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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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21 | 2025-05-14 |
Synthetic Biology Strategies for the Production of Natural Colorants and Their Non-Natural Derivatives
2025-Mar-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00799
PMID:40066730
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review | 本文综述了合成生物学策略在天然色素及其非天然衍生物生产中的应用 | 讨论了通过合成生物学方法提高天然色素产量及扩展其颜色谱的策略 | 天然色素稳定性低、颜色谱有限及产量低的问题尚未完全解决 | 探讨如何利用合成生物学技术高效生产天然色素及其衍生物 | 天然色素及其非天然衍生物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA |
22 | 2025-05-14 |
Semiautomated Production of Cell-Free Biosensors
2025-Mar-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00703
PMID:40073441
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研究论文 | 本文探讨了利用液体处理机器人技术半自动化生产无细胞生物传感器的可行性 | 首次将液体处理机器人技术应用于无细胞生物传感器的生产,提高了生产效率和一致性 | 仅测试了两种基因表达检测系统,需要更多样化的验证 | 开发可扩展的无细胞生物传感器生产技术 | 无细胞生物传感器 | 合成生物学 | NA | 液体处理机器人技术 | NA | 实验数据 | 384孔板的氟化物传感无细胞生物传感器 |
23 | 2025-05-14 |
Engineering highly active nuclease enzymes with machine learning and high-throughput screening
2025-Mar-19, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101236
PMID:40081373
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研究论文 | 本文介绍了一种名为TeleProt的机器学习框架,用于优化核酸酶在新型化学环境中的催化活性 | TeleProt结合进化和实验数据设计多样化的蛋白质库,显著提升了核酸酶的催化活性,且无需先前的实验数据即可设计高性能初始库 | NA | 优化酶在新型化学环境中的功能,以应用于合成生物学 | 核酸酶 | 机器学习 | NA | 高通量筛选 | 机器学习框架 | 实验数据 | 55,000种核酸酶变体 |
24 | 2025-05-14 |
Integration of therapeutic cargo into the human genome with programmable type V-K CAST
2025-Mar-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57416-2
PMID:40082411
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研究论文 | 该研究展示了如何利用来自未培养微生物的紧凑型V-K CAST系统,在人类细胞基因组中进行可编程DNA整合 | 使用单Cas12k效应器的V-K CAST系统,相比需要三个Cas蛋白的Cascade系统更为简化,能够实现治疗相关转基因的安全港位点整合 | 脱靶事件虽少但可重复地出现在特定基因组区域 | 开发基因组编辑技术以加速治疗开发、生物技术和合成生物学应用 | 人类细胞基因组 | 基因组编辑 | NA | CRISPR-associated (Cas) transposases (CAST) | NA | DNA | 多种人类细胞类型 |
25 | 2025-05-14 |
A globular protein exhibits rare phase behavior and forms chemically regulated orthogonal condensates in cells
2025-Mar-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57886-4
PMID:40069234
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research paper | 研究发现一种结构良好的球状蛋白LplA在体外表现出罕见的LCST型可逆相分离,并在细胞中形成可被小分子调控的正交凝聚体 | 发现了一种结构良好的球状蛋白LplA具有罕见的LCST型可逆相分离行为,并能形成可被小分子特异性溶解的正交凝聚体 | NA | 探索蛋白质相分离行为的化学调控机制及其在生物医学和合成生物学中的应用 | 大肠杆菌中的脂酰蛋白连接酶A(LplA)及其在细胞中的相分离行为 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
26 | 2025-05-14 |
The mutational landscape of Bacillus subtilis conditional hypermutators shows how proofreading skews DNA polymerase error rates
2025-Feb-27, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf147
PMID:40057377
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研究论文 | 本文研究了枯草芽孢杆菌条件性超突变体的突变景观,揭示了校对如何影响DNA聚合酶的错配率 | 通过构建条件性超突变体并利用数学模型,揭示了校对在防止错配修复饱和中的作用及其对聚合酶错配率的固有影响 | 研究中的突变计数可能聚合了异质性突变,且野生型突变途径存在未知因素 | 解析DNA聚合酶初始核苷酸选择性、校对及错配修复对突变率的贡献 | 枯草芽孢杆菌 | 合成生物学 | NA | 突变积累实验、数学模型分析 | NA | 基因组数据 | 多个条件性超突变体 |
27 | 2025-05-14 |
Systematic Characterization and Analysis of the Freeze-Thaw Tolerance Gene Set in the Budding Yeast, Saccharomyces cerevisiae
2025-Feb-27, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26052149
PMID:40076774
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研究论文 | 本文对芽殖酵母(Saccharomyces cerevisiae)中的冻融耐受基因集进行了系统表征和分析 | 在统一的遗传背景(BY4741实验室菌株)下,采用标准化协议对冻融基因家族的热耐受性和存活率进行了完整表征,揭示了五个基因与冻融应激和热休克应激下的存活率增加相关 | 研究仅限于BY4741实验室菌株,可能无法完全代表野生型背景下的基因行为 | 探究能够提高冷冻后存活率的基因修饰,以优化低温培养条件下的生物合成产量 | 芽殖酵母(Saccharomyces cerevisiae)中的冻融耐受基因集 | 合成生物学 | NA | 基因修饰、热休克应激测试 | NA | 基因表达数据 | BY4741实验室菌株中的六个冻融耐受基因 |
28 | 2025-05-14 |
Structural Features of 5' Untranslated Region in Translational Control of Eukaryotes
2025-Feb-25, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26051979
PMID:40076602
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综述 | 本文综述了真核生物mRNA的5'非翻译区(5' UTR)在翻译调控中的关键作用及其结构特征 | 总结了5' UTR结构特征如何独立或通过反式作用因子调控翻译,并探讨了其在合成生物学和mRNA靶向治疗中的潜在应用 | NA | 探讨真核生物基因表达调控中5' UTR的结构特征及其在翻译起始中的功能影响 | 真核生物mRNA的5'非翻译区(5' UTR) | 分子生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
29 | 2025-05-14 |
Engineering the bilayer: Emerging genetic tool kits for mechanistic lipid biology
2021-12, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2021.05.013
PMID:34218059
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research paper | 本文探讨了利用合成生物学和代谢工程策略控制细胞膜脂质组成、物理化学性质及功能的新方法 | 提出了通过可调控表达平台和异源表达基因来精确控制膜脂质组成的新策略 | 尚未完全开发出所有膜脂质结构的合成控制工具 | 探索通过遗传工具包控制细胞膜脂质组成和功能的机制 | 细胞膜脂质 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、异源表达 | NA | NA | NA |
30 | 2025-05-14 |
Digital switching in a biosensor circuit via programmable timing of gene availability
2014-Dec, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/nchembio.1680
PMID:25306443
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研究论文 | 本文展示了通过可编程基因可用性时序在生物传感器电路中实现数字切换的方法 | 利用位点特异性重组酶通过可编程时序控制多基因电路中的基因可用性,显著减少了传感器的基底泄漏并提高了动态范围 | NA | 提高合成生物学中基因电路的稳健性和性能 | 内源性microRNA的比例传感器和多基因电路 | 合成生物学 | NA | 位点特异性重组酶技术 | NA | 基因表达数据 | NA |
31 | 2025-05-13 |
Enhancing mixed-species microalgal biofilms for wastewater treatment: Design, construction, evaluation and optimisation
2025-Aug, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.132600
PMID:40306338
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综述 | 本文详细总结了混合物种生物膜(包括藻类和细菌)的设计、构建、评估和优化(DCEO),并讨论了它们在工业和农业废水及新污染物处理中的相关应用 | 提出了使用DCEO方法来增强混合物种生物膜用于废水处理的新视角,结合了合成生物学的概念和三维生物打印技术 | 未提及具体的实验数据或案例研究来验证DCEO方法的实际效果 | 增强混合物种微藻生物膜用于废水处理 | 混合物种生物膜(藻类和细菌) | 合成生物学 | NA | 三维生物打印 | NA | NA | NA |
32 | 2025-05-13 |
Engineering strategies for producing medium-long chain dicarboxylic acids in oleaginous yeasts
2025-Aug, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.132593
PMID:40294756
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review | 本文综述了在产油酵母中生产中等长链二羧酸(DCAs)的工程策略 | 系统总结了产油酵母中DCAs的生物合成途径及提高产量的工程策略,包括启动子、酶、途径、细胞、发酵和下游工程 | 未提及具体的实验数据或样本量,主要基于现有研究的总结 | 探讨利用产油酵母生物合成高附加值DCAs的工程策略 | 中等长链二羧酸(DCAs)及其在产油酵母中的生物合成 | 合成生物学 | NA | 生物合成、发酵工程 | NA | NA | NA |
33 | 2025-05-13 |
Microbial production of hyaluronic acid: The current advances, engineering strategies and trends
2025-Jul, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2025.03.015
PMID:40154620
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review | 本文综述了透明质酸(HA)的微生物生产方法,包括工程菌株的使用、代谢工程策略、工业生产规模及影响分子量的关键因素 | 讨论了利用基因和代谢工程以及合成生物学的最新进展来解决分子量、粘度和副产物形成等挑战 | 需要进一步研究开发更高效、抗污染且能利用低成本底物的工程菌株 | 促进透明质酸的工业化生产并扩展其应用 | 透明质酸(HA)的微生物生产 | 合成生物学 | NA | 微生物发酵、代谢工程、基因工程 | NA | NA | NA |
34 | 2025-05-13 |
Paving the way for bacteria-based drug delivery: biohybrid microrobots emerging from microrobotics and synthetic biology
2025-Jun, Advanced drug delivery reviews
IF:15.2Q1
DOI:10.1016/j.addr.2025.115577
PMID:40250568
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综述 | 本文探讨了微机器人学和合成生物学的融合如何推动基于细菌的药物递送系统的发展 | 结合微机器人学和合成生物学的优势,开发出生物杂交细菌微机器人,通过外部控制模式(如光、超声波和磁场)提高靶向治疗的精确性和有效性 | 需要解决生物与合成组件之间的兼容性、规模化制造工艺以及针对活体治疗剂的监管路径等关键挑战 | 探索微机器人学和合成生物学在药物递送领域的创新应用 | 细菌作为药物递送系统的载体 | 合成生物学 | NA | 光、超声波和磁场控制 | NA | NA | NA |
35 | 2025-05-13 |
A Photonastic Prototissue Capable of Photo-Mechano-Chemical Transduction
2025-May-12, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202502830
PMID:40350988
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research paper | 本文描述了一种能够模拟活体组织复杂能量转导过程的光敏原型组织的合成方法 | 开发了一种新型的原型细胞,包含基于金纳米颗粒的光热转导原型细胞器和热响应聚合物原型皮层,能够组装成具有光诱导可逆收缩和复杂运动的原型组织 | NA | 构建具有复杂能量转导机制的原型组织,以解决自下而上合成生物学和生物启发材料工程中的关键挑战 | 原型组织和原型细胞 | 合成生物学 | NA | 光热转导技术 | NA | NA | NA |
36 | 2025-05-13 |
Active Armoring of Protocell Condensates with Metal-Phenolic Networks
2025-May-12, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202503077
PMID:40351056
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research paper | 该研究介绍了金属酚醛网络(MPNs)在肽基凝聚物可移除膜化中的应用,为稳定和保护凝聚物免受化学有害物质侵害提供了有效策略 | 利用MPNs的氧化还原活性特性实现膜的形成与解离的可控调节,并通过调整膜厚度实现选择性渗透,模拟生物膜的关键特征 | 研究仅针对特定化学试剂(如TCEP)的保护效果进行了验证,未涉及更广泛的化学环境或生物体系中的实际应用测试 | 开发稳定的、功能化的原始细胞模型,并保护其免受外部化学威胁 | 肽基凝聚物(如聚-L-赖氨酸和三磷酸腺苷凝聚物) | synthetic biology | NA | 核磁共振波谱(NMR) | NA | 化学分析数据 | 未明确样本数量,但涉及特定试剂(如Fe⁺、单宁酸、TCEP)处理的凝聚物 |
37 | 2025-05-13 |
Bridging chemistry and biology for light-driven new-to-nature enantioselective photoenzymatic catalysis
2025-May-12, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d4cs00561a
PMID:40351234
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教程综述 | 本文综述了光驱动酶催化领域的基本原理、不同策略及其在可持续不对称合成中的应用 | 结合光驱动光催化与酶的高选择性,开发新型对映选择性光酶催化系统 | 未提及具体实验数据或样本量,主要为基础原理和策略的综述 | 推动可持续不对称合成的发展 | 光酶催化系统 | 生物催化与光化学 | NA | 光驱动光催化与酶催化结合技术 | NA | NA | NA |
38 | 2025-05-13 |
Ponceau S as a Targeted Modulator for Protein Liquid-Liquid Phase Separation
2025-May-12, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c06432
PMID:40353860
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research paper | 本研究介绍了Ponceau S作为一种选择性调节剂,用于精确调控和监测蛋白质的液-液相分离(LLPS) | 首次将Ponceau S作为小分子调节剂应用于蛋白质液-液相分离的精确调控和监测 | 研究仅针对牛血清白蛋白和溶菌酶进行了验证,未在其他蛋白质系统中测试 | 探索小分子对蛋白质液-液相分离的精确调控机制 | 牛血清白蛋白和溶菌酶 | 生物分子工程 | NA | 荧光监测技术 | NA | 实验数据 | 两种蛋白质(牛血清白蛋白和溶菌酶) |
39 | 2025-05-13 |
Glycosyltransferases in human milk oligosaccharide synthesis: structural mechanisms and rational design
2025-May-09, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103315
PMID:40347686
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review | 本文系统分析了糖基转移酶在人类母乳寡糖合成中的结构机制和理性设计 | 综述了糖基转移酶的结构生物学、优化策略以及深度学习算法在酶改造和从头设计中的创新应用 | 未提及具体实验验证或工业应用中的实际效果 | 探讨糖基转移酶在人类母乳寡糖生物合成中的作用及其优化策略 | 糖基转移酶及其在人类母乳寡糖合成中的应用 | 合成生物学 | NA | 结晶学研究、深度学习算法 | NA | 结构生物学数据 | NA |
40 | 2025-05-13 |
Recent Advances in Biocatalytic and Chemoenzymatic Synthesis of Oligonucleotides
2025-May-05, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202400987
PMID:39854143
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综述 | 本文总结了生物催化和化学酶法合成寡核苷酸的最新进展,强调了酶工程、底物和反应条件优化等方面的创新 | 综述了生物催化和化学酶法在寡核苷酸合成中的最新进展,包括优化的系统和工程酶的使用,以实现化学修饰核苷酸的掺入 | 未提及具体的实验数据或样本量,可能缺乏对某些方法实际应用效果的详细分析 | 探讨生物催化和化学酶法作为寡核苷酸合成的替代策略,以提高合成效率和可持续性 | 寡核苷酸的合成方法 | 生物技术 | NA | 生物催化、化学酶法 | NA | NA | NA |