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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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21 | 2025-08-09 |
Bacteria-algae synergy in carbon sequestration: Molecular mechanisms, ecological dynamics, and biotechnological innovations
2025-Oct, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108655
PMID:40701356
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综述 | 本文综述了细菌-藻类协同作用在碳封存中的分子机制、生态动态和生物技术创新 | 首次将分子机制(如群体感应)、生态碳转化过程(如难降解溶解有机碳的形成)和合成生物学应用(如CRISPR工程联合体)整合到一个统一框架中,并提出了增强碳汇的新策略“微生物相互作用网络优化” | 存在可扩展性挑战,包括光生物反应器中的光照限制和合成联合体的生态风险 | 探索细菌-藻类协同作用在碳封存中的应用,以实现碳中和 | 微藻(如小球藻和三角褐指藻)和大型藻类(如巨藻和海带)与细菌的联合体 | 合成生物学 | NA | CRISPR、群体感应、水平基因转移 | NA | NA | NA |
22 | 2025-08-09 |
Recent advances in engineering microbial lipases for industrial applications
2025-Oct, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108658
PMID:40701353
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综述 | 本文全面回顾了脂肪酶的分类、一般特性、工业生产及应用,以及工程化脂肪酶和脂肪酶生产微生物细胞的最新进展 | 整合合成生物学和工程工具设计新型脂肪酶,以及利用蛋白质工程、固定化技术和人工智能工具提高脂肪酶催化性能 | 微生物脂肪酶存在多种同工酶,限制了其应用并需要昂贵的纯化过程 | 开发新型脂肪酶基生物工艺和生物产品 | 脂肪酶及其生产微生物细胞 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、固定化技术、人工智能 | NA | NA | NA |
23 | 2025-08-09 |
Revolutionizing keratinase science: Biocatalytic advances, sustainable innovation, and industrial perspectives
2025-Oct, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108657
PMID:40701354
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综述 | 本文系统回顾了角蛋白酶的研究历史、分类、催化机制及其在多个领域的应用 | 强调了蛋白质工程、人工智能辅助酶设计和合成生物学在提升角蛋白酶性能方面的创新应用 | 工业生产中广泛应用的障碍包括高生产成本、酶稳定性不足和监管复杂性 | 推动角蛋白酶研究的发展,促进其在可持续发展和资源管理中的转化应用 | 角蛋白酶及其在环境修复和循环生物经济中的潜在应用 | 生物催化 | NA | 蛋白质工程、人工智能辅助酶设计、合成生物学 | NA | NA | NA |
24 | 2025-08-09 |
Advances in sphingan production: Biosynthesis and synthetic biology strain modification strategies based on Sphingomonas
2025-Oct, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108659
PMID:40712756
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综述 | 本文综述了鞘氨醇单胞菌属的分类现状及鞘聚糖的结构、生物合成途径、分子遗传学和基因工程研究 | 综合了鞘聚糖的现有研究,并提出了未来的研究方向 | NA | 探讨鞘氨醇单胞菌属在生物聚合物合成中的潜力及其应用 | 鞘氨醇单胞菌属及其产生的鞘聚糖 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | NA | NA |
25 | 2025-07-29 |
Bioactive metabolites and extracellular vesicles from the marine chlorophyte genus Tetraselmis: Review
2025-Oct, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108662
PMID:40714169
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综述 | 本文综述了海洋绿藻属Tetraselmis的生物活性代谢物和细胞外囊泡在生物技术和生物医学中的潜在应用 | 探讨了Tetraselmis物种的代谢灵活性、生物活性化合物生产及其细胞外囊泡的治疗潜力,并提出了利用人工智能和合成生物学优化培养策略的新机会 | NA | 探索Tetraselmis物种及其细胞外囊泡在生物技术和生物医学中的多样化应用 | 海洋绿藻属Tetraselmis及其细胞外囊泡 | 生物技术 | NA | NA | NA | NA | NA |
26 | 2025-08-09 |
Programmable DNA Nanocages Enable Adaptive Spatiotemporal Organization of Biomimetic Organelle Networks
2025-Aug-08, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202511909
PMID:40776809
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research paper | 该论文提出了一种模块化和可编程的DNA纳米笼策略,用于构建稳定且具有适应性的合成细胞器网络 | 利用DNA纳米笼增强囊泡稳定性,并通过逻辑门控DNA元件实现环境响应的空间组织和信号重构 | 当前合成细胞器缺乏天然细胞骨架蛋白的支持和动态调控,限制了自主通信网络的构建 | 构建具有自适应反馈调节的人工细胞器网络 | 细胞外囊泡(EVs)和DNA纳米结构 | 合成生物学 | NA | 回文杂交链式反应(PHCR) | NA | NA | NA |
27 | 2025-08-09 |
Toward a monocot SynBio toolkit: assessing regulatory element performance and eudicot compatibility
2025-Aug-08, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-025-03583-x
PMID:40779074
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研究论文 | 本文旨在构建和评估一个适用于单子叶植物的合成生物学工具包,包含多种遗传调控元件,以优化转基因表达 | 构建了一个包含80个成员的组合部件库,并发现新的CaMV 35S启动子与病毒5'UTR序列组合能产生接近强病毒启动子的表达水平,以及新鉴定的植物小热休克蛋白3'UTR序列能显著增强报告基因表达 | 研究主要基于玉米原生质体和烟草叶片的瞬时表达系统,尚未在完整植株中进行验证 | 开发适用于单子叶植物的合成生物学工具包,以增强其在农业中的应用 | 单子叶植物(如玉米)和双子叶植物(如烟草)的遗传调控元件 | 合成生物学 | NA | 荧光测定法、农杆菌浸润 | NA | 基因表达数据 | 80个遗传调控元件组合,在玉米原生质体和烟草叶片中测试 |
28 | 2025-08-09 |
Decoding NF-κB: nucleocytoplasmic shuttling dynamics, synthetic modulation and post-therapeutic behavior in cancer
2025-Aug-07, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-025-10917-1
PMID:40775128
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综述 | 本文回顾了核因子κB(NF-κB)的结构、功能及其在癌症治疗中的行为,并探讨了通过合成生物学工具调控NF-κB的潜力 | 探讨了NF-κB核质穿梭的时空调节和分子动力学,以及利用合成基因电路和光遗传学工具精确控制NF-κB的创新方法 | NF-κB复合物的随机变异性导致单细胞水平的异质性反应,且缺乏明确的药物靶点,使其在癌细胞中的完全抑制具有挑战性和不确定性 | 研究NF-κB的调控机制及其在癌症治疗后的行为,以克服耐药性 | 核因子κB(NF-κB)及其在癌症中的调控机制 | 合成生物学 | 癌症 | 合成基因电路、光遗传学工具 | NA | NA | NA |
29 | 2025-08-09 |
CloneFast: A simple plasmid design and construction guide for labs venturing into synthetic biology
2025-Aug-06, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104025
PMID:40773353
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research paper | 介绍CloneFast指南,一种简化质粒构建的方法 | 提出CloneFast指南,通过生物信息学设计和实验步骤优化,实现高效质粒构建 | 未提及具体实验验证数据或与其他方法的比较 | 简化质粒构建过程,提高效率和可及性 | 质粒设计和构建 | 合成生物学 | NA | CompetePCR, 碘介导的切割 | NA | 生物信息学设计数据 | NA |
30 | 2025-08-09 |
Utilizing the SacB-mediated gene editing system in Komagataeibacter xylinus to explore the function of bacterial cellulose synthase
2025-Aug-05, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2025.08.003
PMID:40774389
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研究论文 | 本研究开发了一种基于SacB的基因编辑系统,用于探索细菌纤维素合酶在细菌纤维素合成和结构中的功能 | 开发了pK18mobsacB系统,实现了标记自由的基因编辑,效率高达83.33%,并成功应用于细菌纤维素合酶的功能研究 | NA | 提高细菌纤维素生产菌株的基因编辑效率,简化操作流程,实现无疤痕修饰,并探索细菌纤维素合酶的功能 | Komagataeibacter xylinus CGMCC 2955及其细菌纤维素合酶 | 合成生物学 | NA | SacB介导的基因编辑系统 | NA | NA | NA |
31 | 2025-08-09 |
Molecular circuits for genomic recording of cellular events
2025-Aug, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2025.04.004
PMID:40335327
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综述 | 本文综述了基因组记录领域的最新进展,特别是基于CRISPR的基因组编辑技术在细胞事件记录中的应用 | 探讨了构建多样化传感器的新策略,并探索新兴合成生物学工具如何帮助构建用于记录多样化细胞事件的分子电路 | 直接记录和重建过去细胞事件的方法仍然有限,其在揭示细胞命运决定新见解方面的潜力尚未实现 | 开发新的传感模块和遗传电路架构,将过去的细胞状态忠实编码到基因组DNA记录中 | 细胞事件 | 合成生物学 | NA | CRISPR-based genome editing | NA | 基因组数据 | NA |
32 | 2025-08-09 |
Machine Learning Empowering Microbial Cell Factory: A Comprehensive Review
2025-Aug, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-025-05260-x
PMID:40397295
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review | 本文综述了机器学习与合成生物学在微生物细胞工厂升级中的协同作用及其在生物技术中的应用 | 探讨了机器学习与合成生物学结合在生物制造中的创新应用,包括化学生产、人类健康和环境修复 | NA | 为生物制造与人工智能交叉领域的未来研究提供有价值的指导 | 微生物细胞工厂 | machine learning | NA | synthetic biology | NA | NA | NA |
33 | 2025-08-09 |
Synthetic Biocatalysis in Erythrocyte Microreactors for Gasotransmitter H2S Production and Vessel Vasodilation
2025-Aug, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202502208
PMID:40451735
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研究论文 | 本研究开发了一种能够持续产生硫化氢(H₂S)以实现治疗性血管舒张的红细胞微反应器 | 通过将PLP-PLys复合物封装到红细胞中,创建了一种新型微反应器,能够持续产生H₂S并有效诱导血管舒张 | 研究仅在体外实验中验证了微反应器的效果,尚未进行体内实验 | 开发一种能够模拟天然细胞执行重要代谢过程并与生物系统相互作用的治疗性微反应器 | 红细胞微反应器及其在H₂S产生和血管舒张中的应用 | 合成生物学与生物工程 | 心血管疾病 | 低渗膨胀法、荧光成像 | NA | 体外实验数据、荧光成像数据 | 体外实验使用分离的胸主动脉环 |
34 | 2025-08-09 |
Exploring the Application and Prospects of Synthetic Biology in Engineered Living Materials
2025-Aug, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202305828
PMID:37677048
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综述 | 本文综述了合成生物学在工程活性材料(ELMs)中的应用与前景,探讨了其在环境修复、生态建筑和可持续能源等领域的潜力 | 全面概述了ELMs的最新研究进展和新兴设计策略,并探讨了不同种类ELMs之间的协同应用可能性 | 未提及具体实验数据或案例研究,主要基于文献综述 | 探讨合成生物学在工程活性材料中的应用及未来发展 | 细菌、真菌和植物衍生的工程活性材料(ELMs) | 合成生物学与材料科学 | NA | NA | NA | NA | NA |
35 | 2025-08-09 |
Protein structure prediction and design for high-throughput computing
2025-Jul-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.18.665594
PMID:40777508
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研究论文 | 本文介绍了针对高吞吐量计算的蛋白质结构预测和设计工具,并提出了容器化解决方案以优化这些工具在不同计算架构上的部署 | 开发了针对AlphaFold3、Chai-1、Boltz-2和RFdiffusion的容器化解决方案,并提出了OmniFold平台,优化了这些工具在GPU系统上的使用效率 | 这些算法的采用受到高计算需求和部署难度的影响 | 优化蛋白质结构预测和设计工具在高吞吐量计算环境中的部署和使用 | 蛋白质结构预测和设计工具(AlphaFold3、Chai-1、Boltz-2、RFdiffusion) | 分子生物学 | NA | 机器学习、容器化技术 | AlphaFold3、Chai-1、Boltz-2、RFdiffusion | 蛋白质结构数据 | NA |
36 | 2025-08-08 |
Engineering DNA nanopores: from structural evolution to sensing and transport
2025-Oct, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2025.102137
PMID:40761509
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综述 | 本文回顾了DNA纳米孔的结构演变及其在分子传感和跨膜运输中的应用 | 整合了DNA纳米孔的结构演变与关键局限性分析,并突出了单分子传感和受控跨膜运输的突破 | 稳定性、可扩展性和噪声等问题 | 探讨DNA纳米孔在合成生物学和纳米医学中的优化路径 | DNA纳米孔 | 纳米技术 | NA | DNA折纸技术 | NA | NA | NA |
37 | 2025-08-08 |
Prospects for synthetic biology in 21st century agriculture
2025-Aug, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2024.12.016
PMID:39742963
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research paper | 本文探讨了植物合成生物学在21世纪农业中的前景及其在提高粮食安全、应对气候变化和实现可持续农业实践方面的潜力 | 整合先进的遗传工具、计算模型和系统生物学,精确修改植物基因组以增强产量、胁迫耐受性和养分利用效率等性状 | 面临监管审批和公众接受的挑战,需要严格的跨领域测试以确保可重复性 | 探讨植物合成生物学在农业中的应用,以解决全球粮食安全挑战 | 植物基因组及其在农业中的应用 | 合成生物学 | NA | 遗传工具、计算模型、系统生物学、人工智能 | NA | NA | NA |
38 | 2025-08-08 |
Structural insights and rational engineering strategies for modular polyketide synthases: A review
2025-Aug, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.145299
PMID:40533022
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综述 | 本文综述了模块化聚酮合酶(PKSs)的结构见解和理性工程策略,特别关注顺式酰基转移酶(AT)PKSs的设计和改造 | 系统总结了基于结构和机制见解的模块化构建块选择和催化域设计策略,为合成生物学和天然产物发现提供了新思路 | 对单个结构域的微小改变可能在整个组装线上传播结构和功能变化,这对理性设计提出了重大挑战 | 探索顺式AT PKS的多维设计,以增强产品产量并扩大可获得的聚酮化合物库 | 顺式酰基转移酶(AT)聚酮合酶(PKSs) | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
39 | 2025-08-08 |
[Research progress in the fungal bioluminescence pathway]
2025-Jul-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250138
PMID:40769542
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综述 | 本文综述了真菌生物发光途径(FBP)的研究进展及其在植物基因工程中的应用 | 通过基因工程将FBP引入植物,创造出具有自主发光能力的转基因植物,克服了传统报告系统的底物限制,为园艺生产、环境保护和生物工程应用提供了新的机会 | NA | 探讨植物FBP工程的最新进展以及如何利用机器学习方法优化自主发光表型,以加速农业生物技术、环境传感和合成生物学应用的创新 | 真菌生物发光途径(FBP)及其在转基因植物中的应用 | 合成生物学 | NA | 基因工程、机器学习 | NA | NA | NA |
40 | 2025-08-08 |
Regulatory helix plays a key role in genetic ON-OFF switching for the 2'-deoxyguanosine-sensing mRNA element
2025-Jul, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110282
PMID:40412519
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研究论文 | 本文研究了2'-脱氧鸟苷感知mRNA元素的遗传开关调控机制 | 揭示了2'-脱氧鸟苷感知核糖开关在转录中间体阶段的调控机制,而非简单的二元开关 | 研究主要基于体外实验,未涉及体内复杂环境的影响 | 探究核糖开关在转录过程中的动态调控机制 | 2'-脱氧鸟苷感知核糖开关(dGsw)及其转录中间体 | 分子生物学 | NA | 化学探测、荧光淬灭实验 | NA | 生化实验数据 | NA |