合成生物学相关文章
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当前共找到 3173 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-05-29 |
DRIMS: A Synthetic Biology Platform that Enables Deletion, Replacement, Insertion, Mutagenesis, and Synthesis of DNA
2025-02-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00649
PMID:39902634
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研究论文 | 介绍了一种名为DRIMS的合成生物学平台，该平台能够高效地进行DNA的删除、替换、插入、突变和合成 | DRIMS平台通过PCR技术实现DNA的多种修改和合成，无需依赖recA重组途径，且操作简单、成本低、速度快 | 未提及平台在大规模或复杂DNA序列处理中的表现 | 开发一种高效、简单、经济的DNA修改和合成平台，以加速合成生物学领域的发展及治疗策略的开发 | DNA序列 | 合成生物学 | 癌症 | PCR | NA | DNA序列数据 | 进行了多种DNA修改和合成实验，包括4次删除、64次替换、4次嵌合抗原受体组件替换、51次人工microRNA插入、5种点突变及8段DNA序列合成 |
| 22 | 2025-05-29 |
BioTRY: A Comprehensive Knowledge Base for Titer, Rate, and Yield of Biosynthesis
2025-01-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00347
PMID:39423319
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research paper | 介绍BioTRY，一个包含生物合成滴度、速率和产量(TRY)数据的综合知识库 | BioTRY是首个可用的生物合成TRY原始研究数据库，包含超过52,000条TRY条目 | 未明确提及具体局限性 | 评估发酵过程的经济可行性，为研究人员和决策者提供生物合成发展现状的参考 | 生物合成过程中的滴度、速率和产量(TRY)数据 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 生物合成TRY数据 | >5,000种生化物质和>3,800种菌株，包含52,000条TRY条目 |
| 23 | 2025-05-29 |
CRISPR/Cas-Based Gene Editing Tools for Large DNA Fragment Integration
2025-01-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00632
PMID:39680738
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综述 | 本文综述了过去五年中用于整合大片段DNA的方法，特别关注新兴的CRISPR相关技术 | 重点讨论了同源定向修复（HDR）及新兴的CRISPR转座酶和CRISPR重组酶策略，这些技术有望革新复杂疾病的基因治疗 | 现有技术在整合大片段基因时面临效率低下、脱靶效应和高成本等问题 | 开发高效工具，以精确插入千碱基大小的DNA片段到哺乳动物基因组中，支持基因工程、基因治疗和合成生物学应用 | 大片段DNA的整合技术 | 基因编辑 | 遗传病 | CRISPR/Cas, HDR, CRISPR-transposase, CRISPR-recombinase | NA | NA | NA |
| 24 | 2025-05-29 |
Biological Switches: Past and Future Milestones of Transcription Factor-Based Biosensors
2025-01-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00689
PMID:39709556
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综述 | 本文回顾了转录因子生物传感器的发展历程，分析了从基础研究到工程策略的关键里程碑，并探讨了未来的前景和挑战 | 全面梳理了转录因子生物传感器从基础研究到工程应用的发展历程，并提出了未来研究方向 | 未深入探讨具体技术细节和实施难点 | 回顾转录因子生物传感器的发展历程，分析关键里程碑，并探讨未来前景 | 转录因子生物传感器 | 合成生物学 | NA | 高通量分析工具、DNA随机化策略、正向工程、高级蛋白质工程工作流程 | NA | NA | NA |
| 25 | 2025-05-29 |
Fine-Tuning Genetic Circuits via Host Context and RBS Modulation
2025-01-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00551
PMID:39754601
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research paper | 该研究通过改变核糖体结合位点组成和宿主环境，探索了遗传开关的设计空间，并展示了如何通过这两种方式的结合来精细调节开关的性能 | 首次将宿主环境作为遗传电路设计的重要变量进行系统探索，并展示了其与核糖体结合位点调制相结合在性能调节上的潜力 | 仅测试了9种核糖体结合位点组合和3种宿主环境，样本量相对有限 | 探索遗传开关设计中宿主环境和核糖体结合位点调制对性能的影响 | 遗传开关（toggle switch） | 合成生物学 | NA | 遗传电路设计 | NA | 生物性能指标数据 | 27种电路变体（9种核糖体结合位点×3种宿主环境） |
| 26 | 2025-05-29 |
ATP Regeneration from Pyruvate in the PURE System
2025-01-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00697
PMID:39754602
|
研究论文 | 本研究通过整合基于丙酮酸氧化酶、乙酸激酶和过氧化氢酶的ATP再生系统，扩展了PURE系统的功能 | 提出了一种新的ATP再生途径，能够独立或与现有肌酸系统结合使用，显著提高蛋白质合成效率 | 需要高初始浓度的磷酸盐缓冲液（约10 mM） | 工程化改造PURE系统以提高其蛋白质合成能力 | PURE系统及其ATP再生机制 | 合成生物学 | NA | 细胞游离蛋白质合成系统 | NA | 生化实验数据 | 多批次自制PURE系统及商业PURExpress系统 |
| 27 | 2025-05-29 |
Long-Term Protein Synthesis with PURE in a Mesoscale Dialysis System
2025-01-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00618
PMID:39757539
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研究论文 | 本研究开发了一种易于组装的中尺度透析系统，用于延长无细胞系统中的蛋白质合成时间和提高产量 | 利用商业可用组件构建的中尺度透析系统，实现了PURE无细胞系统中蛋白质合成的长期稳定性和高产量 | 未提及系统在大规模生产中的应用效果 | 解决无细胞系统（特别是PURE系统）反应寿命短和产量低的问题 | PURE无细胞系统和GFP蛋白质合成 | 合成生物学 | NA | 透析技术 | NA | 实验数据 | 未明确说明样本数量 |
| 28 | 2025-05-29 |
Advanced Strategies for Ultrasound Control and Applications in Sonogenetics and Gas Vesicle-Based Technologies: A Review
2025, International journal of nanomedicine
IF:6.6Q1
DOI:10.2147/IJN.S507322
PMID:40433121
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综述 | 本文综述了超声控制在声遗传学和基于气体囊泡技术中的先进策略及其应用 | 探讨了基于合成生物学的超声控制系统，特别是声遗传学和气体囊泡技术，克服了传统纳米材料的复杂功能和毒性问题 | 当前超声控制系统在设计和应用中仍面临挑战，如精确控制和生物相容性等问题 | 研究超声控制在医学诊断和治疗中的应用，特别是在声遗传学和气体囊泡技术中的激活策略 | 超声控制系统及其在声遗传学和气体囊泡技术中的应用 | 生物医学工程 | 癌症 | 超声控制技术 | NA | NA | NA |
| 29 | 2025-05-29 |
Omics-driven onboarding of the carotenoid producing red yeast Xanthophyllomyces dendrorhous CBS 6938
2024-Dec-28, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13379-w
PMID:39731599
|
研究论文 | 本研究利用转录组学数据从红酵母Xanthophyllomyces dendrorhous CBS 6938中发现了组成型和光调控启动子，并开发了一套模块化合成生物学元件库 | 结合系统生物学和合成生物学，开发了一种从组学数据快速获取遗传工具的流程，适用于非传统微生物 | 许多假定的调控启动子在合成遗传背景下表现出组成型活性，而非预期的调控特性 | 开发Xanthophyllomyces dendrorhous的遗传工具并研究其光生物学特性 | 红酵母Xanthophyllomyces dendrorhous CBS 6938 | 合成生物学 | NA | 转录组学、差异基因表达分析(DGE)、基因本体(GO)分析 | NA | 转录组数据 | 在不同波长光(红、绿、蓝、紫外)和氧化应激条件下培养的X. dendrorhous样品 |
| 30 | 2025-05-29 |
Identification of acidic stress-responsive genes and acid tolerance engineering in Synechococcus elongatus PCC 7942
2024-Dec, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-023-12984-5
PMID:38204133
|
研究论文 | 本研究通过RNA测序比较转录组分析，在模型蓝藻Synechococcus elongatus PCC 7942中鉴定了酸性应激响应基因，并通过基因敲除和过表达实验验证了这些基因在酸耐受性中的作用 | 鉴定了六个参与酸性应激响应的基因，并通过过表达chlL和chlN基因成功提高了S. elongatus PCC 7942的酸耐受性 | 研究仅针对S. elongatus PCC 7942，未在其他蓝藻中进行验证 | 探究蓝藻的酸应激响应机制并提高其酸耐受性 | Synechococcus elongatus PCC 7942蓝藻 | 合成生物学 | NA | RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 31 | 2025-05-29 |
Regulation of genes encoding polysaccharide-degrading enzymes in Penicillium
2024-Dec, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-023-12892-8
PMID:38170318
|
综述 | 本文综述了青霉菌中多糖降解酶(PPDE)的分布、功能、生物合成调控机制及高产PPDE菌株的分子育种研究进展 | 总结了青霉菌PPDE的最新研究进展，包括其分布、功能、调控机制及分子育种策略 | 作为小型综述，可能未涵盖该领域所有相关研究 | 促进通过代谢工程和合成生物学开发真菌PPDE生产，推动PPDE工业生物精炼应用 | 青霉菌(特别是草酸青霉)及其产生的植物多糖降解酶(PPDE) | 合成生物学 | NA | 分子育种、代谢工程 | NA | NA | NA |
| 32 | 2025-05-29 |
Microbial host engineering for sustainable isobutanol production from renewable resources
2024-Dec, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-023-12821-9
PMID:38175234
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综述 | 本文综述了利用基因工程技术改造微生物宿主以提高可再生资源生产异丁醇的策略和合成生物学方法 | 总结了近年来通过基因工程改造天然和非天然微生物宿主以提高异丁醇产量的策略 | 讨论了工程化微生物宿主面临的挑战，如底物范围有限、溶剂耐受性低等问题 | 提高可再生资源生产生物燃料异丁醇的效率 | 微生物宿主 | 合成生物学 | NA | 基因工程技术 | NA | NA | NA |
| 33 | 2025-05-29 |
Minimisation of metabolic networks defines a new functional class of genes
2024-10-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52816-2
PMID:39482321
|
研究论文 | 该研究通过构建最小代谢网络（MMNs）定义了一类新的功能基因——网络效率决定因子（NEDs） | 提出了一种新的计算方法来构建最小代谢网络，并定义了一类新的功能基因NEDs | 研究仅基于计算机模拟，尚未进行实验验证 | 理解代谢网络的起源并提高生物技术过程的效率 | 基因组尺度的代谢模型中的基因 | 合成生物学 | NA | 计算机模拟方法 | NA | 基因组数据 | NA |
| 34 | 2025-05-29 |
Development of a xylose-inducible and glucose-insensitive expression system for Parageobacillus thermoglucosidasius
2024-Oct-23, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13333-w
PMID:39441395
|
研究论文 | 开发了一种木糖诱导且对葡萄糖不敏感的基因表达系统IExyl*，用于Parageobacillus thermoglucosidasius DSM 2542 | 通过结合xylA5p启动子及其转录调节因子XylR，并减少葡萄糖对木糖摄取的分解代谢抑制，开发了IExyl*系统 | NA | 开发一种多功能且高效的诱导表达机制，用于优化生物合成途径 | Parageobacillus thermoglucosidasius DSM 2542 | 合成生物学 | NA | 基因表达调控 | NA | NA | NA |
| 35 | 2025-05-29 |
In vivo thrombin activity in the diatom Phaeodactylum tricornutum: biotechnological insights
2024-Oct-08, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13322-z
PMID:39377797
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研究论文 | 本研究通过硅学分析在三角褐指藻中识别出可能编码类凝血酶蛋白的序列，并通过体内实验验证了其切割效率 | 首次在三角褐指藻中发现并验证了一种新型类凝血酶蛋白酶的存在 | 研究仅基于硅学预测和体内验证，缺乏对该蛋白酶生化特性的详细表征 | 探索三角褐指藻中类凝血酶蛋白的功能及其在生物技术中的应用潜力 | 三角褐指藻(Phaeodactylum tricornutum)中的类凝血酶蛋白 | 合成生物学 | NA | 蛋白质结构预测、分子对接、Western blot分析 | NA | 蛋白质序列数据、蛋白质表达数据 | 使用两种包含YFP的融合蛋白构建体进行体内验证 |
| 36 | 2025-05-29 |
Synthetic biology toolkit of Ralstonia eutropha (Cupriavidus necator)
2024-Aug-29, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13284-2
PMID:39207499
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review | 本文综述了目前可用于改造和增强Ralstonia eutropha生物生产的不同合成生物学技术 | 开发一个合成生物学工具包，赋予Ralstonia eutropha菌株新的能力，用于新颖应用 | NA | 增强Ralstonia eutropha的生物生产能力，用于生产新型生物产品 | Ralstonia eutropha（Cupriavidus necator） | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
| 37 | 2025-05-29 |
Enhancing Escherichia coli abiotic stress resistance through ornithine lipid formation
2024-Apr-08, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13130-5
PMID:38587638
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研究论文 | 通过工程改造大肠杆菌使其产生鸟氨酸脂质，以增强其对非生物胁迫的抗性 | 首次将鸟氨酸脂质（OLs）的合成能力引入原本不具备此能力的大肠杆菌中，并证明其能增强胁迫抗性和生物量产量 | 研究仅针对特定胁迫条件（如pH变化和磷酸盐限制），未涵盖所有可能的非生物胁迫 | 通过改造大肠杆菌的膜脂组成，构建具有增强非生物胁迫抗性的宿主，用于生物技术和合成生物学应用 | 大肠杆菌（Escherichia coli）及其工程改造菌株 | 合成生物学 | NA | 基因工程（表达合成操纵子olsFC）、转录组分析 | NA | 基因表达数据、生长表型数据 | 多种工程改造的大肠杆菌菌株 |
| 38 | 2025-05-29 |
DNA methylases for site-selective inhibition of type IIS restriction enzyme activity
2024-Jan-25, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13015-7
PMID:38270650
|
研究论文 | 本研究旨在生产能够体外抑制IIS型限制酶BsaI、BpiI或LguI活性的重组DNA甲基化酶 | 通过克隆和表达来自I型和II型R-M系统的甲基化酶，优化其表达条件，并验证其在体外选择性抑制IIS型限制酶活性的能力 | 研究仅限于体外实验，未涉及体内应用或更复杂的生物系统 | 开发新型分子和合成生物学工具，特别是用于DNA组装技术 | DNA甲基化酶及其对IIS型限制酶活性的抑制作用 | 合成生物学 | NA | 重组DNA技术、蛋白质表达与纯化、DNA甲基化分析 | NA | NA | 十种来自I型和II型R-M系统的甲基化酶 |
| 39 | 2025-05-28 |
Microfluidics-driven templating preparation of polymer vesicles with tailorable dimensions and rapid cellular internalization
2025-May-27, Biomaterials science
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d5bm00377f
PMID:40237355
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研究论文 | 本文提出了一种基于微流控技术的聚合物囊泡制备方法，实现了对囊泡尺寸的可控调节和快速细胞摄取 | 首次报道了微球模板策略，结合微流控精确控制和嵌段共聚物自组装，克服了传统方法的限制 | NA | 开发一种可控尺寸和快速细胞摄取的聚合物囊泡制备方法 | 聚合物囊泡 | 纳米技术 | NA | 微流控技术 | NA | NA | NA |
| 40 | 2025-05-28 |
Deep mutational scanning and CRISPR-engineered viruses: tools for evolutionary and functional genomics studies
2025-May-27, mSphere
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/msphere.00508-24
PMID:40272173
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review | 本文综述了深度突变扫描和基于CRISPR的基因组编辑这两种强大的方法，用于病毒蛋白的全面诱变和功能表征 | 利用合成生物学和测序技术的最新进展，实现对病毒基因组的精确操控，为病毒进化和适应提供深入理解 | NA | 探讨深度突变扫描和CRISPR基因组编辑在病毒进化、功能基因组学研究中的应用及其对疫苗开发和治疗策略的潜在影响 | 病毒基因组和病毒蛋白 | 合成生物学 | NA | 深度突变扫描, CRISPR基因组编辑 | NA | 基因组数据 | NA |