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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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21 | 2025-06-21 |
Digital switching in a biosensor circuit via programmable timing of gene availability
2014-Dec, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/nchembio.1680
PMID:25306443
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研究论文 | 本文介绍了一种通过可编程基因可用性时间控制来优化生物传感器电路的方法 | 利用位点特异性重组酶通过可编程时间控制基因可用性,显著减少了生物传感器电路的背景泄漏并提高了动态范围 | NA | 开发更稳健的合成生物学基因电路部署方法 | 基因电路和生物传感器 | 合成生物学 | NA | 位点特异性重组技术 | NA | 基因表达数据 | NA |
22 | 2025-06-20 |
Strategy for Generating Giant Unilamellar Vesicles with Tunable Size Using the Modified cDICE Method
2025-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00026
PMID:40536055
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研究论文 | 本研究探讨了一种优化策略,通过使用改良的连续液滴界面交叉封装方法,从水包油乳液滴中生成具有可调尺寸的巨型单层囊泡(GUVs) | 通过系统调整关键参数(如腔室旋转时间、角频率和内溶液密度)来优化GUVs的尺寸分布,并研究了内溶液盐度对封装效率的影响 | 该方法在囊泡尺寸分布上存在广泛且难以控制的问题,这是构建人工细胞的一个显著缺点 | 优化巨型单层囊泡(GUVs)的尺寸分布,以促进合成生物学应用中具有生物相关性质的细胞大小隔室的创建 | 巨型单层囊泡(GUVs) | 合成生物学 | NA | 改良的连续液滴界面交叉封装方法(modified cDICE) | NA | NA | NA |
23 | 2025-06-20 |
Synthetic CRISPR Networks Driven by Transcription Factors via Structure-Switching DNA Translators
2025-Jun-18, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c06913
PMID:40491004
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研究论文 | 介绍了一种利用转录因子通过工程DNA翻译器调控CRISPR-Cas12a反式切割活性的平台 | 利用转录因子通过结构转换DNA翻译器调控CRISPR-Cas12a活性,建立了蛋白质-核酸通信新通道 | NA | 开发新型合成生物学应用,扩展CRISPR-Cas系统的调控方式 | 转录因子(TATA结合蛋白和Myc-Max)和CRISPR-Cas12a系统 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas12a反式切割活性调控,DNA结构转换技术 | NA | NA | NA |
24 | 2025-06-20 |
Cardiac Regeneration From Scar to Syncytium: Mitigating the Formation of Scar Tissue
2025-Jun-18, Cardiology in review
IF:2.0Q3
DOI:10.1097/CRD.0000000000000972
PMID:40530862
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综述 | 本文综述了当前心脏再生医学中的各种方法,包括细胞疗法、细胞外囊泡、直接心脏重编程、基因编辑以及合成生物学和组织工程 | 探讨了从细胞疗法到基因编辑和合成生物学的多学科创新,重新定义了心脏护理的边界 | 未提及具体临床试验结果或大规模应用的可行性 | 探讨心脏再生医学的当前方法和未来方向,以改善心脏功能 | 心肌梗死和心力衰竭患者的心脏组织 | 心血管医学 | 心血管疾病 | 细胞疗法、细胞外囊泡、直接心脏重编程、基因编辑(CRISPR/Cas9)、合成生物学和组织工程 | NA | NA | NA |
25 | 2025-06-20 |
Synthetic biology-driven induction of mature TLS formation enhances antitumor immunity in colorectal cancer
2025-Jun-18, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.ado8395
PMID:40531967
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研究论文 | 该研究通过合成生物学方法诱导成熟三级淋巴结构(mTLS)的形成,以增强结直肠癌(CRC)的抗肿瘤免疫反应 | 首次设计了一种表达LIGHT的工程菌株SLC,通过LIGHT-HVEM信号通路特异性诱导mTLS形成,并揭示了ILC3在该过程中的关键作用 | 研究仅在两种CRC小鼠模型中进行,尚未进行人体临床试验 | 探索通过诱导mTLS形成增强结直肠癌免疫治疗效果的新方法 | 结直肠癌微环境中的免疫细胞和三级淋巴结构 | 合成生物学 | 结直肠癌 | 工程菌株构建、免疫组化分析 | NA | 动物实验数据 | 两种不同CRC小鼠模型 |
26 | 2025-06-20 |
A Tn5 Transposase-Based System for High-Efficiency Genome-Wide Gene Activation in Escherichia coli
2025-Jun-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00170
PMID:40527878
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研究论文 | 开发了一种基于Tn5转座酶的系统,用于在大肠杆菌中高效实现全基因组基因激活 | 利用Tn5转座酶系统实现全基因组范围的基因激活,为功能基因组学和合成生物学提供新工具 | 未明确说明系统的插入位点偏好性或可能的脱靶效应 | 开发高效的全基因组基因激活工具以促进细菌工程研究 | 大肠杆菌的基因组 | 合成生物学 | NA | Tn5转座酶系统 | NA | 基因组数据 | 未明确说明具体样本数量 |
27 | 2025-06-20 |
Engineering Genetic Circuits for Dynamic Control of Central Metabolism
2025-Jun-16, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2025.06.007
PMID:40532756
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研究论文 | 本文研究了一种能够动态调控中央代谢的遗传电路工程方法,以提高微生物细胞工厂中有价值化合物的生产性能 | 建立了响应丙酮酸的PdhR生物传感器系统,动态调控中央代谢中的代谢流分布,优化了海藻糖和4-羟基香豆素的生物合成 | 大多数遗传工具具有途径或中间产物特异性,限制了其在合成生物学中的广泛应用 | 探索遗传调控工具在动态控制中央代谢中的潜力,以提高有价值化合物的生物合成效率 | 微生物细胞工厂中的中央代谢 | 合成生物学 | NA | 生物传感器系统、定点突变 | NA | NA | 多种来源于不同微生物的PdhR同源物 |
28 | 2025-06-20 |
Structural insights and rational engineering strategies for modular polyketide synthases: A review
2025-Jun-16, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.145299
PMID:40533022
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综述 | 本文综述了模块化聚酮合酶(PKSs)的结构见解和合理工程策略,特别关注顺式酰基转移酶(AT)PKSs的设计 | 探讨了基于结构和机制见解选择模块化构建块和设计催化域的多维性,以及通过修饰特定域来微调底物特异性和立体化学复杂性的创新方法 | 对单个域的微小改变可能在整个装配线中传播结构和功能变化,这对合理设计顺式AT PKSs提出了重大挑战 | 增强产品产量并扩大可访问聚酮化合物的范围 | 顺式酰基转移酶(AT)聚酮合酶(PKSs) | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
29 | 2025-06-20 |
Functional identification of 10-hydroxygeraniol oxidoreductases related to camptothecin biosynthesis in Ophiorrhiza pumila
2025-Jun-13, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.145253
PMID:40517854
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研究论文 | 本研究在全基因组范围内鉴定了与喜树碱生物合成相关的10-羟基香叶醇氧化还原酶,并验证了其中三个酶的功能 | 首次在全基因组范围内鉴定并验证了Ophiorrhiza pumila中与喜树碱生物合成相关的10HGOs酶的功能 | 仅验证了三个10HGOs酶的功能,未对其他12个10HGOs进行功能验证 | 鉴定与喜树碱生物合成相关的酶编码基因,为利用合成生物学工具在异源系统中重建喜树碱生物合成途径提供元件 | Ophiorrhiza pumila中的10-羟基香叶醇氧化还原酶(10HGOs) | 合成生物学 | 癌症 | 基因组学分析、酶活性测定、转基因技术 | NA | 基因组数据、酶活性数据 | 15个10HGOs基因,其中3个进行了功能验证 |
30 | 2025-06-20 |
A synthetic platform for developing recombinant adeno-associated virus type 8 producer cell lines
2025 May-Jun, Biotechnology progress
IF:2.5Q3
DOI:10.1002/btpr.70009
PMID:39968660
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研究论文 | 本研究建立了一个基于合成生物学的平台,用于构建稳定的重组腺相关病毒8型(rAAV8)生产细胞系 | 将rAAV2细胞系构建流程扩展到rAAV8,并优化了包装模块,提高了病毒滴度 | 初始生产率低于传统三质粒转染方法,衣壳蛋白生产和衣壳形成是潜在限制因素 | 开发适用于不同AAV血清型的稳定生产细胞系平台 | 重组腺相关病毒8型(rAAV8)生产细胞系 | 基因治疗 | NA | 合成生物学、细胞系构建 | NA | NA | 四种rAAV8生产细胞系(VH1-4) |
31 | 2025-06-20 |
Engineering bacteria for cancer immunotherapy by inhibiting IDO activity and reprogramming CD8+ T cell response
2024-Dec-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2412070121
PMID:39693352
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研究论文 | 本文通过基因工程改造高色氨酸表达的细菌株,抑制IDO活性并重编程CD8+ T细胞反应,以增强肿瘤免疫治疗效果 | 开发了一种能严格定植于肿瘤的高色氨酸表达细菌株,其产生的丁酸盐能抑制IDO活性,同时释放大量色氨酸支持CD8+ T细胞激活和能量代谢 | 目前仅在鼠和兔的多肿瘤模型中验证效果,临床应用的可行性和安全性尚需进一步研究 | 开发一种增强肿瘤免疫治疗的合成生物学策略 | 基因工程改造的细菌株L-Trp CB及其对肿瘤微环境中IDO活性和CD8+ T细胞反应的影响 | 合成生物学 | 癌症 | 基因工程 | NA | NA | 鼠和兔的多肿瘤模型 |
32 | 2025-06-19 |
Research progress in high-throughput DNA synthesis and its applications
2025-Jun-18, Journal of materials chemistry. B
DOI:10.1039/d5tb00869g
PMID:40530447
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综述 | 本文综述了高通量DNA合成技术的研究进展及其在基因组学和合成生物学等领域的应用 | 系统阐述了高通量DNA合成技术的发展历程,对比分析了各代技术的优缺点,并探讨了其在生命科学和医学等领域的应用潜力 | 现有技术仍面临序列长度短和环境污染等挑战 | 探讨高通量DNA合成技术的发展方向及其应用前景 | 高通量DNA合成技术 | 合成生物学 | NA | 光刻、喷墨、电化学和热控合成技术,以及酶促合成技术 | NA | NA | NA |
33 | 2025-06-19 |
AlphaDesign: a de novo protein design framework based on AlphaFold
2025-Jun-17, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.1038/s44320-025-00119-z
PMID:40527958
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research paper | 介绍了一种名为AlphaDesign的从头蛋白质设计框架,结合了AlphaFold和自回归扩散模型,用于快速生成和计算验证具有可控相互作用、构象和寡聚状态的蛋白质 | 结合AlphaFold与自回归扩散模型,无需类别依赖的模型重新训练或微调,即可设计具有特定功能的蛋白质 | 未提及具体的技术限制或实验验证的局限性 | 开发一种通用的从头蛋白质设计框架,用于合成生物学中的蛋白质设计 | 细菌噬菌体防御系统中有毒效应子retrons的抑制剂 | synthetic biology | NA | AlphaFold, autoregressive diffusion models | AlphaFold, autoregressive diffusion models | protein sequences and structures | NA |
34 | 2025-06-19 |
Rosmarinic Acid as Bioactive Compound: Molecular and Physiological Aspects of Biosynthesis with Future Perspectives
2025-06-05, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14110850
PMID:40498026
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综述 | 本文综述了迷迭香酸(RA)的生物合成、分子机制及其生理功能,并探讨了提高其产量的生物技术方法 | 探讨了合成生物学和代谢工程技术在提高迷迭香酸工业产量中的应用 | 未提及具体实验数据或样本量,主要为基础研究和综述 | 研究迷迭香酸的生物合成途径及其生物活性,探索提高其产量的方法 | 迷迭香酸及其在植物中的生物合成 | 植物生物技术 | NA | 植物细胞组织培养、合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA |
35 | 2025-06-19 |
Editorial: Immune responses at barrier tissues: insights from synthetic biology in therapeutics, diagnostics, mechanisms, and beyond
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1621688
PMID:40529376
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
36 | 2025-06-19 |
A basis set of de novo coiled-coil peptide oligomers for rational protein design and synthetic biology
2012-Jun-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/sb300028q
PMID:23651206
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研究论文 | 本文介绍了一组从头设计的α-螺旋卷曲螺旋肽,用于蛋白质设计和合成生物学 | 提出了一种基于序列到结构关系的设计方法,创建了明确且特征良好的平行二聚体、三聚体和四聚体状态的肽 | 研究中使用的经验规则在设计系统中不适用,需要通过数据库信息重新设计 | 建立一套可用于蛋白质组装和控制的肽组件工具包 | α-螺旋卷曲螺旋肽 | 蛋白质工程 | NA | 圆二色光谱、分析超速离心、X射线晶体学 | NA | 肽序列、晶体结构数据 | NA |
37 | 2025-06-18 |
Investigating the Potential of Division of Labor in Synthetic Bacterial Communities for the Production of Violacein
2025-Jun-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00120
PMID:40525226
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研究论文 | 本研究探讨了在合成细菌群落中分工对紫胶素生产的潜在益处 | 通过将紫胶素生物合成途径分配到两个亚群中,实现了2.5倍的产量提升 | 研究仅基于E. coli的合成群落,未探索其他微生物系统 | 探索分工策略对复杂代谢产物生产效率的提升 | 合成细菌群落和紫胶素生产途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | 使用基于E. coli的合成群落进行实验 |
38 | 2025-06-18 |
'Intelligent' proteins
2025-Jun-14, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-025-05770-1
PMID:40515853
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research paper | 本文提出了一种挑战传统蛋白质分子观点的新理念,认为蛋白质表现出一种基本的‘智能’形式 | 结合整合信息理论(IIT)、网络理论和变构效应,重新定义蛋白质智能,并探讨其信息处理、环境适应和记忆行为 | 将智能概念应用于分子系统存在挑战,且如何设计适应性‘智能’蛋白质仍需解决 | 探索蛋白质的动态和适应性本质,为蛋白质工程、药物设计和合成生物学提供新视角 | 蛋白质分子 | 生物化学 | NA | 整合信息理论(IIT)、网络理论、变构效应分析 | NA | 理论分析 | NA |
39 | 2025-06-18 |
Deciphering and Predicting Thermal and pH Stabilities of Triplex DNA Under Multifactorial Conditions
2025-Jun-11, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202507190
PMID:40498537
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研究论文 | 本文开发了一种高通量5D荧光共振能量转移熔解退火(5DFRETMA)方法,用于研究环境及序列因素如何调控三链DNA的稳定性 | 开发了5DFRETMA方法,首次预测了可变温度和离子环境下的pH稳定性,并揭示了离子强度对三链DNA稳定性的双重影响 | NA | 揭示环境和序列因素如何调控三链DNA的稳定性,并开发预测模型 | 三链DNA | 生物物理学 | NA | 5D荧光共振能量转移熔解退火(5DFRETMA) | 预测模型 | 荧光数据 | 至少414组缓冲条件 |
40 | 2025-06-18 |
Real-Time Fluorescence-Based Method for Dynamic Quantification of Droplet Network Assembly
2025-Jun-10, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c02156
PMID:40521463
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research paper | 该研究介绍了一种基于荧光的分子信标方法,用于实时监测液滴组装,提高了合成生物学和中尺度材料应用的精确度 | 与传统成像技术(如显微镜图像的皮尔逊相关性)不同,这种直接方法能够以高灵敏度连续量化动态液滴相互作用 | NA | 提高合成生物学和中尺度材料应用中液滴组装的精确度 | 液滴网络组装 | 合成生物学 | NA | 荧光基分子信标方法 | NA | 荧光信号 | NA |