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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-03-08 |
From prebiotics to engineered microbes: microbe-inspired treatments for atopic dermatitis
2026-02-18, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljaf451
PMID:41231731
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综述 | 本文综述了针对特应性皮炎(AD)的皮肤微生物组靶向治疗方法,包括微生物移植、益生元、益生菌和后生元,并展望了利用合成生物学工程化皮肤细菌作为下一代益生菌的潜力 | 提出了利用合成生物学工程化皮肤微生物作为活体生物治疗产品的创新视角,以按需产生AD治疗药物 | NA | 探讨通过调节皮肤微生物组来减少AD感染和炎症的治疗策略 | 特应性皮炎(AD)及其相关的皮肤微生物组,特别是金黄色葡萄球菌 | NA | 特应性皮炎 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 皮肤微生物组中的细菌 | 能够感知皮肤信号(如免疫信号)和环境因素,并按需产生AD治疗药物的合成生物电路 | 医学 |
| 22 | 2026-03-08 |
Microbial medicines: Unlocking the therapeutic potential of the microbiome in cancer treatment
2026-Feb-12, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2026.114720
PMID:41690480
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综述 | 本文综述了工程化微生物作为治疗剂在癌症治疗中的应用,特别是通过检测疾病标志物和精准递送治疗载荷来靶向肿瘤微环境 | 利用基因工程和合成生物学技术开发工程化微生物,作为靶向癌症治疗的新兴方法,强调其在胰腺癌、乳腺癌、肺癌和结直肠癌中的治疗潜力 | 存在个体间变异性、安全性问题和监管障碍等挑战 | 评估微生物作为治疗剂在癌症治疗中的应用潜力,并探索未来研究方向 | 工程化微生物及其在癌症治疗中的作用机制 | NA | 胰腺癌, 乳腺癌, 肺癌, 结直肠癌 | 基因工程, 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 医学 |
| 23 | 2026-03-08 |
Strategies for Metabolic Engineering of Escherichia coli for β-Carotene Biosynthesis
2026-Feb-10, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules31040611
PMID:41752388
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综述 | 本文总结了在大肠杆菌中通过代谢工程策略生产β-胡萝卜素的方法 | 系统综述了在大肠杆菌中生产β-胡萝卜素的多种代谢工程策略,包括内源MEP途径调控、杂合MVA途径引入、中心碳代谢调控、细胞膜修饰及发酵工艺优化,并强调了高效生产β-胡萝卜素作为多种类胡萝卜素及脱辅基类胡萝卜素合成枢纽的重要性 | NA | 为设计高效的β-胡萝卜素生产菌株提供理论见解,并为有价值的类胡萝卜素及脱辅基类胡萝卜素的可持续生产奠定基础 | 大肠杆菌(Escherichia coli) | NA | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌(Escherichia coli) | β-胡萝卜素生物合成途径,包括内源MEP途径、引入的杂合MVA途径 | 食品、制药、化妆品 |
| 24 | 2026-03-08 |
Beyond CRISPR: next-gen precision engineering of CAR-NK cells for enhanced persistence, trafficking, and tumor eradication
2026-Feb-05, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-026-04219-0
PMID:41645252
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综述 | 本文综述了超越传统CRISPR的下一代精准工程技术,以增强CAR-NK细胞的持久性、迁移能力和肿瘤清除效果 | 提出整合碱基编辑、表观遗传重编程、靶向转座子系统及合成生物学回路,以协同克服CAR-NK细胞临床应用的“CRISPR天花板”限制 | NA | 探索提升CAR-NK细胞疗法安全性与疗效的下一代精准工程工具 | 嵌合抗原受体自然杀伤细胞 | 合成生物学 | 肿瘤 | 碱基编辑、表观遗传重编程、靶向转座子系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 碱基编辑器, 先导编辑器, CRISPR相关转座酶 | 自然杀伤细胞 | 逻辑门控靶向、合成/表观遗传回路、双特异性衔接器 | 医学 |
| 25 | 2026-03-08 |
The cell biologist's guide to detecting and modulating membrane phospholipids
2026-Feb-02, The Journal of cell biology
IF:7.4Q1
DOI:10.1083/jcb.202508058
PMID:41481227
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综述 | 本文为细胞生物学家提供了检测和调控膜磷脂的实用工具指南,旨在将脂质生物学融入主流细胞生物学实验 | 系统性地将脂质生物学工具整合到分子细胞生物学家熟悉的实验框架中,包括荧光成像、药理学调控、合成生物学平台和光遗传学系统 | 部分方法仍存在技术难度,且作为综述文章未提出原始实验数据 | 为细胞生物学家提供检测和调控膜磷脂的实用工具与方法 | 细胞膜磷脂 | 细胞生物学 | NA | 免疫荧光、活细胞成像、药理学抑制、合成生物学平台、光遗传学系统 | NA | NA | NA | 合成生物学平台、光遗传学系统 | NA | 可诱导脂质生成或降解的合成生物学平台 | 基础生物学研究 |
| 26 | 2026-03-08 |
Engineering plasmids with synthetic origins of replication
2026-Feb-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68907-1
PMID:41629321
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研究论文 | 本文通过重构天然pMB1复制起点,开发了具有可定制拷贝数和合成RNA调节器的质粒,实现了独立复制控制和环境信号的多重报告 | 创建了合成复制起点(SynORI),允许通过调节重构组件实现质粒拷贝数的定制化,并利用合成RNA调节器实现兼容复制起点的独立控制 | NA | 开发具有可调复制机制的合成质粒,以克服天然质粒在可调性、兼容性和模块性方面的限制 | 质粒的复制起点和合成RNA调节器 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | E. coli | 合成复制起点(SynORI),包括可调拷贝数组件和合成RNA调节器,用于实现逻辑门和生物传感器功能 | 工业生物技术 |
| 27 | 2026-03-08 |
Harnessing synthetic biology for energy-efficient bioinspired electronics: applications for logarithmic data converters
2026-Feb-02, Communications engineering
DOI:10.1038/s44172-026-00589-5
PMID:41629453
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研究论文 | 本文提出了一种将合成基因电路映射到仿生电子架构的计算框架,并开发了一种基于对数编码的低功耗对数模数转换器 | 利用合成基因电路作为高效计算模型,为合成生物学与仿生电子设计的融合提供了平台,实现了对数编码在空间资源效率上的最大化 | NA | 探索合成生物学在能源高效仿生电子学中的应用,特别是用于对数数据转换器 | 合成基因电路与仿生电子架构 | 合成生物学 | NA | 合成基因电路设计 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成基因电路作为高效计算模型 | 能源, 电子 |
| 28 | 2026-03-08 |
Structure, Mutation, Functional Domain Roles and Medical Implications of Glycerol Kinase
2026-Feb, The protein journal
DOI:10.1007/s10930-025-10316-2
PMID:41537922
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综述 | 本文综述了甘油激酶(GK)的结构、突变、功能域作用及其在甘油代谢、能量生产和疾病中的医学意义,并探讨了GK抑制剂的研究现状与开发策略 | 系统整合了GK从基因到翻译后修饰的调控机制,并强调了其在合成生物学和肿瘤发展中的新兴研究领域,同时分析了GK作为疾病靶点的抑制剂开发挑战与策略 | 作为综述文章,未提供原始实验数据,主要基于现有文献总结,可能受限于当前研究进展的覆盖范围 | 探讨GK在代谢途径中的关键作用及其与疾病的关联,并评估GK抑制剂作为治疗靶点的潜力 | 甘油激酶(GK)及其在细胞代谢和疾病中的功能 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 29 | 2026-03-08 |
Evolutionary repurposing of a metabolic thiolase complex enables antibiotic biosynthesis
2026-Jan-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68910-6
PMID:41617701
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研究论文 | 本研究报道了一种来自口腔链球菌的三组分酶复合物,它通过不常见的Friedel-Crafts C-乙酰化反应完成了抗生素reutericyclin A的生物合成 | 揭示了硫解酶复合物通过关键催化残基重编程实现功能新生的罕见进化案例,为理解酶进化轨迹提供了新视角 | 未明确说明该复合物在其他链球菌物种中的分布及工程化应用的实验验证程度 | 探究初级代谢酶如何进化获得次级代谢专化功能 | 口腔链球菌来源的三组分硫解酶复合物(SmaATase) | 合成生物学 | NA | 冷冻电镜、生化表征、分子建模、进化分析 | NA | 结构数据、生化数据、序列数据 | NA | NA | 口腔链球菌(Streptococcus macacae) | NA | 合成生物学 |
| 30 | 2026-03-08 |
PIONEER: A periplasmic display platform for synthetic biology-based screening of genetically encoded protein regulators
2026-01, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110967
PMID:41274507
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研究论文 | 本文介绍了PIONEER平台,一种用于合成生物学中遗传编码蛋白调节剂筛选的酵母周质展示系统 | 通过优化分泌信号和展示支架,实现稳定配体保留和稳健自分泌信号,首次实现基于信号而非仅结合的功能优先筛选 | 尽管已应用于G蛋白偶联受体,但平台可适应更广泛的膜蛋白和可溶性蛋白靶标,具体扩展性未在文中详细验证 | 开发一个模块化平台,用于筛选和研究遗传编码的蛋白调节剂,以直接探究膜蛋白功能 | 肽、蛋白质和纳米抗体,针对人类G蛋白偶联受体等膜蛋白 | 合成生物学 | NA | 酵母周质展示技术 | NA | 遗传序列和蛋白质结构数据 | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 酿酒酵母 | 自分泌信号系统,用于配体活性和纳米抗体调节剂分类 | 医学, 工业生物技术 |
| 31 | 2026-03-08 |
Integrating synthetic biology to understand and engineer the heart, lung, blood, and sleep systems
2025-Dec-17, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101446
PMID:41412113
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综述 | 本文综述了合成生物学在心脏、肺、血液和睡眠系统中的整合应用,以理解和工程化这些系统 | 将合成生物学从微生物扩展到人类系统,通过基因组工程、动态基因电路和高维生物传感器实现基因表达、细胞命运和组织组织的精确控制,并整合组学数据与AI引导的电路设计 | 存在递送、转基因稳定性和生理相关模型中稳健时空控制等关键挑战 | 工程化细胞和组织,使其在动态多器官环境中可靠功能 | 心脏、肺、血液和睡眠系统 | 合成生物学 | NA | 基因组工程、动态基因电路、高维生物传感器、组学数据、AI引导电路设计 | 系统级模型 | 组学数据 | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 人类细胞、组织 | 可调转录调节器、合成组织器、反馈电路 | 医学、药物开发、基因治疗 |
| 32 | 2026-03-07 |
Recent advances in computer-aided engineering of microbial synthesis and nutritional functions of fucosylated oligosaccharides
2026 May-Jun, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108849
PMID:41740692
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综述 | 本文综述了岩藻糖基化寡糖的微生物合成和计算机辅助工程的最新进展,重点关注其在婴儿健康中的营养功能 | 结合生物信息学方法与合成生物学策略,实现岩藻糖基化寡糖的精确和可扩展生产 | NA | 提高岩藻糖基化寡糖的微生物合成效率,促进其工业化应用 | 岩藻糖基化寡糖 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、代谢工程、生物信息学、虚拟筛选 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | E. coli, S. cerevisiae | 代谢途径、生物传感器 | 医药、食品 |
| 33 | 2026-03-07 |
Assembling a True "Olympic Gel" From over 16 000 Combinatorial DNA Rings
2026-Mar-06, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202520549
PMID:41789447
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研究论文 | 本研究成功组装了一种由超过16000种不同DNA环构成的真正“奥林匹克凝胶”,并验证了其独特的溶胀行为和弹性响应 | 首次通过酶激活独特序列域的方法,成功避免了非预期的交联和聚合,实现了由大规模组合DNA环库组装真正的奥林匹克凝胶 | NA | 研究网络拓扑结构对宏观材料性质的影响,并探索其作为生物和仿生系统中遗传信息载体的功能 | 由超过16000种不同DNA环组成的奥林匹克凝胶材料 | DNA纳米技术 | NA | 下一代测序、振荡流变学、大规模计算模拟、原子力显微镜、低温电子显微镜 | NA | DNA序列数据、力学性能数据、结构图像数据 | 超过16000种不同的DNA环分子 | NA | NA | NA | 材料、工业生物技术 |
| 34 | 2026-03-07 |
Repositioning the Leader Peptide in Graspetide Biosynthesis
2026-Mar-06, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c21135
PMID:41789461
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研究论文 | 本研究通过重新定位前导肽序列在graspetide生物合成中的位置,探索了合成生物学中组合酶法生成新型肽类产物的策略 | 首次通过将前导肽序列从N端重新定位至C端,实现了对graspetide合成酶ThfB底物选择性的保留,并成功构建了具有双重前导序列(N端和C端)的嵌合RiPP产物 | 前导肽重新定位后酶修饰速率降低了约2倍,可能影响整体合成效率 | 开发合成生物学策略以扩展核糖体合成和翻译后修饰肽(RiPPs)的结构多样性 | fuscimiditide前体肽及其graspetide合成酶ThfB | 合成生物学 | NA | 前导肽工程、酶催化环化、嵌合肽合成 | NA | 生物化学数据 | NA | 前导肽序列重定位 | NA | 双前导序列(N端和C端)指导的嵌合RiPP生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 35 | 2026-03-07 |
Design-driven optimization of low-cost reagent formulations for reproducible and high-yielding cell-free gene expression
2026-Mar-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69605-8
PMID:41786720
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研究论文 | 本文通过多维度确定性筛选设计,优化了无细胞基因表达系统的试剂配方,以降低成本、提高重现性和产量 | 开发了一种基于12种组分的简单、可重现的无细胞试剂配方,实现了高达95%的成本降低,并能从氮碱基和核糖生产核苷三磷酸 | NA | 优化无细胞基因表达系统的试剂配方,以降低成本和复杂性,提高蛋白质生产的重现性和产量 | 无细胞基因表达系统及其试剂配方 | 合成生物学 | NA | 无细胞基因表达 | NA | 实验数据 | 1,231种不同的试剂配方 | NA | NA | NA | 生物技术、蛋白质制造 |
| 36 | 2026-03-07 |
Recruiting orthogonal biological systems for engineering microorganisms
2026-Mar-04, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.12.023
PMID:41786536
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综述 | 本文综述了微生物合成生物学中正交策略的最新进展与应用,包括正交遗传系统、代谢途径、能量系统和调控系统的构建 | 总结了正交策略在微生物合成生物学中的创新应用,以解决工程过程对自然代谢的干扰问题 | NA | 探讨正交策略在微生物合成生物学中的应用,以增强工程微生物的功能和可预测性 | 微生物细胞及其正交工程系统 | 合成生物学 | NA | 正交工程策略 | NA | NA | NA | NA | 微生物细胞 | 正交遗传系统、代谢途径、能量系统、调控系统 | 工业生物技术 |
| 37 | 2026-03-07 |
Developing artificial cytoskeletons using RNA origami-based nanotubes
2026-Feb-28, Progress in biophysics and molecular biology
DOI:10.1016/j.pbiomolbio.2026.02.006
PMID:41765186
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综述 | 本文综述了利用RNA折纸纳米管构建人工细胞骨架的新兴领域,探讨了其设计策略、功能优势及在合成生物学与纳米技术中的应用前景 | 系统性地提出了利用RNA折纸技术构建可编程仿生细胞骨架网络的创新概念,突出了RNA在共转录折叠、复杂三级结构形成及与细胞机器接口方面的独特优势 | 存在体内稳定性不足和递送效率低等挑战 | 探索RNA折纸纳米管在构建人工细胞骨架中的应用,推动合成细胞工程与RNA纳米技术的发展 | RNA折纸纳米管及其仿生的微管与肌动蛋白丝结构 | 合成生物学 | NA | RNA折纸技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 仿生细胞骨架网络(模拟微管与肌动蛋白丝) | 纳米技术, 合成生物学, 医疗 |
| 38 | 2026-03-07 |
From biopolymers to microcompartments: A structured review of protein-based scaffolds for enzyme immobilization
2026-Feb-27, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108851
PMID:41765154
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综述 | 本文系统回顾了从天然生物聚合物到工程化蛋白质支架,再到细菌微区室(BMCs)等用于酶固定的蛋白质基支架的进展 | 采用分层视角,从天然生物聚合物支架推进到工程化蛋白质支架,并重点介绍了作为新兴细胞器样平台的细菌微区室(BMCs)在空间精度、选择性渗透性和封装多酶途径方面的优势 | NA | 回顾酶固定化支架的发展,为未来支架设计提供信息并拓宽生物催化的应用范围 | 用于酶固定的蛋白质基支架,包括生物聚合物、工程化蛋白质支架和细菌微区室 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术, 医学 |
| 39 | 2026-03-07 |
CO2-driven biosurfactant synthesis by bacteria within CCUS
2026-Feb-25, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-026-13761-w
PMID:41741775
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综述 | 本文综述了微生物在CCUS(碳捕集、利用与封存)框架内利用CO₂驱动生物表面活性剂合成的代谢与工程学进展 | 系统探讨了厌氧及CO₂富集培养系统中CO₂代谢与生物表面活性剂合成的关联,并整合了合成生物学、模块化路径设计及人工智能优化等前沿技术 | 面临技术与经济层面的挑战,具体实施方案的规模化与能效仍需进一步验证 | 探索通过微生物碳捕集与生物表面活性剂生产相结合,实现温室气体减排与可持续生物制造的策略 | 微生物(细菌)的CO₂代谢途径与生物表面活性剂合成机制 | 合成生物学与代谢工程 | NA | 遗传工程、合成生物学、系统级建模、人工智能 | NA | NA | NA | 合成生物学工具(未具体说明) | 细菌(未具体说明菌种) | 碳固定模块与生物表面活性剂合成途径的耦合设计 | 环境, 工业生物技术 |
| 40 | 2026-03-07 |
Advancing codon language modeling with synonymous codon constrained masking
2026-Feb-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag166
PMID:41736545
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SynCodonLM的密码子语言模型,通过同义密码子约束掩码来改进蛋白质编码DNA序列的建模 | 该模型引入了基于生物学的约束,仅从同义选项预测掩码密码子,从而解耦密码子级与蛋白质级语义,能学习核苷酸特异性模式 | NA | 改进密码子语言模型以更好地捕获DNA级生物学特征 | 蛋白质编码DNA序列 | 自然语言处理 | NA | 密码子语言建模 | 语言模型 | DNA序列 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |