合成生物学相关文章
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当前共找到 3783 篇文献，本页显示第 321 - 340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2025-10-05 |
Hybrid AI in synthetic biology: next era in agriculture
2025-Sep-09, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2025.08.011
PMID:40930858
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研究论文 | 本文探讨混合人工智能在合成生物学农业应用中的潜力与挑战 | 提出混合AI方法能更有效处理多组学复杂性，实现气候智能型高产量作物设计 | 需要清晰流程、精选数据集和自动化平台才能充分发挥潜力 | 利用混合AI技术推动合成生物学在农业领域的应用发展 | 多基因组、多性状和多环境数据驱动的作物工程 | 合成生物学 | NA | 多组学数据分析 | 混合AI | 多组学数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 作物植物 | 复杂基因网络 | 农业 |
| 322 | 2025-10-05 |
Food production from air: gas precision fermentation with hydrogen-oxidising bacteria
2025-Sep-09, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.08.003
PMID:40930898
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综述 | 本文探讨利用氢氧化细菌通过气体发酵从空气中生产食品的可持续方法 | 提出将氢氧化细菌工程化为细胞工厂进行精密发酵，超越传统单细胞蛋白生产 | NA | 开发不依赖农业的可持续食品生产技术 | 氢氧化细菌及其工程化应用 | 合成生物学 | NA | 气体发酵、合成生物学、代谢工程、计算建模 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 氢氧化细菌 | 细胞工厂设计、重组蛋白分泌系统 | 食品, 工业生物技术 |
| 323 | 2025-10-05 |
PCR-Free Site-Directed Mutagenesis on Repetitive Sequences Using Single-Stranded DNA-Assisted Double-Stranded DNA Nicking by DNAzymes
2025-Sep-08, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202509127
PMID:40626944
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研究论文 | 开发了一种无需PCR的位点定向诱变方法，使用DNA切割脱氧核酶和单链DNA辅助实现对重复序列的突变操作 | 首次将DNA切割脱氧核酶的应用范围扩展到双链超螺旋质粒，无需PCR或限制性内切酶即可在重复序列上进行位点定向诱变 | NA | 开发一种能够处理重复序列的PCR-free位点定向诱变技术 | 含有PCR不兼容重复序列的质粒 | 合成生物学 | NA | DNA切割脱氧核酶技术，单链DNA辅助双链DNA切割 | NA | NA | NA | DNA切割脱氧核酶 | NA | 单链DNA辅助双链DNA切割系统(DANDA) | 生物技术, 生物化学 |
| 324 | 2025-10-05 |
Controlling complex rhythms: A hierarchical approach to limit cycle switching
2025-Sep-01, Chaos (Woodbury, N.Y.)
DOI:10.1063/5.0296708
PMID:40932349
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研究论文 | 本文提出一种分层控制方法，通过周期性调制实现非线性动力系统中极限环之间的可靠切换 | 开发了通过分层逐步周期性调制控制多节律性的方法，能够在保持系统其他特性的同时实现节律状态间的可靠切换 | NA | 研究非线性动力系统中极限环之间的分层动力学转变 | 非线性动力系统中的极限环和节律行为 | 动力系统理论 | NA | 周期性调制控制 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 神经工程,合成生物学 |
| 325 | 2025-10-05 |
Genome mining and characterization of a heme-dependent enzyme catalyzing intermolecular Nitrogen-Nitrogen bond formation in hydrazinosuccinic acid biosynthesis
2025-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.08.006
PMID:40918557
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研究论文 | 通过基因组挖掘发现并表征了一种新型血红素依赖性酶系统，该酶催化分子间氮-氮键形成生成肼基琥珀酸 | 发现首个血红素依赖性酶系统能够催化分子间氮-氮键形成，并提出了涉及活性氮中间体的催化机制 | NA | 探索氮-氮键形成酶在天然产物生物合成中的作用机制 | 血红素酶与铁硫蛋白复合物系统 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、体内外重组、定点诱变、结构建模 | NA | 基因组数据、酶活性数据 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 326 | 2025-10-05 |
Spatial Organization of the Metabolic Pathway for Enhancing l-Fucose Biosynthesis in Engineered Escherichia coli
2025-Sep-10, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c06801
PMID:40853549
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研究论文 | 本研究通过空间组织策略优化工程大肠杆菌中l-岩藻糖的生物合成途径 | 采用无支架酶组装和工程蛋白质区室化两种空间组织策略，首次系统性地优化l-岩藻糖生物合成途径的空间构型 | NA | 通过合成空间组织提高微生物生物合成效率 | 工程大肠杆菌中的l-岩藻糖生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、多酶复合物组装、蛋白质区室化 | NA | NA | NA | RIAD-RIDD肽相互作用、DIX结构域 | 大肠杆菌 | l-岩藻糖生物合成途径，包含WbgL和AfcA关键酶的多酶复合物，代谢通量导向系统 | 工业生物技术 |
| 327 | 2025-10-05 |
The oxidative rearrangements in bacterial aromatic polyketide biosynthesis
2025-Sep-10, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00049a
PMID:40927919
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综述 | 系统阐述细菌芳香聚酮化合物生物合成中氧化重排反应的关键作用及机制 | 首次全面总结氧化重排反应在细菌芳香聚酮生物合成中的多样性催化机制，揭示黄素依赖单加氧酶、酮还原酶和双加氧酶等酶的创新催化功能 | NA | 阐明天然酶如何利用氧化还原化学在细菌芳香聚酮生物合成中构建新碳骨架 | 细菌芳香聚酮化合物的生物合成途径及相关氧化重排酶 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 医药，合成生物学 |
| 328 | 2025-10-05 |
STAGE: A compact and versatile TnpB-based genome editing toolkit for Streptomyces
2025-Sep-02, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2509146122
PMID:40857323
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研究论文 | 开发基于TnpB的紧凑型基因组编辑工具包STAGE，用于链霉菌的高效基因编辑 | 使用尺寸仅为Cas9三分之一的ISDra2 TnpB开发基因组编辑工具，实现高效精确编辑并通过AI辅助蛋白工程获得近100%编辑效率的变体 | NA | 开发适用于链霉菌的高效基因组编辑工具 | 链霉菌菌株 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、AI辅助蛋白工程 | NA | NA | 两种工业重要链霉菌菌株 | CRISPR-TnpB, STAGE, STAGE-cBEST, STAGE-McBEST | 链霉菌 | 基因组编辑系统、碱基编辑系统 | 工业生物技术, 医药 |
| 329 | 2025-10-05 |
FluxRETAP: a REaction TArget Prioritization genome-scale modeling technique for selecting genetic targets
2025-Sep-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf471
PMID:40848245
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研究论文 | 开发了一种基于基因组尺度模型的反应靶点优先排序技术FluxRETAP，用于选择遗传工程目标 | 结合机制性知识和机器学习流程，提供计算成本低廉的遗传靶点选择方法 | 需要依赖先前的生物学知识，不能完全独立使用机器学习方法 | 提高目标代谢物产量的遗传工程靶点选择 | 代谢工程中的遗传过表达、下调或删除靶点 | 机器学习 | NA | 基因组尺度建模 | NA | 代谢模型数据 | 在大肠杆菌和恶臭假单胞菌中验证 | NA | Escherichia coli, Pseudomonas putida | NA | 工业生物技术 |
| 330 | 2025-10-05 |
Evolution and synthetic biology
2023-12, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2023.102394
PMID:37801925
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综述 | 本文综述了受进化观察启发的三个合成生物学领域：基于细胞的生物分子进化组合方法、建立微生物群落的工程互依赖性以及合成免疫学 | 系统梳理了进化观察如何为合成生物学设计提供灵感，并聚焦于三个具体研究方向的进化前提 | 仅涵盖了进化启发合成生物学应用的部分案例，未穷尽所有相关领域 | 探讨进化观察如何启发和塑造合成生物学与生物技术 | 合成生物学中受进化启发的技术平台和应用 | 合成生物学 | NA | 遗传电路构建、合成翻译系统、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 细胞、微生物群落 | 遗传电路、合成翻译系统、代谢途径 | 生物技术 |
| 331 | 2025-10-05 |
Development of novel metabolite-responsive transcription factors via transposon-mediated protein fusion
2018-02-01, Protein engineering, design & selection : PEDS
DOI:10.1093/protein/gzy001
PMID:29385546
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研究论文 | 开发了一种通过转座子介导的蛋白质融合将代谢物结合蛋白转化为代谢物响应转录因子的通用方法 | 提出了名为BERDI的创新方法，利用体外转座子插入反应在代谢物结合蛋白中随机插入DNA结合域，创建新型生物传感器 | 该方法目前仅以麦芽糖结合蛋白为模型进行验证，尚未在其他代谢物结合蛋白上广泛应用 | 开发通用方法将代谢物结合蛋白转化为代谢物响应转录因子 | 麦芽糖结合蛋白和锌指DNA结合域 | 合成生物学 | NA | 转座子插入反应、荧光激活细胞分选 | NA | NA | NA | BERDI | NA | 代谢物响应转录因子生物传感器 | 代谢工程, 合成生物学 |
| 332 | 2025-10-05 |
Targeted metabolomics-guided rational refinement of cyanobacterial metabolism enables enhanced photosynthetic production of L-lysine
2025-Nov, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2025.07.015
PMID:40754064
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研究论文 | 本研究通过靶向代谢组学指导蓝藻代谢工程，显著提高了光合作用驱动的L-赖氨酸产量 | 首次结合靶向代谢组学与合成生物学方法系统识别并解除蓝藻赖氨酸生物合成的限速步骤 | 研究仅针对Synechococcus sp. PCC 7002菌株，未在其他蓝藻中验证通用性 | 开发碳负排放的赖氨酸光合生物合成路线 | 聚球藻Synechococcus sp. PCC 7002 | 合成生物学 | NA | 靶向代谢组学, 合成生物学 | NA | 代谢物数据 | 工程菌株系列 | 代谢工程 | Synechococcus sp. PCC 7002 | 赖氨酸生物合成途径优化 | 工业生物技术, 能源 |
| 333 | 2025-10-05 |
Genome mining of tailoring enzymes from biosynthetic gene clusters for synthetic biology: A case study with fungal methyltransferases
2025-Nov, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2025.08.001
PMID:40774411
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研究论文 | 本研究开发了一种基于机器学习的基因组挖掘方法，用于从真菌生物合成基因簇中识别可修饰聚酮底物的甲基转移酶 | 首次将机器学习方法应用于真菌甲基转移酶的功能预测，成功实现了对未知功能酶的精准筛选 | 仅针对甲基转移酶进行了验证，方法在其他类型修饰酶中的适用性仍需进一步验证 | 开发高效的基因组挖掘方法以识别真菌生物合成基因簇中的修饰酶 | 真菌天然产物生物合成基因簇中的甲基转移酶 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、机器学习 | 机器学习 | 基因组数据 | 101,321个真菌BGCs中的16,748个推定甲基转移酶 | NA | 微生物细胞工厂 | NA | 医药、生物工业 |
| 334 | 2025-10-05 |
Advances in metabolic engineering of Vibrio natriegens as an unconventional host for biotechnology
2025-Nov, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2025.08.008
PMID:40834994
|
综述 | 本文综述了非传统生物技术宿主Vibrio natriegens在代谢工程领域的最新进展 | 利用Vibrio natriegens作为非传统生物技术宿主，具有高生长速率和天然感受态等独特优势 | NA | 总结Vibrio natriegens作为生物技术宿主的工程化进展和应用潜力 | Vibrio natriegens海洋细菌 | NA | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | Vibrio natriegens | 代谢途径、生物传感器、合成生物学回路 | 工业生物技术、环境、医药 |
| 335 | 2025-10-05 |
The future of cultured meat: focusing on multidisciplinary, digitization, and nutritional customization
2025-Nov, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2025.117005
PMID:40922220
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综述 | 本文综述了培养肉领域的前沿工程技术、生物材料应用，并探讨了通过生物工程、合成生物学和人工智能加速发展的未来趋势 | 重点关注培养肉的多学科融合、数字化技术和营养定制化发展方向 | NA | 促进智能细胞农业发展，实现定制化肉类产品生产 | 培养肉生产技术 | 生物技术 | NA | 组织工程、生物技术、生物工程、合成生物学、人工智能 | NA | NA | NA | NA | 干细胞 | NA | 食品工业 |
| 336 | 2025-10-05 |
Modular RNAi Pathway Engineering Enhances Plasmid Copy Number Control in Yeast Bioproduction System
2025-Oct, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.70014
PMID:40583249
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研究论文 | 通过构建正交RNA干扰系统开发了酿酒酵母中可动态调控质粒拷贝数的合成生物学平台 | 发现RNAi系统重建意外导致质粒拷贝数扩增，并据此开发了化学诱导型基因剂量控制平台 | NA | 优化微生物细胞工厂的代谢通量并减少细胞负担 | 酿酒酵母 | 合成生物学 | NA | RNA干扰 | NA | NA | NA | RNAi | 酿酒酵母 | 靶向质粒编码选择标记的序列特异性siRNA设计，类胡萝卜素生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 337 | 2025-10-05 |
Engineered Coenzyme A Biosynthesis and Butyrate Transporter Drives High-Efficient Butyrate Synthesis in Escherichia coli
2025-Oct, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.70018
PMID:40641096
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研究论文 | 本研究通过工程化大肠杆菌的辅酶A生物合成和丁酸转运系统，实现了高效丁酸合成 | 通过解除辅酶A介导的抑制和优化TolC相关的MdtEF外排泵，协同提高了丁酸产量 | NA | 提高大肠杆菌中丁酸的合成效率和产量 | 大肠杆菌JH016菌株 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 大肠杆菌 | 异源丁酸生物合成途径，辅酶A生物合成途径优化，丁酸转运系统 | 化学工业, 食品工业, 制药工业 |
| 338 | 2025-10-05 |
Parallel DLD microfluidics for chloroplast isolation and sorting
2025-Sep-09, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d5lc00348b
PMID:40497380
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研究论文 | 开发了一种基于确定性侧向位移(DLD)的微流控平台，用于实现叶绿体按尺寸分离 | 集成四个平行DLD阵列实现带通过滤，可在单一设备中同时分离不同尺寸的叶绿体 | 分离效率为50-85%，回收组分纯度为17-66%，仍有提升空间 | 解决传统叶绿体分离方法的技术挑战，开发快速自动化的分离平台 | 植物细胞叶绿体 | 微流控技术 | NA | 确定性侧向位移(DLD)微流控技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 植物研究, 生物技术, 合成生物学 |
| 339 | 2025-10-05 |
Synthetic biology-driven design and bioproduction of mechanical proteins
2025-Sep-09, Biomaterials science
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d5bm00646e
PMID:40827630
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综述 | 本文系统总结了结构蛋白异源生物合成的工程策略与最新进展 | 全面整合了表达宿主改造、分子设计创新和培养条件优化等关键方法 | NA | 推动高性能结构蛋白基生物材料的创新发展 | 重组结构蛋白 | 合成生物学 | NA | 异源生物合成 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 材料 |
| 340 | 2025-10-05 |
Streptomyces as a versatile host platform for heterologous production of microbial natural products
2025-Sep-09, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00036j
PMID:40923873
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综述 | 本文系统分析了2004-2024年间链霉菌作为异源表达平台在微生物天然产物生物合成基因簇表达中的应用 | 首次对20年间450多项研究进行定量分析，提供了该领域发展趋势的数据驱动视角 | NA | 评估链霉菌作为异源表达平台在微生物天然产物开发中的应用潜力 | 微生物生物合成基因簇(BGCs)及其异源表达 | 合成生物学 | NA | 异源表达、基因组工程、组合生物合成 | NA | 文献数据 | 450多项同行评审研究 | 基因组工程 | 链霉菌(Streptomyces) | 生物合成基因簇表达平台 | 医药, 工业生物技术 |