合成生物学相关文章
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当前共找到 3354 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-07-05 |
Abstraction hierarchy to define biofoundry workflows and operations for interoperable synthetic biology research and applications
2025-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61263-6
PMID:40593727
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研究论文 | 提出一个抽象层次结构，用于定义生物铸造厂的工作流程和操作，以促进合成生物学研究的互操作性 | 提出一个四层互操作性抽象层次结构，优化设计-构建-测试-学习（DBTL）循环，提高实验工作流程的模块化、灵活性和自动化 | NA | 提高合成生物学研究的标准化和互操作性 | 生物铸造厂的工作流程和操作 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 22 | 2025-07-05 |
Transient infrared nanoscopy resolves the millisecond photoswitching dynamics of single lipid vesicles in water
2025-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61341-9
PMID:40593745
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research paper | 该研究开发了一种非破坏性、无标记的中红外成像和光谱技术，用于研究单个光开关脂质体的动态变化 | 利用散射型扫描近场光学显微镜（s-SNOM）实现了高时空分辨率的中红外成像和光谱分析，能够以30毫秒的采样时间跟踪动态变化 | 该方法可能仅限于特定类型的光开关纳米载体研究，且未涉及体内应用验证 | 推进光药理学、药物递送、纳米诊疗和合成生物学领域的研究 | 光开关脂质体（azobenzene-based photoswitchable lipids） | 纳米技术 | NA | 散射型扫描近场光学显微镜（s-SNOM） | NA | 图像和光谱数据 | 单个光开关脂质体 |
| 23 | 2025-07-05 |
Comprehensive datasets for RNA design, machine learning, and beyond
2025-Jul-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-07041-2
PMID:40594473
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研究论文 | 本文创建了一个全面的RNA设计数据集，用于机器学习和RNA建模算法的基准测试 | 提供了一个包含超过32万实验验证实例的标准化基准数据集，用于RNA设计和建模算法的开发和评估 | 数据集虽然全面，但可能无法覆盖所有RNA结构和序列的多样性 | 解决RNA二级结构预测和序列设计中的挑战，推动计算生物学在医学、合成生物学和生物技术中的应用 | RNA分子及其二级结构和序列 | 计算生物学 | NA | 机器学习 | NA | RNA序列和结构数据 | 超过32万实验验证实例 |
| 24 | 2025-07-05 |
Divergent multifunctional P450s-empowered biosynthesis of bioactive tripterifordin and cryptic atiserenoids in Aconitum implies convergent evolution
2025-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61188-0
PMID:40595667
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research paper | 该研究通过挖掘乌头属植物的转录组数据，发现并验证了多种萜类合成酶和细胞色素P450单加氧酶的功能，揭示了它们在二萜类化合物结构多样化和生物活性形成中的关键作用 | 发现了9种能够提供ent-kaurene、ent-atiserene或16α-hydroxy-ent-kaurene骨架的TPSs和14种具有多功能的P450s，其中8种P450s能够在骨架的七个不同位点催化氧化反应 | 研究主要集中在乌头属植物中的二萜类化合物，可能不适用于其他植物或化合物类型 | 探索细胞色素P450单加氧酶如何驱动二萜类化合物的结构和功能多样化 | 乌头属植物（Aconitum carmichaelii和Aconitum coreanum）中的二萜类化合物 | 合成生物学 | NA | 转录组挖掘、功能验证、蛋白质分析和突变实验 | NA | 转录组数据、蛋白质数据 | 两种乌头属植物（Aconitum carmichaelii和Aconitum coreanum） |
| 25 | 2025-07-05 |
Genetic characteristics of novel extreme alkaline-inducible promoter located in five prime upstream region of peptidyl-prolyl cis/trans isomerase from Vibrio anguillarum
2025-Jul-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-98559-y
PMID:40596401
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研究论文 | 本研究鉴定并表征了Vibrio anguillarum NB10的启动子区域，该区域在极端碱性条件下增强FK506结合蛋白型肽酰-脯氨酰顺反异构酶的表达 | 发现了一种新型极端碱性诱导启动子，可用于生物技术应用，如pH响应基因表达系统的开发 | 研究仅在大肠杆菌中测试了启动子活性，未在其他宿主系统中验证 | 研究Vibrio anguillarum NB10在极端碱性条件下基因表达的调控机制 | Vibrio anguillarum NB10的启动子区域及其调控的FklB基因 | 合成生物学 | NA | 蛋白质组学分析，β-半乳糖苷酶报告基因检测 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 26 | 2025-07-05 |
Microbial production of medium-chain-length diols: Current stage and perspectives
2025-Jul-01, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.132932
PMID:40609762
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综述 | 本文综述了中链长度α,ω-二醇（mcl-diols）的微生物生产现状与前景 | 提出了适用于不同链长的通用生物合成途径，并探讨了合成生物学、适应性实验室进化和AI驱动酶设计等未来方向 | 微生物底盘选择与优化仍需加速，限速酶活性有待提高，中间体和终产物的毒性问题需要解决 | 开发生物基替代品以取代化石基化学品 | 中链长度α,ω-二醇（mcl-diols） | 合成生物学 | NA | 代谢工程策略、高级蛋白质工程技术、过程优化 | NA | NA | NA |
| 27 | 2025-07-05 |
Identification of Thermoregulatory Factors Involved in Validamycin Biosynthesis and Reconstitution of a Thermoregulated Expression System
2025-Jul, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70068
PMID:40611707
|
研究论文 | 本研究在链霉菌中鉴定参与有效霉素生物合成的温度调控因子，并重建了一个温度调控表达系统 | 首次在链霉菌中发现并重建了一个温度调控系统，用于调控放线菌天然产物的生产 | 研究仅在特定链霉菌株中进行，未在其他菌株中验证系统的普适性 | 鉴定有效霉素生物合成中的温度调控因子并开发温度调控表达系统 | 链霉菌(Streptomyces hygroscopicus TL01和Streptomyces albus J1074) | 合成生物学 | NA | DNA亲和层析、启动子工程 | NA | 分子生物学数据 | 多种链霉菌株 |
| 28 | 2025-07-05 |
Revolutionizing lignin valorization: Key advances in demethylation, methylation, and methyl metabolism
2025-Jun-28, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108634
PMID:40588043
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综述 | 本文系统综述了木质素生物增值中的去甲基化、甲基化和甲基代谢过程，探讨了相关酶和机制，并提出了提高木质素转化效率的新策略 | 总结了微生物木质素增值的有前景的甲基循环途径，并强调了机器学习辅助酶工程、合成生物学和代谢工程等先进策略 | 未提及具体实验数据或案例研究的局限性 | 促进木质素的可持续增值，推动木质素基生物经济的发展 | 木质素及其衍生物 | 生物工程 | NA | 机器学习辅助酶工程、合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA |
| 29 | 2025-07-05 |
Bridging BioSciences and technology: The impact of AI & GenAI in life sciences and agribusiness
2025-Jun-16, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2025.149623
PMID:40516836
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综述 | 本文探讨了生成式人工智能（GenAI）在生命科学和农业业务中的多方面影响 | GenAI作为催化剂，加速药物发现、蛋白质折叠预测、基因组学研究、疾病诊断和生物标志物识别，同时在农业中优化作物育种和提高生产力 | 讨论了GenAI在生命科学和农业业务中的伦理问题，如数据隐私、算法偏见和利益公平分配 | 探讨GenAI在生命科学和农业业务中的应用及其影响 | 生命科学和农业业务中的GenAI应用 | 生命科学与农业技术 | NA | 生成式人工智能（GenAI） | NA | 基因组和生态信息数据集 | NA |
| 30 | 2025-07-05 |
Transcriptional regulation of living materials via extracellular electron transfer
2024-Oct, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01628-y
PMID:38783133
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研究论文 | 本文展示了细胞外电子传递（EET）如何作为活细胞代谢与合成材料特性之间的可调桥梁 | 利用EET调控水凝胶交联，并通过转录布尔逻辑门控制EET基因表达，实现计算聚合物网络的机械响应 | NA | 探索基因电路设计如何模拟工程活材料中的生理行为 | Shewanella oneidensis和合成聚合物网络 | 合成生物学 | NA | 细胞外电子传递（EET） | NA | NA | NA |
| 31 | 2025-06-10 |
Sensl: a synthetic biology sensor for tracking strigolactone signaling in rice
2025-Aug, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.70242
PMID:40484984
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 32 | 2025-07-04 |
The horizontally transferred gene, CsMTAN, rewired purine traffic to build caffeine factories in tea leaves
2025-Jul-03, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.13957
PMID:40607640
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研究论文 | 本研究通过代谢组学和基因组关联分析，揭示了茶树中水平转移基因CsMTAN在嘌呤代谢和咖啡因生物合成中的关键作用 | 首次鉴定并功能验证了水平转移基因CsMTAN在茶树嘌呤代谢中的关键作用，发现其SNP变异导致酶活性显著改变 | 研究主要基于体外酶活实验和瞬时表达系统，未进行稳定的转基因植株验证 | 阐明茶树嘌呤代谢和嘌呤生物碱合成的遗传与分子机制 | 茶树(Camellia sinensis)叶片组织 | 植物代谢组学 | NA | 代谢组学分析、全基因组关联分析(GWAS)、体外酶活实验、瞬时表达系统 | NA | 代谢组数据、基因组数据 | 183个遗传多样性茶树品种的幼叶和成熟叶组织 |
| 33 | 2025-07-04 |
Engineered Membrane Vesicle Production via oprF or oprI Deletion Has Distinct Phenotypic Effects in Pseudomonas putida
2025-Jul-03, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00171
PMID:40607986
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research paper | 研究通过删除oprF或oprI基因在Pseudomonas putida KT2440中诱导膜囊泡（MV）超产的表型效应 | 识别并表征了两种诱导膜囊泡超产的基因工程策略，揭示了不同基因删除对膜囊泡产量、大小、蛋白质组成及菌株适应性的影响 | 研究仅针对Pseudomonas putida KT2440，未在其他菌株中验证策略的普适性 | 探索膜成分操纵对膜囊泡生产的影响，为工业生物过程中的膜囊泡应用提供合成生物学工具 | Pseudomonas putida KT2440菌株及其基因工程改造后的膜囊泡 | 合成生物学 | NA | 基因删除、膜囊泡分析 | NA | 生物分子数据 | NA |
| 34 | 2025-07-04 |
Three-dimensional robotic structures fabricated and powered entirely with proteins
2025-Jul-02, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-025-01186-0
PMID:40604266
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research paper | 该研究报道了一种全蛋白质基微三维打印机器人结构的逐步构建过程，这些结构由最小肌动球蛋白皮层涂层驱动 | 首次实现了全蛋白质基微三维打印机器人结构的构建与驱动，为合成生物学中生物分子活性的放大提供了新方法 | 该方法需要使用者具备生物材料专业知识，且完成过程需要15天时间 | 开发自供能软体机器人并推动三维蛋白质基机器人技术的发展 | 蛋白质基微三维打印机器人结构 | 合成生物学 | NA | 三维打印技术、肌动球蛋白涂层技术 | NA | NA | NA |
| 35 | 2025-07-04 |
Membrane-Anchored Polyproline Provides Controlled Microdomain Formation and Permeability in Lipid Vesicles
2025-Jul-02, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c06134
PMID:40605254
|
研究论文 | 本研究合成了一类由l-脯氨酸单体单元和磷脂引发剂组成的脂质聚合物，通过将聚脯氨酸链锚定在膜上，实现了可逆的相分离 | 通过锚定聚脯氨酸链到膜上，实现了温度调控的可逆相分离和微区形成，增强了膜的通透性，并实现了封装分子的尺寸控制释放 | 未提及具体的临床应用效果或长期稳定性数据 | 开发一种新型脂质聚合物系统，用于控制膜微区形成和通透性，应用于药物传递或合成生物学 | 由l-脯氨酸单体单元和磷脂引发剂组成的脂质聚合物 | 合成生物学 | NA | 共聚焦显微镜和FRAP分析 | NA | NA | NA |
| 36 | 2025-07-04 |
FoldMark: Safeguarding Protein Structure Generative Models with Distributional and Evolutionary Watermarking
2025-Jun-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.23.619960
PMID:39554012
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research paper | 本文提出了一种名为FoldMark的新型水印策略，旨在保护蛋白质结构生成模型，平衡水印容量与结构质量 | 首次提出结合分布和进化原理的水印策略，适用于蛋白质生成模型，并能在保持结构质量的同时实现高精度水印嵌入 | 未明确提及水印策略对模型性能的长期影响以及在更广泛蛋白质类型上的适用性 | 开发一种安全保护措施，防止AI驱动的蛋白质设计技术被滥用 | 蛋白质生成模型（如AlphaFold3、ESMFold、RFDiffusion等）及其生成的蛋白质结构 | computational protein science | NA | distributional and evolutionary watermarking | generative AI models (AlphaFold3, ESMFold, RFDiffusion) | protein structures | 测试了EGFP和CRISPR-Cas13两种蛋白质 |
| 37 | 2025-07-04 |
Expanding salivary biomarker detection by creating a synthetic neuraminic acid sensor via chimeragenesis
2025-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.13.598939
PMID:38915506
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research paper | 该研究通过合成生物学技术开发了一种全细胞生物传感器，用于检测与口腔鳞状细胞癌相关的唾液生物标志物 | 利用合成生物学技术构建了一种新型嵌合转录因子（Sphnx），用于检测唾液中的N-乙酰-D-神经氨酸（Neu5Ac） | 目前仅为概念验证，尚未应用于临床筛查 | 开发一种非侵入性早期诊断口腔鳞状细胞癌的生物传感器 | 唾液中的N-乙酰-D-神经氨酸（Neu5Ac） | 合成生物学 | 口腔鳞状细胞癌 | 合成生物学技术 | 全细胞生物传感器（WCB） | 生物分子数据 | NA |
| 38 | 2025-07-04 |
Bioremediation of complex organic pollutants by engineered Vibrio natriegens
2025-Jun, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-08947-7
PMID:40335686
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法改造Vibrio natriegens菌株，使其能够在含盐废水和土壤中生物修复复杂的有机污染物 | 利用合成生物学技术将tfoX基因插入Vibrio natriegens染色体并过表达，增强了DNA摄取和整合能力，构建了能够降解多种有机污染物的工程菌株 | 研究仅针对五种有机污染物进行了测试，未涉及其他可能的环境污染物 | 开发能够在高盐环境中生物修复复杂有机污染物的微生物技术 | 工业废水、石油污染和塑料污染中的有机污染物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、基因组工程 | NA | NA | 来自氯碱厂和石油精炼厂的工业废水样品 |
| 39 | 2025-07-04 |
Advancing sustainable practices with Paenibacillus polymyxa: From soil health to medical applications and molecular engineering
2025, AIMS microbiology
IF:2.7Q3
DOI:10.3934/microbiol.2025016
PMID:40600215
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综述 | 本文全面分析了多粘类芽孢杆菌在农业、环境管理、医学和工业中的多功能应用及其在可持续实践中的潜力 | 强调多粘类芽孢杆菌作为蛋白质表达、代谢工程和合成生物学的多功能平台的潜力，并探讨了其遗传资源和代谢能力 | 天然多粘类芽孢杆菌生物资源的广泛利用受到遗传操作能力和工具的限制 | 推动可持续实践，特别是在农业、环境管理、医学和工业领域的应用 | 多粘类芽孢杆菌 | 合成生物学 | NA | 遗传编辑技术 | NA | NA | NA |
| 40 | 2025-07-03 |
Application of the Pipeline Metabolic Model in Food Synthetic Biology
2025-Jul-02, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c04173
PMID:40600973
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research paper | 本文提出了一种名为管道代谢模型的概念和操作框架，旨在简化食品合成生物学中的代谢网络设计和工程 | 将代谢网络抽象为管道（代谢途径）和阀门（关键酶）的网络，实现了更直观的可视化和模块化工程 | 未提及具体模型在更复杂代谢网络中的适用性或验证范围 | 降低合成生物学研究的障碍，促进可持续食品生产的创新 | 功能性食品分子（如碳水化合物、蛋白质和脂肪）的生产 | 食品合成生物学 | NA | 代谢工程 | 管道代谢模型 | NA | 以乳四糖（LNT）合成为案例研究 |