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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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341 | 2025-05-08 |
A molecular proximity sensor based on an engineered, dual-component guide RNA
2024-Aug-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.14.553235
PMID:37645782
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研究论文 | 本文介绍了一种名为'P3编辑'的策略,通过工程化的双组分引导RNA将蛋白质-蛋白质接近性连接到功能性CRISPR-Cas9系统的形成 | 提出了一种将蛋白质-蛋白质接近性与CRISPR-Cas9基因组编辑功能连接的新策略,增强了基因组编辑的可控性 | NA | 开发可编程的合成分子电路,将分子事件(如蛋白质相互作用)与基因组编辑联系起来 | 人类细胞中的蛋白质-蛋白质相互作用和化学诱导的二聚化 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9, 基础编辑, 主要编辑 | NA | 分子相互作用数据 | NA |
342 | 2025-05-08 |
Resurrecting ancestral antibiotics: unveiling the origins of modern lipid II targeting glycopeptides
2023-11-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43451-4
PMID:38030603
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研究论文 | 本研究通过计算技术和合成生物学方法,揭示了脂质II靶向糖肽抗生素的祖先分子paleomycin的结构及其抗生素活性,探索了自然界如何通过进化优化这类抗生素 | 结合计算技术和合成生物学方法,成功预测并复活了脂质II靶向糖肽抗生素的祖先分子paleomycin,揭示了其结构和抗生素活性 | 研究主要依赖于计算预测和合成生物学技术,可能无法完全还原自然进化过程中的所有细节 | 探索脂质II靶向糖肽抗生素的进化起源及其优化策略 | 脂质II靶向糖肽抗生素(如teicoplanin和vancomycin)及其祖先分子paleomycin | 合成生物学 | 抗生素耐药性细菌感染 | 计算技术、合成生物学技术 | NA | NA | NA |
343 | 2025-05-07 |
Phosphorothioate-Modified Hairpin G-Triplex Reporter-Assisted Split CRISPR/Cas12a-Powered Biosensor for "Turn-On" Fluorescent Detection of Nucleic Acid and Non-Nucleic Acid Targets
2025-May-06, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c00140
PMID:40270429
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research paper | 开发了一种基于CRISPR/Cas12a和硫代磷酸酯修饰的G-三链体报告基因的“开启”型荧光生物传感器,用于核酸和非核酸靶标的高灵敏度检测 | 首次探索了硫代磷酸酯修饰的G-四链体和G-三链体序列与硫黄素T结合在分裂CRISPR/Cas12a系统中产生“开启”荧光信号的新现象,并开发了相应的生物传感器 | 未提及在更复杂样本中的实际应用效果及可能的干扰因素 | 开发高灵敏度、低背景的“开启”型荧光生物传感器,用于核酸和非核酸靶标的检测 | 核酸靶标(miRNA-21)和非核酸靶标(卡那霉素) | 合成生物学传感技术 | NA | CRISPR/Cas12a系统,硫代磷酸酯修饰技术,荧光检测 | SCas12a/psHG3系统 | 荧光信号数据 | 未明确说明具体样本数量,但检测限达到100 fM(miRNA-21)和100 pM(卡那霉素) |
344 | 2025-05-07 |
Engineering plant photoreceptors towards enhancing plant productivity
2025-May-06, Plant molecular biology
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s11103-025-01591-9
PMID:40327169
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综述 | 本文综述了植物光感受器在调节农艺重要性状中的作用、植物光感受器工程的现状、光遗传学和合成生物学的应用及其在作物改良中的实际考虑 | 探讨了通过工程化光感受器活动或光感受器途径来增强作物生产力的潜在途径,以及光遗传学工具在实时操控植物细胞反应中的应用 | 未提及具体实验数据或案例研究,主要集中于理论和技术前景的讨论 | 探索通过光感受器工程和光遗传学技术提高植物生产力的方法和潜力 | 植物光感受器及其在作物改良中的应用 | 合成生物学 | NA | 光遗传学、合成生物学 | NA | NA | NA |
345 | 2025-05-07 |
The key role of cytochrome P450s in the biosynthesis of plant derived natural products
2025-May, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.109695
PMID:40015195
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综述 | 本文综述了细胞色素P450在植物源性天然产物生物合成中的关键作用 | 重点探讨了细胞色素P450在天然产物下游合成途径和结构修饰中的重要作用,并总结了天然产物生物合成和合成生物学研究的最新进展 | NA | 深入了解细胞色素P450酶在天然产物合成途径中的作用,促进天然产物的开发和合成生物学研究 | 植物源性天然产物及其生物合成途径中的细胞色素P450酶 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
346 | 2025-05-07 |
Future-proofing ornamental plants: Cutting-edge strategies for drought resistance and sustainability
2025 May-Jun, Physiologia plantarum
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/ppl.70255
PMID:40325615
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review | 本文综述了观赏植物抗旱性研究的最新进展,探讨了干旱胁迫对植物形态、生理、生化及美学价值的影响,并介绍了CRISPR/Cas9、合成生物学和数字表型分析等前沿技术在培育抗旱观赏植物中的应用 | 整合了多组学方法、先进育种技术和数字工具,加速关键抗旱基因和性状的鉴定,并探讨了表观遗传工程、合成生物学和高通量表型分析在培育更具抗逆性和美学价值的观赏植物中的潜力 | 虽然对植物干旱胁迫响应的理解取得了显著进展,但如何将这些知识有效转化为观赏植物的实际育种策略仍存在空白 | 开发抗旱观赏植物,以应对干旱胁迫对观赏园艺的挑战,满足对美观且可持续景观日益增长的需求 | 观赏植物 | 园艺学 | NA | CRISPR/Cas9, 合成生物学, 数字表型分析, 多组学方法 | NA | NA | NA |
347 | 2025-05-07 |
QM/MM Unlocks The Catalytic Mechanism of YtfE: The Structural Reorganization of The Active Site Enables Nitrite-to-NO Conversion
2025-Apr-28, Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/chem.202500817
PMID:40296212
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研究论文 | 本研究通过多尺度计算方法揭示了YtfE蛋白在亚硝酸盐还原过程中的分子机制 | 揭示了活性位点的结构重组对亚硝酸盐还原机制的关键作用,特别是氢键网络和HONO中间体配位转换的影响 | 研究主要基于计算模拟,缺乏实验验证 | 阐明YtfE蛋白在亚硝酸盐还原中的催化机制 | 大肠杆菌铁中心修复蛋白(YtfE) | 计算生物学 | NA | QM/MM, QM/MM MD, QM计算 | NA | 计算模拟数据 | NA |
348 | 2025-05-07 |
Robust and highly efficient transformation method for a minimal mycoplasma cell
2025-Mar-20, Journal of bacteriology
IF:2.7Q3
DOI:10.1128/jb.00415-24
PMID:39903184
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研究论文 | 本文报道了一种针对最小细胞JCVI-syn3B的稳健且高效的转化方法 | 开发了一种高效的转化方法,显著提高了转化效率,并减少了所需的DNA和受体细胞数量 | NA | 改进最小细胞的转化方法,以促进基因工程和生物学研究 | 最小细胞JCVI-syn3B | 合成生物学 | NA | 转化方法 | NA | NA | 小于0.2 mL的培养物,约1×10^10细胞和10 ng质粒DNA |
349 | 2025-05-07 |
A new flavor of synthetic yeast communities sees the light
2025-Mar-12, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.02008-23
PMID:39912663
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综述 | 本文综述了利用合成生物学策略构建人工酵母群落的最新进展,特别是光遗传学在调控群落表型中的应用 | 强调了光遗传学技术在合成酵母群落中实现时空调控的创新应用 | NA | 探索合成微生物群落的构建及其在生态动力学和代谢工程中的应用 | 合成酵母群落 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA |
350 | 2025-05-07 |
Innovative logic "AND" gate gene circuits for bladder cancer treatment: preclinical study
2025-Mar-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000002270
PMID:39903549
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research paper | 该研究开发了一种名为LAG-DTGC的合成基因电路,用于膀胱癌的精准治疗 | 创新性地设计了逻辑'AND'门双靶点基因电路,能够整合多个信号以实现膀胱癌细胞信号通路的全面重编程 | 目前仅进行了临床前研究,尚未进行人体试验 | 开发针对膀胱癌的精准、低毒治疗方法 | 膀胱癌细胞 | 合成生物学 | 膀胱癌 | 生物信息学分析 | 逻辑'AND'门双靶点基因电路(LAG-DTGC) | 基因表达数据 | NA |
351 | 2025-05-07 |
Spatial Control of CAR T Cell Activation Using Tumor-Homing Polymers
2025-Feb-12, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.4c15442
PMID:39902740
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research paper | 该研究开发了一种名为IMPACT的新框架,通过合成生物学和生物材料方法实现CAR T细胞的空间控制激活 | 提出了IMPACT框架,首次实现了通过聚合物介导的解剖学控制IF-THEN门控CAR T细胞 | 目前仅在鼠类肿瘤模型中进行了验证,尚未在人体中测试 | 提高CAR T细胞疗法的特异性,减少脱靶毒性 | CAR T细胞和肿瘤归巢聚合物 | 合成生物学 | 肿瘤 | 合成生物学和生物材料方法 | IF-THEN门控CAR T细胞 | NA | 鼠类肿瘤模型 |
352 | 2025-05-07 |
Innovations and challenges in collagen and gelatin production through precision fermentation
2025-Feb-06, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04276-z
PMID:39910024
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综述 | 本文全面综述了通过精密发酵生产胶原蛋白和明胶的创新与挑战 | 介绍了精密发酵技术在生产重组胶原蛋白和明胶中的应用,减少环境影响并提高产量 | 面临规模化生产、成本效益和市场整合等挑战 | 探索更可持续和伦理的生产方法以替代传统动物组织提取 | 胶原蛋白和明胶 | 生物技术 | NA | 精密发酵(PF)、重组技术、合成生物学、生物过程优化 | NA | NA | NA |
353 | 2025-05-07 |
An inorganic mineral-based protocell with prebiotic radiation fitness
2023-12-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43272-5
PMID:38052788
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research paper | 该研究提出了一种基于无机矿物共聚物液滴的耐辐射原始细胞模型,探讨其在极端前生物条件下的适应性 | 首次构建了具有辐射抗性的分区化原始细胞模型,利用非酶抗氧化系统清除活性氧 | 未验证该模型在真实前生物环境中的长期稳定性与进化潜力 | 探索原始细胞在早期地球辐射环境中的生存适应机制 | 由多聚磷酸盐-锰液滴和三肽液滴组成的复合原始细胞系统 | 合成生物学 | NA | 共聚物液滴组装技术 | 分区化原始细胞模型 | 生化实验数据 | 两种共聚物液滴系统(polyP-Mn和polyP-三肽) |
354 | 2025-05-06 |
Living therapeutics: Precision diagnosis and therapy with engineered bacteria
2025-Oct, Biomaterials
IF:12.8Q1
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综述 | 本文综述了工程化细菌在癌症治疗中的最新进展,包括理论基础、基因工程和化学修饰技术的应用,以及未来的挑战和前景 | 总结了合成生物学和化学工程在开发可控性更强、靶向性更高且毒性更低的工程化细菌平台方面的最新进展 | 未提及具体的临床研究数据或样本量,可能缺乏实际应用的详细评估 | 探讨工程化细菌在精准肿瘤学中的诊断和治疗潜力 | 工程化细菌及其在癌症治疗中的应用 | 合成生物学 | 癌症 | 基因工程和化学修饰技术 | NA | NA | NA |
355 | 2025-05-06 |
Synthetic biology of Fusarium for the sustainable production of valuable bioproducts
2025 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108579
PMID:40222460
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综述 | 本文综述了利用合成生物学优化镰刀菌属作为可持续生产多种生物制品的高效平台 | 综述了CRISPR/Cas9、RNA干扰和合成启动子等先进工程技术在优化镰刀菌代谢途径中的应用,以及下一代测序和组学技术对镰刀菌代谢网络理解的扩展 | 代谢瓶颈、监管复杂性和菌株稳定性等挑战仍是工业规模应用的主要障碍 | 探索镰刀菌作为可持续细胞工厂的潜力,以生产生物燃料、药品、酶和其他有价值的化合物 | 镰刀菌属 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9, RNA干扰, 合成启动子, 下一代测序, 组学技术 | NA | NA | NA |
356 | 2025-05-06 |
Engineering artificial microbial consortia for personalized gut microbiome modulation and disease treatment
2025-May-05, Annals of the New York Academy of Sciences
IF:4.1Q1
DOI:10.1111/nyas.15352
PMID:40320966
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review | 本文提出了一种通过工程化人工微生物群落来个性化调节肠道微生物组并治疗疾病的新方法 | 整合合成生物学、系统生物学和先进培养技术,设计定制化微生物群落以执行特定功能 | 需要进一步的临床试验来评估其安全性、有效性和长期影响 | 通过精确调控肠道微生物组来治疗代谢紊乱、炎症性疾病和胃肠道感染等疾病 | 人工微生物群落及其在肠道微生物组中的应用 | 合成生物学 | 代谢紊乱、炎症性疾病、胃肠道感染 | 合成生物学、系统生物学、先进培养技术 | NA | NA | NA |
357 | 2025-05-06 |
Microbial Biosensor for Sensing and Treatment of Intestinal Inflammation
2025-May-05, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202504364
PMID:40323169
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研究论文 | 本文介绍了一种优化的钙卫蛋白生物传感器,用于检测和治疗肠道炎症 | 开发了一种结合锌摄取调节器(Zur)控制启动子和记忆电路的生物传感器,能够检测并记录体内肠道炎症,同时具备诊断和治疗功能 | 研究仅在两种独立的小鼠结肠炎模型中进行验证,尚未在人类临床试验中应用 | 开发用于肠道疾病诊断和治疗的合成生物体 | 肠道炎症及其生物标志物钙卫蛋白 | 合成生物学 | 肠道炎症 | 合成生物学技术、生物传感器技术 | NA | 生物标志物数据 | 两种独立的小鼠结肠炎模型 |
358 | 2025-05-06 |
Semantical and geometrical protein encoding toward enhanced bioactivity and thermostability
2025-May-02, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.98033
PMID:40314227
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research paper | 提出了一种新的预训练框架,整合了蛋白质一级和三级结构的序列和几何编码器,以提高蛋白质工程的功能性和热稳定性预测 | 整合了序列和几何编码器,模拟自然选择指导突变方向,并在三个基准测试中展示了卓越性能 | 现有方法主要依赖蛋白质序列,难以高效编码氨基酸局部环境的几何方面,且缺乏对蛋白质热稳定性预测的基本评估 | 提高蛋白质工程的功能性和热稳定性预测的准确性和全面性 | 蛋白质序列和结构 | synthetic biology | NA | deep learning | pre-training framework with sequential and geometric encoders | protein sequence and structure data | over 300 deep mutational scanning assays |
359 | 2025-05-06 |
Biotechnological approaches for the production of neuroactive huperzine A
2025-Apr-29, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2025.04.020
PMID:40311807
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综述 | 本文综述了石杉碱甲(HupA)的神经保护特性及其在治疗神经退行性疾病中的潜力,并探讨了提高其产量的生物技术策略 | 强调了生物技术在提高HupA产量中的应用,包括化学合成、微生物发酵、植物组织培养和合成生物学方法 | 目前对HupA生物合成的认识仍存在知识空白,需要进一步研究以开发经济高效的可持续生产方法 | 探讨HupA在神经退行性疾病治疗中的潜力及提高其产量的生物技术策略 | 石杉碱甲(HupA)及其在神经退行性疾病中的应用 | 生物技术 | 阿尔茨海默病、帕金森病、亨廷顿病、多发性硬化症、癫痫、重症肌无力 | 化学合成、微生物发酵、植物组织培养、合成生物学 | NA | 文献综述数据 | NA |
360 | 2025-05-04 |
Construction of P450 scaffold biocatalysts for the biodegradation of five chloroanilines
2025-May-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.137305
PMID:39854990
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研究论文 | 本研究通过工程化改造P450BM3单加氧酶的活性位点,开发出新型人工生物催化剂,用于高效降解五种氯苯胺类环境污染物 | 通过将P450BM3中高度保守的苏氨酸268替换为天冬氨酸,成功诱导了过氧化物酶活性,显著提升了催化效率 | NA | 开发无需NAD(P)H或双功能小分子辅助的高效生物催化剂,用于环境污染物降解 | 五种氯苯胺类化合物(4-氯苯胺、2-氯苯胺、2,4-二氯苯胺、3,4-二氯苯胺和3,5-二氯苯胺) | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、UPLC-MS分析 | NA | 化学分析数据 | 五种氯苯胺类化合物 |