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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-04-22 |
Plant-derived indole alkaloids in chronic inflammatory diseases: molecular mechanisms, therapeutic potential and translational challenges
2026-Apr-20, Inflammopharmacology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s10787-026-02244-z
PMID:42009998
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综述 | 本文综述了植物来源吲哚生物碱在慢性炎症性疾病中的分子机制、治疗潜力及转化挑战 | 系统整合了植物来源吲哚生物碱的化学、来源及作用机制,强调了其对NF-κB、JAK/STAT、MAPK、PI3K/AKT、NLRP3炎症小体和AhR信号通路等多靶点的调控作用,并指出了其在微生物群和器官选择性治疗方面的前景 | 主要基于临床前证据,临床证据不足,且存在转化障碍 | 评估植物来源吲哚生物碱作为多靶点支架在慢性炎症性疾病中的治疗潜力 | 植物来源的吲哚生物碱 | NA | 慢性炎症性疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 22 | 2026-04-22 |
Synthetic control of implanted engineered liver tissue growth
2026-Apr-17, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adz8362
PMID:41996502
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研究论文 | 本文提出了一种通过合成生物学和工程组织技术,在体内植入后诱导小规模工程肝组织生长扩增的策略 | 整合合成生物学与组织工程工具,实现植入后按需驱动工程肝组织在体内扩增,通过YAP和生长因子信号轴控制 | NA | 解决工程组织植入物在治疗相关尺寸上的扩增障碍,促进临床转化 | 工程肝组织和人肝细胞 | 合成生物学 | 器官衰竭 | 合成生物学工具 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 人类肝细胞 | 通过YAP和生长因子信号轴控制组织扩增的合成生物电路 | 医学 |
| 23 | 2026-04-22 |
Biological Detoxification of Gossypol: Enzymatic Mechanisms, System Engineering, and Prospects for Green Valorization
2026-Apr-16, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c17645
PMID:41989489
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综述 | 本文综述了棉酚的生物解毒机制,包括酶学途径、系统工程策略以及绿色增值前景 | 将棉酚的互变异构和反应热点与可处理目标关联,整合微生物和混合培养途径,并将棉酚活性酶分类为四个模块,提出结合分析学、命运追踪、分层生物测定和毒代动力学的产品解析验证方法 | NA | 探讨棉酚的生物解毒策略,以降低其毒性并促进棉籽副产品的升级利用 | 棉酚及其解毒产物 | NA | NA | 酶工程、多酶级联设计、AI辅助酶/途径挖掘、合成生物学架构 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 微生物、混合培养物 | 功能基团修饰、芳香环裂解、增溶共轭、自由基介导环化等模块化酶途径 | 农业、工业生物技术 |
| 24 | 2026-04-22 |
Plant Synthetic Biology Takes Off: Bryophytes Onboard with New Tools, Systems, and Opportunities
2026-Apr-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00092
PMID:41984537
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综述 | 本文综述了植物合成生物学的最新进展,强调苔藓植物作为实验平台在工具开发和跨植物谱系生物工程方法中的重要性 | 将苔藓植物(包括苔藓、角苔和地钱)作为植物合成生物学的新兴模型系统,以克服被子植物系统的复杂性限制 | 目前大多数研究仍集中于被子植物,苔藓植物系统的应用潜力尚未充分开发 | 推动植物合成生物学领域的发展,通过简化系统实现更广泛的应用 | 苔藓植物(苔藓、角苔、地钱)作为合成生物学的实验平台 | 合成生物学 | NA | 模块化克隆、基因电路、基因组编辑、合成基因组学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 苔藓植物(苔藓、角苔、地钱) | 基因电路 | 农业, 环境, 工业生物技术 |
| 25 | 2026-04-22 |
Synthetic Biology Approaches to Enzymology in Food and Agriculture Systems
2026-Apr-10, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c16525
PMID:41962132
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综述 | 本文综述了合成生物学在食品和农业系统酶学中的应用,探讨了如何通过工程化酶来提升食品安全、生产效率和副产品价值 | 整合合成生物学与酶工程,提出创新且可持续的酶介导解决方案以应对全球粮食不安全问题,并探讨了跨行业技术向食品农业的转化 | 讨论了当前整合合成生物学到全球食品系统中的限制、法规挑战以及未来方向 | 通过合成生物学方法解决全球粮食不安全问题,提升食品系统的可持续性和效率 | 食品和农业系统中的酶学应用,包括酶工程、生物催化和计算设计 | 合成生物学 | NA | 酶工程、生物催化、计算设计 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业, 食品 |
| 26 | 2026-04-22 |
Synthetic Control of Implanted Engineered Liver Tissue Growth
2026-Jan-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.10.693527
PMID:41427324
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研究论文 | 本文提出了一种通过合成生物学工具控制植入后工程肝组织生长的策略,以解决组织工程植入物规模扩大的临床转化难题 | 结合合成生物学和组织工程技术,首次实现植入后通过合成触发因子按需诱导工程肝组织生长 | NA | 开发一种通过植入后诱导生长来扩大工程组织规模的方法,以治疗器官衰竭 | 工程肝组织和人肝细胞 | 组织工程 | 器官衰竭 | 合成生物学工具、YAP和生长因子信号通路调控 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 人肝细胞 | 通过合成生物学工具控制YAP和生长因子信号轴,以驱动组织扩张 | 医学 |
| 27 | 2026-04-22 |
Recent advance in macrolactams: Structure, bioactivity, and biosynthesis
2025-06-01, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2025.108406
PMID:40184666
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综述 | 本文系统综述了2004年至2023年间报道的105个大环内酰胺,涵盖其来源、结构、生物活性及17种已知生物合成途径,并深入分析了相关基因簇、关键酶机制及其在生物合成中的作用 | 首次系统讨论大环内酰胺家族的最新进展,特别关注结构-活性关系及偏离传统共线性规则的新生物合成途径 | NA | 为大环内酰胺的发现及其通过合成生物学方法的可持续生产提供参考 | 105种由微生物菌株产生的大环内酰胺,这些菌株分离自海洋沉积物、土壤、植物和动物等多样环境 | NA | NA | NA | NA | NA | 105种大环内酰胺 | NA | NA | NA | NA |
| 28 | 2026-04-22 |
A size filter at the Golgi regulates apical membrane protein sorting
2024-Oct, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-024-01500-0
PMID:39237743
|
研究论文 | 本研究通过合成生物学方法探究高尔基体是否存在尺寸筛选机制,以调控顶端膜蛋白的排序 | 首次发现高尔基体存在尺寸筛选机制,并揭示Pals1蛋白的及时解离对Crb3正常分选的关键作用 | 研究主要基于三种代表性顶端蛋白(Crb3、Ace2、Muc1),尚未验证是否适用于所有顶端膜蛋白 | 探究顶端膜蛋白分选的分子机制,特别是细胞质结构域尺寸对分选的影响 | 上皮细胞膜蛋白(Crb3、Ace2、Muc1)及其与Pals1蛋白的相互作用 | 细胞生物学 | NA | 合成生物学方法、生物素触发释放系统、蛋白质定位追踪 | NA | 蛋白质定位图像、时间序列运输数据 | 三种代表性顶端膜蛋白(Crb3、Ace2、Muc1)及其修饰变体 | 链霉亲和素结合肽标记系统 | 哺乳动物细胞 | 内质网滞留-生物素触发释放系统,用于同步研究蛋白质从高尔基体到细胞皮层的运输 | 基础细胞生物学研究 |
| 29 | 2026-04-21 |
Functional identification of key enzymes in calycosin biosynthesis in Astragalus membranaceus and establishment of heterologous expression system
2026-Dec, Pharmaceutical science advances
DOI:10.1016/j.pscia.2026.100118
PMID:42005051
|
研究论文 | 本研究鉴定了黄芪中毛蕊异黄酮生物合成的三个关键酶,并成功在酵母和烟草中建立了异源表达系统 | 揭示了毛蕊异黄酮的新型合成途径,发现AmOMT2的多功能性拓宽了AmIFS的底物范围 | NA | 阐明黄芪中毛蕊异黄酮的生物合成途径并建立异源生产系统 | 黄芪(Astragalus membranaceus)及其关键生物合成酶 | 合成生物学 | NA | 异源表达、组织特异性表达分析 | NA | NA | NA | 异源表达系统 | 酵母, 烟草 | 毛蕊异黄酮生物合成途径(涉及AmIFS、AmOMT2、AmI3'H三个关键酶) | 医药 |
| 30 | 2026-04-21 |
Deep learning revolutionizes protein research: Advances in structure prediction, functional annotation, and engineered design
2026-Jun, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2026.03.012
PMID:41839238
|
综述 | 本文综述了深度学习如何通过连接结构预测、功能注释和理性设计,形成一个协同循环,从而彻底改变蛋白质研究 | 提出了一个统一的“预测-理解-创造”范式,展示了深度学习在蛋白质结构预测、功能注释和从头设计中的突破性进展,并阐述了这些领域如何相互促进,形成一个自我强化的循环 | 在数据稀缺性、模型可解释性以及分布外泛化方面仍存在挑战 | 阐述深度学习如何变革蛋白质研究,并展示结构预测、功能注释和理性设计之间的协同循环 | 蛋白质(特别是单域、球状蛋白质) | 机器学习 | NA | 深度学习,生成式AI,逆向折叠模型,混合实验-计算工作流(如与AI集成的冷冻电镜) | 端到端深度学习模型(如AlphaFold2),多模态模型,生成式AI | 序列数据,3D坐标,相互作用数据 | NA | NA | NA | NA | 药物开发,合成生物学 |
| 31 | 2026-04-21 |
Microbial lipids for a sustainable future: the growing potential of synthetic microbial engineering for consumer oils
2026-May, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2026.2615047
PMID:41692578
|
综述 | 本文探讨了合成微生物工程在可持续生产消费油脂方面的潜力,以应对传统作物依赖带来的环境问题 | 利用合成生物学和自动化生物铸造技术,开发微生物作为可持续油脂来源的新方法 | NA | 推动消费油脂产业向可持续微生物生物制造经济转型 | 微生物油脂及其在食品、营养品、塑料、化妆品、燃料等产品中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成酵母基因组学、自动化生物铸造 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | NA | 食品, 营养品, 塑料, 动物饲料, 化妆品, 药品, 燃料 |
| 32 | 2026-04-21 |
Engineering non-ribosomal peptide synthesis: tuning the antibiotics engine of the microbial world
2026-May, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2026.2615819
PMID:41771683
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综述 | 本文综述了通过合成生物学方法工程化改造非核糖体肽合成酶以提高抗生素产量和生物活性的主要进展 | 系统总结了通过代谢工程、启动子调控和异源表达等合成生物学策略优化非核糖体肽生产的创新方法 | NA | 利用合成生物学技术优化非核糖体肽合成酶,以提高抗生素类肽的产量和生物活性 | 非核糖体肽合成酶及其产生的抗生素肽类 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、代谢工程、异源表达 | NA | NA | NA | 启动子工程、代谢通路重定向 | 微生物 | 生物合成基因簇、代谢通路工程 | 医药 |
| 33 | 2026-04-21 |
OptoChaperone─A Biohybrid Tool for Regulating Protein Condensates in Cells and In Vitro
2026-Apr-19, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c04074
PMID:42002974
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研究论文 | 本文介绍了一种名为OptoChaperone的光激活生物杂交系统,用于在体外和活细胞中精确、可逆地调控蛋白质凝聚体的形成与溶解 | 开发了一种基于光响应开关的生物杂交工具,实现了对蛋白质液-液相分离(LLPS)的可逆、时空控制,无需化学添加剂或客户蛋白的基因修饰 | NA | 研究蛋白质凝聚体的调控机制,开发新型工具以解析其在细胞生理和病理中的作用 | 疾病相关蛋白质凝聚体,如融合肉瘤蛋白、TAR DNA结合蛋白43和热休克因子1 | 合成生物学 | NA | 光激活分子系统 | NA | NA | NA | OptoChaperone | 活细胞 | 光响应开关系统,用于控制分子伴侣活性以调节蛋白质凝聚体 | 医学, 合成生物学, 生物分子工程 |
| 34 | 2026-04-21 |
High-performance bioimaging and biosensing via nucleobase-editing enzymes
2026-Apr-17, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d5cs00678c
PMID:41773995
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综述 | 本文综述了核苷碱基编辑酶在生物成像和生物传感中的高性能应用,包括其催化原理、集成模式以及未来发展方向 | 将核苷碱基编辑酶重新用作可编程执行器,实现高特异性、高效放大和生理条件兼容的敏感监测 | NA | 探讨核苷碱基编辑酶在生物传感和生物成像中的应用潜力 | 核苷碱基编辑酶(如脱氨酶、甲基转移酶/去甲基化酶和DNA糖基化酶)及其在核酸、蛋白质和细胞过程监测中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 诊断, 治疗监测, 合成生物学 |
| 35 | 2026-04-21 |
Rhodo-Box: A Synthetic Biology Toolbox to Facilitate Metabolic Engineering of Rhodobacter sphaeroides
2026-Apr-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00808
PMID:41832780
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研究论文 | 本文介绍了Rhodo-Box,一个为Rhodobacter sphaeroides设计的合成生物学工具箱,旨在促进其代谢工程应用 | 开发了Rhodo-Box工具箱,通过适应和扩展Zymo-Parts模块化克隆框架,为Rhodobacter sphaeroides提供了标准化的遗传元件和半自动化克隆方法 | NA | 促进Rhodobacter sphaeroides作为可持续生物制造底盘微生物的代谢工程应用 | Rhodobacter sphaeroides(一种紫色非硫α-变形菌) | 合成生物学 | NA | 模块化克隆、半自动化克隆 | NA | NA | NA | Zymo-Parts, Gibson Assembly | Rhodobacter sphaeroides | 包括复制起点、启动子、诱导表达系统、RBS和转录终止子在内的遗传元件集合 | 工业生物技术 |
| 36 | 2026-04-21 |
Vacuum and Sonication Treatment Enable Efficient Transient Gene Expression in Various Monocot and Eudicot Plant Seedlings
2026-Apr-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00855
PMID:41865287
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研究论文 | 本文介绍了一种名为VAST的瞬时基因表达方法,通过真空和超声处理显著提高了多种单子叶和双子叶植物幼苗的基因表达效率和适用性 | VAST方法结合了真空渗透和超声预处理,优化了植物生长条件,相比现有方法在提高基因表达效率的同时减少了组织损伤,并成功应用于多种关键作物物种 | NA | 开发一种高效、通用的瞬时基因表达方法,以促进功能基因组学、合成生物学和生物技术研究 | 多种单子叶和双子叶植物幼苗,包括番茄、谷子、柳枝稷、玉米和小麦等关键作物物种 | 合成生物学 | NA | 瞬时基因表达、真空渗透、超声处理 | NA | NA | NA | NA | 番茄、谷子、柳枝稷、玉米、小麦等植物幼苗 | NA | 农业、生物技术 |
| 37 | 2026-04-21 |
Vibrio natriegens, a Promising Chassis from Strain Property to Protein Expression: A Review
2026-Apr-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00761
PMID:41886740
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综述 | 本文系统介绍了Vibrio natriegens作为合成生物学中蛋白质表达宿主的生物学特性、工程化改造及最新应用进展 | 重点关注Vibrio natriegens在蛋白质表达领域的最新研究成果,这是以往综述中较少涉及的内容 | NA | 为研究人员提供使用Vibrio natriegens进行蛋白质表达的全面概述,并推动合成生物学领域的更广泛研究 | Vibrio natriegens菌株及其在蛋白质表达中的应用 | 合成生物学 | NA | 分子生物学工具、基因组注释、代谢途径分析 | NA | NA | NA | NA | Vibrio natriegens | NA | 工业生物技术 |
| 38 | 2026-04-21 |
Multifunctional Roles and Microbial Production Bottlenecks of Ergothioneine
2026-Apr-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00735
PMID:41919719
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综述 | 本文综述了麦角硫因的多功能作用、微生物生产瓶颈、关键酶发现、代谢工程策略及其在食品、化妆品和制药行业的应用 | 系统总结了麦角硫因生物合成与分解代谢途径关键酶的最新发现,以及通过合成生物学和代谢组学实现的高效异源生产策略,包括化学酶级联催化路线达到的47.3 g/L最高产量 | 作为综述文章,未提出新的实验数据或原创性生产方法,主要基于现有文献进行总结分析 | 探讨麦角硫因的生产瓶颈、生物合成途径优化及其在多个工业领域的应用潜力 | 麦角硫因及其生物合成与分解代谢途径的关键酶 | 合成生物学 | NA | 代谢组学、代谢工程、化学酶催化级联 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 大肠杆菌、酿酒酵母 | 麦角硫因生物合成途径的异源重构与优化 | 食品、化妆品、制药 |
| 39 | 2026-04-21 |
HySimODE: A hybrid stochastic-deterministic simulation framework for multiscale models of biological systems
2026-Apr-17, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag185
PMID:41999207
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研究论文 | 介绍HySimODE框架,一种用于生物系统多尺度建模的混合随机-确定性仿真工具 | 通过机器学习分类器自动分配物种的随机或确定性机制,无需手动指定机制或重新构建模型 | NA | 为混合随机-确定性生物化学系统仿真提供自动化框架 | 生物化学ODE模型 | 计算生物学 | NA | 机器学习分类器、刚性ODE求解器 | 混合随机-确定性模型 | ODE模型 | 涵盖多种动态机制的数据集 | NA | NA | NA | 合成生物学、神经生物学 |
| 40 | 2026-04-21 |
LinkCraft: An interactive tool for the design of flexible linkers
2026-Apr-17, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2026.169814
PMID:42001978
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研究论文 | 本文介绍了一个名为LinkCraft的计算工具,用于理性设计多域蛋白质中的内在无序连接子 | LinkCraft工具通过集成序列组成、电荷模式和长度等多因素,支持基于理化性质的自定义连接子序列生成和评估,推动了从以域为中心到以多模块为中心的蛋白质设计转变 | NA | 开发一个计算工具以促进多域蛋白质中内在无序连接子的理性设计 | 多域蛋白质中的内在无序连接子 | 合成生物学 | NA | 计算建模 | NA | 蛋白质序列和结构数据 | NA | NA | NA | NA | 生物技术, 合成生物学 |