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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2026-05-26 |
Functions and optimization of soft law in the international governance of synthetic biology: The predicament of hard law vs. the rise of soft law
2026-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.11.005
PMID:42179736
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研究论文 | 探讨合成生物学国际治理中软法与硬法的功能分工与协作模式,指出软法在应对伦理风险方面的优势及与硬法协同的必要性 | 提出“软法引导、硬法固化、软法反馈”的混合治理模型,强调软法在技术适应性、共识构建和灵活性方面的不可替代作用 | 未具体讨论软法实施效果和定量评估指标,缺乏对各国实际采纳情况的实证分析 | 分析合成生物学国际治理中软法与硬法的现有困境,提出优化协作的治理框架 | 合成生物学领域的国际法律体系(BWC、CBD)及软法工具(伦理指南、政策建议、行为准则) | 政策与法律研究 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学国际治理 |
| 302 | 2026-05-26 |
Transcriptome-Guided Identification of N-Acetyltransferases Involved in Melatonin Biosynthesis in a Streptomyces-Based Cell Factory
2026-May-27, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.70390
PMID:42178992
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研究论文 | 通过转录组引导挖掘,鉴定了链霉菌细胞工厂中参与褪黑素生物合成的N-乙酰转移酶,并优化菌株实现产量提升65% | 首次利用转录组引导方法鉴定链霉菌中参与褪黑素生物合成的内源N-乙酰转移酶,并通过工程改造显著提高产量 | 未明确说明局限性 | 开发可持续的微生物褪黑素生物合成方法 | 工程改造的白色链霉菌(Streptomyces albus)菌株 | 合成生物学 | NA | 转录组引导挖掘、基因工程 | NA | 转录组数据 | 一个工程菌株及多个衍生菌株 | 基因敲除、过表达 | 白色链霉菌(Streptomyces albus) | 从头合成的褪黑素生物合成途径 | 医药、工业生物技术 |
| 303 | 2026-05-26 |
Spontaneous Non-Catalyzed Molecular Reactions and Interactions in the Human Body: Biomedical Implications
2026-May-25, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202524277
PMID:42183827
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综述 | 综述人体内自发非催化分子反应与相互作用的生物医学应用 | 系统总结了无酶介导下自发发生的分子反应与相互作用,并探讨其在疾病诊断、药物递送、再生工程及合成生物学中的新兴机遇 | 未深入讨论这些反应与相互作用的体内定量分析及长期安全性问题 | 阐明非催化分子反应在生物医学领域的应用前景 | 人体内小分子、蛋白质、细胞等组分间的非催化反应与相互作用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 人类 | NA | 医学 |
| 304 | 2026-05-26 |
Exploring specialized metabolic pathways in medicinal plants with single-cell and spatial omics
2026-May, Acta pharmaceutica Sinica. B
DOI:10.1016/j.apsb.2025.12.023
PMID:42180555
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综述 | 探讨单细胞和空间组学技术在药用植物特殊代谢途径研究中的应用 | 综述了单细胞和空间组学技术在解析药用植物细胞类型特异性代谢途径中的前沿进展,如单萜吲哚生物碱和紫杉醇的生物合成研究 | 未明确指出技术应用的具体局限性,但隐含了当前方法在数据处理和成本方面的潜在挑战 | 总结单细胞和空间组学技术进展,评估其在代谢途径发现和分区中的应用,并探讨其在植物合成生物学和代谢工程中的未来方向 | 药用植物中特殊代谢物的生物合成途径 | 数字病理学 | NA | 单细胞组学、空间组学 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | NA | NA | 药用植物 | NA | 医药、合成生物学 |
| 305 | 2026-05-26 |
Biofilm engineering through c-di-GMP tuning boosts bioleaching efficiency and arsenic tolerance in Acidithiobacillus ferrooxidans
2026-03-18, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.02288-25
PMID:41705824
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研究论文 | 通过调控c-di-GMP信号增强氧化亚铁硫杆菌的生物膜形成、生物浸出效率和砷耐受性 | 通过靶向调控全局调控分子c-di-GMP,同时增强生物浸出效率和重金属耐受性,克服了传统单性状修饰的局限性 | NA | 提高生物浸出效率和重金属耐受性,实现环境友好的生物浸出和尾矿回收 | 氧化亚铁硫杆菌(Acidithiobacillus ferrooxidans) | 合成生物学 | NA | 遗传工程, 转录组学分析 | NA | 基因表达数据 | 三个工程菌株(S-222、S-306、S-651)与对照 | NA | 氧化亚铁硫杆菌(Acidithiobacillus ferrooxidans) | c-di-GMP信号通路调制,包括双鸟苷酸环化酶基因过表达 | 环境生物技术, 工业生物技术 |
| 306 | 2026-05-26 |
Arboviral Diseases in a Changing World: Evolutionary Dynamics, Host-Vector Interactions, and Novel Control Strategies
2026-Feb, Vector borne and zoonotic diseases (Larchmont, N.Y.)
DOI:10.1177/15303667251376450
PMID:40955762
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综述 | 系统综述虫媒病毒在气候变化背景下的进化动态、宿主-媒介互作及新型防控策略 | 整合基因组分析、元流行病学综合与预测建模的多学科框架,系统阐述CRISPR基因驱动、沃尔巴克氏体干预及mRNA疫苗等新型防控策略 | 伦理、生态和监管问题(如基因编辑和微生物干预)需进一步考量 | 理解虫媒病毒进化机制、宿主-媒介互作及新型控制策略以有效缓解疾病 | 登革病毒、寨卡病毒、基孔肯雅病毒、西尼罗病毒等虫媒病毒及其媒介(蚊、蜱) | NA | 虫媒病毒病 | 基因组分析、元流行病学综合、预测建模 | NA | 文献数据 | 从16320篇初始文献中筛选出12项高质量同行评审研究 | CRISPR基因驱动 | 蚊、蜱 | 基因驱动回路、基于RNAi的抗病毒回路 | 医学 |
| 307 | 2026-05-26 |
Next-Generation Probiotics: From Traditional Strains to Personalized Therapeutics
2026-01, Molecular nutrition & food research
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mnfr.70339
PMID:41327880
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review | 本文综述了从传统益生菌到下一代益生菌的演变,重点比较了机制差异和功能进步,并探讨了合成生物学、人工智能和微生物组分析在个性化益生菌治疗中的潜力 | 系统对比传统益生菌与下一代益生菌在机制上的区别,引入合成生物学可编程基因电路和人工智能驱动的个性化治疗策略 | 广泛临床应用仍处于早期阶段,面临安全性、监管和转化方面的挑战 | 比较传统与下一代益生菌,探讨个性化治疗的前沿进展 | 传统益生菌(如乳杆菌属、双歧杆菌属)与下一代益生菌(如阿克曼氏菌、普拉梭菌) | NA | 代谢性疾病、炎症性疾病、神经系统疾病 | 合成生物学、微生物组分析 | NA | NA | NA | 可编程基因电路 | 人体肠道微生物 | 可编程基因电路 | 医学、营养学 |
| 308 | 2026-05-26 |
Gut-engineered Bacillus subtilis-mediated BAMBI delivery for the treatment of thioacetamide-induced liver fibrosis through mechanotransduction inhibition
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1817519
PMID:42183058
|
研究论文 | 利用肠道工程化枯草芽孢杆菌递送BAMBI蛋白治疗硫代乙酰胺诱导的肝纤维化 | 首次采用遗传工程枯草芽孢杆菌通过肠-肝轴持续递送BAMBI蛋白,同时抑制生化信号和机械传导,创新性地将合成生物学与机械生物学相结合治疗肝纤维化 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人体中验证;需评估长期口服活菌的安全性和潜在副作用 | 开发一种基于工程微生物的肝纤维化治疗方法,通过抑制机械传导来逆转肝纤维化 | 经硫代乙酰胺诱导肝纤维化的小鼠模型 | 合成生物学 | 肝纤维化 | 遗传工程、口服给药、组织分析、血清标志物检测 | NA | 实验数据(组织学评分、血清生化指标、蛋白表达数据) | 小鼠模型,具体数量未在摘要中说明 | NA | 枯草芽孢杆菌 | 构建持续分泌BAMBI蛋白的基因电路 | 医学 |
| 309 | 2026-05-26 |
Microbial production of 5-epi-jinkoheremol, a plant-derived antifungal sesquiterpene
2024-10-23, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.01191-24
PMID:39283105
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研究论文 | 利用微生物平台高效生产植物源抗真菌倍半萜5-epi-jinkoheremol | 首次构建高效微生物细胞工厂可持续生产该抗真菌倍半萜,通过蛋白质工程优化关键酶TPS18提升催化活性和稳定性 | 研究未评估大规模发酵的经济可行性和实际农业应用效果 | 构建微生物平台实现植物源抗真菌倍半萜的高水平生产 | 5-epi-jinkoheremol及其合成酶TPS18 | 合成生物学 | 作物真菌病害 | 代谢工程,蛋白质工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | 甲羟戊酸和甾醇生物合成途径优化,转录因子Hac1和mA写入因子Ime4代谢工程策略 | 农业 |
| 310 | 2026-05-26 |
Optogenetic and chemogenetic approaches for modeling neurological disorders in vivo
2024-04, Progress in neurobiology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.pneurobio.2024.102600
PMID:38548126
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综述 | 综述基于光遗传学和化学遗传学的动物模型在模拟人类神经疾病中的应用 | 利用光遗传学和化学遗传学等合成生物学方法,在细胞层面精准诱导病理状态,模拟多种人类神经疾病,提供传统模型无法实现的新机遇 | 未明确说明具体局限性 | 总结基于光遗传学和化学遗传学的神经疾病动物模型及其未来发展方向 | 光遗传学和化学遗传学动物模型 | NA | 神经疾病, 阿尔茨海默病, 帕金森病, 肌萎缩侧索硬化, 癫痫, 共济失调 | 光遗传学, 化学遗传学 | NA | NA | NA | 光遗传学, 化学遗传学 | 动物(未指定具体物种) | 光遗传和化学遗传调控通路 | 医学 |
| 311 | 2026-05-26 |
Design and assembly of the 117-kb Phaeodactylum tricornutum chloroplast genome
2024-03-29, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiad670
PMID:38114089
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研究论文 | 展示两种方法克隆三角褐指藻117-kb叶绿体基因组,并通过酵母组装实现高效克隆和工程改造 | 首次实现了高效克隆117-kb藻类叶绿体基因组,并设计了可线性化和整合表达盒的SapI位点,为叶绿体合成生物学底盘开发提供了新方法 | 该方法可能仅适用于类似基因组大小和结构的物种(如假微型海链藻),且尚未验证在藻类叶绿体中的实际递送和表达效果 | 开发高效克隆和工程改造叶绿体基因组的技术,拓展光合真核生物的合成生物学底盘 | 三角褐指藻的叶绿体基因组 | 合成生物学 | NA | 酵母组装, 金门克隆, PCR扩增 | NA | DNA序列 | 10个酵母菌落 | 酵母组装, 金门克隆 | 酿酒酵母, 大肠杆菌 | NA | 工业生物技术, 农业 |
| 312 | 2026-05-25 |
Bacillus-derived antimicrobial peptides as alternatives to antibiotics in poultry: mechanisms, applications, and future prospects- a review
2026-May-23, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-026-04941-3
PMID:42176025
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综述 | 综述了芽孢杆菌源抗菌肽作为家禽中抗生素替代品的机制、应用及未来前景 | 系统总结了芽孢杆菌源抗菌肽(包括核糖体合成细菌素和非核糖体合成脂肽)的结构多样性、多机制作用(膜靶向、生物膜调节、免疫调节及霉菌毒素相关肠道保护)以及其在替代抗生素中的潜力与挑战 | 抗菌肽活性受肽类、配方、微生物生态和宿主生理因素影响,可能存在适应性或基因编码耐药性,且面临肽不稳定性、体内疗效差异、菌株特异性差异、安全性问题及缺乏标准化比较模型等转化挑战 | 评估芽孢杆菌源抗菌肽作为家禽中抗生素替代品的可行性,并探讨其作用机制、应用限制及未来发展方向 | 家禽病原菌及芽孢杆菌源抗菌肽 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 芽孢杆菌 | NA | 农业, 食品 |
| 313 | 2026-05-25 |
Bacterial 3D genome architecture: organization, regulation, and synthetic biology applications
2026-May-23, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04117-8
PMID:42177580
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综述 | 综述细菌三维基因组结构的组织、调控机制及其在合成生物学中的应用 | 整合染色体构象捕获与成像研究的见解,突出基因组架构对环境信号的动态响应,并探讨三维基因组学在合成生物学中的潜在应用 | 细菌基因组架构及其调控的详细原则尚未完全阐明 | 理解细菌三维基因组的结构组织、调控因素以及在合成生物学中的应用前景 | 细菌三维基因组架构及其调控因子 | NA | NA | 染色体构象捕获, 成像 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 合成生物学, 医学 |
| 314 | 2026-05-25 |
Tunable low-rate genomic recombination with Cre-lox in Escherichia coli: a versatile tool for anoxic environmental biosensing and synthetic biology
2026-04-22, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.01768-25
PMID:41870091
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研究论文 | 开发了一种在大肠杆菌中利用Cre-lox系统实现可调低速率基因组重组的方法,应用于厌氧环境生物传感和合成生物学 | 开发了严格调控、可滴定的Cre重组酶系统,实现了低重组率和最小基础活性,并展示了其在厌氧砷检测中的实用性 | 论文未明确说明系统的长期稳定性和潜在脱靶效应 | 开发可用于环境生物传感和合成生物学的可调低速率基因组重组工具 | 大肠杆菌及基于重组的砷生物传感器 | 合成生物学 | NA | Cre-lox位点特异性重组 | NA | NA | 未明确样本数量 | Cre-lox系统 | 大肠杆菌 | 基于Cre-lox的砷响应生物传感器电路 | 环境监测, 合成生物学 |
| 315 | 2026-05-25 |
Amalgamation of Biofilms and Synthetic Biology: A Paradigm Shift in Biotechnology
2026-Feb-17, Medical principles and practice : international journal of the Kuwait University, Health Science Centre
IF:2.9Q1
DOI:10.1159/000550994
PMID:41701651
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综述 | 本文综述了生物膜工程与合成生物学交叉领域的最新进展,重点介绍了调控生物膜行为以用于生物技术应用和解决相关挑战的策略 | 整合了噬菌体疗法、电遗传系统、微生物联合体设计、群体感应调控、遗传电路、胞外聚合物修饰和抗菌肽涂层表面等多种策略,实现了对生物膜结构、组成和代谢输出的精确调控 | 存在生物安全性、异质性、可扩展性和监管合规性等挑战 | 探讨合成生物学工具在生物膜工程中的应用,以优化生物膜在废水处理、生物修复、生物能源和诊断等领域的性能,并控制致病性生物膜 | 生物膜及其工程化系统 | 机器学习 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 遗传电路 | 环境, 能源, 医学 |
| 316 | 2026-05-25 |
Predicting lasso peptide structure with LassoPred
2026, Methods in enzymology
DOI:10.1016/bs.mie.2026.01.037
PMID:42177065
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研究论文 | 提出LassoPred,一个基于机器学习的模块化计算流程,用于从序列预测套索肽的三维结构 | LassoPred通过整合ESM2嵌入训练的支持向量机分类器注释关键拓扑特征(异肽环和塞子残基),并采用拓扑感知的结构构建器组装和优化原子模型,实现了近实验精度,同时将预测时间缩短至分钟级,并将已知套索肽结构覆盖率从不足50个扩展至超过4000个基因组挖掘模型 | 输入标题与摘要中未明确提及局限性 | 从序列准确预测套索肽的三维结构,桥接序列发现与结构洞察的差距 | 套索肽(LaPs) | 机器学习 | NA | 机器学习、同源建模、能量最小化 | 支持向量机 | 序列数据 | 超过4000个基因组挖掘模型 | NA | NA | NA | 酶学、结构生物学、合成生物学、治疗学设计 |
| 317 | 2026-05-25 |
Pathway crosstalk enables degradation of aromatic compounds in marine Roseobacter clade bacteria
2025-09-17, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00978-25
PMID:40793766
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研究论文 | 通过多组学分析和CRISPR-Cas基因编辑,破译海洋玫瑰杆菌分支菌中芳香化合物的降解途径,发现β-酮己二酸途径与β-氧化途径在硫解步骤的交叉对话 | 首次揭示海洋玫瑰杆菌分支菌中芳香化合物降解的完整途径,并发现途径交叉对话的新机制 | 研究主要基于模型化合物,对其他芳香化合物的适用性及海洋环境中的实际降解效率尚待验证 | 阐明海洋细菌中芳香化合物的生物转化途径,为环境修复和生物碳循环利用奠定基础 | 海洋玫瑰杆菌分支菌中的芳香化合物降解途径 | 合成生物学 | NA | 多组学分析, CRISPR-Cas基因编辑, NGS | NA | 基因组数据, 代谢组数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 海洋玫瑰杆菌分支菌 | β-酮己二酸途径与β-氧化途径的交叉对话 | 环境, 工业生物技术 |
| 318 | 2026-05-25 |
Enhanced phenanthrene degradation by a synthetically engineered E. coli consortium utilizing the SCRaMbLE for the evolution of key genes
2025-09-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.139152
PMID:40628214
|
研究论文 | 本研究利用SCRaMbLE方法对关键基因进行进化,构建了由三株工程化大肠杆菌组成的合成菌群,用于高效降解菲 | 首次将SCRaMbLE方法应用于多环芳烃降解菌群关键基因的定向进化,显著提升了菲的降解效率 | 研究仅测试了100 mg/L的菲浓度,未评估其他浓度或实际污染环境中菌群的降解性能 | 开发基于合成生物学和SCRaMbLE的微生物菌群策略,以增强菲的生物降解 | 菲,一种多环芳烃污染物 | 环境工程 | NA | SCRaMbLE | NA | 生物降解数据 | 三个工程化大肠杆菌菌株(E. coli SCRPHE033、E. coli SCRKA065、E. coli CRSA)在含有100 mg/L菲的MSM培养基中测试 | SCRaMbLE | 大肠杆菌BL21(DE3) | 菲完全矿化的三个分解代谢模块(上游、下游及辅助模块),整合17个关键基因 | 环境生物修复 |
| 319 | 2026-05-25 |
CTGCT, Centre of Excellence for the Technologies of Gene and Cell Therapy: Collaborative translation of scientific discoveries into advanced treatments for neurological rare genetic diseases and cancer
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.11.051
PMID:39760072
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评论 | CTGCT卓越中心旨在将科学发现转化为针对神经系统罕见遗传病和癌症的先进基因与细胞疗法 | 斯洛文尼亚首个此类中心,整合合成生物学工具、基因编辑、RNA技术、免疫调控工程及新型递送系统,建立GMP设施推动临床转化 | 尚未提供具体实验数据或临床结果评估 | 推动基因与细胞疗法从基础研究向临床应用转化 | 神经系统罕见遗传病和癌症 | 数字病理学 | 神经系统罕见遗传病, 癌症 | 基因编辑, 剪接技术, RNA技术, 免疫调控工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN | 哺乳动物细胞 | NA | 医学 |
| 320 | 2026-05-24 |
Unveiling the adaptive structure-function synergy in thermophilic translation initiation factor 1: A molecular dynamics framework
2026-Aug, Biophysical chemistry
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.bpc.2026.107644
PMID:42085878
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研究论文 | 通过分子动力学模拟揭示嗜热翻译起始因子1的结构-功能协同适应性机制 | 首次通过全原子分子动力学模拟系统比较嗜热与中温翻译起始因子1的动态特性,揭示嗜热因子通过扩展氢键和盐桥网络增强结构刚性的分子机制 | 仅基于计算机模拟,缺乏体外实验验证;仅研究了单一嗜热菌株的IF1蛋白 | 阐明嗜热细菌翻译起始因子1的热稳定性分子机制,为工程化耐热蛋白建立框架 | 嗜热菌Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum的IF1蛋白(TT_IF1)与中温菌Flavobacterium kingsejongi的IF1蛋白(FK_IF1) | 分子生物学 | 不适用 | 分子动力学模拟,主成分分析 | 不适用 | 模拟轨迹数据 | 每种IF1蛋白3次独立模拟,每次1000纳秒 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 合成生物学,工业生物技术 |