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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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21 | 2025-06-15 |
Advances in engineered models of peri-gastrulation
2025-Jun-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112659
PMID:40510116
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research paper | 本文讨论了利用干细胞技术和工程工具整合的工程模型在研究人类发育早期阶段中的应用 | 整合了工程技术和合成生物学工具,提高了模型的精确度,为人类早期发育阶段的研究提供了新视角 | NA | 研究人类发育早期阶段的细胞分化和组织形成 | 人类早期发育阶段的细胞和组织 | synthetic biology | NA | stem cell technology, micropatterned substrates, microfluidic systems, synthetic biology tools | blastoids, 2D micropatterned systems, 3D gastruloid constructs, somitoids | NA | NA |
22 | 2025-06-15 |
Unraveling the regulatory dynamics of bidirectional promoters for modulating gene co-expression and metabolic flux in Saccharomyces cerevisiae
2025-Jun-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf511
PMID:40503683
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研究论文 | 本研究通过全基因组筛选和表征酵母中的双向启动子(BDPs),揭示了其调控机制并应用于代谢通量的精细调控 | 利用DREAM-CNN AI预测模型识别BDPs中的保守激活剂结合热点,并通过实验验证这些热点对BDP功能的关键作用 | 研究仅针对酵母Saccharomyces cerevisiae,未在其他生物体中验证BDPs的普适性 | 探索双向启动子的调控机制并应用于合成生物学中的基因共表达和代谢通量调控 | 酵母Saccharomyces cerevisiae中的749个双向启动子候选者 | 合成生物学 | NA | 全基因组筛选、转录组分析、荧光报告分析、计算机模拟突变 | DREAM-CNN | 基因组数据、转录组数据、荧光报告数据 | 749个双向启动子候选者 |
23 | 2025-06-15 |
Prospects of Synthetic Biology-Based Approaches in the Enhanced Production of Pyocyanin in Pseudomonas aeruginosa MCCB 117 as the Drug of Choice in Aquaculture
2025-Jun-03, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-025-04279-x
PMID:40459729
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综述 | 本文探讨了利用合成生物学方法提高铜绿假单胞菌MCCB 117中绿脓菌素产量的前景,以作为水产养殖中的首选药物 | 提出了利用合成生物学工具增强绿脓菌素生物合成的分子机制和基因水平操作的新方法 | 未提及具体实验数据或实施细节 | 研究如何通过合成生物学方法提高绿脓菌素的产量,以应用于可持续水产养殖生产系统 | 铜绿假单胞菌MCCB 117及其绿脓菌素生物合成途径 | 合成生物学 | 弧菌病 | 基因水平操作 | NA | NA | NA |
24 | 2025-06-15 |
Coli bond: A dual-function encryption system for secure information storage and transmission by microorganisms
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0325926
PMID:40498745
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研究论文 | 介绍了一种名为Coli Bond的双功能加密系统,利用微生物进行安全信息存储和传输 | 结合DNA存储的分子精确性与合成生物学的可控动态性,提供数据加密和存储的创新平台 | NA | 开发一种安全可控的信息存储和传输系统 | 利用合成生物学改造的大肠杆菌菌株 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | DNA编码信息 | NA |
25 | 2025-06-15 |
Unlocking the potential of flavonoid biosynthesis through integrated metabolic engineering
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1597007
PMID:40510168
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综述 | 本文全面综述了类黄酮生物合成的代谢工程策略及其应用前景 | 整合植物细胞工厂、基因组编辑、环境优化和AI驱动的代谢工程,提出可持续高产类黄酮的新路线图 | 未提及具体实验验证数据或案例研究 | 探索提高类黄酮产量的综合代谢工程策略 | 植物类黄酮生物合成途径及其调控机制 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、空间代谢组学、AI驱动的代谢工程 | NA | 代谢组学数据 | NA |
26 | 2025-06-15 |
Open-endedness in synthetic biology: A route to continual innovation for biological design
2024-01-19, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adi3621
PMID:38241375
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research paper | 提出了一种开放式的合成生物学设计方法,强调设计的新颖性与实现目标同等重要 | 提出将新颖性作为生物设计的重要考量,而不仅仅是优化单一最佳设计,以突破工程生物学中性能提升的瓶颈 | 未具体说明开放式设计方法在实际应用中的具体操作步骤或验证案例 | 探索合成生物学中更具创造性的设计方法,以克服当前系统复杂性瓶颈和实验室到实际应用的转化难题 | 合成生物学设计方法 | synthetic biology | NA | NA | NA | NA | NA |
27 | 2025-06-14 |
Decoding the Minimal Translation System of the Plasmodium falciparum Apicoplast: Essential tRNA-modifying Enzymes and Their Roles in Organelle Maintenance
2025-Aug-15, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2025.169156
PMID:40335414
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研究论文 | 本研究通过比较基因组学和预测工具,鉴定了疟原虫顶质体中16种tRNA修饰酶,并验证了其中14种的定位,揭示了6种对寄生虫生存至关重要的酶 | 首次系统鉴定了疟原虫顶质体中tRNA修饰酶的最小集合,并确定了其中6种对寄生虫生存和顶质体功能至关重要的酶 | 有2个基因无法被敲除,其中一个具有双重定位,可能在其他细胞器中具有必需功能,另一个可能具有无法通过代谢旁路绕过的关键作用 | 研究疟原虫顶质体中最小翻译系统所需的tRNA修饰酶及其功能 | 疟原虫顶质体中的tRNA修饰酶 | 分子生物学 | 疟疾 | 比较基因组学、蛋白质定位预测、基因敲除 | NA | 基因组数据、蛋白质定位数据 | 16种预测的tRNA修饰酶,其中14种被实验验证 |
28 | 2025-06-14 |
Effect of glycosylation on protein folding: From biological roles to chemical protein synthesis
2025-Jun-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112605
PMID:40502693
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review | 探讨糖基化在蛋白质折叠中的双重作用及其在化学蛋白质合成中的应用 | 提出临时糖基化支架策略,为化学蛋白质合成提供可逆的折叠引导方法 | 未提及具体实验数据或样本量,可能缺乏实证支持 | 研究糖基化对蛋白质折叠的影响及其在生物技术和合成生物学中的应用 | 蛋白质折叠及糖基化修饰 | 合成生物学 | NA | 化学蛋白质合成 | NA | NA | NA |
29 | 2025-06-14 |
Characterization of a consensus-designed trans-cinnamic acid decarboxylase for styrene biosynthesis
2025-Jun-11, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00714-25
PMID:40407334
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research paper | 该研究描述了一种共识设计的反式肉桂酸脱羧酶PSC1,用于微生物生物合成苯乙烯 | 设计了一种新型的共识蛋白PSC1,能够在微生物中高效催化反式肉桂酸脱羧生成苯乙烯,并解析了其晶体结构 | NA | 开发更环保的苯乙烯生物合成方法以替代传统石化工艺 | 反式肉桂酸脱羧酶PSC1及其在苯乙烯生物合成中的应用 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、X射线晶体学 | NA | 蛋白质结构数据 | NA |
30 | 2025-06-14 |
Expressing exogenous gene in Chlamydomonas reinhardtii chloroplast with viral replication elements
2025-Jun-07, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.132784
PMID:40490158
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研究论文 | 本研究开发了一种基于病毒复制元件的表达平台,用于在莱茵衣藻叶绿体中高效表达外源基因 | 利用甜菜卷顶病毒的复制机制构建表达平台,相比传统同源重组方法提高了表达水平(2-4倍),并能稳定表达转基因长达12个月 | NA | 解决莱茵衣藻叶绿体作为合成生物学底盘时产物产量低的问题 | 莱茵衣藻叶绿体 | 合成生物学 | NA | 病毒复制元件表达平台 | NA | NA | NA |
31 | 2025-06-14 |
Rosmarinic Acid as Bioactive Compound: Molecular and Physiological Aspects of Biosynthesis with Future Perspectives
2025-Jun-05, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14110850
PMID:40498026
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综述 | 本文综述了迷迭香酸(RA)的生物合成、分子机制、生理功能及其在生物技术中的应用 | 探讨了合成生物学和代谢工程技术在提高RA工业生产中的应用 | NA | 研究迷迭香酸的生物合成、功能及其生产方法 | 迷迭香酸及其在植物中的生物合成 | 植物生物技术 | NA | 植物细胞组织培养、合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA |
32 | 2025-06-14 |
Synthetic Biology in Natural Product Biosynthesis
2025-Apr-09, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00567
PMID:40116601
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综述 | 本文综述了合成生物学在天然产物生物合成中的最新进展 | 总结了合成生物学在天然产物发现和工程中的多学科工具整合与应用 | NA | 探讨合成生物学在天然产物生物合成中的作用 | 天然产物及其生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 生物信息学、异源表达、组合生物合成 | NA | NA | NA |
33 | 2025-06-14 |
Cell-free expression and SMA copolymer encapsulation of a functional receptor tyrosine kinase disease variant, FGFR3-TACC3
2025-01-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-86194-6
PMID:39848978
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研究论文 | 该研究通过无细胞蛋白表达系统成功表达了功能性的FGFR3-TACC3融合蛋白,并利用SMA共聚物进行重构 | 首次使用无细胞蛋白表达系统在48小时内成功表达功能性FGFR3-TACC3融合蛋白,并实现高产量重构 | 尚未获得全长受体酪氨酸激酶的高分辨率结构 | 解决跨膜蛋白特别是受体酪氨酸激酶融合蛋白表达困难的问题 | FGFR3-TACC3融合蛋白 | 合成生物学 | 癌症 | 无细胞蛋白表达(CFPE), SMA共聚物重构 | NA | 蛋白功能数据 | NA |
34 | 2025-06-14 |
Optimal network sizes for most robust Turing patterns
2025-01-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-86854-7
PMID:39849094
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research paper | 该研究通过随机矩阵理论分析较大网络的Jacobian矩阵,探讨了图灵模式在生物系统中的形成机制及其最优网络大小 | 揭示了图灵模式比以往认为的更可能偶然发生,并发现最稳健的图灵网络具有一个最优大小,仅由少数分子物种组成,从而显著提高了其在生物系统中的可识别性 | 研究主要基于理论分析,需要进一步的实验验证以确认在真实生物系统中的适用性 | 探讨图灵模式在复杂生物基因调控网络中的形成机制及其稳健性 | 基因调控网络及其Jacobian矩阵 | systems biology | NA | random matrix theory | NA | theoretical analysis | NA |
35 | 2025-06-14 |
Optimizing phage therapy with artificial intelligence: a perspective
2025, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2025.1611857
PMID:40496019
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综述 | 本文综述了人工智能在优化噬菌体疗法中的最新进展及其潜在应用 | 探讨了AI如何促进噬菌体-宿主相互作用的研究,以设计更有效的噬菌体治疗剂 | 未提及具体的AI模型或技术在实际应用中的效果验证 | 探索人工智能在优化噬菌体疗法中的应用 | 噬菌体与细菌的相互作用 | 人工智能 | 抗菌耐药性 | NA | NA | NA | NA |
36 | 2025-06-13 |
Revolutionizing immunotherapy: The next frontier in CAR T-cell engineering
2025-Jul, Critical reviews in oncology/hematology
DOI:10.1016/j.critrevonc.2025.104751
PMID:40306469
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review | 本文综述了嵌合抗原受体(CAR)T细胞疗法的发展历程及其在癌症治疗中的革命性潜力 | 探讨了从第一代到第五代CAR T细胞的设计进展,包括共刺激结构域的引入、双信号通路和细胞因子释放机制的整合 | 在实体瘤治疗中仍面临免疫抑制性肿瘤微环境和抗原异质性的挑战 | 探索CAR T细胞疗法在癌症治疗中的最新进展和未来方向 | CAR T细胞疗法及其在血液系统恶性肿瘤和实体瘤中的应用 | 免疫治疗 | 癌症 | 合成生物学 | NA | NA | NA |
37 | 2025-06-13 |
Opto-p53: A Light-Controllable Activation of p53 Signaling Pathway
2025-Jun-12, Cell structure and function
IF:2.0Q4
DOI:10.1247/csf.25017
PMID:40500178
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研究论文 | 本研究开发了一种光遗传学工具Opto-p53,通过光控制p53信号通路的激活 | 开发了Opto-p53工具,利用光诱导二聚化系统选择性激活p53信号通路 | NA | 开发一种实验系统,用于在细胞和组织中选择性激活p53信号通路 | p53蛋白及其信号通路 | 合成生物学 | 肿瘤 | 光遗传学 | NA | NA | NA |
38 | 2025-06-13 |
In Vivo Multicellular Feedback Control in Synthetic Microbial Consortia
2025-Jun-11, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00862
PMID:40499137
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research paper | 提出了一种能够在合成微生物群落中实现稳定和精确基因表达调控的生物分子控制架构 | 通过分布式多细胞反馈回路在两个菌株之间实现分工,克服了传统单细胞生物分子控制策略的复杂性和适应性限制 | NA | 开发一种能够在合成微生物群落中实现稳定和精确基因表达调控的生物分子控制架构 | 合成微生物群落中的基因表达调控 | synthetic biology | NA | biomolecular control architecture | NA | NA | NA |
39 | 2025-06-13 |
Detection of TuMV by a toehold switch sensor coupled with NASBA amplification in Pseudostellaria heterophylla
2025-Jun-09, Plant methods
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s13007-025-01394-5
PMID:40490766
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研究论文 | 开发了一种基于核酸序列扩增(NASBA)和toehold开关传感器的无细胞表达系统,用于检测太子参中的芜菁花叶病毒(TuMV) | 结合NASBA扩增和toehold开关传感器,开发了一种快速、灵敏、特异性强且适用于田间应用的TuMV检测方法 | 未提及该方法在其他病毒检测中的适用性或长期稳定性 | 开发高效诊断系统以控制和减轻太子参中的TuMV感染 | 太子参(Pseudostellaria heterophylla)及其感染的芜菁花叶病毒(TuMV) | 合成生物学 | 植物病毒感染 | NASBA, toehold开关传感器 | NA | RNA片段 | 田间样品(具体数量未提及) |
40 | 2025-06-13 |
Methanol metabolism in synthetic methylotrophic microorganisms
2025-Jun-09, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108623
PMID:40499848
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review | 本文深入探讨了甲醇代谢途径及合成甲基营养微生物的代谢工程进展 | 重点介绍了人工甲基营养中创新的C1同化途径 | NA | 增强对甲醇代谢的理解并释放合成甲基营养菌的工业潜力 | 合成甲基营养微生物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |