合成生物学相关文章
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当前共找到 5211 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-06-23 |
RATEX: A Scalable RNA-Based Platform for Logical and Multi-Layered Cellular Programming
2026-Jun-22, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202520600
PMID:42083989
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研究论文 | 介绍了一种名为RATEX的基于RNA的可扩展平台，用于逻辑和多层细胞编程 | 将翻译到转录的转换器与合成RNA调控器集成，创建紧凑且可扩展的RNA编程电路架构，实现了多达6输入的OR逻辑门和混合3输入逻辑门，用于感知多样代谢物和小分子输入 | 尽管展示了广泛的应用，但文中未明确讨论潜在的局限性，如实际细胞环境中的稳定性或长期运行问题 | 开发可扩展的遗传电路，实现细胞内的复杂功能编程 | RNA调控器和RATEX平台在活细胞中的功能验证 | 合成生物学 | NA | RNA调控器、翻译到转录转换 | 逻辑门电路模型 | NA | NA | NA | 未明确指定，但可能涉及大肠杆菌等模式生物 | 逻辑门电路（包括OR门、AND门）、信号级联、代谢物感应电路 | 合成生物学、生物技术 |
| 22 | 2026-06-23 |
Emerging porous materials for cell encapsulation
2026-Jun-22, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d4cs00071d
PMID:42132741
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综述 | 从合成生物学和材料科学角度综述细胞@MOF、细胞@COF和细胞@HOF复合材料的最新进展 | 系统总结多孔框架材料封装细胞的合成策略，并整合细胞表面化学与活性评估方法 | 未深入讨论不同框架材料在长期稳定性与免疫原性方面的比较 | 探讨框架材料在合成细胞工程和增强细胞功能中的应用前景与挑战 | 细胞@MOF、细胞@COF、细胞@HOF复合材料 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 多孔框架封装系统（MOF、COF、HOF） | 医学, 工业生物技术, 环境 |
| 23 | 2026-06-23 |
Overcoming cellular secretion bottlenecks: advanced secretion engineering and molecular tailoring for next-generation microbial α-amylases with enhanced industrial performance
2026-Jun-22, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05053-2
PMID:42329468
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综述 | 本文综述了克服微生物α-淀粉酶细胞分泌瓶颈的策略，包括信号肽优化、分子伴侣共表达和CRISPR-Cas基因编辑等技术 | 将传统克隆范式转向设计参数框架，结合人工智能和分子动力学模拟进行理性设计，并采用CRISPR-Cas技术实现精确基因组编辑以提升酶产量 | 未提及具体实验验证或比较不同策略的实际效果，缺乏定量分析 | 分析并解决微生物α-淀粉酶生产中的分泌瓶颈，提升其工业性能 | 微生物α-淀粉酶 | 机器学习 | NA | CRISPR-Cas | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 枯草芽孢杆菌, 毕赤酵母, 黑曲霉, 大肠杆菌 | 信号肽优化, 分子伴侣共表达, 碳水化合物结合模块融合 | 工业生物技术, 医药, 食品 |
| 24 | 2026-06-23 |
Heterologous production of a plant biostimulant in Streptomyces albidoflavus
2026-Jun-20, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-026-13915-w
PMID:42322407
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研究论文 | 本研究通过异源生产平台在Streptomyces albidoflavus中生产植物生物刺激素pteridic acids F和H，并显著提高了产量 | 首次建立pteridic acids (PTA)的功能性异源生产平台，结合Cas12a辅助的精确靶向克隆、CRISPR-Cas9基因组整合和启动子工程，以及基因组规模代谢模型指导的培养基优化，实现超过20倍的产量提升 | 初始异源表达仅产生可检测的elaophylin而非PTA，且经过启动子工程后PTA产量仍低于定量限 | 建立Pteridic acids (PTA)的异源生产平台并优化产量，以开发植物生长促进剂应对非生物胁迫 | Pteridic acids F和H（植物生长促进聚酮化合物） | 合成生物学 | NA | Cas12a辅助精确靶向克隆（CAPTURE）, CRISPR-Cas9, 基因组规模代谢模型 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Cas12a, Cre-lox重组 | Streptomyces albidoflavus J1074, NBC1270 | PTA生物合成基因簇异源表达系统，包括kasOp*启动子工程 | 农业, 生物技术 |
| 25 | 2026-06-23 |
Chemical Synthesis of Mirror-Image Proteins Reveals Chirality-Dependent Cellular Uptake Mediated by a Cell-Penetrating Peptide
2026-Jun-17, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c03792
PMID:42307060
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研究论文 | 通过化学合成镜像蛋白，揭示细胞穿透肽介导的手性依赖性细胞摄取 | 首次系统研究了在恒定递送载体下，货物手性对细胞摄取效率的影响 | 未完全阐明手性影响细胞摄取的具体分子机制 | 探究货物手性在细胞穿透肽介导的细胞内化中的作用 | L型和D型构型的三种模型货物，偶联至相同环十精氨酸细胞穿透肽 | 合成生物学 | NA | 化学合成，流式细胞术，凝胶分析，共聚焦显微镜 | NA | 图像，数值数据 | 多种哺乳动物细胞系 | NA | 哺乳动物细胞 | NA | 医学，合成生物学 |
| 26 | 2026-06-23 |
Strategies for enhancing specificity and efficacy of oncolytic viruses in cancer treatment
2026-Jun, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2026.110708
PMID:41999961
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综述 | 综述了增强溶瘤病毒在癌症治疗中特异性和功效的策略 | 系统总结了转录靶向、微小RNA去靶向、病毒进入重定向等多层次逻辑门调控系统，以及免疫调节、纳米包裹、载体细胞运输等最新工程技术进展 | 虽然综述了多种策略，但未讨论这些方法在临床试验中的实际转化障碍或长期安全性数据 | 分析当前溶瘤病毒工程化进展，以解决肿瘤选择性不足和治疗效果有限的问题 | 溶瘤病毒及其工程化改造策略 | 机器学, 合成生物学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick | 哺乳动物细胞 | 逻辑门调控系统, 开关, 代谢通路 | 医学 |
| 27 | 2026-06-23 |
Engineering Lactobacillus for therapeutic delivery and biosensing: lessons from niche adaptation
2026-Jun, Future microbiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1080/17460913.2026.2686558
PMID:42288957
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review | 综述了乳酸杆菌的工程化改造及其在治疗递送和生物传感中的应用，重点讨论了其生态位适应机制带来的启示 | 系统总结了乳酸杆菌通过合成生物学工具（如CRISPR-Cas系统）从传统益生菌向多功能治疗递送和生物传感平台转化的最新进展 | 工程化乳酸杆菌的稳定性和法规监管方面仍存在挑战 | 探讨乳酸杆菌作为活体生物治疗产品和生物传感器的工程化应用潜力 | 乳酸杆菌及其工程化改造产物 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas, 基因工程, 包囊技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 乳酸杆菌 | 治疗递送系统（重组蛋白、疫苗、细胞因子、靶向酶、多肽），生物传感器（全细胞或无细胞平台检测病原体、毒素、临床生物标志物） | 医学, 食品安全, 环境监测, 诊断 |
| 28 | 2026-06-23 |
HySimODE: a hybrid stochastic-deterministic simulation framework for multiscale models of biological systems
2026-May-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag185
PMID:41999207
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研究论文 | 提出了HySimODE，一个用于生物系统多尺度模型的混合随机-确定性模拟框架 | 利用机器学习分类器自动将生化物种分配到随机或确定性状态，避免了手动指定区域和模型重构 | 标题和摘要未明确提及局限性 | 为基于常微分方程的生化模型提供自动化混合模拟方法，支持数据驱动的随机-确定性分区 | 涉及生化系统的混合模拟，包括合成生物学的宿主-电路相互作用模型和神经生物学的长期突触增强模型 | 计算生物学 | NA | 混合随机-确定性模拟、常微分方程求解、机器学习分类器 | 机器学习分类器、常微分方程求解器 | 生化常微分方程模型数据 | 多样化的生化常微分方程模型数据集，跨越多种动力学区域 | NA | NA | NA | 合成生物学、神经生物学 |
| 29 | 2026-06-23 |
Plant-derived indole alkaloids in chronic inflammatory diseases: molecular mechanisms, therapeutic potential and translational challenges
2026-May, Inflammopharmacology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s10787-026-02244-z
PMID:42009998
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综述 | 综述植物来源吲哚生物碱在慢性炎症性疾病中的分子机制、治疗潜力及转化挑战 | 整合了吲哚生物碱对NF-κB、JAK/STAT、MAPK、PI3K/AKT、NLRP3炎症小体和AhR信号等关键炎症轴的调控机制，并强调其在微生物组和器官选择性治疗中的前景 | 主要基于临床前证据，转化至临床仍面临合成生物学、代谢组学和合理杂合设计等障碍 | 阐明植物来源吲哚生物碱的抗炎和抗氧化机制及其治疗慢性炎症性疾病的潜力 | 植物来源吲哚生物碱 | NA | 慢性炎症性疾病（如结肠炎、骨关节炎、COPD、动脉粥样硬化、慢性肾病、炎症驱动肿瘤） | NA | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 30 | 2026-06-23 |
OptoChaperone─A Biohybrid Tool for Regulating Protein Condensates in Cells and In Vitro
2026-Apr-29, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c04074
PMID:42002974
|
研究论文 | 报道了一种名为OptoChaperone的光敏生物杂合系统，用于调控体外和活细胞中的蛋白质凝聚体 | 利用光响应开关控制分子伴侣活性，实现蛋白质凝聚体的可逆、精准和时空可控调节，无需化学添加剂或基因修饰 | 未提及潜在的光毒性或长期稳定性问题，以及体内应用的可行性 | 开发一种可逆且高效的工具，用于研究蛋白质凝聚体在细胞生理和病理中的作用 | 疾病相关蛋白质凝聚体，如融合肉瘤蛋白、TAR DNA结合蛋白43和热休克因子1 | 合成生物学 | 神经系统疾病 | 光遗传学 | NA | NA | NA | 光响应分子开关 | 哺乳动物细胞 | 光激活分子伴侣系统，用于调控液-液相分离形成的蛋白质凝聚体 | 医学, 合成生物学, 生物分子工程 |
| 31 | 2026-06-23 |
Synthetic mechanobiology
2026-Apr-20, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2026.03.005
PMID:42013804
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综述 | 本文综述了合成力学生物学领域，探讨如何将机械感知机制作为可编程的输入-输出关系进行设计 | 将合成生物学工具与力学生物学原理结合，重新定义力感知为设计问题，通过重新布线机械信号实现有用结果，并以此作为研究策略 | 该领域面临开放挑战，如机械信号解读和整合的复杂性，但本文未具体列出当前主要限制 | 构建能够读取组织力学并对其采取行动的工程细胞，将疾病的物理特征转化为精确、局部递送的治疗程序 | 细胞机械感知机制及其作为模块化力学遗传部件的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 力学遗传回路 | 医学 |
| 32 | 2026-06-23 |
RNA-templated diversity generation via reverse transcription and homologous recombination: an evolutionary hypothesis
2026-Apr-17, Theory in biosciences = Theorie in den Biowissenschaften
DOI:10.1007/s12064-026-00469-8
PMID:41995898
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研究论文 | 提出通过逆转录和同源重组实现RNA模板化多样性生成的进化假说 | 首次系统提出逆转录酶介导的多样性生成机制，认为细胞或外源RNA通过逆转录和同源重组整合入基因组，从而利用模块化遗传信息偏向性地改变序列空间的探索分布 | 该机制目前仅为进化假说，缺乏直接实验证据支持，且逆转录活性的细胞调控频率尚不清楚 | 探讨RNA介导的多样性生成机制及其在基因组进化和遗传变异中的作用 | 多样性生成逆转录元件、逆转录转座子、端粒酶、体细胞高频突变等生物机制，以及转录假基因和重复序列 | 进化生物学 | NA | 逆转录、同源重组 | NA | NA | NA | AutoDiMe方法 | NA | NA | 医学 |
| 33 | 2026-06-23 |
Synthetic control of implanted engineered liver tissue growth
2026-Apr-17, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adz8362
PMID:41996502
|
研究论文 | 提出一种通过合成生物学控制植入工程肝组织原位生长的策略，以解决组织工程移植物的尺寸限制问题 | 首次将合成生物学与组织工程结合，通过YAP和生长因子信号通路实现植入后肝组织的按需扩展 | 研究尚处于概念验证阶段，需进一步评估长期安全性和临床应用可行性 | 开发一种基因策略，通过合成生物学触发实现工程肝组织在体内外可控扩增，以生成大型器官植入物 | 工程化肝组织 | 合成生物学、组织工程 | 器官衰竭 | 合成生物学工具、组织工程 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 人类细胞 | YAP与生长因子信号通路调控回路 | 医学 |
| 34 | 2026-06-23 |
Cell-in-Shell Metacells in Single-Cell Nanoencapsulation
2026-Apr, ChemPlusChem
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/cplu.202500586
PMID:41999168
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评论 | 提出了“元细胞”概念，用于定义单细胞纳米封装中形成的细胞-壳结构系统，并阐述其核心功能特征 | 首次提出“元细胞”术语，为单细胞纳米封装技术建立统一概念框架，并定义可重构性、负载能力和运动性三个核心功能标志 | 未提供实验验证，需要未来研究来检验该框架的适用性和通用性 | 为单细胞纳米封装中的细胞-壳系统建立概念定义和组织框架，推动材料科学、合成生物学和细胞工程交叉领域的研究 | 单细胞纳米封装形成的细胞-壳结构（元细胞） | 材料科学, 合成生物学, 细胞工程 | NA | 单细胞纳米封装 | NA | NA | NA | NA | NA | 元细胞系统（具有可重构性、负载能力和运动性） | 医学, 机器人技术, 生物混合系统 |
| 35 | 2026-06-23 |
A standardized workflow for kinetic metabolic model curation and dissemination
2026-Apr, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014227
PMID:42008579
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研究论文 | 介绍一种用于构建、注释、可视化和共享动力学代谢模型的标准工作流程 | 整合社区标准和开源工具，确保动力学代谢模型的可重复性、互操作性和用户可访问性 | 未提及具体局限性 | 提高动力学代谢模型的标准化、可重复性和实用性 | 动力学代谢模型 | 系统生物学 | NA | NA | 动力学模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 代谢工程, 系统生物学 |
| 36 | 2026-06-23 |
Global reports on Glutamicibacter: a mini review
2026-Feb-28, Cellular and molecular biology (Noisy-le-Grand, France)
DOI:10.14715/cmb/2025.72.2.2
PMID:42322567
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综述 | 这篇综述全面整合了最新关于谷氨酸杆菌的分类、生态、形态、基因组和代谢知识 | 提供关于谷氨酸杆菌这一稀有放线菌群的综合当代视角，并指出通过基因组挖掘、代谢组学和合成生物学方法开展未来研究的方向 | 大多数物种中的生物合成基因簇尚未表征，植物-微生物和昆虫-微生物相互作用的机制了解有限，酶和代谢产物的工业开发受到限制 | 整合关于谷氨酸杆菌的分类、生态、形态、基因组和代谢知识，并识别未来研究前景 | 谷氨酸杆菌物种 | NA | NA | 16S rRNA测序, 系统基因组学, 基因组挖掘, 代谢组学, 合成生物学 | NA | 基因组数据, 代谢组数据, 生态数据 | NA | NA | 谷氨酸杆菌（Glutamicibacter） | NA | 食品安全, 农业, 生物修复, 治疗 |
| 37 | 2026-06-23 |
Bacteriophage therapy against multidrug resistant bacterial infections demonstrates clinical advances and engineering innovations between 2020-2026
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1865548
PMID:42326420
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综述 | 本文综述了2020至2026年间噬菌体疗法对抗多重耐药细菌感染的临床进展和工程创新 | 系统总结了噬菌体疗法的最新临床经验、基因工程进展（包括CRISPR系统）、组合疗法及合成噬菌体颗粒等创新技术 | 随机对照试验数据有限，监管标准、规模化生产和耐药管理仍面临挑战 | 评估噬菌体疗法作为多重耐药细菌感染治疗策略的潜力 | 多重耐药细菌感染的噬菌体疗法 | 机器学习 | 多重耐药细菌感染 | NA | NA | 文献 | NA | CRISPR-Cas系统 | 噬菌体 | 噬菌体递送的CRISPR抗菌剂、杂交递送平台、合成噬菌体颗粒 | 医学 |
| 38 | 2026-06-22 |
A Comprehensive Review on Metabolomics-Guided Metabolite Production in Plant Tissue Culture: Integrating Omics and Synthetic Biology for Enhanced Yields
2026-Jun-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00352
PMID:42301185
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综述 | 本文综述了在植物组织培养中，结合代谢组学与合成生物学及多组学框架，从试错实践转变为预测性系统工程，以提升高价值次生代谢物产量的方法 | 将代谢组学从分析工具提升为核心决策层，连接代谢表型与理性通路设计、遗传干预和过程调控，构建设计-构建-测试-学习循环范式 | 分析覆盖度、培养稳定性和代谢可预测性方面仍存在挑战 | 探讨如何通过代谢组学引导的合成生物学策略，在植物组织培养中实现高产、可扩展和可预测的代谢物生产 | 植物组织培养中的次生代谢产物及相关的代谢网络 | 数字病理学 | NA | 代谢组学, 合成生物学, 多组学整合 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | 植物细胞 | 合成启动子, 模块化基因回路, 异源表达系统 | 医药, 工业生物技术 |
| 39 | 2026-06-22 |
Multilevel Metabolic Engineering of Probiotic Escherichia coli Nissle 1917 for Antibiotic-Free Production of β-Alanine
2026-Jun-10, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00228
PMID:42270566
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研究论文 | 通过对益生菌大肠杆菌Nissle 1917进行多层次的代谢工程改造，实现无抗生素条件下β-丙氨酸的高效生产 | 首次系统研究了TdcC、SstT、SdaC和RhaT四种转运蛋白在β-丙氨酸积累中的作用，并构建了无抗生素菌株，在5升生物反应器中达到60.55 g/L的产量，是目前益生菌生产β-丙氨酸的最高水平 | 尚未提及在工业放大或不同碳源条件下的性能评估 | 通过多层次代谢工程策略，实现益生菌大肠杆菌Nissle 1917无抗生素生产β-丙氨酸 | 益生菌大肠杆菌Nissle 1917中的代谢途径和转运系统 | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 单一菌株在5升生物反应器中多次发酵 | NA | 大肠杆菌Nissle 1917 | 异源关键酶引入、前体L-天冬氨酸双途径强化、竞争途径动态调控、中心代谢重编程、转运系统工程 | 工业生物技术 |
| 40 | 2026-06-22 |
Deep learning on protein language model embeddings unlocks accurate prediction of protein solubility
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1716930
PMID:41953440
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研究论文 | 提出了一种基于蛋白质语言模型嵌入的深度学习模型DeepSolNet，用于准确预测蛋白质溶解度 | 利用先进的蛋白质语言模型ESM Cambrian结合双向长短期记忆网络、卷积神经网络和注意力机制的多模块架构，显著提升了溶解度预测性能 | 在独立测试集上的准确率仅为0.53，性能仍有提升空间 | 提高蛋白质溶解度的预测准确性，以促进合成生物学和蛋白质工程中的应用 | 蛋白质溶解度预测相关的序列数据 | 机器学习 | NA | 深度学习 | CNN, LSTM, 注意力机制 | 序列 | 验证集和独立测试集包含γ-抗体、转谷氨酰胺酶和醛脱氢酶序列 | NA | 大肠杆菌 | NA | 工业生物技术 |