合成生物学相关文章
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当前共找到 3361 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-07-06 |
Engineering biology approaches to modulate bacterial biofilms
2025-Jul, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.11.002
PMID:39643528
|
research paper | 探讨利用工程生物学方法控制和改造细菌生物膜以实现新功能 | 结合合成生物学的最新进展，开发新型生物系统以应对全球性挑战 | NA | 研究工程生物学在细菌生物膜控制和改造中的应用 | 细菌生物膜 | 合成生物学 | NA | 工程生物学 | NA | NA | NA |
| 22 | 2025-07-06 |
Iterative deep learning design of human enhancers exploits condensed sequence grammar to achieve cell-type specificity
2025-Jun-04, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101302
PMID:40472848
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research paper | 该研究应用迭代深度学习设计具有特定细胞类型活性的合成增强子 | 利用迭代深度学习优化模型，设计出在两种人类细胞系中具有显著差异活性的合成增强子，并通过实验验证和模型再优化提高特异性 | 研究仅针对两种人类细胞系，可能无法推广到其他细胞类型 | 解决合成生物学中如何靶向特定细胞类型进行基因表达的问题 | 人类细胞系中的合成增强子 | synthetic biology | NA | deep learning, chromatin accessibility analysis | deep learning model | genomic sequence, chromatin accessibility data | two human cell lines |
| 23 | 2025-07-06 |
Minimal shuttle vectors for Saccharomyces cerevisiae
2025, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysaf010
PMID:40612073
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研究论文 | 本文描述了一组用于酿酒酵母的最小整合或着丝粒穿梭载体的设计和验证 | 这些载体是目前已知最小的酵母穿梭载体，大小在2.6至3.5 kb之间，移除了质粒中常见的限制性酶切位点，释放了约30个切割位点 | NA | 解决合成生物学中复杂遗传工程任务因缺乏合适载体骨架而受阻的问题 | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae） | 合成生物学 | NA | 基因合成 | NA | NA | 六种最小穿梭载体（pLS400, pLS410, pLS403, pLS413, pLS404, pLS414, pLS405, pLS415, pLS406, pLS416, pLS408, pLS418） |
| 24 | 2025-07-05 |
Optimizing Plant Alkaloid Biosynthesis under Drought Stress: Regulatory Mechanisms and Biotechnological Strategies
2025-Aug, Journal of plant physiology
IF:4.0Q1
DOI:10.1016/j.jplph.2025.154545
PMID:40523330
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综述 | 本文综述了干旱胁迫下植物生物碱生物合成的调控机制及生物技术优化策略 | 探讨了干旱胁迫通过ABA信号和ROS反应调控生物碱合成的机制，并提出了结合遗传工程、合成生物学和AI的优化策略 | 需平衡植物生长与代谢产物生产，且实验室策略的田间适用性有待验证 | 优化干旱胁迫下植物生物碱的生物合成，提升作物抗逆性和生物碱产量 | 植物生物碱及其生物合成途径 | 植物生物学与生物技术 | NA | 遗传工程、合成生物学、AI | NA | NA | NA |
| 25 | 2025-07-05 |
Polymer sailing on rafts within lipid membranes
2025-Jul-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2503203122
PMID:40608678
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研究论文 | 研究线性聚合物在二元脂质膜上的动力学，通过流体动力学模拟和单分子追踪实验揭示了聚合物与脂质筏的相互作用 | 发现纳米尺寸聚合物优先吸附于膜上形成脂质筏的组分，诱导并稳定单个脂质筏，进而对聚合物施加动态限制，导致其呈现膨胀但受限的二维构象和Saffman-Delbrück型扩散性 | 研究主要基于模拟和实验，可能未完全涵盖真实生物膜中所有复杂的相互作用 | 阐明细胞膜上大分子吸附动力学及其在生物技术中的应用 | 线性聚合物和二元脂质膜 | 生物物理学 | NA | 流体动力学模拟和单分子追踪实验 | Zimm模型和Saffman-Delbrück模型 | 模拟数据和实验数据 | NA |
| 26 | 2025-07-05 |
Structurally Tunable Cell-Free System: to Expand the Synthetic Biology Toolkit for Studies on Extracellular Polysaccharide
2025-Jul-04, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c04053
PMID:40611812
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研究论文 | 本研究开发了一种灵活的无细胞（膜）蛋白质合成系统（CF(M)PS），用于研究与膜蛋白相关的糖生物学，并成功应用于糖缀合物的生产 | 开发了结合纳米脂质体作为膜模拟物的CF(M)PS系统，促进了转录-翻译耦合和膜蛋白的溶解，成功表达了膜结合的磷酸糖基转移酶并耦合了催化反应 | 未提及具体样本量或实验规模的限制 | 扩展合成生物学工具包，研究细胞外多糖的生物合成模块 | 微生物细胞外多糖（EPS）及其生物合成途径中的关键酶和膜相关生化反应 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白质合成系统（CF(M)PS），纳米脂质体膜模拟技术 | NA | 生化反应数据 | NA |
| 27 | 2025-07-05 |
Flippase-Mediated Hybrid Vesicle Division
2025-Jul-04, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202504519
PMID:40613217
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研究论文 | 本文展示了在聚合物脂质混合囊泡中重组活性Drs2p-Cdc50p脂质翻转酶，以实现囊泡分裂 | 通过重组Drs2p-Cdc50p脂质翻转酶在混合囊泡中实现跨膜不对称性，进而引发囊泡收缩和分裂，模拟细胞分裂过程 | 研究仅针对特定组成的混合囊泡系统，未验证在其他系统中的适用性 | 开发能够实现蛋白质介导分裂的合成系统，推动自下而上的合成生物学发展 | 由磷脂和两亲性嵌段共聚物组成的聚合物脂质混合囊泡 | 合成生物学 | NA | 脂质翻转酶重组技术 | NA | 实验数据 | 使用特定组成的混合囊泡系统（含1或2.5 mol%两亲性嵌段共聚物） |
| 28 | 2025-07-05 |
The secret life of RNA and lipids
2025-Jul-04, RNA biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/15476286.2025.2526903
PMID:40613519
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综述 | 本文探讨了RNA与脂质之间的相互作用及其在合成生物学、RNA世界和现代细胞生物学中的意义 | 讨论了RNA如何选择性地以序列依赖的方式与脂质膜结合，并探索了这些相互作用在合成系统中设计RNA传感器和调控元件的潜力 | NA | 探索RNA与脂质之间的相互作用及其在合成生物学和RNA世界中的应用 | RNA和脂质的相互作用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 29 | 2025-07-05 |
Engineered Bacteriophages: Advances in Phage Genome Redesign Strategies for Therapeutic and Environmental Applications
2025-Jul-02, Protein and peptide letters
IF:1.0Q4
|
综述 | 本文综述了噬菌体基因重组策略在治疗和环境应用中的最新进展 | 探讨了多种噬菌体工程技术，包括CRISPR-Cas系统、噬菌体展示、随机和定点诱变、retrons和重启方法，展示了定制功能噬菌体的潜力 | 讨论了当前工程方法的局限性，如噬菌体抗性、免疫反应等 | 探索噬菌体基因重组策略在治疗和环境应用中的潜力 | 噬菌体及其基因重组技术 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统、噬菌体展示、随机和定点诱变、retrons和重启方法 | NA | NA | NA |
| 30 | 2025-07-05 |
Development of Dipeptide-Based Liquid Droplets and Fibrils as Enzyme-Mimics
2025-Jul, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202503916
PMID:40411841
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研究论文 | 本文开发了一种基于二肽的液滴和纤维作为酶模拟物 | 提出了一种简单的二肽，能够自组装成微米级液滴，并作为微反应器用于疏水反应物，同时在不同pH下形成纤维状结构作为酯酶模拟物 | NA | 开发最小化的超分子催化剂设计策略，应用于酶学和合成生物学 | 二肽自组装形成的液滴和纤维 | 合成生物学 | NA | 液相分离(LLPS) | NA | NA | NA |
| 31 | 2025-07-05 |
Merging the computational design of chimeric type I polyketide synthases with enzymatic pathways for chemical biosynthesis
2025-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61160-y
PMID:40593699
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研究论文 | 本文介绍了BioPKS管道，一种自动化的逆生物合成工具，结合多功能I型聚酮合酶（PKSs）和单功能酶，用于化学生物合成 | 开发了BioPKS管道，结合RetroTide和DORAnet工具，自动设计I型聚酮合酶与单功能酶的合成路径，扩展了化学生物合成的可能性 | 未提及具体局限性 | 通过合成生物学方法更可持续地生产化学品 | I型聚酮合酶（PKSs）和单功能酶 | 合成生物学 | NA | 逆生物合成工具（RetroTide和DORAnet） | NA | 化学结构数据 | 155种生物制造候选化合物 |
| 32 | 2025-07-05 |
Abstraction hierarchy to define biofoundry workflows and operations for interoperable synthetic biology research and applications
2025-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61263-6
PMID:40593727
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研究论文 | 提出一个抽象层次结构，用于定义生物铸造厂的工作流程和操作，以促进合成生物学研究的互操作性 | 提出一个四层互操作性抽象层次结构，优化设计-构建-测试-学习（DBTL）循环，提高实验工作流程的模块化、灵活性和自动化 | NA | 提高合成生物学研究的标准化和互操作性 | 生物铸造厂的工作流程和操作 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 33 | 2025-07-05 |
Transient infrared nanoscopy resolves the millisecond photoswitching dynamics of single lipid vesicles in water
2025-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61341-9
PMID:40593745
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research paper | 该研究开发了一种非破坏性、无标记的中红外成像和光谱技术，用于研究单个光开关脂质体的动态变化 | 利用散射型扫描近场光学显微镜（s-SNOM）实现了高时空分辨率的中红外成像和光谱分析，能够以30毫秒的采样时间跟踪动态变化 | 该方法可能仅限于特定类型的光开关纳米载体研究，且未涉及体内应用验证 | 推进光药理学、药物递送、纳米诊疗和合成生物学领域的研究 | 光开关脂质体（azobenzene-based photoswitchable lipids） | 纳米技术 | NA | 散射型扫描近场光学显微镜（s-SNOM） | NA | 图像和光谱数据 | 单个光开关脂质体 |
| 34 | 2025-07-05 |
Comprehensive datasets for RNA design, machine learning, and beyond
2025-Jul-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-07041-2
PMID:40594473
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研究论文 | 本文创建了一个全面的RNA设计数据集，用于机器学习和RNA建模算法的基准测试 | 提供了一个包含超过32万实验验证实例的标准化基准数据集，用于RNA设计和建模算法的开发和评估 | 数据集虽然全面，但可能无法覆盖所有RNA结构和序列的多样性 | 解决RNA二级结构预测和序列设计中的挑战，推动计算生物学在医学、合成生物学和生物技术中的应用 | RNA分子及其二级结构和序列 | 计算生物学 | NA | 机器学习 | NA | RNA序列和结构数据 | 超过32万实验验证实例 |
| 35 | 2025-07-05 |
Divergent multifunctional P450s-empowered biosynthesis of bioactive tripterifordin and cryptic atiserenoids in Aconitum implies convergent evolution
2025-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61188-0
PMID:40595667
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research paper | 该研究通过挖掘乌头属植物的转录组数据，发现并验证了多种萜类合成酶和细胞色素P450单加氧酶的功能，揭示了它们在二萜类化合物结构多样化和生物活性形成中的关键作用 | 发现了9种能够提供ent-kaurene、ent-atiserene或16α-hydroxy-ent-kaurene骨架的TPSs和14种具有多功能的P450s，其中8种P450s能够在骨架的七个不同位点催化氧化反应 | 研究主要集中在乌头属植物中的二萜类化合物，可能不适用于其他植物或化合物类型 | 探索细胞色素P450单加氧酶如何驱动二萜类化合物的结构和功能多样化 | 乌头属植物（Aconitum carmichaelii和Aconitum coreanum）中的二萜类化合物 | 合成生物学 | NA | 转录组挖掘、功能验证、蛋白质分析和突变实验 | NA | 转录组数据、蛋白质数据 | 两种乌头属植物（Aconitum carmichaelii和Aconitum coreanum） |
| 36 | 2025-07-05 |
Genetic characteristics of novel extreme alkaline-inducible promoter located in five prime upstream region of peptidyl-prolyl cis/trans isomerase from Vibrio anguillarum
2025-Jul-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-98559-y
PMID:40596401
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研究论文 | 本研究鉴定并表征了Vibrio anguillarum NB10的启动子区域，该区域在极端碱性条件下增强FK506结合蛋白型肽酰-脯氨酰顺反异构酶的表达 | 发现了一种新型极端碱性诱导启动子，可用于生物技术应用，如pH响应基因表达系统的开发 | 研究仅在大肠杆菌中测试了启动子活性，未在其他宿主系统中验证 | 研究Vibrio anguillarum NB10在极端碱性条件下基因表达的调控机制 | Vibrio anguillarum NB10的启动子区域及其调控的FklB基因 | 合成生物学 | NA | 蛋白质组学分析，β-半乳糖苷酶报告基因检测 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 37 | 2025-07-05 |
Identification of Thermoregulatory Factors Involved in Validamycin Biosynthesis and Reconstitution of a Thermoregulated Expression System
2025-Jul, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70068
PMID:40611707
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研究论文 | 本研究在链霉菌中鉴定参与有效霉素生物合成的温度调控因子，并重建了一个温度调控表达系统 | 首次在链霉菌中发现并重建了一个温度调控系统，用于调控放线菌天然产物的生产 | 研究仅在特定链霉菌株中进行，未在其他菌株中验证系统的普适性 | 鉴定有效霉素生物合成中的温度调控因子并开发温度调控表达系统 | 链霉菌(Streptomyces hygroscopicus TL01和Streptomyces albus J1074) | 合成生物学 | NA | DNA亲和层析、启动子工程 | NA | 分子生物学数据 | 多种链霉菌株 |
| 38 | 2025-07-05 |
Revolutionizing lignin valorization: Key advances in demethylation, methylation, and methyl metabolism
2025-Jun-28, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108634
PMID:40588043
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综述 | 本文系统综述了木质素生物增值中的去甲基化、甲基化和甲基代谢过程，探讨了相关酶和机制，并提出了提高木质素转化效率的新策略 | 总结了微生物木质素增值的有前景的甲基循环途径，并强调了机器学习辅助酶工程、合成生物学和代谢工程等先进策略 | 未提及具体实验数据或案例研究的局限性 | 促进木质素的可持续增值，推动木质素基生物经济的发展 | 木质素及其衍生物 | 生物工程 | NA | 机器学习辅助酶工程、合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA |
| 39 | 2025-07-05 |
Bridging BioSciences and technology: The impact of AI & GenAI in life sciences and agribusiness
2025-Jun-16, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2025.149623
PMID:40516836
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综述 | 本文探讨了生成式人工智能（GenAI）在生命科学和农业业务中的多方面影响 | GenAI作为催化剂，加速药物发现、蛋白质折叠预测、基因组学研究、疾病诊断和生物标志物识别，同时在农业中优化作物育种和提高生产力 | 讨论了GenAI在生命科学和农业业务中的伦理问题，如数据隐私、算法偏见和利益公平分配 | 探讨GenAI在生命科学和农业业务中的应用及其影响 | 生命科学和农业业务中的GenAI应用 | 生命科学与农业技术 | NA | 生成式人工智能（GenAI） | NA | 基因组和生态信息数据集 | NA |
| 40 | 2025-07-05 |
Transcriptional regulation of living materials via extracellular electron transfer
2024-Oct, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01628-y
PMID:38783133
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研究论文 | 本文展示了细胞外电子传递（EET）如何作为活细胞代谢与合成材料特性之间的可调桥梁 | 利用EET调控水凝胶交联，并通过转录布尔逻辑门控制EET基因表达，实现计算聚合物网络的机械响应 | NA | 探索基因电路设计如何模拟工程活材料中的生理行为 | Shewanella oneidensis和合成聚合物网络 | 合成生物学 | NA | 细胞外电子传递（EET） | NA | NA | NA |