本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2026-04-25 |
Designing biological network motif-based controllers by reverse engineering Hill function-type models from linear models
2025-Apr, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2024.0811
PMID:40262636
|
研究论文 | 提出一种逆向工程方法,从线性模型分析推断非线性Hill函数模型的动力学参数,用于设计实现完美适应的生物控制器 | 首次提出将线性系统理论与非线性Hill函数建模相结合进行逆向工程,实现生物网络基序控制器的设计 | 研究仅通过仿真验证了方法的有效性,缺乏实验验证 | 设计能够实现完美适应的合成生物控制器 | 三种基于生物网络基序的控制器 | 系统生物学 | NA | NA | Hill函数模型、线性模型 | 仿真数据 | NA | NA | NA | 生物网络基序控制器 | 合成生物学 |
| 362 | 2026-04-25 |
Advancing CRISPR base editing technology through innovative strategies and ideas
2025-03, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2699-5
PMID:39231901
|
综述 | 重点介绍基于CRISPR平台的非DSB编辑器BE和PE的开发与创新,探讨改进策略及未来理想编辑器的发展前景 | 系统归纳了“替换”、“组合”、“适应”和“调整”等改进思路在BE和PE开发中的应用,并阐述了CRISPR技术创新中的巧妙思维反转与跳跃 | 未具体探讨CRISPR碱基编辑技术在实际应用中可能面临的脱靶效应或伦理问题 | 综述CRISPR碱基编辑技术通过创新策略和思路的进展,展望未来理想编辑器的开发 | 基于CRISPR平台的碱基编辑器(BE)和先导编辑器(PE) | 合成生物学 | NA | CRISPR碱基编辑, 先导编辑, AAV递送系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 碱基编辑器, 先导编辑器, 小型编辑器 | 医学, 农业, 工业生物技术 |
| 363 | 2026-04-25 |
Morphology remodelling and membrane channel formation in synthetic cells via reconfigurable DNA nanorafts
2025-Feb, Nature materials
IF:37.2Q1
DOI:10.1038/s41563-024-02075-9
PMID:39805958
|
研究论文 | 利用可重构DNA纳米筏构建合成细胞模型,实现形态重塑和膜通道形成 | 将DNA纳米筏在纳米尺度的重塑与巨型单层囊泡在微米尺度的重塑耦合,通过可编程方式改变囊泡形态,并利用生物孔辅助形成可密封的合成通道 | NA | 探索可重构DNA纳米结构与合成细胞之间的界面,扩展DNA纳米技术在合成生物学中的应用潜力 | 信号响应型DNA纳米筏、生物孔和巨型单层囊泡组成的合成细胞模型 | NA | NA | DNA纳米技术 | NA | NA | NA | DNA纳米技术 | NA | 可重构DNA纳米筏网络 | 合成生物学 |
| 364 | 2026-04-24 |
Protein-free membrane fusion: A refined view of the delicate fusogenic properties of calcium
2026-Apr-21, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2026.03.040
PMID:41863074
|
研究论文 | 本文使用微流控捕获平台结合共聚焦显微镜,定量研究了钙离子介导的巨型单层囊泡融合,揭示了其作为无蛋白质融合剂的精细特性 | 首次在细胞大小的膜上系统量化钙离子介导的融合效率,并发现融合依赖于狭窄的参数空间,澄清了不同尺寸囊泡实验间的长期矛盾 | 研究仅限于特定脂质成分和钙浓度,未涵盖生理条件下其他离子或蛋白质的影响 | 阐明钙离子在无蛋白质条件下促使细胞大小膜融合的机制及其应用潜力 | 巨型单层囊泡 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 图像 | 数百个单个囊泡 | NA | NA | NA | 合成生物学, 膜重构研究 |
| 365 | 2026-04-24 |
Employing synthetic biology to modulate metabolic flux: Current strategies and applications
2026-Apr-21, Journal of bioscience and bioengineering
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.jbiosc.2026.03.012
PMID:42020273
|
综述 | 综述了利用合成生物学调控代谢通量的最新基因调控工具和策略,及其在生物制造中的应用 | 根据基因调控的分子层面(中心法则及以外)对工具进行分类,并指出了尚未充分探索但具有潜力的工具 | 单一策略无法适用于所有系统,需根据具体系统采用定制化方法 | 总结代谢工程中用于调控代谢通量的基因调控工具和策略,推动生物制造发展 | 细菌、古菌和真核生物中的多酶途径基因调控工具 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术, 能源, 材料, 医药, 食品 |
| 366 | 2026-04-24 |
On-Demand Droplet Routing and Splitting Using Independently Addressable Interdigitated Electrodes
2026-Mar-20, Micromachines
IF:3.0Q2
DOI:10.3390/mi17030375
PMID:41900261
|
研究论文 | 提出一种利用独立寻址叉指电极实现按需液滴路由和分裂的低电压微流控平台 | 将倾斜叉指电极与非对称Y型结点集成,在单一器件中实现电可调液滴分裂与分选,并通过低电压介电泳实现液滴动态路由和实时确定性分裂 | NA(摘要未明确提及局限性) | 开发低电压微流控平台,实现液滴的按需路由和分裂,用于生物化学分析 | 微流控芯片中的液滴 | 微流控 | NA | 微流控、介电泳 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物发现、单细胞分析、分子诊断、合成生物学 |
| 367 | 2026-04-24 |
Unintended Creation or Insertion of Antisense Promoter Motifs During Codon Optimization: A Cyber-Biosecurity Risk
2026-Mar-12, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14030638
PMID:41900397
|
研究论文 | 本研究探究密码子优化过程中无意引入或有意插入反义启动子基序(如“TATAAT”)的网络安全风险,并开发了计算管道进行检测和防御 | 首次揭示密码子优化工具中双向DNA链筛查的缺失可能导致潜在生物网络安全漏洞,并提出计算防御策略 | 研究主要基于计算机模拟分析和公共数据集,缺乏湿实验验证插入反义基序后的实际生物效应 | 评估密码子优化过程中反义启动子基序的无意引入或有意插入风险,并提出防御方法 | 484741个蛋白质编码序列及其密码子优化后的反义链基序 | 合成生物学 | NA | 密码子优化 | NA | 基因组序列 | 484,741个蛋白质编码序列 | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 368 | 2026-04-24 |
A Scaffoldomics Platform for Modular In Vivo Enzyme Colocalisation and Its Application to Naringenin Biosynthesis
2026-Mar, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70328
PMID:41814496
|
研究论文 | 开发了一种‘支架组学’平台,用于模块化体内酶共定位,并应用于柚皮素生物合成 | 提出了一种通用的‘支架组学’合成框架,能够实现多达四种途径酶在蛋白支架上的组合组装,并通过大肠杆菌中染色体编码的生物传感器实现实时检测和途径评估 | 当前方法仍可能劳动密集且效率不足,但该平台展示了显著改善 | 提高微生物细胞工厂的代谢效率,增强精细化学品的产量 | 微生物细胞工厂中的酶共定位系统 | 合成生物学 | NA | 蛋白支架组装、生物传感器 | NA | 实验数据 | 多种酶组合的支架组装和柚皮素生物合成实验 | 蛋白质工程、生物传感器 | 大肠杆菌 | 蛋白支架用于多酶复合物组装和代谢途径优化 | 工业生物技术、医药 |
| 369 | 2026-04-24 |
Point-of-Care Devices to Detect Zika and Other Emerging Viruses
2020-06-04, Annual review of biomedical engineering
IF:12.8Q1
|
综述 | 本文综述了用于检测寨卡病毒及其他新兴病毒的即时检测设备,重点比较了侧向流免疫层析法和合成生物学诊断方法 | 本文创新性地提出侧向流免疫层析法与合成生物学诊断(包括CRISPR诊断)相结合可能是未来可扩展快速诊断的最佳方案,并描述了结合功能化多色纳米颗粒和计算方法来区分密切相关的病原体 | NA | 评估和比较多种快速诊断平台,为应对新兴病毒传播提供有效的即时检测策略 | 寨卡病毒及其他新兴病毒 | 人工智能 | 寨卡病毒感染 | 侧向流免疫层析法,合成生物学诊断,CRISPR诊断 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 合成基因回路(病原体核酸序列识别激活回路) | 医学 |
| 370 | 2026-04-23 |
iFLinkC-EZ: A scalable and automatable method for the assembly of complex fusion proteins and multi-gene expression constructs based on the iFLinkC framework
2026-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.03.008
PMID:42006855
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于iFLinkC框架的可扩展且可自动化的方法iFLinkC-EZ,用于组装复杂融合蛋白和多基因表达构建体 | iFLinkC-EZ通过遗传手段纯化DNA组装产物,简化了组装过程并使其兼容机器人自动化,克服了传统方法需要物理纯化DNA片段的限制 | NA | 开发一种标准化框架,用于组装任意大小和复杂度的蛋白质编码序列和多基因表达构建体 | 融合蛋白和多基因表达构建体,包括单色和多色多荧光融合蛋白以及多顺反子表达构建体 | 合成生物学 | NA | 迭代功能性连接子克隆(iFLinkC) | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly | 酵母 | 合成蛋白开关、传感器、多酶复合物以及由此组成的遗传电路和代谢途径 | 生物技术 |
| 371 | 2026-04-23 |
Natural Food Pigments: From Biosynthesis to Application
2026-Apr-22, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c05093
PMID:41954457
|
综述 | 本文综述了天然食品色素的生物合成、合成生物学策略、药理活性机制以及在医药、保健和化妆品中的应用进展 | 系统整合了天然色素的生物合成路径、合成生物学策略、药理活性机制及多领域应用,结合代谢工程、人工智能辅助筛选和生物传感等新兴技术,提出了从基础合成到高价值应用的跨学科发展路径 | NA | 探讨天然色素的生物合成、应用潜力及作为功能性色素在天然药物开发中的多重价值 | 天然食品色素,包括吡咯、类异戊二烯、醌类、酚类和甜菜碱五大结构类别 | NA | NA | 代谢工程、人工智能辅助筛选、生物传感 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药、保健、化妆品 |
| 372 | 2026-04-23 |
Decoding Outer Membrane β-Barrels: From Structural Curiosity to Engineered Nanotherapeutics
2026-Apr-22, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.5c00902
PMID:41973831
|
综述 | 本文综述了外膜β-桶状蛋白(OMPs)的结构、功能多样性及其在生物传感、药物递送和纳米医学等领域的工程应用前景 | 将OMPs从结构研究对象提升为可工程化的精准生物分子设计平台,并系统整合了其从基础发现到纳米治疗应用的全链条发展 | 作为综述文章,未提出新的实验数据或具体技术方案,主要基于现有文献进行整合分析 | 探讨外膜β-桶状蛋白的结构功能特性及其在生物工程与纳米治疗领域的应用潜力 | 革兰氏阴性细菌、线粒体和叶绿体中的跨膜β-桶状外膜蛋白(OMPs) | 结构生物学与合成生物学 | NA | 冷冻电镜(cryo-EM)、核磁共振(NMR)、分子动力学模拟(MD simulations)、AlphaFold | NA | 结构数据、生物化学数据、相互作用组数据 | NA | 理性设计工程 | 革兰氏阴性细菌、线粒体、叶绿体 | 生物传感器、药物递送系统、诊断平台 | 医学、合成生物学、纳米医学、生物传感、诊断 |
| 373 | 2026-04-23 |
From Xylose to Biobased High-Value Chemicals: Advances in Microbial Xylose Utilization for Industrial Biotechnology
2026-Apr-22, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c06628
PMID:41979057
|
综述 | 本文综述了微生物利用木糖生产高价值化学品的最新研究进展,重点关注木糖代谢途径、代谢工程策略以及相关挑战与未来机遇 | 系统总结了利用代谢工程和合成生物学技术提升微生物木糖利用效率的最新策略,并提出了从木质纤维素中高效提取木糖、葡萄糖与木糖共利用等关键挑战的解决方案 | NA | 提高木质纤维素生物质中木糖的利用效率,以生产高价值化学品并促进工业生物技术发展 | 微生物的木糖代谢途径及利用木糖生产高价值化学品的生物过程 | 工业生物技术 | NA | 代谢工程,合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 能源,工业生物技术 |
| 374 | 2026-04-23 |
Selective on-chip DNA synthesis using electric field-assisted PCR
2026-Apr-22, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d5lc01200g
PMID:42015792
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于微电极阵列的电场辅助PCR系统,用于选择性片上DNA合成 | 利用电场操控实现DNA选择性固定和酶介导单链DNA合成,在微尺度上实现精确空间控制 | NA | 开发一种可扩展的高通量酶促合成平台 | DNA合成与核酸检测 | 合成生物学 | NA | 电场辅助PCR(E-PCR) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | DNA数据存储, 合成生物学, 分子诊断 |
| 375 | 2026-04-23 |
Living Microbial Drugs
2026-Apr-22, Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/chem.202503523
PMID:42015835
|
综述 | 本文综述了活微生物治疗剂作为新型药物类别的发展,从传统益生菌到先进的合成生物学工程微生物,探讨了其设计原则、应用领域及面临的挑战 | 将合成生物学应用于微生物工程,使其具备检测宿主信号、原位递送治疗药物的能力,实现动态、自调节的个性化治疗 | 存在生物安全性、生物控制、监管审批和患者接受度等障碍 | 探讨活微生物治疗剂作为新型药物的发展、设计原则及其在疾病治疗中的应用 | 工程化微生物(包括细菌、酵母、噬菌体和古菌)作为治疗平台 | 合成生物学 | 传染病、代谢疾病、炎症性疾病、癌症 | 合成生物学、遗传逻辑电路、群体感应调控、合成记忆设备 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 细菌、酵母、噬菌体、古菌 | 遗传逻辑电路、群体感应调控系统、合成记忆设备,用于实现上下文依赖和自我调节的治疗能力 | 医学 |
| 376 | 2026-04-23 |
Epigenetic Control of Toehold-Mediated Strand Displacement for Programmable Molecular Circuit Regulation and Enhanced microRNA Detection
2026-Apr-21, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.6c01658
PMID:41952075
|
研究论文 | 本文提出了一种利用N-甲基腺苷(mA)表观遗传修饰调控toehold介导的链置换反应的方法,实现了对DNA分子电路的可编程动力学控制,并应用于microRNA检测 | 首次将单碱基表观遗传修饰(mA)引入toehold结构域,实现了对链置换反应动力学的可逆、精确调控,突破了传统方法依赖固定toehold稳定性的限制 | 未明确说明该技术在其他类型核酸电路或更复杂生物环境中的普适性及长期稳定性 | 开发一种可编程调控分子电路动力学的新方法,并提高microRNA检测的灵敏度与特异性 | toehold介导的DNA链置换反应、催化发夹组装电路、癌症相关microRNA-21 | 合成生物学 | 癌症 | 单碱基N-甲基腺苷(mA)表观遗传修饰、脱甲基酶FTO调控、细胞内成像 | NA | 实验数据与理论分析 | NA | NA | NA | 表观遗传调控的toehold介导链置换系统、催化发夹组装电路 | 生物传感、分子计算、合成生物学 |
| 377 | 2026-04-23 |
Synthetic mechanobiology
2026-Apr-20, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2026.03.005
PMID:42013804
|
综述 | 本文综述了合成机械生物学这一新兴领域,探讨如何将机械传感通路重新编程以实现特定功能,并展望其在疾病治疗中的应用 | 将机械生物学与合成生物学工具相结合,将力传感视为可编程的设计问题,提出通过重新连接机械信号通路来实现有用结果并作为研究策略 | NA | 探讨如何将机械调控通路作为可编程的输入-输出关系,构建能够感知并响应组织力学的工程化细胞 | 细胞的机械传感分子机制、模块化机械遗传部件、工程化细胞 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具 | NA | NA | NA | NA | 工程化细胞 | 机械信号通路重连 | 医学 |
| 378 | 2026-04-23 |
mRNA medicine for cardiovascular disease
2026-Apr, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-026-00804-8
PMID:41981145
|
综述 | 本文综述了mRNA技术在心血管疾病治疗中的进展,包括mRNA修饰、递送平台、基因组编辑及免疫细胞工程等应用 | 整合了mRNA修饰、纳米技术、基因组编辑和RNA合成生物学的最新进展,为心血管疾病提供了新的治疗策略 | NA | 探讨mRNA技术在心血管疾病治疗中的应用潜力和发展方向 | 心血管疾病,包括高胆固醇血症、动脉粥样硬化、缺血性心脏损伤、心脏纤维化和心脏淀粉样变性 | NA | 心血管疾病 | mRNA技术、纳米技术、基因组编辑、RNA合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 379 | 2026-04-23 |
Tunable Low-Rate Genomic Recombination with Cre-lox in Escherichia coli : A Versatile Tool for Environmental Biosensing and Synthetic Biology
2025-Sep-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.02.616356
PMID:40949998
|
研究论文 | 本文开发了一种在Escherichia coli中可调控的低速率Cre-lox基因组重组系统,用于环境生物传感和合成生物学应用 | 实现了紧密调控、可滴定且具有低重组率和最小基础活性的Cre重组酶系统,并成功应用于缺氧环境下的砷酸盐生物传感 | NA | 开发一种可调控的低速率基因组重组工具,以增强环境生物传感和合成生物学的应用能力 | Escherichia coli(大肠杆菌)中的Cre-lox重组系统 | 合成生物学 | NA | Cre-lox重组技术 | NA | NA | NA | Cre-lox | Escherichia coli | 可调控的低速率基因组重组系统,用于环境生物传感 | 环境, 工业生物技术 |
| 380 | 2026-04-23 |
Engineered receptors for soluble cellular communication and disease sensing
2025-02, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08366-0
PMID:39542025
|
研究论文 | 本研究开发了一种名为SNIPR的合成受体平台,能够响应可溶性配体并激活定制细胞功能,用于增强工程化治疗细胞的特异性 | 首次将SNIPR受体架构改造为可被可溶性配体激活的平台,实现了低基线活性与高倍数激活,并通过内吞和pH依赖性切割机制工作 | 未明确说明受体平台在复杂生理环境中的长期稳定性及潜在免疫原性问题 | 开发模块化合成受体以响应可溶性配体,用于精准调控工程化治疗细胞功能 | 合成受体平台(SNIPR)、CAR-T细胞、可溶性疾病相关因子 | 合成生物学 | 实体瘤 | 合成受体工程、细胞信号网络设计 | NA | NA | NA | SNIPR平台 | 哺乳动物细胞 | 可溶性配体激活的合成受体、正交于天然信号通路的细胞间通信网络 | 医学 |