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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2026-06-06 |
Amodiaquine Enhances Anti-Melanoma Efficacy of Attenuated Salmonella via Targeting Glutathione Reductase in Neutrophils
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202515009
PMID:41588921
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研究论文 | 通过结合阿莫地喹与减毒沙门氏菌VNP20009,靶向中性粒细胞中的谷胱甘肽还原酶来增强抗黑色素瘤疗效 | 首次揭示VNP招募的中性粒细胞主要为促肿瘤N2亚型,并发现阿莫地喹通过结合GR降低中性粒细胞ROS耐受性,在高ROS肿瘤微环境中选择性清除这些细胞,从而增强抗肿瘤效果 | NA | 探究减毒沙门氏菌VNP20009在癌症治疗中中性粒细胞的作用机制,并开发联合治疗策略以增强抗黑色素瘤疗效 | 中性粒细胞(特别是N2亚型)、谷胱甘肽还原酶(GR)、减毒沙门氏菌VNP20009、黑色素瘤 | 合成生物学 | 黑色素瘤 | 化学生物学、基因工程(GR-shRNA) | NA | NA | NA | CRISPR相关、RNA干扰(shRNA) | 减毒沙门氏菌VNP20009 | GR-shRNA负载的VNP菌株 | 医学 |
| 322 | 2026-06-06 |
Engineering Immune Cell to Counteract Aging and Aging-Associated Diseases
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202521776
PMID:41603194
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综述 | 本文综述了工程化免疫细胞在对抗衰老及衰老相关疾病中的原理、挑战与前景 | 系统总结了基于免疫细胞的抗衰老疗法原理,结合嵌合抗原受体-T细胞等前沿技术,并强调多学科交叉(纳米技术、合成生物学、人工智能)推动个性化抗衰老干预 | 靶点特异性有限、免疫抑制微环境、细胞来源和功能变异等挑战尚待解决 | 探讨免疫细胞工程在抗衰老领域的治疗潜力,推动精准医疗延长健康寿命 | 嵌合抗原受体工程化免疫细胞(如嵌合抗原受体-T细胞) | 数字病理学 | 老年疾病 | 嵌合抗原受体工程化免疫细胞 | NA | NA | NA | 嵌合抗原受体-T细胞 | NA | 嵌合抗原受体工程化免疫细胞(用于清除衰老细胞) | 医学 |
| 323 | 2026-06-06 |
Mistletoe- and Mussel-Inspired Fabrication of Hierarchically Structured Protein-Cellulose Scaffolds From Biomolecular Condensates
2026-Mar, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202520827
PMID:41603494
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研究论文 | 受槲寄生和贻贝启发,利用生物分子凝聚体制造具有层次结构的蛋白质-纤维素支架 | 首次结合动物和植物系统中可变形生物分子相的研究成果,开发了一种受贻贝和槲寄生启发的协同方法,用于制造具有可调层次结构的蛋白质-纤维素复合支架 | 文中未明确提及局限性 | 开发一种生物启发的方法,利用生物分子凝聚体制造具有层次结构的蛋白质-纤维素复合支架,并探究其在组织工程中的应用潜力 | 重组贻贝足蛋白-1 (rMfp-1) 和表面功能化的阴离子纤维素纳米棒 | 生物材料 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 材料 |
| 324 | 2026-06-06 |
The Coli Toolkit (CTK): An Extension of the Modular Yeast Toolkit for Use in E. coli
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00489
PMID:41581077
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研究论文 | 本文介绍了Coli Toolkit(CTK),一个基于Golden Gate的模块化克隆系统,扩展了Yeast Toolkit用于大肠杆菌的遗传电路构建 | 通过将启动子细分为子部件(启动子、绝缘核酶和核糖体结合位点),增强了对转录和翻译的灵活控制,并提供预组装的NOT门基本部件以加快大型遗传电路的克隆 | 未明确讨论该工具包在大规模复杂电路设计中的潜在挑战或与其他系统的直接性能比较 | 为大肠杆菌提供一个快速高效的遗传电路组装模块化工具包,填补细菌合成生物学基础设施的关键空白 | 大肠杆菌中的遗传电路 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | 校准模型 | 表征数据 | NA | Golden Gate Assembly | 大肠杆菌 | 遗传电路,NOT门,可诱导和组成型启动子 | 健康、可持续性、生物技术 |
| 325 | 2026-06-06 |
Rational engineering of combinatorial bacterial therapies for cancer
2026-Jan-28, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-03951-0
PMID:41606628
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综述 | 本文综述了合成生物学在工程化细菌用于癌症治疗中的最新进展,重点讨论了基因回路设计如何增强肿瘤特异性、调控治疗递送和调动宿主免疫系统 | 强调了通过理性工程实现时空控制和菌群行为编程的策略,为下一代微生物疗法提供指导 | 当前临床转化存在障碍,但本文未具体展开,仅作简要讨论 | 促进工程化细菌作为癌症治疗方法的开发和应用 | 工程化细菌及其基因回路设计 | 合成生物学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学基因回路工具箱 | 细菌 | 基因回路,包括减毒控制、有效载荷释放和免疫调节回路 | 医学 |
| 326 | 2026-06-06 |
Microbial melanin: biosynthesis, functional Insights, and emerging research challenges
2026-Jan-27, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04757-1
PMID:41591674
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综述 | 综述微生物黑色素的生物合成、功能见解及新兴研究挑战 | 系统总结了组学技术和基因工程在阐明微生物黑色素合成机制和提高产量中的关键作用,并提出了整合合成生物学、先进分析技术和安全性评估的未来研究方向 | 强调该领域仍存在挑战和争议,从基础研究到工业化之间存在差距 | 为微生物黑色素领域的研究者提供全面且关键的参考,推动基础研究与工业化的衔接 | 微生物黑色素及其产生菌(细菌和真菌) | NA | NA | 组学技术,基因工程,分析技术 | NA | NA | NA | NA | 细菌,真菌 | NA | 工业生物技术 |
| 327 | 2026-06-06 |
A modular single- and dual-gene expression toolkit for Kluyveromyces marxianus
2026-Jan-23, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-04794-4
PMID:41571921
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研究论文 | 为马克斯克鲁维酵母开发了一套模块化的单基因和双基因表达工具包 | 首次基于筛选的pENO启动子和pHTX双向启动子,构建了适用于马克斯克鲁维酵母的单基因和双基因表达系统,并实现了与HEM1共表达增强血红素合成,提升外源蛋白产量 | 表达水平受遗传元件组合、碳源和培养时间影响,尚未测试在工业大规模发酵条件下的稳定性 | 扩展马克斯克鲁维酵母的合成生物学工具库,提高其作为工业蛋白生产底盘菌株的适用性 | 马克斯克鲁维酵母(Kluyveromyces marxianus) | 合成生物学 | NA | 基因表达系统构建 | NA | NA | 多个马克斯克鲁维酵母菌株 | NA | 马克斯克鲁维酵母(K. marxianus) | 单基因表达系统、双基因表达系统、双顺反子表达系统 | 工业生物技术,医药 |
| 328 | 2026-06-06 |
Breaking the cell wall for efficient DNA delivery to diatoms
2026-Jan-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68562-6
PMID:41571648
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研究论文 | 报道了两种优化方法用于高效递送DNA和Cas9核糖核蛋白复合物到模式硅藻三角褐指藻,并实现了体内组装和大片段质粒传递 | 首次发现通过电穿孔可在硅藻细胞内通过非同源或同源修复机制直接组装附加体(命名为DIVA技术),并将PEG方法成功应用于另一种硅藻Thalassiosira pseudonana | 未提及 | 开发高效遗传工具以促进硅藻合成生物学研究及可持续发展技术应用 | 硅藻(三角褐指藻和Thalassiosira pseudonana) | 合成生物学 | NA | 电穿孔、PEG转化、Cas9核糖核蛋白复合物递送 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 三角褐指藻, Thalassiosira pseudonana | 附加体(线性或环形)的体内组装 | 工业生物技术, 环境 |
| 329 | 2026-06-06 |
Phyllosphere microbiome: Exploring the unexplored frontiers for precision agricultural and environmental sustainability
2026-Jan-19, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-04788-2
PMID:41549150
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综述 | 综述叶际微生物组在可持续农业和环境保护中的潜能与挑战 | 强调利用组学技术、微生物联合工程和纳米递送系统克服叶际微生物实际应用的障碍 | 叶际微生物应用受限于环境不稳定性、田间持久性差及功能特征不完全 | 推动精准农业和环境可持续性发展 | 叶际微生物组(细菌、真菌、酵母) | 机器学习 | NA | 组学技术 | NA | NA | NA | 合成生物学、生态建模 | 植物 | NA | 农业, 环境 |
| 330 | 2026-06-06 |
Development of a high-performance synthetic promoter for plant-based bioproduction
2026-Jan-19, Planta
IF:3.6Q1
DOI:10.1007/s00425-026-04925-z
PMID:41553553
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研究论文 | 通过副逆转录病毒启动子的结构域改组开发了一种高性能合成启动子,其活性比CaMV35S高4倍,并在植物中实现了重组蛋白的高效生产 | 通过策略性的分子间结构域改组,将FMV和MMV全长度转录启动子的关键调控区域融合,生成了活性比CaMV35S高4倍的新型合成启动子FM,并验证了其与CRISPR-dCas9/VP64正交调控系统的兼容性 | 未明确说明,但可能包括植物表达系统的瞬时稳定性限制以及研究主要集中在模式植物中 | 开发用于植物合成生物学和分子农业的高性能组成型启动子,以最大化重组蛋白产量 | FM合成启动子以及其在三种模式植物和转基因植株中的功能 | 合成生物学 | NA | 启动子工程、结构域改组、GUS检测、qRT-PCR、组织化学染色、CRISPR-dCas9/VP64转录激活、抗病毒测定 | NA | 基因表达数据、蛋白质活性测定数据 | 三种模式植物(烟草、本氏烟草、矮牵牛)用于瞬时表达;稳定转基因烟草和拟南芥品系 | CRISPR-dCas9/VP64 | 烟草(Nicotiana tabacum)、本氏烟草(Nicotiana benthamiana)、矮牵牛(Petunia × atkinsiana)、拟南芥(Arabidopsis thaliana) | 合成启动子FM驱动的抗病毒肽scytovirin表达系统 | 医学、分子农业 |
| 331 | 2026-06-06 |
Research and Application of the Polyene Macrolide Antibiotic Nystatin
2026-Jan-19, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules31020330
PMID:41599380
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综述 | 系统阐述了多烯大环内酯类抗生素制霉菌素的多组分化学性质、靶向麦角固醇的作用机制、质量控制分析技术、临床应用及组合疗法,以及在生物合成和基因编辑技术方面的最新进展 | 重点介绍了基因编辑技术特别是CRISPR/Cas9在靶向敲除毒性成分相关基因、优化生产菌株以提高制霉菌素产量和纯度方面的最新进展 | 未提及具体实验数据或临床研究结果的量化分析 | 为制霉菌素的进一步研究和临床应用提供参考,展望通过结构优化、创新递送系统和合成生物学策略提高其安全性和疗效的未来发展方向 | 制霉菌素的多组分化学性质、作用机制、毒性成分RT6、质量控制方法、临床应用、生物合成途径及基因编辑技术 | NA | 浅表真菌感染、口腔疾病、阴道炎、外耳炎 | CRISPR/Cas9, I型聚酮合酶途径 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 制霉菌素A的I型聚酮合酶组装机制及其后续修饰过程 | 医学 |
| 332 | 2026-06-06 |
Stem cells in organogenesis and regeneration
2026-Jan-18, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04889-z
PMID:41549301
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综述 | 综述了干细胞在器官发生与再生中的主要类型、来源、调控信号通路及临床转化进展 | 整合胚胎干细胞、诱导多能干细胞、间充质干细胞及类器官模型,结合CRISPR、3D生物打印和合成生物学等前沿技术,全面探讨干细胞生物学与临床转化潜力 | 未详细讨论具体实验局限性或定量比较不同干细胞疗法的效果 | 概述干细胞在器官发生与再生中的关键作用、调控机制及临床转化进展 | 干细胞(胚胎干细胞、诱导多能干细胞、间充质干细胞)及类器官 | 机器学习 | NA | CRISPR, 3D生物打印, 合成生物学 | NA | 文本 | NA | CRISPR, 3D生物打印, 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 333 | 2026-06-06 |
YhfH functions as a tri-function RNA in Bacillus thuringiensis BMB171
2026-Jan-14, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1528
PMID:41562254
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研究论文 | 揭示了苏云金芽孢杆菌BMB171中YhfH RNA作为一种三功能RNA的作用机制 | 首次发现YhfH RNA同时具有小RNA、反义RNA和信使RNA三种功能,即三功能RNA | NA | 阐明YhfH RNA的多功能调控机制及其在合成生物学中的应用潜力 | 苏云金芽孢杆菌BMB171菌株中的YhfH RNA | 合成生物学 | NA | RNA测序 | NA | RNA数据 | NA | NA | 苏云金芽孢杆菌BMB171 | 三功能RNA调控回路 | 合成生物学 |
| 334 | 2026-06-06 |
Marine-derived antimicrobial peptides (AMPs): Blue biotechnological assets for sustainable healthcare and circular bioeconomy
2026, Advances in protein chemistry and structural biology
DOI:10.1016/bs.apcsb.2025.08.002
PMID:41581932
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综述 | 综述海洋源抗菌肽作为可持续医疗和循环生物经济资源的蓝生物技术资产 | 强调了海洋源抗菌肽在应对抗菌素耐药性危机中的独特优势,包括低耐药倾向、多功能生物活性,以及通过基因组学、宏基因组学、机器学习和合成生物学等先进技术推动发现与优化的创新方法 | 讨论了生产可扩展性和监管框架等关键挑战,这些是商业化面临的主要障碍 | 综述海洋源抗菌肽在可持续医疗和循环生物经济中的应用潜力,并为其商业化路径提供清晰方向 | 海洋源抗菌肽,源自无脊椎动物、极端微生物和蓝细菌等海洋生物 | 计算生物学、合成生物学 | NA | 基因组学、宏基因组学、机器学习、合成生物学、异源表达、海洋生物质转化 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医疗、水产养殖、食品安全、环境修复 |
| 335 | 2026-06-06 |
High-throughput screening of biomolecules using cell-free systems
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.11.001
PMID:41581987
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综述 | 探索基于无细胞系统的高通量筛选原理、平台及应用 | 该系统绕开细胞生理限制,实现从DNA或RNA模板直接快速可调地表达生物分子,并与微孔板、液滴微流控及纸基设备等高通量平台集成 | 高试剂成本及有限的翻译后修饰 | 推动下一代生物分子筛选和治疗开发 | 生物分子(化合物、核酸、蛋白质) | 合成生物学、药物发现、诊断学、蛋白质工程 | NA | 无细胞系统、高通量筛选、液滴微流控、数字PCR、质谱 | NA | 荧光、发光、质谱、数字PCR信号 | NA | NA | 大肠杆菌、小麦胚芽、兔网织红细胞 | NA | 医学、工业生物技术 |
| 336 | 2026-06-06 |
Artificial intelligence for cell-free systems
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.009
PMID:41581993
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综述 | 探讨人工智能与无细胞系统的整合,关注最新进展、工业应用及未来方向 | 通过深度学习发现抗菌肽和主动学习实现蛋白产量34倍提升,展示了AI在无细胞系统优化中的显著成效 | 存在数据需求、模型可迁移性和可扩展性等挑战 | 研究AI在无细胞系统中的应用,推动合成生物学发展 | 无细胞系统,包括蛋白质合成和代谢过程 | 机器学习 | NA | 无细胞蛋白质合成 | 深度学习, 主动学习, 贝叶斯优化, 神经网络 | 实验数据 | NA | NA | NA | 代谢通路 | 生物制造, 制药, 诊断 |
| 337 | 2026-06-06 |
Harnessing Cannabis sativa as a dual-use platform for biohydrogen production and pharmaceutical synthesis: a hypothesis and theory
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1833491
PMID:42245109
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假设与理论 | 提出一种利用工程化大麻进行生物氢生产和药物合成的双用途生物炼制范式 | 提出利用工程化大麻的光合作用驱动绿色氢生产,同时保持其药用价值,并利用现有受控环境农业基础设施 | NA | 探索大麻作为双用途平台在生物氢生产和药物合成中的应用 | 工程化大麻 | 合成生物学 | NA | 光合电子流重定向、氢化酶活性工程 | NA | NA | NA | 合成生物学、氢化酶工程 | 大麻 (Cannabis sativa) | 光合电子流重定向至氧保护氢化酶通路,用于分子氢生成 | 能源、医药、工业生物技术 |
| 338 | 2026-06-06 |
DNABERT2-CAMP: A Hybrid Transformer-CNN Model for E. coli Promoter Recognition
2025-Dec-28, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17010027
PMID:41595447
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研究论文 | 提出一种混合Transformer-CNN模型DNABERT2-CAMP用于大肠杆菌启动子识别 | 首次将预训练DNABERT-2 Transformer与CNN-Attention-Mean Pooling模块结合,同时捕获长程基因组依赖和局部基序特征,显著提升启动子识别准确性和可解释性 | 未提及模型在其他细菌物种或长序列上的泛化能力,以及处理多类型启动子(如σ38、σ54)的表现 | 开发一种高精度、可解释的混合深度学习框架,用于大肠杆菌σ70启动子识别 | 大肠杆菌K-12菌株的σ70启动子序列 | 机器学习 | NA | DNABERT-2, CNN, Attention机制 | 混合Transformer-CNN模型(DNABERT-2 + CAMP模块) | 81-bp核苷酸序列 | 8720条经实验验证的阳性和阴性81-bp序列 | NA | E. coli | NA | 合成生物学, 基因组注释 |
| 339 | 2026-06-05 |
Unlocking non-model organisms with CRISPR-Cas: A roadmap for sustainable biotechnology
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108890
PMID:42000334
|
综述 | 该综述系统评估了将CRISPR-Cas基因组编辑应用于非模式生物所面临的挑战与机遇,并提出了一个框架以解决宿主特异性障碍、启用技术解决方案和实际应用 | 提出了一个系统框架,整合了宿主特异性障碍分析、创新技术解决方案(如Cas变体工程、宿主适应性递送系统、无DSB编辑方法)以及合成生物学与机器学习优化,旨在解锁非模式生物在可持续生物技术中的潜力 | 未具体说明局限性,但综述本身依赖于现有文献,可能存在数据覆盖不全的问题 | 评估并推动CRISPR-Cas编辑在非模式生物中的应用,以促进可持续生物技术(如低能耗生物制造、环境生物修复和碳捕获)的发展 | 非模式生物(非传统宿主) | 机器学习 | NA | CRISPR-Cas, 碱基编辑, 先导编辑, CRISPR相关转座酶, 重组酶辅助工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, CRISPR-Cas12, CRISPR-Cas13 | 非模式生物(泛指,如细菌、酵母、植物等,未具体指定) | NA | 农业, 生物制造, 环境修复 |
| 340 | 2026-06-05 |
Sustainable insect pest management using bioactive compounds derived from marine macroalgae: A comprehensive review
2026-Sep, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134672
PMID:42035956
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综述 | 综述了从海洋大型藻类中提取的生物活性化合物在可持续害虫管理中的应用潜力 | 系统总结了绿藻、棕藻和红藻中多种生物活性化合物的杀虫、驱避、拒食和生长调节特性,并强调了其在综合害虫管理中的作用及未来生物技术升级方向 | 实践应用受限于代谢物含量的季节性和区域变异性、大规模生产与提取成本高、田间验证不足及监管问题 | 评估海洋大型藻类生物活性化合物作为可持续害虫管理替代方案的潜力 | 海洋大型藻类(绿藻、棕藻、红藻)及其衍生的生物活性化合物 | 机器学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |