本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2026-07-30 |
Xeno-nucleic acids support formation of Ag(I)-mediated duplexes and silver nanoclusters
2026-Feb-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag132
PMID:41705510
|
研究论文 | 本研究探索异源核酸(XNAs)在银离子介导的双链体形成和银纳米团簇稳定化中的应用 | 首次证明XNAs能够形成银离子介导的双链体结构,并发现其骨架化学可调控银纳米团簇的光谱特性,为合成生物学和纳米材料提供了新工具 | 未提及具体实验条件优化或长期稳定性分析 | 研究XNAs在金属介导的相互作用和纳米材料形成中的潜力 | 多种骨架组成的异源核酸(XNAs)和DNA对照 | 合成生物学 | NA | 圆二色光谱法、质谱法 | NA | 光谱数据、质谱数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 纳米材料 |
| 302 | 2026-07-30 |
Next-Generation Immune Checkpoints and Tumor Microenvironment Modulation in Cancer Immunotherapy
2026, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/jimr/7864229
PMID:41811823
|
综述 | 全面审查下一代免疫检查点及肿瘤微环境调节在癌症免疫疗法中的作用 | 总结了共抑制性和共刺激性新一代免疫检查点(如LAG-3、TIM-3、ICOS等)的分子机制、临床证据,并整合了免疫代谢、先天免疫传感、细胞因子信号及肠道菌群等互补策略,提出基于多组学和AI的精准免疫肿瘤学框架 | 主要基于现有文献和临床试验,缺乏对长期疗效或毒性比较的直接原始数据,未涉及真实世界患者异质性分析 | 探讨下一代免疫检查点及肿瘤微环境调控策略以提高癌症免疫疗法的疗效和适用范围 | 新一代免疫检查点分子(LAG-3、TIM-3、TIGIT、VISTA、IGSF8等)及TME调节机制(IDO1、CD73、TLRs、IL-2等) | 机器学习, 系统生物学 | 癌症 | NA | NA | 文本, 临床数据 | 大量的临床试验(如LAG-3的6项、TIM-3的4项等) | NA | NA | NA | 医学 |
| 303 | 2026-07-30 |
Evaluating AI-assisted customer verification for synthetic nucleic acid screening
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1819556
PMID:42516423
|
研究论文 | 评估大型语言模型在合成核酸订购客户身份验证中的辅助作用 | 首次系统比较五种大型语言模型与人类专家在合成核酸合法性筛查中的表现,发现AI在准确率上与人类无显著差异,且成本仅为人类的十分之一 | 未提及具体局限性 | 评估AI工具是否能有效辅助合成核酸订购的合法性筛查过程 | 来自全球的生命科学研究人员客户资料 | 自然语言处理 | NA | NA | 大型语言模型(Gemini 2.5 Pro等) | 文本 | 未明确样本数量,涉及全球生命科学研究人员客户资料 | NA | NA | NA | 生物技术安全、公共卫生 |
| 304 | 2026-07-30 |
Synthetic biology and genome engineering in support of human, agricultural, and environmental security
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1820360
PMID:42518765
|
评论文章 | 探讨合成生物学和基因组工程在保障人类、农业和环境安全方面的当前和潜在益处,以平衡生物安全风险讨论 | 强调在生物安全监管辩论中,政策制定者需同时关注合成生物学技术的积极应用价值,提供风险与收益的平衡视角 | NA | 概述合成生物学和基因组工程对人类健康、农业和环境安全的潜在社会、经济和环境价值 | 核酸合成调控、生物安全治理、医疗健康技术、生物制造、食品农业创新、环境生物传感器及生态修复干预 | NA | NA | 核酸合成 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 环境生物传感器 | 医药, 农业, 环境, 工业生物技术 |
| 305 | 2026-07-30 |
Anticancer natural products from the Middle East and North Africa: biodiversity, mechanisms, and translational challenges
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1846357
PMID:42518807
|
综述 | 系统回顾中东和北非地区来源的天然抗癌产物,涵盖其生物多样性、作用机制及转化挑战 | 首次聚焦MENA地区特有生物资源中的抗癌天然产物,结合新技术(高通量筛选、宏基因组学、AI预测)阐述发现策略,并强调该区域的未被充分开发潜力 | 未提供具体临床前或临床试验数据验证化合物的疗效与安全性,综述性质缺乏原创新实验证据 | 评估MENA地区天然产物作为抗癌药物的潜力,并探讨其从发现到临床转化的路径与挑战 | MENA地区植物、真菌、海洋生物和环境细菌中分离的天然产物 | 数字病理学 | 癌症 | 高通量表型筛选,生化筛选,宏基因组学,基因组挖掘,生物合成基因簇激活,合成生物学,多组学整合,人工智能预测,异源表达 | NA | 文本与综述数据 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学 |
| 306 | 2026-07-30 |
Base modifications reshape RNA folding landscapes and structure-function relationships in synthetic and natural RNAs
2025-May-29, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6465433/v1
PMID:40502763
|
研究论文 | 本文研究了5-甲基胞嘧啶和N1-甲基假尿苷等修饰碱基对RNA三维折叠景观及结构-功能关系的影响 | 首次揭示碱基修饰通过改变关键连接处的堆积能量而非碱基配对来驱动RNA构象转变,并影响其动力学成熟 | 未涉及其他常见修饰碱基(如假尿苷、N6-甲基腺苷)的影响,且仅在两种特定RNA结构中进行验证 | 阐明碱基修饰对RNA折叠和功能的影响机制,为合成生物学和治疗方法中功能性RNA的开发提供设计原则 | 工程化RNA折纸纳米结构和天然核酶 | 合成生物学, 结构生物学 | NA | 冷冻电镜, FRET | NA | 图像 | 两种RNA结构 | RNA折纸 | NA | RNA折纸纳米结构, 核酶 | 医学, 合成生物学 |
| 307 | 2026-07-30 |
Generation of cell-sized liposomes using laser-induced microjets
2025-05-28, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d5lc00149h
PMID:40302460
|
研究论文 | 提出一种利用激光诱导高速微射流穿透含脂油相来生成细胞大小脂质体的新方法 | 首次采用高速激光诱导微射流技术实现按需、可靠且可重复地生成细胞大小脂质体 | 未提及具体局限性 | 开发一种按需生产脂质体的新方法,推动合成生物学和膜科学的发展 | 细胞大小的脂质体 | 合成生物学 | NA | 激光诱导微射流 | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | 生物化学研究,合成生物学 |
| 308 | 2026-07-30 |
Orthogonal RNA replication enables directed evolution and Darwinian adaptation in mammalian cells
2025-03, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01783-2
PMID:39753704
|
research paper | 该研究开发了一种正交的α病毒RNA复制系统,能够在哺乳动物细胞中实现RNA基装置的定向进化和达尔文适应 | 首次在哺乳动物细胞中建立正交RNA复制系统用于定向进化,无需宿主基因组干扰,可产生大规模连续多样化RNA文库,并支持达尔文适应性进化 | 目前仅针对RNA基装置进行进化,未验证对DNA基或蛋白质基装置的适用性;系统复杂性可能影响其普适性和易用性 | 开发哺乳动物细胞中高效、可控的RNA定向进化平台 | RNA基装置(如荧光蛋白和转录因子) | synthetic biology | NA | RNA replication, directed evolution | NA | NA | NA | NA | mammalian cells | orthogonal alphaviral RNA replication system | synthetic biology, cell engineering |
| 309 | 2026-07-30 |
Tumor-specific antibodies elicited by engineered bacteria promote bladder cancer immunotherapy
2024-Oct-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.24.620122
PMID:39554157
|
研究论文 | 利用工程化细菌表达趋化因子CXCL13,增强膀胱癌免疫治疗效果 | 首次将工程化益生菌用于表达人类趋化因子CXCL13,通过诱发生发中心反应增强抗肿瘤体液免疫,并与PD-1阻断联合提高疗效 | NA | 探究工程化细菌表达CXCL13能否增强膀胱癌免疫治疗的效果 | 膀胱癌原位小鼠模型及工程化大肠杆菌Nissle 1917 (EcN) | 合成生物学,肿瘤免疫治疗 | 膀胱癌 | 合成生物学,细菌工程改造 | NA | NA | NA | 合成生物学工程细菌 | 大肠杆菌Nissle 1917 (EcN) | 表达CXCL13的基因电路 | 医药 |
| 310 | 2026-07-29 |
Global research trends and hotspots of plant physiologically active substances: quantitative visualization analysis based on CiteSpace
2026-Aug, Plant biology (Stuttgart, Germany)
DOI:10.1111/plb.70219
PMID:42287740
|
综述 | 利用CiteSpace对植物生理活性物质领域2000-2024年间8096篇文献进行文献计量与可视化分析 | 首次系统揭示植物生理活性物质研究从基础化合物分离向机制研究、功能食品和纳米递送系统转变的趋势 | 仅基于Web of Science核心合集数据,可能遗漏其他重要数据库来源 | 分析植物生理活性物质全球研究趋势与热点演变 | 2000-2024年间植物生理活性物质相关研究文献 | 文献计量学 | NA | 文献计量分析、可视化分析 | NA | 文本 | 8096篇文献 | NA | NA | NA | 健康、营养、工业 |
| 311 | 2026-07-29 |
An Engineered Multicellular Bacterial Network for Simultaneously Answering Multiple Computational Decision Problems
2026-Jul-28, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.70325
PMID:42517293
|
研究论文 | 通过分子遗传工程改造的多细胞细菌网络,在同一系统中同时解答多种计算决策问题,成功识别0-9范围内的四种素数类型 | 首次使用分子遗传工程细菌构建的人工神经网络架构,实现单一系统同时解答四个不同计算决策问题 | 目前仅限于0-9范围内的素数识别,且工程细胞数量最多扩展至六种,系统规模有限 | 验证工程细菌网络能否在单一系统中同时解答多个计算决策问题 | 经过分子遗传工程改造的大肠杆菌群体 | 合成生物学, 生物计算 | NA | 合成基因调控网络, 荧光蛋白表达 | 单层人工神经网络 | 荧光蛋白表达模式 | 四种或六种不同工程细胞类型 | NA | 大肠杆菌 | 合成基因调控网络, 人工神经突触模块 | 合成生物学, 生物计算, 人工智能湿件 |
| 312 | 2026-07-29 |
Metabolic fermentation pathways of microalgae for the synthesis of high-value chemical products
2026-Jul-27, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.135509
PMID:42508660
|
综述 | 综述微藻通过发酵途径转化为高价值化学产品的生化多样性及代谢工程进展 | 系统总结了微藻中糖类、蛋白质等组分经酒精发酵、暗发酵和ABE发酵转化为醇类、有机酸、萜类等高价值化合物的酶学机制,并重点关注了代谢工程优化菌株(如酿酒酵母、梭菌)以提高产量的最新进展 | 研究空白在于类胡萝卜素丰富的微藻(如杜氏藻、血球藻)用于萜类/异戊二烯生产的发酵研究仍不充分 | 探讨微藻生物质经发酵合成高价值化学产品的潜力,并强调合成生物学与实时生物传感器在工业过程中的应用前景 | 微藻(小球藻、节螺藻、微绿球藻、栅藻、绿球藻)及工程菌(酿酒酵母、丙酮丁醇梭菌) | NA | NA | 发酵(酒精发酵、暗发酵、ABE发酵)、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母、丙酮丁醇梭菌 | 代谢途径(糖类发酵产乙醇、蛋白质发酵产高级醇和挥发性脂肪酸、脂质转化产生物柴油、类胡萝卜素转化产异戊二烯和萜类) | 工业生物技术 |
| 313 | 2026-07-29 |
Plant-cyanobacterial symbioses: mutualism with emerging translational possibilities
2026-Jul-27, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2026.07.007
PMID:42509115
|
综述 | 探讨植物-蓝藻共生关系作为作物固氮替代路径的潜力 | 提出以植物-蓝藻共生为作物固氮工程替代方案,聚焦共生早期保守步骤可能简化策略 | 未明确讨论共生工程的具体技术障碍或规模化应用的可行性 | 探索植物-蓝藻共生在合成生物学中实现作物固氮的转化可能性 | 植物-蓝藻共生关系 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 植物 | 固氮共生通路 | 农业 |
| 314 | 2026-07-29 |
Tumor-specific antibodies elicited by engineered bacteria promote bladder cancer immunotherapy in preclinical mouse models
2026-Jul-22, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adv7600
PMID:42485436
|
research paper | 使用工程化细菌表达CXCL13以增强膀胱癌免疫治疗在小鼠模型中的效果 | 首次利用工程化益生菌大肠杆菌Nissle 1917表达CXCL13,通过触发生发中心反应来增强肿瘤特异性体液免疫,并与PD-1阻断联合改善膀胱癌治疗效果 | 研究仅基于原位小鼠模型,尚未在人类患者中进行验证 | 探讨工程化细菌是否能够通过增强体液免疫来提升免疫检查点阻断疗法的抗癌效果 | 原位膀胱癌小鼠模型 | machine learning | bladder cancer | NA | NA | NA | 使用多个原位膀胱癌小鼠模型,具体样本数量未说明 | CRISPR-Cas9 | E. coli Nissle 1917 | 表达人CXCL13的合成基因回路 | medicine |
| 315 | 2026-07-29 |
Multi-level precise regulation of gene transcription in the yeast Saccharomyces cerevisiae based on light-sensitive CRISPR/Cas systems
2026-Jul-17, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag719
PMID:42507484
|
研究论文 | 本研究基于光敏CRISPR/Cas系统在酿酒酵母中实现多层次的基因转录精准调控 | 整合翻译和翻译后水平的光遗传调控模式,实现dCas9蛋白的多层次精密调控,从而灵活调节目标基因转录水平 | 调控敏感度仍有待提高,且主要基于荧光蛋白验证,实际应用效果有待进一步评估 | 构建基于光敏CRISPR/Cas系统的多层次基因转录调控方法,提升调控灵活性和灵敏度 | 酿酒酵母中的基因转录及dCas9蛋白调控 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas系统,光遗传学 | NA | 荧光强度数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | 光遗传调控的CRISPR基因转录回路 | 合成生物学, 基因调控网络研究 |
| 316 | 2026-07-29 |
Programmable Nucleic Acid Sensing in Human Cells Using Circularizable ssDNA
2026-Jun-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-73990-5
PMID:42248894
|
研究论文 | 开发了一种名为SONAR的平台,利用可环化单链DNA传感器在人类细胞中检测目标核酸序列并触发可控基因表达 | 首次利用可环化单链DNA传感器在人类细胞中实现程序化核酸感知,并通过细胞连接酶依赖的环化驱动基因表达 | 未提及明显的局限性 | 开发能够在活细胞中感知核酸信号并触发细胞功能的可编程技术 | 人类细胞中的DNA和RNA序列 | 合成生物学 | NA | 可环化单链DNA传感器、反义寡核苷酸、逆转录 | NA | 核酸序列 | NA | NA | 人类细胞 | 核酸传感器电路,通过可环化单链DNA与互补核酸杂交后经细胞连接酶环化驱动基因表达 | 医学, 诊断, 治疗, 合成生物学 |
| 317 | 2026-07-29 |
Synthetic Mirror Bacteria as a Frontier for Chiral Synthetic Biology and Biocontainment
2026-06, MicrobiologyOpen
IF:3.9Q2
DOI:10.1002/mbo3.70356
PMID:42338029
|
综述 | 本文综述了镜像细菌的理论发展,探讨其分子基础、工程策略、生物安全及生态影响 | 系统总结了镜像生物学体系在分子倒置手性下的构建前景,强调了手性层次结构与立体化学约束,并分析了从理论到实验可行性的关键挑战 | 镜像细菌仍停留在理论阶段,尚未实现自我复制的镜像细胞系统,且缺乏实验验证 | 评估镜像细菌的理论可行性及相关生物安全与生态风险 | 镜像细菌及镜像生物分子(镜像蛋白质和镜像核酸) | 合成生物学 | NA | 化学合成(镜像蛋白质和镜像核酸) | NA | NA | NA | NA | NA | 镜像生物系统(手性倒置的生化框架) | 生物安全、生态评估 |
| 318 | 2026-07-29 |
Effector Triggered Susceptibility and Immunity in Bacterial Diseases of Leaf Blight and Streak in Rice
2026-Feb-27, Rice (New York, N.Y.)
DOI:10.1186/s12284-026-00885-w
PMID:41758451
|
综述 | 本文综述了水稻细菌性叶片枯病和条斑病中的效应蛋白触发的感病性和免疫机制 | 整合了最新研究成果,详细介绍了TAL效应子和Xops的结构与功能多样性及其宿主靶标,并讨论了利用CRISPR基因编辑、效应子引导育种和合成生物学策略培育广谱持久抗性的新兴方法 | 未解决的关键问题被指出,但未提供具体实验验证 | 总结水稻细菌性叶片枯病和条斑病中效应蛋白触发的感病性和免疫分子机制,并探索可持续病害管理策略 | 水稻及病原菌黄单胞菌(Xoo和Xoc) | 分子植物病理学 | 水稻细菌性叶片枯病、水稻细菌性条斑病 | CRISPR基因编辑 | NA | 文献综述 | NA | CRISPR-Cas9 | 水稻 | NA | 农业 |
| 319 | 2026-07-29 |
Recognition of Non-standard Base Pairs by Triplex-Forming Oligonucleotides Containing an Expanded Genetic Alphabet
2026-Feb-17, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-8652009/v1
PMID:41756467
|
研究论文 | 利用扩展遗传字母系统的三链形成寡核苷酸识别非标准碱基对的研究 | 首次利用人工扩展遗传信息系统(AEGIS)中的核碱基扩展了三链形成寡核苷酸(TFO)的识别空间,发现了至少12种新的模块化三联体,能在中性pH下以纳摩尔亲和力靶向包含标准、损伤或合成碱基对的双链DNA | 未提及实际应用中的潜在脱靶效应或体内验证,且仅针对体外酶组装的双链构建体进行验证 | 开发使用扩展遗传字母系统的三链形成寡核苷酸以实现对双链DNA的序列特异性识别 | 双链DNA中的非标准碱基对,包括标准、损伤和合成碱基对 | 合成生物学 | NA | Hoogsteen碱基配对 | NA | 实验数据 | 120种碱基三联体组合 | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学 |
| 320 | 2026-07-29 |
Engineered probiotics: a new era in treating inflammatory bowel disease
2025-11-04, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07271-y
PMID:41188868
|
综述 | 总结了工程益生菌在炎症性肠病诊断和治疗中的最新研究进展,探讨其通过基因编辑工具构建以调节肠道微环境的机制 | 首次全面阐述利用CRISPR-Cas9等基因编辑工具构建的工程益生菌在IBD治疗中的多种机制,包括靶向递送抗炎因子、清除活性氧、恢复屏障完整性和调节微生物稳态,并结合智能响应系统实现实时监测和动态释放治疗分子 | 文中提及主要为临床前研究,缺乏大规模临床试验验证,可能存在的长期安全性和免疫原性问题未详细讨论 | 总结工程益生菌在炎症性肠病诊断和治疗中应用的进展,为微生物组驱动的IBD治疗干预提供见解 | 工程益生菌及其在炎症性肠病治疗中的应用 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 多种微生物(具体种类未指定) | 智能响应型工程益生菌回路,包括靶向递送抗炎因子、清除活性氧、恢复屏障功能和调节微生物稳态 | 医药 |