合成生物学相关文章
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当前共找到 5561 篇文献，本页显示第 341 - 360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2026-07-27 |
Programmable CRISPRtune dissects the transcriptional repressive activity of MeCP2
2026-Jul-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.07.08.737375
PMID:42465491
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研究论文 | 开发名为CRISPRtune的可编程转录调控工具，通过将MeCP2与失活dCas9融合，实现对人类内源基因转录水平的中等程度下调，并解析MeCP2的转录抑制机制 | 首次将MeCP2与dCas9融合实现可编程的转录中等程度调控，利用全基因组CRISPR筛选建立靶向规则，并揭示MeCP2诱导的局部表观遗传变化及其遗传依赖伙伴 | 文中未明确提及局限性 | 开发可编程的转录调控工具并解析MeCP2在活细胞中的转录抑制机制 | 人类细胞内源基因的转录调控及MeCP2蛋白功能 | 合成生物学 | Rett综合征 | CRISPR筛选 | NA | 基因表达数据、表观遗传数据 | 全基因组规模的数千个内源基因 | CRISPR-dCas9 | 人类细胞 | CRISPRtune融合蛋白（MeCP2-dCas9）实现转录调谐 | 医学 |
| 342 | 2026-07-27 |
Engineered microorganisms unlock a new era of diterpenoid biomanufacturing: recent advances and future perspectives
2026-Jul-09, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-026-01094-5
PMID:42420691
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综述 | 综述了利用工程微生物高效合成二萜类化合物的最新进展和未来展望 | 系统总结了二萜类化合物在微生物细胞工厂中的生物合成途径构建和工程策略 | 未对具体工程策略的优劣进行量化比较，也未涵盖所有微生物底盘 | 探讨微生物高效合成二萜类化合物的研究进展、关键挑战及未来方向，以促进工业应用 | 大肠杆菌、酿酒酵母、解脂耶氏酵母和圆红冬孢酵母等工程微生物底盘 | 合成生物学 | 不适用 | 代谢工程, 合成生物学 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 大肠杆菌, 酿酒酵母, 解脂耶氏酵母, 圆红冬孢酵母 | 二萜类化合物生物合成途径 | 化妆品, 食品添加剂, 制药 |
| 343 | 2026-07-27 |
Improving cell-free metabolism through direct integration of artificial respiratory chains
2026-Jul-07, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2613483123
PMID:42391401
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研究论文 | 通过直接整合人工呼吸链提高无细胞代谢效率 | 开发了定制化的人工呼吸链，能够在一氧化碳固定的16酶催化循环中维持快速电子传递，并利用电子流合成三磷酸腺苷，同时展示了该链可多样化以接受多个电子入口并与其他生物功能耦合 | 构建自维持/自供能的人工类生命系统仍面临挑战，能源守恒机制的整合存在困难和未充分解决的问题 | 从零开始重建能量守恒机制并将其与生物功能整合，以构建具有生命特性的复杂无细胞代谢网络 | 人工呼吸链及一氧化碳固定的16酶催化循环（巴豆酰辅酶A/乙基丙二酰辅酶A/羟基丁酰辅酶A循环） | 合成生物学 | 不适用 | 无细胞代谢工程、电子传递重建、三磷酸腺苷合成 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 人工呼吸链、无细胞转录-翻译网络 | 工业生物技术 |
| 344 | 2026-07-27 |
A self-replicating artificial module-genome that generates bacterial chromosome replication system in vitro
2026-Jul-03, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag663
PMID:42406626
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研究论文 | 本研究构建了一个53 kb的环状DNA，称为RCR模块基因组，编码所有26种RCR蛋白，可在体外利用PURE系统实现自我复制 | 首次实现了由遗传信息生成功能性染色体复制系统，构建了可自我复制的体外人工模块基因组，实现了超过28次递归自我复制 | NA | 构建能够自我复制的体外人工基因组，推动自下而上合成生物学中人造细胞的构建 | RCR模块基因组（53 kb环状DNA，编码26种RCR蛋白） | 合成生物学 | NA | 体外重组、蛋白质合成、DNA复制 | NA | NA | NA | NA | Escherichia coli（大肠杆菌） | RCR模块基因组（包含复制循环反应的基因回路） | 合成生物学、基础研究 |
| 345 | 2026-07-27 |
Single-residue engineering of Klenow fragment enables broad acceptance of chemically modified nucleotides
2026-Jul-03, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag697
PMID:42454372
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研究论文 | 报道了Klenow片段的一个单残基突变体F762A，能够在生理条件下高效合成多种化学修饰核酸（XNA） | 首次通过单点突变实现中温聚合酶对多种修饰核苷酸的广泛接纳，在37°C下高效合成DNA、RNA、2'-F-RNA、FANA等，并具备逆转录活性和自复制能力 | 未提及在更复杂的生物环境或体内应用中的表现，长期稳定性及诱变率在长期扩增中的影响尚需进一步验证 | 开发能在生理条件下高效合成XNA的中温聚合酶，拓展XNA在合成生物学和生物技术中的应用 | Klenow片段F762A突变体及其与多种修饰核苷酸的相互作用 | 合成生物学 | NA | 分子动力学模拟、酶学表征、核苷酸合成 | NA | 序列数据、生化实验数据 | NA | 定点突变 | 大肠杆菌 | NA | 合成生物学、生物技术、医药 |
| 346 | 2026-07-27 |
Clocked stepping of an artificial protein walker along a DNA track
2026-Jul, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/s41565-026-02211-3
PMID:42410215
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研究论文 | 本文报道了一种名为“风滚草”的人工受控蛋白质马达，该马达通过模块化设计策略构建，能在DNA轨道上沿指定方向进行16纳米步进的定向运动 | 首次实现了基于蛋白质的人工分子马达，采用模块化设计整合配体门控DNA结合域，实现了对外部输入的可控定向步进运动 | NA | 构建并验证一种人工蛋白质马达，实现沿DNA轨道的可控步进运动 | Tumbleweed蛋白质马达及其与DNA轨道的相互作用 | 合成生物学 | NA | 单分子荧光检测，微流控装置 | NA | 单分子荧光图像 | NA | NA | NA | 蛋白质马达（风滚草）由三个包含配体门控DNA结合域的“腿”组成 | 纳米技术, 合成生物学 |
| 347 | 2026-07-27 |
seq2ribo: structure-aware integration of machine learning and simulation to predict ribosome location profiles from RNA sequences
2026-Jul-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag296
PMID:42412804
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研究论文 | 提出一种混合模拟与机器学习的框架seq2ribo，仅从RNA序列预测核糖体位置分布 | 首次仅从序列数据实现与实验核糖体图谱有意义的位点相关性，结合结构感知TASEP模拟与机器学习抛光模型 | 未明确说明局限性 | 开发一种无需表达数据或基因组背景即可预测核糖体分布的新方法，用于mRNA序列的理性设计和优化 | 核糖体A位点位置分布、翻译效率、蛋白质表达量 | 机器学习, 合成生物学 | NA | Ribo-seq, RNA-seq, 核糖体图谱分析 | 结构感知TASEP模拟, 抛光模型（机器学习） | RNA序列数据 | 多种细胞类型（iPSC, HEK293, LCL, RPE-1） | NA | 人类细胞（iPSC, HEK293, LCL, RPE-1） | NA | 医学, 合成生物学, mRNA疫苗设计 |
| 348 | 2026-07-27 |
Next-Generation Cyanobacterial Biocontrol Agents for Crop Fungal Diseases: Molecular Mechanisms, Omics Insights, Applications, and Biosafety Considerations
2026-Jul, Journal of basic microbiology
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/jobm.70181
PMID:42423136
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综述 | 综述蓝细菌作为作物真菌病害生物防治剂的分子机制、组学见解、应用及生物安全考量 | 系统整合了蓝细菌抗真菌代谢物的分子机制、多组学分析进展及合成生物学应用前景 | 田间应用受环境变异性与制剂稳定性限制，实验室成果向大田推广存在挑战 | 为开发环保可持续的作物真菌病害防控方案提供理论依据和未来方向 | 蓝细菌产生的抗真菌代谢物及其对作物真菌病害的抑制作用 | 机器学习 | 作物真菌病害 | 多组学分析、全基因组挖掘 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 蓝细菌 | 生物传感器、代谢通路工程 | 农业 |
| 349 | 2026-07-27 |
Genetic Toolbox Expansion Enables Constitutively Fluorescent Lacticaseibacillus rhamnosus for Functional Microbiome Research
2026-Jul, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70405
PMID:42426988
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研究论文 | 通过扩展遗传工具箱，实现了鼠李糖乳杆菌的组成型荧光标记，以支持功能微生物组研究 | 首次在鼠李糖乳杆菌GR-1和GG中实现了直接质粒克隆和一组之前在植物乳杆菌中验证的遗传元件测试，并构建了组成型荧光菌株 | 未提及研究的局限性，可能包括荧光稳定性或体内适用性需进一步验证 | 扩充鼠李糖乳杆菌的遗传工具箱，开发组成型荧光菌株用于功能微生物组研究和合成生物学应用 | 鼠李糖乳杆菌GR-1和GG菌株 | 合成生物学 | NA | 质粒克隆、荧光蛋白标记 | NA | 荧光图像数据 | 两个鼠李糖乳杆菌菌株（GR-1和GG）和一个金黄色葡萄球菌致病菌株 | 组成型启动子、荧光蛋白（mCherry， mScarlet3， sfGFP） | 鼠李糖乳杆菌GR-1 | 组成型荧光表达回路 | 医学、工业生物技术 |
| 350 | 2026-07-27 |
An Experimentally Verified Mechanistic Model for Predicting Quorum Sensing-Based Switches
2026-Jul, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70408
PMID:42444116
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研究论文 | 开发了一个预测基于群体感应的EsaI/EsaR开关的机理模型并用实验验证 | 提出了一个能够区分转录因子和合酶表达水平对双向启动子响应影响的数学模型，强调了转录因子在调控电路中的关键作用 | 未说明，推测模型可能受限于特定系统或实验条件 | 开发一个数学预测模型以加速群体感应基因电路的调控过程 | EsaI/EsaR群体感应系统 | 合成生物学 | NA | NA | 数学模型 | 实验数据 | 构建了菌株文库 | NA | NA | 群体感应开关 | 合成生物学 |
| 351 | 2026-07-27 |
Functional Engineering of Bioactive Peptides: Chemical Modifications and Synthetic Biology Approaches
2026-Jul-01, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27135939
PMID:42450206
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综述 | 系统总结了生物活性肽的合成生物学和化学修饰策略，并讨论了当前挑战与未来趋势 | 首次全面整合合成生物学（氨基酸替换、序列截短与杂合等）和化学修饰（末端修饰、环化、聚合物缀合等）两大类策略，并基于122篇系统文献检索结果提供理论指导 | 未深入研究具体修饰策略的实际应用效果比较，且综述性质限制了实验验证 | 梳理生物活性肽的工程改造方法，为克服其天然局限性提供理论指导与创新思路 | 生物活性肽（BPs） | NA | NA | 氨基酸替换、序列截短、杂合、侧链功能化、主链/侧链整合、末端修饰、环化、主链修饰、聚合物缀合、脂化、糖基化 | NA | 文献数据 | 122篇系统文献 | NA | NA | NA | 食品、医药、生物材料 |
| 352 | 2026-07-27 |
Synthetic Biology of Sclareol: From the Plant Biosynthetic Pathway to Engineered Microbial and Photosynthetic Chassis
2026-Jul, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70285
PMID:42489835
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综述 | 综述了植物合成通路及工程微生物和光合底盘生产香紫苏醇的研究进展 | 系统总结了香紫苏醇在异源宿主中的生物合成途径重建策略，并介绍了新兴的光合和植物基平台作为互补的绿色生产系统 | 涉及生产挑战和未来展望的讨论可能不够深入，且对具体工程策略的定量比较有限 | 综述香紫苏醇生物合成途径的解析和异源宿主中的工程化生产策略 | 香紫苏醇及其生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 微生物细胞工厂, 光合底盘, 植物基平台 | 香紫苏醇生物合成途径 | 工业生物技术, 医药 |
| 353 | 2026-07-27 |
Recombinant Alphaherpesvirus Vectors in Veterinary Vaccinology: Platforms, Applications, and Translational Challenges
2026-Jun-24, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27135686
PMID:42449959
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综述 | 全面分析用于兽医疫苗学的五种阿尔法疱疹病毒载体平台、应用及转化挑战 | 系统比较了五种阿尔法疱疹病毒载体与传统疫苗平台，重点阐述了从概念验证到多价构型构建的研发进展 | 未提及具体转化障碍分析 | 评估疱疹病毒载体疫苗在动物传染病防控中的潜力 | 五种阿尔法疱疹病毒（牛疱疹病毒1型、伪狂犬病毒、马立克病病毒、马疱疹病毒1型、鸭肠炎病毒） | 机器学习 | 口蹄疫、猪繁殖与呼吸综合征、禽流感、传染性法氏囊病、西尼罗河热 | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学, 农业 |
| 354 | 2026-07-15 |
Recent advances in the biosynthesis of bacterial hybrid polyketide-non ribosomal peptide natural products
2026-Sep-15, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2026.110227
PMID:42442297
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综述 | 综述了细菌杂合聚酮合酶-非核糖体肽合成酶天然产物的生物合成研究进展 | 首次系统总结了近十年（2015-2025）细菌来源的杂合PKS-NRPS天然产物，涵盖其结构、生物活性、基因簇及域组织多样性 | 仅聚焦于细菌来源的杂合系统，未涵盖真菌等其他来源 | 全面概述细菌杂合PKS-NRPS天然产物生物合成的复杂性及其潜在的治疗/生物技术应用 | 细菌来源的杂合聚酮合酶-非核糖体肽合成酶天然产物及其生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、生物信息学、酶学表征 | NA | 序列数据 | NA | NA | 细菌 | 杂合PKS-NRPS生物合成通路 | 医学, 工业生物技术 |
| 355 | 2026-06-21 |
Synergistic dual ring-cleavage pathways enable efficient degradation of chlorobenzenes by Pseudomonas putida BS-1 in groundwater
2026-Aug-01, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2026.142676
PMID:42320103
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研究论文 | 发现恶臭假单胞菌BS-1中一种新型协同双环裂解途径，可有效降解地下水中的氯苯类污染物 | 首次揭示一种由质粒携带的tod-clc基因簇介导的邻位和间位裂解途径协同作用机制，能够快速解毒中间代谢产物氯代儿茶酚 | 研究主要基于单一菌株和实验室条件，未评估长期现场应用中的稳定性和生态影响 | 阐明氯苯类化合物生物降解过程中氯代儿茶酚解毒的新机制，并提供用于地下水修复的微生物资源 | 恶臭假单胞菌BS-1菌株及其降解对二氯苯、氯苯和苯的代谢途径 | 环境微生物学 | NA | 基因敲除、异源表达、代谢产物分析 | NA | 实验数据 | 单一菌株BS-1，以及实际受污染地下水样本（含p-DCB 6.83 mg·L⁻¹和o-DCB 13.31 mg·L⁻¹） | NA | 恶臭假单胞菌 | 由tod-clc基因簇编码的邻位和间位双环裂解途径 | 环境修复 |
| 356 | 2026-07-26 |
Quo vadis reconstituted cell surfaces? Purpose and future perspectives for minimal systems of the cell plasma membrane
2026-Aug, Current opinion in cell biology
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.ceb.2026.102667
PMID:42349351
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 357 | 2026-07-26 |
Microbial growth control: integrating protein abundance and activity
2026-Jul-24, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102803
PMID:42497777
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 358 | 2026-07-18 |
BxbI-mediated insertion of a 77kb human RET sensitive haplotype into the mouse genome to generate a humanized model of Hirschsprung disease
2026-Jul-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.07.05.736620
PMID:42465522
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研究论文 | 通过BxbI介导的77kb人类RET敏感单倍型插入小鼠基因组，构建Hirschsprung病的人源化模型 | 利用‘大DNA’合成生物学和Bxb1介导重组技术，将完整的77kb人类RET基因座（包括所有外显子、内含子和上游调控元件）精确插入小鼠基因组，并验证了功能表达 | 初始HSCR相关的‘敏感’单倍型表达量仅为野生型水平的21%，且在内源性小鼠Ret基因缺失时不足以挽救生存 | 研究人类RET基因非编码变异如何导致Hirschsprung病的病理机制 | 人类RET基因座及HSCR相关风险单倍型 | 数字病理学, 基因组编辑 | Hirschsprung病 | Bxb1重组, CRISPR/Cas9, 纳米孔测序, 短读长测序 | 人源化小鼠模型 | DNA序列, 功能表达数据 | 小鼠胚胎和成体组织样品 | Bxb1介导重组, CRISPR/Cas9 | 小鼠 | NA | 医学 |
| 359 | 2026-03-16 |
Sustainable bioenergy manufacturing in plants
2026-03-09, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101711
PMID:41517869
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综述 | 本文综述了如何通过合成生物学、基因组学、人工智能和化学等多学科融合，克服传统生物质转化的效率、成本和多功能性限制，以推动可持续生物能源制造，并以自发光植物为例进行了深入探讨 | 提出利用多学科融合（合成生物学、基因组学、AI、化学）革新生物能源生产，并重点介绍了基于真菌生物发光途径（FBP）的自发光植物这一前沿应用，其利用内源性代谢物咖啡酸实现可持续自主生物照明 | 作为一篇综述文章，未报告原始实验数据或具体技术细节，主要基于现有文献进行总结和展望 | 探讨如何通过多学科方法克服传统生物能源制造的局限性，推动可持续植物基能源生产的发展 | 生物能源制造过程、能源作物、生物精炼厂、自发光植物 | NA | NA | 基因组编辑、组学技术、人工智能 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9（可能用于基因组编辑，文中提及但未明确指定） | 植物（能源作物） | 真菌生物发光途径（FBP），利用内源性咖啡酸代谢物将光合作用能量转化为可见光发射的生物传感器/照明系统 | 能源, 环境 |
| 360 | 2026-07-25 |
NanoporeDB: a structural resource of multimeric protein nanopores for single-molecule sensing
2026-Jan-21, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag076
PMID:42348340
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