合成生物学相关文章
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当前共找到 5142 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-06-13 |
Development of Bacillus subtilis cell factories for nutraceuticals production
2026-Jun-06, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05068-9
PMID:42250015
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综述 | 系统总结了利用枯草芽孢杆菌细胞工厂生产保健品的合成生物学工具和代谢工程策略 | 全面比较了不同工程策略的局限性并强调其在保健品生物合成中的应用 | 当前挑战包括生产效率和经济性仍需提升 | 开发枯草芽孢杆菌作为高效生产保健品的底盘细胞 | 枯草芽孢杆菌细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具、代谢工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 枯草芽孢杆菌 | 代谢途径 | 工业生物技术 |
| 22 | 2026-06-13 |
Untapped microbial factories for next-generation therapeutics: Endophytic fungi of medicinal plants
2026-Jun-04, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-026-03036-4
PMID:42243878
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综述 | 本文综述了药用植物内生真菌作为下一代治疗药物可持续来源的潜力 | 整合多组学技术与合成生物学方法，系统阐述了内生真菌中生物活性次生代谢物的发现与产量优化策略 | 低产量、沉默基因簇和大规模生产困难等挑战仍待解决 | 探索内生真菌作为生物工厂生产治疗药物的潜力 | 药用植物内生真菌及其产生的生物活性次生代谢物 | 数字病理学 | NA | OSMAC、共培养、表观遗传修饰、基因组学、转录组学、代谢组学 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 药用植物内生真菌 | 生物合成基因簇、代谢途径 | 医学、药物 |
| 23 | 2026-06-13 |
Rational assembly of synthetic marine biofilm community with chitinase production
2026-Jun-04, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-9419003/v1
PMID:42282017
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研究论文 | 利用自上而下的方法理性组装具有几丁质酶活性的合成海洋生物膜群落 | 首次采用自上而下的组装策略，利用天然海洋细菌设计多功能生物膜群落，实现目标功能几丁质酶的产生，并展示了多物种生物膜在入侵挑战中的集体韧性 | 研究局限于实验室条件下的短期观察（7天），未探讨更长时间尺度下的群落稳定性；仅评估了一种目标功能（几丁质酶），其他潜在功能未涉及 | 设计具有几丁质酶生产功能的多物种生物膜，利用天然海洋细菌实现目标功能工程化 | 17种初始分离的海洋细菌及其组装形成的多物种生物膜 | 合成生物学，微生物组工程 | NA | 自上而下的群落组装，几丁质酶活性检测 | NA | 生物膜组成数据，酶活性数据 | 17种初始海洋细菌分离株，14种成员组成的最终群落 | NA | 天然海洋细菌 | 几丁质酶生产功能电路 | 海洋微生物组工程，生物技术 |
| 24 | 2026-06-13 |
Coupled intracellular redox and extracellular respiration sensing for quantitative oxidative stress profiling
2026-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.30.727573
PMID:42282784
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研究论文 | 提出一种结合基因编码的氧化还原生物传感器和光学氧传感器的双荧光传感平台，用于工业酵母系统中细胞内活性氧和耗氧率的并行、非侵入性定量测定 | 首次将细胞内氧化还原生物传感器与胞外氧气传感集成，实现对酵母氧化应激的动态监测，并识别出不同酵母的独特氧化还原-呼吸表型 | NA | 开发一种定量评估细胞氧化应激的方法，通过同时测量细胞内氧化还原状态和胞外呼吸活性 | 两种工业酵母菌株（Crabtree阳性酵母和专性呼吸酵母） | 合成生物学 | NA | 双荧光传感、基因编码生物传感器、光学氧传感 | NA | 荧光强度、氧气消耗率 | 两种酵母菌株（具体数目未提及） | NA | 酿酒酵母（Crabtree阳性酵母）、专性呼吸酵母 | NA | 生物制造、合成生物学 |
| 25 | 2026-06-13 |
Combining model-based and data-driven models: An application to synthetic biology resource competition
2026-Jun, Mathematical biosciences
IF:1.9Q3
DOI:10.1016/j.mbs.2026.109649
PMID:41791590
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研究论文 | 探索机器学习与机理模型在合成生物学资源竞争问题中的融合，提出部分不确定模型结构和嵌入式物理信息神经网络方法 | 提出部分不确定模型结构概念以防机器学习忽略机理约束，引入嵌入式物理信息神经网络方法，无缝融合机器学习和机理模型组件 | 机理模型构建劳动密集且依赖简化假设，机器学习可能忽视机理信息导致过拟合或可解释性降低 | 通过融合机器学习和机理模型实现更鲁棒的预测、增强系统洞察并改进对稀疏或噪声数据的处理 | 合成生物学中因资源共享导致基因电路意外行为的基因网络模型 | 机器学习 | NA | NA | 物理信息神经网络 | NA | NA | NA | NA | 基因电路 | 合成生物学 |
| 26 | 2026-06-13 |
Cytochrome P450-mediated structural diversification of diketopiperazine alkaloids
2026-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103476
PMID:41793977
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综述 | 综述细胞色素P450酶催化二酮哌嗪生物碱结构多样化的研究进展 | 强调P450酶除羟基化外的催化多样性，包括二聚化、核苷碱基偶联和分子内环化，并探讨工程化P450变体在可持续生物合成中的应用 | 未提及具体实验验证或定量比较不同P450变体的催化效率 | 总结P450酶在二酮哌嗪结构多样化中的作用，并探索合成生物学驱动的创新策略 | 细胞色素P450酶及其催化的二酮哌嗪生物碱 | 合成生物学 | NA | P450酶催化、工程化P450变体 | NA | NA | NA | 工程化P450变体 | NA | 二酮哌嗪生物合成途径 | 药物发现 |
| 27 | 2026-06-13 |
Nitrogenase regulation in Vibrio natriegens differs from other γ-proteobacteria
2026-Jun-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.30.728972
PMID:42282805
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研究论文 | 研究了费氏弧菌中固氮酶的调控机制，并发现其与γ-变形菌的其他物种存在差异 | 首次揭示了费氏弧菌中固氮酶调控的独特层次，特别是NifA能独立激活固氮酶表达而NtrBC并非必需，以及GlnB和GlnK对NtrBC的冗余抑制类似非固氮菌 | 研究主要基于实验室条件，未在自然环境或复杂生态系统中验证这些调控机制 | 阐明费氏弧菌中固氮酶在铵离子与氮气条件下的调控机制 | 费氏弧菌（Vibrio natriegens）及其固氮酶调控蛋白 | 合成生物学 | NA | 功能基因组学、定点突变、报告基因分析 | NA | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 | CRISPR-Cas9 | 费氏弧菌 | 固氮酶调控回路（包括NtrBC、PII蛋白GlnB/GlnK及NifA的层级调控） | 农业, 工业生物技术 |
| 28 | 2026-06-13 |
Combinatorial and Inducible CRISPRa/i Enables Canalized hiPSC Forward Programming and Iterative Refinement via Single-Cell Genomics
2026-Jun-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.31.729073
PMID:42282825
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研究论文 | 开发了一种名为CIRI的可组合、诱导型CRISPRa/i平台，用于人类诱导多能干细胞（hiPSCs）的前向编程和迭代优化，并结合单细胞基因组学进行调控 | 首次在hiPSCs中建立可组合、诱导型CRISPRa/i平台，利用单一dCas9实现正交的CRISPR激活和干扰，并整合单细胞RNA测序筛选进行通路优化 | 未提及具体限制，可能包括体内应用验证不足或长期稳定性问题 | 开发一种可编程的合成生物学框架，用于人类干细胞模型中的基因调控和前向编程 | 人类诱导多能干细胞（hiPSCs）及其衍生的心肌类器官和骨骼肌细胞 | 合成生物学 | NA | CRISPRa/i, 单细胞RNA测序, 四环素诱导系统 | NA | 单细胞转录组数据 | 涉及hiPSCs、hiPSC衍生的心肌类器官和骨骼肌细胞，具体样本数量未提及 | CRISPR-Cas9 | 人类诱导多能干细胞（hiPSCs） | 可组合、诱导型CRISPRa/i基因调控回路，包括四环素响应性sgRNA和模块化RNA适配体 | 医学, 生物技术 |
| 29 | 2026-06-13 |
Sugarcane Biorefinery from Component Separation to High-Value Outputs: Technical Progress and Future Perspectives
2026-May-26, Foods (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/foods15111877
PMID:42279664
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综述 | 系统总结了甘蔗汁、蔗渣和滤泥的高值化利用途径，并提出甘蔗加工全组分高值化利用框架 | 构建'甘蔗加工树'全组分高值化框架，定量揭示功能糖高利润、蔗渣预处理成本占比40-50%以及滤泥粗蜡回收率仅5-8%等关键瓶颈，并提出耦合生物炼制、合成生物学和标准化框架的未来方向 | 当前瓶颈包括预处理效率低、菌株性能不佳和分离成本高 | 解决甘蔗加工单一产品依赖和副产品利用率低的问题，推动低碳循环转型 | 甘蔗汁、蔗渣、滤泥 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术、农业 |
| 30 | 2026-06-13 |
Molecular recruitment and release using DNA host condensates
2026-May-12, Nanoscale horizons
IF:8.0Q1
DOI:10.1039/d5nh00586h
PMID:41774821
|
研究论文 | 使用DNA宿主凝聚体实现分子招募与释放 | 在DNA纳米星中整合适配体以构建具有招募和释放目标生物分子能力的凝聚体，并研究适配体位置对凝聚和招募效率的影响 | 仅研究了链霉亲和素（SA）一种模型蛋白，且适配体定位对凝聚和招募无显著影响可能限制了设计灵活性 | 探索DNA纳米星凝聚体作为可调控分子招募与释放平台的潜力 | DNA纳米星凝聚体及其招募的链霉亲和素（SA）分子 | 合成生物学 | NA | DNA纳米自组装、适配体技术 | NA | 实验数据 | 未明确说明 | DNA纳米星 | 无细胞系统 | 适配体修饰的DNA纳米星凝聚体 | 合成生物学 |
| 31 | 2026-06-13 |
Beyond text generation: large language models as autonomous agents for orchestrating synthetic biology cycles
2026-May, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134309
PMID:41763131
|
综述 | 探讨大语言模型作为自主智能体在合成生物学设计-构建-测试-学习周期中的协同作用 | 将LLM定位为自主智能体而非单纯预测工具，提出语义驱动范式替代传统人工特征工程，并系统分析不同LLM架构与生物任务的适配性 | 计算成本、模型可解释性及伦理治理挑战 | 推动合成生物学在可持续制造、医学等领域突破 | 大语言模型在合成生物学中的应用范式 | 自然语言处理, 合成生物学 | NA | 大语言模型 | 各类LLM架构 | 生物序列数据 | NA | NA | NA | NA | 医药, 可持续制造 |
| 32 | 2026-06-13 |
Engineering non-ribosomal peptide synthesis: tuning the antibiotics engine of the microbial world
2026-May, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2026.2615819
PMID:41771683
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综述 | 综述通过合成生物学工程非核糖体肽合成酶以优化抗菌肽产量和活性的研究进展 | 系统总结了通过前体代谢工程、代谢流调控、强启动子和调控因子引入以及异源表达等策略提升非核糖体肽产量和生物活性的方法，并指出糖肽类抗生素作为合成生物学工程新方向的潜力 | 未提及具体实验数据验证或比较不同工程策略的效率，且综述范围可能未涵盖所有非核糖体肽类型 | 综述通过合成生物学方法工程改造非核糖体肽合成酶，以提高产量和生物活性 | 非核糖体肽合成酶及其生产的抗菌肽，特别是糖肽类抗生素 | 合成生物学 | NA | 非核糖体肽合成酶工程、代谢工程、启动子工程、异源表达 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 33 | 2026-06-13 |
A synthetic angiotensin II/ACE2-based hormone shunt controlling experimental hypertension
2026-Apr-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71796-z
PMID:41965354
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研究论文 | 设计一种名为ARCH的全人源抗高血压基因电路，通过合成生物学方法控制实验性高血压 | 提出一种基于合成生物学的闭合环路基因电路，利用天然血管紧张素受体监测血压生物标志物，并驱动可溶性ACE2表达以自我调节血压 | NA | 开发一种可逆、自给自足的闭环系统来精确监测和控制肾素-血管紧张素系统驱动的高血压 | 雄性高血压小鼠 | NA | 高血压 | 基因工程 | NA | NA | 雄性高血压小鼠，具体数量未提及 | 合成生物学基因电路 | 人源细胞 | 包含血管紧张素受体监测模块和可溶性ACE2治疗表达模块的自调节基因电路 | 医学 |
| 34 | 2026-06-13 |
Gallium in liquid state shows nuclease-mimicking activity
2026-Apr-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71346-7
PMID:41963312
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研究论文 | 液态镓展现出类似核酸酶的活性，具有优先切割位点 | 首次发现液态镓具有类似核酸酶的活性，其氧化层用于底物吸附，金属核心作为裂解活性中心，构建无配体、无辅因子的人工核酸酶平台 | 未提及 | 探索非生物材料模仿酶活性的新方法 | 液态镓的核酸酶活性及其机制 | NA | NA | NA | NA | 实验数据 | NA | NA | NA | NA | 治疗应用, 合成生物学, 生物材料 |
| 35 | 2026-06-13 |
Yeast-based green nanoparticle synthesis: past, present and future in nanomedicine
2026-Apr, Nanomedicine (London, England)
DOI:10.1080/17435889.2026.2642296
PMID:41797356
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综述 | 综述酵母绿色合成纳米颗粒在纳米医学中的历史进展、当前应用和未来潜力 | 系统回顾了酵母作为生物平台合成纳米颗粒的发展历程，强调了酶还原途径和天然生物分子包被在提高纳米颗粒稳定性和生物相容性中的作用，并展望了合成生物学和生物过程工程的未来应用 | 临床转化受限于标准化GMP生产、毒性免疫原性评估和监管框架的不足 | 评估酵母来源纳米颗粒在纳米医学中的应用前景 | 酵母合成的银、金、硒纳米颗粒 | 纳米医学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | NA | 酵母 | NA | 医学 |
| 36 | 2026-06-13 |
Engineering sensor-based antithetic integral controllers for enhanced dynamic performance and noise attenuation
2026-Mar-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101512
PMID:41763220
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研究论文 | 开发并分析了一种基于传感器的拮抗积分反馈控制器，用于增强动态性能和噪声抑制 | 通过对经典拮抗控制基序进行单一修改，内在引入比例反馈，无需额外电路，从而加速动态响应并降低噪声放大 | 当前实现基于大肠杆菌，可能需在其他宿主中验证通用性；实际应用中的长期稳定性未充分探讨 | 设计高性能生物控制器以改善动态性能和噪声特性 | 基于传感器的拮抗积分反馈控制器在大肠杆菌中的实现与表征 | 合成生物学 | NA | intein介导的剪接 | 控制理论模型和随机分析 | 实验测量数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | 基于传感器的拮抗积分反馈控制器 | 合成生物学、代谢工程、细胞疗法 |
| 37 | 2026-06-13 |
Editing and synthetic engineering of chloroplast genomes
2026-Mar-09, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101783
PMID:41761616
|
综述 | 本文综述了叶绿体基因组最小化、高效基因组编辑及代谢途径重新设计的最新进展，旨在优化叶绿体功能并推动合成生物学发展 | 系统整合了叶绿体基因转移、精密编辑工具（如基因敲除、敲入、碱基替换和多靶点修饰）以及能量代谢动态调控和代谢通路重新设计等创新策略 | 未提及当前技术在植物转化效率、脱靶效应或不同物种中的适应性限制 | 探索通过叶绿体基因组工程提升作物性状和高效生产高价值化合物的方法 | 叶绿体基因组及相关代谢途径 | 合成生物学 | NA | 叶绿体基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 植物, 藻类 | 代谢通路重新设计, 能量代谢动态调控 | 生物技术, 农业 |
| 38 | 2026-06-13 |
Biosynthesis of benzylisoquinoline alkaloids and its evolution in plants
2026-Mar-09, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101786
PMID:41776991
|
综述 | 系统综述了苄基异喹啉生物碱（BIAs）的生物合成途径、关键酶及其进化机制 | 整合了BIAs结构多样化的酶促机制与进化驱动力（基因重复、新功能化、基因簇组装） | 仍存在途径空白、酶底物混杂性及调控网络未完全表征的挑战 | 阐明BIAs生物合成途径及其在植物中的进化规律 | 苄基异喹啉生物碱及其关键酶（甲基转移酶、细胞色素P450单加氧酶、小檗碱桥酶、去甲基酶、酰基转移酶） | 植物生物学、生物化学 | NA | 多组学、蛋白质工程、合成生物学 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 植物 | 代谢途径 | 医学、农业、工业生物技术 |
| 39 | 2026-06-13 |
Enhanced Heterologous Production of Tylosin Through Pathway Reconstruction and Integrated Optimization in Streptomyces
2026-Mar, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70203
PMID:41761947
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研究论文 | 通过通路重构和整合优化在链霉菌中增强泰乐菌素的异源生产 | 利用ExoCET技术成功捕获87 kb的泰乐菌素生物合成基因簇，并通过两步组装策略在三种链霉菌宿主中实现异源表达，结合培养基优化、启动子替换和调控基因敲除等多层次策略显著提升产量 | 未说明 | 提高泰乐菌素的异源生物合成效率并开发具有增强治疗活性的类似物 | 泰乐菌素生物合成基因簇和链霉菌宿主 | 合成生物学 | NA | ExoCET技术, 异源表达, 启动子替换, 基因敲除 | NA | NA | 三种链霉菌宿主（包括S. albus J1074） | ExoCET, 两步组装策略 | Streptomyces fradiae QL100, Streptomyces albus J1074 | 泰乐菌素生物合成通路 | 医药 |
| 40 | 2026-06-13 |
Leveraging a synthetic biology approach to enhance BCG-mediated expansion of Vγ9Vδ2 T cells
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0343925
PMID:41941447
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研究论文 | 利用合成生物学方法工程化BCG菌株以增强HMBPP的产生，进而促进Vγ9Vδ2 T细胞扩增 | 通过宿主自身-非自身识别机制利用HMBPP感知来增强免疫应答，而非传统的配体或抗原策略 | 尚未进行体内验证，且未评估工程菌株的安全性和长期免疫保护效果 | 开发更有效的抗结核疫苗，增强BCG诱导的免疫应答 | BCG菌株、Vγ9Vδ2 T细胞 | 合成生物学 | 结核病 | 合成生物学工程、体外刺激实验、同线性分析 | NA | 基因组序列、实验数据 | 超过63种分枝杆菌物种和356个基因组 | 合成生物学方法 | BCG（牛分枝杆菌卡介苗） | MEP途径合成基因座，包括HMBPP合酶GcpE过表达 | 医学 |