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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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21 | 2025-07-03 |
Design principle of successful genome editing applications using CRISPR-based toolkits
2025-Jul-01, Journal of applied genetics
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s13353-025-00979-z
PMID:40591237
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research paper | 本文讨论了利用CRISPR工具包设计成功基因组编辑应用的原理和策略 | 提出了两种独立策略开发一锅质粒系统,并讨论了减少脱靶切割的方法 | 未提及具体实验验证结果或性能指标 | 开发基于CRISPR的基因编辑系统 | 微生物宿主(如酵母) | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9, Cpf1, dCas9 | NA | NA | NA |
22 | 2025-07-03 |
Abstraction hierarchy to define biofoundry workflows and operations for interoperable synthetic biology research and applications
2025-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61263-6
PMID:40593727
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研究论文 | 提出一个抽象层次结构,用于定义生物铸造厂的工作流程和操作,以促进合成生物学研究的互操作性 | 将生物铸造厂活动组织为四个可互操作的层次:项目、服务/能力、工作流程和单元操作,从而优化设计-构建-测试-学习(DBTL)循环 | NA | 提高合成生物学研究的可扩展性和效率 | 生物铸造厂的工作流程和操作 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
23 | 2025-07-03 |
Development and application of a highly specific whole-cell biosensor for supersulfide detection in environmental samples
2025-Jun-25, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2025.117731
PMID:40592263
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研究论文 | 开发并应用了一种高特异性的全细胞生物传感器,用于环境样品中超硫化物的检测 | 首次报道了使用Agrobacterium tumefaciens的超硫化物感应抑制子BigR(AtBigR)构建的全细胞生物传感器,该系统对超硫化物具有极高的选择性 | NA | 开发一种能够准确检测超硫化物的生物传感器,以促进对超硫化物在生物学、环境和锂硫电池中作用的理解 | 超硫化物(如元素硫、无机多硫化物和有机多硫化物) | 合成生物学 | NA | 全细胞生物传感器技术 | AtBigR-WCB(基于AtBigR的全细胞生物传感器) | 环境样品(海洋沉积物、锂硫电池电解质) | 多种海底地形的海洋沉积物样品及锂硫电池电解质样品 |
24 | 2025-07-03 |
The Japan-UK Synthetic Biology Conference, Spring 2025: Strengthening Global Links to Engineer Biology
2025-Jun-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00232
PMID:40538270
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评论 | 本文总结了2025年春季日本-英国合成生物学会议的内容,旨在促进合成生物学领域研究者之间的国际合作 | 强调国际合作在推动合成生物学发展和可持续生物经济转型中的重要性 | 未提供具体研究成果或实验数据,仅基于会议讨论的观点总结 | 促进合成生物学领域的国际合作与研究进展 | 合成生物学领域的国际合作与研究趋势 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
25 | 2025-07-03 |
Advances in programmable DNA nanostructures enabling stimuli-responsive drug delivery and multimodal biosensing
2025-Jun-17, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d5cb00057b
PMID:40585578
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综述 | 本文综述了DNA纳米技术在精准医学中的应用,特别是在靶向药物递送和生物医学成像方面的最新进展 | 介绍了可编程DNA纳米结构在动态响应肿瘤微环境信号(如pH、酶活性、氧化还原梯度)以实现触发药物释放方面的创新应用 | 存在规模化制造瓶颈、免疫兼容性优化以及长期纳米毒性严格评估等关键转化挑战 | 探讨DNA纳米技术在精准医学中的应用,特别是在靶向药物递送和生物医学成像方面的潜力 | DNA工程纳米结构,包括基于瓦片的组装、折纸框架、球形核酸和刺激响应水凝胶 | 合成生物学 | 癌症 | 荧光共振能量转移(FRET)探针、电化学发光放大电路、SERS底物和细胞可变区传感技术 | NA | NA | NA |
26 | 2025-07-03 |
Structural insights and rational engineering strategies for modular polyketide synthases: A review
2025-Jun-16, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.145299
PMID:40533022
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综述 | 本文综述了模块化聚酮合酶(PKSs)的结构见解和理性工程策略,特别关注顺式酰基转移酶(AT)PKSs的设计和改造 | 系统总结了顺式AT PKSs的多维设计策略,包括模块化构建块的选择和基于结构及机制见解的催化域设计 | 未提及具体的实验验证数据或案例研究 | 探索顺式AT PKSs的理性设计策略,以增强产物产量并扩展可获得的聚酮化合物种类 | 顺式酰基转移酶(AT)聚酮合酶(PKSs) | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
27 | 2025-07-03 |
Engineering artificial microbial consortia for personalized gut microbiome modulation and disease treatment
2025-Jun, Annals of the New York Academy of Sciences
IF:4.1Q1
DOI:10.1111/nyas.15352
PMID:40320966
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review | 本文提出了一种通过工程化人工微生物群落来个性化调节肠道微生物组并治疗疾病的新方法 | 整合合成生物学、系统生物学和先进培养技术,设计定制化的微生物群落以执行特定功能 | 需要进一步的临床试验来评估其安全性、有效性和长期影响 | 通过精确操控肠道微生物组来治疗代谢紊乱、炎症和胃肠道感染等疾病 | 人工微生物群落及其在肠道中的功能 | 合成生物学 | 代谢紊乱、炎症、胃肠道感染 | 合成生物学、系统生物学、先进培养技术 | NA | NA | NA |
28 | 2025-07-03 |
Design Principles Of Inorganic-Protein Hybrid Materials for Biomedicine
2025-Jun, Exploration (Beijing, China)
DOI:10.1002/EXP.20240182
PMID:40585774
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综述 | 本文综述了无机-蛋白质杂化材料(IPHMs)的结构基础和设计原则,并探讨了其在生物医学领域的潜在应用 | 提出了基于生物活性单元合成具有高度生物安全性的IPHMs的新材料设计与合成方法,并探讨了原位杂化材料合成的思路 | 未提及具体的实验验证或实际应用案例 | 探讨无机-蛋白质杂化材料的设计原则及其在生物医学领域的应用 | 无机-蛋白质杂化材料(IPHMs) | 材料科学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
29 | 2025-07-03 |
Expression of microbial lipase in filamentous fungus Aspergillus niger: a review
2024-Jul, 3 Biotech
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s13205-024-03998-5
PMID:38841267
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综述 | 本文综述了微生物脂肪酶在丝状真菌黑曲霉中的表达及其应用 | 总结了提高脂肪酶表达的各种策略,并探讨了CRISPR/Cas9基因编辑技术在构建工程化脂肪酶生产菌株中的应用 | NA | 综述微生物脂肪酶的来源、特性及其在黑曲霉中的表达优化策略 | 微生物脂肪酶及其在丝状真菌黑曲霉中的表达 | 合成生物学与系统生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑技术 | NA | 文献数据 | NA |
30 | 2025-07-03 |
Context-dependent redesign of robust synthetic gene circuits
2024-Jul, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.01.003
PMID:38320912
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综述 | 本文综述了合成基因电路设计中电路与宿主相互作用的动态影响及控制策略 | 总结了电路与宿主相互作用的最新进展,强调了宿主感知和资源感知的设计策略 | 未提及具体实验数据或案例研究 | 探讨合成基因电路设计中电路与宿主相互作用的动态影响及控制策略 | 合成基因电路及其与宿主细胞的相互作用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
31 | 2025-07-03 |
TidyTron: Reducing lab waste using validated wash-and-reuse protocols for common plasticware in Opentrons OT-2 lab robots
2024-Apr, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2023.08.007
PMID:37696493
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研究论文 | 介绍并验证了TidyTron,一个用于清洁被DNA、大肠杆菌和酿酒酵母污染的微量移液器吸头和微孔板的协议库 | 开发了首个使用低成本实验室机器人进行塑料器皿有效去污的开源验证协议,促进了安全重复使用 | 仅测试了DNA、E. coli和S. cerevisiae的污染,未涵盖所有可能的生物污染物 | 提高生物技术实验室的可持续性,减少塑料废物和重复成本 | 微量移液器吸头和微孔板 | 合成生物学 | NA | qPCR, 流式细胞术 | NA | 实验数据 | 未明确提及具体样本数量,但涉及多种清洁溶液、接触时间和搅拌方法的测试 |
32 | 2025-07-03 |
Digital switching in a biosensor circuit via programmable timing of gene availability
2014-Dec, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/nchembio.1680
PMID:25306443
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研究论文 | 该研究展示了通过编程控制基因可用时间,利用位点特异性重组酶在多基因电路中纠正不良效应,显著提高了内源性microRNA比例传感器的性能 | 首次提出通过编程控制基因可用时间的方法来优化基因电路设计,显著提高了传感器的动态范围和特异性 | 研究仅针对microRNA比例传感器进行了验证,尚未在其他类型基因电路中测试该方法的普适性 | 开发更稳健的基因电路部署方法,提高合成生物学应用的可靠性 | 基因电路和microRNA比例传感器 | 合成生物学 | NA | 位点特异性重组酶技术 | NA | 基因表达数据 | NA |
33 | 2025-07-02 |
Expressing exogenous gene in Chlamydomonas reinhardtii chloroplast with viral replication elements
2025-Oct, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.132784
PMID:40490158
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研究论文 | 本文开发了一种基于病毒复制元件的基因表达平台,用于在莱茵衣藻叶绿体中稳定高效地表达外源基因 | 利用甜菜卷顶病毒的复制机制构建表达平台,相比传统同源重组方法显著提高了基因表达水平和产物产量 | NA | 解决莱茵衣藻叶绿体作为合成生物学底盘时产物产量低的问题 | 莱茵衣藻叶绿体 | 合成生物学 | NA | 病毒复制元件介导的基因表达 | NA | NA | NA |
34 | 2025-07-02 |
Understanding carboxysomes to enhance carbon fixation in crops
2025-Jun-30, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20253072
PMID:40570186
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research paper | 探讨羧酶体在提高作物碳固定效率中的作用及其在合成生物学中的应用 | 研究羧酶体的模块化自组装特性及其在植物叶绿体中的移植潜力,以提高光合作用效率 | 对羧酶体外壳的精确机械作用机制尚不明确,且需要找到合适的碳酸氢盐转运体并优化表达水平 | 提高作物光合作用效率,增强碳固定能力 | 羧酶体及其在作物中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
35 | 2025-07-02 |
Advancements in DNA-Driven Precision Modulation of Cell Surface Receptor for Programmable Cellular Functions
2025-Jun-30, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202505073
PMID:40588818
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综述 | 本文全面总结了基于DNA的策略在受体工程中的最新进展,包括遗传和非遗传方法 | 整合遗传和非遗传DNA工程策略,推动下一代智能细胞系统的发展 | NA | 理解细胞通讯并开发靶向治疗 | 细胞表面受体 | 合成生物学与DNA纳米技术 | NA | DNA origami, 功能性核酸(FNAs), DNA逻辑电路, DNA纳米机器人 | NA | NA | NA |
36 | 2025-07-02 |
Modular RNAi Pathway Engineering Enhances Plasmid Copy Number Control in Yeast Bioproduction System
2025-Jun-29, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.70014
PMID:40583249
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研究论文 | 本研究通过重建酵母中的正交RNA干扰系统,开发了一种可动态调控质粒拷贝数的合成生物学底盘,显著提高了类胡萝卜素生物合成途径的产量 | 整合异源RNAi通路基因并设计靶向质粒选择标记的siRNAs,实现了化学诱导的质粒拷贝数动态调控,最高可扩增7.13倍 | 研究仅针对酿酒酵母系统,未在其他微生物宿主中验证通用性 | 开发动态调控质粒拷贝数的合成生物学工具以优化微生物细胞工厂的代谢通量 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)及其质粒系统 | 合成生物学 | NA | RNA干扰(RNAi)、siRNA设计 | NA | 分子生物学实验数据 | NA |
37 | 2025-07-02 |
Revolutionizing lignin valorization: Key advances in demethylation, methylation, and methyl metabolism
2025-Jun-28, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108634
PMID:40588043
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综述 | 本文系统展望了生物木质素增值化中的去甲基化、甲基化和甲基代谢过程 | 提出了一种有前景的微生物木质素增值化甲基循环路线,并强调了机器学习辅助酶工程、合成生物学和代谢工程等新型先进策略 | NA | 促进木质素的高效生物转化及其增值化,推动木质素基生物经济的发展 | 木质素及其衍生物 | 合成生物学 | NA | 机器学习辅助酶工程、合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA |
38 | 2025-07-02 |
Edible and Medicinal Fungi as Candidate Natural Antidepressants: Mechanisms and Nutritional Implications
2025-Jun, Molecular nutrition & food research
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mnfr.70080
PMID:40289452
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综述 | 本文系统综述了食用药用真菌(EMFs)作为天然抗抑郁剂的潜力,重点关注其生物活性化合物和作用机制 | 探讨了EMFs通过调节神经递质系统、色氨酸-犬尿氨酸通路、HPA轴及神经炎症等多途径发挥抗抑郁作用,并涉及肠道-脑轴机制及3D食品打印、合成生物学等创新技术应用 | 存在标准化不足和缺乏临床验证的挑战 | 评估食用药用真菌的抗抑郁潜力及其营养学意义 | 食用药用真菌(如灵芝、猴头菇、茯苓、蛹虫草)及其生物活性成分 | 营养学与神经科学交叉领域 | 抑郁症 | 3D食品打印、合成生物学、人工智能建模 | NA | 文献数据与临床前研究数据 | NA(系统综述未报告具体样本量) |
39 | 2025-07-02 |
Reconfigurable nanomaterials folded from multicomponent chains of DNA origami voxels
2024-11-27, Science robotics
IF:26.1Q1
DOI:10.1126/scirobotics.adp2309
PMID:39602517
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研究论文 | 本文介绍了一种基于DNA折纸技术的模块化系统,能够实现复杂三维纳米结构的快速高效重构 | 开发了具有可编程三维连接的DNA折纸'体素'模块化系统,实现了多种形状的组装和快速可逆的全局结构重构 | 当前合成系统在分层组装中的产量较低,且在多样结构间的快速高效重构方面仍面临挑战 | 开发可重构的纳米材料,为纳米机器人系统的组装提供模块化组件 | DNA折纸体素 | 纳米技术 | NA | DNA折纸技术 | NA | NA | 50种结构原型 |
40 | 2025-07-01 |
Multiactivity of Nanozyme Liposome Regulates the Homeostasis of Biochemical Microenvironment
2025-Jun-22, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202501918
PMID:40545445
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研究论文 | 本文开发了一种具有多酶活性的仿生脂质体,用于调节外源性植入物诱导的促炎因子 | 通过自组装人工膜在CeO纳米颗粒上构建具有多酶活性的仿生脂质体,模拟内皮细胞膜功能,调节生化微环境稳态 | 未提及具体临床前或临床试验数据,实际应用效果尚待验证 | 开发用于组织工程的合成生物学治疗脂质体,调节移植重塑过程中的生化微环境 | 仿生脂质体及其在调节促炎因子和血小板聚集中的作用 | 合成生物学 | NA | 纳米酶技术、脂质体自组装技术 | NA | 实验数据 | NA |