合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
21	2025-05-04	Optimal network sizes for most robust Turing patterns 2025-Jan-23, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-86854-7 PMID:39849094	research paper	该研究通过随机矩阵理论分析大型网络的雅可比矩阵，揭示了图灵模式在生物系统中出现的可能性及其最优网络规模	使用随机矩阵理论分析大型网络的统计特性，发现图灵模式的出现概率高于预期，并确定了最优网络规模	研究主要基于理论分析，未涉及具体生物实验验证	探讨图灵不稳定性在生物模式形成中的作用及其网络规模的影响	基因调控网络中的图灵模式	systems biology	NA	random matrix theory	NA	theoretical analysis	NA
22	2025-05-04	BAC-browser: the tool for synthetic biology 2025-Jan-23, BMC bioinformatics IF:2.9Q1 DOI:10.1186/s12859-025-06049-9 PMID:39849360	研究论文	介绍了一个名为BAC-browser v.2.1的图形界面程序，用于合成基因组学中的序列设计和DNA组装	开发了一个集成了多种工具的图形界面程序，使非生物信息学背景的研究者也能进行合成基因组学的任务	未提及程序的性能评估或与其他工具的对比	为合成基因组学领域提供易用的软件工具	合成基因组学中的序列设计和DNA组装	合成生物学	NA	DNA序列设计和组装	NA	核苷酸序列	NA
23	2025-05-04	Physiology-informed use of Cupriavidus necator in biomanufacturing: a review of advances and challenges 2025-Jan-22, Microbial cell factories IF:4.3Q1 DOI:10.1186/s12934-025-02643-x PMID:39844200	综述	本文综述了在生物制造中利用Cupriavidus necator的生理学进展与挑战	讨论了C. necator作为生物制造底盘的最新进展，特别是在利用二氧化碳和氢气或甲酸盐作为碳和能源来源方面的应用	现有工具和应用常因未充分考虑C. necator独特的生理和代谢特征而受限	探讨如何更好地理解和利用C. necator的生理机制以优化其在生物制造中的应用	Cupriavidus necator细菌及其在生物制造中的应用	生物制造	NA	合成生物学工具和建模	NA	NA	NA
24	2025-05-04	Development of a Komagataella phaffii cell factory for sustainable production of ( +)-valencene 2025-Jan-21, Microbial cell factories IF:4.3Q1 DOI:10.1186/s12934-025-02649-5 PMID:39838465	研究论文	本研究开发了一种利用Komagataella phaffii细胞工厂可持续生产(+)-valencene的方法	首次在K. phaffii中通过CRISPR/Cas9系统引入(+)-valencene合成酶，并通过多种优化策略显著提高了产量	研究仅在摇瓶水平进行验证，尚未进行大规模发酵生产测试	开发可持续生产(+)-valencene的微生物细胞工厂	Komagataella phaffii微生物细胞	合成生物学	NA	CRISPR/Cas9基因编辑技术	NA	NA	NA
25	2025-05-04	Recent trends and advances in chloroplast engineering and transformation methods 2025, Frontiers in plant science IF:4.1Q1 DOI:10.3389/fpls.2025.1526578 PMID:40313723	综述	本文综述了叶绿体工程和转化方法的最新趋势和进展	讨论了合成生物学在叶绿体工程中的应用以及现代转化载体的构建要素	该技术目前主要局限于学术实验室的模式物种，尚未商业化	提高作物产量、营养品质、抗逆性以及工业酶和治疗蛋白的生产	叶绿体基因组和转基因植物	合成生物学	NA	叶绿体转化技术	NA	NA	NA
26	2025-05-04	Enhancing the physiological characteristics of chimeric antigen receptor natural killer cells by synthetic biology 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1592121 PMID:40313937	review	探讨合成生物学在增强嵌合抗原受体自然杀伤细胞（CAR-NK）生理特性方面的最新进展	通过合成生物学工具包与NK细胞的协同作用，为开发下一代CAR-NK疗法提供路线图	临床转化仍受限于在免疫抑制性肿瘤微环境中的持久性和功能耗竭问题	提升CAR-NK细胞的生理特性以应对实体瘤挑战	嵌合抗原受体自然杀伤细胞（CAR-NK）	合成生物学	实体瘤	合成生物学工具包	NA	NA	NA
27	2025-05-03	Machine learning reveals novel compound for the improved production of chitooligosaccharides in Escherichia coli 2025-May-25, New biotechnology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.nbt.2025.01.005 PMID:39827984	研究论文	利用机器学习模型和特征重要性分析改进大肠杆菌中壳寡糖的生产	通过机器学习模型和特征重要性分析发现铁元素可以显著提高壳寡糖的生产效率	工程步骤可能无法带来足够的改进，且代谢反应中的瓶颈可能仍被隐藏	提高壳寡糖的生产效率和预测性	大肠杆菌中的壳寡糖生产途径	合成生物学	NA	机器学习	NA	代谢数据	大肠杆菌工程转录调节因子库
28	2025-05-03	Biotechnological approaches for the production of neuroactive huperzine A 2025-Apr-29, Journal of biotechnology IF:4.1Q2 DOI:10.1016/j.jbiotec.2025.04.020 PMID:40311807	综述	本文综述了石杉碱甲（HupA）的神经保护特性及其在治疗神经退行性疾病中的潜力，并探讨了提高HupA产量的生物技术策略	强调了通过生物技术手段（如化学合成、微生物发酵、植物组织培养和合成生物学）提高HupA产量的创新方法，并讨论了关键生物合成中间体和酶的作用	目前对HupA生物合成的知识仍存在空白，需要进一步研究以开发经济高效、可持续的生产方法	探讨HupA在神经退行性疾病治疗中的潜力及其生物技术生产方法	石杉碱甲（HupA）及其在神经退行性疾病中的应用	生物技术	阿尔茨海默病、帕金森病、亨廷顿病、多发性硬化症、癫痫、重症肌无力	化学合成、微生物发酵、植物组织培养、合成生物学	NA	NA	NA
29	2025-05-03	Enhancing mixed-species microalgal biofilms for wastewater treatment: Design, construction, evaluation and optimisation 2025-Apr-28, Bioresource technology IF:9.7Q1 DOI:10.1016/j.biortech.2025.132600 PMID:40306338	review	本文详细总结了混合物种生物膜（包括藻类和细菌）的设计、构建、评估和优化（DCEO），并讨论了它们在工业和农业废水及新污染物处理中的应用	提出了使用DCEO方法来增强混合物种生物膜用于废水处理的新视角	讨论了混合物种微藻生物膜面临的问题及解决方案，但未具体说明实验验证的局限性	增强混合物种微藻生物膜在废水处理中的应用	混合物种生物膜（包括藻类和细菌）	合成生物学	NA	三维生物打印	NA	NA	NA
30	2025-05-03	Engineering strategies for producing medium-long chain dicarboxylic acids in oleaginous yeasts 2025-Apr-26, Bioresource technology IF:9.7Q1 DOI:10.1016/j.biortech.2025.132593 PMID:40294756	review	本文综述了在产油酵母中生产中等长度链二羧酸（DCAs）的工程策略	系统总结了提高DCAs产量的多种工程策略，包括启动子、酶、途径、细胞、发酵和下游工程	讨论了当前DCAs生物合成领域的挑战和发展趋势，但未提出具体解决方案	探索利用产油酵母生物合成高附加值DCAs的工程策略	中等长度链二羧酸（DCAs, C ≥ 6）	合成生物学	NA	生物合成	NA	NA	NA
31	2025-05-03	Addressing semantic ambiguity in biotechnology: Proposals from the European research infrastructure IBISBA 2025-Apr-24, New biotechnology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.nbt.2025.04.010 PMID:40280273	讨论论文	本文探讨了生物技术领域的语义模糊问题，并提出了统一核心术语定义的建议	分析了生物技术领域术语定义的混乱现状，并提出了术语标准化的必要性	仅提出了问题而未提供具体的术语定义解决方案	促进生物技术领域术语定义的标准化，以支持有效的政策制定和科学传播	生物技术领域的核心术语（如biotechnology, biomanufacturing等）	生物技术	NA	NA	NA	文本	NA
32	2025-05-03	Paving the way for bacteria-based drug delivery: biohybrid microrobots emerging from microrobotics and synthetic biology 2025-Apr-16, Advanced drug delivery reviews IF:15.2Q1 DOI:10.1016/j.addr.2025.115577 PMID:40250568	综述	本文探讨了微机器人学和合成生物学的融合如何促进生物混合细菌微机器人的发展，用于药物递送	结合微机器人学和合成生物学的优势，开发出具有外部控制模式的生物混合细菌微机器人，提高了靶向治疗的精确性和有效性	需要解决生物与合成组件之间的兼容性、规模化制造过程以及针对活体治疗剂的监管路径等关键挑战	探索微机器人学和合成生物学在药物递送领域的创新解决方案	细菌作为治疗系统的工程化应用	合成生物学	NA	光、超声波和磁场等外部控制模式	NA	NA	NA
33	2025-05-03	Elucidation and de novo reconstitution of glyceollin biosynthesis 2025-Apr-10, Molecular plant IF:17.1Q1 DOI:10.1016/j.molp.2025.04.003 PMID:40211535	研究论文	本研究揭示了glyceollins的完整生物合成途径，并通过合成生物学和代谢工程实现了在面包酵母中从简单碳源生产glyceollins	发现了glyceollins生物合成途径中未表征的基因，特别是编码还原酶和五个P450酶的基因，实现了在微生物宿主中的可持续生产	未提及具体产量或生产效率，可能在实际应用中存在优化空间	阐明glyceollins的生物合成途径并实现其可持续生产	glyceollins及其生物合成途径	合成生物学	NA	瞬时表达、体外酶表征、酵母喂养研究	NA	NA	NA
34	2025-05-03	Creating a Halotolerant Degrader for Efficient Mineralization of p-Nitrophenol-Substituted Organophosphorus Pesticides in High-Saline Wastewater 2025-Apr, Biotechnology and bioengineering IF:3.5Q2 DOI:10.1002/bit.28923 PMID:39821562	研究论文	本研究通过合成生物学方法创建了一种耐盐降解菌J9U-MP，用于高效矿化高盐废水中的对硝基酚取代有机磷农药	首次将包含七个基因的异源生物降解途径与耐盐底盘菌Halomonas cupida J9结合，创建了能在高盐和低氧环境下高效降解有机磷农药的工程菌J9U-MP	研究仅针对特定类型的有机磷农药（对硝基酚取代的有机磷农药）进行测试，未涉及其他类型污染物	开发能在高盐废水中高效降解有机磷农药的生物修复技术	对硝基酚取代的有机磷农药（如甲基对硫磷）及其降解中间产物	合成生物学	NA	基因工程、RT-PCR、气相色谱分析、稳定同位素分析	NA	生物化学数据	工程菌J9U-MP在含60g/L NaCl的废水中对50mg/L甲基对硫磷及其降解产物的降解实验
35	2025-05-03	Next-generation metabolic models informed by biomolecular simulations 2025-Apr, Current opinion in biotechnology IF:7.1Q1 DOI:10.1016/j.copbio.2025.103259 PMID:39827498	research paper	该文章探讨了如何将生物分子模拟与代谢模型相结合，以推动结构引导的合成生物学应用	提出了将生物分子模拟和机器学习预测整合到代谢模型中的新方法，以优化和理解代谢途径	尚未具体说明生物分子模拟与代谢模型整合的实际应用效果和具体案例	优化和理解代谢途径，以改善蛋白质和小分子产品的生物生产	从微生物到人类的细胞代谢	合成生物学	NA	生物分子模拟, 机器学习	flux balance analysis, dynamic, kinetic delineations	代谢网络数据	NA
36	2025-05-03	Advances in designed bionanomolecular assemblies for biotechnological and biomedical applications 2025-Apr, Current opinion in biotechnology IF:7.1Q1 DOI:10.1016/j.copbio.2024.103256 PMID:39827499	综述	本文综述了蛋白质工程在生物纳米分子组装设计方面的最新进展及其在生物技术和生物医学中的应用	结合AI工具（如AlphaFold、RFDiffusion和ProteinMPNN）显著提高了从头设计的可扩展性和成功率	NA	探讨蛋白质工程在设计和应用生物纳米分子组装方面的潜力	有限组装（如纳米笼和基于卷曲螺旋的结构）和扩展组装（如细丝和2D/3D晶格）	合成生物学、材料科学、生物技术、生物医学	NA	蛋白质工程、AI工具（AlphaFold、RFDiffusion、ProteinMPNN）	NA	NA	NA
37	2025-05-03	Using synthetic biology to express nitrogenase biosynthesis pathway in rice and to overcome barriers of nitrogenase instability in plant cytosol 2025-Apr, Trends in biotechnology IF:14.3Q1 DOI:10.1016/j.tibtech.2024.12.002 PMID:39818476	research paper	该研究通过合成生物学方法将固氮酶生物合成途径引入水稻，以克服植物细胞质中固氮酶不稳定的障碍	成功将包含13个基因的固氮酶生物合成途径引入水稻，并发现NifH-S18是导致蛋白降解的关键残基，获得了具有Fe蛋白活性且抵抗植物内切蛋白酶切割的NifH变体	NifH在水稻细胞质中仍不稳定，需要进一步优化以提高其稳定性	通过工程化方法实现谷物中的固氮作用，减少化学氮肥的使用	水稻	合成生物学	NA	多基因载体转化、性杂交、基因组测序分析	NA	基因组数据、蛋白质数据	转基因水稻品系L12-13和L8-17
38	2025-05-03	Designing with Printed Responsive Biomaterials: A Review 2025-Apr, 3D printing and additive manufacturing IF:2.3Q3 DOI:10.1089/3dp.2024.0004 PMID:40308656	review	本文综述了跨学科领域中用于设计响应性生物材料的增材制造策略，并展望了如何将印刷响应性生物材料（PRBs）融入日常物品和建筑中以增强环境和人类健康	探讨了增材制造在生物材料科学、生物材料制造、合成生物学、生物医学工程、生物设计和活体建筑中的最新进展，展示了多感官互动的日常产品和建筑环境的新时代	NA	探索如何利用增材制造技术设计和集成响应性生物材料，以提升环境和人类健康	响应性生物材料及其在日常生活和建筑中的应用	生物材料科学	NA	增材制造（AM）	NA	NA	NA
39	2025-05-03	Artificial intelligence driven innovations in biochemistry: A review of emerging research frontiers 2025-Mar-07, Biomolecules & biomedicine DOI:10.17305/bb.2024.11537 PMID:39819459	综述	本文综述了人工智能在生物化学领域的应用及其对研究能力的提升	探讨了人工智能在生物化学中的当前及潜在应用，特别是在数据分析、分子建模、酶工程和代谢途径研究方面	面临数据质量、模型可解释性和伦理问题等挑战	评估人工智能在生物化学领域的应用及其未来潜力	生物化学研究中的复杂数据集、分子相互作用、药物发现等	生物化学	NA	机器学习算法、自然语言处理、基于AI的分子建模	AlphaFold	复杂数据集	NA
40	2025-05-03	Mechanisms and applications of bacterial luciferase and its auxiliary enzymes 2025-Mar, Archives of biochemistry and biophysics IF:3.8Q1 DOI:10.1016/j.abb.2025.110307 PMID:39824239	review	本文综述了细菌荧光素酶(LuxAB)及其辅助酶的机制和应用	最近的研究阐明了C4a-氢过氧黄素形成的机制，并确定了关键催化残基如His44，这些发现有助于理解光生成过程中重要的黄素中间体的产生	仍存在一些挑战性问题，如实现红移发射、优化信号强度以及确定与发光物种生成相关的机制	深入了解LuxAB反应的机制，并探索其在生物技术和生物医学领域的应用	细菌荧光素酶(LuxAB)及其辅助酶	合成生物学	NA	蛋白工程、合成生物学	NA	NA	NA