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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2026-07-29 |
Harnessing transposable elements for plant functional genomics and genome engineering
2025-10, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2025.03.007
PMID:40240259
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综述 | 全面概述转座因子在植物功能基因组学和基因组工程中的应用 | 系统整合了植物转座因子的功能机制与前沿生物技术应用,为作物育种和植物合成生物学提供新视角 | 未提及具体实验验证或定量比较不同转座子方法的优缺点 | 综述转座因子在植物功能基因组学和基因组工程中的发现、机制与技术应用 | 植物转座因子 | 基因组学 | NA | 功能基因组学、表观遗传调控 | NA | 基因组序列 | NA | NA | 植物 | NA | 农业, 工业生物技术 |
| 322 | 2026-07-29 |
Ponceau S as a Targeted Modulator for Protein Liquid-Liquid Phase Separation
2025-05-27, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c06432
PMID:40353860
|
研究论文 | 本研究介绍Ponceau S作为蛋白质液-液相分离的选择性调节剂,并在牛血清白蛋白和溶菌酶中监测相分离过程 | 首次发现Ponceau S可作为蛋白质液-液相分离的靶向调节剂,同时利用其荧光增强特性实现相分离的可视化监测 | 仅针对两种模型蛋白进行研究,缺乏在复杂细胞环境中的验证 | 探索小分子Ponceau S对蛋白质液-液相分离的精确调控能力 | 牛血清白蛋白和溶菌酶 | 机器学习 | NA | 荧光光谱分析 | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | 生物分子工程、药物递送、合成生物学 |
| 323 | 2026-07-28 |
Photocatalytic and Biotechnological Strategies for Remediation of Persistent Organic Pollutants: Mechanisms, Toxicity, and Antimicrobial Perspectives
2026-Jul-27, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.70172
PMID:42504676
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综述 | 评估用于持久性有机污染物修复的光催化和生物技术策略,关注其机制、性能及环境影响 | 整合材料科学、环境毒理学和微生物生态学,强调组学技术、合成生物学和数字化优化等新兴工具,推动风险知情和可持续的修复策略 | 转化产物的毒性、对抗微生物耐药性的影响以及混合系统的可扩展性方面仍存在关键空白 | 评估光催化和生物技术用于持久性有机污染物修复的策略 | 持久性有机污染物 | 环境科学 | NA | 光催化、生物技术、组学技术、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 环境 |
| 324 | 2026-07-28 |
Ortho-alkyl phenylalkenoyl natural products: structural diversity, bioactivities and biosynthesis
2026-Jul-27, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d6np00053c
PMID:42507473
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综述 | 系统总结了邻烷基苯基烯酰基天然产物的结构多样性、生物活性和生物合成机制 | 首次系统对比含非核糖体肽骨架的CCNPs与不含NRPS的APAs两类代谢物的生物合成差异,揭示异构化和6π电环化等新机制及多功能酶作为生物催化剂的潜力 | NA | 总结邻烷基苯基烯酰基天然产物的化学多样性、生物活性谱和生物合成途径,并评估其作为先导化合物来源的前景 | 含肉桂酰基的非核糖体肽(CCNPs)和邻烷基苯基烯酸(APAs)两类细菌天然产物 | 天然产物化学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 医学 |
| 325 | 2026-07-28 |
Metabolic engineering of cereal lipids: from omega-3 fatty acids to wax esters and pheromones
2026-Jul-24, Advanced biotechnology
DOI:10.1007/s44307-026-00124-9
PMID:42496959
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综述 | 综述了通过代谢工程改造谷物脂质以生产高价值脂质化合物(如omega-3脂肪酸、蜡酯和信息素)的最新进展 | 从天然来源到工程植物系统的转变,利用合成生物学和基因组编辑工具定制合成高价值脂质 | 未明确提及具体局限性 | 探讨谷物作为可持续平台用于高价值脂质生产的潜力 | 主要谷物(如水稻、玉米、小麦)种子中的脂质代谢 | 合成生物学 | NA | 代谢工程, 合成生物学, 基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 遗传转化 | 谷物(如水稻、玉米、小麦) | 种子脂质代谢通路改造,合成二十碳五烯酸、二十二碳六烯酸、蜡酯、昆虫性信息素 | 农业, 营养, 生物经济 |
| 326 | 2026-07-28 |
Construction and evaluation of an inside-out lysis system based on T4 lysozyme
2026-Jul-23, Protein expression and purification
IF:1.4Q4
DOI:10.1016/j.pep.2026.106983
PMID:42492745
|
研究论文 | 基于T4溶菌酶构建了一种由内而外的裂解系统,并评估其裂解大肠杆菌的效果 | 通过融合不同的分泌信号肽(PelB、NapA和HybA)与T4溶菌酶,实现了从细胞内部启动的裂解系统,其中NapA-T4溶菌酶表现出最高的细胞内蛋白质泄漏水平 | 未提及具体局限性 | 开发一种由内而外的裂解系统,用于程序性细胞破坏,以支持合成生物学应用 | 大肠杆菌细胞和T4溶菌酶融合蛋白 | 合成生物学 | NA | 融合蛋白表达与化学诱导裂解 | NA | 实验数据 | 未明确提及样本数量,涉及多种信号肽融合蛋白和化学处理条件 | NA | 大肠杆菌 | 由内而外的裂解系统 | 工业生物技术 |
| 327 | 2026-07-28 |
The Mevalonate Pathway: Innovations, Applications, and Challenges in Biotechnology with Emphasis on Fungal Biology
2026-Jul-07, Journal of fungi (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/jof12070497
PMID:42506259
|
综述 | 全面综述甲羟戊酸(MVA)途径,重点关注真菌生物学中的创新、应用和挑战 | 对MVA途径在真菌中的酶学调控、结构生物学、代谢工程及合成生物学的最新进展进行全面梳理,强调真菌作为工程宿主在异戊二烯可持续生产中的潜力 | 未提及 | 综述MVA途径的分布、进化、代谢组织、酶学特性及在真菌合成生物学中的应用 | 甲羟戊酸途径、真菌、异戊二烯前体 | 合成生物学、代谢工程 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 真菌 | MVA途径、麦角固醇生物合成、蛋白质异戊二烯化、次生代谢产物合成 | 工业生物技术、医学、农业 |
| 328 | 2026-07-28 |
Turbocharging fundamental science translation through controlled environment agriculture
2026-07, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2025.08.014
PMID:41033905
|
综述 | 探讨通过可控环境农业加速植物科学基础研究向农业应用的转化 | 提出可控环境农业作为连接基础发现与作物实际应用的桥梁,整合育种、基因组学和合成生物学工具,实现作物设计的重新构想 | 指出了在整合过程中仍存在的挑战 | 综述可控环境农业在加速植物科学转化中的进展和潜力 | 植物科学突破和作物设计 | 机器视觉 | NA | 合成生物学工具 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 植物 | 生物传感器、代谢通路 | 农业, 环境 |
| 329 | 2026-07-28 |
Construct design for precise DNA insertion in plants
2026-07, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2026.01.005
PMID:41846181
|
综述 | 综述了植物基因组中精准DNA插入的构建设计原则与策略 | 系统评估了短片段、大片段及多片段插入等不同应用场景下的敲入方法,并探讨了非植物先进技术提升植物敲入效率与精度的潜力 | 实际指导有限,且主要基于现有方法综述,缺乏实验验证 | 促进植物敲入技术在作物遗传改良中的有效应用,降低脱靶效应 | 植物基因组中的精准DNA插入技术 | 合成生物学 | NA | DNA插入(敲入)技术 | NA | NA | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 330 | 2026-07-28 |
seq2ribo: Structure-aware integration of machine learning and simulation to predict ribosome location profiles from RNA sequences
2026-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.08.700508
PMID:41726975
|
研究论文 | 提出一种结合机器学习和结构感知模拟的框架seq2ribo,仅从RNA序列预测核糖体A位点位置分布 | 首次仅从序列数据实现与观测核糖体图谱有意义的位点相关性,引入结构感知TASEP模型整合RNA二级结构特征,通过抛光器模型修正模拟分布提升预测保真度 | NA | 开发仅依赖mRNA序列预测核糖体定位图谱的方法,为合成生物学中mRNA序列设计提供工具 | 多种细胞类型的核糖体A位点位置分布及翻译效率 | 机器学习 | NA | Ribo-seq, RNA-seq | 神经网络抛光器, TASEP模拟 | 测序数据 | 跨四种细胞类型(iPSC, HEK293, LCL, RPE-1)的核糖体图谱数据 | NA | NA | NA | 合成生物学, 药物开发 |
| 331 | 2026-07-28 |
The disputed identity of Pseudomonas putida KT2440: when taxonomists rename your favorite microbe
2026-03-11, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03390-25
PMID:41589905
|
评论 | 讨论恶臭假单胞菌KT2440因分类学重新命名引发的争议,呼吁保留传统名称以维护科学实践和社区共识 | 首次系统评估微生物分类学重新命名对长期研究实践的负面影响,强调命名应兼顾实用性和社区认同 | 未提供具体的替代命名方案或量化分析命名变更对研究成果的直接影响 | 探讨微生物命名中分类学严谨性与科学实践连续性之间的平衡问题 | 恶臭假单胞菌KT2440菌株的命名争议 | 微生物学 | NA | 系统发育分析 | NA | 文本数据 | 单一菌株KT2440 | NA | 恶臭假单胞菌 | NA | 环境微生物学、生物技术、合成生物学 |
| 332 | 2026-07-28 |
Synthetic overlapping genes stabilize genetic systems
2026-03-11, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.02725-25
PMID:41649272
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研究论文 | 提出了一种名为OAFI的新方法,用于在抗生素抗性基因中创建合成重叠基因对,从而稳定基因系统 | 首次提出OAFI方法,通过将内部基因插入外部基因的柔性区域,实现重叠基因对的简单构建,并展示了限制抗生素抗性基因水平转移的能力 | 内部基因翻译效率受其在外基因中重叠位置的影响,部分重设计可能在功能保留上有局限性 | 开发合成重叠基因的方法,用于基因稳定和生物遏制 | 抗生素抗性基因、细菌毒素、遗传报告基因 | 合成生物学 | NA | OAFI | NA | NA | NA | OAFI | 细菌 | 合成重叠基因对,包括遗传报告基因和细菌毒素的嵌入 | 基因稳定、生物遏制 |
| 333 | 2026-07-28 |
Biomaterials Based on Bacteria for Cancer Clinical Therapy
2026, Biomaterials research
IF:8.1Q1
DOI:10.34133/bmr.0350
PMID:41982812
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综述 | 系统探讨了基于细菌的生物材料在癌症临床治疗中的应用,包括工程化细菌的抗肿瘤机制及其与传统疗法的协同作用 | 全面梳理了合成生物学改造细菌作为精准活体治疗手段的进展,重点分析了细菌疗法与化疗、放疗及免疫治疗的协同增效策略 | 未提供临床试验的具体数据或定量分析,对临床转化的安全性和生产挑战仅作定性讨论 | 为开发更安全有效的细菌介导抗癌策略提供基础性视角 | 工程化细菌、肿瘤微环境、肠道菌群 | 数字病理学 | 癌症 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 活体治疗回路(局部药物递送、靶向免疫调节、肿瘤微环境重塑) | 医学 |
| 334 | 2026-07-28 |
Introducing carbon assimilation in yeasts using photosynthetic directed endosymbiosis
2024-07-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49585-3
PMID:39013857
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research paper | 利用光合定向内共生方法在酵母中引入碳同化能力 | 首次通过定向内共生方法将光合蓝细菌作为内共生体引入酵母细胞,构建可进行光合自养的酵母/蓝细菌嵌合体,减少对外源碳源的依赖 | NA | 将异养酵母转化为部分或完全自养生物,以促进可持续生物技术 | 酿酒酵母和光合蓝细菌 | 合成生物学 | NA | 定向共培养和工程化 | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母 | 光合内共生系统,包括蓝细菌碳同化和糖分泌通路 | 可持续生物技术, 工业生物技术, 合成生物学 |
| 335 | 2026-07-27 |
X-ray crystal structures of the cannabinoid synthases CBCAS, CBDAS and THCAS
2026-Dec, Current research in structural biology
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.crstbi.2026.100197
PMID:42502799
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研究论文 | 解析了大麻素合酶CBCAS、CBDAS和THCAS的X射线晶体结构,揭示了它们活性位点的差异 | 首次报道了CBCAS和CBDAS的晶体结构,并获得了比已知结构更高分辨率的THCAS结构,揭示了决定底物特异性的活性位点差异 | 未提供 | 解析大麻素合酶的结构基础,为合理工程化改造这些酶的化学选择性提供平台 | 大麻素合酶CBCAS、CBDAS和THCAS | 结构生物学 | NA | X射线晶体学 | NA | 结构数据 | 三种酶的晶体结构 | NA | NA | NA | 药物合成、合成生物学 |
| 336 | 2026-07-27 |
Bottom-up reconstitution of model membrane systems: a mini-review
2026-Jul-29, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20250291
PMID:42460640
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综述 | 总结了自下而上重构模型膜系统的最新进展,重点介绍了支持脂质双层(SLBs)和巨单层囊泡(GUVs)的制备与应用 | 系统回顾了SLBs和GUVs在膜相关蛋白组装、膜曲率感应与重塑、渗透性及细胞骨架组织中的关键作用,并强调了新兴方向如悬浮膜、膜-凝聚相相互作用及GUV作为合成生物学底盘的应用 | 未提及具体技术限制或算法缺陷,可能受限于综述篇幅而对某些细节讨论不充分 | 探讨自下而上重构膜系统在理解膜组织与功能方面的物理原理及其在生物医学中的应用潜力 | 支持脂质双层(SLBs)和巨单层囊泡(GUVs) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物医学 |
| 337 | 2026-07-27 |
A programmable fungal platform for engineered living textiles
2026-Jul-24, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aed6937
PMID:42497282
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研究论文 | 报告了一种基于真菌的活体材料平台,通过低能耗工艺制备宏观粘合薄膜,保持菌丝代谢活性,用于工程化活体纺织品 | 将宏观结构组装与持续细胞活力和可编程功能无缝整合,通过模块化设计解耦结构制备与基因功能化,采用低能耗工艺实现环境响应和表面更新 | 未明确提及,但可能涉及工程化微生物伙伴的长期稳定性和实际应用中的环境适应性 | 开发可扩展且可持续的真菌基活体材料平台,弥合结构完整性与生物可编程性之间的关键差距 | 真菌菌丝体及其工程化微生物伙伴(产色素细菌和黑色素化细菌) | 合成生物学 | NA | 低能耗工艺 | NA | 文本 | NA | NA | 真菌菌丝体 | 模块化平台,用于共培养和原位图案化及紫外屏蔽 | 材料, 环境 |
| 338 | 2026-07-27 |
Reimagining Lignin Valorization: Synthetic Biology-Enabled Sustainable Aromatic Carbon Biomanufacturing
2026-Jul-20, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.76698
PMID:42474033
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综述 | 提出将合成生物学驱动的调控策略作为整合木质素解聚、转化和代谢调控的统一框架,实现可持续芳香碳生物制造 | 主张从孤立催化步骤转向协同控制框架,强调全局调控(而非路径完整性)是提高木质素生物转化效率、鲁棒性和可扩展性的关键,并引入光酶催化、化学生物杂合体等新兴技术扩大设计空间 | 未具体说明当前方法的实际应用挑战(如规模化成本、工程化瓶颈)或未来需解决的调控机制细节 | 提出通过合成生物学实现木质素可持续生物转化的路线图,强调调控作为统一原则 | 木质素(可再生芳香碳库)及其衍生物 | 合成生物学 | NA | 光酶催化、化学生物杂合体、动态生物传感器 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 微生物细胞工厂 | 动态调控回路、生长-生产解耦系统、模块化代谢通路 | 可持续生物制造、工业生物技术 |
| 339 | 2026-07-27 |
Advances in Betalain Biosynthesis and Metabolic Engineering for Sustainable Natural Pigment Production
2026-Jul-19, Biotech (Basel (Switzerland))
DOI:10.3390/biotech15030056
PMID:42496572
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综述 | 本文综述了甜菜红素生物合成及代谢工程的最新进展,旨在推动可持续天然色素的生产 | 重点比较植物、植物细胞、酵母和细菌生产系统,并涵盖合成生物学、诱导方法、组学途径鉴定和纳米生物技术等新方法 | 甜菜红素在工业应用中仍面临天然含量低、对环境敏感及制造和储存中不稳定的限制 | 优化甜菜红素生产并克服商业化瓶颈,实现可持续天然色素替代人工色素 | 甜菜红素生物合成途径及代谢工程系统 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学、组学分析、纳米生物技术 | NA | NA | NA | NA | 植物, 植物细胞, 酵母, 细菌 | 甜菜红素生物合成途径的工程化改造 | 食品, 工业生物技术 |
| 340 | 2026-07-27 |
Bioinspired organic materials for seamless neurohybrid interfaces: from material design to living electronics
2026-Jul-18, Materials horizons
IF:12.2Q1
DOI:10.1039/d6mh00280c
PMID:42468887
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研究论文 | 本文探讨了基于生物启发的有机材料,用于无缝神经混合接口,从材料设计到活体电子学的进展 | 提出了利用有机混合离子-电子导体、先进聚合物化学和软材料实现神经组织无缝整合的新方法,并探索了原位聚合和合成生物学在活体神经电子学中的潜力 | 未明确说明具体局限,但可能包括活体整合的长期稳定性和生物相容性挑战 | 研究神经混合接口的无缝整合,以实现神经组织双向通信,用于理解和治疗神经疾病 | 神经电子设备和神经混合接口 | 神经科学、生物工程、临床医学 | 神经疾病 | 原位聚合、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 神经混合接口 | 医学 |