177/23265094251381803
PMID:41043961
|
评论 | 本文分析《禁止生物武器公约》在日益复杂的全球生物安全生态系统中保持韧性的适应策略 | 将BWC概念化为自创生子系统,提出通过科学技术机制作为结构耦合装置来应对新兴生物技术挑战 | NA | 探讨BWC在生物技术快速发展背景下的适应性和有效性 | 《禁止生物武器公约》及其制度框架 | NA | NA | 合成生物学、生物信息学、人工智能 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 310 | 2025-10-24 |
MOSAIC: A Highly Efficient, One-Step Recombineering Approach to Plasmid Editing and Diversification
2025-Oct-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00657
PMID:40471122
|
研究论文 | 开发了一种名为MOSAIC的高效一步法重组工程方法,用于质粒编辑和多样化 | 使用单链DNA退火蛋白CspRecT实现高达90%的单靶点编辑效率,并能一次性在质粒四个不同区域生成组合质粒文库 | NA | 开发高效质粒编辑和组合质粒文库构建方法 | 质粒编辑和质粒文库构建 | 合成生物学 | NA | 重组工程,纳米孔测序 | NA | DNA序列数据 | NA | 重组工程,CspRecT | NA | 质粒编辑和多样化 | 分子生物学,合成生物学 |
| 311 | 2025-10-24 |
Broad-Host-Range Synthetic Biology: Rethinking Microbial Chassis as a Design Variable
2025-Oct-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00308
PMID:40964802
|
观点文章 | 本文探讨广宿主范围合成生物学如何将微生物宿主选择重新定义为设计变量 | 将宿主选择视为关键设计参数而非障碍,强调通过利用微生物多样性扩展生物技术设计空间 | NA | 重新定义微生物宿主在遗传设计中的作用 | 微生物宿主和工程遗传构建体 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 模块化载体, 宿主无关遗传设备 | 多种微生物宿主 | 资源分配, 代谢相互作用, 调控串扰 | 生物制造, 环境修复, 治疗 |
| 312 | 2025-10-24 |
Computational Pipeline for Targeted Integration and Variable Payload Expression in Bacteriophage Engineering
2025-Oct-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00450
PMID:40982657
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研究论文 | 开发了一种结合计算工具和经典基因组分析的噬菌体工程方法,用于靶向基因组有效载荷整合 | 使用基于机器学习的启动子预测工具PhagePromoter识别具有有利表达特征的基因间位点,建立了计算辅助的工程流程 | 仅在严格裂解性噬菌体K中验证了该方法,尚未在其他噬菌体系统中测试 | 扩展可行的遗传插入位点范围,增强噬菌体的治疗潜力 | 噬菌体基因组和生物发光报告基因 | 机器学习 | NA | 同源重组,启动子预测 | 机器学习模型 | 基因组数据 | 三个重组噬菌体 | 同源重组 | 噬菌体K | 靶向基因组有效载荷整合系统 | 医药 |
| 313 | 2025-10-24 |
A functional and applied perspective of Vitreoscilla hemoglobin: from oxygen carriage to biotechnological innovation
2025-Sep-04, Biotechnology letters
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s10529-025-03635-y
PMID:40908439
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综述 | 本文从功能和应用角度全面综述了透明颤菌血红蛋白的分子特性及其在生物技术领域的创新应用 | 整合了VHb转录因子相互作用、氧化还原偶联电子传递和定点诱变揭示的结构-功能关系等最新机制见解,并系统总结了vgb启动子作为强调控元件的新兴应用 | NA | 系统梳理透明颤菌血红蛋白的研究进展并展望其未来发展方向 | 透明颤菌血红蛋白(VHb)及其相关生物技术应用 | 合成生物学 | NA | 定点诱变、CRISPR调控表达平台、高细胞密度发酵 | NA | NA | NA | CRISPR | 哺乳动物系统、微生物 | 基于VHb的模块化组件 | 环境修复、精准农业、工业生物技术 |
| 314 | 2025-10-24 |
Glycyrrhiza, a commonly used medicinal herb: Review of species classification, pharmacology, active ingredient biosynthesis, and synthetic biology
2025-Sep, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.11.019
PMID:39551128
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综述 | 本文全面综述了甘草属植物的物种分类、药理活性、活性成分生物合成途径及合成生物学研究进展 | 整合多学科知识为甘草属研究提供独特而全面的视角,系统梳理活性成分生物合成途径与代谢工程策略 | NA | 为甘草分子育种和合成生物学领域的研究开发提供资源基础和理论支撑 | 甘草属植物及其活性成分(三萜类、黄酮类和多糖) | NA | NA | 多组学研究、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 生物合成途径 | 医药 |
| 315 | 2025-10-24 |
Engineering microalgal cell wall-anchored proteins using GP1 PPSPX motifs and releasing with intein-mediated fusion
2025-Jul-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.23.634604
PMID:39896471
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研究论文 | 本研究开发了一种基于GP1糖蛋白PPSPX基序和pH敏感内含肽的蛋白质锚定与可控释放系统 | 发现PPSPX基序是蛋白质锚定微藻细胞壁的关键信号,并首次将pH敏感内含肽用于可控释放锚定蛋白 | NA | 开发蛋白质空间定位和可控释放的技术平台 | 微藻细胞壁锚定蛋白系统 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、荧光动力学、Western blot分析 | NA | 荧光数据、蛋白质印迹数据 | NA | 内含肽介导的蛋白质融合 | 微藻 | 基于GP1 PPSPX基序的蛋白质锚定系统和pH敏感内含肽介导的释放系统 | 靶向药物递送,环境生物传感,生物催化剂部署 |
| 316 | 2025-10-24 |
Bioactive compounds from deep-sea extremophiles: emerging potential in cosmeceuticals and nutraceuticals
2025-Jan-10, FEMS microbiology letters
IF:2.2Q3
DOI:10.1093/femsle/fnaf102
PMID:40996452
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综述 | 系统探讨深海极端微生物生物活性化合物在化妆品和营养保健品领域的应用潜力 | 聚焦深海极端微生物这一未充分开发的生物资源,阐明其活性成分在抗衰老和健康促进方面的独特作用机制 | 规模化生物加工存在技术瓶颈,商业化应用面临法规合规性挑战 | 评估深海极端微生物在化妆品和营养保健品领域的生物技术应用潜力 | 深海极端微生物产生的生物活性化合物(极端酶、胞外多糖、微生物色素等) | 生物技术 | NA | 宏基因组学、高通量筛选、合成生物学、发酵优化 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药, 化妆品 |
| 317 | 2025-10-22 |
HUH endonuclease-mediated DNA-protein conjugates: sequence-specific tools and cellular applications
2025-Oct-21, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d5cc04628a
PMID:41032013
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综述 | 本文综述了HUH内切核酸酶作为自标记蛋白标签在序列特异性共价连接未修饰ssDNA方面的最新进展及其在细胞研究中的应用 | 利用HUH内切核酸酶实现序列特异性、生物正交且生理条件下稳健的DNA-蛋白质共价连接 | NA | 开发基于HUH内切核酸酶的DNA-蛋白质偶联工具及其在细胞研究中的应用 | HUH内切核酸酶及其DNA-蛋白质偶联物 | 合成生物学 | NA | HUH内切核酸酶技术、定向进化 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | NA | DNA-蛋白质偶联系统 | 医学, 合成生物学 |
| 318 | 2025-10-21 |
STRAIGHT-IN Dual: a platform for dual, single-copy integrations of DNA payloads and gene circuits into human induced pluripotent stem cell
2025-Sep-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.17.616637
PMID:39464154
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研究论文 | 开发了STRAIGHT-IN Dual平台,实现高效双DNA负载单拷贝整合到人诱导多能干细胞 | 首次实现同时、等位基因特异性、单拷贝整合两个DNA负载,效率达100%,且一周内完成 | NA | 开发高效基因工程平台用于干细胞精准工程 | 人诱导多能干细胞(hiPSCs) | 合成生物学 | NA | 基因整合技术 | NA | 基因表达数据 | NA | STRAIGHT-IN平台 | 人诱导多能干细胞 | grazoprevir诱导型synZiFTR系统,四环素诱导系统,基因回路设计 | 医学 |
| 319 | 2025-10-21 |
From Knallgas Bacterium to Promising Biomanufacturing Host: The Evolution of Cupriavidus necator
2025, Advances in biochemical engineering/biotechnology
DOI:10.1007/10_2024_269
PMID:39363001
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综述 | 深入探讨了Cupriavidus necator从克纳尔加斯细菌发展为有前景的生物制造宿主的演化历程 | 系统总结了C. necator在过去十年中在分子生物学工具、代谢工程和创新发酵策略领域取得的显著技术进步 | NA | 推动从化石燃料经济向可持续生物经济的转型,促进可持续生物加工和生物产品开发的未来发展 | Cupriavidus necator微生物及其在生物制造中的应用 | 合成生物学 | NA | 分子生物学工具、代谢工程、发酵策略 | NA | NA | NA | NA | Cupriavidus necator | NA | 工业生物技术 |
| 320 | 2025-10-20 |
Transcriptomic functional characterization of recombinant adeno-associated virus producing cell line adapted to suspension-growth
2025 Sep-Oct, Biotechnology progress
IF:2.5Q3
DOI:10.1002/btpr.70042
PMID:40396307
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法开发了可悬浮培养的重组腺相关病毒生产细胞系,并分析了其转录组功能特征 | 首次将HEK293为基础的rAAV生产细胞系成功适应于无血清悬浮培养,并通过转录组分析揭示了不同培养条件下细胞对病毒生产的响应差异 | 悬浮培养的细胞系病毒滴度显著降低,即使优化后生产力也只能恢复到贴壁培养的25%-50% | 开发可规模化生产的重组腺相关病毒生产系统 | 重组腺相关病毒生产细胞系GX6B及其悬浮适应株GX6Bs | 合成生物学 | NA | 转录组分析 | NA | 基因表达数据 | HEK293衍生细胞系 | 合成生物学方法 | HEK293细胞 | 整合了AAV和腺病毒辅助组件编码基因的合成基因回路 | 医学 |