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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-06-10 |
Super-enhancer-mediated transcriptional regulation of gene clusters in plants
2026-Apr, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2026.102871
PMID:41719895
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综述 | 探讨超级增强子在植物基因簇转录调控中的核心作用 | 揭示了超级增强子通过拓扑关联域协调同源基因簇和生物合成基因簇中基因共表达的机制,并指出其可通过染色质可及性数据预测 | 主要基于拟南芥研究,对其他植物物种的普遍性仍需验证 | 阐明植物中超级增强子调控基因簇共表达的机制及其在合成生物学和作物改良中的应用潜力 | 植物同源基因簇和生物合成基因簇中的基因表达调控 | 分子生物学 | NA | CRISPR-Cas, T-DNA插入, 染色质可及性测序 | NA | 染色质可及性数据 | NA | CRISPR-Cas9, T-DNA插入 | 拟南芥 | 超级增强子调控的基因簇共表达回路 | 合成生物学, 代谢工程, 作物改良 |
| 22 | 2026-06-10 |
Engineered E. coli Nissle 1917 Depletes Branched-Chain Amino Acids to Suppress Colorectal Tumorigenesis
2026-Mar-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00804
PMID:41712535
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研究论文 | 工程化大肠杆菌Nissle 1917通过消耗支链氨基酸抑制结直肠肿瘤发生 | 利用合成生物学方法工程化益生菌,通过靶向支链氨基酸分解代谢来抑制结直肠癌进展,提供了一种新的癌症治疗策略 | 研究仅在AOM/DSS诱导的CRC小鼠模型和氨基酸饮食条件下进行,缺乏在人体中的验证 | 探究工程化益生菌通过消耗肠道支链氨基酸抑制结直肠癌的作用机制 | 工程化的大肠杆菌Nissle 1917菌株(ECN-Deg和ECN-Tra)以及AOM/DSS诱导的结直肠癌小鼠模型 | 合成生物学 | 结直肠癌 | NA | NA | NA | 使用AOM/DSS诱导的结直肠癌小鼠模型,具体样本数量未提及 | NA | 大肠杆菌 Nissle 1917 | 支链氨基酸分解代谢通路 | 医学 |
| 23 | 2026-06-10 |
Green Biosynthesis of Terpenoid-Derived Flavor and Fragrance Compounds: Advances and Strategic Perspectives
2026-Mar-04, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c08719
PMID:41718042
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综述 | 系统总结了利用绿色生物合成方法生产萜类来源的香精香料化合物的最新进展与战略前景 | 聚焦低成本底物和微生物细胞工厂的宿主选择,并系统论述酶改造、动态途径调控、细胞区室化和提高萜类耐受性等关键工程策略 | NA | 为萜类化合物的可持续生产提供关键见解和指导方针 | 萜类及其衍生物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物(多种宿主菌株) | 微生物细胞工厂中的萜类生物合成途径 | 食品,日化用品 |
| 24 | 2026-06-10 |
BOTany methods: accessible automation for plant synthetic biology
2026-Mar-02, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiag066
PMID:41715940
|
研究论文 | 开发了一套名为BOTany Methods的自动化方法,利用Opentrons OT-2机器人简化植物合成生物学中的分子生物学流程 | 提供基于表格输入的模块化协议,用户无需编程经验即可运行复杂实验,实现从引物稀释到质粒提取的端到端自动化 | 依赖特定硬件Opentrons OT-2机器人,可能不适用于所有实验室;协议验证仅限于常见分子生物学方法 | 提高植物合成生物学实验中液体处理和分子克隆的自动化程度与可重复性 | 植物分子生物学实验流程,包括引物稀释、PCR设置、植物模块化克隆、细菌转化和质粒提取 | 合成生物学 | NA | PCR, 分子克隆, 细菌转化, 质粒提取 | NA | NA | NA | Opentrons OT-2机器人, 3D打印 | 大肠杆菌(用于细菌转化和质粒提取) | 植物模块化克隆(MoClo) | 农业, 生物技术 |
| 25 | 2026-06-10 |
Synthetic gene circuits that selectively target RAS-driven cancers
2026-Feb-24, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.104320
PMID:41733988
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研究论文 | 本文提出了一种合成基因电路设计方法,通过整合多个RAS传感器实现对RAS驱动癌症的选择性靶向治疗 | 首次将多个RAS传感器组合构建基因电路,实现了对突变RAS细胞前所未有的选择性输出蛋白表达,通过模块化设计和模型驱动优化提高了电路适应性和治疗潜力 | 当前电路仍局限于特定KRAS突变,且可能存在耐药性风险 | 开发针对RAS驱动癌症的新型合成基因电路治疗策略 | RAS突变癌细胞系 | 合成生物学 | RAS驱动癌症 | 合成基因电路设计 | 电路组件建模 | NA | 多种RAS驱动癌细胞系 | 合成基因电路 | 哺乳动物细胞 | RAS传感基因电路,整合多个RAS传感器实现选择性蛋白表达 | 医学 |
| 26 | 2026-06-10 |
Generative AI for synthetic biology: Designing biological parts, circuits, and genomes
2026-Feb-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2026.101533
PMID:41713401
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review | 探讨生成式人工智能与合成生物学的融合,重点介绍在生物元件、电路和基因组设计中的创新应用 | 系统性地总结了生成式AI在合成生物学中从分子工具到系统架构的转变,提出了数据驱动的新型生物设计范式 | 未涉及具体实验验证或定量性能比较 | 分析生成式AI在合成生物学中的机遇与挑战,并提出发展路线图 | 生物元件、遗传电路、基因组 | 机器学学习 | NA | NA | 生成式AI模型 | 生物序列数据 | NA | NA | NA | 遗传电路、基因组 | 合成生物学 |
| 27 | 2026-06-10 |
Live biotherapeutics: Emerging trends and future directions in microbial therapy
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.12.001
PMID:41714074
|
综述 | 综述了活体生物治疗产品在微生物疗法中的新兴趋势和未来方向 | 系统阐述了活体生物治疗产品从单一菌株到工程化微生物群落和天然配方的多样性发展,以及其在精准医学中的整合潜力 | 临床开发面临菌株筛选、复杂生产、活性问题及合并症患者安全性等关键挑战 | 概述当前活体生物治疗产品的种类、作用机制、临床应用及监管框架,并展望其未来方向 | 活体生物治疗产品 | NA | 代谢性疾病、神经系统疾病、免疫介导疾病 | 合成生物学、CRISPR基因组编辑、多组学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 工程化微生物群落 | 医学 |
| 28 | 2026-06-10 |
Advancements in technology for developing recombinant live biotherapeutics
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2026.01.006
PMID:41714076
|
综述 | 综述重组活体生物治疗药物的最新技术进展及其在人类健康中的应用 | 综合了合成生物学、基因工程、多组学和人工智能/机器学习方法在重组活体生物治疗药物设计中的应用,强调了从基础研究到临床转化的创新策略 | 在可扩展性、安全性和临床应用方面仍存在重大挑战 | 总结重组活体生物治疗药物的开发进展,并指出其作为下一代治疗剂的机遇与障碍 | 基因和代谢工程改造的微生物物种 | 机器学习 | NA | 合成生物学, 基因工程, 多组学, 人工智能/机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 29 | 2026-06-10 |
The human reproductive tract microbiome: A novel source of live biotherapeutics
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2026.01.027
PMID:41714081
|
综述 | 探讨人类生殖道微生物组作为活体生物治疗药物新来源的潜力 | 提出了将生殖道微生物组特别是阴道微生物作为下一代活体生物治疗药物候选来源的新视角 | 未提供具体实验数据或临床验证结果,仅为文献综述 | 探索人类生殖道微生物组作为活体生物治疗药物候选来源的应用潜力 | 人类生殖道微生物组,特别是女性阴道微生物群落 | 微生物组学 | 细菌性阴道病、性传播感染、不孕症、早产 | NA | NA | 文本 | NA | 合成生物学、基因工程 | 人类阴道 | NA | 医学 |
| 30 | 2026-06-10 |
Recent advances of microbial medicine to prevent and treat cardiovascular disease
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2026.01.028
PMID:41714082
|
综述 | 综述微生物医学在预防和治疗心血管疾病方面的最新进展,重点关注肠道微生物组的作用 | 提出微生物医学整合到心血管护理中,推动精准、整体和个性化治疗范式转变 | 面临菌株特异性、递送系统和监管框架等挑战 | 探索微生物医学在心血管疾病管理中的创新治疗干预措施及其影响 | 肠道微生物组及其代谢产物如短链脂肪酸、三甲胺N-氧化物和吲哚衍生物 | NA | 心血管疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | 人类肠道微生物组 | 肠道微生物代谢通路 | 医学 |
| 31 | 2026-06-10 |
Recombinant live biotherapeutics and synthetic biology: Recent advancement and perspective
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2026.01.004
PMID:41714087
|
综述 | 本文综述了重组活体生物治疗药物及其合成生物学的最新进展和前景 | 系统性地总结了合成生物学在精准改造微生物以调控宿主-微生物组相互作用、疾病通路和免疫反应方面的关键作用 | 未提供具体的实验数据或对比分析,可能缺乏对临床转化风险的深入探讨 | 阐述重组活体生物治疗药物的原理、宿主相互作用、递送机制及应用前景 | 重组活体生物治疗药物及其在人类疾病治疗中的应用 | 合成生物学 | 代谢性疾病、炎症性肠病、癌症 | 基因工程 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 生物遏制策略 | 医学 |
| 32 | 2026-06-10 |
Live biotherapeutics in cancer therapy
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2026.01.002
PMID:41714084
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综述 | 本文综述了活体生物治疗剂在癌症治疗中的潜力与应用 | 整合微生物学、免疫学、合成生物学和肿瘤学,提出活体生物治疗剂作为下一代癌症治疗策略的创新方向 | 安全性、生产制造、监管和个性化方面仍存在挑战 | 探讨活体生物治疗剂在癌症治疗中的潜在应用及未来发展方向 | 天然和工程化活体生物治疗剂(细菌和病毒) | 合成生物学 | 癌症(结肠癌、胃癌、胰腺癌、肝癌等) | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 33 | 2026-06-09 |
Leveraging the bacteria for enhanced cancer immunotherapy: from a perspective of synthetic biology
2026-Dec-31, Cancer biology & therapy
IF:4.4Q2
DOI:10.1080/15384047.2026.2683171
PMID:42240055
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review | 综述了合成生物学在细菌介导的癌症免疫治疗中的最新进展,重点介绍工程细菌如何激活免疫系统及实现肿瘤靶向的策略 | 系统总结了利用合成生物学改造细菌以表达免疫治疗剂、增强肿瘤靶向性及直接递送治疗载荷的创新策略,并探讨了缺氧响应启动子、细菌群集运动和细胞外囊泡等前沿技术 | 未提及该领域的未来挑战或当前研究的局限性 | 回顾合成生物学在细菌癌症免疫治疗中的研究进展,聚焦免疫激活机制与工程策略 | 工程化细菌作为癌症免疫治疗剂 | 合成生物学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 表达免疫治疗剂的合成回路、缺氧响应启动子、细菌群集运动工程 | 医学 |
| 34 | 2026-06-09 |
Bacterial conjugation and its deployment for diverse biotechnology applications
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108894
PMID:41956307
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review | 综述细菌接合在合成生物学中的应用,包括基因回路传递、代谢工程、微生物底盘识别和生物修复等 | 系统阐述了接合机制在合成生物学中的重新利用,以及结合多种合成生物学策略扩展研究空间的新方法 | 未讨论接合传递的效率限制及潜在的生物安全问题 | 总结细菌接合在合成生物学中的最新进展,并为研究人员提供利用接合传递的实用指南 | 细菌接合系统及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | 细菌接合 | NA | NA | NA | 接合系统 | 多种微生物(供体菌和靶标菌) | 遗传回路、代谢通路 | 生物技术, 环境修复, 微生物工程 |
| 35 | 2026-06-09 |
Random mutagenesis platform for accelerated genome evolution (RAMPAGE) of Pichia pastoris
2026-Sep, Engineering microbiology
DOI:10.1016/j.engmic.2026.100269
PMID:42256413
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研究论文 | 开发了一种用于毕赤酵母的随机诱变加速基因组进化平台RAMPAGE | 首次建立适用于毕赤酵母的连续全基因组进化平台,实现高效表型进化并揭示耐受性相关基因 | NA | 开发加速毕赤酵母基因组进化的随机诱变平台,提升其在极端工业条件下的适应性 | 毕赤酵母菌株 | 合成生物学 | NA | 全基因组重测序 | NA | 基因组序列 | 经进化筛选的毕赤酵母菌株 | 随机诱变 | 毕赤酵母 | 连续基因组进化系统 | 工业生物技术 |
| 36 | 2026-06-09 |
Integrative frameworks for plastic biodegradation in insect-microbiome systems: mechanistic insights, emerging multi-omics and enzyme engineering perspectives
2026-Jun-08, Biodegradation
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10532-026-10316-8
PMID:42257753
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综述 | 该综述整合了昆虫-微生物组系统中塑料生物降解的机制、多组学和酶工程研究进展 | 通过分析宿主与肠道微生物的协同作用,提出了昆虫幼虫中塑料降解的多步骤模型,并总结了酶工程与合成生物学策略的潜在应用 | 多组学数据主要提供相关性证据,特定酶功能的直接实验验证仍然有限 | 理解昆虫-微生物组系统中塑料降解的复杂机制,并指导酶基可持续塑料废物管理策略的开发 | 昆虫幼虫(如蜡螟)及其肠道微生物组 | 环境科学、合成生物学 | NA | 多组学(宏基因组学、宏转录组学、代谢组学)、酶工程、合成生物学 | NA | NA | NA | 酶工程、合成生物学 | 昆虫幼虫(蜡螟科等) | 多步降解通路(包括机械破碎、氧化修饰、微生物解聚和中间代谢处理) | 环境、工业生物技术 |
| 37 | 2026-06-09 |
Engineering peroxisomal cofactor systems in Saccharomyces cerevisiae for enhanced biosynthesis of α-humulene
2026-Jun-08, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05060-3
PMID:42257761
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研究论文 | 通过酿酒酵母过氧化物酶体辅因子系统工程改造,实现α-葎草烯的高效生物合成 | 首次系统改造酿酒酵母过氧化物酶体辅因子平衡,利用ScPEX5*-oPTS1*正交转运系统将甲羟戊酸途径靶向至过氧化物酶体,并建立辅酶A代谢循环,最终通过细胞质-过氧化物酶体双区室工程策略显著提高α-葎草烯产量 | 未提及对工程菌株的长期稳定性评估及大规模发酵性能研究 | 通过过氧化物酶体区室化策略优化酿酒酵母中α-葎草烯的生物合成途径 | 酿酒酵母BY4741菌株中的过氧化物酶体辅因子系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 产量数据 | NA | NA | 酿酒酵母 | 甲羟戊酸途径、过氧化物酶体辅酶A代谢循环、细胞质-过氧化物酶体双区室工程 | 工业生物技术 |
| 38 | 2026-06-09 |
Metabolic engineering strategies for neuroactive postbiotic production: Current progress and perspectives
2026-Jun-06, Journal of microbiological methods
IF:1.7Q4
DOI:10.1016/j.mimet.2026.107571
PMID:42251865
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综述 | 系统综述了代谢工程和合成生物学策略在神经活性后生元微生物合成中的最新进展,涵盖途径优化、调控元件调谐和辅因子平衡等方法 | 首次整合技术就绪水平评估神经活性后生元生产系统的转化和工业潜力,并强调利用可持续富含蛋白质原料和农工副产品作为经济前体来源 | 工业规模生产率仍受限于低微生物生产力、途径瓶颈和过程不稳定性 | 评估和促进神经活性后生元在功能食品、营养保健品和神经治疗学中的应用发展 | 神经活性后生元(如GABA、短链脂肪酸、血清素、多巴胺和吲哚衍生物)的微生物生产系统 | 代谢工程 | 神经疾病 | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 代谢途径优化 | 医学, 工业生物技术 |
| 39 | 2026-06-09 |
Insights into the Fucoidan and Mannitol Biosynthetic Pathways in the Brown Seaweed Padina Tetrastromatica Based on Draft Genome and Transcriptome Analysis
2026-Jun-04, Marine biotechnology (New York, N.Y.)
DOI:10.1007/s10126-026-10649-8
PMID:42240916
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研究论文 | 本研究通过基因组和转录组分析揭示了褐藻Padina tetrastromatica中岩藻多糖和甘露醇生物合成途径 | 首次对P. tetrastromatica进行互补基因组和转录组组装,鉴定了参与岩藻多糖和甘露醇生物合成的关键酶编码基因,为褐藻功能性糖类代谢提供了分子框架 | 基因组覆盖度不足20%,限制了完整基因组的获取 | 阐明褐藻中岩藻多糖和甘露醇的生物合成分子机制,为未来代谢工程和合成生物学应用奠定基础 | 褐藻Padina tetrastromatica | 生物信息学 | NA | NGS, 转录组测序, 基因组组装 | NA | 基因组序列, 转录本序列 | 单个褐藻样本(Padina tetrastromatica) | NA | NA | NA | 工业生物技术, 合成生物学 |
| 40 | 2026-06-09 |
Unlocking plant abiotic stress resilience through biostimulants and omics-driven innovations
2026-Jun, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.70205
PMID:41782210
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综述 | 探讨生物刺激素与组学驱动创新在提升植物非生物胁迫适应性中的作用 | 整合生物刺激素技术、小RNA、肽和激素作为新兴分子调节因子,以及AI驱动的早期预警系统,为合理设计生物刺激素提供路线图 | 未明确讨论生物刺激素在实际应用中的规模化挑战或潜在生态影响 | 阐明生物刺激素增强植物非生物胁迫耐受性的机制,并构建气候适应性农业的路线图 | 植物(作物)及其对干旱、温度、盐分、涝渍和重金属等胁迫的响应 | 计算机视觉 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | 植物 | 生物刺激素代谢途径设计 | 农业 |