合成生物学相关文章
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当前共找到 5109 篇文献，本页显示第 361 - 380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2026-05-22 |
The amino acid alphabet and the architecture of the protein sequence-structure map. I. Binary alphabets
2014-Dec, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1003946
PMID:25473967
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研究论文 | 探索二元氨基酸字母表序列-结构映射的架构及势能函数相对力的影响 | 采用图论视角和简单精确蛋白质模型，系统分析势能中吸引、中性和排斥力的相对比例如何定义不同类型的势能，并揭示它们对序列-结构映射架构的差异化影响 | 基于简化精确模型及随机采样，可能无法完全捕捉天然蛋白质的复杂性；未涉及实际蛋白质动力学或进化过程中的动态因素 | 阐明势能函数相对力对蛋白质序列-结构映射架构的影响，并探讨其对天然蛋白质折叠码、随机肽库构建及早期字母表演化的启示 | 二元氨基酸字母表的潜在能量函数空间及简单精确蛋白质模型 | 生物信息学 | NA | NA | 简单精确模型（图论视角） | 模拟数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、进化生物学 |
| 362 | 2026-05-21 |
Beyond tiny aquatic plants: how duckweeds serve the world as revolutionary crops for alleviating resource and energy crises
2026-Jul-01, Food chemistry
IF:8.5Q1
DOI:10.1016/j.foodchem.2026.149330
PMID:42048806
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review | 本文综述了浮萍作为革命性作物在缓解资源和能源危机方面的潜力与应用 | 全面分析了浮萍在替代蛋白、可持续生物燃料、合成生物学底盘和空间生命支持系统中的多样化应用，并进行了生命周期和技术经济评估 | NA | 评估浮萍在确保粮食安全、发展能源替代、促进生物制造和推动生态可持续性方面的核心优势与可行性 | 浮萍（水生植物） | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 浮萍 | 合成生物学底盘 | 农业, 能源, 环境, 生物制造 |
| 363 | 2026-05-21 |
PlantGFM: A Genomic Foundation Model for Discovery and Creation of Plant Genes
2026-May-20, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.75772
PMID:42160034
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research paper | 提出PlantGFM，一种基于Hyena算子的植物基因组基础模型，支持长上下文预测和序列生成，并成功设计出有转录活性的新植物基因 | 首次在植物中展示了大型语言模型生成序列的DNA-RNA-蛋白质表达，并实现从头设计具有转录活性的植物基因，包括NLR基因的生成 | NA | 开发人工智能驱动的植物基因发现和生成方法 | 植物基因序列 | 机器学习 | NA | NA | Hyena算子 | 基因组序列 | 从12个植物物种的108.4亿个核苷酸进行预训练，并在10个注释植物基因组上微调 | NA | 本氏烟草 | NA | 农业, 合成生物学 |
| 364 | 2026-05-19 |
Betacyanin biofortification in wheat via synthetic biology for nutritional enhancement
2026-May-06, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiag266
PMID:42148553
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 365 | 2026-05-21 |
The Leptin Renaissance: Orchestrating the Next Endocrine Paradigm
2026-May, Journal of cellular biochemistry
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/jcb.70091
PMID:42159080
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评论 | 文章讨论瘦素从传统代谢激素向多系统免疫-代谢调控因子的范式转变，并强调整合精准医学、合成生物学和微生物组干预的新策略 | 提出将瘦素视为多效性全身激素，整合免疫调节、工程化瘦素类似物和微生物组靶向治疗的系统级方法 | 未提供具体实验数据或验证，仅基于观点性论述；瘦素抵抗的分子机制仍需进一步阐明 | 提出瘦素作为内分泌新范式的核心，探索克服瘦素抵抗的创新治疗策略 | 瘦素及其在代谢、免疫和微生物组中的多系统作用 | NA | 肥胖及相关代谢紊乱 | 多组学分析、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 366 | 2026-05-21 |
Recent advances in pathway engineering for the biosynthesis of 1,4-butanediol
2026-Apr-10, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-026-13816-y
PMID:41961299
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综述 | 综述了路径工程在1,4-丁二醇生物合成中的最新进展 | 系统总结了三条从头合成路径的设计和动态代谢调控策略，并评估了体外酶级联与全细胞转化体系的建立 | 工业放大受限于细胞内源性分解代谢、宿主耐受性不足和经济可行性欠佳 | 实现1,4-丁二醇的可持续生物合成并解决商业化瓶颈 | 微生物合成途径、酶工程和代谢调控策略 | NA | NA | 多组学、酶工程 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | CoA依赖路径、木质纤维素糖代谢路径、氨基酸分解代谢路径、体外酶级联、全细胞转化 | 工业生物技术 |
| 367 | 2026-05-21 |
Human Allele Frequency Distributions Contradict Current Narratives of Imminent Danger From Genetically Targeted Bioweapons
2026-Apr, Health security
IF:2.1Q3
DOI:10.1177/23265094261434692
PMID:41937340
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research paper | 分析遗传变异在种族间分布，驳斥基因生物武器迫在眉睫的说法 | 从自然遗传变异角度系统评估基因目标武器可行性，对比病原体和药物反应变异的种族分布差异 | 仅分析149个已验证的感染相关变异和136个药物反应相关变异，未覆盖全基因组范围 | 验证基因生物武器叙事的真实性基础，评估种族目标武器的可行性 | 人类种族间遗传变异分布数据 | machine learning | NA | 遗传变异分析 | NA | 遗传变异数据 | 149个感染相关变异和136个药物反应相关变异 | NA | NA | NA | medicine |
| 368 | 2026-05-21 |
The oxidative rearrangements in bacterial aromatic polyketide biosynthesis
2025-12-10, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00049a
PMID:40927919
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综述 | 本文综述了细菌芳香族聚酮化合物生物合成中的氧化重排反应 | 系统总结了黄素依赖性单加氧酶催化的Baeyer-Villiger和Favorskii型氧化重排、酮还原酶和双加氧酶催化的创新碳骨架重排以及CYP450或NmrA样蛋白催化的分子间二聚化等独特反应，并揭示了相关酶的结构特征和催化机制 | 时间范围截止至2025年4月，可能未涵盖近期最新研究进展 | 阐述细菌芳香族聚酮生物合成中天然酶如何利用氧化还原化学创造新碳骨架 | 细菌芳香族聚酮化合物生物合成中的氧化重排反应和相关酶类 | 天然产物生物合成 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 芳香族聚酮生物合成途径中的氧化重排反应 | 医学 |
| 369 | 2026-05-21 |
The Global Decarbonisation Potential of Synthetic Biology
2025-09, Global change biology
IF:10.8Q1
DOI:10.1111/gcb.70478
PMID:40905760
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研究论文 | 本文探讨了合成生物学在长期脱碳中的潜力，并采用自上而下的方法量化其影响 | 首次从宏观角度系统评估合成生物学不同应用领域对全球脱碳的贡献潜力，并分析其对碳价等经济因素的敏感性 | 采用自上而下的方法，可能忽略具体技术细节和区域差异 | 评估合成生物学技术在不同领域的脱碳潜力，并为气候减缓政策提供优先方向 | 合成生物学技术在农业恢复、食品生产、土壤碳汇、工业减排和地球工程等领域的脱碳应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境, 农业, 工业 |
| 370 | 2026-05-21 |
Expanding salivary biomarker detection by creating a synthetic neuraminic acid sensor via chimeragenesis
2025-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.13.598939
PMID:38915506
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研究论文 | 利用合成生物学技术构建新型嵌合转录因子（Sphnx）作为全细胞生物传感器，用于检测唾液中的N-乙酰-D-神经氨酸（Neu5Ac），实现口腔鳞状细胞癌的早期非侵入性诊断 | 通过嵌合体技术创建新型合成神经氨酸传感器，首次将工程细菌的全细胞生物传感器应用于口腔鳞状细胞癌唾液生物标志物检测 | 尚未进行临床验证，传感器性能在真实唾液样本中的灵敏度和特异性待评估，平台仍需优化以提高检测通量和稳定性 | 开发能够检测口腔鳞状细胞癌相关唾液生物标志物的合成生物传感器，为口腔及全身疾病的临床筛查提供概念验证平台 | N-乙酰-D-神经氨酸（Neu5Ac）和工程细菌菌株 | 合成生物学 | 口腔鳞状细胞癌 | 合成生物学、嵌合体技术 | NA | 分子数据 | NA | NA | 工程细菌 | 嵌合转录因子（Sphnx）传感回路 | 医学 |
| 371 | 2026-05-21 |
Mechanisms and applications of bacterial luciferase and its auxiliary enzymes
2025-03, Archives of biochemistry and biophysics
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.abb.2025.110307
PMID:39824239
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综述 | 本文综述了细菌荧光素酶及其辅助酶的机制和应用 | 阐明了C4a-氢过氧化黄素形成机制并鉴定出关键催化残基His44，通过蛋白质工程和合成生物学改进了LuxAB的生物发光特性 | 实现红移发射、优化信号强度和识别与发光物种生成相关的机制等问题仍有待探索 | 总结LuxAB的反应机制及其在生物技术中的应用进展 | 细菌荧光素酶（LuxAB）及其辅助酶（如LuxG） | 合成生物学 | NA | 生物发光分析 | NA | NA | NA | 蛋白质工程, 合成生物学 | NA | lux操纵子编码的自发光系统 | 生物成像, 生物报告器, 生物传感, 代谢工程, 生物燃料生产 |
| 372 | 2026-05-21 |
A generic cell-based biosensor converts bacterial infection signals into chemoattractants for immune cells
2024-11-12, Biofabrication
IF:8.2Q1
DOI:10.1088/1758-5090/ad8bf4
PMID:39467389
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研究论文 | 设计了一种基于合成生物学的细胞生物传感器，将细菌感染信号转化为免疫细胞趋化因子 | 系统具有通用性，可感知多种感染类型并通过增强内源性免疫系统发挥作用，同时实现超敏检测和治疗蛋白输出 | NA | 开发一种通用的细胞基生物传感器/执行器，用于检测和对抗细菌感染 | 基因工程化的传感器/执行细胞 | 合成生物学 | 细菌感染 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 感应I型干扰素的合成电路，包含正反馈环路 | 医学 |
| 373 | 2026-05-20 |
One Yeast, Sixteen Synthetic Chromosomes, Infinite Possibilities
2026-May-19, Yeast (Chichester, England)
DOI:10.1002/yea.70026
PMID:42152749
|
综述 | 庆祝《Yeast》期刊40周年，回顾合成酵母基因组计划（Sc2.0）在构建全部16条合成染色体中的技术与概念进展，并展望新型合成染色体的未来潜力 | 系统总结了Sc2.0项目在构建真核生物首个全合成基因组中的里程碑式成就，并引入新型模块化合成染色体（neochromosomes）作为正交于天然基因组的工程平台，拓展了酵母工程的通用性和可编程性 | 未详细讨论合成染色体在长期稳定性或生物安全性方面的潜在挑战 | 回顾Sc2.0项目进展并展望合成酵母的下一个发展方向，强调从模型生物到工程化底盘的转变 | 酿酒酵母及其16条合成的染色体 | 合成生物学 | NA | 设计-构建-测试-学习（DBTL）循环, 基因组规模工程 | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae） | 模块化合成染色体（neochromosomes） | 工业生物技术, 医学, 农业 |
| 374 | 2026-05-20 |
Substrates reconfigure picosecond electric field fluctuations in dihydrofolate reductase
2026-May-19, Journal of biomolecular structure & dynamics
IF:2.7Q2
DOI:10.1080/07391102.2026.2672099
PMID:42153902
|
研究论文 | 本研究通过分子动力学模拟，探讨底物对二氢叶酸还原酶中皮秒电场波动的影响 | 揭示了底物结合显著改变催化剂中局部电场波动，影响能量势垒跨越事件的新机制 | NA | 理解酶催化中快速静电波动的作用，为酶抑制剂设计和工程酶开发提供基础 | 大肠杆菌二氢叶酸还原酶（DHFR）及其配体结合态和未结合态 | NA | NA | 分子动力学模拟（MD） | NA | 模拟数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | NA | 合成生物学, 蛋白质工程 |
| 375 | 2026-05-20 |
TALEs, TALENs, and TALE Base Editors: From Plant Pathology to Biotechnology
2026-May-18, Annual review of phytopathology
IF:9.1Q1
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综述 | 探讨TALE蛋白从植物病理学到生物技术的应用，重点关注TALEN和TALE碱基编辑器的基因组编辑作用 | 系统总结TALE蛋白的模块化DNA结合域特性及其在合成生物学中的最新进展，包括叶绿体和线粒体基因组编辑工具的开发 | 未详细讨论TALEN技术与其他基因编辑工具（如CRISPR）的比较及潜在脱靶效应 | 综述TALE蛋白在自然发生、基因组编辑和合成生物学中的当前角色和最新进展 | TALE蛋白及其衍生的TALEN和TALE碱基编辑器 | 合成生物学, 基因组编辑 | NA | TALE, TALEN, TALE碱基编辑器 | NA | NA | NA | TALEN, TALE碱基编辑器 | 植物细胞 | NA | 农业, 生物技术 |
| 376 | 2026-05-20 |
Translation efficiency covariation identifies conserved coordination patterns across cell types
2026-May, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-025-02718-5
PMID:40715459
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研究论文 | 通过翻译效率协变分析跨细胞类型的协调翻译模式 | 首次定义翻译效率协变概念并发现哺乳动物跨细胞类型的保守翻译协调模式 | 未明确说明局限性 | 探究翻译效率在跨细胞类型中的协调模式及其保守性 | 人类和小鼠的翻译效率协变模式 | 机器学习 | NA | 核糖体足迹测序 | NA | 核糖体足迹数据 | 人类117种和小鼠94种组织及细胞系的3819个核糖体足迹数据集 | NA | 人类和小鼠 | NA | 合成生物学, 生物技术 |
| 377 | 2026-05-20 |
Toward life with a 19-amino acid alphabet through generative artificial intelligence design
2026-Apr-30, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aeb5171
PMID:42060756
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research paper | 通过计算设计和合成生物学探索构建基于19种氨基酸的细胞，验证异亮氨酸的可替代性并生成稳定细胞 | 首次通过蛋白质语言模型和结构模型协同设计，系统性替换核糖体中所有382个异亮氨酸残基，创建了首个19种氨基酸的活细胞 | 未详细说明模型在非必需蛋白或复杂多细胞生物中的适用性，且细胞稳定性仅基于短期进化实验 | 探索生命在简化氨基酸字母表下的可行性，构建19种氨基酸的细胞 | 大肠杆菌中的必需蛋白质和核糖体 | machine learning、computational biology | NA | 计算机辅助设计、合成生物学 | 蛋白质语言模型、结构模型 | 蛋白质序列和结构数据 | 核糖体中382个异亮氨酸残基改造，涉及21个重新设计的亚基 | 合成生物学 | 大肠杆菌 | NA | 生物技术、基础生物学 |
| 378 | 2026-05-20 |
MOSAIC: A Highly Efficient, One-Step Recombineering Approach to Plasmid Editing and Diversification
2025-10-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00657
PMID:40471122
|
研究论文 | 建立一种高效的一步重组工程方法MOSAIC，用于质粒编辑和多样化 | 利用单链DNA退火蛋白CspRecT高效整合DNA寡核苷酸，实现高达90%的单靶点编辑效率，并在单次转化中生成覆盖四个靶区域的组合质粒文库，同时集成基于Nanopore测序的用户友好验证流程 | 未明确说明具体局限性，可能包括对寡核苷酸设计的依赖或某些质粒类型的适用性限制 | 开发一种简单、快速且资源高效的质粒编辑和文库构建方法 | 质粒的定向编辑和组合文库生成 | 合成生物学 | NA | 重组工程，Nanopore测序 | NA | 序列数据 | NA | CspRecT蛋白，重组工程 | 细菌（具体未指定） | 质粒编辑和组合文库构建系统 | 分子生物学，合成生物学 |
| 379 | 2026-05-20 |
Engineered Bacteria Convert a 3-Bit Binary Code to a 3-Bit Gray Code by Multicellular Artificial-Neural-Network-Type Architecture
2025-09-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00145
PMID:40333022
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研究论文 | 利用基因工程细菌构建单层人工神经网络，实现3位二进制码到3位格雷码的转换 | 首次使用基因工程细胞构建人工神经网络实现二进制码到格雷码的转换，扩展了神经形态计算在合成生物学中的应用能力 | 目前处于概念验证阶段，实际应用场景和规模尚需进一步探索 | 开发基于基因工程细胞的生物计算机技术与合成生物电路设计 | 基因工程改造的细菌种群（大肠杆菌） | 合成生物学 | NA | NA | 人工神经网络（ANN） | NA | 5个工程细菌种群 | NA | 大肠杆菌 | 单层人工神经网络（3位二进制到格雷码转换器） | 工业生物技术、计算机科学 |
| 380 | 2026-05-20 |
The Dawn of High-Throughput and Genome-Scale Kinetic Modeling: Recent Advances and Future Directions
2025-08-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00868
PMID:40262025
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综述 | 本文综述了高通量和全基因组规模动力学建模的最新进展与未来方向 | 整合机器学习与机械代谢模型、开发新型动力学参数数据库以及定制化参数化策略，推动了动力学建模领域的变革 | 未提及具体局限性，但历史上对详细参数化和大量计算资源的需求仍是挑战 | 促进系统生物学、合成生物学、代谢工程和医学研究在无前例规模和速度下取得进展 | 代谢过程的动力学模型及其在细胞过程表征中的应用 | 机器学习和系统生物学 | NA | 动力学建模、机器学习 | 机械代谢模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 系统生物学、合成生物学、代谢工程、医学研究 |