合成生物学相关文章
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当前共找到 4700 篇文献，本页显示第 321 - 340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2026-03-05 |
Quantitative Characterization of Gene Regulatory Circuits Associated With Fungal Secondary Metabolism to Discover Novel Natural Products
2024-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202407195
PMID:39467708
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研究论文 | 本研究开发了一种结合微流体平台与数学模型的系统，用于在单细胞水平上定量表征真菌基因调控回路，并利用该平台成功重构了生物活性分子的生物合成途径 | 首次将先进微流体平台与数学模型结合，实现了对多细胞真菌基因调控回路在单细胞水平的精确表征与定量分析 | 研究主要基于模式真菌构巢曲霉，尚未广泛验证于其他真菌物种 | 定量表征真菌次级代谢相关基因调控回路，以发现新型天然产物 | 真菌基因调控回路（GRCs）及其调控的次级代谢生物合成基因簇（BGCs） | 合成生物学 | NA | 微流体平台、数学模型、基因回路重构 | 数学模型 | 单细胞表达数据 | 30个转录因子-启动子组合（源自两个代表性真菌GRCs） | 基因回路重构 | 构巢曲霉（Aspergillus nidulans） | 基因调控回路（GRCs）、生物合成基因簇（BGCs）重构 | 医药、工业生物技术 |
| 322 | 2026-03-05 |
Regulostat Inferelator: a novel network biology platform to uncover molecular devices that predetermine cellular response phenotypes
2019-08-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkz417
PMID:31114928
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研究论文 | 本文提出了一种名为Regulostat Inferelator（RSI）的新型网络生物学算法，用于识别能够预先决定和微调细胞表型响应的基因调控网络 | 首次开发了能够从基础转录组数据中识别具有“调节器”功能的基因对的算法，并首次提供了癌症细胞中药物-调节器相互作用的证据 | 目前仅为概念验证研究，需要进一步的实验验证 | 开发识别预先决定细胞表型响应的分子调控网络的工具 | 基因表达模式、细胞表型响应、癌症细胞 | 网络生物学 | 癌症 | 转录组数据分析 | RSI算法 | 转录组数据 | NA | NA | NA | 调节器网络（具有类似变阻器合作模式的基因对） | 医学、生物工程 |
| 323 | 2026-03-04 |
High-performance bioimaging and biosensing via nucleobase-editing enzymes
2026-Mar-03, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d5cs00678c
PMID:41773995
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综述 | 本文综述了核苷碱基编辑酶在生物成像和生物传感中的应用，包括其催化原理、集成模式及未来发展方向 | 将核苷碱基编辑酶重新用作可编程执行器，实现高特异性、高效扩增和生理条件兼容的生物传感与成像系统 | NA | 探讨核苷碱基编辑酶在生物传感和生物成像中的新兴应用，以提升诊断、治疗监测和合成生物学的平台性能 | 核苷碱基编辑酶（如脱氨酶、甲基转移酶/去甲基酶、DNA糖基化酶）及其在核酸、蛋白质和细胞过程监测中的应用 | NA | NA | 核苷碱基编辑技术，包括脱氨、甲基化/去甲基化、碱基切除等反应 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、合成生物学 |
| 324 | 2026-03-04 |
Building AuxInYeast Synthetic Biology Strains for Biochemical Characterization of Maize Auxin Hormone Signaling Components
2026-Mar-02, Cold Spring Harbor protocols
DOI:10.1101/pdb.prot108634
PMID:40074300
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研究论文 | 本文介绍了一种名为AuxInYeast的合成生物学工具，用于在酵母中构建玉米生长素信号通路组件，以进行生化表征 | 开发了AuxInYeast系统，作为植物合成生物学底盘，首次在酵母中重建玉米生长素信号通路，实现高通量定量分析 | 系统基于酵母环境，可能不完全模拟植物体内复杂调控网络，且仅针对玉米组件，通用性需进一步验证 | 构建合成生物学菌株，以生化表征玉米生长素激素信号通路组件 | 玉米生长素信号通路组件，包括受体、阻遏物、辅阻遏物、转录因子和响应元件 | 合成生物学 | NA | 流式细胞术、荧光蛋白标记 | NA | 生化数据、荧光信号数据 | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 酵母 | 生长素信号通路，包括受体-阻遏物复合物、转录激活级联和响应元件 | 农业, 工业生物技术 |
| 325 | 2026-03-04 |
Testing AuxInYeast Synthetic Biology Strains via Fluorescence Flow Cytometry
2026-Mar-02, Cold Spring Harbor protocols
DOI:10.1101/pdb.prot108635
PMID:40074301
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研究论文 | 本文介绍了一种使用荧光流式细胞术测试AuxInYeast合成生物学菌株的协议，用于分析玉米生长素信号通路 | 开发了基于酵母异源表达平台的AuxInYeast系统，结合荧光流式细胞术实现高通量定量测量植物生长素信号通路组件 | NA | 工程化玉米生长和发育，通过合成生物学工具分析生长素激素信号通路 | 玉米生长素感知受体和荧光标记的阻遏蛋白 | 合成生物学 | NA | 荧光流式细胞术 | NA | 荧光数据 | 多个AuxInYeast菌株，具体数量未指定 | AuxInYeast系统 | 酵母 | 生长素感知和阻遏蛋白降解的生物传感器通路 | 农业 |
| 326 | 2026-03-04 |
Advancing Genetic Code Expansion in Live Cells Through Metabolic Engineering
2026-Mar-02, Annual review of chemical and biomolecular engineering
IF:7.6Q1
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综述 | 本文综述了通过代谢工程在活细胞中推进遗传密码扩展（GCE）的进展，重点关注非标准氨基酸（nsAAs）的生物合成及其在合成生物学中的应用 | 整合代谢工程与GCE，实现nsAAs的生物合成，减少对化学合成补充的依赖，拓展蛋白质化学功能 | 现有GCE方法通常依赖细胞培养基中化学合成nsAAs的补充，这限制了其应用范围 | 克服GCE中nsAAs来源的限制，通过代谢工程实现nsAAs的生物合成，以促进合成生物学应用 | 遗传密码扩展（GCE）、非标准氨基酸（nsAAs）、活细胞中的蛋白质翻译 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、遗传密码扩展（GCE） | NA | NA | NA | NA | 活细胞（未指定具体宿主） | 生物合成途径设计，用于生产非标准氨基酸（nsAAs） | 医学、工业生物技术 |
| 327 | 2026-03-04 |
Engineering non-ribosomal peptide synthesis: tuning the antibiotics engine of the microbial world
2026-Mar-02, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2026.2615819
PMID:41771683
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综述 | 本文综述了通过合成生物学方法工程化非核糖体肽合成以优化抗生素生产的进展 | 聚焦于通过工程化前体代谢物、改变代谢流、引入强启动子和调控因子以及重定向代谢至生物合成基因簇，以提高非核糖体肽的产量和生物活性 | NA | 利用合成生物学优化非核糖体肽的合成，以增强其作为抗生素的医药应用 | 非核糖体肽合成酶及其产生的肽类抗生素 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 生物合成基因簇的工程化表达 | 医药 |
| 328 | 2026-03-04 |
A meta-analysis of the gut microbiome in inflammatory bowel disease patients identifies disease-associated small molecules
2025-Feb-12, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2025.01.002
PMID:39947133
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meta-analysis | 通过荟萃分析炎症性肠病患者肠道微生物组的小分子生物合成基因簇，鉴定出与克罗恩病相关的脂肪酸酰胺，并验证其破坏肠道通透性和加剧疾病的作用 | 首次通过合成生物学方法解析了克罗恩病相关基因簇产生的六种脂肪酸酰胺结构，并证实这些微生物来源小分子在疾病发生中的作用 | 研究主要基于小鼠模型验证，人类样本中的直接致病机制仍需进一步探究 | 探究肠道微生物组小分子代谢物在炎症性肠病发病机制中的作用 | 炎症性肠病患者和健康对照的肠道宏基因组样本、克罗恩病相关基因簇产物、结肠炎小鼠模型 | 宏基因组学 | 炎症性肠病（克罗恩病） | 宏基因组测序、合成生物学、结构解析 | NA | 宏基因组数据、质谱数据 | IBD患者与健康对照的粪便样本（具体数量未明确说明） | 合成生物学 | 梭菌属（Clostridia） | 小分子生物合成基因簇（BGCs） | 医学 |
| 329 | 2026-03-04 |
Recent advances in CAR T-cell engineering using synthetic biology: Paving the way for next-generation cancer treatment
2024, Advances in protein chemistry and structural biology
DOI:10.1016/bs.apcsb.2024.02.003
PMID:38762281
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综述 | 本章节全面探讨了合成生物学在CAR T细胞疗法中的创新应用，以推动下一代癌症治疗的发展 | 强调合成生物学通过基因编辑、合成基因电路和分子工程技术，优化CAR T细胞功能，提升治疗的安全性和有效性 | NA | 探索合成生物学如何增强CAR T细胞疗法的个性化和精准性，以改善癌症治疗效果 | CAR T细胞疗法及其在癌症免疫治疗中的应用 | 合成生物学 | 癌症 | 基因编辑、合成基因电路、分子工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | T细胞 | 合成基因电路，用于优化CAR T细胞功能，如逻辑门或生物传感器设计 | 医学 |
| 330 | 2026-03-04 |
GroovDB: A Database of Ligand-Inducible Transcription Factors
2022-10-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.2c00382
PMID:36178800
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研究论文 | 本文介绍了GroovDB，一个用于配体诱导型转录因子的数据库，旨在支持合成生物学中的工程应用 | 开发了一个经过验证的、可访问的数据库，整合了配体诱导型转录因子的序列、配体和操作数据，并提供了自动化数据管理和可视化工具 | NA | 为合成生物学提供一个可靠的配体诱导型转录因子资源库，以促进遗传电路的设计和应用 | 配体诱导型原核转录因子及其相关数据 | 合成生物学 | NA | 自动化数据管理流程 | NA | 序列数据、配体数据、操作数据 | NA | NA | 原核生物 | 化学响应型遗传电路 | 工业生物技术、医学 |
| 331 | 2026-03-04 |
Engineering modular and orthogonal genetic logic gates for robust digital-like synthetic biology
2011-Oct-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/ncomms1516
PMID:22009040
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研究论文 | 本文构建了一个基于大肠杆菌的正交AND逻辑门，利用来自Pseudomonas syringae的新型异源调控模块，实现模块化和数字化的合成生物学设计 | 采用来自Pseudomonas syringae的新型异源调控模块构建正交AND逻辑门，展示了模块化设计和与NOT门组合形成NAND门的能力 | NA | 构建模块化和正交的遗传逻辑门，以定制细胞信号传导并实现稳健的数字化合成生物学设备 | 大肠杆菌中的遗传逻辑门电路 | 合成生物学 | NA | 定量表征、建模、构建和测试的基于部件的工程方法 | NA | NA | NA | 基于部件的工程方法 | 大肠杆菌 | 正交AND逻辑门，由两个共激活基因hrpR和hrpS控制输入，σ(54)依赖的hrpL启动子驱动输出，可模块化组合形成NAND门 | 工业生物技术 |
| 332 | 2026-03-03 |
Metabolomics-guided engineering of drought-resilient crops: Integrating multi-omics and AI for climate-smart agriculture
2026-Apr, Plant science : an international journal of experimental plant biology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.plantsci.2026.113025
PMID:41662977
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综述 | 本文综述了代谢组学在指导抗旱作物工程化中的应用，重点探讨了其与多组学、CRISPR基因编辑、合成生物学及人工智能等前沿技术的整合，旨在构建一个面向气候智能型农业的转化框架 | 强调将代谢组学从诊断工具发展为预测性和规范性平台，并系统整合了单细胞/空间代谢组学、生态代谢组学及AI驱动建模等新兴前沿方向，以连接实验室发现与田间应用 | NA | 构建一个整合多组学、基因编辑、合成生物学和人工智能的转化框架，以培育抗旱作物，应对全球粮食安全威胁 | 作物（特别是面临干旱胁迫的作物）及其在干旱响应中的代谢物 | NA | NA | 代谢组学，多组学整合，CRISPR基因编辑，通路工程，合成生物学，人工智能 | AI驱动的预测模型 | 代谢组学数据，多组学数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 作物（植物） | 通路工程 | 农业 |
| 333 | 2026-03-03 |
Synthetic biology for heterologous expression and engineering of fungal polyketide synthases
2026-Mar-02, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00020c
PMID:41770117
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综述 | 本文综述了真菌聚酮合酶（PKS）的异源表达与工程化策略，包括宿主选择、工程策略及未来发展方向 | 系统总结了真菌PKS工程化的两大关键设计原则（宿主选择与工程策略），并提出了整合先进计算工具等未来方向 | NA | 探讨真菌聚酮合酶的异源表达与工程化方法，以拓展聚酮类天然产物的应用潜力 | 真菌聚酮合酶（PKS）及其产生的天然产物 | 合成生物学 | NA | 异源表达、点突变、结构域交换 | NA | NA | NA | NA | 酵母、丝状真菌 | 聚酮合酶工程化（包括起始单元选择、点突变、结构域交换） | 医药、农业、生物技术 |
| 334 | 2026-03-03 |
Molecular characterization following expression analysis of sugar transporters in passion fruit to explore their roles in fruit development and abiotic stress tolerance
2026-Mar, 3 Biotech
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s13205-026-04707-0
PMID:41768418
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研究论文 | 本研究通过全基因组分析鉴定百香果中的55个糖转运蛋白，探究其在果实发育和非生物胁迫耐受中的功能 | 首次在百香果中进行糖转运蛋白的全基因组鉴定，结合分子对接、动力学模拟和表达分析揭示其功能多样性及胁迫响应机制 | NA | 探索百香果糖转运蛋白在果实发育和非生物胁迫耐受中的潜在作用 | 百香果（Passiflora edulis）中的糖转运蛋白基因家族 | 植物分子生物学 | NA | 全基因组分析、RNA-seq、实时定量PCR、分子对接、分子动力学模拟 | NA | 基因组序列、RNA-seq数据、蛋白质序列 | NA | 合成生物学 | 百香果（植物） | 合成生物学指导的电路设计，用于开发多重非生物胁迫耐受的高糖百香果 | 农业 |
| 335 | 2026-03-03 |
Chromatin Landscape of Saccharomyces cerevisiae Acquiring H3K9 Methylation and Its Reader Molecule HP1
2026-Jan, Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms
IF:1.3Q4
DOI:10.1111/gtc.70072
PMID:41362113
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法，将小鼠H3K9甲基转移酶和HP1引入酿酒酵母，探究H3K9甲基化及其阅读器分子HP1对转录和染色质压缩的影响 | 首次在缺乏H3K9甲基化系统的酿酒酵母中引入哺乳动物H3K9甲基转移酶和HP1，以简化系统研究其在异染色质形成中的作用 | 研究仅在酿酒酵母的基因体区域进行，可能不适用于其他生物或染色质区域；H3K9甲基化和HP1单独不足以改变高阶染色质结构 | 探究H3K9甲基化和HP1在异染色质形成中的重要性及其对转录和染色质结构的影响 | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae） | 合成生物学 | NA | Hi-C-seq分析 | NA | 基因组测序数据 | NA | 合成生物学方法 | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae） | 引入小鼠H3K9甲基转移酶和HP1以模拟异染色质表观基因组系统 | 基础生物学研究 |
| 336 | 2026-03-03 |
Imagining an ethics for synthetic biology
2026, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2026.1746379
PMID:41767306
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 337 | 2026-03-03 |
Intestinal Delivery of Probiotics: Materials, Strategies, and Applications
2024-08, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202310174
PMID:38245861
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综述 | 本文综述了用于肠道递送的益生菌类型、不同的益生菌封装策略（化学、物理、遗传策略及其组合）以及使用纳米涂层方法的新兴单细胞封装策略的最新进展 | 讨论了纳米技术如何提高益生菌在肠道递送中的存活率和抗逆性，并强调了合成生物学为高效、有目的地设计和操控益生菌创造的新机遇 | NA | 探讨益生菌的肠道递送材料、策略及其应用，以应对益生菌在加工、口服摄入和肠道递送过程中的存活与定植难题 | 用于肠道递送的益生菌 | NA | NA | 纳米技术，合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 益生菌 | NA | 医学 |
| 338 | 2026-03-03 |
Development of novel metabolite-responsive transcription factors via transposon-mediated protein fusion
2018-02-01, Protein engineering, design & selection : PEDS
DOI:10.1093/protein/gzy001
PMID:29385546
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研究论文 | 本文开发了一种名为BERDI的通用方法，通过转座子介导的蛋白质融合将代谢物结合蛋白转化为代谢物响应转录因子 | 提出了一种新的生物传感器工程策略，利用体外转座子插入反应生成所有可能的DNA结合域插入变体，从而创建新型代谢物响应转录因子 | NA | 开发一种通用方法，将代谢物结合蛋白转化为代谢物响应转录因子，以解决缺乏天然生物传感器的代谢物检测问题 | 麦芽糖结合蛋白作为模型代谢物结合蛋白，以及锌指DNA结合域 | 合成生物学 | NA | 转座子插入反应，荧光激活细胞分选 | NA | NA | NA | 转座子介导的蛋白质融合 | NA | 代谢物响应转录因子生物传感器 | 代谢工程，合成生物学 |
| 339 | 2026-03-02 |
Synthetic Biology and Metabolic Engineering of Microalgae for Sustainable Lipid and Terpenoid Production: An Updated Perspective
2026-Mar, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70405
PMID:41117552
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综述 | 本文是一篇关于微藻合成生物学与代谢工程用于可持续生产脂质和萜类化合物的最新进展的综述 | 整合并批判性评估了关键微藻模型（如莱茵衣藻、微拟球藻和三角褐指藻）的最新研究进展，重点介绍了加速设计-构建-测试-学习（DBTL）循环的新型遗传工具包、基因组规模代谢建模的突破，以及用于高价值化合物细胞器靶向生物合成的创新策略 | NA | 评估微藻合成生物学与代谢工程的最新进展，以推动其作为可持续生产脂质和萜类化合物的生物平台 | 微藻，特别是莱茵衣藻、微拟球藻和三角褐指藻等关键模型 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、代谢工程、基因组规模代谢建模 | NA | NA | NA | NA | Chlamydomonas reinhardtii, Nannochloropsis spp., Phaeodactylum tricornutum | 用于高价值化合物（如多不饱和脂肪酸和萜类）生物合成的代谢途径 | 食品, 燃料, 生物制造 |
| 340 | 2026-03-02 |
Ultrasound-Responsive Engineered Bacteria for Targeted Cancer Therapy: Strategies, Mechanisms, and Applications
2026-Mar-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202523952
PMID:41764403
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综述 | 本文综述了超声响应型工程菌在肿瘤靶向治疗中的策略、机制与应用进展 | 聚焦于将外源性响应调控因子（如超声）与微生物疗法相结合，为肿瘤治疗提供更智能、精准的治疗策略 | NA | 总结工程菌在肿瘤治疗中的核心改造方法、作用机制及主要应用策略，并重点阐述超声与工程菌结合的形式与相互作用机制 | 工程菌及其与超声结合的系统 | 合成生物学 | 肿瘤 | 生物与物理化学方法的功能修饰与工程化 | NA | NA | NA | NA | 多种来源的细菌 | NA | 医学 |