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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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21 | 2025-05-09 |
Efficient Site-Directed Mutagenesis Mediated by Primer Pairs with 3'-Overhangs
2025-Feb, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.70104
PMID:39945594
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研究论文 | 提出了一种优化的定点诱变方案,利用具有3'端突出部分的引物对提高诱变效率和降低错误率 | 通过部分互补的引物对设计显著提高诱变效率,平均效率达到约50%,部分情况下接近100%的理想阈值 | 未明确说明该方法在不同基因长度或复杂结构区域的适用性 | 开发更高效可靠的定点诱变方法 | 质粒DNA | 分子生物学 | NA | 定点诱变技术 | NA | NA | 每次诱变反应仅需分析3个菌落 |
22 | 2025-05-09 |
The Establishment of Artificial RNA Cascade Circuits for Gene Regulation Based on Doxycycline-Induced Pre-mRNA Alternative Splicing
2025-Jan-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26031163
PMID:39940931
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研究论文 | 本研究开发了一种基于多西环素诱导的前mRNA选择性剪接的人工RNA级联电路,用于基因调控 | 通过改变开关中的适配体2碱基对,意外获得了具有完全相反调控功能的'开启开关'CTM和'关闭开关'C2ITetR>4A,并将其与L7Ae/k-turn模块整合,创建了内含子剪接的双开关RNA级联系统 | NA | 为哺乳动物合成生物学提供有价值的工具,实现基因表达的精确预测和动态调控 | 人工嵌合内含子模块、RNA核糖开关、TetR适配体 | 合成生物学 | NA | 前mRNA选择性剪接 | NA | NA | NA |
23 | 2025-05-09 |
Colored Proteins Act as Biocolorants in Escherichia coli
2025-Jan-21, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules30030432
PMID:39942539
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research paper | 该研究探讨了多种彩色蛋白质作为生物着色剂在大肠杆菌中的应用,特别关注了GfasPurple的稳定性和耐受性 | 研究发现GfasPurple在高温、乙醇、酸碱等恶劣条件下表现出优异的稳定性,并通过诱变创造了更多颜色的变体,扩展了色蛋白库 | 研究主要集中在大肠杆菌系统,未在其他生物系统中验证GfasPurple的应用效果 | 评估彩色蛋白质作为生物着色剂的性能和应用潜力 | 多种彩色蛋白质(包括荧光蛋白和色蛋白)及其在大肠杆菌中的表现 | 合成生物学 | NA | 吸收光谱分析、诱变技术 | NA | 光谱数据、视觉观察数据 | 多种彩色蛋白质(eGFP、sfGFP、mKate2、GfasPurple、AmilCP、AeBlue) |
24 | 2025-05-09 |
Challenges and limitations in using bacterial metabolites as immunomodulators
2025, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2025.1535394
PMID:39944722
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综述 | 探讨利用细菌代谢物作为免疫调节剂面临的挑战与限制 | 强调了个性化方法的重要性,并探讨了克服限制的潜在技术进步 | 细菌代谢物的生物利用度有限,存在脱靶效应,以及微生物组与代谢物之间复杂的相互作用 | 研究细菌代谢物作为免疫调节剂的临床应用潜力 | 细菌代谢物及其与免疫系统的相互作用 | 免疫学 | 免疫相关疾病 | 宏基因组学、代谢组学、合成生物学、靶向递送系统 | NA | NA | NA |
25 | 2025-05-09 |
Enhancing active ingredient biosynthesis in Chinese herbal medicine: biotechnological strategies and molecular mechanisms
2025, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.18914
PMID:39950047
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综述 | 本文综述了现代生物技术在增强中草药活性成分生物合成中的应用及其分子机制 | 整合了生物合成、分子调控、提取方法和合成生物学的多角度分析,提出了增强中草药活性成分生产的策略 | 未提及具体实验验证或案例研究,可能缺乏实际应用的详细指导 | 探索现代生物技术在中草药活性成分生物合成中的应用潜力 | 中草药的活性成分及其生物合成途径 | 生物技术 | NA | 代谢工程、合成生物学工具 | NA | NA | NA |
26 | 2025-05-09 |
Innovative applications and research advances of bacterial biosensors in medicine
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1507491
PMID:40336836
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综述 | 本文综述了细菌生物传感器在医学领域的应用及最新进展,并讨论了其研究和应用中存在的挑战与障碍 | 利用合成生物学和基因工程的突破性进展,定制具有卓越检测特性的细菌,为早期疾病诊断和治疗监测提供了强大的技术基础 | 细菌生物传感器在研究和应用中仍面临挑战与障碍 | 探讨细菌生物传感器在医学领域的应用及研究进展 | 细菌生物传感器 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | NA | NA |
27 | 2025-05-09 |
A meta-analysis of the gut microbiome in inflammatory bowel disease patients identifies disease-associated small molecules
2024-Feb-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.07.579278
PMID:38370680
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meta-analysis | 通过多队列分析肠道微生物组中的小分子生物合成基因簇(BGCs),研究了炎症性肠病(IBD)患者与健康对照之间的差异 | 发现了一组与IBD显著相关的梭菌衍生BGCs,并通过合成生物学方法鉴定出六种脂肪酸酰胺作为这些BGCs的产物 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本的验证可能不足 | 探索肠道微生物组中小分子在IBD发病机制中的作用 | 炎症性肠病(IBD)患者和健康对照的肠道微生物组 | 微生物组学 | 炎症性肠病 | 宏基因组测序、合成生物学 | NA | 宏基因组数据 | 5,306个肠道微生物组样本(来自2,033名IBD患者和833名健康对照) |
28 | 2025-05-09 |
Concepts of a synthetic minimal cell: Information molecules, metabolic pathways, and vesicle reproduction
2024, Biophysics and physicobiology
IF:1.6Q4
DOI:10.2142/biophysico.bppb-v21.0002
PMID:38803330
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review | 本文回顾了合成最小细胞系统的概念,包括信息分子、代谢途径和囊泡繁殖,并与生物细胞进行了比较 | 提出了合成最小细胞系统,展示了递归生长和分裂周期,避免了使用生物细胞的复杂分子机制 | NA | 探索生命系统如何从非生命分子组装中产生,以及支持这一过程的物理和化学原理 | 合成最小细胞系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
29 | 2025-05-09 |
A simeprevir-inducible molecular switch for the control of cell and gene therapies
2023-11-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43484-9
PMID:38012128
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research paper | 本文介绍了一种基于simeprevir的新型化学诱导二聚化(CID)模块,用于控制细胞和基因治疗中的生物过程 | 开发了一种基于已获批口服小分子simeprevir的新型CID模块,可用于控制基因表达和细胞凋亡,并在异种移植小鼠模型中展示了其诱导肿瘤细胞凋亡的能力 | 研究主要集中于体外和小鼠模型,尚未在人体中进行验证 | 开发可用于临床环境的新型分子开关系统 | 化学诱导二聚化(CID)模块及其在细胞和基因治疗中的应用 | 合成生物学 | 肿瘤 | 化学诱导二聚化技术 | 异种移植小鼠模型 | 实验数据 | 体外细胞实验和异种移植小鼠模型 |
30 | 2025-05-09 |
Digital switching in a biosensor circuit via programmable timing of gene availability
2014-Dec, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/nchembio.1680
PMID:25306443
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研究论文 | 本研究展示了通过编程控制基因可用性时间,利用位点特异性重组酶纠正多基因电路中的不良效应,显著提高了内源性microRNA比例传感器的性能 | 首次提出通过编程控制基因可用性时间来优化基因电路性能,显著提升了传感器的动态范围和特异性 | 研究仅针对microRNA传感器进行了验证,未在其他类型基因电路中测试 | 开发更稳健的合成生物学基因电路设计方法 | 基因电路和microRNA传感器 | 合成生物学 | NA | 位点特异性重组酶技术 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明样本数量,但进行了细胞类型分类实验 |
31 | 2025-05-08 |
Making Cells as a "Nirvana Phoenix": Precise Coupling of Precursors Prior to ROS Bursts for Intracellular Synthesis of Quantum Dots
2025-May-07, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c02861
PMID:40259718
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research paper | 该研究开发了一种在活细胞内精确合成近红外量子点(QDs)的方法,通过控制前体的耦合和反应条件,显著提高了细胞存活率和荧光强度 | 利用细胞适应性硒代胱氨酸((Cys-Se))作为前体,结合Ag-谷胱甘肽(AgSG),在细胞内合成近红外AgSe量子点,同时抑制细胞毒性物质和ROS的爆发 | 研究未涉及大规模生产或临床应用的具体细节 | 开发一种在活细胞内高效、低毒合成荧光量子点的方法,用于细胞标记和生物成像 | 活细胞内的无机纳米晶体合成 | 合成生物学 | NA | 细胞内量子点合成技术 | NA | 荧光成像数据 | NA |
32 | 2025-05-08 |
Mapping the Edges of Mass Spectral Prediction: Evaluation of Machine Learning EIMS Prediction for Xeno Amino Acids
2025-May-07, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c00286
PMID:40329886
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research paper | 评估NEIMS光谱预测算法在单取代α-氨基酸上的准确性,以解决依赖实验确定签名的问题 | 评估了NEIMS算法在预测超出训练数据范围的氨基酸光谱时的准确性,并指出其不准确性无法通过物理化学差异或氨基酸的衍生化状态来解释 | 预测光谱对于超出算法训练数据的氨基酸不准确,且这些不准确性无法通过物理化学差异或衍生化状态来解释 | 评估机器学习EIMS预测算法在单取代α-氨基酸上的准确性,以扩展未知生物分子的检测能力 | 单取代α-氨基酸 | machine learning | NA | mass spectrometry | NEIMS | mass spectral data | NA |
33 | 2025-05-08 |
Automated Construction of a Yeast-Based Multigene Library via Homologous Recombination in a Biofoundry Workflow
2025-May-07, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00812
PMID:40331904
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研究论文 | 本研究开发了一种基于体内同源重组的自动化一步多基因组装方法,用于构建表达可调库 | 开发了一种自动化一步多基因组装方法,优化了穿梭载体以提高组装效率,并实现了高通量基因组装 | NA | 突破传统克隆技术的限制,简化多基因组装过程,实现高效代谢途径构建 | 酵母基于的多基因库 | 合成生物学 | NA | 体内同源重组 | NA | NA | NA |
34 | 2025-05-08 |
Responses of natural plastisphere community and zooplankton to microplastic pollution: a review on novel remediation strategies
2025-May-07, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04334-y
PMID:40332619
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综述 | 本文综述了微塑料污染对自然塑球群落和浮游动物的影响,并探讨了基于自然群落水平的新型修复策略 | 重点讨论了塑球群落的适应性反应、浮游动物对微塑料的摄取和表面修饰,以及基于微生物降解和生态功能的生物修复策略 | 需要进一步研究开发先进的微塑料去除技术,并更深入了解微塑料对海洋生态系统的毒性影响 | 探讨微塑料污染的修复策略及其对环境的影响 | 自然塑球群落和浮游动物 | 环境科学 | NA | DNA元条形码 | NA | 文献数据 | NA |
35 | 2025-05-08 |
Functional investigation of Zur in metal ion homeostasis, motility and multiple stresses resistance in cyanobacteria Synechocystis sp. PCC 6803
2025-May-07, Stress biology
DOI:10.1007/s44154-025-00224-x
PMID:40332629
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研究论文 | 本研究通过转录组分析探讨了Zur在蓝藻Synechocystis sp. PCC 6803中金属离子稳态、运动性和多重胁迫抗性中的多功能作用 | 揭示了Zur不仅调控锌离子稳态,还影响铁平衡、细菌运动性及对盐、氧化和抗生素胁迫的抗性 | 研究仅基于Synechocystis sp. PCC 6803模型,未在其他蓝藻中进行验证 | 阐明Zur转录调控因子在蓝藻环境适应中的多重功能 | 蓝藻Synechocystis sp. PCC 6803的Δzur突变体和野生型菌株 | 合成生物学 | NA | 转录组分析 | NA | 基因表达数据 | Δzur突变体和野生型Synechocystis sp. PCC 6803菌株 |
36 | 2025-05-08 |
Coacervates as enzymatic microreactors
2025-May-06, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d4cs01203h
PMID:40084439
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综述 | 本文综述了基于凝聚层的酶微反应器的最新进展,重点讨论了凝聚层加速酶反应的机制及其在生物催化、合成生物学和纳米技术中的潜在应用 | 探讨了凝聚层作为酶微反应器的创新应用,包括增强底物和酶浓度、稳定中间产物以及提供分子拥挤环境 | 讨论了在凝聚层内监测反应的挑战,以及当前可用的技术如荧光技术、色谱和核磁共振光谱的局限性 | 研究凝聚层微反应器的设计及其在生物催化、合成生物学和纳米技术中的应用 | 合成聚合物、肽和核酸为基础的凝聚层系统 | 合成生物学 | NA | 荧光技术、色谱、NMR光谱 | NA | NA | NA |
37 | 2025-05-08 |
Cell-free synthetic biology for natural product biosynthesis and discovery
2025-May-06, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d4cs01198h
PMID:40104998
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综述 | 本文综述了无细胞合成生物学在天然产物生物合成和发现中的应用及其优势与局限 | 探讨了无细胞合成生物学在天然产物生物合成中的新兴应用,包括路径原型设计和新型代谢物生产 | 与全细胞或化学生产路线相比,无细胞合成生物学存在一定的局限性 | 研究无细胞合成生物学在天然产物生物合成和发现中的应用 | 天然产物及其生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 无细胞合成生物学 | NA | NA | NA |
38 | 2025-05-08 |
Protein-derived cofactors: chemical innovations expanding enzyme catalysis
2025-May-06, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d4cs00981a
PMID:40151987
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review | 本文综述了蛋白质衍生辅因子的生物合成、反应性、代谢调控及其在合成生物学和生物技术中的应用 | 揭示了蛋白质衍生辅因子的多样性和扩展功能,包括远程催化和氧化还原调控的分子开关等新范式 | 对辅因子组装机制的理解仍滞后于其发现速度 | 探讨蛋白质衍生辅因子的化学创新及其对酶催化的扩展作用 | 蛋白质衍生辅因子 | 生物化学 | NA | 非经典氨基酸位点特异性掺入、结构生物学、质谱、生物物理光谱 | NA | NA | NA |
39 | 2025-05-08 |
A Robust and Orthogonal Far-Red Light Sensor for Gene Expression Control in Escherichia coli
2025-May-06, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00044
PMID:40327816
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research paper | 该研究开发了一种基于RfpABC信号系统的正交远红光传感器,用于大肠杆菌中的基因表达控制 | 首次在大肠杆菌中建立了基于RfpABC信号系统的正交远红光传感器,动态范围超过230倍 | 研究仅限于大肠杆菌,未在其他细菌中验证 | 开发用于合成生物学应用的远红光传感器 | 大肠杆菌和蓝藻中的RfpABC信号系统 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | 基因表达数据 | NA |
40 | 2025-05-08 |
Engineering Bacillus Spores to Display Nicotine Oxidase: In Situ Specific and Sensitive Nicotine Detection
2025-May-06, ACS sensors
IF:8.2Q1
DOI:10.1021/acssensors.5c00275
PMID:40329593
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研究论文 | 本研究通过合成生物学和材料工程的结合,开发了一种新型的活体电化学生物传感器,用于高灵敏度和实时检测尼古丁 | 通过基因工程改造的NOX突变体(活性增强9.5倍且热稳定性提高)与FeSe@MHCS复合电极的结合,实现了超低检测限(0.25 nM)和优异的稳定性 | NA | 开发一种高灵敏度和实时检测尼古丁的生物传感器 | 尼古丁 | 生物传感器 | NA | 电化学阻抗谱(EIS)、差分脉冲伏安法(DPV) | NA | 电化学数据 | 血液和尿液样本 |