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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-04-02 |
Enzymatic and microbial routes to bioplastics: The green chemistry frontier of biopolymers
2026-Apr, FEBS open bio
IF:2.8Q3
DOI:10.1002/2211-5463.70241
PMID:41891232
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综述 | 本文全面综述了通过微生物和酶法生产生物塑料(特别是聚羟基脂肪酸酯)的代谢途径、结构特性和新兴技术创新 | 重点关注体外酶法合成PHA的最新进展,包括PHA合酶工程、无细胞代谢工程平台、酶固定化和表面展示策略,以实现完全可编程和模块化的聚合 | NA | 综述微生物和酶法生产生物塑料(尤其是聚羟基脂肪酸酯)的技术进展,并探讨其在循环生物经济框架下的规模化、可持续生产策略 | 生物塑料,特别是聚羟基脂肪酸酯(PHA)、PLA前体、细菌纤维素、微生物聚酰胺和其他生物衍生聚合物 | NA | NA | 酶法合成、无细胞代谢工程、酶固定化、表面展示策略 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 细菌 | 代谢途径(PHA生物合成途径) | 环境, 工业生物技术, 材料 |
| 22 | 2026-04-02 |
Oncolytic Virotherapy for Solid Tumors: Clinical Advances and Future Directions
2026-04, Surgical oncology clinics of North America
IF:2.4Q2
DOI:10.1016/j.soc.2025.10.011
PMID:41903995
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综述 | 本文综述了溶瘤病毒疗法治疗实体瘤的生物学基础、临床应用、组合疗法、新一代病毒平台的发展以及临床转化面临的主要障碍和应对策略 | 系统性地概述了溶瘤病毒疗法的最新临床进展、新兴组合策略以及基于合成生物学和免疫肿瘤学发展的下一代病毒平台,并指出了克服临床转化障碍的新兴策略 | NA | 总结溶瘤病毒疗法在实体瘤治疗中的现状、挑战与未来发展方向 | 溶瘤病毒及其在实体瘤治疗中的应用 | NA | 实体瘤 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 23 | 2026-04-02 |
Programmable Synthesis of DNA Networks in Giant Vesicles via Rolling Circle Amplification
2026-Apr-01, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.6c00726
PMID:41919686
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研究论文 | 本文介绍了一种通过滚环扩增在巨型囊泡内可编程合成DNA网络的仿生囊泡平台 | 利用滚环扩增在囊泡内构建长DNA链网络,模拟细胞骨架功能,将分子尺度生化活动与介观尺度机械行为耦合 | NA | 创建具有功能调控和机械反馈能力的合成细胞 | 巨型囊泡、DNA网络、DNA折纸纳米孔 | 合成生物学 | NA | 滚环扩增、DNA折纸 | NA | NA | NA | NA | NA | 囊泡内DNA网络结构(模拟细胞骨架功能) | 合成生物学、生物制造、仿生材料 |
| 24 | 2026-04-02 |
Multifunctional Roles and Microbial Production Bottlenecks of Ergothioneine
2026-Apr-01, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00735
PMID:41919719
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综述 | 本文综述了麦角硫因(EGT)的多功能作用、微生物生产瓶颈以及合成生物学和代谢工程策略的最新进展 | 总结了EGT生物合成和降解途径关键酶的发现与鉴定,以及通过异源生产和化学酶催化级联路线实现高产量(最高达47.3 g/L)的创新策略 | NA | 探讨EGT的生产方法、生物合成途径及其在食品、化妆品和制药行业的应用 | 麦角硫因(EGT)及其在非天然宿主菌株(如大肠杆菌和酵母)中的异源生产 | NA | NA | 合成生物学、代谢组学、代谢工程、化学酶催化级联 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌, 酵母 | NA | 食品, 化妆品, 制药 |
| 25 | 2026-04-02 |
Structures of pentatricopeptide repeat proteins
2026-Apr-01, Acta crystallographica. Section F, Structural biology communications
DOI:10.1107/S2053230X26002311
PMID:41919993
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综述 | 本文系统综述了pentatricopeptide repeat (PPR)蛋白的晶体结构,包括天然和设计蛋白在apo和RNA结合状态下的结构特征 | 首次全面汇编并分析了所有PPR蛋白的晶体结构,揭示了PPR识别密码、RNA结合时的构象变化以及模块化架构的结构基础 | NA | 研究PPR蛋白的结构特征及其在细胞器基因表达中的功能 | PPR蛋白的晶体和冷冻电镜结构 | 结构生物学 | NA | 晶体学,冷冻电镜 | NA | 结构数据 | 113个结构(30个PPR和83个核糖体PPR结构) | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 26 | 2026-04-02 |
Engineering a Virus-Derived X Family DNA Polymerase FvPolX for de novo DNA Synthesis
2026-Mar-31, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.75017
PMID:41915827
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研究论文 | 本文报道了从Faustovirus中发现的FvPolX DNA聚合酶,并通过蛋白质工程改造,显著提升了其催化活性,用于从头DNA合成 | 首次发现并工程化微生物来源的X家族DNA聚合酶FvPolX,使其在催化活性和结构最小化方面超越传统动物来源的聚合酶 | 研究主要集中于酶学特性,未涉及大规模工业应用或体内验证 | 开发高效酶工具用于合成生物学中的从头DNA合成 | Faustovirus来源的X家族DNA聚合酶FvPolX及其工程变体 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、酶催化 | NA | 酶活性数据 | NA | 蛋白质工程 | Faustovirus(病毒) | NA | 工业生物技术 |
| 27 | 2026-04-02 |
Vibrio natriegens, a Promising Chassis from Strain Property to Protein Expression: A Review
2026-Mar-26, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00761
PMID:41886740
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综述 | 本文系统介绍了Vibrio natriegens作为蛋白质表达底盘的基本生物学特性、工程化改造进展及其在合成生物学中的应用 | 重点关注Vibrio natriegens在蛋白质表达领域的最新研究和应用成果,这是以往综述中较少涉及的内容 | NA | 为研究人员提供使用Vibrio natriegens进行蛋白质表达的全面概述,突出其优势和应用前景 | Vibrio natriegens菌株及其工程化改造 | 合成生物学 | NA | 分子生物学工具 | NA | NA | NA | NA | Vibrio natriegens | NA | 工业生物技术 |
| 28 | 2026-04-02 |
Biosilicification across Biological Hierarchies
2026-Mar-26, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5c22206
PMID:41888096
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综述 | 本文探讨了生物硅化在分子、细胞和组织层面的进展,强调了其在增强生物材料性能、保护生命系统及整合合成与生物物质方面的潜力 | 挑战了硅在生物学中惰性的传统观点,并利用合成生物学和材料科学实现超越进化时间尺度的可编程硅化调控 | NA | 研究生物硅化作为平台,以改善生物材料性能、保护生命系统并整合合成与生物物质 | 硅在生物体中的化学形式、海洋生物(如硅藻)的硅化途径,以及硅-生物界面的工程应用 | 材料科学 | NA | 合成生物学、诱变、材料科学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、材料 |
| 29 | 2026-04-02 |
Vacuum and Sonication Treatment Enable Efficient Transient Gene Expression in Various Monocot and Eudicot Plant Seedlings
2026-Mar-22, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00855
PMID:41865287
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研究论文 | 本文介绍了一种名为VAST(真空和超声辅助瞬时转化)的瞬时基因表达方法,该方法通过优化植物生长条件并结合真空渗透和超声预处理,显著提高了多种单子叶和双子叶植物幼苗的基因表达效率 | VAST方法通过结合真空和超声处理,提高了瞬时基因表达的效率和适用范围,相比现有方法减少了组织损伤,并成功应用于多种关键作物物种 | NA | 开发一种高效且通用的瞬时基因表达方法,以促进功能基因组学、合成生物学和生物技术研究 | 多种单子叶和双子叶植物幼苗,包括番茄、谷子、柳枝稷、玉米和小麦等作物 | 合成生物学 | NA | 真空渗透和超声预处理 | NA | NA | NA | VAST | 番茄、谷子、柳枝稷、玉米、小麦 | 瞬时基因表达系统 | 农业, 生物技术 |
| 30 | 2026-04-02 |
Membrane-Based Assembly and Interactions in Immune Receptors
2026-Mar-22, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.5c00993
PMID:41865294
|
综述 | 本文综述了免疫受体在脂质双层中的组装、分子相互作用原理及结构基序,重点探讨了其跨膜结构域在受体构建和功能中的作用 | 系统总结了免疫受体跨膜结构域特异性相互作用的分子原理,并指出这些原理可应用于合成生物学 | NA | 理解免疫受体在膜中的组装机制及其跨膜结构域在结构和功能中的作用 | 免疫受体(特别是具有跨膜结构域的模块化受体) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 31 | 2026-04-02 |
Decoding nucleic acid contributions to phase separation and ordering in biomolecular condensates
2026-Mar-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag253
PMID:41909948
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研究论文 | 本文通过实验和分子动力学模拟,探讨了核酸在生物分子凝聚体相分离和有序化中的作用,并提出了一个评估凝聚体稳定性的指标 | 首次系统研究了核酸长度和杂交程度对相分离行为的影响,并揭示了液滴中液晶有序性的形成条件及其对动力学的不同影响 | 研究基于模型系统,可能无法完全反映自然生物系统中的复杂性 | 填补核酸在液-液相分离(LLPS)中作用的研究空白,为合成生物学和生物医学应用提供设计指导 | 由寡核苷酸和适度带电无序肽组成的模型系统 | 合成生物学 | NA | 分子动力学模拟 | NA | 实验数据和模拟数据 | NA | NA | NA | NA | 生物医学, 合成生物学 |
| 32 | 2026-04-02 |
Programmable, target-induced fluorogenic CRISPR-tDeg platform for live-cell RNA visualization
2026-Mar-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag279
PMID:41909946
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研究论文 | 本研究开发了一种名为CtDeg的模块化RNA成像平台,用于活细胞中RNA的可视化 | 通过将荧光激活直接与靶RNA识别相连接,并利用degron介导的降解来抑制背景信号,实现了比传统方法更低的背景和更高的特异性 | NA | 开发一种用于活细胞中RNA精确可视化的新型成像平台 | RNA分子,包括NEAT1_2 lncRNA和SARS-CoV-2基因组RNA | 合成生物学 | NA | CRISPR-dCas13-tDeg技术 | NA | 图像数据 | NA | CRISPR-Cas13 | 哺乳动物细胞 | 通过工程化crRNA支架嵌入Pepper RNA基序,实现靶向诱导的荧光激活系统 | 医学, 合成生物学 |
| 33 | 2026-04-02 |
Concentration-Dependent CsrA Regulation of the uxuB Transcript Leads to Development of a Post-Transcriptional Bandpass Filter
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00668
PMID:40202123
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研究论文 | 本研究利用CsrA蛋白与uxuB mRNA转录本之间的新型转录后相互作用,设计了一种生物转录后带通滤波器 | 首次利用CsrA蛋白在uxuB mRNA上的异质性调控特性,通过5' UTR + 100 nt CDS序列作为支架,实现基于蛋白质浓度的ON/OFF状态转换,减少了合成电路组件数量 | NA | 开发基于转录后调控的合成生物电路,以减少细胞负担并简化调控组件 | uxuB mRNA转录本(特别是5' UTR + 100 nt CDS序列)与CsrA蛋白的相互作用 | 合成生物学 | NA | 转录后调控系统设计 | NA | NA | NA | NA | NA | 基于CsrA与uxuB mRNA相互作用的转录后带通滤波器,采用分级结合策略实现剂量依赖性调控 | 合成生物学 |
| 34 | 2026-04-02 |
Engineering Toehold-Mediated Switches for Native RNA Detection and Regulation in Bacteria
2022-09-30, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2022.167689
PMID:35717997
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综述 | 本文综述了基于RNA toehold介导的开关在细菌中用于天然RNA检测和调控的工程应用 | 重点讨论了将RNA toehold开关应用于体内天然RNA检测的挑战,包括跨生物体的可转移性,并展望了结构预测算法在提升RNA开关体内功能方面的潜力 | NA | 探讨RNA toehold介导的开关在合成生物学中用于传感和调控的应用,特别是在细菌环境中 | RNA toehold介导的开关及其在天然RNA检测和调控中的设计 | 合成生物学 | NA | RNA toehold介导的开关设计 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | RNA toehold介导的开关,通过链置换控制开关状态转换,用于传感和调控 | 工业生物技术 |
| 35 | 2026-04-02 |
RNP-Based Control Systems for Genetic Circuits in Synthetic Biology Beyond CRISPR
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2421-0_1
PMID:35666436
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综述 | 本文综述了基于核糖核蛋白(RNP)的遗传电路控制系统在合成生物学中的应用,并提供了系统选择标准 | 系统性地回顾了CRISPR之外的工程化RNP控制系统,并提出了针对不同生物过程的优化选择框架 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据,且未来应用部分基于推测 | 评估和总结工程化RNP控制系统在合成生物学中的发展现状与应用潜力 | 核糖核蛋白(RNP)复合物及其工程化控制系统 | 合成生物学 | NA | 工程化RNP系统设计 | NA | NA | NA | CRISPR, 其他RNP工程工具 | 原核生物, 真核生物 | 遗传电路控制, 生物传感器, 逻辑门 | 工业生物技术, 医学, 环境, 农业 |
| 36 | 2026-04-01 |
Molecular kinetics dictate population dynamics in CRISPR-based plasmid defense
2026-Apr-07, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2525424123
PMID:41911458
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研究论文 | 本研究采用延时成像方法,从分子、单细胞和群体水平分析CRISPR-Cas系统对质粒RP4动态的防御机制 | 通过荧光标记质粒和CRISPR-Cascade复合物,量化了群体动态与间隔序列数量、Cascade表达水平及质粒成瘾模块的关系,并首次结合单细胞追踪和基于代理的空间模型预测质粒动态 | 研究可能受限于特定实验条件(如RP4质粒和细菌模型),且未全面探索所有CRISPR-Cas变体或环境因素对质粒传播的影响 | 理解和操纵移动遗传元件(如质粒)的传播,以应用于合成生物学、农业和医学领域 | CRISPR-Cas防御系统、质粒RP4、细菌群体动态 | 合成生物学 | NA | 延时成像、荧光标记、单细胞追踪、基于代理的建模 | 基于代理的空间模型 | 图像、时间序列数据 | NA | CRISPR-Cas | 细菌 | CRISPR-Cascade防御系统 | 合成生物学, 农业, 医学 |
| 37 | 2026-04-01 |
Tunable low-rate genomic recombination with Cre-lox in Escherichia coli: a versatile tool for anoxic environmental biosensing and synthetic biology
2026-Mar-23, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.01768-25
PMID:41870091
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研究论文 | 本文开发了一种在E. coli中可调控的低速率Cre-lox基因组重组系统,用于缺氧环境生物传感和合成生物学应用 | 开发了紧密调控、可滴定的Cre重组酶系统,实现低重组率和最小基础活性,并在质粒和染色体上实施,后者显示出跨代遗传记忆的优越保留 | NA | 开发一种用于环境生物传感和合成生物学的可调控基因组重组工具 | Escherichia coli(大肠杆菌) | 合成生物学 | NA | Cre-lox重组技术 | NA | NA | NA | Cre-lox | Escherichia coli | 基于Cre重组酶的遗传记忆系统,用于生物传感 | 环境, 医学, 工业生物技术 |
| 38 | 2026-04-01 |
A general strategy to enhance aptamer affinity by suppressing dissociation through symmetric assembly
2026-Mar-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag268
PMID:41873762
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研究论文 | 本文提出了一种通过对称组装抑制解离来增强适体亲和力的通用策略 | 采用对称引导的组装方法,通过快速再结合实现动力学协同性,显著降低解离速率常数 | NA | 增强适体亲和力以克服快速靶标解离的限制 | 针对SARS-CoV-2刺突蛋白、VEGF165和心脏肌钙蛋白I的适体 | 合成生物学 | NA | 对称组装方法 | NA | NA | NA | NA | NA | 三价柔性组装体 | 诊断、治疗、合成生物学 |
| 39 | 2026-04-01 |
Aptamer- and Ribozyme-Engineered sgRNAs for Conditional Control of CRISPR/Cas9 Function
2026-Mar-09, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/FBL47300
PMID:41914300
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综述 | 本文综述了通过将功能性核酸元件(如适配体、核酶和适配酶)整合到sgRNA特定结构区域中,开发条件响应性CRISPR/Cas9系统的设计策略与应用 | 通过工程化sgRNA实现CRISPR/Cas9系统的条件响应性控制,使其能响应小分子、蛋白质和内源性代谢物等多种分子信号 | 当前系统在特异性、效率和适用性方面仍面临挑战,需要进一步改进 | 开发条件响应性CRISPR/Cas9系统,用于合成生物学、疾病建模和治疗开发 | 工程化的单导RNA(sgRNA)和CRISPR/Cas9系统 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9系统,功能性核酸元件整合 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 原核细胞,真核细胞 | 条件响应性基因编辑、激活、抑制和成像系统 | 医学 |
| 40 | 2026-04-01 |
Tunable Low-Rate Genomic Recombination with Cre-lox in Escherichia coli : A Versatile Tool for Environmental Biosensing and Synthetic Biology
2025-Sep-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.02.616356
PMID:40949998
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研究论文 | 本文开发了一种基于Cre-lox系统的可调控低速率基因组重组工具,用于环境生物传感和合成生物学应用 | 开发了紧密调控、可滴定Cre重组酶系统,实现低重组率和最小基础活性,并应用于染色体以增强遗传记忆跨代保留 | NA | 开发一种可调控低速率基因组重组工具,用于环境生物传感和合成生物学 | 大肠杆菌(Escherichia coli) | 合成生物学 | NA | Cre-lox重组系统 | NA | NA | NA | Cre-lox | 大肠杆菌 | 基于Cre-lox的遗传记忆系统,用于环境生物传感 | 环境, 工业生物技术 |