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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-05-17 |
Engineering Fibroblast Growth Factor-2 (FGF2) Production in Cyanobacteria
2025-10-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00388
PMID:41045549
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research paper | 本研究通过将成纤维细胞生长因子2(FGF2)与藻蓝蛋白CpcB亚基融合,在蓝细菌中实现了FGF2的稳定表达和生物活性保持 | 首次通过融合藻蓝蛋白CpcB亚基的方法,克服了FGF2因仅含β-折叠结构而在异源系统中难以稳定表达的问题,并保持了融合蛋白的双重生物活性 | 研究仅测试了单一种类的蓝细菌(集胞藻PCC 6803),且未探讨融合蛋白的规模化生产或长期稳定性 | 实现对难于表达的FGF2蛋白在蓝细菌中的稳定重组表达 | 成纤维细胞生长因子2(FGF2)和集胞藻PCC 6803 | synthetic biology | NA | 基因融合、密码子优化 | NA | NA | NA | NA | 集胞藻PCC 6803 | FGF2与藻蓝蛋白CpcB亚基的融合基因构建 | 医学、生物技术 |
| 22 | 2026-05-17 |
Biomolecular Condensate-Based Artificial Organelle for Driving Compartmentalized Flux Control
2025-06-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00871
PMID:40339164
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研究论文 | 利用工程化生物分子凝聚体构建人工细胞器,实现代谢途径的区室化通量控制 | 首次设计FUSLCD-GCN4融合蛋白系统创建可编程人工细胞器,通过空间组织关键酶来增强代谢途径效率 | 该研究仅以2'-岩藻糖基乳糖合成途径为模型,未验证在其他代谢途径中的通用性 | 建立基于生物分子凝聚体的合成生物学平台,实现通量区室化控制以提高微生物细胞工厂的生物合成效率 | 工程化大肠杆菌及其中的人工细胞器 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程 | NA | NA | NA | 蛋白质融合设计 | 大肠杆菌 | 人工细胞器(基于FUSLCD-GCN4的区室化途径) | 工业生物技术 |
| 23 | 2026-05-17 |
Microfluidic Fluorescence-Activated Cell Sorting of Convolutional Neural Network-Designed Synthetic Yeast Promoter
2025-06-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00025
PMID:40368332
|
研究论文 | 结合分支卷积神经网络设计和高通量微流控荧光激活细胞分选,筛选增强型合成酵母启动子 | 首次将分支卷积神经网络(B-CNN)与遗传算法结合,用于预测和重新设计酵母启动子核心区域,并集成微流控荧光激活细胞分选(μFACS)系统实现高吞吐量单细胞分选 | 未提及大规模验证或其他酵母菌株的通用性 | 实现合成酵母启动子的理性设计和高效高通量筛选,提升基因表达和代谢物生物合成性能 | 酵母酒精氧化酶1启动子(P_AOX1)及其突变体 | 机器学习 | NA | 微流控荧光激活细胞分选(μFACS)、分支卷积神经网络(B-CNN)、遗传算法 | 分支卷积神经网络(B-CNN) | 序列数据和荧光图像 | GFP表达文库,具体数量未给出;细胞吞吐量7000个/秒 | NA | 酵母(毕赤酵母) | 合成启动子(P_AOX1核心区重新设计)及GFP报告基因表达电路 | 工业生物技术、医药 |
| 24 | 2026-05-17 |
De Novo Synthesis of Friedelin in Saccharomyces cerevisiae via Combination of Metabolic and Lipid Droplet Engineering
2025-06-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00047
PMID:40373267
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研究论文 | 在酿酒酵母中通过代谢与脂滴工程联合策略实现弗里德林的全新合成 | 首次在酿酒酵母中构建弗里德林的全新生物合成途径,并结合脂滴工程技术极大提高产量至1500 mg/L | 仅进行了摇瓶发酵,尚未进行中试或大规模生产验证 | 开发高效、可持续的弗里德林微生物生产方法 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 合成生物学 | NA | 代谢工程、脂滴工程 | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 弗里德林生物合成途径 | 医药 |
| 25 | 2026-05-17 |
Genetic Toggle Switch in Plants
2025-06-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00777
PMID:40387045
|
研究论文 | 本文利用定量表征的植物遗传元件和计算机模型,设计并验证了一种在稳定转基因植物中功能可预测的遗传双稳态开关 | 首次在稳定遗传工程化植物中实现可预测的遗传双稳态开关,并通过计算模型指导元件选择和电路迭代优化,克服了植物生命周期长、环境影响大的挑战 | 未讨论该遗传开关在不同植物物种或环境条件下的通用性,且长期稳定性尚未验证 | 开发可编程、可预测的植物遗传电路,特别是双稳态开关,以推动植物合成生物学应用 | 植物遗传元件(如启动子、转录因子)及其组装成的双稳态开关电路 | 合成生物学 | NA | NA | 计算机模型(in silico model) | 定量功能数据 | 稳定转基因植物(具体数量未提及) | NA | 植物(具体种类未提及) | 双稳态开关(mutually inhibitory gene-regulatory device) | 农业、环境 |
| 26 | 2026-05-17 |
Synthetic Phosphorylation Networks with Fluorescence and Luminescence Expansion
2025-06-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00814
PMID:40476587
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研究论文 | 提出一种名为SPN-FLUX的合成磷酸化网络平台,集成分裂荧光素酶或发光蛋白,实现快速可调的细胞过程报告 | 首次实现完全翻译后水平的合成磷酸化网络,能够在1小时内响应胞外刺激,克服了传统转录介导报告过程无法快速实时监测的局限 | 目前仅基于哺乳动物细胞模型验证,可能在其他系统(如细菌或植物)中的效果未知;且局限于缺氧等少数环境刺激的检测 | 开发一种基于翻译后修饰的快速、可调控的合成受体平台,用于实时监测细胞信号事件 | 哺乳动物细胞(如HEK293细胞) | 合成生物学 | NA | 合成生物学、分裂荧光素酶/发光蛋白、配体诱导二聚化 | NA | 荧光/发光信号 | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 合成磷酸化网络,包括膜结合受体(配体诱导二聚化激活)和组成型活性细胞内生物传感器 | 生物医学研究,环境监测 |
| 27 | 2026-05-17 |
Standardized Quorum Sensing Tools for Gram-Negative Bacteria
2025-06-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00036
PMID:40476774
|
研究论文 | 开发了一套标准化的群体感应工具,用于革兰氏阴性菌的合成生物学应用 | 基于SEVA载体库构建标准化、可互换的群体感应收发模块,并提供数学模型和参数以支持工程设计 | NA | 为革兰氏阴性菌提供标准化的群体感应工具,实现可预测的多细胞功能工程 | 群体感应系统及其收发模块 | 合成生物学 | NA | 群体感应系统的标准化构建与表征 | 数学模型 | NA | NA | SEVA载体库 | 革兰氏阴性菌 | 群体感应收发模块 | 工业生物技术, 合成生物学 |
| 28 | 2026-05-17 |
Robust Synthetic Biology Toolkit to Advance Carboxysome Study and Redesign
2025-06-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00144
PMID:40488673
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研究论文 | 设计和验证了pXpressome工具包,用于稳健表达和重新设计α-羧酶体 | 开发了pXpressome工具包,实现α-羧酶体的稳健表达、纯化后保持完整和功能,并通过基因缺失实验揭示蛋白质比例可理性影响形态 | 未提及,但可能涉及工具包在复杂环境或不同宿主中的适用性限制 | 促进羧酶体的研究和重新设计,以增强碳固定或作为纳米封装平台 | α-羧酶体及其组成蛋白(Rubisco、碳酸酐酶、顶点蛋白、面形成蛋白) | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | pXpressome工具包,Gibson Assembly | 大肠杆菌(E. coli) | 羧酶体表达系统,包括荧光标记构建体 | 环境,工业生物技术 |
| 29 | 2026-05-17 |
Opportunities to accelerate extracellular vesicle research with cell-free synthetic biology
2023-May, Journal of extracellular biology
DOI:10.1002/jex2.90
PMID:38938277
|
观点文章 | 讨论利用无细胞合成生物学加速细胞外囊泡研究的机会与挑战 | 提出将无细胞合成生物学技术应用于细胞外囊泡工程,以实现理性设计和制造携带定制分子货物的囊泡 | 当前对细胞外囊泡异质性、货物装载机制的理解有限,且囊泡计量学发展尚处于初期阶段 | 探索无细胞合成生物学在加速细胞外囊泡研究和医疗应用中的潜力 | 细胞外囊泡及其在人类生理和病理中的功能 | 合成生物学 | NA | 无细胞基因表达系统 | NA | NA | NA | NA | NA | 囊泡工程,包括货物装载和膜蛋白生产 | 医学,生物技术 |
| 30 | 2026-05-17 |
Digital switching in a biosensor circuit via programmable timing of gene availability
2014-Dec, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/nchembio.1680
PMID:25306443
|
研究论文 | 通过可编程的基因可用性时序控制在生物传感器电路中实现数字开关 | 利用位点特异性重组酶对多基因电路中基因可用性进行可编程时序控制,显著降低地态泄漏,增强动态范围和特异性 | NA | 开发一种通过时序控制基因可用性来改善生物传感器电路性能的方法 | 基于内源微RNA的比例传感器电路 | 合成生物学 | NA | 位点特异性重组酶 | NA | NA | NA | 位点特异性重组酶 | NA | 生物传感器电路、比例传感器、基因电路 | 医学、生物技术 |
| 31 | 2026-05-16 |
Evaluating Malat1-derived 3'end sequences for functional transgene expression in human cells using synthetic mRNA delivery
2026-Dec, RNA biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/15476286.2026.2670832
PMID:42093635
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研究论文 | 评估利用长链非编码RNA MALAT1来源的3'端序列替代poly(A)尾实现人类细胞中转基因表达的功能 | 首次系统比较了MALAT1来源的三螺旋结构与经典poly(A)尾在合成mRNA表达中的功能差异 | MALAT1来源序列的表达效率始终低于经典poly(A)尾,需优化三螺旋序列和折叠以增强翻译能力 | 探索poly(A)尾的替代策略,用于合成生物学和RNA治疗中的功能性转基因表达 | MALAT1来源的3'端序列基序与经典poly(A)尾 | 分子生物学 | NA | 合成mRNA递送 | NA | NA | NA | NA | 人细胞 | NA | 合成生物学, RNA治疗 |
| 32 | 2026-05-16 |
PHYCUT: Scalable Multiplex CRISPR/Cas9 Editing for Genome Engineering in the Diatom Phaeodactylum tricornutum
2026-05-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00843
PMID:41979903
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研究论文 | 开发了一种名为PHYCUT的多重CRISPR/Cas9编辑系统,用于硅藻基因组工程,并实现α(1,3)岩藻糖基化基因的多重编辑 | 首次在硅藻中建立基于Csy4内切核糖核酸酶处理多导向RNA阵列的质粒型多重CRISPR/Cas9系统,实现了高效的多位点同时编辑 | 未提及编辑效率的具体量化数据,且仅针对α(1,3)岩藻糖基化途径的三个基因进行验证,系统在其他基因座或不同硅藻物种中的适用性尚未评估 | 克服硅藻中缺乏稳健的多重CRISPR/Cas9编辑系统的局限,开发高效基因组工程工具 | 三角褐指藻(Phaeodactylum tricornutum) | 合成生物学 | 不适用 | CRISPR/Cas9 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | CRISPR-Cas9, Csy4 | 三角褐指藻(Phaeodactylum tricornutum) | 基于Csy4处理多导向RNA阵列的质粒型CRISPR/Cas9系统 | 生物技术, 医药 |
| 33 | 2026-05-16 |
Plant Synthetic Biology Takes Off: Bryophytes Onboard with New Tools, Systems, and Opportunities
2026-05-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00092
PMID:41984537
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综述 | 本文综述了苔藓植物在植物合成生物学作为新型工具、系统和机遇平台的最新进展 | 强调苔藓植物作为替代实验平台可弥补被子植物系统复杂性限制,推动跨植物谱系的通用和协同生物工程方法建立 | 未明确提及具体限制 | 突出苔藓植物作为植物合成生物学系统的重要性,并讨论其技术发展与应用前景 | 苔藓植物(包括藓类、角苔类和地钱类),特别是作为主要模型的物种 | NA | NA | 模块化克隆、基因回路、基因组编辑、合成基因组学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 苔藓植物(藓类、角苔类、地钱类) | 基因回路 | 农业, 工业生物技术 |
| 34 | 2026-05-16 |
Engineering Rapamycin-Induced Dimerization for Control of Gene Expression in Plants
2026-05-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00125
PMID:41990133
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研究论文 | 开发了一种雷帕霉素诱导的FKBP-FRB分裂转录因子系统,用于植物中基因表达的精确控制 | 通过系统优化多种DNA结合域、FRB重复序列和启动子架构,将诱导倍数提升至87倍,且诱导表达水平超过2×CaMV35S组成型启动子;雷帕霉素可通过简单喷洒或土壤施用实现控制 | 研究提及现有化学诱导系统的局限性,但未明确阐述本系统在非目标植物或环境中的潜在风险如持久性 | 实现植物基因表达的时间、空间和定量精确控制,替代现有诱导系统缺陷 | 植物(具体物种未明述,但数据表型涉及叶、土壤施用等通用植物模型) | 合成生物学 | NA | 雷帕霉素诱导系统、分裂转录因子系统 | NA | 基因表达数据、应用方法数据 | NA | NA | 植物(具体物种未明述) | 雷帕霉素诱导的二聚化分裂转录因子系统;包含hFRB-结合域和hFKBP12-转录激活域的回路设计 | 农业、生物技术 |
| 35 | 2026-05-16 |
Yeast MoClo Secretion and Surface Display Toolkit 2.0: Improvements and Applications for Analysis of protein-protein Interactions and Whole-Cell Biocatalysis
2026-05-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00085
PMID:42025218
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研究论文 | 描述了酵母MoClo分泌与表面展示工具包2.0的改进和应用,用于分析蛋白质相互作用和全细胞生物催化 | 新增了基于N端截短Aga1和C端Aga2的锚定蛋白部分,以及GFP荧光互补检测和分泌增强蛋白部分,并展示了在抗GFP纳米抗体展示和PET塑料降解中的新应用 | 未在摘要中明确提及 | 改进酵母MoClo分泌与表面展示工具包并扩展其应用 | 酵母细胞以及用于分泌和表面展示的异源蛋白 | 合成生物学 | NA | MoClo模块化克隆 | NA | NA | 多个蛋白质部分和酵母菌株 | MoClo | 酿酒酵母 | 分泌和表面展示线路,包括锚定蛋白、GFP互补系统和分泌增强蛋白 | 生物技术, 环境 |
| 36 | 2026-05-16 |
Construction and Application of a Multicolor Bactosensor for Detecting Bioavailable Antibiotic Mixtures in the Environment
2026-05-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00891
PMID:42027138
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研究论文 | 构建了一种多色细菌传感器,用于同时检测环境中的四环素和红霉素 | 首次将两个基于转录因子的传感模块整合到一个质粒中,并通过引入抗生素抗性基因提升性能,实现了通过智能手机图像颜色差异定量区分二元抗生素混合物 | 主要针对两种抗生素的检测,对于更复杂混合物的适用性未在论文中明确讨论 | 开发一种可现场部署的细菌传感器,用于环境中抗生素混合物的定量检测 | 四环素和红霉素 | NA | NA | 合成生物学、荧光传感 | NA | 图像 | 真实水样(未明确数量) | NA | 大肠杆菌 | 多色细菌传感器,包含基于转录因子的四环素和红霉素传感模块 | 环境监测 |
| 37 | 2026-05-16 |
Metabolic Engineering of Bacillus subtilis for High-Level Production of Salidroside from Potato Starch
2026-05-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00803
PMID:42048483
|
研究论文 | 通过代谢工程手段,在枯草芽孢杆菌中利用马铃薯淀粉高效生产红景天苷 | 首次在枯草芽孢杆菌中引入芳香醛合酶合成酪醇,结合群体感应动态调控系统优化红景天苷生产,并利用马铃薯淀粉作为碳源实现高效发酵 | 目前仅在摇瓶发酵水平实现生产,未提及工业规模放大及成本分析 | 开发可持续的红景天苷生产方法,推动天然产物生物合成的工业化应用 | 枯草芽孢杆菌工程菌株 | 代谢工程 | NA | 代谢工程、发酵工程 | NA | 实验数据 | 工程菌株BS18及其他中间菌株 | NA | 枯草芽孢杆菌 | 异源芳香醛合酶合成酪醇途径、内源醇脱氢酶筛选、群体感应动态调控系统、磷酸葡萄糖变位酶和UDP-葡萄糖焦磷酸化酶过表达 | 生物医药,化妆品,工业生物技术 |
| 38 | 2026-05-16 |
A Streamlined and High-Osmolarity Bacillus subtilis Cell-Free Platform for Rapid Characterization of Genetic Regulatory Elements
2026-05-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00165
PMID:42052911
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研究论文 | 建立了一种简化且高渗透压的枯草芽孢杆菌无细胞平台,用于快速表征遗传调控元件 | 系统重新评估了传统的提取制备和反应环境,省略了常规所需的流出培养和透析步骤,并通过将钾谷氨酸浓度提高至400 mM并添加渗透保护剂甜菜碱,显著增强了翻译能力 | 未提及具体局限性 | 开发一种简化的枯草芽孢杆菌无细胞系统,用于快速表征遗传调控元件 | 枯草芽孢杆菌无细胞系统中的遗传调控元件 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白质合成 | NA | NA | NA | NA | 枯草芽孢杆菌 | 遗传调控元件,包括启动子强度分析和catabolite抑制子CcpA介导的阻遏 | 合成生物学、工业生物技术 |
| 39 | 2026-05-16 |
Multiplexed Engineering of Salmonella Typhimurium for Targeted Cancer Therapies
2026-05-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00119
PMID:42085230
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综述 | 提出一个系统性工程框架,用于将鼠伤寒沙门氏菌改造为有效的抗癌活体生物治疗产品 | 提出了一个多模块协同工程框架,涵盖菌株减毒、靶向增强、定植优化、治疗生产、裂解控制释放和辅助模块,将鼠伤寒沙门氏菌从病原体转化为抗肿瘤载体 | 工程化鼠伤寒沙门氏菌在遗传稳定性和临床转化方面存在挑战和瓶颈 | 总结通过合成生物学方法工程化鼠伤寒沙门氏菌用于靶向癌症治疗的关键方法,并推动其临床应用 | 鼠伤寒沙门氏菌 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学重组 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Golden Gate Assembly | 鼠伤寒沙门氏菌 | 多模块协同工程回路,包括减毒回路、靶向增强回路、定植优化回路、治疗生产回路、裂解控制释放回路和辅助模块 | 医学 |
| 40 | 2026-05-16 |
Systematic Evaluation of Different Ribonucleoprotein Complexes as Posttranscriptional Biosensors in Cell-Free TX-TL Systems
2026-05-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00170
PMID:42086502
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研究论文 | 系统评估了三种不同的核糖核蛋白复合物在无细胞转录-翻译系统中作为转录后生物传感器的性能 | 首次系统比较了RISC、MS2-CNOT7和L7Ae三种RNP复合物在真核、原核和重组无细胞平台中的传感器功能,并成功在PURE系统中实现了蛋白酶响应性L7Ae介导的条件抑制 | IVT RNA基miRNA传感器存在报告基因基础表达水平难以可靠量化的瓶颈,MS2-CNOT7传感器则受限于裂解液依赖性约束 | 探索核糖核蛋白复合物在无细胞转录-翻译系统中作为转录后生物传感器的潜力 | RISC、MS2-CNOT7和L7Ae三种核糖核蛋白复合物 | 合成生物学 | NA | 无细胞转录-翻译系统、体外转录、荧光素酶报告基因 | NA | 实验数据 | NA | NA | NA | 转录后生物传感器电路(RISC、MS2-CNOT7、L7Ae) | 医学、环境 |