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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2025-10-05 |
Engineering Motile Coacervate Droplets via Nanomotor Stabilization
2025-Sep-03, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c09366
PMID:40834351
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研究论文 | 本研究通过纳米马达稳定化技术开发了具有运动能力的凝聚层液滴人工细胞系统 | 首次实现了通过金纳米颗粒包覆的纳米马达与三元聚合物膜协同稳定凝聚层液滴,并赋予其光驱动运动能力 | NA | 开发具有运动功能的凝聚层基人工细胞系统 | 凝聚层液滴和纳米马达复合系统 | 合成生物学 | NA | 表面等离子体热效应 | NA | NA | NA | 纳米马达,三元聚合物膜 | 人工细胞系统 | 光驱动微马达平台 | 合成生物学,生物医学工程 |
| 342 | 2025-10-05 |
Isoprenoids in eukaryotic phytoplankton: Metabolic diversity, eco-physiology, and biotechnological opportunities
2025-Sep-01, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiaf314
PMID:40707021
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综述 | 本文全面评估了真核浮游植物中异戊二烯类化合物的生物合成、调控机制及其生态生理功能和生物技术应用 | 系统比较了不同微藻类群中MEP和MVA途径的区室化差异,揭示了藻类特有的酶适应性和谱系特异性类胡萝卜素生物合成酶 | NA | 阐明真核浮游植物中异戊二烯类化合物的代谢多样性、生态生理功能和生物技术潜力 | 真核浮游植物(微藻)的异戊二烯类代谢系统 | 合成生物学 | NA | 代谢工程,合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微藻 | 异戊二烯类生物合成途径(MEP和MVA途径) | 生物技术,工业生物技术 |
| 343 | 2025-10-05 |
Reinforcement Learning-Based Target-Specific De Novo Design of Cyclic Peptide Binders
2025-Aug-28, Journal of medicinal chemistry
IF:6.8Q1
DOI:10.1021/acs.jmedchem.5c00789
PMID:40824037
|
研究论文 | 提出基于强化学习的环肽结合剂从头设计框架CYC_BUILDER | 采用蒙特卡洛树搜索指导片段选择、肽链生长和结构优化,实现高效环化 | 仅实验验证了9个设计肽中的4个具有活性 | 开发计算设计环肽结合剂的新方法 | 环肽-蛋白质复合物 | 机器学习 | NA | 强化学习,蒙特卡洛树搜索 | 强化学习 | 蛋白质结构数据 | 9个设计肽的实验验证 | NA | NA | NA | 医药,合成生物学 |
| 344 | 2025-10-05 |
Assessing the Quality of Cotranscriptional Folding Simulations
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3519-3_14
PMID:38780738
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研究论文 | 本文开发了用户友好的BarMap-QA流程,用于评估共转录折叠模拟的质量 | 改进了原有BarMap软件,开发了专门针对共转录折叠场景的用户友好流程,并通过迭代工作流程以最小计算资源获得可靠的动力学模拟 | 原始BarMap方法基于简化的二级结构表示,仅保留少量低能局部极小值和能量势垒,存在近似处理 | 改进共转录折叠模拟方法,验证合成核糖开关设计的功能性 | RNA共转录折叠过程,特别是合成转录调控核糖开关 | 计算生物学 | NA | BarMap方法,粗粒度表示,马尔可夫过程建模 | 马尔可夫过程模型 | RNA二级结构数据 | NA | NA | NA | 合成转录调控核糖开关 | 合成生物学 |
| 345 | 2025-10-05 |
In vivo self-assembled siRNAs ameliorate neurological pathology in TDP-43-associated neurodegenerative disease
2025-Sep-08, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awaf330
PMID:40916343
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研究论文 | 本研究开发了一种基于合成生物学的体内自组装siRNA递送系统,用于改善TDP-43相关神经退行性疾病的神经病理 | 利用内源性小RNA加工机制自组装siRNA封装小细胞外囊泡,并通过宿主天然循环系统实现siRNA向中枢神经系统的递送 | 研究仅在小鼠模型中进行验证,尚未进行人体临床试验 | 开发治疗TDP-43相关神经退行性疾病的新型基因治疗方法 | TDP-43蛋白异常积累相关的肌萎缩侧索硬化症(ALS)和额颞叶变性(FTLD) | 合成生物学 | 神经退行性疾病 | siRNA技术,小细胞外囊泡(sEVs)递送,腺相关病毒(AAV)递送系统 | NA | NA | TDP-43病理小鼠模型 | 腺相关病毒(AAV) | 小鼠肝细胞 | 狂犬病毒糖蛋白(RVG)标记的小细胞外囊泡siRNA递送系统 | 医学 |
| 346 | 2025-10-05 |
Metabolic engineering of Saccharomyces cerevisiae for de novo biosynthesis of hydroxytyrosol and salidroside
2025-Aug-20, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00712-25
PMID:40668011
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研究论文 | 通过代谢工程改造酿酒酵母实现羟基酪醇和红景天苷的从头生物合成 | 构建了高效生产羟基酪醇和红景天苷的酵母工程菌株,通过优化前体供应和糖基化效率实现了规模化生产 | NA | 开发羟基酪醇和红景天苷的高效生物合成方法 | 酿酒酵母工程菌株及其代谢途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、发酵工程 | NA | 发酵数据、代谢产物分析 | 多个工程菌株(ZYT1、ZYHT1、ZYSAL1、ZYSAL9+3) | 代谢工程、途径优化 | 酿酒酵母 | 羟基酪醇和红景天苷生物合成途径,包括酪醇合成、羟基化修饰和糖基化反应 | 工业生物技术、医药 |
| 347 | 2025-10-05 |
Multiactivity of Nanozyme Liposome Regulates the Homeostasis of Biochemical Microenvironment
2025-Aug-18, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202501918
PMID:40545445
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研究论文 | 开发具有多酶活性的仿生脂质体纳米酶,用于调节外源性植入物引起的炎症反应并促进组织再生 | 通过在人造膜上自组装CeO纳米颗粒构建仿生脂质体,同时具备内皮细胞膜特性和多酶催化活性 | 未提及具体的临床前或临床试验数据 | 设计能够模拟天然细胞功能的治疗性脂质体以调控生化微环境稳态 | 仿生脂质体纳米酶及其对炎症因子和血小板聚集的调控作用 | 合成生物学 | 组织工程相关疾病 | 纳米酶技术、自组装技术 | NA | 实验数据 | NA | 自组装 | NA | 仿生信号调节系统 | 医学 |
| 348 | 2025-10-05 |
Hydrogel-Immobilized Multienzyme Systems for Cell-Free Chemical Bioproduction
2025-Aug-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00234
PMID:40689784
|
研究论文 | 本研究开发了一种将无细胞表达的多酶系统共固定于聚乙二醇二丙烯酸酯-甘油水凝胶中的方法,用于提高生物催化系统的稳定性和可重复使用性 | 通过水凝胶固定化技术显著提高了无细胞表达酶系统的长期稳定性、可重复使用性和活性,实现了比游离酶高1.6倍的活性和2倍的使用寿命 | NA | 开发稳定、可重复使用的无细胞多酶系统用于化学生物生产 | 无细胞基因表达系统、多酶固定化水凝胶 | 合成生物学 | NA | 小角X射线散射、直接荧光测量、光交联固定 | NA | 实验数据 | NA | 无细胞表达系统 | 细菌裂解物 | 多酶生物合成途径(丙酮酸到苹果酸的生物转化) | 工业生物技术 |
| 349 | 2025-10-05 |
Remodeling of ribosomally synthesized peptide backbones based on posttranslational modifications
2025-Aug-13, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00018a
PMID:40392103
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综述 | 本文综述了2013-2024年间通过翻译后修饰重塑核糖体合成肽骨架的研究进展 | 重点关注导致肽骨架重构的非常规翻译后修饰酶及其催化机制 | NA | 深化对RiPP生物合成的理解,增强功能肽制剂理性设计与合成生物学生产能力 | 核糖体合成和翻译后修饰肽(RiPP)天然产物 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘,合成生物学策略 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 350 | 2025-10-05 |
Dendritic Membranized Coacervate Microdroplets: A Robust Platform for Synthetic-Living Cell Consortia
2025-Aug-13, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c09772
PMID:40751679
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于树枝状聚合物的膜包被凝聚微滴平台,用于构建合成-天然细胞联合体 | 利用树枝状聚合物的球状刚性结构,显著提高了凝聚微滴在生理盐浓度下的稳定性,临界盐浓度比传统多肽或支链聚电解质形成的凝聚体提高两倍以上 | NA | 构建结构稳定且具有细胞样功能的合成细胞平台,用于生物医学应用 | 树枝状聚合物膜包被凝聚微滴 | 合成生物学 | NA | 共凝聚技术、聚合物组装 | NA | NA | NA | NA | NA | 具有酶封装、内部快速动力学和化学通讯功能的合成细胞平台 | 医学, 组织工程, 再生医学 |
| 351 | 2025-10-05 |
An old dog with new tricks-the value of photorespiration as a central metabolic hub with implications for environmental acclimation
2025-Aug-04, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiaf258
PMID:40515676
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综述 | 探讨光呼吸作为中心代谢枢纽在环境适应中的新功能与价值 | 揭示光呼吸与气孔代谢调控的新联系,发现新型代谢参与者及细胞器间互作网络 | NA | 阐明光呼吸在光合作用和环境适应中的核心作用 | 光养生物的光呼吸代谢途径 | 植物代谢工程 | NA | 同位素标记、反向遗传学、合成生物学 | NA | 代谢通量数据 | NA | 合成生物学方法 | 植物 | 旁路途径整合、天然酶优化 | 农业 |
| 352 | 2025-10-05 |
Human Synthetic Biology and Programmable Gene Regulation Control
2025-Aug, Annual review of genomics and human genetics
IF:7.7Q1
|
综述 | 本文综述了人类合成生物学领域在可编程基因调控系统方面的最新进展 | 开发了多层次基因表达控制工具,能够同时提供细胞行为信息并操纵细胞功能 | NA | 开发可编程遗传系统以控制细胞表型和功能 | 人类细胞中的基因调控系统 | 合成生物学 | NA | 高通量合成生物学方法 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 人类细胞 | 合成基因回路、基因表达控制系统、DNA/RNA/蛋白质水平调控模块 | 医学 |
| 353 | 2025-10-05 |
5'-O-P-N Linkages of Phosphoramidate Nucleotides: Chemical Construction and Biological Impact
2025-Aug, Chemical record (New York, N.Y.)
DOI:10.1002/tcr.202500056
PMID:40442970
|
综述 | 本文系统综述了5'-O-P-N磷酰胺核苷酸的化学合成方法及其生物学影响 | 重点关注5'-羟基位置磷酰胺(P-N)连接这一新兴核苷酸类似物的合成策略与生物功能研究 | NA | 探讨磷酰胺核苷酸的合成方法、生物学功能及其在医药和生物技术中的应用前景 | 5'-O-P-N磷酰胺核苷酸及其化学修饰 | 生物化学与合成生物学 | NA | 磷酰胺化策略、催化方法、绿色化学技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药化学、生物技术 |
| 354 | 2025-10-05 |
Microbial strategies on polyhydroxyalkanoates production from food waste to support the circular bioeconomy
2025-Aug, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.146023
PMID:40669653
|
综述 | 本文重点探讨利用餐厨垃圾生产聚羟基脂肪酸酯的微生物策略及其在循环生物经济中的应用前景 | 系统总结了代谢工程和合成生物学在餐厨垃圾生物转化生产聚羟基脂肪酸酯中的最新微生物策略 | NA | 促进餐厨垃圾资源化利用和循环生物经济发展 | 餐厨垃圾和聚羟基脂肪酸酯 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物底盘细胞 | NA | 环境,工业生物技术 |
| 355 | 2025-10-05 |
Heavy metals toxicity in plants: understanding mechanisms and developing coping strategies for remediation: a review
2025-Sep-04, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-025-00930-4
PMID:40906247
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综述 | 本文综述重金属对植物的毒性机制及基于自然的生物修复策略 | 系统整合分子耐受机制与新型生物修复技术,强调合成生物学在增强修复效率中的应用 | 未涉及具体田间应用的规模化挑战和长期生态影响评估 | 探讨重金属毒性机制及开发可持续环境修复策略 | 受重金属污染的植物及修复生物(植物、微生物) | 环境生物技术 | NA | 分子生物学、合成生物学、遗传工程 | NA | 文献数据 | NA | 遗传工程 | 超富集植物物种、耐金属微生物 | NA | 环境 |
| 356 | 2025-10-05 |
Current advances and emerging prospects of specifically targeted antimicrobial peptides: A comprehensive review
2025-Sep, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.147037
PMID:40848790
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综述 | 全面总结特异性靶向抗菌肽(STAMPs)的最新研究进展,包括其结构、抗菌活性、设计策略、应用领域及未来展望 | 系统阐述STAMPs的靶向-连接-杀伤三域结构设计理念及其精准消除特定病原体的创新机制 | 未明确提及具体实验数据或临床研究案例 | 探讨STAMPs作为精准抗菌策略的开发与应用前景 | 特异性靶向抗菌肽(STAMPs) | 合成生物学 | NA | 计算机辅助设计(CAD) | NA | 文献资料 | NA | NA | NA | 靶向-连接-杀伤三域结构设计 | 临床医学, 农业, 生物材料, 食品保鲜 |
| 357 | 2025-10-05 |
Progress on the synthesis of bioengineered heparin as an alternative to animal-derived heparin active pharmaceutical ingredient
2025-Nov-15, Carbohydrate polymers
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.carbpol.2025.124099
PMID:40912801
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综述 | 本文综述了通过微生物发酵和酶修饰合成生物工程肝素的近期进展 | 结合合成生物学与先进生物加工技术开发结构明确的生物工程肝素,作为传统动物源肝素的可持续替代品 | 仍面临肝素聚糖分子量精确控制、硫酸化模式优化、结构功能等效性验证和工业规模工艺验证等关键挑战 | 开发安全、均质且可扩展的生物工程肝素作为动物源肝素的替代品 | 生物工程肝素活性药物成分 | 合成生物学 | NA | 微生物发酵、酶修饰、分析表征 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 肝素聚糖生物合成途径、酶促硫酸化策略 | 医药 |
| 358 | 2025-10-05 |
Synthetic approaches to enhance biological carbon capture
2025-Oct, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103350
PMID:40882447
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综述 | 本文综述了通过合成生物学和生物工程方法增强生物碳捕获效率的最新研究进展 | 超越传统卡尔文循环改造,探索为CBB循环提供能量的新方法、开发体内自养合成途径以及构建全新碳固定途径 | NA | 开发提高碳捕获效率、生物质生产力和可持续能源整合的生物工程框架 | 卡尔文-本森-巴沙姆循环、RuBisCO酶、合成碳固定途径 | 合成生物学 | NA | 生物工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 卡尔文-本森-巴沙姆循环增强、新型碳固定途径、自养合成途径 | 环境 |
| 359 | 2025-10-05 |
A computational framework for Optimal and Model Predictive Control of stochastic gene regulatory networks
2025-Sep-05, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2025.3598449
PMID:40911462
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研究论文 | 开发用于随机基因调控网络的最优控制和模型预测控制的计算框架 | 通过偏积分微分方程高效近似化学主方程,实现对细胞群体概率密度函数的精确控制和动态目标分布追踪 | 基于模型近似方法,可能存在近似误差 | 解决生物分子系统中分子噪声的控制问题 | 随机基因调控网络 | 计算生物学 | NA | 偏积分微分方程、伴随优化方法 | 模型预测控制 | NA | NA | NA | NA | 诱导型基因调控电路 | 合成生物学 |
| 360 | 2025-10-05 |
Systematic discovery and engineering of synthetic immune receptors in plants
2025-Sep-04, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adx2508
PMID:40906849
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研究论文 | 通过生物信息学和合成生物学方法系统发现并改造植物中的合成免疫受体SCORE,使其能够感知多种病原体的冷休克蛋白肽 | 首次在285种植物中系统表征LRR-RLK-XII受体家族,发现并工程化改造能够识别多种病原体CSP肽的SCORE受体变体 | 研究主要关注LRR-RLK-XII受体家族,可能未涵盖其他类型的植物免疫受体 | 探索植物免疫受体的多样性并开发工程化植物免疫受体的策略 | 285种植物中的LRR-RLK-XII受体家族,特别是SCORE受体及其变体 | 合成生物学 | 植物病害 | 生物信息学分析,蛋白质结构预测,合成生物学工程 | NA | 基因组数据,蛋白质序列,结构预测数据 | 285种植物物种 | 合成生物学方法 | 植物,多年生作物 | 免疫受体工程,模式识别受体改造 | 农业 |