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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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21 | 2025-09-06 |
Advancing biomaterial innovation for tissue engineering through microbial synthetic biology: A review
2025-Sep, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.146771
PMID:40803465
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综述 | 本文回顾了微生物合成生物学在组织工程生物材料创新中的应用与前景 | 通过微生物合成生物学技术设计先进生物材料,为组织工程提供新方向 | 面临未来挑战,具体技术障碍未详细说明 | 推动组织工程生物材料创新 | 微生物宿主、合成生物学方法及工程微生物生产的生物材料 | 合成生物学 | NA | 微生物基因组修饰、代谢过程调控 | NA | NA | NA |
22 | 2025-09-06 |
Synthetic biology: pioneering the next bio revolution for a sustainable planet
2025-Sep-01, Journal of applied microbiology
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/jambio/lxaf202
PMID:40833632
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综述 | 本文综述了微生物合成生物学在推动生物基经济、应对污染、粮食安全、能源需求等全球挑战中的关键作用 | 整合多学科研究发现,强调微生物合成生物学通过模仿和增强自然系统提供环境友好解决方案的变革能力 | 需要有效的安全与伦理考量以及多方合作才能充分发挥潜力 | 探讨微生物合成生物学在应对全球可持续性挑战中的作用 | 微生物合成生物学技术及其在污染治理、农业、能源等领域的应用 | 合成生物学 | NA | 基因工程、微生物工程 | NA | 多学科研究数据 | NA |
23 | 2025-09-06 |
Microbial-Derived Anti-Cancer Compounds: Advances in Drug Discovery, Bioengineering, and Therapeutic Applications
2025-Sep-01, Anti-cancer agents in medicinal chemistry
IF:2.6Q3
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综述 | 本文综述了人工智能和纳米技术在微生物来源抗癌化合物发现与递送中的应用进展 | 整合人工智能与纳米技术加速微生物代谢物的筛选、优化及靶向递送 | 缺乏体内验证和完整的药代动力学数据,临床转化存在挑战 | 加速微生物来源抗癌化合物的发现与治疗应用 | 微生物代谢物及其衍生的生物活性化合物 | 生物医学工程 | 癌症 | AI、机器学习、分子对接、QSAR建模 | NA | 分子结构数据、药效数据 | NA |
24 | 2025-09-06 |
One-pot cloning and protein expression platform for genetic engineering
2025-Aug-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.28.672974
PMID:40909620
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研究论文 | 介绍一种集成突变、质粒组装和功能蛋白测试的一锅法克隆与蛋白表达平台 | 将Golden Gate克隆与无细胞转录翻译结合,实现无需中间纯化或细菌扩增的遗传变体高效生成与筛选 | NA | 开发高通量克隆和蛋白质工程的通用自动化方法 | 荧光蛋白、荧光素酶、抗生素转化酶及紫色素生物合成途径 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆、无细胞转录翻译 | NA | NA | NA |
25 | 2025-09-06 |
Active learning-guided optimization of cell-free biosensors for lead testing in drinking water
2025-Aug-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.20.671382
PMID:40894645
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研究论文 | 开发一种基于机器学习的多目标优化方法,用于工程化基于变构转录因子的生物传感器,以检测饮用水中的铅污染 | 提出使用方向性标签的机器学习模型和多目标优化框架,同时优化生物传感器的灵敏度和选择性 | NA | 优化基于变构转录因子的生物传感器性能,用于饮用水铅污染检测 | 变构转录因子PbrR及其突变体 | 合成生物学 | NA | 机器学习,无细胞基因表达,定向进化 | 机器学习模型(具体类型未指定) | 序列到功能数据 | NA |
26 | 2025-09-06 |
Toward a monocot SynBio toolkit: assessing regulatory element performance and eudicot compatibility
2025-Aug-08, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-025-03583-x
PMID:40779074
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研究论文 | 本研究构建并评估了一个用于单子叶植物合成生物学的遗传调控元件工具包,旨在增强转基因表达的可调性 | 开发了包含80个元件的组合库,首次系统评估了病毒、微生物和植物来源的调控元件在单子叶植物中的性能,并发现了新型3'UTR序列能显著增强报告基因表达 | 研究主要在玉米原生质体和本氏烟叶片中进行瞬时表达实验,尚未在稳定转化的单子叶植物中进行长期验证 | 解决禾谷类作物遗传工程中合适调控元件相对缺乏的问题,为单子叶植物合成生物学应用提供可调转基因表达工具 | 玉米原生质体和本氏烟叶片作为实验系统 | 合成生物学 | NA | 原生质体转化、农杆菌浸润、荧光测定法 | NA | 荧光表达数据 | 80个遗传调控元件组合在玉米原生质体和本氏烟叶片中进行测试 |
27 | 2025-09-06 |
Advancements in DNA-Driven Precision Modulation of Cell Surface Receptor for Programmable Cellular Functions
2025-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202505073
PMID:40588818
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综述 | 本文全面总结了基于DNA的策略作为受体工程多功能平台的最新进展,涵盖遗传和非遗传方法 | 整合DNA逻辑电路和纳米机器人实现受体信号的可编程自主控制,推动智能细胞系统发展 | NA | 通过DNA技术精确调控细胞表面受体以实现可编程细胞功能 | 细胞表面受体及其信号传导机制 | 合成生物学 | NA | DNA纳米技术、功能核酸(FNAs)、DNA折纸、位点定向诱变 | NA | NA | NA |
28 | 2025-09-06 |
A simple and universal quasi-modular cloning system using NEBuilder® HiFi DNA assembly kit
2025 May-Jun, BioTechniques
IF:2.2Q4
DOI:10.1080/07366205.2025.2542012
PMID:40819309
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研究论文 | 开发了一种基于NEBuilder HiFi DNA组装试剂盒的准模块化克隆系统,用于非模式生物中的DNA片段组装 | 利用单链寡核苷酸桥接技术实现可重复使用DNA片段的组装,无需限制性内切酶 | NA | 扩展模块化克隆系统的应用范围至非模式生物 | 厌氧肠道真核生物ST7-B | 合成生物学 | NA | NEBuilder HiFi DNA组装技术,寡核苷酸桥接组装 | NA | DNA序列数据 | 使用ST7-B作为测试案例,构建了多种启动子-终止子组合的载体 |
29 | 2025-09-06 |
Mapping variation in dual use risk assessments of synthetic biology projects
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1620678
PMID:40895722
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研究论文 | 本研究通过评估合成生物学项目的双重用途风险,揭示了专家和学生评审在风险认知和管理策略上的显著差异 | 首次对现实世界合成生物学项目进行双重用途风险评估的实证研究,揭示了评审者间存在显著判断差异 | 样本规模有限(18名专家和49名学生),仅评估了四个项目,可能影响结果的普适性 | 分析双重用途研究关切(DURC)风险评估的一致性和准确性,改进风险管理方法 | 合成生物学项目 | 生物安全 | NA | 修改版美国政府对生命科学双重用途研究监管政策的配套指南框架 | NA | 专家评审数据 | 18名经验丰富的DURC评审专家和49名合成生物学学生 |
30 | 2025-09-05 |
Versatile Applications of CRISPR-Based Programmable T-DNA Integration in Plants
2025-Sep-04, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70353
PMID:40905066
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研究论文 | 本研究开发并验证了基于CRISPR的靶向T-DNA整合技术(CRISTTIN),用于植物基因功能研究和转基因表达的精确调控 | 发现传统Cas9在CRISTTIN中的性能优于设计的Cas9-适配体融合核酸酶,并展示了该技术在多重基因编辑、报告基因整合和转录调控中的多样化应用 | NA | 开发植物基因组中靶向T-DNA整合的新方法,以克服随机整合的局限性 | 拟南芥和水稻 | 合成生物学 | NA | CRISPR, Agrobacterium介导的T-DNA整合 | NA | NA | NA |
31 | 2025-09-05 |
Dynamic membranization results in core-shell coacervates that selectively localize particles and small molecules
2025-Sep-04, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d5cc02423d
PMID:40905114
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研究论文 | 开发了一种动态多相凝聚系统,模拟细胞区室化实现选择性分子分配 | pH响应性平台可根据极性分离酶促产物并具有增强的胶体稳定性 | NA | 构建用于催化、合成生物学和仿生化学系统的多相凝聚体系 | 颗粒和小分子 | 合成生物学 | NA | 多相凝聚技术 | NA | NA | NA |
32 | 2025-09-05 |
CELLM: Bridging Natural Language Processing and Synthetic Genetic Circuit Design with AI
2025-Sep-04, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00391
PMID:40905372
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研究论文 | 本研究开发了一个结合自然语言处理与合成生物学工具CELLO的集成系统,用于自动化设计和优化遗传电路 | 首次将大型语言模型(如DeepSeek-R1、Phi-4)与合成生物学设计工具CELLO集成,实现自然语言到功能性生物设计的直接转换 | NA | 通过AI技术降低遗传电路设计的复杂性,使非生物工程专家也能参与设计 | 遗传电路的设计与优化 | 自然语言处理 | NA | 大型语言模型(LLM)、LangChain框架、Cello v2.1软件 | DeepSeek-R1, Phi-4 | 文本 | NA |
33 | 2025-09-05 |
Topology-Engineered Guide RNAs for Programmable Control of CRISPR/Cas Activity
2025-Sep-04, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202511756
PMID:40905590
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综述 | 本文总结了拓扑工程化向导RNA(TE-gRNAs)在实现CRISPR/Cas系统可编程控制方面的策略、优势与挑战 | 通过设计聚合物、环状和树枝状等明确拓扑结构,实现CRISPR活性的空间控制、可逆性和程序化激活 | NA | 提升CRISPR/Cas系统的时间与条件控制精度 | 拓扑工程化向导RNA(TE-gRNAs) | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas系统,化学响应连接器,刺激敏感基团 | NA | NA | NA |
34 | 2025-09-05 |
Intelligent Design of Escherichia coli Terminators by Coupling Prediction and Generation Models
2025-Sep-04, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00429
PMID:40905909
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研究论文 | 本研究通过结合预测模型和生成模型,实现了大肠杆菌终止子的智能设计 | 首次将序列特征和热力学特征结合用于终止子强度预测,并采用GAN生成终止子序列 | 预测模型性能仍有提升空间(R²=0.72),实验验证样本量有限(18个终止子) | 开发计算工具准确预测和生成大肠杆菌终止子序列 | 大肠杆菌内在终止子 | 合成生物学 | NA | 机器学习,生成对抗网络(GAN) | GAN,机器学习模型 | DNA序列数据 | 使用内在终止子训练数据,实验验证18个生成终止子 |
35 | 2025-09-05 |
Heavy metals toxicity in plants: understanding mechanisms and developing coping strategies for remediation: a review
2025-Sep-04, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-025-00930-4
PMID:40906247
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综述 | 本文综述重金属对植物的毒性机制及基于自然的生物修复策略 | 强调分子生物学和合成生物学在增强生物修复效率方面的最新进展,包括超积累植物和抗金属微生物的基因工程 | NA | 理解重金属毒性机制并开发可持续的环境修复策略 | 植物及微生物系统 | 环境生物技术 | NA | 分子生物学技术、合成生物学、基因工程 | NA | 文献数据 | NA |
36 | 2025-09-05 |
Creating a designer cyanobacterial ecosystem for the sustainable production of biomass rich in sun-protecting compounds: mycosporine-like amino acids and scytonemin
2025-Sep-04, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04450-9
PMID:40906293
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综述 | 探讨通过合成生物学策略构建蓝藻生态系统以可持续生产富含紫外线防护化合物生物质的研究 | 提出利用基因和代谢工程优化蓝藻菌株代谢途径的创新生物技术方法,以提高紫外线防护化合物的产量 | 蓝藻中有益代谢物浓度通常较低,使得工业化规模生产在经济上不可行 | 开发可持续生产富含紫外线防护化合物(如MAAs和scytonemin)的高质量蓝藻生物质 | 蓝藻及其代谢产物 | 合成生物学 | NA | 基因工程、代谢工程 | NA | NA | NA |
37 | 2025-09-05 |
Engineering Motile Coacervate Droplets via Nanomotor Stabilization
2025-Sep-03, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c09366
PMID:40834351
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研究论文 | 通过纳米马达稳定化技术构建可运动的凝聚液滴人工细胞 | 首次通过金纳米颗粒涂覆的纳米马达与三元共聚物膜协同稳定凝聚相界面,实现光驱运动功能的有效传递 | NA | 开发具有运动功能的人工细胞系统 | 凝聚液滴人工细胞 | 合成生物学 | NA | 表面等离子体热效应、静电相互作用 | NA | NA | NA |
38 | 2025-09-05 |
Bacterial exopolysaccharides and live biotherapeutics: Orchestrating immune modulation and therapeutic potential in the gut microbiome era
2025-Sep-02, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2025.118510
PMID:40902409
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综述 | 本文综述了肠道微生物产生的胞外多糖(EPS)在免疫调节中的关键作用及其作为活生物治疗剂的治疗潜力 | 系统阐述EPS通过特定结构基序与宿主模式识别受体相互作用实现精准免疫调控的创新机制,并提出工程化活生物治疗剂原位生产定制化EPS的新策略 | 存在结构功能认知缺口,特定结构基序与可预测免疫结果之间的关联性尚未明确,且可扩展、可重复的生产方法仍面临挑战 | 探讨肠道微生物胞外多糖的免疫调节功能及治疗应用开发 | 肠道共生菌和益生菌产生的免疫调节性胞外多糖 | 合成生物学 | 免疫相关疾病 | 合成生物学技术、理性工程设计 | NA | 文献数据 | NA |
39 | 2025-09-05 |
Guns 'N Roses: Fungal Volatile Warfare in Postharvest Disease Control
2025-Sep, Annual review of phytopathology
IF:9.1Q1
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综述 | 本文综述了真菌挥发性有机化合物在采后病害生物防治中的作用、化学多样性及应用前景 | 系统探讨真菌挥发性化合物作为生物熏蒸剂的创新应用,并提出结合定向诱变、合成生物学和人工智能的未来研究方向 | NA | 研究采后病害的生物防治方法,特别关注真菌挥发性有机化合物的作用机制与应用 | 植物病原微生物、食品腐败微生物、真菌挥发性有机化合物 | NA | NA | 生物熏蒸、定向诱变、合成生物学、人工智能分析化学 | NA | 化学化合物数据 | NA |
40 | 2025-09-05 |
A fragment in the 5' untranslated region of alcohol oxidase 1 promoter significantly influencing gene expression of Komagataella phaffii
2025-Sep-01, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2025.149745
PMID:40902693
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研究论文 | 本研究在Komagataella phaffii的醇氧化酶1启动子5'非翻译区鉴定出一个13bp的负调控顺式作用元件D3,敲除该片段可使异源蛋白表达提高3.5倍 | 首次发现并验证了醇氧化酶1启动子中D3片段作为负调控元件的功能,通过敲除该片段显著提升异源蛋白表达效率 | NA | 探究Komagataella phaffii醇氧化酶1启动子调控异源蛋白表达的分子机制 | Komagataella phaffii酵母及其醇氧化酶1启动子 | 合成生物学 | NA | 基因片段敲除、转录组分析、电泳迁移率变动分析、DNA pull-down assay、液相色谱-质谱联用 | NA | 基因序列数据、蛋白质表达数据、转录组数据 | NA |