合成生物学相关文章
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当前共找到 4700 篇文献，本页显示第 361 - 380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2026-02-28 |
Synthetic Lipid Biology
2025-Feb-26, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00761
PMID:39805091
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综述 | 本文正式提出“合成脂质生物学”这一新兴领域，整合化学、生物学、物理学和工程学方法，以合成和操纵脂质及生物膜来理解其复杂性质与功能 | 首次将跨学科研究系统化为“合成脂质生物学”框架，强调通过构建与分析脂质及膜系统来深化理解，类比合成生物学的核心理念 | NA | 通过合成、编辑和检测脂质及生物膜，揭示其性质、行为和功能，以应对脂质生物学复杂性 | 脂质分子、生物膜及其与蛋白质的相互作用 | 合成生物学 | NA | 化学合成、化学酶法合成、光遗传学、蛋白质工程、生物正交化学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 362 | 2026-02-27 |
InsiliCoil: An Integrated Software Suite for Coiled Coil Design, Prediction, and Therapeutic Engineering
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00678
PMID:41370672
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研究论文 | 本文介绍了一个名为InsiliCoil的集成软件套件，用于卷曲螺旋的设计、预测和治疗性工程 | 将预测建模、选择性肽抑制剂发现和正交相互作用组设计统一到一个单一的可访问框架中，提供比基于结构的方法快几个数量级的通量 | NA | 开发一个用于控制螺旋介导的蛋白质-蛋白质相互作用的综合平台，以加速治疗发现和可编程生物系统的理性工程 | 卷曲螺旋（CCs）作为合成生物学中的模块化、可编程构建块以及治疗靶点 | 合成生物学 | NA | 预测建模、高通量筛选、计算设计 | NA | 蛋白质序列和结构数据 | NA | InsiliCoil软件套件 | NA | 正交卷曲螺旋网络，用于合成生物电路和生物材料 | 医学, 工业生物技术 |
| 363 | 2026-02-27 |
Multilayer Host Engineering of Saccharomyces cerevisiae to Enhance Cricket Paralysis Virus (CrPV) Internal Ribosome Entry Site Mediated Translation
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00744
PMID:41546634
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研究论文 | 本文通过多层宿主工程改造酿酒酵母，以增强蟋蟀麻痹病毒内部核糖体进入位点介导的翻译 | 提出了一种结合翻译起始、tRNA修饰和mRNA稳定性三个机制层面的宿主工程策略，显著提升CrPV IRES活性 | NA | 增强非典型翻译系统中的IRES活性，以扩展合成生物学中的RNA调控工具 | 酿酒酵母和蟋蟀麻痹病毒内部核糖体进入位点 | 合成生物学 | NA | 报告基因筛选、宿主工程改造 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | 内部核糖体进入位点介导的翻译系统 | 工业生物技术 |
| 364 | 2026-02-27 |
The Coli Toolkit (CTK): An Extension of the Modular Yeast Toolkit for Use in E. coli
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00489
PMID:41581077
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研究论文 | 本文介绍了Coli Toolkit (CTK)，一个基于Golden Gate的模块化克隆系统，适用于大肠杆菌，旨在加速遗传电路的组装 | CTK通过将启动子部分细分为启动子、绝缘核酶和核糖体结合位点，提供了更灵活的转录和翻译控制，并整合了Cello库的20个NOT门作为预组装基本部件 | NA | 开发一个用于大肠杆菌的模块化克隆系统，以优化遗传电路的设计-构建-测试-学习循环 | 遗传电路和DNA组装工具 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆 | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly | E. coli | 遗传电路，包括启动子、绝缘核酶、核糖体结合位点和NOT门 | 生物技术 |
| 365 | 2026-02-27 |
Slowpoke: An Automated Golden Gate Cloning Workflow for Opentrons OT-2 and Flex
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00629
PMID:41642882
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研究论文 | 本文介绍了一个名为Slowpoke的自动化Golden Gate克隆工作流程，专为Opentrons OT-2和Flex液体处理平台设计 | 开发了一个用户友好、灵活且开源的自动化Golden Gate克隆工作流程，并配有免费的图形用户界面，简化了协议生成过程 | 工作流程仍需用户干预菌落挑取和平板转移步骤 | 开发一个标准化、高通量且无错误的DNA组装自动化解决方案 | Golden Gate克隆工作流程的自动化 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆 | NA | NA | 使用MoClo酵母工具包和SubtiToolKit进行验证，涉及多个组装组合 | Golden Gate Assembly | 酵母, 枯草芽孢杆菌 | NA | 工业生物技术 |
| 366 | 2026-02-27 |
Engineering Basal Cognition: Minimal Genetic Circuits for Habituation, Sensitization, and Massed-Spaced Learning
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00766
PMID:41666326
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研究论文 | 本文采用合成生物学方法，探索如何利用最小遗传电路在单细胞系统中实现非关联性学习，包括习惯化、敏感化和集中-分散学习效应 | 通过设计基于理论模型和已知调控元件的合成电路，首次在单细胞水平模拟了习惯化、敏感化及集中-分散学习效应，为实验验证提供了平台 | 研究基于模拟设计，尚未进行实验验证，且电路可能受限于结构和动力学约束，与神经学习系统存在差异 | 探索基础认知功能的遗传实现机制，以理解单细胞生物的学习行为及其进化优势 | 单细胞系统和非神经生物中的学习行为，如原生生物和黏菌 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法，包括遗传电路设计和模拟 | NA | 模拟数据 | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 单细胞系统（如大肠杆菌或酵母） | 包含激活子、抑制子、荧光报告基因和群体感应分子的合成电路，用于实现习惯化、敏感化和集中-分散学习效应 | 工业生物技术，医学 |
| 367 | 2026-02-27 |
Synthesis of Plant-Inspired O-Acetylated Hemicellulose Structures in the Yeast Yarrowia lipolytica
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00595
PMID:41611228
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研究论文 | 本研究在解脂耶氏酵母中成功重建了植物来源的半纤维素（β-葡甘露聚糖和β-葡聚糖）的生物合成途径，并实现了其O-乙酰化修饰 | 首次在酵母系统中同时合成植物来源的半纤维素骨架结构及其O-乙酰化变体，创造了自然界不存在的结构更复杂的乙酰化变体 | 未明确说明产量、规模化生产可行性及与天然植物半纤维素在高级结构上的完全一致性 | 利用合成生物学方法在微生物工厂中生产具有特定理化性质的植物源半纤维素多糖 | 半纤维素多糖（β-葡甘露聚糖和β-葡聚糖）及其O-乙酰化衍生物 | 合成生物学 | NA | 糖基转移酶表达、寡糖质谱分析、组成分析、糖苷键分析 | NA | 质谱数据、化学分析数据 | NA | 基因表达（糖基转移酶、O-乙酰转移酶） | 解脂耶氏酵母 | 重建植物半纤维素生物合成途径（骨架合成与乙酰化修饰模块） | 生物材料、制药、工业生物技术 |
| 368 | 2026-02-27 |
Yeast Stress Response to Synthetic Constructs
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00715
PMID:41615018
|
综述 | 本文综述了工程化酵母中由异源构建体引发的应激反应，并提出了应激感知的设计原则以提高其生物技术应用中的稳健性和产量 | 提出了“应激组”概念以整合多种应激通路对合成构建体的响应，并系统总结了减轻细胞负担的多种策略及新兴方法 | NA | 理解合成构建体如何与酵母应激通路相互作用，并开发更稳健、高产的工程酵母系统 | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）作为合成生物学底盘生物 | 合成生物学 | NA | CRISPR、适应性实验室进化、数据驱动的菌株工程 | NA | NA | NA | CRISPR | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae） | 合成细胞器构建、动态调控、通路区室化 | 工业生物技术 |
| 369 | 2026-02-27 |
Synthetic Biology of Plants and Microbes for Agriculture, Environment, and Future Applications
2026-Jan-28, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00687
PMID:41609588
|
综述 | 本文综述了合成生物学在植物和微生物工程中的最新进展，旨在推动农业革命并拓展植物工程在制造、传感和修复等新领域的应用 | 提出将植物及其共生微生物视为整体系统进行工程化设计，并整合基因组构建工具、计算机辅助设计和人工智能等新技术 | NA | 探讨合成生物学如何通过先进基因工程技术驱动农业革命并拓展植物工程的新应用领域 | 植物及其共生微生物（真菌、细菌、古菌） | NA | NA | 基因组构建工具、计算机辅助设计、人工智能 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 植物、真菌、细菌、古菌 | 响应环境变化、改变形态或应对威胁的智能植物电路 | 农业, 环境, 制造业, 基础设施, 传感, 修复 |
| 370 | 2026-02-27 |
Advances and Future Perspectives of Synechocystis sp. as a Microbial Cell Factory for Biomanufacturing
2025-Nov, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70162
PMID:41311002
|
综述 | 本文综述了集胞藻作为微生物细胞工厂在生物制造中的最新进展、面临的挑战及未来研究方向 | 整合了生物信息学概述与合成生物学应用的最新进展，并提出了规模化、工业化及组学策略整合的未来方向 | NA | 推动蓝藻在工业生物技术中的应用，促进可持续、低碳、高效的生物生产系统发展 | 集胞藻 | 工业生物技术 | NA | 组学策略 | NA | NA | NA | 合成生物学设计 | 集胞藻 | NA | 工业生物技术 |
| 371 | 2026-02-27 |
Computation-driven redesign of an NRPS-like carboxylic acid reductase improves activity and selectivity
2024-11-29, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adp6775
PMID:39612335
|
研究论文 | 本文通过计算驱动重新设计非核糖体肽合成酶样羧酸还原酶的腺苷化结构域，以提高其催化活性和选择性 | 采用基于近似机制的几何标准和Rosetta能量评分，对CARs的“守门员”腺苷化结构域进行重新设计，实现了高达101倍的催化效率提升和86倍的底物特异性增强 | NA | 提高非核糖体肽合成酶样羧酸还原酶的催化效率和底物选择性 | 羧酸还原酶（CARs）的腺苷化结构域 | 合成生物学 | NA | 计算重新设计、Rosetta能量评分 | NA | NA | NA | Rosetta | NA | NA | 工业生物技术 |
| 372 | 2026-02-27 |
Data-Driven Design of Triple-Targeted Protein Nanoprobes for Multiplexed Imaging of Cancer Lymphatic Metastasis
2024-09, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202405877
PMID:38889909
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研究论文 | 本文介绍了一种通过数据驱动设计和合成生物学组装策略开发的三靶向蛋白质纳米探针，用于癌症淋巴转移的多重成像 | 利用机器学习生物信息学分析结合患者组织检查，识别出CXCR4、TfR1和VEGFR3三个靶点组合，并设计出能特异性结合所有三个靶点的铁蛋白纳米笼探针，实现了对高度异质性淋巴转移的多重成像 | NA | 开发用于癌症淋巴转移成像的靶向纳米探针 | 癌症淋巴转移的异质性靶点及成像 | 数字病理学 | 胃癌 | 机器学习生物信息学分析、合成生物学组装 | NA | 组织样本数据、成像数据 | 19个新鲜切除的人类胃癌标本及患者淋巴组织 | 合成生物学方法 | NA | 基于基因工程铁蛋白亚基自组装的纳米笼探针 | 医学 |
| 373 | 2026-02-26 |
Lactic Acid Bacteria Bacteriocins: Classification, Biosynthesis, Health Benefits, and Strategies for Enhanced Efficacy
2026-Feb-25, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c14047
PMID:41700423
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综述 | 本文综述了乳酸菌细菌素的分类、生物合成、健康益处及增强效能的策略 | 提供了更新的细菌素分类（I-III类），并分析了产量影响因素和增强效能的策略，如代谢工程和合成生物学 | 产量优化和临床转化方面仍存在挑战 | 综述乳酸菌细菌素的研究进展，以指导其治疗开发和规模化生产 | 乳酸菌细菌素 | NA | 感染和癌症 | NA | NA | NA | NA | 代谢工程, 合成生物学 | 乳酸菌 | NA | 食品, 生物医学 |
| 374 | 2026-02-26 |
A comprehensive ruminant microbial catalog (CRMC) reveals convergent selection for key vitamin-synthesizing pathways and genes across ruminants and human
2026-Feb-25, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag016
PMID:41738843
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研究论文 | 本研究基于反刍动物胃肠道宏基因组样本，构建了一个全面的反刍动物微生物基因组目录（CRMC），并系统揭示了维生素合成微生物的功能特征、生态角色及其在反刍动物与人类肠道中的趋同选择模式 | 构建了迄今为止最全面的反刍动物胃肠道微生物基因组目录（CRMC），并首次系统揭示了跨反刍动物宿主的维生素合成微生物在关键合成途径和基因节点上的趋同选择模式 | 研究主要基于宏基因组组装基因组（MAGs），可能无法完全覆盖低丰度或难培养的微生物类群 | 阐明反刍动物胃肠道维生素合成微生物的功能特征、生态角色及其跨宿主分布模式 | 反刍动物胃肠道微生物组，特别是维生素合成微生物 | 宏基因组学 | NA | 宏基因组测序 | NA | 宏基因组序列数据 | 2,325个宏基因组样本，来自8种反刍动物宿主 | NA | 反刍动物（8种） | NA | 农业，工业生物技术 |
| 375 | 2026-02-26 |
Precision Fermentation Processes for Producing Novel Foods and Its Sustainable Applications
2026-Feb, Journal of basic microbiology
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/jobm.70160
PMID:41735245
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综述 | 本文对精准发酵技术在可持续食品生产中的应用进行了系统综述，整合了微生物菌株设计、生物工艺工程、技术经济可行性、环境绩效和监管准备度等多个方面 | 提供了一个整合微生物菌株设计、生物工艺工程、技术经济可行性、环境绩效和监管准备度的统一框架，弥补了以往仅关注产品或特定生物的综述的不足 | 面临高资本和能源成本、放大效率低、下游处理复杂、消费者接受度以及监管不确定性等挑战 | 评估精准发酵技术在可持续食品生产中的应用、技术经济可行性和环境影响 | 精准发酵过程及其在食品生产中的应用 | NA | NA | 精准发酵、代谢途径工程 | NA | 文献数据 | 37项符合纳入标准的研究（包括实验室研究、工业案例研究、技术经济分析和生命周期评估） | 合成生物学 | 微生物宿主 | 代谢途径工程 | 食品, 工业生物技术 |
| 376 | 2026-02-26 |
High-throughput yeast engineering in biofoundries: towards autonomous and scalable synthetic biology
2026-Jan-05, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foag003
PMID:41591451
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综述 | 本文综述了生物铸造厂如何通过整合自动化、人工智能和标准化工作流程，推动高通量酵母工程向自主化和规模化方向发展 | 探讨了从DBTL（设计-构建-测试-学习）循环向自主优化的“自动驾驶实验室”和Design-Build-Deploy（设计-构建-部署）循环的转变趋势 | 仍存在协议可变性、AI工具整合不足以及国际标准、数据治理和伦理保障需要协调等关键障碍 | 推动酵母工程的高通量、自主化和规模化发展，以实现经济、可持续的大规模生物制造 | 酵母工程、生物铸造厂及其在菌株开发中的应用 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、表型筛选、预测建模 | 预测模型（AI驱动） | NA | NA | CRISPR-Cas9（提及基因组编辑，但未明确指定工具） | 酵母 | NA | 工业生物技术 |
| 377 | 2026-02-26 |
Structure and encapsulation of carbonic anhydrase within the α-carboxysome
2025-Nov-18, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2523723122
PMID:41223214
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研究论文 | 本研究解析了α-羧化体内部碳酸酐酶的结构及其封装机制 | 首次揭示了CsoSCA的六聚体三聚体结构，证明其封装不依赖锌离子和连接蛋白CsoS2，并阐明了其在羧化体内部连接Rubisco与外壳的桥梁作用 | 研究主要基于合成微型外壳和细菌模型，体内完整羧化体的动态组装过程仍需进一步验证 | 阐明α-羧化体中碳酸酐酶的结构特征及其在微区室内的封装机制 | 化能自养细菌Halothiobacillus neapolitanus的α-羧化体碳酸酐酶CsoSCA | 结构生物学 | NA | 分子结构解析、合成微型外壳技术 | NA | 结构数据、生化实验数据 | NA | 合成生物学技术 | Halothiobacillus neapolitanus（化能自养细菌） | 羧化体微区室封装系统（包含Rubisco和碳酸酐酶的半透性蛋白质外壳） | 合成生物学、生物技术 |
| 378 | 2026-02-26 |
Regulatory helix plays a key role in genetic ON-OFF switching for the 2'-deoxyguanosine-sensing mRNA element
2025-07, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110282
PMID:40412519
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研究论文 | 本文通过化学探测和荧光淬灭实验，揭示了2'-脱氧鸟苷感应核糖开关在转录过程中的动态调控机制 | 发现核糖开关并非简单的二元开关，而是通过关键中间态在RNA合成过程中精细调控下游基因转录 | 研究主要基于体外实验，需要进一步在体内验证调控机制 | 阐明2'-脱氧鸟苷感应核糖开关的转录调控机制 | 2'-脱氧鸟苷感应核糖开关及其转录中间体 | 合成生物学 | NA | 化学探测、荧光淬灭实验 | NA | 结构探测数据、荧光信号数据 | NA | NA | NA | 核糖开关调控元件 | 医学, 合成生物学 |
| 379 | 2026-02-26 |
Compliant DNA Origami Nanoactuators as Size-Selective Nanopores
2024-09, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202405104
PMID:39014922
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研究论文 | 本文介绍了一种可重构的DNA折纸纳米孔，其孔径可通过分子触发器调节，实现了尺寸选择性跨膜运输 | 结合DNA折纸纳米技术、机械启发设计和合成生物学，创建了具有可调孔径和可逆构象变化的纳米孔，克服了传统生物纳米孔孔径固定的限制 | NA | 开发一种可调节孔径的纳米孔技术，以扩展其在生物物理学和生物技术中的应用 | DNA折纸纳米孔（MechanoPore）及其在脂质体膜中的重构与功能 | 合成生物学 | NA | DNA折纸纳米技术、3D-DNA-PAINT超分辨率成像、染料流入测定、倒置乳液cDICE技术、共聚焦成像 | NA | 图像数据（超分辨率和共聚焦成像） | NA | DNA折纸 | 脂质体（人工膜系统） | 可重构纳米孔（MechanoPore），具有三个稳定状态和可调孔径的机械开关 | 药物递送, 生物分子分选, 传感, 合成生物学 |
| 380 | 2026-02-26 |
Synthetic biology: at the crossroads of genetic engineering and human therapeutics-a Keystone Symposia report
2021-12, Annals of the New York Academy of Sciences
IF:4.1Q1
DOI:10.1111/nyas.14710
PMID:34786712
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会议报告 | 本文总结了2021年5月3日至4日举行的Keystone eSymposium，探讨了合成生物学在细胞和基因疗法中的潜在应用 | 强调合成生物学在人类治疗中的临床应用，而非技术细节，并讨论了多种疗法（如T细胞、基因、病毒疗法和益生菌）的工程化改进 | NA | 探索合成生物学如何转化细胞和基因疗法以治疗多种疾病 | 真核和原核细胞，包括T细胞、基因疗法、病毒疗法和益生菌 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 真核细胞, 原核细胞 | 生物传感器, 逻辑门, 代谢途径 | 医学 |