合成生物学相关文章
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当前共找到 4263 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-01-20 |
InSillyClo, a User-Friendly Web Application to Assist Large-Scale Golden Gate Cloning and MoClo Workflows
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00553
PMID:41404662
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研究论文 | 本文介绍了InSillyClo，一个开源Web应用程序，旨在辅助大规模Golden Gate克隆和MoClo工作流程，通过自动化生成工作流相关数据来提高效率 | 开发了首个专门用于处理Golden Gate和MoClo克隆工作流程中耗时且易错任务的用户友好型开源Web应用，支持灵活的部分类型系统 | NA | 简化合成生物学中大规模克隆工作流程的干实验室任务，提高电路构建效率 | 遗传电路变体构建工作流程 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆，Modular Cloning (MoClo) | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly, MoClo | NA | 遗传电路变体 | 工业生物技术 |
| 22 | 2026-01-20 |
Force Transmission by Minimal Focal Adhesion Complexes Induces Synthetic Cell Deformation
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00645
PMID:41407554
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研究论文 | 本研究在巨型单层囊泡中重构了最小化黏着斑样复合物，揭示了仅通过特定蛋白-膜相互作用即可实现肌动蛋白募集、力传递和结构稳定性，为探究机械感知和设计力响应仿生系统提供了可控合成生物学平台 | 首次在三维合成系统中重构了包含kindlin-2、talin-1等关键蛋白的最小化黏着斑复合物，并演示了其介导的肌动蛋白网络形成和囊泡变形能力 | 研究基于简化的人工膜系统，可能未完全模拟天然细胞环境的复杂性，且蛋白组合为最小化设定，实际生理中可能存在额外调控因子 | 探究黏着斑复合物传递力和感知机械信号的最小物理要求 | 由kindlin-2、talin-1、FAK、paxillin、zyxin和VASP蛋白与含PIP及整合素β1尾的膜锚定组成的合成黏着斑样复合物 | 合成生物学 | NA | 巨型单层囊泡重构技术、蛋白质组装与膜锚定 | NA | 实验观测数据 | NA | NA | NA | 基于膜锚定蛋白组装的力传递与肌动蛋白网络形成系统 | 医学、材料 |
| 23 | 2026-01-20 |
A Dual CRISPR-Cas/Cre-loxP Genome Engineering Strategy for Stable Uricase Expression in Food-Grade Probiotics
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00774
PMID:41432353
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研究论文 | 本文开发了一种结合CRISPR-Cas9基因敲入与Cre/loxP介导的基因组精简的双重基因组工程策略，用于在食品级益生菌中实现尿酸酶的稳定表达 | 首次将CRISPR-Cas9基因编辑与Cre/loxP系统整合，构建了遗传稳定、生物安全的食品级益生菌底盘，并实现了异源尿酸酶的高效稳定表达 | 研究目前仅在小鼠肠道中验证了定植能力，尚未进行人体临床试验；尿酸降解实验仅在体外条件下完成 | 开发具有定制代谢功能的食品级微生物底盘，用于合成生物学在健康与营养领域的应用 | 乳酸乳球菌NZ9000菌株及其工程改造菌株 | 合成生物学 | 高尿酸血症/痛风 | CRISPR-Cas9基因编辑, Cre/loxP重组系统, 基因组工程 | NA | 酶活性数据, 基因组测序数据, 体内定植数据 | 工程菌株（NZ9000-Δ）及其对照 | CRISPR-Cas9, Cre/loxP | 乳酸乳球菌（Lactococcus lactis） | 尿酸酶异源表达系统, 基因组精简设计 | 食品, 医药 |
| 24 | 2026-01-20 |
Recoded Bacteriophage Genome for Bio-Orthogonal-Enabled Concentration and Detection of E. coli in Drinking Water
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00665
PMID:41436063
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研究论文 | 本研究通过高复杂度Golden Gate组装技术重新编码噬菌体基因组，开发了一种基于噬菌体的生物传感器，用于饮用水中大肠杆菌的检测和浓缩 | 利用HC-GGA技术实现噬菌体基因组的快速、准确、灵活修改，并通过生物正交环加成反应结合磁纳米颗粒，实现噬菌体的磁化和宿主浓缩 | NA | 开发一种快速、低成本的方法来检测饮用水中的有害病原体和指示性非致病细菌 | 大肠杆菌作为粪便污染的指示生物 | 合成生物学 | NA | 高复杂度Golden Gate组装（HC-GGA）、生物正交环加成反应 | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly | 大肠杆菌 | 噬菌体生物传感器，通过基因组重编码引入炔基修饰的非经典氨基酸，结合磁纳米颗粒实现捕获和浓缩，并表达荧光素酶进行检测 | 环境监测、公共卫生 |
| 25 | 2026-01-20 |
Artificial Multidomain Ribosomally Synthesized and Post-translationally Modified Peptide Enzymes for Farnesylated Peptide Library Generation
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00613
PMID:41451912
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研究论文 | 本文设计了一种人工多域核糖体合成与翻译后修饰肽酶系统，用于生成法尼基化肽库 | 开发了一种简单而稳健的方法，通过将多个生物合成基因融合在可溶性表达载体中，实现大环肽的生成及酪氨酸侧链的特异性异戊二烯化修饰 | NA | 构建能够高效产生法尼基化肽库的生物合成系统 | 蓝细菌素生物合成途径中的酶及肽库 | 合成生物学 | NA | 核糖体合成与翻译后修饰肽（RiPP）技术、异戊二烯化修饰 | NA | NA | 估计最大260万种肽衍生物的库 | 基因融合、合成生物学方法 | 活体生物（未具体说明） | 多酶融合表达系统，用于大环肽合成与异戊二烯化修饰 | 药物发现、化学生物学 |
| 26 | 2026-01-20 |
Synthetic Biology Strategies for Harnessing Bacterial Glucose Oxidation Pathways
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00901
PMID:41494861
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综述 | 本文系统综述了细菌葡萄糖氧化途径的组成、分布、生理功能、关键酶及其代谢产物的工业应用，并重点讨论了通过代谢工程策略优化该途径以生产高价值化合物的潜力 | 系统整合了细菌葡萄糖氧化途径的生物学知识与代谢工程策略，并全面评估了该途径在可持续生产多种高价值化合物（如酒石酸、2,5-呋喃二甲酸、维生素C前体和磷肥）中的应用潜力 | NA | 探讨如何利用合成生物学与代谢工程策略优化细菌的葡萄糖氧化途径，以实现特定高价值化合物的高效、可持续生产 | 细菌的葡萄糖氧化途径及其关键酶（如PQQ依赖型和FAD依赖型葡萄糖酸脱氢酶），以及该途径的代谢产物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 葡萄糖氧化途径（涉及葡萄糖酸、5-酮基-D-葡萄糖酸、2-酮基-D-葡萄糖酸和2,5-二酮基-D-葡萄糖酸等中间产物的代谢通路） | 工业生物技术, 农业, 医药 |
| 27 | 2026-01-20 |
A Framework for a Standard-Enabled FAIR Data Management Workflow for Synthetic Biology
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00813
PMID:41498158
|
综述 | 本文提出了一个基于标准的FAIR数据管理框架，用于合成生物学实验室中数据与元数据的整合与标准化工作流 | 通过半结构化访谈分析当前实践，构建了将常见数据类型映射到社区标准的框架，并提供逐步采用指南和软件解决方案目录 | NA | 解决合成生物学数据分散、格式不一致的问题，提升数据的可查找性、可访问性、互操作性和可重用性 | 合成生物学项目生命周期中产生的序列、模型、协议、图像和时间序列测量等数据与元数据 | 合成生物学 | NA | 半结构化访谈 | NA | 序列、模型、协议、图像、时间序列测量 | 美国多个实验室的合成生物学研究人员 | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 28 | 2026-01-20 |
Copper biosorption by Serratia plymuthica: crucial role of tightly bound extracellular polymeric substances in planktonic and biofilm systems
2026-Jan-16, Biodegradation
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10532-026-10245-6
PMID:41545695
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研究论文 | 本研究探讨了沙雷氏菌（Serratia plymuthica）菌株As3-5a(5)在浮游细胞和生物膜系统中对铜的生物吸附作用，重点关注紧密结合的胞外聚合物物质的关键角色 | 揭示了紧密结合的胞外聚合物物质（尤其是蛋白质组分）在铜生物吸附中的关键作用，并展示了该菌株在强酸性真实电镀废水中仍能实现高效铜去除的潜力 | 研究未在真实工业废水条件下进行规模化验证，未来需要通过合成生物学方法改进铜螯合能力并提升技术成熟度 | 开发高效的重金属生物去除系统，探索可持续的铜修复生物技术方法 | 沙雷氏菌（Serratia plymuthica）菌株As3-5a(5)及其胞外聚合物物质 | 环境生物技术 | NA | 生物吸附、生物膜培养、废水处理实验 | NA | 实验数据、吸附效率数据 | 使用烧结玻璃生物膜系统和浮游细胞系统进行实验，具体样本数量未明确说明 | 合成生物学方法（未来研究方向） | 沙雷氏菌（Serratia plymuthica） | NA | 环境、工业生物技术 |
| 29 | 2026-01-20 |
Synthetic Biology Strategies for Activating Cryptic BGCs in Streptomyces: Engineering Native and Synthetic Promoters for Antibiotic Discovery
2026-Jan-13, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c08473
PMID:41552574
|
综述 | 本文综述了在链霉菌中通过工程化天然和合成启动子来激活隐性生物合成基因簇（BGCs）以发现新型抗生素的策略 | 系统性地整合了天然与合成启动子工程、基于CRISPR的激活系统以及机器学习引导的启动子设计等多种前沿策略，用于激活隐性BGCs | NA | 为天然产物发现提供启动子工具的系统级理解及其转化应用 | 链霉菌中的隐性生物合成基因簇（BGCs） | 合成生物学 | NA | 启动子工程、CRISPR激活系统、机器学习引导设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 链霉菌 | 用于激活隐性生物合成基因簇的启动子工程（包括组成型和诱导型启动子） | 医药 |
| 30 | 2026-01-20 |
CRISPR/Cas9-Mediated Metabolic Engineering of Endophytic Pseudomonas loganensis sp. nov. for the Production of Nutritionally Valuable Carotenoids
2026-Jan-13, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c05877
PMID:41552580
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研究论文 | 本研究利用CRISPR-Cas9技术对一种新型内生细菌进行代谢工程改造，以生产具有营养价值的类胡萝卜素 | 首次将内生细菌Pseudomonas loganensis sp. nov.开发为类胡萝卜素生产的微生物底盘，并采用CRISPR-Cas9技术构建了能生产多种目标产物的工程菌株 | 未提及 | 开发可持续且环境友好的类胡萝卜素生物生产方法 | 内生细菌Pseudomonas loganensis sp. nov. | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑，HPLC分析，响应面方法优化 | NA | 实验数据 | 未明确 | CRISPR-Cas9 | Pseudomonas loganensis sp. nov. | 通过敲除关键类胡萝卜素合成基因构建生产玉米黄质、番茄红素和β-胡萝卜素的菌株，并引入过表达质粒生产虾青素 | 食品, 饲料, 制药, 化妆品 |
| 31 | 2026-01-20 |
A synthetic gene circuit to convert biochemical signals to electrical signal in engineered sensory bacteria for electrochemical biosensing
2026-Jan-12, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2026.118391
PMID:41548356
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研究论文 | 本研究构建了一个合成基因电路，将生化信号转换为电信号，用于工程化感官细菌的电化学生物传感 | 设计了一个集成合成基因电路，结合一氧化氮响应模块和PCA合成模块，增强了电信号输出，实现了单细胞水平的高灵敏度检测 | NA | 开发基于工程化电活性微生物的电化学生物传感器，用于细胞内一氧化氮的原位分析 | 工程化的大肠杆菌（Escherichia coli） | 合成生物学 | NA | 电化学量化 | NA | 电信号 | NA | 合成生物学工具 | 大肠杆菌 | 集成合成基因电路，包括一氧化氮响应模块和苯二胺-1-羧酸合成模块，用于间接电子传递和信号转换 | 医学 |
| 32 | 2026-01-20 |
Chimeric antigen receptor-based cellular therapy for T-cell malignancies
2026-Jan, Critical reviews in oncology/hematology
DOI:10.1016/j.critrevonc.2025.105044
PMID:41285209
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综述 | 本文综述了基于嵌合抗原受体（CAR）的细胞疗法在T细胞恶性肿瘤中的应用，探讨了包括T细胞亚群、NK细胞、NKT细胞、CIK细胞和γδ T细胞在内的多种免疫效应细胞，并讨论了多抗原靶向、新兴技术和最新临床试验 | 聚焦于CAR疗法在T细胞恶性肿瘤中的挑战，如抗原共享导致的细胞自相残杀和T细胞再生障碍，并探索了多种免疫效应细胞和新兴技术以改善疗效 | NA | 改善复发或难治性T细胞恶性肿瘤的CAR疗法疗效 | T细胞恶性肿瘤患者 | NA | T细胞恶性肿瘤 | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | T细胞、NK细胞、NKT细胞、CIK细胞、γδ T细胞 | 嵌合抗原受体（CAR）设计，使用单链可变片段（scFv）识别肿瘤相关抗原 | 医学 |
| 33 | 2026-01-20 |
The Importance of Being Imperfect: Structure and Function of Bacterial Amyloid
2026-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202517090
PMID:41347620
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综述 | 本文综述了细菌功能性淀粉样蛋白（FuBAs）的结构、组装和功能，强调其作为广泛且多功能蛋白质组装体的重要性 | 揭示了细菌功能性淀粉样蛋白通过不完美重复序列稳定β-螺旋折叠，形成高稳定性和低多态性的原纤维，并扩展了细胞外基质的生化功能 | NA | 探讨细菌功能性淀粉样蛋白的结构与功能关系及其在生物材料工程中的应用潜力 | 细菌功能性淀粉样蛋白，特别是大肠杆菌的curli（CsgA）和假单胞菌的FapC | 结构生物学 | NA | 冷冻电镜（cryo-EM）和整合计算研究 | NA | 结构数据 | NA | NA | 大肠杆菌（Escherichia coli），假单胞菌（Pseudomonas） | NA | 合成生物学，生物材料工程，生物膜控制 |
| 34 | 2026-01-20 |
Toward full automation in synthetic biology: A progressive conceptual framework integrating robotics and intelligent agents
2026-Jan, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2025.100378
PMID:41360266
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综述 | 本文探讨了合成生物学中物理（机器人）和认知（智能代理）自动化的进展与前景，并提出了一个双重概念框架 | 提出了一个双重概念框架：一个用于设计-构建-测试-学习（DBTL）周期的完全自动化，另一个适用于不同实验室环境的渐进式自动化 | NA | 支持合成生物学实验室中自动化系统的开发和负责任实施 | 合成生物学中的自动化技术和智能代理 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 35 | 2026-01-20 |
Designing synthetic regulatory elements using the generative AI framework DNA-Diffusion
2026-Jan, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02441-6
PMID:41437153
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研究论文 | 本研究介绍了一种名为DNA-Diffusion的生成式人工智能框架，用于设计具有细胞类型特异性的紧凑调控元件 | 首次利用基于DNA可及性数据训练的生成式AI框架设计调控元件，生成的200碱基对合成元件能重现内源性转录因子结合模式并增强细胞类型特异性 | NA | 开发用于精确基因表达控制的合成调控元件设计方法 | 调控元件设计、基因表达控制 | 合成生物学 | 白血病 | STARR-seq、EXTRA-seq、DNA可及性数据 | 生成式AI、DNA-Diffusion | DNA序列数据、基因表达数据 | 5,850个元件的STARR-seq文库在三种细胞系中验证 | NA | 多种细胞系 | 合成调控元件设计 | 医学、基因治疗 |
| 36 | 2026-01-20 |
Editorial: Synthetic biology approaches for biocatalytic production of value-added chemicals
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1755163
PMID:41550373
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 37 | 2026-01-19 |
Arabinose-Inducible Univariant Control System (AUCS) for Microbial Production of Proteins, Enzymes, and Metabolites
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00602
PMID:41423945
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研究论文 | 本文介绍了一种阿拉伯糖诱导的单变量控制系统（AUCS），用于微生物生产蛋白质、酶和代谢物，旨在克服现有诱导系统的局限性 | AUCS通过组成型表达阿拉伯糖转运蛋白AraE消除了碳分解代谢物阻遏，并最小化诱导异质性，仅需3 μM l-阿拉伯糖即可实现最大蛋白质输出，显著降低诱导剂成本和环境足迹 | NA | 开发一种稳健、紧密调控且低成本的表达平台，以优化微生物生产中的基因表达控制 | 微生物生产系统，包括蛋白质（如卵清蛋白）、酶（如萜烯合酶、类胡萝卜素裂解双加氧酶）和次级代谢物（如芳樟醇、橙花叔醇和香紫苏醇） | 合成生物学 | NA | 基因表达调控、启动子库定制 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 大肠杆菌 | 单变量控制系统，包括阿拉伯糖诱导的启动子和阿拉伯糖转运蛋白AraE的组成型表达，用于精确调控多酶操纵子和复杂生物合成途径 | 工业生物技术, 医药 |
| 38 | 2026-01-19 |
Phage-mediated delivery of CRISPR payloads
2026-Jan-16, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2025.102704
PMID:41547318
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综述 | 本文综述了利用噬菌体递送CRISPR-Cas效应器的最新进展，旨在通过原位基因编辑工程化微生物群落 | 结合噬菌体工程策略、合成生物学技术和计算工具，实现CRISPR-Cas系统在宿主环境中的精准递送和基因组编辑 | 在系统发育广度部署方面仍面临挑战 | 开发技术以操纵和工程化微生物群落，实现其功能的理性调控 | 微生物群落及其功能角色 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统、噬菌体工程、合成生物学技术、计算工具 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 微生物群落（未指定具体宿主） | NA | 医学, 食品, 农业 |
| 39 | 2026-01-19 |
SynVectorDB: embedding-based retrieval system for synthetic biology parts
2026-Jan-15, Database : the journal of biological databases and curation
DOI:10.1093/database/baaf088
PMID:41537189
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研究论文 | 本文介绍了SynVectorDB，一个基于嵌入的合成生物学元件检索系统，旨在解决现有数据库数据组织不一致和语义搜索能力有限的问题 | 开发了基于BGE-M3多语言嵌入的可扩展向量数据库架构，实现了语义相似性匹配；提出了新颖的三级层次分类系统；建立了标准化的数据整理工作流程 | NA | 改进合成生物学元件的发现和组织方式，提高检索效率和准确性 | 合成生物学元件（生物部件） | 生物信息学 | NA | 嵌入技术，语义相似性匹配 | BGE-M3嵌入模型 | 文本数据，元数据 | 19,850个生物部件（来自Addgene、iGEM注册库和实验室收集），其中7,656个通过文献验证获得验证状态 | iGEM | NA | NA | 工业生物技术 |
| 40 | 2026-01-19 |
Automated strain-to-peptide conversion: a high-throughput proteome analysis platform empowering rational design of microbial cell factories
2026-Jan-13, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134010
PMID:41539624
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研究论文 | 本文开发了一种名为“菌株到肽转换”的高通量蛋白质组分析平台，用于加速微生物细胞工厂的理性设计 | 提出自动化SPC策略，相比传统SP3方法处理时间减少94%，膜蛋白定量提升28%，并实现96个样品在1小时内处理 | NA | 开发高通量蛋白质组分析平台以支持微生物细胞工厂的理性设计 | 工程化菌株的蛋白质组，特别是大肠杆菌样品 | 合成生物学 | NA | 质谱蛋白质组学，磁固相烷基化 | NA | 蛋白质组数据 | 96个大肠杆菌样品 | NA | 大肠杆菌 | NA | 工业生物技术 |