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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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21 | 2025-06-13 |
Methanol metabolism in synthetic methylotrophic microorganisms
2025-Jun-09, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108623
PMID:40499848
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review | 本文深入探讨了甲醇代谢途径及合成甲基营养微生物的代谢工程进展 | 重点介绍了人工甲基营养中创新的C1同化途径 | NA | 增强对甲醇代谢的理解并释放合成甲基营养菌的工业潜力 | 合成甲基营养微生物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
22 | 2025-06-13 |
Molecular engineering and biotechnological advancements in β-glucosidase for industrial impact: A review
2025-Jun-09, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.145133
PMID:40499858
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综述 | 本文综述了β-葡萄糖苷酶(BGL)在分子工程和生物技术方面的进展及其工业应用 | 讨论了多种酶工程策略,如异源表达、CRISPR-Cas9基因编辑和组学方法,以提高BGL的催化性能和工业适用性 | 尽管有多种改进策略,BGL的低催化效率、窄底物特异性和对操作条件的敏感性仍限制其大规模应用 | 提高β-葡萄糖苷酶的催化性能和工业应用潜力,以促进可持续和经济的生物转化过程 | β-葡萄糖苷酶(BGL)及其在工业中的应用 | 生物技术 | NA | CRISPR-Cas9, 组学方法(基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学), 酶固定化 | NA | NA | NA |
23 | 2025-06-13 |
Unraveling the regulatory dynamics of bidirectional promoters for modulating gene co-expression and metabolic flux in Saccharomyces cerevisiae
2025-Jun-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf511
PMID:40503683
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研究论文 | 本研究通过全基因组筛选和表征酵母中的双向启动子(BDPs),揭示了其调控机制并应用于代谢通量的精细调控 | 利用AI预测模型DREAM-CNN识别BDP中的保守激活剂结合热点,为合成启动子的理性设计提供了新方法 | 研究仅针对酵母Saccharomyces cerevisiae中的BDPs,未在其他生物体中验证 | 解析双向启动子的调控机制并开发其在合成生物学中的应用 | 酵母Saccharomyces cerevisiae中的749个双向启动子候选序列 | 合成生物学 | NA | 全基因组筛选、转录组分析、荧光报告基因分析、计算机模拟诱变 | DREAM-CNN | 基因组数据、转录组数据 | 749个双向启动子候选序列 |
24 | 2025-06-13 |
Biosourced Functional Hydroxybenzoate-co-Lactide Polymers with Antimicrobial Activity
2025-Jun-04, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c04624
PMID:40380948
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研究论文 | 研究通过合成生物学和化学方法设计和制备具有抗菌活性的生物源功能羟基苯甲酸-丙交酯共聚物 | 利用工程真菌宿主异源生产单体前体,并通过化学修饰和开环聚合制备具有抗菌活性的可降解聚合物 | 仅针对革兰氏阳性菌进行了抗菌活性测试,未涉及其他类型病原体 | 开发具有抗菌活性的可降解生物源聚合物 | 4-(甲基/烯丙基/苄基)氧-6-(H/烷基)-2-氧-苯甲酸-丙交酯基聚合物库 | 合成生物学与高分子化学 | 抗菌药物耐药性 | 异源生产、化学修饰、开环聚合 | NA | 化学合成数据 | 不同聚合度的聚合物(M/I = 5-30) |
25 | 2025-06-13 |
Cell-Targeting Bio-Catalytic Killer Protocell for High-Order Assembly Guided Cancer Cell Inhibition
2025-Jun, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202500047
PMID:40270292
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research paper | 该研究设计和构建了一种能够与活细胞进行高阶组装的合成治疗性原细胞,用于靶向消除癌细胞 | 通过宿主-客体化学构建正交多糖基原细胞,并引入细胞靶向配体和类过氧化氢酶铂金纳米颗粒,形成具有生物催化功能的杀手原细胞 | 目前仅进行了体外实验,尚未进行体内验证 | 开发可编程的原细胞治疗系统用于癌症治疗 | 癌细胞 | 合成生物学与生物工程 | 癌症 | 宿主-客体化学、静电驱动自组装 | NA | NA | NA |
26 | 2025-06-13 |
Base modifications reshape RNA folding landscapes and structure-function relationships in synthetic and natural RNAs
2025-May-29, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6465433/v1
PMID:40502763
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研究论文 | 研究碱基修饰如何影响RNA的三维结构及其功能 | 揭示了碱基修饰通过改变堆叠能量而非碱基配对来影响RNA的折叠和功能 | 仅研究了两种碱基修饰(5mC和N1Ψ)对RNA结构的影响 | 探讨碱基修饰对RNA折叠和功能的影响 | 工程化的RNA origami纳米结构和天然存在的核酶 | 合成生物学 | NA | Cryo-EM, FRET | NA | 结构数据 | 两种RNA结构(工程化和天然) |
27 | 2025-06-13 |
Transcription regulation by RNA-induced structural strain in duplex DNA
2025-May-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf429
PMID:40401557
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research paper | 该研究描述了一种通过RNA-DNA三链体调控转录速率的机制,并展示了其在设计的大肠杆菌启动子架构中的应用 | 揭示了RNA-DNA三链体通过引起双链DNA结构扭曲来增强或抑制转录的新机制 | 研究主要基于大肠杆菌系统,尚未在更复杂的生物体如哺乳动物中验证 | 探索非编码RNA通过形成三链体结构调控基因表达的分子机制 | RNA-DNA三链体及其对转录速率的影响 | 分子生物学 | NA | 合成生物学方法、体外表征 | NA | NA | 细菌启动子文库 |
28 | 2025-06-13 |
Expanding the σ54-dependent transcription process with orthogonal designs
2025-May-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf442
PMID:40401558
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研究论文 | 本研究通过基于知识的筛选和重新设计σ54中的RpoN盒及其配对的启动子,开发了三组基于σ54-R456H、R456Y和R456L的正交表达系统 | 开发了三组具有不同启动子偏好和理想相互正交性的σ54突变体,这些正交性可转移到三种非模式细菌中,并能与不同的bEBPs结合以响应环境或化学信号 | NA | 扩展合成生物学工具包,提供可靠且多样化的基因表达 | σ54因子及其配对的启动子 | 合成生物学 | NA | 知识筛选和重新设计 | NA | NA | NA |
29 | 2025-06-13 |
Engineering plant photoreceptors towards enhancing plant productivity
2025-May-06, Plant molecular biology
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s11103-025-01591-9
PMID:40327169
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综述 | 本文综述了植物光感受器在调节农艺重要性状中的作用,以及光感受器工程、光遗传学和合成生物学在作物改良中的应用现状和前景 | 探讨了通过光感受器工程和光遗传学技术精确调控植物生长和发育的新方法,为作物育种提供了创新思路 | NA | 提高植物生产力,优化作物育种方法 | 植物光感受器及其调控的农艺重要性状 | 合成生物学 | NA | 光遗传学、合成生物学 | NA | NA | NA |
30 | 2025-06-13 |
Bridging the gap: pathway programs for inclusion and persistence in microbiology
2025-Feb, Trends in microbiology
IF:14.0Q1
DOI:10.1016/j.tim.2024.12.007
PMID:39814665
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研究论文 | 本文概述了一个旨在为微生物学领域提供公平的高影响力研究经验和课程指导的途径项目 | 提出了一个途径项目,旨在通过噬菌体发现、合成生物学和数据科学/AI等微生物学新兴领域的培训,促进多样化的劳动力发展 | NA | 促进微生物学领域的多样化劳动力发展 | 微生物学领域的学生和研究人员 | 微生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
31 | 2025-06-13 |
Coli bond: A dual-function encryption system for secure information storage and transmission by microorganisms
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0325926
PMID:40498745
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research paper | 该论文提出了一种名为Coli Bond的双功能加密系统,利用微生物进行安全信息存储和传输 | 结合DNA存储的分子精确性与合成生物学的可控动态性,提供了一种创新的数据加密和存储平台 | 现有方法主要关注静态存储,缺乏安全可控的信息传输策略 | 开发一种安全、可控的信息存储和传输系统 | 利用合成生物学改造的大肠杆菌菌株 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | DNA编码的信息 | 实验验证了系统在各种实际条件下的稳定性和可靠性 |
32 | 2025-06-13 |
Lipase activated endocytosis-like behavior of oil-in-water emulsion
2024-10-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52802-8
PMID:39353937
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research paper | 该研究揭示了水包油乳液中脂滴的酶促反应触发的内吞样行为 | 首次展示了脂肪酶在乳滴膜上的热力学有利招募及其触发的内吞样行为 | 对人工脂滴的生物物理动态行为的理解仍不全面 | 探索水包油乳液中人工脂滴的动态行为并开发其功能化应用 | 水包油乳液中的脂滴 | 生物物理学 | NA | 酶促反应 | NA | NA | NA |
33 | 2025-06-12 |
Tryptophan-producing bacteria to mitigate osteoporosis and intestinal dysfunction
2025-Sep, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.05.013
PMID:40487243
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研究论文 | 研究通过补充产色氨酸细菌修复骨质疏松小鼠的肠道屏障功能并减轻骨质流失 | 揭示了色氨酸代谢在骨质疏松与肠道功能障碍之间的关联,并提出了一种基于合成生物学的治疗策略 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类中验证 | 探索肠道微生物代谢物色氨酸在骨质疏松和肠道功能障碍中的作用 | 骨质疏松小鼠模型和老年小鼠模型 | 合成生物学 | 骨质疏松 | 微生物代谢组学 | NA | NA | 小鼠模型 |
34 | 2025-06-12 |
Establishing a Serine Integrase-Based Genetic Memory System In Vitro
2025-Jul, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28986
PMID:40171936
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研究论文 | 本研究开发了一种基于丝氨酸整合酶的体外遗传记忆系统,用于DNA信息存储和处理 | 利用三种正交丝氨酸整合酶设计模块化、正交且可量化的体外遗传记忆系统,并成功应用于级联生物转化过程 | NA | 开发先进的体外遗传记忆系统以存储和处理遗传信息 | 基于丝氨酸整合酶的遗传记忆系统 | 合成生物学 | NA | 丝氨酸整合酶技术 | NA | DNA | NA |
35 | 2025-06-12 |
Microbial production of torulene and its potential applications: a review
2025-Jul, Food science and biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s10068-024-01780-0
PMID:40492047
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review | 本文综述了托鲁烯的微生物生产方法及其潜在应用 | 总结了当前提高托鲁烯产量的上游和下游工艺策略,并探讨了其在食品、化妆品和制药行业的潜在应用 | 托鲁烯的研究仍然有限,其商业化潜力尚未充分开发,微生物生产中的挑战需要解决 | 探讨托鲁烯的微生物生产方法及其在多个行业的潜在应用 | 托鲁烯及其生产菌株,特别是红酵母 | 生物技术 | NA | 系统生物学和合成生物学 | NA | NA | NA |
36 | 2025-06-12 |
Parallel DLD microfluidics for chloroplast isolation and sorting
2025-Jun-11, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d5lc00348b
PMID:40497380
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研究论文 | 本文介绍了一种基于微流控技术的平台,用于基于大小的叶绿体分离 | 该平台整合了四个平行的确定性侧向位移(DLD)阵列,能够在一个设备中同时分离不同大小的叶绿体,提高了分离效率和纯度 | 分离效率在50-85%之间,回收部分的纯度在17-66%之间,仍有提升空间 | 开发一种快速、自动化和可扩展的叶绿体分离方法,以应用于植物研究、生物技术和合成生物学 | 叶绿体 | 生物技术 | NA | 微流控技术,确定性侧向位移(DLD) | NA | NA | NA |
37 | 2025-06-12 |
Deciphering and Predicting Thermal and pH Stabilities of Triplex DNA under Multifactorial Conditions
2025-Jun-11, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202507190
PMID:40498537
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研究论文 | 本文通过开发高通量5DFRETMA方法,研究了环境与序列因素对三链DNA稳定性的影响 | 开发了高通量5DFRETMA方法,首次预测了不同pH/温度和离子环境下三链DNA的pH稳定性 | NA | 揭示环境和序列因素如何调节三链DNA的稳定性 | 三链DNA | 生物化学 | NA | 5DFRETMA | 预测模型 | 荧光共振能量转移数据 | 414组缓冲条件 |
38 | 2025-06-12 |
Cross and unique stress adaptation strategies of the polyextremophile Natranaerobius thermophilus to individual high salt, alkaline pH, and elevated temperature
2025-Jun-06, Journal of proteomics
IF:2.8Q2
DOI:10.1016/j.jprot.2025.105479
PMID:40482852
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研究论文 | 研究极端多环境适应菌Natranaerobius thermophilus对高盐、碱性pH和高温的交叉与独特适应策略 | 首次揭示了N. thermophilus对碱性pH和热应激的分子机制,填补了碱性特异性调控过程和热适应机制的研究空白 | 对碱性适应的机制仍不够充分,对热适应的理解仅限于基因组分析 | 解析N. thermophilus对高盐、碱性和热应激的响应机制,揭示其生存策略 | 极端多环境适应菌Natranaerobius thermophilus | 微生物学 | NA | iTRAQ定量蛋白质组学分析 | NA | 蛋白质组数据 | NA |
39 | 2025-06-12 |
Label-free high-throughput live-cell sorting of genome-wide random mutagenesis libraries for metabolic traits by Raman flow cytometry
2025-Jun-03, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2503641122
PMID:40445753
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research paper | 该论文介绍了一种基于拉曼流式细胞术的无标记高通量活细胞分选技术,用于代谢特征的基因组范围随机诱变库筛选 | 提出了一种新型的pDEP-DLD-RACS技术,能够以高精度、高通量和高效率分选代谢特征突变的活细胞,相比传统方法具有显著的时间和成本优势 | NA | 开发高效筛选代谢特征突变细胞的技术平台 | 产色素和油脂的酵母细胞 | 合成生物学 | NA | 拉曼流式细胞术(RACS), 正介电泳诱导确定性横向位移(pDEP-DLD) | NA | 拉曼光谱数据 | 基因组范围随机诱变库中超过10^7个酵母突变体 |
40 | 2025-06-12 |
Transformative protein scaffold designs for dual-modality cancer applications: Advances in therapeutic delivery and molecular imaging of tumor microenvironments
2025-Jun-03, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.144881
PMID:40473172
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综述 | 本文全面分析了基于支架的递送系统在癌症免疫治疗中的最新进展,重点介绍了工程化蛋白质支架作为多功能平台的设计原则、合成方法和治疗应用 | 整合了结构生物学、计算建模和合成生物学的见解,利用AI驱动的生成模型和强化学习算法革新支架设计,同时通过无细胞蛋白质合成系统和正交翻译机制实现复杂结构的按需生产 | 在将这些有前景的平台转化为临床实践方面仍面临挑战 | 开发能够同时解决系统性毒性、肿瘤穿透不足和免疫抑制性肿瘤微环境治疗不足等问题的平台,并提供实时监测能力 | 工程化蛋白质支架 | 合成生物学 | 癌症 | AI驱动的生成模型、强化学习算法、无细胞蛋白质合成系统、正交翻译机制 | NA | NA | NA |