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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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21 | 2025-05-13 |
Overcoming ice: cutting-edge materials and advanced strategies for effective cryopreservation of biosample
2025-Mar-07, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03265-6
PMID:40050919
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review | 本文综述了克服冷冻保存中冰形成和生长挑战的前沿材料和先进策略 | 强调了多学科进展在冷冻保存技术中的重要性,包括合成生物学、纳米技术、微流体和3D生物打印等技术的结合 | 当前冷冻保护剂(CPAs)存在细胞毒性问题,且冷冻保存技术并非总是有效 | 探讨高效冷冻保存生物样本的方法和技术 | 生物样本,包括细胞和组织 | 生物医学工程 | NA | 冷冻保存技术、纳米技术、微流体、3D生物打印 | NA | NA | NA |
22 | 2025-05-13 |
Crystal structures of monomeric BsmI restriction endonuclease reveal coordinated sequential cleavage of two DNA strands
2025-Mar-07, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-07612-z
PMID:40055548
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研究论文 | 本文介绍了BsmI限制性内切酶的单体晶体结构,揭示了其协调顺序切割两条DNA链的机制 | 发现了BsmI单体中两个不同活性位点的独特结构组成,并提出了顺序切割机制 | AlphaFold3预测的模型不正确,可能影响部分结构解析的准确性 | 研究BsmI限制性内切酶的结构和功能机制 | BsmI限制性内切酶及其变体Nt*.BsmI | 结构生物学 | NA | X射线晶体学 | NA | 晶体结构数据 | NA |
23 | 2025-05-13 |
Bacterial DNA methylases as novel molecular and synthetic biology tools: recent developments
2025-Mar-06, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-025-13442-0
PMID:40047928
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综述 | 本文综述了细菌DNA甲基化酶的类型、靶向甲基化或去甲基化的主要技术,以及这些酶在分子和合成生物学中的最新作用 | 探讨了细菌甲基化酶作为分子和合成生物学工具的新颖应用,包括通过融合蛋白实现靶向甲基化 | 需要进一步研究以确定更多细菌甲基化酶的特性,以发现新的合成和分子生物学工具 | 探讨细菌DNA甲基化酶在分子和合成生物学中的应用及其潜在价值 | 细菌DNA甲基化酶及其在遗传工程、细菌学、生物技术和农业中的应用 | 合成生物学 | NA | 靶向甲基化或去甲基化技术,包括使用锌指蛋白(ZF)、转录激活因子样效应子(TALE)或CRISPR/dCas9的融合蛋白 | NA | NA | NA |
24 | 2025-05-13 |
SynBioNanoDesign: pioneering targeted drug delivery with engineered nanomaterials
2025-Mar-06, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03254-9
PMID:40050980
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review | 本文综述了合成生物学在推动工程纳米材料用于靶向药物递送系统中的关键作用 | 探讨了合成生物学与纳米技术的融合,以及如何通过生物原理设计新型纳米材料 | 讨论了SynBioNanoDesign在药物递送中的挑战、当前弱点及伦理和社会影响 | 探索合成生物学和纳米技术在靶向药物递送系统中的协同作用 | 工程纳米材料及其在靶向药物递送中的应用 | 生物医学工程 | NA | 合成生物学工具 | NA | NA | NA |
25 | 2025-05-13 |
Logic-Gated Modulation of Cell Migration via Mesoscale Mechanical Uncaging Effects
2025-03-04, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.4c16194
PMID:39980204
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research paper | 该研究展示了通过DNA折纸纳米弹簧系统精确控制癌细胞迁移的机械笼/解笼效应 | 利用DNA作为编程语言创建响应不同miRNA输入的逻辑门(布尔AND和OR门),通过DNA折纸纳米弹簧的机械和结构变化解笼RGD配体,从而抑制癌细胞迁移 | 研究尚处于概念验证阶段,未来需要进一步验证其在合成生物学和精准医学中的实际应用效果 | 探索通过机械解笼效应精确控制癌细胞迁移的方法,并应用于靶向药物递送 | 癌细胞及其迁移行为 | 合成生物学 | 癌症 | DNA折纸技术 | NA | NA | NA |
26 | 2025-05-13 |
[Biosynthesis of ganoderic acid and its derivatives]
2025-Mar, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
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综述 | 本文综述了灵芝酸及其衍生物的合成途径和代谢调控的最新研究进展 | 深入探讨了灵芝三萜的生物合成途径、关键酶基因及其功能,以及通过合成生物学技术优化实现大规模生产 | 灵芝酸的生物合成途径和分子调控机制尚未完全阐明 | 提高三萜类药理成分的高效生产和灵芝资源的开发利用 | 灵芝酸及其衍生物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
27 | 2025-05-13 |
[Functional characterization of flavonoid glycosyltransferase AmGT90 in Astragalus membranaceus]
2025-Mar, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
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研究论文 | 本研究克隆并功能表征了黄芪中的黄酮糖基转移酶AmGT90,揭示了其催化黄酮类化合物形成单糖苷和双糖苷的能力 | 首次报道了黄芪中一种能够催化黄酮类化合物形成双糖苷的糖基转移酶AmGT90,并初步探索了其催化双糖苷形成的机制 | 对AmGT90催化双糖苷形成的分子机制仍需进一步深入研究 | 研究黄芪中黄酮糖基转移酶的功能特性及其在黄酮糖苷生物合成中的作用 | 黄芪(Astragalus membranaceus)中的黄酮糖基转移酶AmGT90 | 植物生物化学 | NA | 基因克隆、系统发育树分析、体外酶反应实验 | NA | 基因序列数据、酶活性数据 | 1个糖基转移酶基因(AmGT90) |
28 | 2025-05-13 |
Decoding and reengineering the promoter specificity of T7-like RNA polymerases based on phage genome sequences
2025-Feb-27, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf140
PMID:40042813
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研究论文 | 本文通过噬菌体基因组序列解码和重新设计T7样RNA聚合酶的启动子特异性 | 揭示了T7样RNA聚合酶与启动子之间相互作用的特异性主要由少数关键位置的氨基酸和核苷酸残基编码,并设计了一组正交性更强的T7 RNAP-启动子变体 | 研究主要关注T7样RNA聚合酶,其他类型的ssRNAPs可能具有不同的特异性规则 | 揭示RNA聚合酶与启动子之间的特异性相互作用规则,并设计新型RNAP-启动子对 | 噬菌体基因组中的T7样RNA聚合酶及其启动子 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、序列共变分析 | NA | 基因组序列 | 多种噬菌体基因组中的T7样RNA聚合酶及其启动子 |
29 | 2025-05-13 |
The mutational landscape of Bacillus subtilis conditional hypermutators shows how proofreading skews DNA polymerase error rates
2025-Feb-27, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf147
PMID:40057377
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研究论文 | 本文研究了枯草芽孢杆菌中DNA聚合酶校对缺陷对突变率的影响 | 通过构建条件性高突变株,揭示了DNA聚合酶校对如何影响突变率并扭曲核苷酸选择性偏差 | 研究结果可能受到突变异质性和野生型突变途径未知因素的影响 | 解析DNA聚合酶初始核苷酸选择性、校对和错配修复对突变率的贡献 | 枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis) | 分子生物学 | NA | 突变积累实验、数学模型分析 | NA | 基因组突变数据 | 多个条件性高突变株(polC校对缺陷和/或mutL缺陷) |
30 | 2025-05-13 |
[Research progress on biosynthesis of triterpenoids in Centella asiatica]
2025-Feb, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
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review | 本文综述了积雪草三萜皂苷的生物合成研究进展及其生物活性 | 总结了积雪草三萜皂苷生物合成途径、代谢调控及异源生物合成的最新研究进展 | NA | 为积雪草活性成分的综合资源开发和生物技术合成提供参考 | 积雪草三萜皂苷 | 合成生物学 | NA | 多组学、分子生物学、合成生物学 | NA | NA | NA |
31 | 2025-05-13 |
Molecular aspects of regeneration in insects
2024-03, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2023.12.011
PMID:38160963
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review | 本文综述了昆虫再生现象的分子机制及其在再生医学中的应用潜力 | 强调了表观遗传调控在昆虫再生过程中的关键作用,并探讨了其在合成生物学和人类健康领域的潜在应用 | 未提及具体实验数据或样本量,可能缺乏实证支持 | 探索昆虫再生的分子基础及其在再生医学中的潜在应用 | 昆虫的再生过程及相关信号分子 | 再生医学 | NA | NA | NA | NA | NA |
32 | 2025-05-13 |
Engineering the bilayer: Emerging genetic tool kits for mechanistic lipid biology
2021-12, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2021.05.013
PMID:34218059
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research paper | 本文探讨了利用合成生物学和代谢工程策略控制细胞膜脂质组成、物理化学性质及功能的新方法 | 提出了可调控表达平台和异源表达生物合成基因的新策略,用于精确控制膜脂质组化学计量比和功能 | 文章未明确提及具体实验验证数据或应用案例 | 开发控制细胞膜脂质组成和功能的合成生物学工具 | 细胞膜脂质代谢和运输途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、异源基因表达 | NA | NA | NA |
33 | 2025-05-13 |
Digital switching in a biosensor circuit via programmable timing of gene availability
2014-Dec, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/nchembio.1680
PMID:25306443
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研究论文 | 该研究展示了通过可编程的基因可用性时间控制,利用位点特异性重组酶在多基因电路中纠正不良效应,显著提高了生物传感器电路的性能 | 利用位点特异性重组酶实现基因可用性的可编程时间控制,显著降低生物传感器电路的本底泄漏并提高动态范围 | NA | 提高合成生物学中基因电路的稳健性和性能 | 内源性microRNA (miRNA) 的比例传感器和多基因电路 | 合成生物学 | NA | 位点特异性重组酶技术 | NA | 基因表达数据 | NA |
34 | 2025-05-12 |
Myxobacteria: Versatile cell factories of novel commercial enzymes for bio-manufacturing
2025-May-08, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108594
PMID:40345460
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综述 | 本文综述了粘细菌作为新型商业酶多功能细胞工厂在生物制造中的应用 | 强调了粘细菌在生物技术应用中的潜力,特别是在新型酶和生物质转化资源发现方面的最新进展 | 遗传工程挑战、生长缓慢以及代谢重塑和表达策略的限制阻碍了粘细菌细胞工厂的构建 | 探索粘细菌及其酶在农业和工业中的潜在应用 | 粘细菌及其产生的酶 | 生物技术 | NA | 生物勘探和计算方法 | NA | NA | NA |
35 | 2025-05-12 |
A novel interpretability framework for enzyme turnover number prediction boosted by pre-trained enzyme embeddings and adaptive gate network
2025-May, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2025.02.010
PMID:40021034
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research paper | 提出了一种新的可解释性框架GELKcat,用于预测酶转换数(kcat),结合了预训练的酶嵌入和自适应门网络 | 利用图变换器进行底物分子编码和CNN进行酶word2vec嵌入,通过自适应门网络整合底物和酶特征,提高了kcat预测的准确性和可解释性 | 性能仍依赖于酶和底物特征提取的有效性以及这两种特征的最优融合 | 改进酶转换数(kcat)的预测方法,为药物发现和合成生物学提供指导 | 酶和底物分子 | machine learning | NA | graph transformers, CNNs, word2vec | GELKcat (结合graph transformers和CNNs) | 分子结构数据 | 多物种酶-底物对转换数数据 |
36 | 2025-05-12 |
Advances in engineering substrate scope of Pseudomonas cell factories
2025-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103270
PMID:39978295
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research paper | 探讨如何通过代谢工程、合成生物学和实验室进化增强假单胞菌的底物范围,以利用多样化的废物衍生底物 | 提出利用假单胞菌作为新一代工业生物技术宿主,并通过工程手段扩展其底物范围,以利用废物衍生底物 | 自然分离的假单胞菌可能不适合高要求的生物技术应用 | 扩展和维持生物工艺,探索新的微生物宿主和废物衍生底物 | 假单胞菌及其代谢工程 | 工业生物技术 | NA | 代谢工程、合成生物学、实验室进化 | NA | NA | NA |
37 | 2025-05-12 |
Improving Bacillus subtilis as Biological Chassis Performance by the CRISPR Genetic Toolkit
2025-Mar-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00844
PMID:40040244
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review | 本文讨论了CRISPR基因工具包在提高枯草芽孢杆菌作为生物底盘性能中的应用 | 介绍了CRISPR技术在枯草芽孢杆菌中的最新进展,包括基因编辑、转录调控和酶调节 | 未提及具体实验数据或样本量,可能缺乏实证支持 | 提高枯草芽孢杆菌作为工业底盘菌的性能,使其能与传统工业微生物如大肠杆菌和酵母相媲美 | 枯草芽孢杆菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR | NA | NA | NA |
38 | 2025-05-12 |
Bacteria-Mediated Intracellular Radical Polymerizations
2025-Mar-19, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.4c17257
PMID:40036043
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研究论文 | 本文展示了细菌细胞通过天然生物分子触发的原子转移自由基反应,在细胞内引发多种丙烯酰胺、丙烯酸和甲基丙烯酸单体的聚合 | 揭示了细菌细胞作为活体催化剂用于聚合物生产的未开发潜力,并展示了基于原子转移自由基聚合引发剂的细胞内聚合作为一种生物正交工具用于细胞工程和合成生物学 | NA | 探索细菌细胞内自由基聚合的机制及其在细胞工程和合成生物学中的应用 | 细菌细胞和多种丙烯酰胺、丙烯酸及甲基丙烯酸单体 | 合成生物学 | NA | 原子转移自由基聚合 | NA | NA | NA |
39 | 2025-05-12 |
A long road ahead to reliable and complete medicinal plant genomes
2025-Mar-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57448-8
PMID:40032878
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research paper | 本文探讨了药用植物基因组测序的现状与挑战,并提出了提高基因组组装质量的策略 | 提出了在药用植物基因组研究中应用前沿基因组学技术,并借鉴作物基因组学研究的经验 | 目前仅有11个无间隙的端粒到端粒基因组组装,许多基因组仍存在组装和注释缺陷 | 提高药用植物基因组的组装质量和完整性,以促进功能基因组学和合成生物学应用 | 药用植物基因组 | 基因组学 | NA | 长读长DNA测序 | NA | 基因组数据 | 超过400个来自203种植物的基因组 |
40 | 2025-05-12 |
Advancements in Escherichia coli secretion systems for enhanced recombinant protein production
2025-Mar-03, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04302-0
PMID:40025370
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综述 | 本文综述了大肠杆菌分泌系统在增强重组蛋白生产方面的进展 | 探讨了天然和工程化分泌系统,以及基因工程、诱变和合成生物学方法的最新进展 | 大肠杆菌的细胞能力有限,且存在蛋白质聚集问题 | 提高重组蛋白的产量、折叠和分泌效率 | 大肠杆菌及其分泌系统 | 微生物学 | NA | 基因工程、诱变、合成生物学 | NA | NA | NA |