合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
21	2025-05-11	A synthetic biology approach for identifying de-SUMOylation enzymes of substrates 2025-May, Journal of integrative plant biology IF:9.3Q1 DOI:10.1111/jipb.13838 PMID:39835880	研究论文	利用大肠杆菌中的稳健重构系统，通过合成生物学方法鉴定负责从特定蛋白质底物中去除SUMO翻译后修饰的植物泛素样蛋白酶	采用合成生物学方法在大肠杆菌中建立重构系统，用于鉴定植物SUMO去修饰酶	NA	鉴定能够去除特定蛋白质底物上SUMO修饰的植物泛素样蛋白酶	植物泛素样蛋白酶	合成生物学	NA	合成生物学方法	NA	NA	NA
22	2025-05-11	Toward an integrated omics approach for plant biosynthetic pathway discovery in the age of AI 2025-Apr, Trends in biochemical sciences IF:11.6Q1 DOI:10.1016/j.tibs.2025.01.010 PMID:40000312	综述	本文综述了利用多组学策略和人工智能技术发现植物生物合成途径的最新进展	提出结合分子网络、反应对分析和基因表达模式的集成工作流程，以及AI驱动的方法来革新途径发现	未提及具体实验验证或应用案例	促进可持续生物经济发展，通过合成生物学获取复杂天然产物	植物生物合成途径	合成生物学	NA	基因组学、转录组学、代谢组学	AI驱动方法	多组学数据	NA
23	2025-05-11	CnRed: Efficient, Marker-free Genome Engineering of Cupriavidus necator H16 by Adapted Lambda Red Recombineering 2025-Mar-21, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00757 PMID:39989320	研究论文	本研究建立了一种适用于Cupriavidus necator H16的lambda Red重组系统，用于高效的基因组编辑	首次在Cupriavidus necator H16中应用lambda Red重组系统，并结合电穿孔技术实现高效的基因删除和稳定基因组整合	研究仅验证了三个基因组位点的修改，可能需要在更多位点进行验证以证明其广泛适用性	开发高效的基因组编辑方法以优化Cupriavidus necator H16作为生物技术生产宿主的性能	Cupriavidus necator H16细菌	合成生物学	NA	lambda Red重组系统、电穿孔、PCR	NA	基因组数据	三个不同的基因组位点
24	2025-05-11	Cell-Free Multistep Gene Regulatory Cascades Using Eukaryotic ON-Riboswitches Responsive to in Situ Expressed Protein Ligands 2025-Mar-21, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00840 PMID:39991792	研究论文	开发了在麦胚提取物中起作用的蛋白质响应性上调核糖开关（ON-riboswitches），用于构建多步基因调控级联	首次在真核无细胞系统中构建了复杂的基因调控级联，并成功提高了核糖开关的效率	初始设计的两种ON-riboswitches效率较低，且需要优化反应条件以防止表达效率降低	构建真核无细胞系统中的复杂基因调控电路	蛋白质响应性ON-riboswitches和基因调控级联	合成生物学	NA	核糖开关技术、HHR（锤头状核酶）自切割	NA	NA	NA
25	2025-05-11	Engineering a New Generation of Gene Editors: Integrating Synthetic Biology and AI Innovations 2025-Mar-21, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00686 PMID:39999982	research paper	该文章探讨了如何通过合成生物学和人工智能创新来设计新一代基因编辑器	整合AI和机器学习技术以优化基因编辑酶的发现和设计，提高活性、特异性和降低免疫原性	未提及具体实验验证结果或临床转化时间表	开发更安全、高效的基因组编辑工具，以促进临床应用	基因编辑酶（如CRISPR-Cas系统）	合成生物学	NA	AI/ML模型、理性设计、诱变筛选、定向进化	AI/ML	NA	NA
26	2025-05-11	Potential and Optimization of Mammalian Splice Riboswitches for the Regulation of Exon Skipping-Dependent Gene Expression and Isoform Switching within the ALOX5 Gene 2025-Mar-21, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00731 PMID:40011207	研究论文	本研究探讨了合成核糖开关在哺乳动物细胞中通过控制选择性剪接来调节基因表达的潜力及其优化方法	提出了通过基因特异性内含子和外显子序列的适应性调整来增强核糖开关调控动态范围的新策略，并展示了将两个盒式外显子组合以增强调控效果的方法	合成核糖开关在真核系统中控制基因表达的功能通常局限于特定基因或细胞类型	探索合成核糖开关通过控制选择性剪接来调节基因表达的潜力及其优化方法	人工花生四烯酸5-脂氧合酶基因(ALOX5)在HEK293细胞中的表达	合成生物学	NA	合成核糖开关技术	NA	基因表达数据	HEK293细胞
27	2025-05-11	Review of Recent Advances in Microbial Production and Applications of Nerolidol 2025-Mar-12, Journal of agricultural and food chemistry IF:5.7Q1 DOI:10.1021/acs.jafc.4c12579 PMID:40013722	综述	本文综述了橙花叔醇（nerolidol）的生物活性、应用及其微生物生产方法的最新研究进展	总结了代谢工程和合成生物学策略在构建微生物细胞工厂生产橙花叔醇方面的应用	NA	探讨橙花叔醇在人类健康、农业和食品工业中的潜在应用及其绿色生产前景	橙花叔醇及其生物活性衍生物	合成生物学	NA	代谢工程、合成生物学	NA	NA	NA
28	2025-05-11	Leaky ribosomal scanning enables tunable translation of bicistronic ORFs in green algae 2025-Mar-04, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2417695122 PMID:40009642	研究论文	研究揭示了绿藻中双顺反子mRNA翻译的机制，通过漏核糖体扫描实现ORF2的可调翻译	首次在绿藻中证实漏核糖体扫描是双顺反子mRNA翻译ORF2的机制，并展示了通过调控ORF1的Kozak样序列强度可逆调节两个ORF的表达	研究仅针对两种绿藻，机制在其他真核生物中的普适性需要进一步验证	探究绿藻中多顺反子转录本的翻译机制	两种分歧绿藻（未明确命名）的双顺反子基因座	分子生物学	NA	生物信息学分析、体内突变分析、双荧光报告系统	NA	基因组数据、荧光报告数据	两种绿藻的高置信度手工注释双顺反子基因座数据集
29	2025-05-11	CAR-NK cells with dual targeting of PD-L1 and MICA/B in lung cancer tumor models 2025-Feb-25, BMC cancer IF:3.4Q2 DOI:10.1186/s12885-025-13780-2 PMID:40000974	研究论文	本研究设计了一种新型双靶向CAR-NK细胞，用于靶向PD-L1和MICA/B，以增强对肺癌细胞的杀伤效果	设计了一种新型双靶向CAR（dtCAR），结合PD-L1纳米抗体和NKG2D，增强了NK细胞的活化和杀伤能力	研究仅针对H1299肺癌细胞模型，未涉及其他肺癌细胞类型或临床样本	开发一种新型免疫治疗策略，用于治疗肺癌	肺癌细胞H1299	免疫治疗	肺癌	合成生物学、CAR-NK细胞工程	双靶向CAR（dtCAR）	体外和体内实验数据	H1299肺癌细胞模型
30	2025-05-11	A concise enzyme cascade enables the manufacture of natural and halogenated protoberberine alkaloids 2025-Feb-23, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-025-57280-0 PMID:39988594	研究论文	设计了一种简洁的酶级联反应，用于高效生产天然和非天然的普罗托贝碱类生物碱	通过酶发现与工程化，以及系统优化普罗托贝碱类生物碱生物合成中的关键酶，实现了高效生产药物罗通定，并展示了其工业化潜力	未提及具体的生产规模限制或酶稳定性问题	克服植物源性天然产物在药物开发中因低丰度和结构多样性不足带来的限制	普罗托贝碱类生物碱，包括天然和非天然（如卤化）衍生物	合成生物学	NA	酶级联反应、酶工程	NA	NA	NA
31	2025-05-11	Marine Phytoplankton Bioactive Lipids and Their Perspectives in Clinical Inflammation 2025-Feb-17, Marine drugs IF:4.9Q1 DOI:10.3390/md23020086 PMID:39997210	研究论文	探讨海洋浮游植物中具有免疫调节功能的生物活性脂质及其在临床炎症治疗中的潜力	提出利用海洋浮游植物作为生物技术平台生产功能性生物活性脂质，用于治疗慢性炎症疾病	脂质前体产量需要提高以具备商业竞争力	研究海洋浮游植物生物活性脂质在临床炎症治疗中的应用	海洋浮游植物中的生物活性脂质	生物技术	慢性炎症疾病	合成生物学方法	NA	NA	NA
32	2025-05-11	Direct Cloning and Heterologous Expression of the Dmxorosin Biosynthetic Gene Cluster from Streptomyces thermolilacinus SPC6, a Halotolerant Actinomycete Isolated from the Desert in China 2025-Feb-11, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms26041492 PMID:40003958	研究论文	本文报道了从中国临泽沙漠分离的耐盐放线菌SPC6中直接克隆并异源表达dmxorosin生物合成基因簇的研究	成功克隆并异源表达了一个完全沉默的隐秘生物合成基因簇，发现了一种新的羊毛硫肽dmxorosin	NA	研究放线菌次级代谢产物的生物合成途径	Streptomyces thermolilacinus SPC6菌株及其次级代谢产物	合成生物学	NA	基因组挖掘、直接克隆、异源表达	NA	基因组数据	1株放线菌(SPC6)
33	2025-05-11	Advanced Technologies for Large Scale Supply of Marine Drugs 2025-Feb-07, Marine drugs IF:4.9Q1 DOI:10.3390/md23020069 PMID:39997193	综述	本文全面探讨了海洋天然产物（MNPs）的生产策略，包括供应、合成和可扩展性方面的挑战，并强调了可能改变当前海洋来源药物工业规模生产方法的最新生物技术进步	结合传统方法与现代合成生物学和生物合成策略，为海洋无脊椎动物MNPs的生产提供了多样化的方法	海洋无脊椎动物MNPs通常自然积累量极少，生产策略面临挑战	确保海洋天然产物的可靠和可持续供应，以转化为商业药物和其他有价值的产品	海洋天然产物（MNPs）及其生产策略	生物技术	NA	合成生物学、生物合成	NA	NA	NA
34	2025-05-11	Public attitudes to potential synthetic cells applications: Pragmatic support and ethical acceptance 2025, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0319337 PMID:40014593	研究论文	本文通过调查13个欧洲国家的公众态度，探讨了合成细胞技术在抗癌治疗、二氧化碳转化为生物燃料和工业废物回收等潜在应用中的公众支持度	首次在13个欧洲国家进行大规模调查，探讨公众对合成细胞技术的态度，并使用数据驱动技术构建决策树模型分析影响因素	研究仅覆盖欧洲国家，可能无法代表全球其他地区的公众态度	探索公众对合成细胞潜在应用的态度和支持程度	来自13个欧洲国家的8,382名具有全国代表性的受访者	合成生物学	癌症	NA	决策树模型	调查数据	8,382名来自13个欧洲国家的受访者
35	2025-05-11	Leaky ribosomal scanning enables tunable translation of bicistronic ORFs in green algae 2024-Jul-25, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.07.24.605010 PMID:39091764	研究论文	本研究通过生物信息学和体内突变分析，探讨了绿藻中多顺反子基因的翻译机制	揭示了绿藻中多顺反子转录本通过漏读核糖体扫描机制实现多ORF翻译的新机制	研究仅针对两种绿藻，结果在其他物种中的普适性有待验证	阐明绿藻中多顺反子基因的翻译调控机制	两种分歧绿藻(未指明具体物种)的多顺反子基因位点	分子生物学	NA	生物信息学分析、体内突变分析、双报告基因系统	NA	基因组序列数据、荧光报告基因数据	两种绿藻的高置信度手动注释双顺反子位点数据集
36	2025-05-10	dTSR enables efficient improvement of heterologous production of spinosad in Saccharopolyspora erythraea 2025-Sep, Synthetic and systems biotechnology IF:4.4Q1 DOI:10.1016/j.synbio.2025.02.003 PMID:40337009	research paper	该研究开发了一种双重转座和位点特异性重组（dTSR）方法，用于提高多杀菌素在Saccharopolyspora erythraea中的异源生产	提出了一种新的dTSR方法，能够高效生成初始异源菌株，并随机整合第二拷贝的多杀菌素生物合成基因簇，显著提高产量	研究仅针对Saccharopolyspora erythraea，未涉及其他稀有放线菌	提高多杀菌素在稀有放线菌中的异源生产效率	Saccharopolyspora erythraea和多杀菌素生物合成基因簇	合成生物学	NA	双重转座和位点特异性重组（dTSR）	NA	NA	NA
37	2025-05-10	Advances in innovative extraction techniques for polysaccharides, peptides, and polyphenols from distillery by-products: Common extraction techniques, emerging technologies, and AI-driven optimization 2025-Jun-01, Food chemistry IF:8.5Q1 DOI:10.1016/j.foodchem.2025.143326 PMID:39986087	review	本文综述了从酿酒副产品中提取多糖、肽和多酚的创新提取技术进展	探讨了超临界流体提取、加压液体提取、脉冲电场和合成生物学等新兴技术，并讨论了机器学习和人工智能在优化提取参数和扩大生产规模中的应用	未提及具体实验数据或案例研究来验证这些新兴技术的实际效果	促进酿酒行业的可持续发展实践，强调经济可行性、环境影响和资源优化	酿酒副产品（如酒糟、废液和酒渣）中的多糖、肽和多酚	生物技术与食品科学	NA	酶法提取、超声波辅助提取、微波辅助提取、超临界流体提取、加压液体提取、脉冲电场、合成生物学	机器学习、人工智能	NA	NA
38	2025-05-10	Engineering advanced bacterial therapy for tumor and inflammatory diseases 2025-May-15, International journal of pharmaceutics IF:5.3Q1 DOI:10.1016/j.ijpharm.2025.125585 PMID:40216039	综述	本文综述了工程化细菌疗法在肿瘤和炎症性疾病治疗中的优势、策略及研究进展	探讨了工程化细菌疗法通过基因重编程和表面化学修饰实现选择性功能重组和精确时空控制的新策略	讨论了当前工程化细菌疗法在应用中的局限性和挑战	探索工程化细菌疗法在疾病治疗中的潜力与前景	肿瘤和炎症性疾病	合成生物学与生物医学	肿瘤和炎症性疾病	基因重编程和表面化学修饰	NA	NA	NA
39	2025-05-10	Biomolecular Condensate-Based Artificial Organelle for Driving Compartmentalized Flux Control 2025-May-08, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00871 PMID:40339164	研究论文	该研究开发了一种基于生物分子凝聚物的人工细胞器，用于实现模块化途径区室化以精确控制代谢通量	利用工程化的生物分子凝聚物创建可编程人工细胞器，实现代谢途径的空间组织以提高生物合成效率	研究仅以2'-岩藻糖基乳糖的生物合成途径为模型系统，未在其他代谢途径中验证	开发合成生物学平台以优化区室化生物合成途径	工程化的大肠杆菌细胞	合成生物学	NA	蛋白质工程、代谢工程	NA	生物分子相互作用数据、代谢通量数据	未明确说明样本数量
40	2025-05-10	Microbiome catalog and dynamics of the Chinese liquor fermentation process 2025-May-05, Bioresource technology IF:9.7Q1 DOI:10.1016/j.biortech.2025.132620 PMID:40334798	research paper	该研究构建了中国白酒发酵过程中微生物的基因目录，揭示了发酵食品的独特性和高代谢潜力	建立了最大的发酵食品基因资源库MTFGC，发现了20%的新物种和新基因，以及25,625个生物合成基因簇（BGCs）	研究主要关注中国白酒发酵过程，可能不适用于其他类型的发酵食品	揭示发酵食品中微生物的多样性和动态变化，推动传统发酵向精准合成生物学的转变	中国白酒发酵过程中的微生物群落	microbiology	NA	metagenome sequencing	NA	genomic data	5,159 metagenome-assembled genomes