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当前共找到 4704 篇文献，本页显示第 321 - 340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2026-03-06 |
Repurposing bacterial secretion systems for the design of living therapeutics
2026-Mar-03, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102726
PMID:41780105
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综述 | 本文综述了如何重新利用细菌分泌系统来设计活体疗法，以在疾病部位直接分泌治疗性蛋白质 | 通过工程化共生和益生性大肠杆菌，利用病原体来源的分泌系统来分泌治疗性蛋白质，以解决药物靶向递送的挑战 | 讨论了每种分泌系统的潜在优势和局限性，以及需要进一步研究的领域 | 设计基于合成生物学的活体疗法，用于靶向递送治疗性蛋白质到疾病部位 | 共生和益生性大肠杆菌，以及其分泌系统 | 合成生物学 | 炎症性肠病 | 细菌分泌系统工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 大肠杆菌 | 分泌系统设计，包括来自病原体的系统，用于分泌治疗性蛋白质载荷 | 医学 |
| 322 | 2026-03-04 |
Publisher Correction: Engineering modular and orthogonal genetic logic gates for robust digital-like synthetic biology
2026-Mar-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69313-3
PMID:41771868
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 323 | 2026-03-06 |
Designing prokaryotic gene expression regulatory elements: From genomic mining to artificial intelligence-driven generation
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108781
PMID:41419171
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综述 | 本文系统回顾了原核生物基因表达调控元件的设计策略，从基因组挖掘到人工智能驱动生成 | 整合了生物物理模型和人工智能指导的理性设计方法，强调了深度生成模型在功能调控元件开发中的应用 | 未具体说明实验验证的局限性或数据可用性问题 | 优化微生物细胞工厂的生物生产，通过精细调控基因表达 | 原核生物基因表达调控元件 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、随机诱变、靶向诱变、深度生成建模 | 深度生成模型 | 序列数据 | NA | NA | 原核生物 | 基因表达调控元件，如启动子、核糖体结合位点等 | 工业生物技术 |
| 324 | 2026-03-06 |
Engineering Escherichia coli for high-level poly(3-hydroxybutyrate) production: Recent advances and future perspective
2026-Feb-28, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108858
PMID:41765153
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综述 | 本文综述了近年来在大肠杆菌中高效生产聚(3-羟基丁酸酯) (PHB) 的关键进展，并强调了使其成为可持续生物塑料生产有前景底盘的新兴策略 | 总结了通过优化前体供应、增强还原力、微调途径表达，特别是工程化糖酵解途径、引入合成途径（如还原甘氨酸和苏氨酸旁路途径）、删除竞争途径、表达phasin蛋白、优化启动子和辅因子再生策略等综合方法，显著提高了重组大肠杆菌中PHB的积累 | NA | 提高聚(3-羟基丁酸酯) (PHB) 的生产效率，以支持对可生物降解塑料日益增长的需求 | 大肠杆菌 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌 | 代谢途径（如还原甘氨酸和苏氨酸旁路途径） | 材料, 工业生物技术 |
| 325 | 2026-03-06 |
Designing synthetic regulatory elements using the generative AI framework DNA-Diffusion
2026-Jan, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02441-6
PMID:41437153
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DNA-Diffusion的生成式人工智能框架，用于设计具有细胞类型特异性的紧凑调控元件 | 利用机器学习训练DNA可及性数据，生成能重现内源转录因子结合语法并增强细胞类型特异性的合成调控元件 | NA | 系统设计调控元件以实现精确的基因表达控制 | 合成调控元件及其在基因调控中的应用 | 合成生物学 | 白血病 | STARR-seq, EXTRA-seq | 生成式人工智能框架 | DNA可及性数据 | 5,850个元件库在三种细胞系中验证 | NA | 多种细胞系 | 紧凑调控元件设计 | 医学 |
| 326 | 2026-03-06 |
A parts list of promoters and gRNA scaffolds for mammalian genome engineering and molecular recording
2025-Nov-11, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-025-02896-2
PMID:41219485
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研究论文 | 本文设计并量化了用于哺乳动物基因组工程和分子记录的启动子和gRNA支架变体库，以促进精确编辑和合成生物学应用 | 首次为哺乳动物系统开发了标准化的启动子和gRNA支架'部件列表'，包括数千个变体，其中数百个比常用序列活性更高，并通过饱和诱变筛选增强了序列多样性 | NA | 开发用于哺乳动物基因组工程和分子记录的标准化遗传部件库，以提高编辑效率和可预测性 | 哺乳动物细胞系（人类和小鼠）中的启动子和gRNA支架变体 | 合成生物学 | NA | 多重prime editing、饱和诱变筛选 | NA | 序列数据、编辑活性数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | gRNA阵列、'十键'阵列用于平衡pegRNA活性，适用于合成基因座、生物记录器和复杂遗传电路 | 医学、工业生物技术 |
| 327 | 2026-03-06 |
Plants against cancer: towards green Taxol production through pathway discovery and metabolic engineering
2024-Sep, aBIOTECH
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s42994-024-00170-8
PMID:39279861
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综述 | 本文综述了植物天然产物发现与工程中的挑战与进展，以抗癌药物紫杉醇生物合成途径中缺失酶的突破性发现为例 | 通过高通量测序和合成生物学方法，成功鉴定了紫杉醇生物合成途径中的关键缺失酶，为绿色生产提供了新途径 | NA | 加速药物发现并解决人类健康问题，特别是通过植物天然产物的工程化生产抗癌药物 | 植物天然产物，尤其是紫杉醇的生物合成途径 | 合成生物学 | 癌症 | 高通量测序、基因组组装、基因合成、分析技术 | NA | NA | NA | 合成生物学方法 | 植物 | 紫杉醇的生物合成途径 | 医药 |
| 328 | 2026-03-06 |
Enabling neighbour labelling: using synthetic biology to explore how cells influence their neighbours
2024-01-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.201955
PMID:38165174
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综述 | 本文综述了合成生物学和图像分析技术的最新进展，以探索细胞如何影响其邻近细胞 | 整合合成生物学工具与图像分析方法，以解决细胞间相互作用研究中的技术挑战 | 在发育模型系统中应用这些技术时存在机会和限制 | 探索细胞间相互作用在发育过程中的机制 | 细胞及其邻近细胞 | 合成生物学 | NA | 图像分析 | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 329 | 2026-03-06 |
Orthogonal translation enables heterologous ribosome engineering in E. coli
2021-01-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-20759-z
PMID:33500394
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研究论文 | 本研究通过正交翻译系统在E. coli中实现了异源核糖体工程，为合成生物学提供了新的核糖体改造框架 | 采用正交核糖体结合位点（RBS）与反RBS配对系统，首次实现了对难改造核糖体的定向工程化 | 目前仅适用于16S rRNA与E. coli相似度≥76.1%的微生物来源核糖体 | 开发活细胞中异源核糖体工程化的通用方法 | 由不同微生物rRNA和核糖体蛋白组成的异源核糖体 | 合成生物学 | NA | 正交翻译系统、核糖体工程 | NA | NA | NA | 正交RBS:antiRBS配对系统 | E. coli | 正交翻译系统、异源核糖体组装 | 工业生物技术 |
| 330 | 2026-03-05 |
Molecular recruitment and release using DNA host condensates
2026-Mar-03, Nanoscale horizons
IF:8.0Q1
DOI:10.1039/d5nh00586h
PMID:41774821
|
研究论文 | 本文研究了利用DNA纳米星构建的人工生物分子凝聚体，通过整合适配体实现对目标生物分子的招募与释放 | 首次在DNA纳米星凝聚体中引入适配体实现靶向分子招募，并开发了通过互补寡核苷酸（kleptamer）控制分子释放的新机制 | 研究仅聚焦于链霉亲和素单一样本，未验证对其他生物分子的普适性；体内应用潜力尚未探索 | 开发可编程的人工生物分子凝聚体系统，实现靶向分子的可控空间组织与释放 | DNA纳米星构建的凝聚体、链霉亲和素蛋白、适配体与kleptamer寡核苷酸 | 合成生物学 | NA | DNA纳米技术、适配体工程、相分离表征 | NA | 生物分子相互作用数据、相图数据、荧光成像数据 | 基于DNA纳米星构建的多种凝聚体构型（适配体位于不同位置） | DNA纳米星自组装、适配体设计 | 无细胞体系 | 基于适配体-kleptamer互补作用的分子捕获与释放开关 | 合成生物学、活性材料、合成细胞 |
| 331 | 2026-03-05 |
PANoptosis as a drug discovery framework: integrating cell death architecture with clinical translation
2026-Mar-03, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-026-00388-0
PMID:41776350
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综述 | 本文综述了PANoptosis（一种整合了凋亡、焦亡和坏死性凋亡的统一性炎症性细胞死亡程序）的分子架构、调控机制及其作为药物发现框架的临床转化潜力 | 提出了PANoptosis作为一个统一的细胞死亡程序的概念，并系统性地将其分子架构与临床转化策略（包括药物干预框架、生物标志物和临床极性-时机模型）相结合，为靶向细胞死亡通路治疗多种疾病提供了新范式 | NA | 阐明PANoptosis的分子机制，并构建一个整合了基础研究与临床转化的药物发现框架，以指导针对感染性、炎症性、肿瘤性和神经退行性疾病的治疗策略开发 | PANoptosis的分子架构（包括上游传感器、支架适配器和效应器）、其调控机制、以及在多种疾病（如感染、脓毒症、癌症、神经退行性疾病）中的作用 | NA | 感染性疾病， 脓毒症， 癌症， 神经退行性疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 332 | 2026-03-05 |
Transforming Crowded Coacervates into Multi-Compartmental Hybrid Microreactors for Practical Enzymatic Catalysis
2025-Oct-20, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202502479
PMID:40884011
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研究论文 | 本文提出了一种基于Pickering乳液的封装方法，将无膜凝聚层转化为多室杂化微反应器，用于高效酶催化 | 创新点包括将拥挤凝聚层转化为具有层次化分隔结构、分子拥挤环境、选择性渗透能力和机械增强稳定性的多室杂化微反应器 | NA | 研究目的是设计和构建具有组织复杂性、多样功能性和实际应用性的人工原细胞，以推动体外合成生物学和生物工程发展 | 研究对象为杂化微反应器，涉及生物和非生物催化物种的空间隔离 | 合成生物学 | NA | Pickering乳液封装 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 333 | 2026-03-05 |
Quantitative Characterization of Gene Regulatory Circuits Associated With Fungal Secondary Metabolism to Discover Novel Natural Products
2024-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202407195
PMID:39467708
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研究论文 | 本研究开发了一种结合微流体平台与数学模型的系统，用于在单细胞水平上定量表征真菌基因调控回路，并利用该平台成功重构了生物活性分子的生物合成途径 | 首次将先进微流体平台与数学模型结合，实现了对多细胞真菌基因调控回路在单细胞水平的精确表征与定量分析 | 研究主要基于模式真菌构巢曲霉，尚未广泛验证于其他真菌物种 | 定量表征真菌次级代谢相关基因调控回路，以发现新型天然产物 | 真菌基因调控回路（GRCs）及其调控的次级代谢生物合成基因簇（BGCs） | 合成生物学 | NA | 微流体平台、数学模型、基因回路重构 | 数学模型 | 单细胞表达数据 | 30个转录因子-启动子组合（源自两个代表性真菌GRCs） | 基因回路重构 | 构巢曲霉（Aspergillus nidulans） | 基因调控回路（GRCs）、生物合成基因簇（BGCs）重构 | 医药、工业生物技术 |
| 334 | 2026-03-05 |
Regulostat Inferelator: a novel network biology platform to uncover molecular devices that predetermine cellular response phenotypes
2019-08-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkz417
PMID:31114928
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研究论文 | 本文提出了一种名为Regulostat Inferelator（RSI）的新型网络生物学算法，用于识别能够预先决定和微调细胞表型响应的基因调控网络 | 首次开发了能够从基础转录组数据中识别具有“调节器”功能的基因对的算法，并首次提供了癌症细胞中药物-调节器相互作用的证据 | 目前仅为概念验证研究，需要进一步的实验验证 | 开发识别预先决定细胞表型响应的分子调控网络的工具 | 基因表达模式、细胞表型响应、癌症细胞 | 网络生物学 | 癌症 | 转录组数据分析 | RSI算法 | 转录组数据 | NA | NA | NA | 调节器网络（具有类似变阻器合作模式的基因对） | 医学、生物工程 |
| 335 | 2026-03-04 |
High-performance bioimaging and biosensing via nucleobase-editing enzymes
2026-Mar-03, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d5cs00678c
PMID:41773995
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综述 | 本文综述了核苷碱基编辑酶在生物成像和生物传感中的应用，包括其催化原理、集成模式及未来发展方向 | 将核苷碱基编辑酶重新用作可编程执行器，实现高特异性、高效扩增和生理条件兼容的生物传感与成像系统 | NA | 探讨核苷碱基编辑酶在生物传感和生物成像中的新兴应用，以提升诊断、治疗监测和合成生物学的平台性能 | 核苷碱基编辑酶（如脱氨酶、甲基转移酶/去甲基酶、DNA糖基化酶）及其在核酸、蛋白质和细胞过程监测中的应用 | NA | NA | 核苷碱基编辑技术，包括脱氨、甲基化/去甲基化、碱基切除等反应 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、合成生物学 |
| 336 | 2026-03-04 |
Building AuxInYeast Synthetic Biology Strains for Biochemical Characterization of Maize Auxin Hormone Signaling Components
2026-Mar-02, Cold Spring Harbor protocols
DOI:10.1101/pdb.prot108634
PMID:40074300
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研究论文 | 本文介绍了一种名为AuxInYeast的合成生物学工具，用于在酵母中构建玉米生长素信号通路组件，以进行生化表征 | 开发了AuxInYeast系统，作为植物合成生物学底盘，首次在酵母中重建玉米生长素信号通路，实现高通量定量分析 | 系统基于酵母环境，可能不完全模拟植物体内复杂调控网络，且仅针对玉米组件，通用性需进一步验证 | 构建合成生物学菌株，以生化表征玉米生长素激素信号通路组件 | 玉米生长素信号通路组件，包括受体、阻遏物、辅阻遏物、转录因子和响应元件 | 合成生物学 | NA | 流式细胞术、荧光蛋白标记 | NA | 生化数据、荧光信号数据 | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 酵母 | 生长素信号通路，包括受体-阻遏物复合物、转录激活级联和响应元件 | 农业, 工业生物技术 |
| 337 | 2026-03-04 |
Testing AuxInYeast Synthetic Biology Strains via Fluorescence Flow Cytometry
2026-Mar-02, Cold Spring Harbor protocols
DOI:10.1101/pdb.prot108635
PMID:40074301
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研究论文 | 本文介绍了一种使用荧光流式细胞术测试AuxInYeast合成生物学菌株的协议，用于分析玉米生长素信号通路 | 开发了基于酵母异源表达平台的AuxInYeast系统，结合荧光流式细胞术实现高通量定量测量植物生长素信号通路组件 | NA | 工程化玉米生长和发育，通过合成生物学工具分析生长素激素信号通路 | 玉米生长素感知受体和荧光标记的阻遏蛋白 | 合成生物学 | NA | 荧光流式细胞术 | NA | 荧光数据 | 多个AuxInYeast菌株，具体数量未指定 | AuxInYeast系统 | 酵母 | 生长素感知和阻遏蛋白降解的生物传感器通路 | 农业 |
| 338 | 2026-03-04 |
Advancing Genetic Code Expansion in Live Cells Through Metabolic Engineering
2026-Mar-02, Annual review of chemical and biomolecular engineering
IF:7.6Q1
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综述 | 本文综述了通过代谢工程在活细胞中推进遗传密码扩展（GCE）的进展，重点关注非标准氨基酸（nsAAs）的生物合成及其在合成生物学中的应用 | 整合代谢工程与GCE，实现nsAAs的生物合成，减少对化学合成补充的依赖，拓展蛋白质化学功能 | 现有GCE方法通常依赖细胞培养基中化学合成nsAAs的补充，这限制了其应用范围 | 克服GCE中nsAAs来源的限制，通过代谢工程实现nsAAs的生物合成，以促进合成生物学应用 | 遗传密码扩展（GCE）、非标准氨基酸（nsAAs）、活细胞中的蛋白质翻译 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、遗传密码扩展（GCE） | NA | NA | NA | NA | 活细胞（未指定具体宿主） | 生物合成途径设计，用于生产非标准氨基酸（nsAAs） | 医学、工业生物技术 |
| 339 | 2026-03-04 |
Engineering non-ribosomal peptide synthesis: tuning the antibiotics engine of the microbial world
2026-Mar-02, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2026.2615819
PMID:41771683
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综述 | 本文综述了通过合成生物学方法工程化非核糖体肽合成以优化抗生素生产的进展 | 聚焦于通过工程化前体代谢物、改变代谢流、引入强启动子和调控因子以及重定向代谢至生物合成基因簇，以提高非核糖体肽的产量和生物活性 | NA | 利用合成生物学优化非核糖体肽的合成，以增强其作为抗生素的医药应用 | 非核糖体肽合成酶及其产生的肽类抗生素 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 生物合成基因簇的工程化表达 | 医药 |
| 340 | 2026-03-04 |
A meta-analysis of the gut microbiome in inflammatory bowel disease patients identifies disease-associated small molecules
2025-Feb-12, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2025.01.002
PMID:39947133
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meta-analysis | 通过荟萃分析炎症性肠病患者肠道微生物组的小分子生物合成基因簇，鉴定出与克罗恩病相关的脂肪酸酰胺，并验证其破坏肠道通透性和加剧疾病的作用 | 首次通过合成生物学方法解析了克罗恩病相关基因簇产生的六种脂肪酸酰胺结构，并证实这些微生物来源小分子在疾病发生中的作用 | 研究主要基于小鼠模型验证，人类样本中的直接致病机制仍需进一步探究 | 探究肠道微生物组小分子代谢物在炎症性肠病发病机制中的作用 | 炎症性肠病患者和健康对照的肠道宏基因组样本、克罗恩病相关基因簇产物、结肠炎小鼠模型 | 宏基因组学 | 炎症性肠病（克罗恩病） | 宏基因组测序、合成生物学、结构解析 | NA | 宏基因组数据、质谱数据 | IBD患者与健康对照的粪便样本（具体数量未明确说明） | 合成生物学 | 梭菌属（Clostridia） | 小分子生物合成基因簇（BGCs） | 医学 |