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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2026-02-07 |
Geminivirus vectors: From gene silencing to synthetic biology
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108771
PMID:41325825
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综述 | 本文综述了双生病毒作为载体在基因沉默和合成生物学中的应用,包括其基因组结构、复制蛋白功能、历史应用及未来展望 | 强调双生病毒载体在病毒诱导基因沉默(VIGS)和合成生物学中的突出作用,如通过自主复制促进高水平蛋白表达和增强CRISPR/Cas基因组编辑效率,并展望其跨王国应用潜力 | NA | 探讨双生病毒载体在植物基因工程、作物改良和生物制造中的实用创新 | 双生病毒(双生病毒科植物DNA病毒)及其衍生的功能复制子(GVRs) | 合成生物学 | NA | 病毒诱导基因沉默(VIGS)、CRISPR/Cas基因组编辑、基因工程 | NA | NA | NA | CRISPR/Cas | 植物 | 双生病毒复制子(GVRs)作为类质粒DNA,支持植物合成生物学中的多样化设计,包括组织特异性启动子和基因表达增强序列 | 农业, 工业生物技术 |
| 322 | 2026-02-07 |
Building an expanded bio-based economy through synthetic biology
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108775
PMID:41360191
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综述 | 本文探讨了合成生物学在扩展生物基经济中的作用,包括资源利用、底盘生物开发以及相关技术挑战与机遇 | 系统性地提出了构建未来生物基经济的综合框架,整合了微生物与植物合成生物学的协同发展路径 | NA | 探讨如何通过合成生物学技术推动生物基经济的扩展与发展 | 生物基经济的资源、底盘生物及合成生物学技术 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物, 植物 | NA | 能源, 工业生物技术, 环境 |
| 323 | 2026-02-07 |
Synthetic biology strategies for engineering probiotics and commensal bacteria for diagnostics and therapeutics
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108782
PMID:41421426
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综述 | 本文综述了利用合成生物学工具和策略改造益生菌和共生细菌,用于人类疾病诊断和治疗的最新进展 | 系统总结了合成遗传回路如何显著提高疾病诊断和治疗的精确性与可靠性,实现实时监测、治疗甚至预防性干预 | NA | 开发用于人类疾病诊断和治疗的工程化益生菌和共生细菌 | 益生菌和共生细菌 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 益生菌, 共生细菌 | 生物传感器, 逻辑门, 振荡器, 切换开关 | 医学 |
| 324 | 2026-02-07 |
Geometric deep learning assists protein engineering. Opportunities and Challenges
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108790
PMID:41456696
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综述 | 本文全面评述了几何深度学习在蛋白质工程中的应用、机遇与挑战 | 系统整合了GDL在蛋白质工程中的方法论原理、架构多样性和性能趋势,强调了其在增强可解释性和泛化能力方面的作用,并提出了将可解释AI与结构验证结合的统一框架 | NA | 探讨几何深度学习如何变革蛋白质工程的计算设计流程 | 蛋白质工程中的稳定性预测、功能注释、分子相互作用建模及从头设计 | 机器学习 | NA | 几何深度学习 | 几何深度学习模型 | 非欧几里得域数据(空间、拓扑、物理化学特征) | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 325 | 2026-02-07 |
A review on squalene production by engineered yeasts: Current advances and perspectives
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108792
PMID:41475586
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综述 | 本文综述了工程酵母生产角鲨烯的当前进展与前景,包括生物合成途径、代谢策略、基因工程工具及新兴酵母潜力 | 首次系统总结工程酵母生产角鲨烯的综合策略,涵盖代谢工程、先进遗传工具和新兴酵母宿主 | NA | 探索通过合成生物学策略利用工程酵母生产角鲨烯的替代方法 | 工程酵母 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、基因工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酵母 | 角鲨烯生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 326 | 2026-02-07 |
Spatial engineering for biocatalytic cascade control through biomolecular compartmentalization
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108786
PMID:41475588
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综述 | 本文系统评估了通过生物分子区室化实现生物催化级联控制的空间工程平台,包括支架化区室和无支架组装体 | 提出了一个理解不同空间控制原则的框架,用于调控途径效率和通量再分配,并展望了多功能空间组织工具和仿生平台的未来发展 | 当前在机制阐明、动态调控和跨系统兼容性方面存在局限性 | 探讨空间工程在生物催化过程控制中的应用,以优化代谢通量和途径效率 | 支架化区室(如脂质体、DNA折纸、聚合物囊泡和细菌微区室)和无支架组装体(如无膜细胞器和凝聚层) | 合成生物学 | NA | 生物分子区室化、空间工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、细胞工程 |
| 327 | 2026-02-07 |
Vanadium-dependent haloperoxidases: Recent advances and perspectives
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108797
PMID:41506498
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综述 | 本文综述了钒依赖性卤过氧化物酶(VHPOs)的最新进展与前景,涵盖其发现、结构功能、机制阐明及合成应用 | 挑战了长期存在的可扩散HOX模型,并实现了理性酶工程,推动选择性卤化和可持续合成 | NA | 综述VHPOs在合成化学和生物技术领域的最新研究进展与未来应用潜力 | 钒依赖性卤过氧化物酶(VHPOs) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 材料科学, 环境生物技术 |
| 328 | 2026-02-07 |
Bioremediation of ether PFAS alternatives: A structure-reactivity-partitioning framework for hybrid treatment design
2026-Feb-10, The Science of the total environment
DOI:10.1016/j.scitotenv.2026.181367
PMID:41570765
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综述 | 本文综述了醚类PFAS替代物的生物修复研究,提出了一个结合结构-反应性-分配性的混合处理设计框架 | 提出了一个结合分子结构、反应活性和分配特性的框架,用于指导混合处理设计,并明确了α-C-H/α-CHF或CCl“手柄”促进转化、全氟化和空间屏蔽导致持久性的结构-反应性规则 | NA | 评估醚类PFAS替代物的生物修复潜力,并提出混合处理策略以提高其矿化效率 | 醚类PFAS替代物,如HFPO-DA (GenX)、ADONA和氯化PFESAs (F-53B) | 环境科学 | NA | 生物修复、物理化学预活化(UV/亚硫酸盐、电芬顿、等离子体、维生素B12/硫化物还原) | NA | NA | NA | 合成生物学 | 工程微生物、转基因植物 | 表达加氧酶、脱卤酶或氟化物输出模块的工程微生物,以及携带氧化酶的转基因植物 | 环境 |
| 329 | 2026-02-07 |
Synthetic overlapping genes stabilize genetic systems
2026-Feb-06, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.02725-25
PMID:41649272
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研究论文 | 本文提出了一种名为OAFI的新方法,用于创建合成重叠基因,以稳定遗传系统并限制抗生素抗性基因的水平转移 | 开发了OAFI方法,通过将内层基因插入外层基因的灵活区域来创建合成重叠基因,从而稳定基因并增强生物控制 | NA | 开发一种工具来稳定工程基因并限制抗生素抗性基因的水平转移 | 合成重叠基因对,包括遗传报告基因和细菌毒素 | 合成生物学 | NA | OAFI方法 | NA | NA | NA | OAFI | 细菌 | 重叠基因对设计,其中内层基因编码于替代阅读框并插入外层基因的灵活区域 | 医学, 环境 |
| 330 | 2026-02-07 |
Natural pigments: recent advances and challenges in production and application
2026-Feb-05, Preparative biochemistry & biotechnology
IF:2.0Q3
DOI:10.1080/10826068.2026.2625199
PMID:41641740
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综述 | 本文全面综述了源自植物、动物和微生物的天然色素,重点关注可持续提取技术和代谢工程、CRISPR/Cas9及合成生物学等生物技术创新 | 系统比较了不同生物来源色素的优缺点,并评估了其在食品、制药、营养保健品和生物医学领域不断扩展的应用,同时提出了规模化生产的关键挑战和未来研究方向 | NA | 提供天然色素的全面且批判性综述,重点关注可持续提取技术和生物技术创新,以促进从实验室发现向工业应用的转化 | 源自植物、动物和微生物的天然色素 | NA | NA | 代谢工程、组学技术、CRISPR/Cas9基因组编辑、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 食品, 化妆品, 制药, 纺织品, 营养保健品, 生物医学 |
| 331 | 2026-02-07 |
Lipid composition effects on the number and size of liposomes formed by the inverted emulsion method
2026-Feb-03, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2025.12.013
PMID:41383017
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研究论文 | 本研究系统探究了磷脂组成对倒置乳化法制备脂质体的产量和尺寸分布的影响 | 首次系统揭示了带电磷脂替换可显著提高脂质体产量约10倍,并阐明了亲水头基大小在不同沉降方法中对脂质体形成的影响差异 | 研究主要基于鸡蛋卵磷脂体系,未涵盖所有可能的脂质组合;离心法的强外力可能掩盖某些脂质的本征效应 | 探究脂质组成对倒置乳化法制备脂质体产量与尺寸的影响规律 | 以鸡蛋卵磷脂为基质的脂质体 | 合成生物学 | NA | 倒置乳化法 | NA | 实验数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学/最小细胞模型构建 |
| 332 | 2026-02-07 |
A modular synthetic biology toolkit unlocks metabolic engineering of the industrially relevant alga Nannochloropsis
2026-Feb-03, Advanced biotechnology
DOI:10.1007/s44307-026-00096-w
PMID:41632226
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研究论文 | 本文开发了一个针对工业相关微藻Nannochloropsis的模块化合成生物学工具包,用于解锁其代谢工程潜力 | 首次为Nannochloropsis开发了一个基于Golden Gate组装和标准语法的全面模块化克隆工具包,包含91个遗传部件,并成功应用于酮类胡萝卜素生物合成途径的工程化 | NA | 开发一个标准化和模块化的遗传工具包,以促进Nannochloropsis在合成生物学中的广泛应用 | 工业相关海洋微藻Nannochloropsis | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly, Modular Cloning (MoClo) | Nannochloropsis | 酮类胡萝卜素生物合成途径 | 工业生物技术, 能源, 环境 |
| 333 | 2026-02-07 |
Engineered probiotics platform for oral delivery of antibody as a high-compliance alternative for immune-mediated inflammatory diseases
2026-Jan-20, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102523
PMID:41421354
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研究论文 | 本研究开发了一种名为AIDEN的工程化益生菌平台,用于口服递送治疗性抗体,以改善免疫介导炎症性疾病的治疗依从性 | 首次构建了能够口服递送单链可变片段抗体的工程化益生菌平台,实现了肠道稳定定植和原位抗体持续生产 | 研究仅在鼠类模型中进行,尚未进行人体临床试验;系统IL-17A水平仅中度降低 | 开发一种高依从性的口服抗体递送平台,用于治疗免疫介导炎症性疾病 | 工程化大肠杆菌Nissle 1917(EcN)益生菌平台及其分泌抗IL-17A单链可变片段的变体AIDEN-IL17 | 合成生物学 | 银屑病,炎症性肠病 | 合成生物学技术 | NA | NA | 鼠类模型 | 合成生物学 | 大肠杆菌Nissle 1917(EcN) | 抗体分泌系统,可模块化适配多种抗体治疗 | 医学 |
| 334 | 2026-02-07 |
Electron transfer engineering of artificially designed cell factory for complete biosynthesis of steroids
2025-Apr-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58926-9
PMID:40258825
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研究论文 | 本研究通过阐明NADPH依赖酶的电子转移机制,系统性地工程化酿酒酵母的电子转移过程,以高效生产胆固醇和孕烯醇酮 | 首次系统性地工程化电子转移链,包括DHCR7和P450酶的电子转移残基、电子转移组件以及NADPH再生途径,显著缩短并稳定电子转移链 | NA | 提高类固醇的生物合成效率 | 酿酒酵母细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 电子转移工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 酿酒酵母 | 代谢途径工程,包括电子转移链和NADPH再生途径 | 医药,工业生物技术 |
| 335 | 2026-02-06 |
Sustainable production of glutaric acid in microbial cell factories: Current advances and future prospects
2026-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.01.003
PMID:41631191
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综述 | 本文综述了微生物细胞工厂可持续生产戊二酸的当前进展与未来前景 | 系统总结了戊二酸生物合成的最新进展,重点关注生物合成途径的设计和代谢工程策略,并探讨了系统生物学技术在该途径开发中的应用 | NA | 为戊二酸及相关精细化学品的可持续生产提供理论见解和技术指导 | 戊二酸的微生物生物合成 | 合成生物学 | NA | 代谢工程,系统生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物细胞工厂 | 戊二酸生物合成途径 | 化学工业,医药,生物材料 |
| 336 | 2026-02-06 |
A novel LPS-dependent outer membrane-anchoring mechanism for T9SS substrates enables engineered enzyme display and whole-cell PET degradation in Cytophaga hutchinsonii
2026-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.01.011
PMID:41631190
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研究论文 | 本研究在Cytophaga hutchinsonii中发现了一种新型的LPS依赖性T9SS底物外膜锚定机制,并基于此开发了用于革兰氏阴性菌的酶表面展示平台,成功实现了PET降解 | 首次揭示了T9SS底物通过LPS依赖性机制锚定于外膜,并利用此机制构建了可编程的酶表面展示平台 | NA | 阐明T9SS底物在Cytophaga hutchinsonii中的外膜锚定机制,并开发基于此机制的酶表面展示平台 | Cytophaga hutchinsonii及其T9SS分泌的纤维素酶,以及异源表达的PET水解酶 | 合成生物学 | NA | 生物信息学分析、基因敲除、LC-MS/MS蛋白质组学 | NA | 蛋白质组学数据、基因序列数据 | NA | 基因融合、表面展示平台 | Cytophaga hutchinsonii | 将异源酶与T9SS底物的CTD结构域融合,构建表面展示系统 | 环境、工业生物技术 |
| 337 | 2026-02-06 |
Adaptive laboratory evolution optimizes an engineered phosphite utilization pathway in Synechococcus elongatus PCC 7942
2026-Mar, Journal of bioscience and bioengineering
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.jbiosc.2025.11.006
PMID:41390308
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研究论文 | 本研究通过长期传代培养优化了在Synechococcus elongatus PCC 7942中构建的磷酸盐利用途径,提高了工程菌株的生长和磷酸盐消耗速率 | 发现长期传代培养可诱导htxBCDE转运蛋白基因发生点突变,从而增强磷酸盐转运活性,优化工程代谢途径而不改变其底物特异性 | 研究仅针对单一菌株和特定代谢系统,未评估在其他宿主或代谢途径中的普适性 | 优化工程微生物的磷酸盐依赖代谢系统,以平衡代谢负担与生物安全控制能力 | Synechococcus elongatus PCC 7942工程菌株RH714及其传代演化群体 | 合成生物学 | NA | 适应性实验室演化、长期传代培养、基因序列分析、基因敲除 | NA | 生长曲线数据、磷酸盐消耗速率数据、基因序列数据 | 原始工程菌株RH714及其传代演化群体 | CRISPR-Cas9 | Synechococcus elongatus PCC 7942 | 磷酸盐依赖代谢系统,包含htxBCDE转运蛋白基因和ptxD基因簇 | 环境、工业生物技术 |
| 338 | 2026-02-06 |
Automated strain-to-peptide conversion: a high-throughput proteome analysis platform empowering rational design of microbial cell factories
2026-Mar, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134010
PMID:41539624
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研究论文 | 开发了一种名为'菌株到肽段转换'的高通量蛋白质组分析平台,用于微生物细胞工厂的理性设计 | 通过自动化工作流程整合细菌裂解、磁性固相烷基化蛋白富集、污染物去除和快速消化,将96个样本处理时间缩短至1小时,相比SP3方法减少94%处理时间,并提高膜蛋白定量28% | NA | 克服微生物工程菌株蛋白质组分析中的样本制备瓶颈,实现高通量蛋白质组分析 | 工程化微生物菌株(如大肠杆菌)的蛋白质组 | 合成生物学 | NA | 质谱蛋白质组学、磁性固相烷基化 | NA | 蛋白质组数据 | 96个大肠杆菌样本 | NA | 大肠杆菌 | NA | 工业生物技术 |
| 339 | 2026-02-06 |
Corrigendum to "Precise control of transcriptional stoichiometry in bacteria: From mechanisms to synthetic biology applications" [Biotechnology Advances 86 (2026) 108748]
2026-Jan-27, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108816
PMID:41611037
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 340 | 2026-02-06 |
A universal polyphosphate kinase powers in vitro transcription
2026-Jan-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-68012-9
PMID:41507187
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研究论文 | 本文介绍了一种通用多磷酸激酶,能够高效磷酸化所有八种常见核糖核苷酸为三磷酸盐,并展示了其在体外转录中的应用潜力 | 开发了一种具有广泛底物谱的通用多磷酸激酶,突破了现有PPKs底物限制,实现了对嘌呤和嘧啶单磷酸及二磷酸的高效磷酸化 | NA | 探索多磷酸激酶在核苷酸生产及体外转录系统中的应用 | 多磷酸激酶及其催化的磷酸化反应 | 合成生物学 | NA | 体外转录、酶催化反应 | NA | NA | NA | NA | NA | 基于通用多磷酸激酶的一锅法体外转录系统 | 工业生物技术 |